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outros aminocidos, a cadeia lateral faz com que o carbono possua quatro
substituintes diferentes. Assim, o carbono um centro quiral, fazendo com que cada
aminocido possua dois possveis estereoismeros (D ou L). Contudo, sabe-se que
todos os resduos de aminocidos das protenas so estereoismeros L.
7. (a) possvel trabalhar com protenas isoladamente?
possvel isolar as protenas baseando-se na diferena de propriedades entre as
protenas, como tamanho, carga e propriedades de ligao.
Para isolar uma protena, inicialmente necessrio obter o extrato bruto, ou seja,
romper as clulas que contm a protena de interesse, liberando-as em uma soluo.
O extrato ento submetido a tratamentos que separam as protenas nele contida em
diferentes fraes, de acordo com a solubilidade, atravs do efeito de salting out: a
adio de sais, normalmente o sulfato de amnio, em quantidades adequadas diminui
a solubilidade de algumas protenas e faz com que estas precipitem. Aps
precipitarem, estas podem ser separadas das que permanecem em soluo atravs
de centrifugao. Caso a protena de interesse esteja na frao solvel, o sal
adicionado pode ser removido posteriormente por dilise.
Aps este pr-tratamento as protenas podem ser isoladas atravs de tcnicas
cromatogrficas de coluna, de troca inica, de afinidade, lquida de alta eficincia
(HPLC) ou por eletroforese. possvel tambm combinar mais de uma tcnica, como
analisar o produto obtido por cromatografia de troca inica atravs de eletroforese.
(b) Descreva com detalhes alguma das tcnicas de purificao de protenas
apresentada na nossa aula.
A cromatografia de troca inica baseada nas diferenas no sinal e na magnitude da
carga eltrica lquida de protenas em determinado pH. Esta tcnica consiste em eluir
a soluo de protenas atravs de uma coluna trocadora de ctions ou de nions,
separando as protenas de acordo com sua afinidade com a fase mvel ou com a fase
estacionria.
A coluna preenchida por uma resina contendo grupos carregados; se os grupos so
carregados negativamente, a coluna chamada de trocadoras de ctions, e as
colunas contendo grupos carregados positivamente so chamadas de trocadoras de
nions.
A afinidade das protenas com estes grupos afetada pelo pH (que interfere na
ionizao da protena) e pela quantidade de sais livres na fase mvel, pois estes
competiro pelos grupos da fase estacionria. Portanto, o pH e a quantidade de sais
dissolvidos podem ser manipulados para otimizar a separao (aumentar a
resoluo).
Na cromatografia de troca catinica, as protenas contidas na fase mvel e carregadas
positivamente percorrem a coluna mais lentamente, uma vez que interagem mais com
a fase estacionria. Assim, as protenas de carga lquida mais negativas eluem mais
cedo. O mesmo princpio utilizado na cromatografia de troca aninica.
A expanso da banda proteica na fase mvel causada pela afinidade das protenas
com a resina como pelo espalhamento difusional. O aumento do tamanho da coluna
melhora a separao destas bandas, mas aumenta o tempo de eluio e, portanto,
aumenta o espalhamento difusional dentro de cada banda de protena.
Enquanto est sendo realizada a corrida cromatogrfica, o efluente da coluna deve ser
coleta em tubos e ser testada para a protena de interesse, bem como para outras
propriedades como fora inica ou concentrao total de protenas. Todas as fraes
positivas para a protena de interesse podem ser combinadas como produto desta
etapa de purificao.
12. (a) Qual a diferena entre uma protena fibrosa e uma globular?
Nas protenas fibrosas as cadeias polipeptdicas esto arranjadas em longos
filamentos ou folhas, enquanto nas protenas globulares estas cadeias esto dobradas
em uma forma esfrica ou globular.
Alm disso, as protenas fibrosas em geral so formadas por um nico tipo de
estrutura secundria, e sua estrutura terciria relativamente simples. J as protenas
globulares possuem diversos tipos de estruturas secundrias.
Em relao funo, protenas fibrosas esto em estruturas que garantem suporte,
forma e proteo externa aos vertebrados, enquanto as protenas globulares atuam
como a maioria das enzimas e protenas reguladoras.
(b) Cite exemplos de ambos os casos.
So exemplos de protenas fibrosas o colgeno, encontrado nos tecidos conectivos
como tendes, cartilagens, a matriz orgnica dos ossos e a crnea dos olhos; as queratinas, que esto nos cabelos, pelos, unhas, garras, chifres, cascos e grande
parte da camada mais externa da pele; e a fibrona da seda, produzida por insetos e
aranhas.
13. Explique com detalhes como a protena hemoglobina pode ser capaz de
transportar o oxignio?
A hemoglobina possui duas conformaes principais: o estado T e o estado R. O
oxignio se liga hemoglobina nos dois estados, mas possui afinidade maior pela
protena no estado R. Sabe-se que quando no h oxignio disponvel, o estado T
mais estvel. A ligao do oxignio a subunidade da hemoglobina no estado T
desencadeia uma mudana na conformao para o estado R.
A hemoglobina deve ligar com eficincia o oxignio nos pulmes e liber-los nos
tecidos. Porm, uma protena que liga o O2 com afinidade o ligar eficientemente nos
pulmes, mas no o liberar muito nos tecidos. Em contrapartida, se a protena ligar o
oxignio com uma afinidade suficientemente baixa para liber-lo nos tecidos, no o
captar bem nos pulmes.
A hemoglobina resolve o problema passando por uma transio de um estado de
baixa afinidade (T) para um de alta afinidade (R) conforme mais molculas de oxignio
vo sendo ligadas.
A ligao do O2 s subunidades da hemoglobina pode alterar a afinidade das
subunidades adjacentes. A primeira molcula de O2 que interage com a
desoxiemoglobina o faz fracamente, pois se liga a uma subunidade no estado T.
Contudo, sua ligao leva a mudanas conformacionais que so transferidas s
subunidades adjacentes, facilitando a ligao de molculas adicionais de O2. A
transio T R ocorre mais facilmente na segunda subunidade depois da ligao do
O2 primeira unidade. A quarta molcula de O2 se liga ao heme de uma subunidade
que j est no estado R, e por isso se liga com uma afinidade muito mais alta que a
primeira.
Portando, a hemoglobina uma protena alostrica, ou seja, uma protena na qual a
interao com um ligante em um stio afeta as propriedades de ligao d outro stio na
mesma protena.
14. Explique com detalhes o mecanismo de contrao muscular.
A contrao muscular estimulada pela liberao de Ca2+ do retculo
sarcoplasmtico. O Ca2+ se liga protena troponina, provocando uma mudana na
conformao do complexo troponina-tropomiosina que desencadeia o ciclo de
interaes actina-miosina.
Este ciclo possui quatro etapas principais. Na etapa 1, O ATP liga-se miosina,
rompendo a interao actina-miosina e liberando a actina. Na etapa 2, o ATP
hidrolisado, causando uma mudana conformacional para um estado de alta energia
que move a cabea de miosina e muda sua orientao em relao ao filamento fino.
Na etapa 3, a cabea de miosina se fixa ao filamento fino, causando a liberao do
fosfato produzido na hidrlise do ATP. Na etapa 4, ocorre um movimento e fora,
desencadeado pela liberao do fosfato na etapa anterior, que consiste em uma
mudana conformacional na cabea de miosina que provoca o movimento dos
filamentos de actina e miosina um em relao ao outro. O ADP liberado ento para
completar o ciclo.
De uma forma geral, a miosina dissocia-se sucessivamente de uma unidade de actina
e se associa com outra unidade mais distante ao longo do filamento. Assim, as
cabeas de miosina deslizam ao longo dos filamentos de actina, movendo o conjunto
de filamentos grossos para dentro do conjunto de filamentos finos.