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MAESTRA EN ENSEANZA DE LAS CIECIAS EXACTAS Y NATURALES

TALLER DE TPICOS EN BIOLOGA N 1

POR: CARLO MARIO CEBALLOS VELSQUEZ

ASIGNATURA: TPICOS DE BIOLOGA

DOCENTE: FRANCISCO L. MONTOYA

MARZO DE 3 DE 2016
MAESTRA EN ENSEANZA DE LAS CIENCIAS EXACTAS Y NATURALES.
UNIVERSIDAD NACIONAL
MEDELLN
2016

MAESTRA EN ENSEANZA DE LAS CIECIAS EXACTAS Y NATURALES


TALLER DE TPICOS EN BIOLOGA N 1
Febrero de 2016
1. Qu es la Biodiversidad y que tipos de biodiversidad biolgica se
conocen
R//: La biodiversidad o diversidad biolgica es el nmero de especies presentes
en una determinada regin, a su vez la biodiversidad es dinmica, por lo que
vara en el tiempo y el espacio en funcin de la extincin de las especies, su
variacin gentica en el tiempo y/o el espacio. La biodiversidad no se considera
exclusivamente respecto al nmero de especies si no que incluye tambin
todos los niveles de organizacin biolgica: desde la gentica hasta el paisaje.
Esto implica que a la hora de plantear estrategias de conservacin de las especies
es necesario establecer cul es el objetivo a realizar: si slo es conservar el
nmero de especies, el nmero de ecosistemas o si se va a incluir el conservar las
interacciones entre los individuos de manera que los ecosistemas se conserven lo
ms intactos posibles. An as, los ecosistemas son procesos vivos en el tiempo
que varan siempre y no son estticos.
Tipos de biodiversidad
Existen varios tipos de biodiversidad que se sealan a continuacin:

Diversidad alfa: es el nmero de especies en un rea pequea siendo sta


rea uniforme. El ndice de Shannon mide este tipo de biodiversidad.
Diversidad beta: es la diversidad que hay entre hbitats dentro de un
mismo ecosistema, es decir, la variacin en el nmero de especies que se
produce entre un hbitat y otro, o tambin definido por Meffe & Carroll en 1997
como recambio de especies de un hbitat a otro. Para medir este tipo de
biodiversidad se utilizan ndices de similitud y disimilitud entre muestras.
Diversidad gamma: es el nmero total de especies observadas en todos
los hbitats de una determinada regin que no presenta barreras para la
dispersin de los organismos.
Desde otra concepcin tambin se puede clasificar como:
DIVERSIDAD DE ESPECIES:

Se refiere al nmero de las diferentes especies que habitan una zona


determinada. Es uno de los componentes importantes y es el aspecto de la
biodiversidad del cual se habla con mayor frecuencia.
DIVERSIDAD GENTICA: Tambin son importantes las ricas variaciones en
formas, colores y patrones de comportamiento que se notan entre los individuos
de una misma especie.
DIVERSIDAD DE ECOSISTEMAS: La complejidad de las interrelaciones entre
poblaciones de diferentes especies y su ambiente es otro aspecto bsico que
define la biodiversidad y al cual se hace referencia como diversidad de
ecosistemas.
Medida de la biodiversidad
La diversidad tiene dos componentes fundamentales:
Riqueza especfica: nmero de especies que tiene un ecosistema
Equitabilidad: mide la distribucin de la abundancia de las especies, es decir,
cmo de uniforme es un ecosistema
Para medir la biodiversidad existen varios ndices que se utilizan para poder
comparar la biodiversidad entre diferentes ecosistemas o zonas. Es importante
tener en cuenta que la utilizacin de estos ndices aporta una visin parcial, pues
no dan informacin acerca de la distribucin espacial de las especies, aunque s
intentan incluir la riqueza y la equitabilidad.
ndice de Margalef
Diversidad = (S-1)/log N donde S es el nmero de especies y N el nmero total de
individuos. Las limitaciones de este ndice son grandes pues el resultado para un
ecosistema de tres especies con 50 individuos de cada una de ellas, ser el
mismo que para un ecosistema con tres especies donde una de ellas tenga 120
individuos, los 30 restantes se repartan entre las otras dos especies. En ambos
casos:
Diversidad = (3-1)/log150

ndice de Shannon Weaver (1949)


Se conoce tambin como el ndice de Shannon. El ndice de Shannon se basa en
la teora de la informacin y por tanto en la probabilidad de encontrar un
determinado individuo en un ecosistema. Se calcula de la siguiente forma:

ni = nmero de individuos en el sistema de la especie determinada i


N = nmero total de individuos
S = nmero total de especies
El valor mximo suele estar cerca de 5, pero hay ecosistemas excepcionalmente
ricos que pueden superarlo.
A mayor valor del ndice indica una mayor biodiversidad del ecosistema.
ndice de Simpson
Se parte de la base de que un sistema es ms diverso cuanto menos dominancia
de especies hay, y la distribucin es ms equitativa.

El valor mnimo para este ndice es 1 que indica que no hay diversidad.
2. Qu es un cladograma y para que se utiliza?
R//: La cladstica ayuda a general diagramas llamados cladogramas que son
hiptesis de las relaciones entre los grupos, o una representacin del rbol
filogentico de la vida. Existen hoy en da muchos programas que se utilizan en
cladstica, esto debido a la complejidad de los procesos durante la generacin de
cladogramas. Busca entender la historia de toda la vida, esto por medio de:
1. Proveer un sistema de clasificacin que sirve para comunicar informacin
acerca de los organismos.
2. Generan hiptesis para la interpretacin de la evolucin de la vida.

3. Estas hiptesis filogneticas y su correspondiente clasificacin nos ayudan a


predecir propiedades de organismos nuevos y de aquellos que se conoce muy
poco.
Un cladograma es un diagrama rbol usado en la cladstica que esquematiza
la filogenia, o historia evolutiva, ms probable de un grupo de taxones terminales
(los nodos terminales del cladograma), con base en cierta metodologa fundada
por el taxnomo Willi Hennig en 1950 (. El cladograma hace algunos supuestos
previos de la historia evolutiva del grupo, como que cada rama de nodo a nodo es
una especie (independientemente de la cantidad de cambios evolutivos que
ocurrieron en ese linaje), que la ramificacin es nicamente dicotmica, que una
especie ancestral al ramificarse en dos da siempre dos especies derivadas y
ninguna de las ramas mantiene los caracteres de la especie ancestral, y que no
hay anastomosis de ramas. En sta esquema se representan el antepasado
comn ms prximo del grupo de organismos y se representa la hiptesis de la
relaciones entre los organimos estudiados, incluyendo el grupo de inters
(ingroup) y el grupo externo o ajeno (outgroup). Todos los organismos que hay en
el planeta se han producido por la evolucin. Esta historia evolutiva, o filogenia se
puede rastrear hacia atras, de esta manera infiriendo las conexiones con otros
linajes por medio de ancestros comunes; todas estas conexiones forman un
inmenso rbol filognetico.

3. Qu es distancia gentica, cmo se mide? Explquelo con un ejemplo


R//: La distancia gentica es una medida de la diferencia del material
gentico entre distintas especies o individuos de la misma especie. Al comparar el
porcentaje de la diferencia entre los mismos genes de diferentes especies, una
figura puede ser obtenida, la cual es una medida de la "distancia gentica".
Dependiendo de la diferencia, y corrigiendo sta por tasas conocidas de evolucin,
la distancia gentica puede ser usada como una herramienta para
construir cladogramas que muestran el rbol genealgico de todos los seres vivos.

Cuando una especie presenta una distribucin geogrfica amplia, generalmente se


espera que las poblaciones ms cercanas geogrficamente tambin sean las ms
parecidas genticamente, ya que se supone que el flujo gnico debe ser ms
probable entre las poblaciones contiguas que entre las ms lejanas. A este idea se
le conoce como aislamiento por distancia distanciamiento gentico (Wright,
1943) y nos dice que los individuos tienden a aparearse ms con aquellos ms
cercanos geogrficamente de lo que se esperara si los cruzamientos fueran al
azar en toda la distribucin de la especie. Con el fin de conocer si una especie
sigue un modelo de aislamiento por distancia, es decir, si existe una correlacin
entre las distancias geogrficas y las distancias genticas entre pares de
poblaciones, se pueden llevar a cabo anlisis estadsticos formales como la
prueba de Mantel , si existe una correlacin positiva significativa entre la distancia
geogrfica y la gentica, existe evidencia de distanciamiento gentico, esto es,
que el flujo gnico es limitado y localizado, lo cual origina que las poblaciones ms
cercanas en el espacio sean ms cercanas y tengan ms flujo gnico que las ms
alejadas. La forma especfica de graficar los datos en un anlisis de aislamiento
por distancia puede permitir hacer entender mejor los posibles modelos finos de
estructura gentica que siguen las poblaciones y hacer inferencias sobre la
magnitud de sus tasa de migracin.
Ejemplo:
As, el hecho de que la distancia gentica entre chimpancs y seres humanos es
de slo un 1,6% (es decir, hay alrededor de 98,4% de similitud), sugiere que los
seres humanos y los chimpancs comparten un ancestro comn desde hace unos
5 millones de aos, y que ambas especies estn ms cercanamente relacionados
entre ellas que con los gorilas o los orangutanes (los que divergieron hace 9
millones de aos, y 12 millones de aos, respectivamente).

4. Cul es el peligro que representan los radicales libres para los cidos
nucleicos, especialmente para el ADN?
R//: La molcula de ADN es uno de los principales blancos del ataque por radicales
libres en la clula y las modificaciones que sufre como consecuencia de esos
ataques son relevantes para la prdida de la homeostasis celular, prdida que puede
prolongarse como consecuencia de las funciones del ADN como reservorio activo de
informacin. Es por ello que se estudian intensamente los agentes y mecanismos del
dao por el ataque electroflico de las especies reactivas del oxgeno (ERO), porque
su esclarecimiento va parejo a la elucidacin de la patogenia de enfermedades de
gran morbilidad y mortalidad como el cncer.

En la molcula de ADN, los grupos nucleoflicos de la desoxirribosa y de las bases


nitrogenadas quedan expuestos al ataque electroflico de las especies reactivas del
oxgeno (ERO), que llegan al interior del ncleo celular ya sean generadas como
consecuencia de un agente externo, as como consecuencia de procesos
metablicos celulares.
Existen diferentes tipos de dao oxidativo al ADN, entre los que se han reportado:
ruptura del esqueleto azcar fosfato de una o de las 2 hebras, modificacin de las
bases nitrogenadas (saturacin y fragmentacin del anillo de timina) y la formacin
de uniones cruzadas (cross-links) ADN-ADN ADN- protena, a travs de diferentes
mecanismos:
1.
2.
3.
4.
5.
6.

Modificacin de las bases de ADN.


Generacin de sitios AP.
Ruptura de una cadena del ADN.
Mutaciones.
Activacin de oncogenes e inactivacin de genes supresores.
Dao endotelial que favorece la metstasis.

1. Modificacin de bases del ADN: se conoce que el dao al ADN por radicales
libres (RL) endgenos ocurre de forma espontnea y existe un nivel normal de
bases modificadas por ERO en el ADN celular.6,7 La accin del .OH da lugar a ms
de 20 modificaciones y entre ellas la ms frecuente es la 8-hidroxi-2'desoxiguanosina (8-OH-dG)6 que tiene un potencial altamente mutagnico al igual
que la 5-hidroximetil-2-desoxiuridina.
2. Depuracin de bases del ADN: los sitios apurnicos o apirimidnicos (AP), se
generan por ruptura del enlace glicosdico, que puede resultar del ataque al azcar
por parte del OH.
Estas lesiones presentan adenina insertada preferencialmente opuesta a la lesin.
Los oxidantes mutgenos que incluyen radiaciones ionizantes, H2O2, bleomicina,
neocarzinos-tatina y complejo Cu-fenantrolina, son capaces de producir sitios AP
por oxidacin de la desoxirribosa del ADN (Garca Triana B, Prez Trueba G.
Especies reactivas del oxgeno y cncer: mecanismos de accin.
3. Rupturas de una cadena del ADN: las rupturas de cadena (RC) se producen por
escisin del enlace fosfodister. Ocurren frecuentemente por ataque qumico o de
radicales libres a la porcin desoxirribosa del esqueleto del ADN. Se ha
demostrado que sustancias carcingenas, generadoras de ERO, provocan la

aparicin de rupturas de una cadena en el ADN, adems de modificaciones de


bases.
4. Mutaciones: dado que muchos tumores humanos contienen 1 ms
mutaciones independientes, indispensables para el desarrollo del tumor, se ha
postulado que son el resultado de un incremento en la velocidad de la
mutagnesis endgena. De otra forma se supone que la ocurrencia de malignidad
sera extremadamente rara. El efecto del ataque al ADN por ERO desempea un
papel importante en el incremento de estas mutaciones que conducen al cncer.
5. Activacin de oncogenes e inactivacin de genes supresores: oxidantes como el
H2O2, O2, oxgeno hiperbrico y el ozono, pueden inducir experimentalmente la
activacin de oncogenes en clulas iniciadas y protegidas. Es posible tambin que
conduzcan a la inactivacin de genes supresores. De esta forma se modifica la
proliferacin celular.
6. Induccin de metstasis: las vas ms importantes para la diseminacin de las
clulas cancerosas, son los vasos sanguneos y linfticos. El ataque por radicales
libres a las clulas endoteliales causa la liberacin de proteasas que pueden con
posterioridad, degradar la membrana basal. Esta accin se asocia con la
generacin de compuestos qumicos que atraen a las clulas tumorales. 12 En
estudios experimentales se ha observado un aumento del nmero de clulas
tumorales retenidas por la pared vascular y su migracin hacia el
subendotelio despus de la accin de ERO (oxigenacin hiperbrica),
cuatriplicndose el nmero de metstasis as obtenidas.

5. Cul de las siguientes propiedades NO es clave para el material gentico?


Explique su respuesta:
a. Debe ser capaz de ser copiado exactamente
b. Debe codificar la informacin necesaria para formar protenas y estructuras
complejas
c. Debe mutar ocasionalmente X
R//: El material gentico no debe mutar ya que es al presentarse una mutacin hay
un cambio en la informacin gentica de un ser vivo, que produce una variacin
en las caractersticas de este y que puede trasmitirse a su descendencia. Se
presenta de manera espontnea y sbita o por la accin de mutgenos. Este
cambio estar presente en una pequea proporcin de la poblacin (variante) o
del organismo (mutacin). La unidad gentica capaz de mutar es el gen, la unidad
de informacin hereditaria que forma parte del ADN. Las mutaciones solo pueden

ser heredadas cuando afectan a las clulas reproductivas. Una consecuencia de


las mutaciones puede ser, por ejemplo, una enfermedad gentica.
d. Debe ser capaz de adaptarse por s mismo en cada tejido del cuerpo
6. Por qu el RNA se produce slo a partir de la cadena molde del DNA y no a
partir de ambas cadenas?
R//: El ARN se fabrica slo a partir de una de las cadenas de la hlice de ADN de
doble cadena. La transcripcin est catalizada por una enzima, la polimerasa de
ARN, y sigue reglas similares a las de la replicacin. El ARN presenta similitudes
con el ADN, aunque en el ARN el azcar presente es la ribosa y el uracilo
reemplaza a la timina. La extraccin del ARN de una clula produce varios tipos
moleculares bsicos: ARN ribosmico, transferente y mensajero, ms una
cantidad limitada de otras molculas de ARN pequeas. Las molculas de ARN
ribosmico (ARNr), de tres tamaos distintos, se unen a un conjunto de protenas
especficas en los ribosomas, las mquinas encargadas de la sntesis de las
protenas. La sntesis de un polipptido a partir de una molcula de ARN
mensajero, mediada por los ribosomas, se denomina traduccin. El ARN
transferente (ARNt) comprende un grupo de molculas de ARN, ms bien
pequeas, cada una con especificidad de unin a un aminocido concreto; se
encargan de acarrear los aminocidos a los ribosomas, donde se incorporan al
polipptido en formacin. Aunque el ARN (como el ADN) es una larga
macromolcula de cido nucleico, tiene propiedades muy diferentes. En primer
lugar, el ARN es casi siempre de cadena sencilla, no una hlice doble. En segundo
lugar, el ARN contiene en sus nucletidos el azcar ribosa (de ah su nombre), en
lugar de desoxirribosa. En tercer lugar, el ARN contiene la base
pirimidnica uracilo (abreviada como U) en lugar de timina. No obstante, el uracilo
forma puentes de hidrgeno con la adenina, exactamente como la timina. Nadie
sabe con seguridad por qu el ARN contiene uracilo en vez de timina, o ribosa en
lugar de desoxirribosa. La caracterstica ms destacable del ARN es su naturaleza
de cadena sencilla pero, por lo dems, su estructura es muy similar a la del ADN.
Aunque el ARN se transcribe a partir de una sola de las cadenas del ADN de cada
gen, no se transcribe necesariamente la misma cadena a lo largo de todo el
cromosoma, o a lo largo de las diferentes fases del ciclo de vida. El ARN
producido en las diferentes fases del ciclo de vida de un fago hibrida con distintas
partes del cromosoma, poniendo as de manifiesto que en cada fase se activan
genes diferentes.

7. Los antibiticos son drogas que matan selectivamente a las bacterias sin daar
a los animales. Muchos antibiticos actan unindose a ciertas protenas que son
esenciales para la funcin bacteriana. Explique por qu la mayora de los
antibiticos exitosos actan sobre la RNA polimerasa bacteriana.
R//: Los antibiticos que interfieren en la sntesis de protenas son muy variados y
abundantes, y la mayora de ellos funcionan interfiriendo con el ribosoma, sobre
todo los que se unen a protenas ribosmicas y/o a alguno de los ARN
ribosmicos. Afectan a la elongacin de la cadena naciente del polipptido. Los
ms tiles son aquellos que tienen efectos selectivos frente a los ribosomas 70S
procariticos, pero no sobre los 80S eucariticos. Dentro de ellos, y siguiendo el
orden natural del funcionamiento de la elongacin de la cadena polipeptdica,
podemos agruparlos segn la fase concreta de la elongacin sobre la que actan:
1. inhibicin del reconocimiento de un aminoacil-ARNt (aa-ARNt) hacia el sitio
A del ribosoma;
2. introduccin de errores en la lectura de los ARNm;
3. inhibicin de la reaccin de formacin del enlace peptdico;
4. inhibicin de la traslocacin del peptidil-ARNt (pp-ARNt) desde el sitio A al
sitio P.
5. bloqueo de los factores de elongacin.
Ejemplo de Tetraciclinas:
En el caso del antibitico tetraciclina las bacterias transportan complejos
tetraciclina-Mg de forma "suicida", cosa que no ocurre en eucariotas. Al llegar la
tetraciclina a la subunidad 30S, se une a las protenas S4 y S18 del ribosoma 70S
intacto, causando un dao en la sntesis y transcripcin de las protenas.

8. Distinga las siguientes parejas de trminos.


a)
Transiciones y transversiones
Transicin es una mutacin puntual del ADN, que puede afectar a
la sntesis del ARNm y, posteriormente, a la fabricacin de protenas. La
transversin es una sustituciones de una purina por una pirimidina o
viceversa. Una transversin solo puede ser revertida por reversin
espontnea. Debido a que, a diferencia de la Transicin este tipo

de mutacin cambia la estructura qumica de manera drstica, las


consecuencias de la Transversin tienden a ser ms drsticas que las de
la Transicin. Las Transversiones pueden ser causadas por la radiacin
ionizante y por agentes alquilantes.
b)
Mutaciones sinnimas y neutras
Las sustituciones nucleotdicas que cambian un aminocido por otro se
denominan mutaciones no sinnimas. En otras ocasiones, la mutacin
altera la base situada en la tercera posicin del codn pero no causa
sustitucin aminoacdica; en este caso se denomina mutaciones sinnimas
(silenciosas). Las mutaciones neutras son aquellas que cambian el
aminocido del codn afectado pero no afectan la actividad de la protena.
c)
Mutaciones de cambio de sentido y sin sentido
Las Mutaciones de cambio de sentido las sustituciones que generan el
cambio de un aminocido y que en general alteran la funcionalidad de la
protena codificada originalmente. Mutaciones sin sentido Se denominan as
a las sustituciones que crean un codn de stop o codn sin sentido (UAA,
UAG y UGA), ocasionando una protena ms corta de lo normal.
d) Mutaciones de desplazamiento del marco de lectura
Mutacin con desplazamiento, desfase o cambio del marco de
lectura (tambin conocida como error de marco o cambio de marco) es un
tipo de mutacin causada por la insercin o deleccin de un nmero
de nucletidos que no es mltiplo de tres en una secuencia de ADN. Debido
a la naturaleza ternaria del cdigo gentico comprendido como una
sucesin de codones; la insercin o deleccin de un nmero de nucletidos
no divisible por tres, puede cambiar el marco de lectura del gen,
provocando una traduccin completamente diferente a la original. Cuanto
antes aparezca la insercin o deleccin en el gen, mayor es la alteracin
que sufre la protena.
10. Considere el gen que especifica la estructura de la hemoglobina. De l orden
cronolgico ms probable de los siguientes hechos:
f. Una mujer que trabaja como tcnica de rayos X, entra accidentalmente en una
habitacin donde est funcionando un generador de rayos X.
b. El ovulo recibe una dosis alta de radiacin
e. Se produce la sustitucin de un par de nucletidos del DNA del gen de la
hemoglobina
g. Aparece un codn incorrecto en el DNA del gen de la hemoglobina
j. Aparicin de un codn incorrecto en el RNAm
h. El anticodn del RNAt se alinea con un codn mutado y se incorpora un
aminocido errado
a. Alteracin de la conformacin del sitio de unin del oxigeno
c. La capacidad de transporte de oxigeno se ve gravemente afectada

d. Aparicin de la anemia
i. Muere un nio
9. Con las letras de su(s) nombre(s) y apellidos (mximo 24) y teniendo en cuenta
la notacin de una nica letra que se emplea para identificar a los aminocidos,
escriba los correspondientes a cada uno de ellos (ignore las letras que no tienen
significado), obtenga la molcula de ARN del cual se pudo haber traducido, luego
la cadena de ADN de la cual se transcribi. A esa cadena simple introdzcale una
inversin (mximo cuatro nucletidos), una deleccin (mximo cuatro nucletidos)
y una transicin. Duplique, transcriba (de la cadena que mut) y traduzca. Cmo
se llama Usted ahora?
R//:

Bibliografa

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