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AMINOACIDOS Y PROTEINAS
PREINFORME PRACTICA N 1
PRESENTADO POR:
GLORIA KATHERIN PERDOMO TORRES
LABORATOTIO DE:
BIOQUIMICA
GRUPO DE LABORATORIO:
1
OBJETIVOS.
MARCO TEORICO.
AMINOACIDOS.
Un aminocido es una molcula orgnica con un grupo amino (-NH2) y un
grupo carboxilo (-COOH). Los aminocidos ms frecuentes y de mayor inters son
aquellos que forman parte de lasprotenas. Dos aminocidos se combinan en una
reaccin de condensacin entre el grupo amino de uno y el carboxilo del otro,
liberndose una molcula de agua y formando un enlace amida que se
denomina enlace peptdico; estos dos "residuos" de aminocido forman
un dipptido. Si se une un tercer aminocido se forma un tripptido y as,
sucesivamente, hasta formar unpolipptido. Esta reaccin tiene lugar de manera
natural dentro de las clulas, en los ribosomas.
Todos los aminocidos componentes de las protenas son L-alfa-aminocidos.
Esto significa que el grupo amino est unido al carbono contiguo al grupo
carboxilo (carbono alfa) o, dicho de otro modo, que tanto el carboxilo como el
amino estn unidos al mismo carbono; adems, a este carbono alfa se unen
un hidrgeno y una cadena (habitualmente denominada cadena lateral o radical R)
de estructura variable, que determina la identidad y las propiedades de cada uno
de los diferentes aminocidos. Existen cientos de radicales por lo que se conocen
cientos de aminocidos diferentes, pero slo 20 (actualmente se consideran 22,
los ltimos fueron descubiertos en el ao 2002) forman parte de las protenas y
tienen codones especficos en el cdigo gentico.
La unin de varios aminocidos da lugar a cadenas llamadas pptidos o
polipptidos, que se denominan protenas cuando la cadena polipeptdica supera
una cierta longitud (entre 50 y 100 residuos aminocidos, dependiendo de los
autores) o la masa molecular total supera las 5000 uma y, especialmente, cuando
tienen una estructura tridimensional estable definida.
CLASIFICACION DE AMINOACIDOS.
La clasificacion de los aminoacidos proteinicos se puede hacer teniendo en
cuenta la relacion de grupos COO-/NH3 +, o considerando criterios que tienen
que ver con su polaridad, presencia o no de cargas positivas o negativas; todo
lo cual, en ltimo trmino, depende de la naturaleza de su cadena lateral (o
grupo R).
AMINOACIDOS NO POLARES:
Aminocidos cidos:
Abreviatura
Asp
Glu
pKa
3,9
4,2
Aminoacidos bsicos:
Abreviatura
His
Lys
Arg
pKa
6,0
10,5
12,5
ENLACE PEPTIDICO.
El enlace peptidico se forma por la condensacion del -COOH de un aminocido
con el -NH2 de otro aminoacido:
ESTRUCTURA TERCIARIA.
En estas proteinas y como consecuencia de sus estructuras primaria y secundaria,
se presentan simultaneamente varias clases de interacciones que determinan su
conformacin.
El uso de solventes organicos miscibles con el agua, tales como acetona y etanol,
actuan como buenos precipitantes de de proteinas, ya que tienen menor poder de
disolver estas proteinas, normalmente se utilizan abajas temperaturas (0C), ya
que a temperauras mayores la proteinas tienden a denaturarse. uso tambien
magnifica la conducta de la proteinas en la tecnica del salting out
Efectos De pH
Las proteinas generalmente tiene muchos grupos ionizables, los que tienen una
variedad de pK. Cada proteina tiene un pH caracteristico al cual las cargas
posivitivas se encuentran en igual cantidad a las cargas negativas, a este pH se
conoce como punto isoelectrico, pI, el cual puede ser conocido atraves del
isoelectroenfoque. En el pI las proteinas tienen una solubilidad minima y son
insensibles al salting in. La solubilidad se incrementa cuando el pH se aleja del pI.
Cristalizacin
MATERIALES.
Material de vidrio
Tubos de ensayo
Gradillas
Esptulas
Pipetas 1, 5 y 10
ml
Mallas de asbesto
Papel filtro
Embudos
Agitador de vidrio
Erlenmeyers 100
y 250 ml
Vasos de
precipitado 250 ml
Vasos precipitado
500 ml
Probeta 100 ml
Pinzas para tubos
en madera
Vidrios reloj
grandes
Mortero con
mango
Soporte para
embudos
Pinzas para tubos
de ensayo
metlicas
Vasos de
Material de vidrio
Reactivos
Alimento de origen
Reactivo de milln
Agua destilada,
vegetal o animal:
Solucin de
concentrados,
CuSO4 1%
protena crnica,
Solucin NaOH
hgado, huevo, etc.
Tapabocas
30% y 40%,
Libros de
Solucin saturada
bioqumica
de NaCl
Marcador de vidrio
HNO3
Cinta para rotular
concentrado,
Cuaderno de
Cristales de
laboratorio
sacarosa
Bata blanca
HCl concentrado,
Marcador para
Acido triclorcetico
vidrio
10%
Solucin cido
pcrico saturada,
Etanol 95%
Solucin de
(NH4SO4) al 50%,
acetona
Solucin de
acetato de plomo
0.5 %
Reactivo de
sakaguchi, cido
actico glacial
HSO4
precipitado de
1000 ml plstico
Vasos de
precipitado de 600
plstico
DIGRAMA DE FLUJO:
Obtencin de los Extractos:
concentrado,
Acido actico al
30%
Aminocidos:
glicina, tirosina,
triptfano,
aminocidos
azufrados, leucina
Ninhidrina ( 2g/l)
preprese en
fresco, Hidrxido
de amonio.
cido sulfanilico
(10g/l en solucin
de HCl 1 mol/l).
Nitrito de sodio,
Carbonato de
sodio
Acetato de plomo,
Nitrato de
mercurio.
Nitroprusiato de
sodio (20 g/l,
preprese fresco).
Alfa- naftol, Agua
de bromo
cido fosfrico,
Molibdato de sodio
Tungsteno de
sodio, Sulfato de
cobre, Nitrato de
sodio
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PRESENTADO POR:
GLORIA KATHERIN PERDOMO TORRES
LABORATOTIO DE:
BIOQUIMICA
GRUPO DE LABORATORIO:
1
S = Solubilidad
= log. de la solubilidad hipottica a fuerza lnica (ji) igual a cero.
Ks= Constante de precipitacin por salado, que varia considerablemente con la
naturaleza de la sal y muy poco con la naturaleza de la protena.
La solubilidad de la mayora de las protenas a una fuerza inica constante,
presenta un mnimo cerca del punto isoelctrico. A este pH, las repulsiones
electrostticas intermoleculares entre las molculas de soluto estn en su mnimo,
lo mismo que las interacciones electrostticas entre los grupos polares cargados y
el agua, por lo tanto las protenas precipitan ms fcilmente.
La mayora de los solventes
orgnicos son
buenos
p r e c i p i t a n t e s p u e s e n g e n e r a l t i e n e n b a j a constante dielctrica.
El dimetilsulfxido y la formamida, con constantes dielctricas
relativamente altas, son buenos solventes
CLASIFICACIN DE OSBORNE DE LAS PROTENAS, POR EL CRITERIO DE
SOLUBILIDAD
La clasificacin comnmente usada no se basa en aspectos estructurales de stas
sino principalmente en su solubilidad frente a diferentes solventes.
Desafortunadamente entre los grupos clasificados no existe un lmite
fijo, pero de todas maneras permite el fraccionamiento de las protenas
provenientes de una misma fuente. Segn Osborne, las protenas vegetales
pueden clasificarse segn su so lubilidad en: albminas, globulinas y glutelinas.
Las albminas corresponden al grupo de protenas que son
s o l u b l e s e n a g u a d e s t i l a d a y e n soluciones salinas diluidas.
Las globulinas son insolubles (euglobulinas) o muy ligeramente solubles en agua
destilada pero son solubles en soluciones salinas diluidas. Con base en las
propiedades de solubilidad no es posible distinguir entre albminas y
seudoglobulina s.
Si se aplican los conceptos de precipitacin por salado, se observa
que las globulinas precipitan en s o l u c i o n e s d e s u l f a t o d e a m o n i o d e l
50% de saturacin, mientras que las albminas lo hacen a
concentraciones mayores del 75% de saturacin. Estas precipitaciones
son mejores si se hacen a pHs cercanos a sus puntos isoelctricos.
Las prolaminas son insolubles en agua pero se disuelven en soluciones acuosas
de alcoholes de bajo peso molecular, en concentraciones entre el 50 y el 90%.
Las glutelinas son insolubles en los solventes anteriores pero se solubilizan en
soluciones diluidas de cido o bases.
Estos dos ltimos grupos solo se encuentran en mate riales vegetales, mientras
que las protenas animales estn constituidas bsicamente por albmin as y
globulinas.
MTODO BIURET
La reaccin de Biuret es una medida del nmero de enlaces peptdicos
presentes. Los compuestos que contienen dos o ms enlaces peptdicos entre
el los pptidos y protenas dan un color rosado o lila caracterstico cuando se
tratan con sulfato de cobre diluido en solucin alcalina. El color se debe al
complejo de coordinacin que se forma entre el tomo de cobre y cuatro tomos
de nitrgeno provenientes de enlaces peptdicos (dos de cada pptido)
METODO DE FOLIN LOWRY PARA DETERMINACION DE PROTEINAS
Las protenas reaccionan con el reactivo de Folin para dar un complejo colorado.
El color que se forma es debido a la reaccin del cobre alcalino con la protena, tal
como sucede en el ensayo de biuret y la reduccin de fosfomolibdato por la
tirosina y el triptfano presentes en la protena. La intensidad del color depende
del nmero de aminocidos aromticos presentes y cambiaran segn la clase de
protena.
MATERIAL DE VIDRIO
MATERIAL BIOLGICO
REACTIVOS
Y OTROS
(ESTUDIANTES)
Tubos de ensayo
Harinas
de
Reactivo de folin
Gradillas
Solucin de sulfato
diferentes cereales
Esptulas
de cobre tartrato
y
leguminosas:
Pipetas 1, 5 y 10
sdico de potasio (
soya, arveja, trigo
ml
5g/l
de
y frijol.
Balones aforados
Tapabocas
CuSO4.5H2O en
de 25 ml
Libros
de
tartrato
sdico
Vasos
de
bioqumica
potsico 10 g/l).
precipitado
de
Marcador de vidrio
Carbonato
de
Cinta para rotular
1000 ml plstico
sodio en NaOH 0.1
Vasos
de
Cuaderno
de
mol/l.
precipitado de 600
laboratorio
NaCI al 1%,
Bata blanca
plstico
Etanol al 75%,
Agitador de vidrio
Marcador
para
NaOH 0.1 N,
Erlenmeyers 100 y
Solucin patrn de
vidrio
250 ml
albmina de huevo
Vasos
de
de concentracin
precipitado 250 ml
Vasos precipitado
500 ml
Probeta 100 ml
Vidrios
reloj
grandes
conocida.(0.25
mg/ml)
Reactivo de Biuret.
DIAGRAMA DE FLUJO.
Pesar 2.0 g de
muestra (en
cada caso ser
una de las
harinas de:
arveja, soya,
frjol, haba,
trigo, cebada,
etc.); pasarla a
un tubo de
ensayo
Vaciar
el sobrenadante a un
baln aforado de 25 ml. Al
residuo agregar de nuevo
otros 10 ml de H2O
desmineralizada y repetir
exactamente el proceso
anterior.
METODO BIURET:
agregar 10 ml de H2O
desmineralizada, agitar
manualmente durante
10 minutos y centrifugar
la suspensin a 2500
rpm por 3 minutos.
Sobre el
residuo que
queda de la
separacin de
las albminas,
se repite ahora
todo el proceso
anterior, pero
agregando esta
vez NaCl al 1%.
Despus de
centrifugar, el
sobrenadante de esta
segunda extraccin se
adiciona al baln que
contiene al primer
sobrenadante. Se
completa su volumen a
25 ml con H2O
desmineralizada
hasta el enrase.
METODO DE FOLYN.
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+
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PRESENTADO POR:
GLORIA KATHERIN PERDOMO TORRES
LABORATOTIO DE:
BIOQUIMICA
GRUPO DE LABORATORIO:
1
ENZIMAS.
Impulsan dentro de los distintos cambios posibles que pueda seguir una
sustancia, cul de ellos en especial, ser el utilizado.
Existen numerosas razones para afirmar que las enzimas son protenas. La
Ms importantes son las siguientes:
a.
b.
c.
Las enzimas son activadas en unas zona muy restringida de pH, y presenta
un punto ptimo de ph donde su actividad es mayor. Las protenas en su
punto isoelctrico, muestran propiedades parecidas desde el punto de vista
de viscosidad, solubilidad, difusin, etc., que resulta del todo similares a las
propiedades de este tipo que muestran las enzimas.
d.
e.
LA SACARASA.
o SUSTRATO.
Los
sustratos
son
especficos
para
cada
enzima:
La sacarosa es el sustrato de la sacarasa que acta rompindola en sus
componentes.
CLASE DE ENZIMAS:
Pertenece a la familia de las disacaridasas, que son las enzimas que se encargan
de romper los disacridos en los monosacridos que los forman.
o ESTRUCTURA EL ALMIDON.
o HIDROLISIS.
La hidrlisis implica la ruptura de un enlace mediante la adicin en medio del
mismo de los elementos del agua. Los polisacridos de la dieta se metabolizan
mediante hidrlisis a monosacridos.
La mayora de los pasos de la degradacin de almidn a glucosa pueden ser
catalizados por tres enzimas distintas, si bien hay otras ms que se necesitan para
completar el proceso. Las tres primeras enzimas son una -amilasa, -amilasa y
almidn fosforilasa. Al parecer solo la -amilasa puede atacar grnulos de almidn
intactos, por lo que cuando participan la -amilasa y la almidn fosforilasa, es
probable que acten sobre los primeros productos liberados por la -amilasa. La
-amilasa ataca de manera aleatoria enlaces 1,4 en las molculas de amilosa y
amilopectina, al principio creando huecos al azar en los granos de almidn y
liberando productos que an son grandes. En cadenas de amilosa no ramificadas,
el ataque repetido por la -amilasa produce maltosa, un disacrido que contiene
dos unidades de glucosa. Sin embargo, la -amilasa no puede atacar los enlaces
MATERIALES.
Material de vidrio
Vaso de
precipitado de 50
ml Vaso de
precipitado de 50
ml( para el grupo
2)
Material biolgico
(estudiantes)
Levadura
granulada
comercial. (No
sirve pulverizada).
Solucin de saliva.
Reactivos
300 ml Acetona
Agua destilada
100 ml de
Solucin de
sacarosa al 5%
Reactivo de
Fehling
Hielo
Esptula
Vidrio reloj
Vaso de
precipitado de 600
ml
100 ml TCA al
10%
200 ml Solucin
de almidn 2%.
Vaso de
precipitado de
250ml
100 ml de KCl al
1.0%
100 ml de solucin
de
lugol.
50 ml Solucin
cido tartrico al
1%
50 Solucin de
NaOH al 0.1 N
50 Solucin de
NaOH al 0.5 N
Vaso de
precipitado de
500ml
Vaso de
precipitado plstico
de 1000 ml
Vaso de
precipitado plstico
de 600 ml
Agitador de vidrio
Pipeta pasteur
Probeta de 100 ml
Embudos y soporte
Erlenmeyers 250
ml
50 ml de buffer
fosfato pH 6.9-7.0
50 ml de cido
clorhdrico al 10%
100 ml de solucin
de glucosa al 5%
Reactivo de
selliwanoff
150 ml de acido
tartrico al 1%
150 ml de NaOH
0.1 M
Erlenmeyers 50 ml
Tubos de ensayo
Gradillas
Pipetas 1, 5,10 ml
Pinzas de madera
para tubos de
ensayo
Solucin de HCl al
5%, Solucin de
NaOH al 5%
Hielo y agua
caliente
DAGRAMA DE FLUJO.
Extraccin de la enzima.
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Obtencin de la enzima
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C
Adicione a la saliva 10 ml
de agua destilada y
mezcle bien. Filtre la
solucin de saliva y rotule
el erlenmeyer como
SOLUCIN DE ENZIMA AMILASA e incube a 38C.
Coloque el tubo # 2 a
temperatura ambiente
de lugol a
cada uno.
Registre
todos los
cambios
que
observe.
tubos
1. Coloque 3.0
mL de solucin
de almidn y 2
gotas de saliva
en tres tubos de
ensayo
previamente
marcados A, B y
C.
Retire los
de ensayo D, E y
F de las
anteriores
condiciones y
agregue cinco
gotas
. Durante diez
minutos coloque el
tubo D en hielo, el
tubo E en el bao
Mara a 37 C y el
tubo F en agua
hirviendo.
previamente
marcados
como D, E y
F, adicione
tres mL de
almidn y
dos gotas de
saliva, a cada
uno.
. Determine el pH
en cada tubo,
utilizando un
pHmetro o papel
indicador
universal.
Registre los
resultados.
Agregue al tubo
A 1.0 mL de
cido clorhdrico
al 5%; al tubo B
1.0 mL de NaOH
al 5%; y al tubo C
1.0 mL de agua
. Prepara un bao
Mara con una
temperatura de
37 C y coloque
los tres tubos de
ensayo durante
10 minutos.
En otros tres
tubos de
ensayo,
Registre los
cambios de
color, olor,
temperatura,
etc.
Retire los
tubos de
ensayo del
bao Mara y
aada cinco
gotas de
lugol a cada
uno.