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2Epsomas
3Tipos
4Aplicaciones
6Conformaciones
7Referencias
8Vase tambin
9Enlaces externos
cual es seguido por una purificacin adicional. Esto resulta en una cantidad
relativamente grande (0,5 -1 mg) de ADN plsmido muy puro.
En los ltimos tiempos muchos kits comerciales han sido creados para realizar
la extraccin plasmdica a varias escalas, purezas y niveles de automatizacin.
Conformaciones[editar]
El ADN plsmido puede aparecer en uno de cinco conformaciones, las cuales
(para un tamao dado) corren a diferentes velocidades en un gel durante
electroforesis. Las conformaciones se muestran abajo en orden de movilidad
electrofortica (velocidad para un voltaje dado), del ms lento al ms rpido:
Lineal: ADN tiene terminales libres, ya sea porque los filamentos fueron
cortados o porque el ADN era linear in vivo. Usted puede modelar este
como un cordn que no se ha conectado as mismo.
plan
A. Introduccin
..........1. los plsmidos y episoma (plsmidos F).
..........2. conjugacin, sexduccin y el plsmido R.
..........3. tipos de plsmidos
..........4. estructura de los plsmidos
..........5. transformacin
..........6. Los marcadores de seleccin
..........7. el replicn y el orgen de replicacin
a continuacin
A. Introduccin
1. Los plsmidos de bacterias
Son molculas de ADN circular o lineal de 1 kb a 250 kb,
contienen de 2 hasta 30 genes. Los plsmidos se rplican y
se transmiten independientemente del cromosoma
bacteriano. La replicacin y la transcripcin de los
---------------------------plsmidos dependen de las protenas de la clula husped. Episoma: Si el plsmido posee la capacidad de insertarse
Los gens codificados por los plsmidos le donan ciertos
en el cromosoma bacteriano se le denomina episoma.
privilegios a la clula husped.
Dentro de este grupo de plsmidos se encuentran los
factores de fertilidad o plsmidos F, que regulan el
El nmero de plsmidos puede variar, dependiendo de su proceso de conjugacin bacteriana..
tipo, desde una sola copia hasta algunos cientos por clula.
Los plsmidos se utilizan en ingeniera gentica por la
2. Conjugacin, sexduccin
y plsmido R
3. Tipos de plsmidos:
Podemos clasificar los plsmidos basndose en su funcin.
a. "Fertility - (F) plasmids" son capaz de conjugacin.
b. " Resistance - (R) plasmids " contienen los gens que pueden
construir una resistencia contra antibiticos o venenos.
Las topoisomerasa I y II
A diferencia de la topoisomerasa 1, la ADN girasa, corta las dos
La topoisomerasa II tiene la propiedad de transformar un ADN
cadenas de la doble hlice del ADN; y acta en la replicacin
circular relajado en superenrollado. Este proceso implica pasar de
del ADN. Mientras, la topoisomerasa 1 corta una cadena del
una forma sin almacenamiento de energa a una forma con alto
ADN para aliviar el superenrrollamiento, y acta durante la
contenido energtico, y por lo tanto es necesaria la presencia de
transcripcin del ADN.
adenosinatrifosfato (ATP) como donante energtico. Por el
contrario, la transformacin de ADN superenrollado en relajado
________________________
con subsecuente liberacin de energa es catalizada
almacenamiento, m: storage, warehousing
directamente por la topoisomerasa I sin necesidad de ATP. La
relajar verbo transitivo: to relax
ADN girasa es una de las topoisomerasas I.
electroforesis: separacin de partculas en suspensin con la
ayuda de un campo elctrico.
La ADN girasa
centrifugacin: separacin de partculas en suspensin con
La ADN girasa, como las topoisomerasas, tiene una funcin muy
la ayuda de un campo gravitacional.
importante en la modulacin del estado topolgico del ADN, pues
regula su estructura superhelicoidal.
a continuacin
5. transformacin
Transformar una bacteria una levadura, consiste en
introducirle en ella una molcula de ADN extranjero (Avery,
McLeod y McCarthy, 1944).
http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Basemol/base_molecular_de_la_herencia.htm
celular.
Para las clulas eucariotas (salvo las levaduras), no se
dicetransformar pero transfectar (transformar una clula
eucariota quiere decir hacerla eterna o hacerla cancerosa).
7. el replicn y el orgen de
replicacin
El elemento gentico que controla el nmero de copias del
plsmido se encuentra en una regin del ADN plasmdico que
incluye el orgen de replicacin. El orgen de replicacin y los
elementos de control asociados definen la unidad gentica
llamada replicn .
8. Clonacin
plsmidos recombinados:
Los plsmidos son excelentes vectore de clonaje. Puede ser
-------------------------------"cortado" con una dos enzimas de restriccin puede
Clonacin: Quiere decir multiplicacin
incorporrsele un fragmento de ADN que ha sido previamente
ori: orgen de replicacin.
cortado usando mas mismas enzimas de restriccin. Los
f1 ori: orgen de replicacin del fago f1. Serva antao
plsmidos as modificados se los denomina plsmidos
para la secuenciacin
recombinados. En ste estado, se los introduce entonces en
una bacteria donde sern replicados.
a continuacin
a continuacin
a continuacin
B. Algunas tcnicas de
clonaje
1. insercin en un gen de
resistencia
Se puede clonar un fragmento de ADN en un gen de
resistencia a un antibitico, con la condicin de que el
plsmido porte al menos 2 gens de resistencia (como pBR
322).
En el ejemplo siguiente, el ADN plasmdico se corta con la
2. insercin en LacZ
Los plsmidos de tipo pUC contienen un segmento derivado
del opern lactosa de E. coli. Ese segmento codifica el
represor, el promotor, el operador y los primeros 146
aminocidos del genlacZ (el pptido alfa, un partes de la galactosidasa).
Polilinker:
Se ha insertado, entre los codones 5 y 6 de la secuencia
lacZa, un polilinker (regin con sitios de clonaje mltiples),
bsicamente una secuencia corta de ADN que contiene
entre 8 a 16 sitios de cortes nicos, por enzimas de
restriccin. El polilinker no modifica las ventanas de lectura,
sin que proporciona un lugar para la introduccin de un
nmero pequeo de aminocidos en la parte aminoterminal del pptido alfa sin cambiar sus propiedades.
Complementacin alfa:
Se muta E. coli para que expriman la -galactosidasa sin el
peptide alfa. La enzima es entonces inactiva: las dos partes de la
-galactosidasa son necesarias para formar una enzima activa.
Estas bacterias no hidrolisan ni la galactosa, ni el compuesto
sinttico X-gal.
Cuando se transforma con un vector pUC estas bacterias, este
vector les aporta el pptido alfa, que les hace falta, provocando
lo que se llama la "complementacin alfa".
Las bacterias transformadas por este vector son fcilmente
reconocidas puesto que ellas forman colonias azules en presencia
de un substrato incoloro X-gal (5-bromo-4 -chloro-3- indolyl-b-Dgalactosida). Cuando X-gal es hidrolisado por la -galactosidasa
produce una substancia azul insoluble en presencia de IPTG (el
inductor de la expresin de la -galactosidasa ).
Si se inserta un fragmento de ADN extranjero en el polilinker, se
destruyen casi todas las entradas de lectura y se para la
complementacin alfa. Las bacterias con plsmido recombinante
forman colonias blancas, puesto que la -galactosidasa es
inactiva. Este mtodo de coloracin permite de identificar de
manera simple las bacterias con plsmidos recombinantes.
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3. clonaje direccional
A pesar de que el vector ser transformado con poca
La mayora de plsmidos utilizados actualmente (como el vctor eficiencia, la mayora de las bacterias resistentes a la
ampicilina contendran el plsmido recombinado.
pGEM del ejemplo precedente) contienen polilinkers con varios
sitios de restriccin nicos que permiten varios usos
experimentales. Permite as tambin de encontrar sitios de
restriccin compatibles con las extremidades del fragmento a
clonar.
Por ejemplo, el vctor pUC19 puede ser digerido por BamHI y
HindIII y, luego de la digestin, el gran fragmento del vector
puede ser separado del pequeo fragmento correspondiente a
partir de un polinker, por electroforsis en gel de agarosa.
El vector puede unirse por ligado a un fragmento de ADN que
tiene extremidades compatibles con aquellas genradas por
BamHI y HindIII.
Las molculas de ADN circular obtenidas sont transformadas en
laE. coli. Las bacterias transformadas son identificadas por su
capacidad de resistencia a la ampicilina. En tanto que no halla
complementaridad entre las extremidades adhesivas BamHI y
HindIII del vector, la circularizacin de aquel no es posible.
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4. defosforilacin
La T4 DNA ligasa cataliza la formacin de un enlace
fosfodister entre los nucletidos adyacentes solamente si Si a pesar de todo se decide clonar en un plsmido un
uno de los nucletidos contiene un grupo 5'-fosfato y el otro fragmento de ms de 10 Kb de talla, har falta tomar
un 3'-OH. Los 5'-fosfatos de las 2 extremidades de una
precauciones para limitar la recircularisacin del vector.
hebra linear de ADN en presencia de una fosfatasa
intestinal de ternero (CIP) alcalina de camarones (SAP) :
no permite ms la recircularizacin del vector. Si se une un
fragmento de ADN con las extremidades 5'-fosfato al vector
desfosforilado, se obtiene entonces una molcula de ADN
circular con 2 cortes. Esos cortes son reparados cuADNo el
plsmido recombinado se introduce en la bacteria. Como el
ADN plasmdico circular es ms eficientemente
transformado que el ADN linear, la mayora de
transformantes contendrn el plsmido recombinado.
Debido a la facilidad de uso, los plsmidos son los vectores
ms empleados en ingenra gentica. Son los vectores ms
eficientes de todos si el tamao del ADN a clonar es inferior
a 10 kb. Para fragmentos con tamao superior a 10 Kb, la
eficiencia de transformacin se hace demasiado dbil.
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C. El opron lactosa
4. el operador
6. la lactosa impide al represor de