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Departamento de Ciencias Biolgicas

Facultad de Ciencias Exactas


Universidad Nacional de La Plata

Regulacin de la transcripcin en
procariotas

Regulacin de la transcripcin en
procariotas
No todos los genes se expresan igual
El nivel de expresin es regulado por seales
ambientales
La transcripcin es regulada por elementos en
el DNA y protenas que interactan con ellos
Tpicamente se regula la etapa de iniciacin

Tipos de protenas que regulan la transcripcin


1. Factores Sigma (control positivo)
Cambian la especificidad de la RNApol por los
promotores
2. Represores (control negativo)
Impide el acceso de la RNApol al promotor
3. Activadores (control positivo)
Favorece la interaccin RNApol-promotor

La unin est modulada por


protenas
activadoras y represoras

Reclutamiento
Cambio alostrico

Accin a distancia

Opern

El opern lac

-galactosidasa

galactsido permeasa

lacY

galactsidos
lacA
tiogalactsido
transacetilasa
(detoxificacin)

lacZ

Opern lac
Dos tipos de regulacin:
Regulacin negativa: depende de los niveles
de lactosa
Regulacin positiva: depende de los niveles
de glucosa

Lac operon

lacZ codes for the enzyme -galactosidase, tetramer of-500 kD. The enzyme breaks a -galactoside into its component sugars.

lacY codes for the -galactoside permease, a 30 kD membrane-bound protein This transports -galactosides into the cell.
lac A codes for -galactoside transacetylase, an enzyme that transfers an acetyl group from acetyl-CoA to -galactosides.

Represor Lac I: tetrmero


Ms de un sitio de unin en el DNA (O1, O2, O3)

La mayora de las secuencias de los


operadores son repeticiones invertidas
el operador lac

La unin del inductor al represor


disminuye su afinidad por el operador

R= Repressor= Lac I

Inducer: allo-lactose, IPTG

Inducer
increases
transcription

El IPTG es un inductor no metabolizable


del opern lac

La induccin del opern lac produce un


aumento de la sntesis de mRNA lac

El modelo de Jacob y Monod

Intercambio gentico entre bacterias

Conjugacin

Fenotipo
(experimental)
Sin induct Con induct

Genotipo
Haploide
I+ O+ Z+ Y+ A+
I- O+ Z+ Y+ A+ ( I-:
I+ Oc Z- Y- A(Oc
Is O+ Z+ Y+ A+
(Is, superrepresor,

af por O)
af por I)

Fenotipo
(denominacin)

100

Salvaje: inducible

100

100

Mutante: constitutivo

Mutante: no inducible

af por O)

Diploides parciales
I+ O+ Z+ Y+ A+
I- O+ Z+ Y+ A+

I+ Oc Z- Y- AI+ O+ Z+ Y+ A+

Factores que actan en trans

Sequencias que actan en cis

Control positivo de la transcripcin del opern lac


cAMP-CAP (cAMP-CRP)
Transcripcin del mRNA lac slo cuando no hay glucosa

CRP: cAMP receptor protein


CAP: catabolite activator protein

cAMP-CRP interacta con el dominio C terminal (CTD) de la


subunidad alfa de la RNA polimerasa

Represin por catabolito


Ocurre porque la glucosa es la fuente de energa preferida por
Escherichia coli

LA REPRESIN POR CATABOLITO ES CONSECUENCIA DE


LA PRDIDA DE UNA REGULACIN POSITIVA

La protena CRP (o CAP) puede unir cAMP y actuar


como un regulador positivo

La unin cooperativa de cAMP-CAP y la RNA polimerasa a


la regin promotora activa la transcripcin del opern lac

El promotor lac contiene tres regiones


cis crticas

Represin catablica
Ocurre porque la glucosa es la fuente de energa preferida por
Escherichia coli

LA REPRESIN CATABLICA ES CONSECUENCIA


DE LA PRDIDA DE UNA REGULACIN POSITIVA

La glucosa no afecta la abudancia del mRNA


lac inmediatamente porque:
1. la sntesis de cAMP debe detenerse;
2. los niveles intracelulares de cAMP deben disminuir (por
transporte activo fuera de la clula);
3. el cAMP debe disociarse de CAP;
4. CAP debe liberarse del promoter lac;
5. la iniciacin de la transcripcin debe declinar al
desaparecer el reclutamiento de la RNA pol;
6. el mRNA lac pre-sintetizado debe ser degradado por
RNasas intracelulares (responsables por la corta vida
media de prcticamente todos los mRNAs bacterianos

Operon Trp:
enzimas de la ruta biosinttica del Trp

El opern trp es regulado


negativamente por el represor Trp

El represor Trp reconoce el operador slo cuando est


unido a su co-represor, el triptofano.

El operador trp es una secuencia


palindrmica

El dmero
represor trp se
une a su
operador a
travs de surcos
mayores en el
DNA

El triptofano induce un cambio


conformacional en el represor Trp

La terminacin prematura por atenuacin participa


en la regulacin de algunos operones

Regin lder del mRNA (trpL)

Mecanismo de atenuacin en el opern trp

Muchas respuestas de las bacterias estn controladas


por sistemas regulatorios de dos componentes

Sensor

La modificacin
covalente reemplaza
a la molcula seal

Regulador

The PhoR/PhoB two-component regulatory system in E. coli

Regulones: desrepresin de los genes del sistema SOS

Represin traduccional: la sntesis de protenas ribosomales y


rRNA es coordinada en funcin de la tasa de crecimiento
20 operones, 1-11 c/u
1 protena acta como represor traduccional
Tambin se une a un rRNA, por lo que slo
inhibe cuando hay exceso

Diferentes promotores son reconocidos


por factores sigma () alternativos

Esporulacin de Bacillus subtilis: el factor sigma de 43 kDa (crecimiento


vegetativo) es reemplazado por otros tres de 29, 30, and 32 kDa. Cada uno
reconoce un grupo de promotores con diferentes secuencias -10 and -35, cambiando
el grupo de genes que se expresan.

La expresin de los genes de un


bacterifago estn regulados por:
1. Factores sigma alternativos

La subunidad sigma determina la especificidad transcripcional de


la RNA pol procariota
Los factores sigma de los virus cambian la especificidad de la
polimerasa durante el proceso de infeccin.

Infeccin de Bacillus subtilis por el bacterifago SPO1 : la


transcripcin del genoma de SP01 se divide en tres etapas:
temprana (early), media (middle), y tarda (late).

Factores organizados en cascada


Existe cuando un factor sigma es necesario para
la sntesis de otro
Los genes tempranos del fago SPO1 son
reconocidos por la RNA polymerasa de la bacteria.
Uno de esos genes tempranos codifica un factor
sigma necesario para la transcripcin de los genes
intermedios
Dos de los genes intermedios codifican para
subunidades del factor sigma requerido para el

reconocimiento de los genes tardos.

La expresin de los genes de un


bacterifago estn regulados por:
2. RNA polimerasas alternativas

Algunos virus codifican para RNA polimerasas que participan de la


transcripcin de los genes virales. Por ejemplo, el bacterifago T7,
que infecta E. coli
La T7 polimerasa se encuentra en los genes tempranos (Clase I)
Los genes medios y tardos (Clase II y III) son especficamente
transcriptos por la T7 RNApol
Uno de los productos de los genes Clase II inactiva a la RNA pol de
E. coli, completando el switch transcripcional de genes de la
bacteria a genes del virus

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