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ACIDOS NUCLEICOS
Dra. Carolina Cucho Espinoza
BIOQUIMICA
Estructura de un nucletido...
Los nucletidos
Nucletido
estn formados
Ac.fosfrico
Nuclesido
por una base
nitrogenada, una
pentosa y un
Pentosa
Base nitrogenada
grupos fosfato.
La base
Pirimidina
nitrogenada puede Purina
ser prica o
pirimidnica.
Adenina(A) y Guanina(G)
Tanto el ADN como el ARN contienen la pirimidina
Citosina(C) pero difieren en la otra pirimidina.
El ADN contiene Timina (T) y el ARN Uracilo(U)
NH2
NH2
N
N
Adenina(A)
N
H
N
O
O
HN
N
H
Citosina(C)
N
H
Uracilo(U)
Los nuclesidos...
La unin de una base
nitrogenada y un azcar
(pentosa), genera un
nuclesido.
Los nuclesidos de las bases
A,G,T,C y U son: adenosina,
guanosina, timidina, citidina y
uridina.
El azcar puede ser ribosa
(ribonuclesido) y 2desoxirribosa
(desoxirribonuclesido)
HOH2C
OH
ribosa
OH
HOH2C
OH
O
OH
OH
Desoxirribosa
Los nucletidos...
Los nucletidos son
steres mono, di y
trifosfricos de los
nuclesidos.
El nuclesido adenosina,
se une al cido fosfrico
para formar:
Nuclesido monofosfato: AMP
Nuclesido difosfato: ADP
Nuclesido trifosfato: ATP
Base
P ~ P ~ P ~OH2C
O
OH
Nuclesido
monofosfato
Nuclesido difosfato
Nuclesido trifosfato
GMP.
aspartato
Los diversos carbonos del
nucleo purina derivan de
N
distintos aminocidos, del
CO2 y del tetrahidrofolato.
El proceso tiene tres etapas:
C
Sntesis de fosforribosil amina
Sntesis de inosina monofosfato
Sntesis de AMP y GMP
Glicina
CO2
C
N
C
C
C
Formil
tetrahidrofolato
Glutamina
5fosfato
Mediante la actividad de la ribosa pirofosfato fosfoquinasa en presencia de
ATP y de Mg
Se activa por el Fosfato inorgnico y se inactiva por la presencia de
nuclesidos purnicos
En la segunda etapa la 5 fosforribosil pirofosfato, en presencia de la
Glutamina:fosforribosil pirofosfato amidotransferasa, de glutamina agua y
magnesio se transforma en fosforribosil amina
POH2C
Fosfoquinasa POH2C
POH2C
O NH2
Mg
Mg
OH
O~P~P
ATP
Ribosa 5 fosfato
Amidotransferasa
AMP
Fosforribosil
1-pirofosfato
Glutamina Glutamato
+ H2O
+PPi
Foforribosil
amina
Sintetasa+Glicina + ATP
Formil transferasa + Formil tetrahidrofolato
Sintetasa + Glutamina + ATP + H2O
Sintetasa + ATP
Carboxilasa + CO2
Sintetasa + Aspartato + ATP
Adenilo succinato liasa + H2O
Formiltransferasa + Formil tetrahidrofolato
Ciclohidrolasa
CH2-NH2
NH2
CH2-NH
O=C
POH2C
Glicina
+ ATP
5fosforribosil
amina
CHO
NH
O=C
POH2C
ADP
NH
Formil tetra
Hidro folatoTetrahidrofolato
5fosforribosil
glicinamida
5fosforribosil
formilglicinamida
N
CH2-NH
CHO
H2N
POH2C
HN=C
N
POH2C
ATP
5fosforribosil
5aminoimidazol
ADP+ Pi
NH
5fosforribosil
I
formilglicinamidina
n
o
COOH
HOOC
HC-NH-C
CH2
H2N
HOOC
H2N
POH2C
ATP
Aspartato
H2N
POH2C
O
Fosforribosil
Succinocarboxamida
Ribosa 5fosfato
aminoimidazol
CO2
5fosforribosil
Aminoimidazol
carboxilato
5fosforribosil
5aminoimidazol
H2O
Fumarato
CO
N
NH2-CO
H2N
H2N
Ribosa 5fosfato
Fosforribosil
Carboxamida
aminoimidazol
Formiltetra
hidrofolato
HN
CO
Ciclohidrolasa
HC-NH
O
N
Ribosa 5fosfato
Ribosa 5fosfato
Fosforribosil
Carboxamida
formamidoimidazol
Inosina 5
monofosfato(IMP)
GTP.
La va que lleva a GMP utiliza ATP.
De esta manera se controla que las proporciones en que
se sintetizan el AMP y el GMP sean equivalentes.
NH
HN
Adenil
N
succinato
CO
GTP+Aspartico CO
HN
N IMP dehidrogenasa HN
OC
Sintetasa
Ribosa 5fosfato
NAD + H2O
Glutamina + ATP
Glutamina sintetasa
NH2
CO
N
HN
ON
NH2
Ribosa 5fosfato
Adenosina
Monofosfato
ON
Ribosa 5fosfato
Ribosa 5fosfato
Adenil
succinasa
HN
Xantosina
monofosfato
Guanosina
Monofosfato
(GMP)
ON
Ribosa 5fosfato
GDP
ATP
GTP
ADP
Nuclesido difosfato
quinasa
nucleasas.
Luego, los nucletidos son desfosforilados a nuclesidos
por fosfatasas y nucleotidasas.
Los nuclesidos son degradados por nucleosidasas o
nuclesido fosforilasas:
nuclesido + H 2O
base + ribosa
nuclesido + Pi
base + ribosa-1-P
La ribosa-1-P es isomerizada a ribosa-5-P
Adenosina
deaminasa
Adenosina
AMP
Inosina
Pi
5 nucleotidasa
H2O
H2O
Pi
Guanosina
GMP
Purina nuclesido
fosforilasa
NH3
Hipoxantina
O2+H2O
Pi
Ribosa 1fosfato
Ribosa 1fosfato
PurinaHnuclesido
fosforilasa
2
O
Xantino oxidasa
H2O2
Aminohidrolasa
Guanina
Xantina
H2O
O2+H2O
NH3
Xantino oxidasa
Catabolismo de las
Purinas
H2O2
cido Urico
inmunodeficiencia; clulas T y B
Gota: hiperuricemia; artritis aguda por depsito
de cristales de cido rico.
Resulta de exceso de purinas o deficiencia parcial en
Aspartato
transcarbamilasa H2N
O=C
PO32
-
Carbamil
fosfato
aspartato
Pi
O
CH2 Dihidroorotasa
CH
N
COOH
H
Carbamil
aspartato
H2O
C
HN
CH2
O=C
CH
COOH
N
dihidroorotato H
NAD
Deshidrogenasa
NADH+H
O
C
CH
HN
O=C
N
CH
HN
CO2
O=C
PP
i
PRPP
C
CH
HN
COOH
O=C
Ribosa 5fosfato
Uridina 5monofosfato
Ribosa 5 fosfato
Orotidina 5monofosfato
C
N
H
COOH
Orotato
Sntesis de CTP
La Citidina trifosfato se forma a partir de la Uridina
UTP
ATP
ADP+Pi
Desoxirribonuclesido difosfato
Ribonucletido reductasa
Tiorredoxina(reducida)
Tiorredoxina(oxidada)
Tiorredoxin reductasa
NADP
NADPH+H
Digestin y
aprovechamiento
de cidos nucleicos en el
intestino
ADN+ARN
pH cido desnaturaliz
cidos nucleicos
cidos nucleicos
desnaturalizados
Nucleasas
Ribonucleasas y
desoxirribonucleasasdel
jugo pancretico hidrolizan
ARN y ADN.
Los oligonucletidos son
hidrolizados por las
fosfodiesterasas
pancreticas
Nucleotidasas y
nucleosidasas liberan
purinas y pirimidinas que
son degradadas en la clula
intestinal y excretadas por
la orina, como en el caso
del c.rico.
oligonucletidos
mononucletidos
Fosfodiesterasa
Nuclesidos
Nucleotidasas
ci
do
ric
o
Orin
a
Nucleosidasas
Bases
nitrogenadas
ADN
ADN: generalidades
Los cidos nucleicos (ADN y
ADN
ADN
ADN
Replicacin
ADN
Transcripcin
ARN
Estructura de ADN
El ADN es un
polidesoxirribonucletido
con muchos
desoxirribonucletidos
unidos por enlaces
fosfodiester 3,5
Existe como una molcula
formada por un par de
cadenas (salvo en
algunos virus)
entorchadas una sobre
otra, en una doble hlice.
En las clulas eucariotes
el ADN est asociado a
varios tipos de protenas
en una estructura llamada
nucleoprotena
Adenina
Citosina
Guanina
Timina
hidroxilo de la desoxirribosa de
un nucletido con el grupo 3
hidroxilo de otro.
La cadena muestra polaridad
en un terminal 5 y en otros
terminales 3 que no estn
unidos.
La secuencia se expresa del
terminal 5 de la cadena al
terminal 3.
Los
enlaces
fosfodiester
pueden ser rotos mediante
endo (al medio)
y exo (al
extremo) desoxirribonucleasas
Terminal 5
P
5
P
5
P
5
P
G
3
P
5
OH
3
Terminal 3
La hlice doble
la hlice doble, las dos
cadenas giran alrededor de un
eje comn.
Estn colocadas de forma
antiparalela, esto es, el terminal
5 de una cadena se une al
terminal 3de la otra.
En la forma clsica B el
esqueleto de desoxirribosa y
fosfato, hidroflico, est hacia
fuera, mientras que las bases
estn hacia adentro
La
estructura genera una
escalera de caracol con una
ranura ancha y otra delgada.
Terminal 3
Terminal 5
En
Terminal 3
Terminal 5
Pares de bases
Las
Adenina
Timina
Guanina
Citosina
Ranura
ancha
Ranura
delgada
Formas
estructurales de
ADN
B-ADN
Z-ADN
Separacin de bases
complementarias en
procariotes
Para
que
las
dos
cadenas se separen debe
iniciarse el proceso en
algn pequeo lugar,
debido
a
que
la
polimerasa slo acta
sobre cadenas sueltas.
En procariotes el proceso
se inicia en un nico
origen de replicacin
melting point a partir del
cual se extiende.
origen
Apertura del
doble helice
Bifurcacin
Separacin de
bases
complementarias en
eucariotes
En
las
clulas
eucariotes,
la
replicacin se inicia en
mltiples puntos a lo
largo del ADN.
Estas zonas incluyen
una
secuencia
Adenina:
Timina
repetida,
y
su
multiplicidad acelera la
replicacin.
Formacin de la
horquilla
ADN
polimerasa
Protena
SSB
ADN
helicasa
Super espiral...
Conforme se separan
Direccin de la Replicacin
de nucletidos en direccin 35 y
sintetiza la nueva cadena en
direccin 5 3.
Luego a partir de un origen se
generaran dos cadenas nuevas en
direccin opuesta. Una en direccin
5 3 hacia la horquilla y otra en
direccin 35 alejndose de la
horquilla.
Adems:hay dos mecanismos
claros:
Cadena primaria: hacia la
horquilla.Se sintetiza
continuamente
Cadena secundaria: desde la
horquilla. Se sintetiza en
fragmentos que luego se unen.
(Fragmentos de Okazaki)
ARN primer
La ADN polimerasa requiere para iniciar el proceso de
Histonas y nucleosomas
Las Histonas son protenas pequeas, cargadas
Nucleosomas y
nucleofilamentos
(H2A,H2B,H3,H4)2
H1
endonucleasa
ADN polimerasa
exonucleasa
ARN
Generalidades
Si bin es cierto, la herencia gentica est contenida
transcripcin
ADN
GPPP
AAA
mARN
tARN
rARN
Clases de ARN
ARN
Factor sigma
3
5
Factor Rho
Secuencia -35
-15 bases
-10 bases
TATAAT
Secuencia de consenso
Terminacin.- El pro-
ceso de elongacin de
la cadena de ARN
contina hasta que una
seal de trmino se
alcanza.
En unos casos
encuentra una protena
llamada factor Rho con
actividad ATPasa.
En otros casos la transcripcin debe poder
formar un giro que
lentifica a la ARN
polimerasa y provoca
una pausa.
Etapas en la sntesis
de ARN en
procariotes
ADN
3~ACACGACTGNNNNNCAGTCGTAAAAT~5
5~TGTGCTGACNNNNNGTCAGCATTTTA~3
Transcripcin
ARN
5~UGUGCUGACNNNNNGUCAGCAUUUUA~3
N
N N
N N
C= G
A= U
G= C
U= A
C= G
5~UGU G= C AUUUUA~3
(28S,18S y 5,8S)
ARN polimerasa II: sintetiza precursores del ARN mensajero y
tambin sintetiza el pequeo ARN nuclear.
Promotores de genes clase II: una secuencia de ADN nucletidos casi
Caja CAAT
Estimulante arriba
del gene
Estimulante
40 bases
TATA
25 bases
Secuencia de consenso
Caja TATA o Caja Hogness
LOCALIZACIONES DEL ESTIMULANTE
Promotor Gene
Promotor Gene
Estimulante
Estimulante abajo
del gene
Modificaciones
Postranscripcionales
Una
Modificaciones Postranscripcionales
ADN
ARN polimerasa I
45S PrerARN
28S
5,8S
18S
ARNasas
Exones:
Segmentos
codificantes
28S
5,8S
18S
Remocin
de
Intrones
Fragmentos que
interrumpen la
regin codificante
del transcripto
Modificaciones Postranscripcionales
ARN mensajero: sintetizada por la ARN polimerasa II, la
al
terminal 5mediante la unin de tres cidos fosfricos, mediante
una guanilil transferasa.
Cola poli A: muchos ARNm tienen una cadena de 40 a 200
nucletidos de Adenina unidos al terminal 3. Generada por una
poli A polimerasa.
Remocin de intrones: durante la maduracin del ARNm se
eliminan los intrones que no participan de la sntesis proteica y se
unen los exones que si forman el ARNm maduro y til, con la
ayuda de snRNAs (pequeos ncleos de partculas de
ribonucleoprotena).
Fuentes de informacin
ALVARADO CARLOS. Repasando Bioqumica y Nutricin 2012