TEMA 5: CIDOS NUCLEICOS

CONTENID
O
TEMA 5: CIDOS NUCLEICOS
1. NUCLETIDOS. Pentosa, base nitrogenada y cido fosfrico.
2. ESTRUCTURA GENERAL DE LOS CIDOS NUCLEICOS.
3. EL ADN. Estructura secundaria (modelo de Watson y Crick).
4. EL ARN. ARN de transferencia. ARN ribosmico. ARN mensajero.

1. Nucletidos
Los cidos nucleicos son polmeros lineales constituidos por unidades llamadas
nucletidos, de forma que cada cido nucleico viene determinado por la composicin
y secuencia de sus monmeros caractersticos (algo similar a lo que suceda con las
protenas -su estructura primaria- y los aminocidos).
Un nucletido est formado por:
-una pentosa,
-una base heterocclica nitrogenada,
-cido fosfrico.

a) La pentosa
En el ARN es la D-ribosa.
En el ADN es la 2-desoxi-D-ribosa.
Ambos
azcares
aparecen en los nucletidos
en
la
forma
cclica
de furanosa.
b) La base nitrogenada
Puede ser prica (derivada de la purina) o pirimidnica (derivada de la
pirimidina).
Bases pricas: adenina y guanina.
Bases pirimidnicas: citosina, timina y uracilo.

La adenina y la guanina se encuentran tanto en el ADN como en el ARN (es

decir, las bases nitrogenadas pricas son comunes a ambos cidos nucleicos).
En cuanto a las bases pirimidnicas, slo la citosina es comn a ambos. La
timina es caracterstica del ADN, y el uracilo del ARN. Por lo tanto:
ADN ===> A, G, C, T.
ARN ===> A, G, C, U.
*Nuclesidos: son el resultado de la unin de una base nitrogenada con la ribosa
o con la desoxirribosa mediante un enlace -N-glucosdico. Este enlace se establece
entre el N-9 de las pricas o el N-1 de las pirimidnicas y el C-1' de
la pentosa (indicamos 1', 2', etc. en lugar de 1, 2, etc. para evitar confusin con la
numeracin de los tomos de la base).

c) El cido fosfrico
Aparece unido a la pentosa por un enlace ster a travs del C-5'.

*Nucletidos: son steres fosforilados de los nuclesidos, por lo que a

veces seles denomina nuclesidos-fosfato. Podra producirse el ster con los hidroxilos
2', 3' y 5' de los ribonucletidos o con los 3' y 5' de los desoxirribonucletidos. Sin
embargo los 2' fosfato y los 3' fosfato son escasos.
La presencia de fosfato confiere carcter cido a la molcula de los nucletidos.

Muchas coenzimas son nucletidos, a los que se asocian vitaminas (como ya

estudiamos en el tema anterior). As nos encontramos con el ATP (adenosn-trifosfato),
que es una molcula que almacena gran cantidad de energa en sus enlaces fosfato y que
desempea un papel principal en las rutas metablicas; y el GTP (guanidn-trifosfato)
que interviene en el ciclo de Krebs, con un papel similar al que hemos visto para el
GTP.

Adems est el AMP-cclico, que acta como segundo mensajero (dentro de la

clula) para hormonas que no pueden atravesar la membrana celular por ser hidrfilas.

El FAD (flavn-adenn-dinucletido) y el NAD (dinucletido de nicotinamida y

adenina) se reducen y participan en reacciones de xido-reduccin del metabolismo.
Algo similar sucede con el FMN (flavn-mononucletido).

2. Estructura general de los cidos nucleicos

Tanto en el ADN como en el ARN los nucletidos adyacentes se encuentran
unidos covalentemente por enlaces fosfodister entre el grupo 5'-hidroxilo de un
nucletido y el 3'-hidroxilo del siguiente.
Se denomina estructura primaria de los cidos nucleicos a la composicin y
secuencia de las bases pricas y pirimidnicas unidas covalentemente al esqueleto
azcar-fosfato.

Para determinar la secuencia de bases de un polinucletido se combinan tcnicas

de hidrlisis selectiva y se analizan posteriormente los fragmentos obtenidos, de forma
similar a como se haca para obtener la secuencia de aminocidos de un polipptido. Las
enzimas utilizadas son:
-Exonucleasas: hidrolizan nicamente los enlaces ster de los nucletidos
terminales de la cadena.
-Endonucleasas: hidrolizan enlaces ster situados en el interior.
Las endonucleasas de restriccin son enzimas de origen bacteriano con tal especificidad
que destruyen los ADN extracelulares introducidos en la clula.
3. El ADN
Es la molcula en la que se almacena -en forma de secuencia de nucletidostoda la informacin gentica de la clula y del individuo.
En las clulas eucariticas el ADN se encuentra localizado fundamentalmente en
el ncleo, aunque tambin se encuentra en mitocondrias, cloroplastos y centriolos.

En las clulas procariticas se encuentra en el citoplasma, en la denominada

zona nuclear.
La masa molecular del ADN es enorme.
Las clulas procariticas tienen un solo cromosoma (luego el ADN es una nica
macromolcula), mientras que las eucariticas tienen varios.

Estructura secundaria del ADN

En 1953 Watson y Crick propusieron un modelo para la estructura
tridimensional del ADN, basado fundamentalmente en:
-las equivalencias de bases observadas por Chargaff,
-los datos de difraccin de rayos X en ADN cristalino obtenidos
por Wilkins y Franklin.
Al principio se pensaba que las 4 bases (adenina, guanina, citosina y timina) se
encontraban en cantidades equimoleculares, pero Chargaff descubri que:
n1 de restos de adenina = n1 de restos de timina
n1 de restos de guanina = n1 de restos de citosina
Luego A + G = C + T (la suma de restos de bases pricas era igual a la suma de
restos de bases pirimidnicas).
Por anlisis de difraccin de rayos X del ADN cristalino altamente purificado se
observaron 2 reflexiones que correspondan a 2 periodicidades:
-una principal de 0'34 nm,
-otra secundaria de 3'4 nm.
Tambin se obtuvieron datos importantes sobre las dimensiones de las
bases pricas y pirimidnicas y de los nuclesidos.
A partir de estos datos Watson y Crick postularon el siguiente modelo estructural
del ADN:
1) La molcula de ADN
estara
constituida por 2
cadenas polinucletidas arrolladas en una estructura helicoidal dextrgira alrededor de
un mismo eje. Forman una doble hlice.
2) Las 2 cadenas son antiparalelas.
3) El arrollamiento es plectonmico (no se puede separar una de las
hebras sin desenrollarlas).
4) Las bases de una de las hebras estn apareadas con las bases de la otra
en planos paralelos entre s y perpendiculares al eje de la hlice.
5) Las bases se aparean de acuerdo con sus tamaos y con la posibilidad
de formar enlaces de H entre ellas (adenina con timina y guanina con citosina): se
forman tres enlaces de H para el parG-C y dos para el A-T.

6)
El
apareamiento de bases se
extiende a lo largo de toda
la molcula de ADN. Por
eso
las
2
hebrasantiparalelas del
ADN no son idnticas ni en
composicin
ni
en
secuencia de bases, sino
que
son complementarias entre
s.
7)
Las
dimensiones moleculares
de la doble hlice son: los
pares de bases adyacentes
se encuentran a una
distancia de 0'34 nm (3'4
); en cada vuelta de la
doble hlice hay 10
restos nucleotdicos por
cadena, por lo que la
distancia que avanza cada
vuelta de la hlice es
3'4 nm (34 ); el dimetro
de la doble hlice es
aproximadamente
de
2nm (20 ), con 2
hendiduras en la superficie:

una superficial y otra

profunda.
Este
modelo
propuesto
por Watson y Crick era
compatible con los datos
obtenidos anteriormente y
permita
indicar
un
mecanismo por medio del
cual
la
informacin
gentica poda replicarse
con exactitud. Los datos
experimentales posteriores
lo han refrendado.
La doble hlice
queda estabilizada por los
puentes de H entre los
pares
de
bases
complementarias y tambin
por
las
interacciones
electrostticas
e hidrofbicas entre
las
bases apiladas en el interior
de la hlice.
Los restos polares
del azcar y los grupos
fosfato
cargados
negativamente quedan en
la parte externa y confieren
a la molcula un marcado
carcter polianinico que
permite un modo de
estabilizacin
adicional
mediante
interacciones
electrnicas con protenas
bsicas
tales
como
las histonas.
Esta estructura de doble hlice la presentan todas las molculas de ADN (en
cromosomas eucariticos , ADN mitocondrial, cloroplastos, procariotas, etc.). Algunos
virus (p. ej. el fago X174), presentan, sin embargo, un ADN circular de una sola
hebra.
4. El ARN
Es el cido nucleico ms abundante en las clulas (aparece en proporcin ms
elevada que el ADN).
Existen 3 tipos diferentes de ARN: ARN de transferencia (ARN-t tRNA), ARN ribosomal (ARN-r r-RNA) y ARN mensajero (ARN-m m-RNA).

Los diversos tipos de ARN participan en la expresin de la informacin gentica

contenida en el ADN. Es decir, mientras el ADN es portador de la informacin gentica
y dicta rdenes para que la clula elabore las protenas, el ARN se ocupa de que esas
rdenes se ejecuten.
Los 3 tipos de ARN no son slo diferentes por su estructura sino tambin por su
localizacin intracelular: aproximadamente la mitad del ARN se encuentra formando
parte de los ribosomas (ARN-r), un 25% en el citosol (fundamentalmente ARN-t y un
poco de ARN-m), y una proporcin significativa en el ncleo (parte asociado de forma
no covalente al ADN y parte en el nucleolo). Igual que con el ADN, las mitocondrias
tienen sus propios ARN especficos (aprox. un 15% del ARN total).

a) ARN de transferencia
Las molculas de ARN-t tienen un pm 25.000, lo que supone entre 75 y 90
nucletidos. Sus molculas son relativamente pequeas. Tienen la funcin de transportar
aminocidos individuales especficos para la sntesis de protenas en los ribosomas.
Cada uno de los 20 aminocidos hallados en protenas posee al menos un ARN-t
correspondiente, mientras que algunos de ellos tienen mltiples ARN-t
(p. ej. en E. coli existen 5 ARN-t especficos para transferir Leu, y algo similar sucede
para algunos aminocidos en mitocondrias y en el citoplasma de clulas eucariticas).
Es el ARN ms estudiado. Tras la determinacin de la secuencia del ARN-t
especfico para Ala, llevada a cabo por Holley, se han secuenciado unos 50 ARN-t ms.
A pesar de tener secuencias de bases muy diferentes entre s, los ARN-t se
caracterizan por contener, adems de las bases principales (A, G, C y U), una
proporcin elevada (hasta un 10%) de bases poco frecuentes.
Adems, todos los ARN-t presentan el nucletido pG en el extremo 5' terminal,
y
la
secuencia pC-pC-AOH en
el
extremo
3'.
Precisamente
a
este extermo adenlico terminal se une el aminocido especfico para dar la forma activa
del aminocido (aminoacil-ARN-t).

Los diferentes ARN-t comparten tambin una estructura secundaria muy

semejante que puede dibujarse bidimensionalmente como una forma que se asemeja a
una hoja de trbol.
Segn este modelo, la cadena polinucleotdica nica se encuentra plegada sobre
s misma y presenta 4 zonas o segmentos de emparejamiento antiparalelo de bases por
enlaces de H, que constituyen una doble hebra intracatenaria similar en su estructura a
la doble hlice del ADN.
Estos segmentos alternan con zonas de conformacin al azar debido a que la
composicin de bases de esos fragmentos no permite su emparejamiento. As, la
molcula presenta 3 lbulos o brazos caractersticos y un brazo abierto que incluye los
dos extremos de la cadena. Algunos ARN-t de cadena ms larga presentan un quinto
brazo accesorio. Los cuatro brazos presentan estructura y funciones caractersticas.
El brazo TC es prcticamente idntico en todos los ARN-t.

El brazo anticodn presenta en su centro una secuencia de 3 bases diferente en

cada ARN-t. Este triplete es el anticodn (secuencia complementaria del triplete del
ARN-m que es caracterstico para cada aminocido). Una de las bases
del anticodn (llamada base "vacilante") presenta una especificidad menor que las otras
dos por su base correspondiente del codn).
De la funcin de los otros dos brazos hablaremos al tratar el proceso de
traduccin o sntesis de protenas en el siguiente tema.
Se sabe que en los ARN-t la molcula se encuentra doblada asimtricamente, y
adopta una estructura terciaria en forma de L, con el brazo anticodn en un extremo y el
brazo aminocido en el otro.

b) ARN ribosomal
Los ribosomas de procariotas y
de eucariotas tienen dos subunidades de
distinto tamao formadas por ARN-r
(65% de su masa total) y protenas. Se
han detectado 3 tipos de ARN-r
en procariotas y 4 en eucariotas, con
coeficientes de sedimentacin diversos
(trataremos de esto al hablar de la
estructura y composicin de los
ribosomas en el siguiente tema). Son
molculas lineales de una sola hebra, con
algunas bases metiladas y con numerosas
zonas de emparejamiento
antiparalelo dentro de una misma fibra.
La funcin exacta, vinculada a la
estructura del ribosoma y al mecanismo
de sntesis de protenas, no est clara
todava.
c) ARN mensajero
Sintetizado en el ncleo como copia complementaria de un fragmento de ADN,
pasa al citoplasma y luego a los ribosomas, donde acta como patrn secuencial de los
sucesivos aminocidos en el proceso de biosntesis de una protena. Cada protena
sintetizada en una clula es codificada por una molcula especfica de ARN-m (que est
constituida por una combinacin de las bases A, G, C y U).
No se ha propuesto ninguna conformacin espacial ordenada para las molculas
de ARN-m sino que se plantea que su molcula sea de estructura abierta o lineal.
La mayora de los ARN-m de las clulas eucariticas se sintetizan con un
fragmento poliadenlico (poli A) de unos 200 restos unido al extremo 3' de la cadena y
cuya funcin no se conoce con exactitud.