At3g13640 ORF

FORWARD O DIRECTO
1
51
101
151
201
251
301
351
401
451
501
551
601
651
701
751
801
851
901
951
1001
1051
1101
1151
1201
1251
1301
1351
1401
1451
1501
1551
1601
1651
1701
1751
1801

ATGTCAGATC
GCCTAAGAAA
CTGGGAAACT
TCAGAGGAGC
TGAAGCTATT
CCCATCGATA
CGGCCGGGGC
TACTGCTCTC
TTAATACTCC
GAACTTCAAA
TATAAAGCCA
TTGGGAAGAT
TGTGCTGATA
ATCTGGTGGA
AGGCTGATAT
CAGAGACTCA
CTACGTAATT
ATTTCGTTTG
CTCCCCTTTT
CCCCACAGAA
CTGAGACTAC
AAATACCCAA
GGAAGGGGAG
GTACAGGGAA
GAAGAGGGTG
GCAAGGGAAT
ACAAGATTCG
AGACCGCTTC
TGGTGGAGAG
CTGATATCTA
CGGATCACAG
AACCGCGTTT
ACCGAGTCAT
TCTCCACAGT
CATCACATTC
TAGAGTCCAT
TTAGACGATT

GATTGACGCG
TGTCGCCAGG
TTGTATCGAG
TGTGTATCGG
CAGATTATCA
TGGGGCTAAT
AAGTCCTTGG
AAAATCTTGG
TCCTGACTGG
GCTATTTCAT
CAACATGTTG
GCTTGAGAAG
TGGAGTTGAA
GAGCTGCAGA
ATACATGTTT
AGGCTGCTCA
GTTGTGGAGC
CTGTTTGTAT
CTGTCAGAGA
AACTTGCGTT
ACAAGAGAAT
ATATGACTAA
TTCACAGACT
AACGACCTTC
TACAATCGGA
GATTCGAAGC
TGATGCATGC
AGATTGAGCA
AAGCAGAGGG
TCTGATTGAC
CTTCAAAGGT
ATTGTGGAGC
TGTGTACGAA
CGCTGCTCAG
AGACGGGATC
CAAGGACAAG
GA

GATTGCTATC
AGTGCAAGAA
GTTGGTTCTA
ATGTGGTATA
ATCTTCCTAA
GGTTTTAAGT
GTTGGTTGGA
CTGGAAAACT
GAAGAAATTT
CCGAGTAGTA
ACTACATAAA
CTGGACGAGA
CCAGGTCCTG
GGTTTGCCAT
GATGAACCAT
AGTTATACGA
ACGACCTCAG
GGGAAACCAG
AGGAATCAAC
TTAGGGATGA
GATGGGGAAG
GCAACTTGGA
CTCAGATTAT
ATCCGGATGC
GATTCCAGAG
GCGAGTGTAC
GCACATCCTC
GTTGATGGAC
TTGCCATTAC
GAGCCAAGTG
CATAAAACGG
ATGACTTCAT
GGACAGCCAG
TGGAATGAAC
CGACTAACTT
GAGCAAAAGA

GTGAGTGAAG
GAGTTGTCCT
CTTCCAAGAG
TGTGTTAAGA
GGACTTAGCC
TGCACAGGCT
ACAAATGGTA
CAAACCAAAT
TGACTCACTT
GAGGAAAATC
AGAAGTTGTT
GAGGACTGAT
GAGCGTGAAG
TGCCGCAGTT
CTAGTTACCT
TCACTCCTCA
CGTCCTTGAC
GAGCATATGG
GTGTTCTTGG
ATCCCTGACC
TGAAGTCCTA
GATTTCAAGC
CGTAATGCTT
TGGCAGGCGC
TTTAATGTGT
AGTGAGACAG
AGTTTATGTC
CAAGTGGTAA
TCTATGCCTT
CGCATTTGGA
TTCATCCTGC
AATGGCAACC
CTGTCAAGTG
CACTTCCTAT
CAGGCCAAGG
CTGCAGGATC

ACCGGTGCAA
GTTGTCAAGA
TGCTTTCATA
AATGCCCGTT
AAAGATACAA
TCCAATTCCA
TTGGAAAATC
CTTGGCAGAT
CCGCGGGTCA
TAAAGACTGC
CGTGGTAATC
GGAAGAGATT
CAAGACAAGT
TTCGTGAAGA
CGATGTGAGG
GGCATGACAG
TATCTCTCGG
TGTCGTGACT
CTGGATTTAT
TTCAGGGTTT
TGCAAGATAC
TGGAAGTGAT
GGAGAGAATG
ATTCCCACGT
CGTACAAACC
TTGCTACATG
AGATGTAATA
AAACTCTGTC
GGGAAGCCTG
CTCAGAGCAG
ACGCAAAGAA
TATCTTGCGG
TATTGCTCAT
CGCACTTGAA
ATAAACAAAC
ATACTACTAC

1. Para el reverse saco la secuencia complementaria

3CGTCCTAG TATGATGATG AATCTGCTAA CT 5
2. La secuencia complementaria anterior la coloco en el orden de 5 a 3
5TC AATCGTCTAA GTAGTAGTAT GATCCTGC 3
3. Entonces, los oligos son los siguientes

Forward 5ATGTCAGATCGATTGACGCGGATTGCTATC3
Reverse 5TCAATCGTCTAAGTAGTAGTATGATCCTGC3
Elaboracin oligos con secuencias de restriccin EcoRI 5 y HindIII 3

EcoRI

HindIII

FORWARD, DIRECTO o 5
Con sitio de restriccin EcoRI GAATTCATGTCAGATC GATTGACGCG GATTGCTATC

REVERSE, REVERSO o 3
1751 TAGAGTCCAT CAAGGACAAG GAGCAAAAGA CTGCAGGATC ATACTACTAC
1801 TTAGACGATT GAAAGCTT
3CGTCCTAG TATGATGATG AATCTGCTAA CTTTCGAA 5

REVERSE O REVERSO 5AAGCTTTC AATCGTCTAA GTAGTAGTAT GATCCTGC 3

Entonces los oligos para ORF 13640 son los siguientes:

1. Forward
Forward 13640 ORF 5ATGTCAGATC GATTGACGCG GATTGCTATC

(Especfico, solo el ORF)

Forward 13640 ORF EcoRI 5GAATTCATGTCAGATC GATTGACGCG GATTGCTATC (Con

sitio de restriccin)

2. Reverse
Reverse 13640 ORF 5TCAATCGTCTAAGTAGTAGTATGATCCTGC 3(Especfico, solo el ORF)
Reverse 13640 ORF HindIII 5AAGCTTTC AATCGTCTAA GTAGTAGTAT GATCCTGC 3(Con sitio de
restriccin)