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Biologie molculaire Chapitre 8

CHAP 8 : LA TRADUCTION
Mcanisme qui permet de fabriquer protine a partir du message contenu dans lARNm.
Protines rsultent de laccrochage successif dAA.
Code gntique : (70s) : traduction ne concerne que les gnes qui codent pour les
protines 22 000.

Le code gntique :

Succession de 3 lettres qui composent les ARNm = Codon : incorporation d1 AA.


Chercheurs ont utilis bactrie comme ouvrier et ont utilis un ARNm qui code pour 1
protine : bactrie utilise message pour traduire en polypeptide.

Proprits gnrales :

universel : utilis par toutes les espces.

dgnr : 4^3 possibilits de codons. 4 lettres possibles pour former combinaison

de 3, 64 possibilits, on a plusieurs codons qui vont signifier de mm AA.


Il y a 61 codons signifiants = incorporation d1 AA.
Les 3 autres sont des codons stop UAA UAG UGA.
CUA CUG CUC CUU = LEU. La plupart des AA sont cods par plusieurs codons. Sauf
mthionine cod par 1 seul codon AUG = Met. Cest le codon dinitiation. Il existe des
enzymes qui peuvent ter la Met en position 1.
La slnocystine : modification dun AA qui est la cystine qui, au lieu de contenir du
souffre contient du slnium. Permet de lutter contre les radicaux oxydants.
Glutathion peroxydase : qui va dtruire les peroxydes forms par la cellule et lutter contre
les oxydants. Elle ne correspond a aucun codon. En fait lorsque lARNm sera lu au niveau
du ribosome, 1 des codons stop va tre utilis. Lorsque ribosome veut incorpore
slnocystine: codon stop lu et va en fait incorporer une srine. Et la chaine
latrale de la srine va tre chang en une fonction SeH sauf que atome de souffre
remplace par slnium. Signaux en amont de lARNm qui ont des signaux SECIS
(selnium cystine insertion squence). Quand ribosome interprt un signal
dincorporation, le codon stop devient codon signal dabord srine et ensuite
modification pour donner slnocystine.

non ambigu : 1 codon ne peut pas signifier plusieurs AA diffrents! 1 codon = 1 AA


pas 2 ^^.

Molcules qui participent a la traduction :

Constituants qui vont assembler le ribosomes pour permettre traduction : ARNm +


ribosomes.
Ribosomes (contient des ARNr): fauteuil a 3 places ^^ ou vont se positionner des
adaptateurs qui apporter les AA = ARNt.
Ribosomes = assemblage dARNr, 10aine de nm. Il peut y avoir milliers de ribosomes
dans cellules.
ARNm : squence imp. Pour la traduction.
1er traduit = 1er codon AUG et Nt se succdent jusqu signal stop. = Cadre de
lecture : message lu par le ribosome. (ORF).
A droite et a gauche du cadre de lecture on a la rgion 5 UTR : non traduite et 3 UTR.
Chez les eucaryotes : fixation de lARNm : squence Kozak : 5 On a une guanine ou
adnine Nt Nt AUGG. Donc en position - 3 on a A/G et en 1 on a A et en 4 on a une
guanine.

Les ARNt : petits ARN en gde quantit qui sert dadaptateur: - de 100Nt de long et

vont tre utile pour apporter les AA dans lusine de synthse des protines.
Ont une forme de trfle avec des rgions en double hlices et des rgions en boucles.
Rgion qui sapparient de faon particulier pour former des doubles hlices.
Se replient dans lespace et forme un L invers, on a lextrmit 3 et la rgion en bas qui
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Biologie molculaire Chapitre 8

correspond a lanticodon. Permet de reconnaitre par hybridation par formation de liaison


H avec le codon au niveau de lARNm.
Message de lanticodon 3 5 et shybride de faon antiparallle donc lie de 5 vers 3.
Au niveau du 3 a se termine toujours par CCA et cest l que se fixe lAA par une liaison
covalente. 3 OH lie lAA.
Enzymes qui accrochent les AA sur un ARNt = amino acyl ARNt synthtase.
Chaque enzyme pourra choisir plusieurs ARNt car code gntique dgnr. (Mais une AA
ARNt S par AA)
Dans les 2 branches en forme de boucles on a des Nt rares = non standard : Nt mthyles,
de la thymine, de la mthyl guanine
Nt rares pour dcourager nuclases de grignoter ARNt.
Les ARNr :
Ribosomes masse molculaire de 5 millions de Da. Ribosomes = enchevtrement dARNr
mlang avec des protines. 4 ARN = coefficient de Svedberg.
On a 5s, 5,8, 18s, et 28s.
Migration des Acides nucliques dans des tubes dultra centrifugeuse. A la surface de ce
sirop a des varit de mol diffrentes. Mol lgre migrent dans gradient de densit. Selon
d de migration, plus elle migre loin, plus elle est petite.
5s + petit 150Nt et 25s 4700Nt.
La petite sous unit contient lARN 18s.
Ces 3 sites dtermins dans ribosomes EPA : E = Exit, P = peptide, A = AA.
ARNt initiateur: dmarre le mcanisme de traduction: reconnait le 1er codon sur lARNm
au cours de ce cycle la gde sous units va se fixer. Le cycle se droule avec lapport des
diffrents AA et synthse des liaisons carboxyle et Amine des diffrents AA. Ds que
peptide synthtis ribosomes se dissocie.
Facteurs de traduction favorise lassociation.
1er lment = activation des AA. Fonction carboxyle sur lARNt : les AA sont activs
chimiquement.
AA + ATP anhydride carboxy phosphorique. Runion par fonction covalente, lune
porte par le carboxyle lautre par le phosphate. AA+ rib + Pate.
Liaison au niveau de lARNt : la fonction hydroxyle libre va attaquer lanhydride carboxy
phosphorique. Cest par lhydroxyle se fait la liaison entre le carboxyle et lARNt et on
libre de lAMP. Raction ralis par AA tRNA synthtase: spcificit des enzymes. Il en
existe autant que dAA;
Lamino acyl tRNA synthtase peut se tromper 1/10 000. Protine > 10 000 AA
rare. De plus est capable de corriger ses erreurs il y a un site qui reconnait la chaine
latrale de lAA et rejette les AA trop gros.

Initiation : chargement du 1er ARNt : Le 1er AA se fixe au niveau du site P. La petite

sous unit fixe lARNm. Forcement lors de linitiation le premier codon AUG va tre lu
par la squence complexe de 3 vers 5 UAC. 1 er AA = Met toujours. LARN 18s
facilite la traduction de lARNm
Il existe des facteurs initiation de la traduction = eIF2 et eIF4.
eIF2 est indispensable a la fixation du 1 er ARNt. Et il va fixer un Nt pour tre activ
qui est le GTP. Ensuite ce facteur avec lARNt incorpor va reconnaitre EIF4 qui tait situ
au niveau de la coiffe.
Le ribosome va scanner le message gntique de 5 vers 3 et sarrte des quil reconnait
le 1er Nt. Mais cela consomme de lATP !

Llongation : une fois que le codon dinitiation a t reconnu, la gde sous unit

va se fixer, prs pour llongation ds que tout fix au niveau de linitiation.


Ensuite va parvenir sur le site de synthse le ribosome : 1 re tape de llongation, 1 ARNt
va lire le code gntique. Ex UUU (Ph) qui va donner un 2 e ARNt qui incorpore une Ph.
Lanti codon sera donc AAA.
Au cours de ce processus, les 2 AA sont trs proche lun de lautre, une peptidyl
transfrase qui est un ribosyl va raliser la liaison chimique entre le 1 er AA et le 2e
. Liaison entre le Co du 1 er AA et le NH du 2 e AA. On a un ARNt qui va fixer 2 AA car la
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Biologie molculaire Chapitre 8

fixation au premier va disparaitre et donc le ribosome va se dplacer vers la droite 5 3,


lARNt va se retrouver au niveau du site E dpourvu dAA et au prochain dplacement du
ribosome il sortira. Au milieu on aura lARNt qui aura les 2AA.
La vitesse de synthse = 20 AA par seconde.
Bilan nergtique :
A chaque fois quon incorpore 1 AA: 3 ATP consomm. 1 ATP lors de lactivation des AA,
1 mol de GTP consomm par la fixation de lAA sur son site A. 1 mol de GTP est
consomm lors de la translocation: dplacement du ribosome.

Terminaison : quand codon stop, le ribosome va interprter le signal et

ninsre aucun ARNt. Il va fixer des facteur protique de terminaison = facteurs


de libration RF (releasing facteur).
Quand ces facteurs se fixent = dissociation des diffrents ribosomes.

Elle peut tre rgule :


Utilisation de mol qui peuvent bloquer la traduction :
Certains antibiotiques : souvent issu de bactrie et souvent vont dtruire traduction des
bactrie.
- la streptomycine : qui va empcher fixation correcte de lARNt initiateur
et empcher la traduction
- La gentamycine: bloque le mcanisme de vrification des appariements
entre codon et anti codon. Elle se fixe sur lARN 18s des bactries (ARN ribosomiaux)
empche reconnaissance entre ARNt et ARNm
- le chloramphnicol : (plutt local) il inhibe lactivit peptidyl transfrase.
- lacide fusidique (fucidine): action locale actif au niveau des infection de la
peau, bloque libration des releasing facteur des procaryotes, empche fin de
traduction : bloque de faon indirecte la traduction.

Contrle de la traduction :
Contrle de qualit : il existe 2 possibilits :
Si mutation au niveau dun ARNm : message gntique incorrecte sur lARNm: cet
ARNm incorrect peut tre dtect par les ribosomes. Ex un codon stop anormal
prmatur. On a 2 codon stop. Il va reprer celui qui est anormal. Ribosome quand
lie message gntique va reconnaitre les protines qui vont tre a la jonction des
messages gntique correspondant au exons. Codon stop : il ny a plus de protine a
la fin du dernier exon, ribosome reconnait quil ny a plus de protine, or si il reconnait
quil y en a encore aprs codon stop, au lieu de risquer davoir une protine anormal il
dtruit tout: il recrute donc le facteur Upf (upstring facteur) reconnait codon stop
anormal en amont. Il recrute un enzyme dcoiffant. Il retire la coiffe par un
mcanisme dhydrolyse et dgradation trs rapide de lARNm par une exonuclase qui
grignote de 5 3 exonuclase.
Plus de codon stop : souvent dans les genopathies. Codon stop mut en un codon
signifiant. Il continue de lire le message et lie le message jusquau polyA, AAA =
lysine, donc le ribosome traduit une protine qui a une grand nombre de lysine du
cot C tal, il va donc recruter un complexe qui est lexosome qui contient a la fois
une exonuclase qui dgrade lARNm en commenant par lextrmit 3 et en
mm tps une protase qui va reconnaitre lanomalie en dgradant les lysines en
partant du Ctale jusquen Ntal.
Mcanisme trs contrl avec conso un peu dE, met en jeu un facteur dinitiation et ce
mca de traduction peut tre contrl quand changement dun codon.

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