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Mcanique des fluides : microfluidique

Simulation dcoulements microfluidiques :


Etude unidimensionnelle du Stacking
Microfluidic flow simulation:
Stacking one-dimensional study
Glawdys Alexis-Alexandre
Universit Montpellier II, France

Bijan Mohammadi
Universit Montpellier II, France

Juan G. Santiago
Universit de Stanford, USA

Rajiv Bharadwaj
Universit de Stanford, USA

Thi study deals with the analyte stacking one dimensional numerical approach which results are closed to the experimental data. The first section is a general presentation of this phenomenon and the multidimensional equations involved in the model. This model is made of a set of electro-diffusional coupled transport equations. In the second part the
one-dimensional equations and the numerical methods used for their resolution are exposed. In the third section the
time resolution algorithm is given and to increase the time precision order we propose a fixed point algorithm. The
fourth and last part is dedicated to the numerical and the experimental results.

I MISE EN PLACE DES QUATIONS

Le stacking peut-tre alors schmatis grce la


figure 1.On modlise ce phnomne par un systme de trois
quations couples rgissant le potentiel, la vitesse et les
concentrations des diffrentes espces prsentes dans la solution. On suppose pour simplifier cette approche que lon est
temprature constante, pH constant, quil ny a ni gnration de pression ni de ractions entre les espces. Toutes
les quations sont dcrites dans [1].

Afin de dvelopper des procds danalyse de concentrations en quantits infinitsimales dans des dispositifs bios
analytiques de plus en plus miniaturiss, il convient daugmenter localement les concentrations des chantillons tudier. Le stacking est un des procds permettant daugmenter localement les concentrations.

I.2 Equation de Poisson

I.1 Quest ce le stacking?

Pour trouver le potentiel lectrique, on utilise la diffrence


de mobilit des espces dans un champ lectrique E (Volts/m).
Dans le cas que nous tudions on suppose que les variations
de densits de charges dues aux mouvements des espces

Son principe est simple, un chantillon dions passant


dune rgion de forte conductivit une rgion de faible
conductivit saccumule linterface de ces deux rgions.

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I.3 Vitesse de lcoulement
La vitesse et la pression sont donnes par la rsolution de
lquation de Navier Stokes :

(1.3)
O est la viscosit dynamique (kg/ms), n la normale
unitaire extrieure, la densit du fluide (kg/m3), P la pression (Pascal), U dsigne le champs de vitesse (m/s) et est
le zta-potentiel qui reprsente la polarisation de la paroi en
prsence des ions.
En labsence de gradient de pression le systme (1.3)
rgissant la vitesse des espces est rduit en deux quations
elliptiques. Ceci induit que le vecteur vitesse est localement
parallle aux parois et proportionnel au champ lectrique

Figure 1 : Stacking dans le cas dun chantillon


danion. Cette figure a t fournie par le dpartement
Mechanical Engeneering de lUniversit de Standford.

ionises sont ngligeables. Le champ lectrique, qui peut-tre


instationnaire ou stationnaire, est donn par E = o le
potentiel lectrique (Volts) est obtenu par la rsolution de
lquation de Poisson :

do

est solution du systme :

(1.1)
(1.4)
O

est la charge totale (Coulomb/m3), p le

nombre total despces chimiques, zk Z est la valence de

o = (1, 2) est le vecteur unitaire tangent aux parois du


canal. Comme le champ lectrique est lui-mme parallle
aux parois cela implique que la vitesse est partout parallle
et proportionnelle au champ lectrique donc :

lespce k de concentration molaire Ck (mol/m3), F est la


constante de Faraday (F = 96 500), r et 0 sont les permittivits relative et absolue (celle du vide). est le domaine de
rsolution et in, out sont les frontires dentre et de sortie
du fluide.
On peut obtenir une autre quation de diffusion pour
dans les configurations lectriquement neutres, cest--dire
o te = e = 0. Si on suppose donc que lon a lectroneutralit, la charge lectrique totale e est dcrite par la loi
dOhm gnralise :

(1.5)

I.4 Advection des espces


Le modle est clos par la description du mouvement des
espces et leurs interactions mutuelles. On rsout donc
lquation dadvection diffusion suivante pour chaque
concentration :

dsigne le courant de densit de charge.


jk = zkkFCk + DkCk U.Ck est le flux molaire (s mol/
m3) o k (s mol/kg) est la mobilit de lespce k et Dk (m2/
s) est le coefficient de diffusion de celle-ci. Ainsi la nouvelle
quation de diffusion intgrant les variations de charges dues
aux espces est :

(1.6)

II DISCRTISATION SPATIALE
(1.2)
Les quations rgissant le stacking tant prsentes il
faut les rsoudre numriquement. Il nest pas ais de construire un modle 2D simulant le phnomne. Une premire

Les conditions limites tant comme pour (1.1).

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tape est alors de considrer que le canal nest rduit qu


une de ces parois pour se ramener a une dimension afin
didentifier les difficults et construire un modle 2D performant.

Posons

et

. La

discrtisation en chaque nud du maillage est, en faisant


une interpolation de type point milieu pour :

II.1 Potentiel
En une dimension, lquation de Poisson (1.1) scrit sous
la forme :

(2.6)

On obtient un systme matriciel semblable (2.4) avec :


(2.1)
On suppose t = 0 que lon a lectroneutralit et que le
maillage est uniforme avec m nuds, la solution de (2.1) est
initialement triviale en chaque nud xi = (i 1) h, i = 1, m
et h = xmax-xmin)/m 1) tant le pas despace :

et

bh,i = i

pour

i = 3,..., m 2,

(2.2)
La mthode de rsolution de ce systme matriciel est identique celle dcrite pour lquation de Poisson.

Dans la boucle en temps lquation (2.1) est discrtise


par un schma diffrences finies centres dordre deux :

II.2 Vitesse
On utilise le modle rduit pour la vitesse 1D, lquation
(1.5) est donc discrtise par un schma diffrences finies
centres dordre un :

(2.3)

avec

et

Pour trouver les composan-

tes (h)2im1) de (2.3) on rsout le systme matriciel


suivant :
(2.4)

(2.7)

o Ah est une matrice (m 2) (m 2) dont les composantes


sont donnes par :

II.3 Concentrations
Lquation unidimensionnelle rgissant les concentrations
est :

Les composantes du second membre sont donnes par :

(2.8)

avec
Le systme est rsolu en utilisant lalgorithme de rduction de Gauss (factorisation LU deAh).
Si on suppose quil y a toujours lectroneutralit au cours
du temps on doit rsoudre lquation (2.5) les conditions aux
bords tant les mmes que pour (2.1).

On intgre (2.8) par parties en espace sur le domaine discrtis


2

vu comme runion des cellules Ki = [xi1/

; xi=1/2], i = 1,, m 1, on obtient :

(2.5)

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III.1 Algorithme

On a alors les quations algbriques suivantes pour chaque nud du maillage initial, i = 1,, m 1 :

Lalgorithme utilis pour rsoudre notre systme dquations dcouple le modle :

que lon rcrit :


(2.9)

(3.1)

(Ck) reprsentant le flux numrique dans lequel a t


inclus le terme de diffusion.
Le programme est construit de telle sorte que seul les termes (Ck,x)i+1/2 et (VkCk)i+1/2 sont discrtiser. On a alors
pour le terme de diffusion :

III.2 Boucle de point fixe


Notre problme est instationnaire, on utilise donc une boucle de point fixe pour augmenter lordre de prcision en
temps. On transforme la formulation temporelle explicite des
quations dadvection diffusion des espces k en une formulation implicite daprs lalgorithme ci-dessous. La discrtisation temporelle explicite de (2.9) tant :

La discrtisation spatiale du terme (VkCk)i+1/2 est base sur


une mthode des volumes finis dcentrs dordre 2. On
introduit donc un dcentrage et une interpolation adquats
suivant le signe de la vitesse Vk :

on voudrait un schma numrique de la forme :

avec

Les valeurs Ck,i+1/2 sont consIl convient alors de transformer (2.9) de la faon
suivante :

truites partir de dveloppement de Taylor au premier et au


deuxime ordre de Ck(x) :

o les

Do lalgorithme de point fixe :

reprsentent des approximations de la dri-

ve

(3.2)

avec = 1.e6 et

est pas de temps numrique et k le pas de temps assurant la stabilit des solutions de chacune des quations
dadvection diffusion :

Ce schma permet de faire disparatre le terme de dissipation lordre 2.

III DISCRTISATION TEMPORELLE


Il faut maintenant construire un algorithme permettant de
contourner la difficult du couplage des quations assurant
la stabilit des solutions.

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est le pas de temps physique.

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IV RSULTATS NUMRIQUES
ET EXPRIMENTAUX

potentiel de 50 V/cm. Lexprience dure 0,6 s et les rsultats


sont capturs toutes les 0,033 s (temps physique effectif).
Le potentiel obtenu, lorsque lon suppose quil y a lectroneutralit, est similaire celui obtenu par rsolution de
lquation de Poisson (fig. 2a). Lhypothse dlectroneutralit est valide numriquement mme si elle na pas dexistence physique. Ceci implique que les courbes des vitesses
(fig. 2b) et des concentrations des espces A (fig. 4a),
B (fig. 4b), C (fig. 3a) obtenus par les deux mthodes se
superposent en de nombreux points. Les rsultats numriques pour les concentrations de lespce C (fig. 3a) sont concordants avec les rsultats exprimentaux (fig. 4b fournie par
lUniversit de Standford). Cependant ils ont un certain
nombre de diffrences, on observe bien le stacking mais les
concentrations trouves exprimentalement se dirigent vers
la droite alors que celles trouves numriquement restent
dans la mme zone. Plusieurs hypothses sont mises pour
expliquer cette diffrence : les donnes exprimentales ne

Les rsultats numriques prsents sont obtenus grce


un code programm en fortran selon lalgorithme prsent
prcdemment. On considre un maillage uniforme de
400 nuds, pour un domaine rectiligne de 1 mm. Il y a trois
espces ioniques prsentes :
des cations A+ (CA0 = 1e3, zA = 1, A = 5,38e13,
DA = 5e10),
des anions B (CB0 = 1e3, zB = 1, B = 3,1742e12,
DB = 3,5e10),
lespce ,C (CC0 = 1e6, zC = 2, C = 3,12039e13,
DC = 2,5e10), dont on veut augmenter la concentration.
Ce modle peut-tre tendu quinze espces. On a de plus
exprime les diffrences de conductivit des
deux rgions considres. On a appliqu une difference de

Figure 2a : Potentiels solutions de lquation de Poisson


(traits pleins) ou de lquation issue de llectroneutralit
(pointills) au cours du temps.

Figure 2b : Vitesses obtenues avec les deux potentiels


au cours du temps.
Figure 2

Figure 3a : Concentrations de lespce C obtenues au


cours du temps, en utilisant le potentiel issu de lquation
de Poisson (traits pleins) ou le potentiel issu de lhypothse
dlectroneutralit (pointills).

Figure 3b : Rsultats exprimentaux pour la concentration


de lespce C au cours du temps.

Figure 3

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Figure 4a : Concentrations de lespce A obtenues au


cours du temps, en utilisant le potentiel issu de lquation
de Poisson (traits pleins) ou le potentiel issu de lhypothse
dlectroneutralit (pointills).

Figure 4b : Concentrations de lespce B obtenues au


cours du temps, en utilisant le potentiel issu de lquation
de Poisson (traits pleins) ou le potentiel issu de lhypothse
dlectroneutralit (pointills).

Figure 4

BIBLIOGRAPHIE

sont pas compltement valides, de nombreuses hypothses


ont t considres pour simplifier le modle, il manque
peut-tre une composante la vitesse, le zta potentiel est
constant dans tout le code. Le modle dvelopp reste
cependant satisfaisant, il servira de base pour le dveloppement dune plate-forme 2D.

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[1] PROBSTEIN Ronald F. (1994). Physicochemical Hydrodynamics, An Introduction, Second edition. New York : Wiley.