RNAs Clases Estructura

y Funciones
Transcripcin
Transcripcin

ADN

Traduccin

ARNm

Protena

Gen
Es un fragmento de ADN que codifica a una
macromolcula, generalmente una protena, pero puede
ser ARN

Transcripcin

ADN

Traduccin

ARNm

Protena

Genoma
Conjunto de genes de una especie

Genoma humano
Genoma humano haploide :
1.7 x 107 nucleosomas
3 x 10 9 pares de bases
Cada cromtide tiene 1.3 x 108 nucletidos

Genoma procariota
Menor tamao
ADN circular
1 sola molcula de ADN
Genoma
ADN desnudo
eucariota
Mayor
ADN tamao
libre en el citosol
ADN lineal
Transcripcin
inmediata
+ de 1 molcula de ADN
ADN
con histonas
ARNm
no se modifican post ADN dentro de la carioteca
transcripcin
Transcripcin no inmediata
Se expresa
casi todo
ARNm
si se modifican
post- del
transcripcin.
ADN
Se expresa el mnimo del ADN

Organizacin
del genoma

Genoma humano
2% del genoma codifica protenas
98% no codifica protenas
24%
ADN satlite
ORI
Telmeros

74%: regula la expresin de genes

Transcripcin

ADN

Traduccin

ARNm

Protena

RNA: cido ribonucleico

RNA: Estructura niveles de

organizacin

Enlaces covalentes

Enlaces no covalentes

Motivos estructurales en el RNA

Helices
Loops
Hairpin
Interior
Bulge
Multibranch
Pseudoknots

Funciones del RNA

Almacen/transferencia de informacin gentica
Estructural

Cataltica
Regulatoria

Funciones del RNA

Almacen/transferencia de informacin genetica
Genomes
many viruses have RNA genomes
single-stranded (ssRNA)
e.g., retroviruses (HIV)
double-stranded (dsRNA)

Transfer of genetic information

mRNA = "coding RNA" - encodes proteins

Transcripcin

ADN

Traduccin

ARNm

Protena

Estructural

Funciones del RNA

rRNA, which is major structural component of ribosomes

BUT - its role is not just structural, also:

Cataltica

RNA in ribosome has peptidyltransferase activity

Enzymatic activity responsible for peptide bond formation
between amino acids in growing peptide chain
Also, many small RNAs are enzymes "ribozymes"

Funciones del RNA

Regulatoria
Recently discovered important new roles for RNAs
In normal cells:
in normal development
e.g., siRNAs, miRNA
As tools:
for gene therapy or to modify gene expression
RNAi
RNA aptamers

Clases y funciones del RNA

Clases de RNAs

Funcin primaria

mRNA - mensajero

Traduccin (sntesis de proteinas)

Regulatorio

rRNA - ribosomal

Traduccin (sntesis de proteinas)

Catalitica

t-RNA - transfer encia

Traduccin (sntesis de proteinas)

hnRNA nuclear heterogeneo

precursores y intermediarios de mRNAs

maduros y otros RNAs

scRNA - citoplasmico pequeo

Partcula de reconocimineto de seal (SRP)

tRNA procesamiento
Catalitica

snRNA - nuclear pequeo

snoRNA - nucleolar pequeo

mRNA procesamiento, Adicin de poly A

Catalitica
rRNA procesamiento/maduracin/metilacion

Regulatorio RNAs (siRNA,

miRNA, etc.)

Regulacin de transcripcin y traduccin,

otros??

mRNA

ARNm Procariota
1. No tiene intrones

2. No sufre modificaciones
post-transcripcin
3. Muchos ARNm son policistrnicos

ARNm Eucariota
1. Tiene intrones
2. Sufre modificaciones

post-transcripcin
3. ARNm es monocistrnico

Diferencias
en los RNA
mensajeros

tRNA

rRNA

Transcripcin

Transcripcin

RNA POLIMERASA

RNA Polimerasa
procariota

RNA Polimerasa
Eucariota
RNA Polimerasa I Precursores de rRNA 28S, 18S 5,8S
RNA Polimerasa II Precursores de mRNA, miRNA, snRNA
RNA Polimerasa III Precurosres de tRNA rRNA 5S

Etapas de Transcripcin
1. Unin
2. Iniciacin
3. Elongacin
4. Terminacin

Etapas de Transcripcin
1. Unin

Etapas de Transcripcin
2. Iniciacin

Etapas de Transcripcin
2. Iniciacin

Etapas de Transcripcin
3. Elongacin

Etapas de Transcripcin
4. Terminacin

Factor rho

RNA inmaduro
Transcripto primario

Factores de Transcripcin

Factores de Transcripcin

RNA inmaduro
Transcripto primario

Procesamiento del mRNA eucarioto

ADN

5
I

Exn

Intrn

ADN
que codifica protenas

ADN
no codificante

ADN satlite

Secuencias 170 nucletidos, repetidas

miles de veces, originan el
Centrmero

ORI
Origen de replicacin

necesario para
Duplicacin del ADN

Telmeros

evita la fusin de

proteccin de las
nucleasas

los extremos del

cromosoma

ADN

3
I

5
E

GEN = UNIDAD DE TRANSCRIPCIN

ARNm
5

(Transcrito primario)

AUG

SD

UGA

3
SS

REGIN CODIFICADORA
Secuencia
seguidora

Secuencia
directora
AUG

Los ARNm transcriptos primarios son modificados antes de salir al citoplasma como ARNm maduros.

Algunas modificaciones son el agregado de molculas:

en el extremo 5' : Capping
en el extremo 3' : Poliadenilacin ( cola poli A)

5
cap

ARNm
(Transcrito primario)

AUG

SD

UGA

3
SS
A
A

A
A
Capping
(7-metil guanosina)

A
Cola poli A
(250 adenosinas)

A
A

Guanililtransferasa

Poliadenilato polimerasa

Modificaciones del ARNm

CAPPING

POLIADENILACIN

SPLICING

1. Eliminacin de intrones
1. Impide la

degradacin del
ARNm
2. Participa en la
remocin de

intrones (ayuda a las

RNPpn)
3. Participa en el Inicio
de la traduccin

y empalme de exones
1. Impide la degradacin
del ARNm
2. Ayudar al ARNm a
salir del ncleo
3. Se aaden
aproximadamente
250 adenosinas

2. Requiere de las
Ribonucleoprotenas
pequeas nucleares
(RNPpn o snRNP) U1 a
U6
3. El complejo resultante
del ensamblado delas
RNPpn se denomina
espliceosoma

Spliceosoma

RNA nucleares: snRNA ricos em Uracilo

Agrupados :
snRNP (snurps) : U1, U2 etc.

mRNA eucarioto maduro

Los ARNm maduros son monocistrnicos, es decir el sector codificador dicta la

secuencia para una sola cadena polipeptdica.

DIFERENCIAS
EN LA TRANSCRIPCIN
PROCARIOTAS

EUCARIOTAS

Existe una sola ARN polimerasa procariota

3 ARN polimerasas eucariotas

La ARN polimerasa procariota no requiere

Las eucariotas requieren la presencia de

factores de transcripcin

factores de transcripcin basales y su

Cada ARN polimerasa reconoce una seal

actividad es regulada por factores de

para la transcripcin

transcripcin especficos.

Ejemplo: Las secuencias sealizadoras

son: TATAAT (caja Pribnow) y TTGACA

Ejemplo: Secuencia sealizadora TATA

(caja Hogness-Goldberg)

Procesamiento de rRNA

Procesamiento de rRNA

Procesamiento de tRNA

Expresin de un gen eucarioto tpico

Protein Coding Gene

DNA

Transcription

Polyadenylation
intron

exon

primary transcript / pre-mRNA

mRNA

Splicing

Export
Translation
Protein

Folding, Modification,
Transport, Complex
Assembly
Protein Complex
Degradation

AAAAAAAAA
Degradation

For each of these

processes, there is
a code
(set of default
recognition rules)