Aislamiento de levaduras degradadoras de petrleo crudo
Se utiliz un medio sinttico Bushnell Hass Sales minerales (BHMS) para
el aislamiento de levaduras degradantes del petrleo crudo. Medio BHMS contiene lo siguiente: KH2PO4, 1g/l; K2HPO4, 0.2 g/l; MgSO4*7H2O, 0.2 g/l; CaCl2, 0.02 g/l; NH4NO3, 1g/l ; NaCl, 2 g/l; y 2 gotas de FeCl3 al 60%. El pH se ajust a 5. El BHMS medio fue suplementado con 1% (v / v) de aceite crudo (petrleo crudo ligero iran) como nica fuente de carbono y energa. Para inhibir el crecimiento de bacterias, se aadi 1% (v / v) de cloranfenicol al medio BHMS. Una parte del sedimento (1 g) o agua de mar (1 ml) se aadi a matraces Erlenmeyer de 250 ml que contienen 100 ml del medio de BHMS; Los matraces se incubaron durante 10 das a 30 C en un agitador rotatorio (INFORS AG, Suiza) que opera a 180 rpm. Luego, alcuotas de 5 ml se transfirieron a medio BHMS fresco. Despus de la serie de cuatro nuevas subculturas, inculo del matraz se estras, y fenotpicamente diferentes colonias se purificaron en medio de agar BHMS. El procedimiento se repiti y slo asla que el crecimiento pronunciado exhibido en el petrleo crudo se almacenaron para una caracterizacin adicional (Hassanshahian et al., 2012). La levadura aislada tambin se cultiv en agar de dextrosa de patata (PDA) para observar las colonias ms grandes para un mejor estudio. Identificacin molecular de las levaduras Se realiz un anlisis de 18S rRNA para caracterizar taxonmicamente las cepas aisladas. El ADN genmico total de 20 ml fue aislado de clulas en fase tarda exponencial utilizando el protocolo de miniprep CTAB para preparaciones de ADN genmico de bacterias (Wilson, 1987). La amplificacin por PCR de los genes 18S rRNA se realiz utilizando cebadores generales eucarioticos EukA (5-AACCTGGTTGATCCTGCCAGT3) y EukB (5-TGATCCTTCTGCAGGTTCACCTAC-3) (Petroni et al., 2002). La reaccin de amplificacin se realiz en un volumen total de 50 l que consta de 50 de la plantilla, 1 x solucin Q (Qiagen, Hilden, Alemania), 1 x Tampn de reaccin Qiagen, 1 M cada uno de adelante y cebador inverso, dNTP 10 lM (Gibco, Invitrogen Co., Carlsbad, CA), 2,0 ml y 2,0 U de Taq polimerasa Qiagen (Qiagen). La amplificacin se realiz en un GeneAmp 5700 (PE Applied Biosystems, Foster City, CA, EE.UU.) durante 35 ciclos thermacycler. El perfil de temperatura para el PCR fue el siguiente:95 C durante 5 min (1 ciclo); 94 C durante 1 min, 50 C durante 1 min y 72 C durante 2 min (35 ciclos); y 72 C durante 10 min al final del ciclo final. Resultados 3.1. Aislamiento e identificacin de levaduras de petrleo crudo degradar Seis cepas de levaduras se aislaron a partir de cultivos de
enriquecimiento que se establecieron a 30 C durante 2 semanas. Dos
de las cepas aisladas que mostraron mayor tasa de crecimiento en el petrleo crudo se selecciona entre los seis aislamientos en estudio. Estas cepas (PG-20 y PG-32) se identificaron por primera vez el uso de pruebas bioqumicas clsicas. La identificacin molecular de los aislamientos se realiz mediante la amplificacin y secuenciacin de las secuencias del gen 18S rRNA y comparndolos con la base de datos de secuencias conocidas de rRNA 18S. Los resultados del procedimiento de identificacin mostraron que dos aislados de levadura pertenecen a la especie Y. lipolytica. Todas las secuencias de dos levaduras se presentaron a la base de datos de secuencia gentica en el Centro Nacional para la Informacin Biotecnolgica (NCBI). Los identificadores de los bancos de genes de estas cepas en NCBI son FM957527 (para PG32) y FM957528 (para PG-20). Los rboles filogenticos de estas dos cepas aisladas se ilustran fig. 1.
en la
La velocidad 1de crecimiento y la extraccin de petrleo crudo
por cepas Dos cepas de Y. lipolytica (PG-20 y PG-32) fueron cultivadas en el petrleo crudo 1% en dos medios diferentes (BHMS y ONR) y en dos niveles de pH diferentes (5 y 7) por 1 semana con agitacin. Despus de 1 semana, el crecimiento microbiano y la biodegradacin de petrleo crudo se analizaron utilizando un mtodo de espectrometra. Como se inform en la Tabla 1, la cepa de Y. lipolytica PG-20 podra degradar hasta un 80% para el petrleo crudo en un medio a pH ONR 5. La velocidad de biodegradacin en el medio BHMS fue menor que en el medio ONR; Adems, el nivel de pH ms cido era mejor para la biodegradacin que el nivel de pH neutro. Sin embargo, en todos los casos la capacidad de biodegradacin de la cepa de Y. lipolytica PG-20 fue mayor que la cepa de Y. lipolytica PG- 32. La Cromatografa de Gases (GC) grficas de estas dos cepas en comparacin con los espacios en blanco se muestran en la figura. 2. Como se muestra en esta figura, la cepa PG-20 disminuy las picas del componente aliftico de petrleo crudo mejor que la cepa PG-32; Sin embargo, que dos cepas igualmente remediadas las picas de los componentes alifticos. La degradacin de los n-alcanos por cepas de levadura El porcentaje de degradacin de los n-alcanos (C9-C25) presentes en el petrleo crudo se calcul mediante la comparacin de los cromatogramas de gas de los controles no degradadas con los de las pruebas para cada cepa (Tabla 2). Los datos obtenidos muestran que las dos cepas completamente degradado longitud de cadena media nalcanos (C9-C16) (100%), pero no completamente degradada longitud de cadena larga (C16-C25) n-alcanos; En este caso, la cepa PG-20 era
mejor en la degradacin que la cepa PG-32. Cuando se aument la
longitud de cadena de n-alcanos, la tasa de degradacin se redujo, ya que las longitudes de cadena larga de n-alcanos son slidas y tienen una baja solubilidad para la degradacin por levaduras. Biodegradacin de algunos hidrocarburos por cepas de levadura Dos cepas de levadura se cultivaron en una concentracin del 1% de los hidrocarburos puros que contenan los siguientes: n-alcanos (C8, C11, C13, C14, C15, C16), Diesel, naftaleno, Phenanterne y Pyrn. Algunos factores relacionados con la biodegradacin se analizaron despus de 1 semana. Los datos se muestran en la Tabla 3 Como se muestra en esta tabla, hidrocarburos alifticos (n-alcanos) apoyar mejor el crecimiento de cepas de levadura que los hidrocarburos aromticos (naftaleno, Phenanterene y Pyrn). Adems, hubo relaciones directas entre tanto la actividad de emulsificacin (E24) y la disminucin de la tensin superficial con el aumento de la tasa de crecimiento de los hidrocarburos. Sin embargo, para todos los compuestos de hidrocarburos, la capacidad de crecimiento de la cepa de Y. lipolytica PG20 fue mayor que la de la cepa de Y. lipolytica PG-32. Actividad de emulsificacin y de disminucin de la tensin superficial por cepas de levadura en diferentes medios Algunos de los factores relacionados con la hidrofobicidad de la superficie celular se analizaron para las dos cepas de levadura. Los resultados se presentaron en la Tabla 1. La Y. lipolytica cepas PG-20 y PG-32 tienen la misma hidrofobicidad de la superficie celular (BAO: 75%). Adems, no hay diferencias en la disminucin de la tensin superficial entre las dos cepas, los dos niveles de pH diferentes y los dos medios diferentes (ONR y BHMS) examinaron. Pero, la actividad de emulsificacin de las cepas es mayor en el medio ONR a pH 5; Adems, la actividad de emulsificacin de la cepa de Y. lipolytica PG-20 fue mayor que la de la cepa de Y. lipolytica PG-32. Discusin Y. lipolytica es una de las levaduras ms estudiadas '"no convencional"' que se utiliza actualmente como un modelo para el estudio de la secrecin de la protena, el dimorfismo, la degradacin de sustratos de hidrocarburos (HS), y varios campos nuevos (Barth y Gaillardin , 1997). La biodegradacin del SA, tales como alcanos, es bastante complejo metablica proceso que involucra varias vas metablicas que tienen lugar en diferentes compartimentos subcelulares. Debido a que estos sustratos no son miscibles con agua, su captacin requiere modificaciones morfolgicas y fisiolgicas, en particular en las propiedades de adhesin celular (hidrofobicidad de la superficie) o en la produccin de emulsionantes (tensioactivos) (Sinigaglia et al., 1994).
Algunos investigadores han aislado levaduras degradan hidrocarburos
de diferentes entornos, incluidos los entornos terrestres y marinos (Manee et al, 1998;. Zinjarde y Pant, 2002a). Mateo et al. (2008) aislado y caracterizado cepas de levadura degradador de hidrocarburos en el agua de la laguna de Nigeria. Informaron dos cepas de Candida, C. albicans y Candida maltosa, como las levaduras de degradacin (Mateo et al., 2008). En el presente estudio, algunas levaduras degradantes del petrleo crudo fueron aisladas del Golfo Prsico. Entre estas cepas, dos cepas fueron identificadas como Y. lipolytica. Nuestros resultados son similares a los de Zinjarde et al. (1997), que aisl Y. lipolytica del agua de mar de aceite contaminado cerca de Mumbai, India (Zinjarde et al., 1997). Se ha observado que la levadura Y. lipolytica es predominante durante la degradacin de alcanos y produccin emulsionante (Zinjarde y Pant, 2002b). Las dos cepas de Y. lipolytica que se describen en este trabajo pueden degradar hidrocarburos alifticos con eficacia, pero no crecer lo suficiente en hidrocarburos aromticos. Levaduras degradadores de hidrocarburos son conocidos por producir sustancias emulsionantes para formar micelas o microgotas de aceite. Y. lipolytica se ha sabido para producir sustancias emulsionantes extracelulares (Torabizadeh et al., 1996). En este estudio, se analizaron algunos factores relacionados con la hidrofobicidad de la superficie celular. Los resultados demuestran que estas dos cepas tienen alta hidrofobicidad de la superficie celular y puede disminuir significativamente la tensin superficial; Adems, estas cepas tienen un nivel aceptable de actividad de emulsificacin en sustratos de hidrocarburos. Amaral et al. (2006) estudiaron la actividad de emulsificacin en medio de cultivo de una cepa brasilea salvaje de Y. lipolytica aislado a partir de agua de ro; encontraron que esta cepa tiene un alto nivel de actividad de emulsificacin en el intervalo de pH de 3-5, similar a nuestros resultados (Amaral et al., 2006). La relacin entre la hidrofobicidad de la superficie celular y la biodegradacin de petrleo crudo por microorganismos ha sido reportado por algunos investigadores (Ijah, 1998). Hasanshahian y Emtiazi (2008) describen una relacin directa entre la hidrofobicidad de la superficie celular y la degradacin de alcanos en las bacterias que degradan el petrleo crudo que se aislaron desde el Golfo Prsico. Los resultados de este estudio sobre la levadura confirman los resultados anteriores de bacterias. Chrzanowski et al. (2005) ilustra una relacin entre hidrofobicidad C. maltosa y la biodegradacin de hidrocarburos, similar a nuestros resultados (Chrzanowski et al., 2005). Debido a la capacidad de los dos aislamientos de la cepa de Y. lipolytica estudi aqu para degradar y oxidar los hidrocarburos y petrleo crudo de manera muy eficiente, estas levaduras se pueden utilizar para los procesos de biorremediacin para disminuir la contaminacin por hidrocarburos en el
Golfo Prsico. Sin embargo, como es de esperar, los resultados obtenidos
en el laboratorio no pueden escalar hasta el entorno natural; por tanto, hay que analizar el comportamiento de estas cepas en experimentos de mesocosmos para determinar la forma en que pueden actuar en el entorno natural para la biorremediacin de ambientes marinos contaminados. Conclusin En este estudio, dos cepas que degradan el petrleo crudo de Y. lipolytica se aislaron desde el Golfo Prsico. Estas cepas tienen altos niveles de degradacin del aceite crudo y un crecimiento suficiente en algunos hidrocarburos alifticos. Se encontr una relacin directa entre tanto la hidrofobicidad celular de las cepas de levadura y su actividad de emulsificacin y la biodegradacin de petrleo crudo y una disminucin de la tensin superficial.