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BQII

2016
1. Tarea de Enzimologa.

1. Si una reaccin obedece la ecuacin de velocidad siguiente v = k[A][B] 2. Si [A] se


modifica:
a) cambia la velocidad de reaccin o la constante de velocidad de reaccin?
b) cul es el orden general de la reaccin?
c) cul es el orden de reaccin para A y para B?
d) cules son las unidades de la constante de velocidad?
2. Determinar cunto (Gno cat-Gcat ) tiene una enzima que disminuir en la energa de
activacin de la reaccin no catalizada para incrementar esta velocidad 106 veces, sin
modificar ni la concentracin de sustratos, ni la temperatura, 25 oC, a la cual se lleva a
cabo la reaccin. Discuta sus resultados, recuerde que puede comparar valores.
3. En un estudio [C.S. Hanes, Biochem J., 26:1406 (1932)] de conversin enzimtica de
amilosa a azcar se obtuvieron los siguientes resultados:
[almidn] %
0.03
0.04
0.05
0.09 0.129 0.216
0.4
0.647 1.078
Vo mg/(5ml
0.14
0.16
0.18
0.26 0.305 0.345
0.4
0.435 0.443
sol*min)
a) Escriba la reaccin efectuada, sealando el tipo general de enzima.
b) Muestre las grficas de v vs. [S] y del doble inverso.
c) Calcule la Km y determine el valor de Vmax, no olvide las unidades.
4. Compara los valores obtenidos por los tres modelos: Lineweaver-Burke, Eadie-Hofstee
y Hanes-Woolf de Km, y Vmax para la enzima para una ATPasa aislada del msculo de
paloma. Su estudio de cintica en el laboratorio reporto los siguientes datos.
5
1.7
1
0.7
0,56
[ATP] M
2.6
1.95
1.7
1.4
1.24
V M/min
1/[S] (1/M)
1/V
(min/M)
V/[S ] (min)
[S /V]
(1/min)
5. Determine los parmetros (Km, Vmax, k cat) de la siguiente cintica enzimtica, [E]o y
de la coenzima fue de 1.6*10-9 M.
[S]o ( mM)
8.33
5.55
2.77
1.38
0.83
Vo
3.62*1
3.39*1
2.75*1
1.99*1 1.49*10
-6
(mM/seg)
0-6
0-6
0-6
0-6
6. Usando la ecuacin de Michaelis-Menten complete las datos de la tabla si Km es de 1
mM
[S]o ( mM)
Vo (moles/L*
min)

0.5
50

10

7. La hexoquinasa cataliza la fosforilacin de glucosa y de fructosa con ATP. Sin embargo


el Km de la glucosa es 0.13 mM y el de fructosa es de 1.3 mM. Considere que el valor
de Vmax es el mismo para ambas reacciones y que ambas tienen un comportamiento
hiperblico de velocidad de reaccin vs. S.
a) Escriba la reaccin efectuada, sealando el tipo general de enzima.

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b) Calcule el valor normalizado de la velocidad inicial de reaccin (es decir


vo/Vmax) para cada sustrato cuando las [S]o son de 0.13, 1.3, 13 mM.
c) Para cul de los sustratos tiene mayor afinidad?
[S]o ( mM)
0.013
0.13
1.3
13
vo/Vmax
para
glucosa
vo/Vmax
para
fructosa
8. Uno de los factores crticos del diseo experimental para la cintica enzimtica es la
eleccin correcta de las concentraciones de sustrato. Considerando los problemas
anteriores a su juicio cmo seleccionara las concentraciones de sustrato? en funcin
de Km, de Vmax o ambas?
9. Se estudi el efecto del ortoarsenato sobre la reaccin de hidrlisis de la fosfatasa
alcalina a pH 8, los siguientes resultados fueron los encontrados.
[S]o
[fosfato]
mM
0.05
0.10
0.20
0.40
0.50
0 mM
0.33
0.50
0.67
0.80
0.83
Vo
[arsenat
0.5
0.20
0.33
0.50
0.67
0.71
(moles/ L*
o]
mM
min)
1 mM
0.14
0.25
0.40
0.57
0.63
a) Escriba la reaccin efectuada, sealando el tipo general de enzima.
b) Grafique y diga de qu tipo de inhibidor se trata
c) Estime el valor de Km, Vmax de la reaccin sin inhibidor y
d) Calcule el KI del inhibidor.
10.
La fumarasa cataliza la deshidratacin del L-malato a fumarato. Los siguientes
datos se obtuvieron a 25oC en ausencia y en presencia de malonato un inhibidor de la
enzima a una concentracin fija de enzima:
[Malato] mM
0.33
0.50
1.00
2.00
0
20.40
25.65
33.30
40.00
Vo
[malonat
moles/
o]
2x10-5
9.26
12.66
20.00
28.57
min
mM
4x10-5
5.99
8.47
14.28
22.23
__1___ mM-1
[Malato]
__1__
0
[malonat
Vo
2x10-5
o]
min/mol
mM
es
4x10-5
a) Escriba la estructura del sustrato y del inhibidor
b) Complete la tabla y grafique el doble reciproco
c) De qu tipo de inhibicin se trata?
d) Calcule el valor de Ki y compare con el valor de Kd para el Malonato que es de
4.2 x10-4 M bajo las mismas condiciones experimentales.
OPCIONAL.
1.
El cido desoxirribonucleico (DNA) es el portador primario de la informacin
gentica en los organismos vivos. El DNA se copia desenrollando su estructura de
doble hlice, como un proceso de primer orden. A 50C, la vida media del
desenrollamiento se estima en 2 min.
a. Cul es el valor de la constante de velocidad?

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b. Cul es la velocidad de reaccin cuando la energa de activacin de alrededor


de 400 kJ/mol
c. Use esta informacin para estimar la vida media del desenrollamiento a la
temperatura fisiolgica de 37C.
d. comente acerca de la importancia de la regulacin de la temperatura en el
cuerpo humano.
2.
The binding of a ligand L to a enzyme is studied. The protein concentration it 10 -3
M. The amounts bound, b, for each added [L] is given as the following:
[L]
.001 .002
.005
.007
.01
.02
.05
(M)
(b)
5*10 3.3*1
3.78*1 4.72*1 4.95*1 5*10 5*10
-6
-3
-3
(M)
0-3
0-3
0-3
0-3
Find if it is cooperative, the number of binding sites, and Kd

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