EVOLUCIN DE LOS GENOMAS

Evolucin Genomas
Mutacin y recombinacin aportan los medios
para que los genomas evolucionen.
Se debe combinar el entendimiento de
mutacin y recombinacin con las
comparaciones de los genomas de diferentes
organismos con el fin de inferir patrones de
evolucin genmica.

Genomas: los primeros 10 billones de aos

Cosmlogos creen que el universo empez hace 14
billones (1 billn = mil millones 1 X 109) de aos con el
Big Bang.
Hace 10 billones, segn modelos matemticos, se
originan las galaxias.
Hace 4.6 millones de aos se forma el sistema solar.
Tierra en sus inicios cubierta de agua en este vasto
oceano aparecieron los primeros sistemas bioqumicos.
Hace 3.5 millones de aos se originaron las primeras
clulas vivas.

or the last 3.6 billion years, simple cells (prokaryotes);

for the last 3.4 billion years, cyanobacteria performing photosynthesis;
for the last 2 billion years, complex cells (eukaryotes);
for the last 1 billion years, multicellular life;
for the last 600 million years, simple animals;
for the last 550 million years, bilaterians, animals with a front and a back;
for the last 500 million years, fish and proto-amphibians;
for the last 475 million years, land plants;
for the last 400 million years, insects and seeds;
for the last 360 million years, amphibians;
for the last 300 million years, reptiles;
for the last 200 million years, mammals;
for the last 150 million years, birds;
for the last 130 million years, flowers;
for the last 60 million years, the primates,
for the last 20 million years, the family Hominidae (great apes);
for the last 2.5 million years, the genus Homo (human predecessors);
for the last 200,000 years, anatomically modern humans.

Sistemas precelulares
Vida celular fue un estadio relativamente
tardo en la evolucin bioqumica.
Fue precedida por la auto-replicacin de
polinucletidos siendo los progenitores de los
primeros genomas.
Iniciar estudio de evolucin de genomas con
los sistemas precelulares.

Origen de los genomas

Primeros oceanos composicin de sal similar a
los de hoy.
Atmsfera terrestre y gases disueltos en los
oceanos muy diferente con los de hoy.
Contenido de oxgeno fue muy bajo hasta
cuando fotosntesis evolucion.
Al inicio los gases ms abundantes fueron
probablemente metano y amonio.

Origen de los genomas

Experimentos han mostrado que descargas
elctricas en mezclas de metano y amonio
result en la sntesis qumica de una variedad de
aminocidos tales como: alanina, glicina, valina y
otros.
Cianuro y formaldehdo tambin se formaron
quienes a su vez participaban en otras reacciones
bioqumicas para formar otros aminocidos, asi
como tambin purinas, pirimidinas y azcares en
menor abundancia.

Material extraterrestre
Meteoritos con molculas orgnicas.
Esto mismo pudo acontecer en la tierra.

Origen de los genomas

Al menos algunos de los bloques para
construir biomolculas pueden haberse
acumulado en la chemosfera antigua.

Primeros sistemas bioqumicos

centrados en el RNA
DNA
RNA PROTENAS
RNA: pudo haber surgido primero que el DNA
y las protenas por:
RNA: almacena informacin gentica como
DNA.
RNA: cataliza reacciones qumicas como las
protenas.

Primeros sistemas bioqumicos

centrados en el RNA
Polimerizacin de bloques construidos para
formar biomolculas pudo haber ocurrido en los
oceanos.
Haber sido promovida por repetida condensacin
y secado de gotas de agua en la nieve.
Polimerizacin pudo haber tomado lugar en
superficies slidas utilizando monmeros
inmovilizados.
.

Primeros sistemas bioqumicos

centrados en el RNA
El oceano pudo haber contenido 1010
biomolculas por litro con lo cual un billn de
aos sera necesario para que eventos de
polimerizacin pudiesen ocurrir. Esto significa
que an los ms improbables escenarios
pudieron ocurrir y no pueden ser desechados.

Primeros sistemas bioqumicos

centrados en el RNA
Progresos en el entendimiento del origen de la
vida fueron inicialmente visualizado por los
requerimientos que polinucletidos y
poliptidos deben trabajar con el fin de
producir sistemas bioqumicos que se
autoreproduzcan.
1980 Descubrimiento que el RNA puede tener
actividad cataltica

Emsamblando un cuadro
completo del mundo del RNA

Sntesis qumica prebitica.

Encontrando ribosimas funcionales.
Teora evolutiva y modelamiento.
Cooperacin molecular.
Replicacin del RNA al interior de las clulas.
Medio ambiente terrestre inicial.
Energa y metabolismo.

Prebiotic chemical synthesis

How can nucleotides be synthesized in
appreciable quantities?
How can nucleotides be polymerized into
strands long enough to be functional?

Finding functional ribozymes

How small is the fraction of random
sequences that can act as functional
ribozymes, and how long do functional
sequences have to be?
Are there ribozymes that can make accurate
copies of themselves by any mechanism?

Evolutionary theory and modelling

Is it easier to begin life with an autocatalytic
set or a single polymerase?
What is the error threshold for cooperative
trans-acting replicators in a spatially
structured model?

Molecular cooperation
Can larger cooperative sets be assembled?
Can an autocatalytic set be designed that
uses single nucleotides as input?

RNA replication inside cells

Did surface-based replication precede
protocells?
How were growth and division of protocells
controlled by the genetic material inside?

Early Earth environment

What were the temperature, pressure, salinity
and other physical conditions in which
replication got going?
What other molecules were relevant to
replication (for example, lipids, mineral
catalysts and peptides)?

Energy and metabolism

What was the source of energy and raw
materials for RNA-based organisms?
Can we find a set of ribozymes that will
catalyze all the metabolic reactions involved in
their own synthesis?

Primeros sistemas bioqumicos

centrados en el RNA
Ribozimas pueden realizar:
autoclivaje
clivaje de otros RNAs
sntesis de enlaces peptdicos.
In vitro, molculas de RNA sinttico han mostrado la
capacidad de realizar sntesis de:
Ribonucletidos
Sntesis y copiado de molculas de RNA y transferencia de
un aa ligado al RNA a otro aa formando un dipptido
anlogo como lo realiza el tRNA en la sntesis proteica.

Polimerizacin espontnea de RNA

Dos escenarios para evolucin de

los primeros RNAs codifiantes
Una ribozima que es tambin una molcula
codificante.
Una ribozima que sintetiza molculas
codificantes.

Conversin de RNA codificante a molcula progenitora del primer genoma de

ADN. (Reduccin de ribonucletidos a deoxiribonucletidos)

CORTO PPTIDO DE ACIDO NUCLEICO. Backbone

amido en lugar de azcar fosfato.

DNA
Adquisicin de doble cadena posiblemente
para reparar daos.

EVOLUCIN DE LA VIDA

Adquisicin de nuevos genes

(Menos de 1000 en bacterias a 27.000 vertebrados)

Evolucin superfamilia de las globinas

Cr. 14

17

22

16

11

Evolucin gene globina beta en

mamferos

EVOLUCIN CLUSTER GNICO HOX

Mecanismos para duplicacin gnica

Crossing over desigual.
Intercambio de cromtides hermanas
desigual.
Amplificacin de ADN.
Deslizamiento de la replicacin.

Formacin de intrones

Duplicacin de genomas completos

El Genoma Humano: ltimos 5

millones de aos

Evolucin humana
El hombre es menos veloz que un caballo,
menos poderoso que un oso; Tiene la vista, el
odo y el olfato menos desarrollados que un
perro o un gato. Sin embargo, controla el
planeta: muchos investigadores creen que ha
sido el desarrollo del cerebro y de las manos lo
que ha permitido llegar a ese control.

Evolucin Biolgica vs evolucin

cultural
Biolgica
genes
lenta

Cultural
Mediada por
ideas
Tasa de cambio
rpida y
exponencial
Agentes de cambio variacin azar propositada
Variacin

seleccin direccional

Biolgica

Cultural

Naturaleza de una

nueva variante
Transmisin
Naturaleza de la
trasmisin
Distribucin en la
naturaleza
Interaccin

a menudo peligrosa
padres a hijos
simple
todas formas vida

a menudo beneficiosa
Por todos los medios
puede ser altamente
compleja
nica del hombre

evolucin requiere del hombre

cultura humana
necesit del
hombre biolgico para alcanzar el cerebro humano

Ev. Biolgica
Complejidad
aparicin de nuevos genes

Cultural

Formacin de
nuevas ideas y
obtenida por
tecnologas.