MIKROBIOLOGI

DNA
singular dan sirkular

DNA tidak berasosiasi dengan histon
Tidak mempunyai membrane-enclosed organelles
Dinding sel pada kebanyakan prokariotik
mengandung complex polysaccharide peptidoglycan

Sitoplasma sel bergranular
ribosom melayang di
sitoplasma

Beberapa prokariotik memiliki flagela sebagai alat
gerak

Umumnya memperbanyak diri dengan cara
pembelahan biner

Morfologi sel bakteri

Struktur sel bakteri
Komponen eksternal dari dinding sel

1.
2.






Dinding sel bakteri

Membran sel bakteri
Sitoplasma sel bakteri : badan inklusi (inclusion
bodies), ribosom, nucleoid, plasmid
Bacterial endospores
3

Bentuk dan
rangkaian:
 Cocci: diplococci,

streptococci,
tetrad, sarcina,
staphylococci
 Bacilli: diplobacilli,
streptobacilli,
coccobacilli
 Spiral: vibrio,
spirilla,
spirochaeta
4

Rods
Bacillus subtilis

Cocci
Enterococcus

Spiral
Leptospira interrogans
5

Ukuran sel bakteri:

Sebagian besar bakteri berukuran 0,2 -2,0 M
(diameter) dan 2-8 M (panjang)
E.coli 1,1 -1,5 M (lebar) 2-6 M (panjang)
Mycoplasma 0,3 M (diameter)
Nanobacteria
kurang dari 0,05 M 0,2 M
Spirochetes
500 M (panjang)
Oscillatoria
7 M (diameter)
9

10

Glycocalyx
substansi yang menyelimuti sel (selubung gula)
Terdapat dua jenis selubung:
 kapsul : struktur yang sangat terorganisasi dan melekat kuat
pada dinding sel
Slime layer : lapisan yang tidak terorganisasi, mudah dihilangkan

Fungsi : perlekatan pada permukaan, proteksi

pada desikasi, sumber nutrisi, patogenesis

Flagella (singular: flagellum)

 Filamen yang mencuat dari sel bakteri dan

berfungsi untuk pergerakan bakteri

11

The Prokaryote Flagellum

Flagella

Bacterium

12

Filamen Axial
 Flagellum-like structure
 Mobilitas bakteri
cth: pada Spirochetes

Fimbria
 Berperan dalam perlekatan
host cell, other

bacterial cell
 Cth: pada Neisseria gonorrhoea
kolonisasi pada
membran mukosa
13

Pili
 Lebih panjang dari fimbria
 Berperan dalam transfer molekul genetik (DNA)

konjugasi

14



Terletak di luar membran sel

Fungsi:
 Menentukan bentuk sel
 Memproteksi sel dari lisis
 Memproteksi sel dari substansi toxic
 Patogen
berperan dalam mekanisme

patogenisitas

Merupakan target dari beberapa antibiotik

15

Dinding sel bakteri

tersusun atas
peptidoglikan
kaku
peptidoglycan memiliki 2
komponen
 glycan
N-acetylglucosamines
(NAG) & N-acetylmuramic
acids (NAM)

 Peptide
tetrapeptide

 Peptide cross bridges

16

BAKTERI GRAM (+)

BAKTERI GRAM (-)

17



Dikembangkan oleh Christian Gram pada

tahun 1884
Didasarkan pada perbedaan struktur dinding
sel bakteri gram (+) dan gram (-) serta
bagaimana komponen tersebut bereaksi
terhadap berbagai reagen yang terlibat

18

19



Kristal violet
masuk ke dalam sitoplasma

Iodine
masuk dan membuat kompleks dengan
kristal violet
Alkohol
 Gram (+):

alkohol menyebabkan dehidrasi pada sel (shrink the

pores of the thick peptidoglycan)
impermeabel thd
crystal violet-iodine
 Gram (-):
lapisan peptidoglikan tipis, porus besar
alkohol
bereaksi dengan lipid pada membran luar
(selanjutnya akan porositas dinding sel)


Safranin
gram (+) ungu, gram (-) pink

20

Karakteristik

Gram (+)

Gram (-)

Gram reaction

Dapat menahan crystal

violet dan terwarnai ungu

Dapat mengalami
dekolorisasi dan terwarnai
pink oleh safranin

Peptidoglycan layer

Tebal (multilayered)

Tipis (single-layered)

Teichoic Acids

Ada

Tidak Ada

Outer membrane

Tidak Ada

Ada

Periplasmic space

Tidak Ada

Ada

Lipid

Sangat sedikit

Banyak
(Lipopolysaccharide layer)

21

Fosfomycin : mentarget gen murA

mencegah pembentukan subunit
peptidoglikan
NAG dan NAM
Sintesis teichoic acid
tag O gene

perkembangan antimikrobia baru yang
mentarget gen dan produknya
Teichoic acid
immunizing agent

proteksi terhadap bakteri Gram (+)
22

Membran plasma prokariotik sebagian besar

terdiri atas phospholipid
membentuk 2
lapisan
lipid bilayer
Tidak mempunyai banyak sterol
Fluid mosaic model
Terdapat protein
peripheral protein &
integral protein
Fungsi: selective barrier (selective
permeability), memecah nutrien, penting
dalam produksi energi, transportasi, sekresi
23

Dijadikan target oleh antimikrobia

 Alkohol dan senyawa quartenary ammonium

desinfectan
 Polymyxins
merusak phospholipid membran

24

Inclusion bodies
 Digunakan untuk penyimpanan (senyawa karbon,
substansi inorganic dan energi)
glikogen merupakan
bentuk penyimpanan dari energy-rich glucose molecule
Ribosom
 Berperan dalam sintesis protein
 Target dari beberapa antibiotik
gangguan pada sintesis
protein
Erythromycin
Chloramphenicol
Streptomycin
Gentamicin 25

Nucleoid
 Tidak diselubungi oleh nuclear envelope
 Pada umumnya bakteri hanya mempunyai satu kromosom sirkular

yang mengandung informasi genetik
semua informasi untuk

struktur dan fungsi sel
 Tidak ada protein histon
 DNA
looped dan coiled , berasosiasi dengan beberapa protein
nukleoid untuk menjaga stabilitasnya

Plasmid
 Extrachromosomal DNA
 Ukuran 0,1% - 10% dari ukuran kromosom bakteri
 Membawa gen untuk produksi toksin dan resistensi terhadap

antibiotik
dapat ditransfer dari satu sel ke sel lain melalui pili saat
konjugasi
potential therapeutic target
26

Dibentuk pada proses sporulasi, ketika bakteri

terekspos oleh stres lingkungan yang sangat
besar
Sebagian besar terjadi pada bakteri Grampositive rods
kecuali pada bakteri gram
negatif Coxiella burnetii
Endospora
resisten terhadap panas, desikasi,
zat toksik, antibiotik dan radiasi UV
Apabila kondisi lingkungan kembali
memungkinkan : endospora
vegetatif
(proses disebut germinasi, dipacu oleh tekanan
fisik/kerusakan kimia pada selubung endospora)
27

28

Bakteri penghasil endospora yang sering

mempunyai implikasi klinis = Bacillus dan
Clostridium
Clostridium botulinum

 problem dalam industri makanan
 Toxin botulinum
penyakit infeksi
 Resistensi endospora pada panas
dihilangkan

dengan kombinasi panas dan tekanan tinggi

29

Bacillus anthracis :
 Terorisme
 Organisme ini menghasilkan endospora yang dapat

dimanipulasi secara khusus
a highly dispersible

endospore powder
 Material ini ditemukan pada tragedi anthrax tahun
2001
menewaskan 5 orang dan melukai 17 orang
 Endospora anthrax sangat kecil (3,5M atau kurang

diameter)
penetrasi ke organ dalam seperti paruparu
serious infection
 Endospore
resisten terhadap antibiotik
susah
dalam penanganan
30

1.

Ciri-ciri
Mayoritas archaea berasal dari kondisi
lingkungan ekstrim
Archaea dapat dibagi ke dalam tiga
kelompok:

Kelompok halobacteria : halofil ekstrim, dapat hidup

pada lingkungan dengan kadar garam tinggi
Kelompok bakteri termoasidofilik: lingkungan panas
ekstrim dan keasaman ekstrim
Bakteri metanogenik: archaea anaerob, penghasil gas
metan
31

2.

Struktur sel
Struktur

Fungsi

Membran
sitoplasma

Pembatas semipermeabel

Dinding sel

Melindungi sel terhadap tek.osmotik

atau kerusakan fisik

Flagela

Pergerakan sel

Kromosom

Sirkular, DNA berasosiasi dengan protein

serupa histon
mempertahankan
struktur kromosom

Ribosom 70S

Translasi mRNA menjadi protein (RNA

5S, 16S, 23S dan protein spesifik
archaea)
32

Membran plasma
 4 perbedaan mendasar membran plasma archaea dengan

organisme lain:

Chirality dari gliserol

Ikatan eter
Rantai isoprenoid
Percabangan rantai samping

Dinding sel
 Tidak memiliki peptidoglikan
 Dinding sel terdiri dari pseudopeptidoglikan,

metanokondroitin, protein atau glikoprotein
archaea

tidak peka terhadap antibiotik (penisilin dan sefalosporin)
33

1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.

Morfologi sel bakteri

Komponen eksternal dari dinding sel
Dinding sel bakteri
Membran sel bakteri
Sitoplasma sel bakteri : badan inklusi (inclusion
bodies), ribosom, nucleoid, plasmid
Bacterial endospores
Archaea
Note: 20 menit diskusi kelompok, 35 menit
diskusi kelas (@kelompok 5 menit)
34

Tortora, G.J., Funke, B.R., and Case, C.L.,

2007, Microbiology: an introduction, Pearson
Education Inc., San Fransisco
Willey, J.M., Sherwood, L.M., and Woolverton
C.J., 2009, Prescotts Principles of
Microbiology, McGraw-Hill Higher Education,
New York
Strelkauskas, A., Strelkauskas, J., and
Strelkauskas D.M., 2010, Microbiology: a
clinical approach, Garland Science, New York
35

TERIMA KASIH

36