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El crecimiento de los microorganismos, en concreto de las bacterias, puede ser de forma libre (aislados), a lo que llamamos
crecimiento planctnico o ms comnmente crecen formando biofilmes. Los biofilmes son ambientes bacterianos
constituidos por la adhesin de bacterias a superficies o interfases sobre las que crecen. Estos biofilmenes, son ms difciles
de tratar, y se estudiar ms adelante su completa composicin.
Objeto de estudio y ciencia microbiolgica.
El objeto de estudio de la microbiologa son los microorganismos. Los microorganismos son seres vivos no distinguibles a
simple vista (excepto Epulopiscium fishelsoniil que mide 0,5cm y Thiomargarita mamibiensis acumula en su interior grnulos
de S fosforescentes).
Para observar a estos microorganismos se necesitan microscopios:
- Resolucin: distancia mnima entre dos puntos que es visible. El ojo humano es capaz de detectar de 0.1-0,2mm de
distancia.
- Aumento: poder de incrementar el tamao de una imagen.
En la microbiologa se da una uniformidad y una diversidad del mismo concepto. En cuanto a uniformidad hablamos de que
todo lo estudiado son microorganismos y este estudio se realiza mediante un microscopio. Los microorganismos se
consiguen mediante mtodos de cultivo y se realizan estudios bioqumicos, moleculares e inmunolgicos
Hablamos de diversidad para referirnos a los distintos tipos de organismos que estudiamos, pues bien pueden ser bacterias,
hongos, procariotas, virus, priones y viroides.
Existe gran diversidad microbiana. Como hemos citado, muchos organismos son
capaces de vivir como clulas aisladas. La microbiologa tiene coherencia por su
metodologa de estudio y por su aproximacin a los problemas.
Se trata de una ciencia biolgica bsica (modelo), industrial y aplicada (medicina,
agricultura).
La microbiologa estudia microorganismos como las archeas, que viven en los ambientes ms extremfilos. Pero, los
microorganismos ms estudiados son las bacterias y procariotas, que constituyen 2/3 del total de microorganismos del
mundo y se pueden encontrar en todos los ambientes.
Origen de la vida.
El origen de la vida en la Tierra data de hace 450mda: las condiciones primitivas, como Fe, S, pH cido y t elevada no
permitan la vida. Los estromatolitos aparecen hace 3500 mda, se trata de bacterias muy primitivas (Australia), aunque no se
poseen fsiles directos de bacterias como para datar la fecha exacta de su origen. Hace 2000 millones de aos, sin
embargo, aparecen las primeras bacterias fotosintticas, las cianobacterias, que como consecuencia comienzan a convertir
la atmsfera anoxignica en oxignica. La atmsfera aerobia permite la aparicin de los primeros eucariotas.
La teora endosimbintica propone la asociacin de bacterias y de clulas ms complejas dando lugar a las clulas
eucariotas (ribosomas 80S, excepto en los cloroplastos y mitocondrias que presentan ribosomas 70S como los procariotas).
As pues, se demuestra que dentro de una misma clula pueden coexistir orgnulos eucariticos con otros de procedencia
procaritica. La aparicin de O2 propulsa la formacin de xidos de hierro y aparecen bacterias oxidantes del hierro (color
rojo, xido). Las cianobacterias fueron las primeras en sintetiza oxgeno, permitiendo el desarrollo de la vida aerbica y
dotando a la Tierra de una capa de ozona que la protega de la luz UV. Todo ello, dio lugar al desarrollo de organismos
eucariticos superiores.
Historia de la microbiologa.
La historia de la microbiologa comienza en 1677 cuando Leeuwenhoek disea los primeros microscopios, basdose en la
idea de combinacin de lentes que usaban los telescopios. Mediantes estas lentes pticas se observaban calidades de las
telas, y poco a poco fue tallando y mejorando estas lentes. Su proximidad al museo de ciencias le llev a observar distintas
muestras biolgicas, llegando a observar lo que l llam animculos. Por ello se considera el padre de la microscopa y el
origen de la microbiologa: llego a dibujar sus observaciones, que eran seres minsculos pero observables con el ojo
humano a travs de lentes
La primera publicacin cientfica en ingls fue llevada a cabo por Jenner, que realizo estudios de inmunizacin en 1796.
Ya en el siglo XIX, Pasteur, un catedrtico de Qumica en Pars y Strasburgo es el que comienza a estudiar con ms
detenimiento las bacterias. A l se le considera el padre de la microbiologa, sobre todo en el campo de la bacteriologa.
Comienza entonces un debate internacional sobre la procedencia de los microorganismos, posicionndose en los que
pensaban que lo haca por generacin espontnea y aquellos que sostenan una idea evolutiva. Se demostr, finalmente, el
origen evolutivo de los microorganismos demostrando que cada clula proceda de una anterior.
Pasteur adems, realizo estudios de las fermentaciones alcohlicas llevadas a cabo por Saccharomyces ceriviseae.
Posteriormente comienza el estudio de los microorganismos en relacin con las enfermedades, se investiga la vacuna
contra la rabia (mdula de conejo inoculado con el virus de la rabia). As pues, las hazaas de Louis Pasteur en el campo de
la ciencia y la microbiologa fueron:
- Rebate la teora de la generacin espontnea
- Teora de los grmenes como causa de la enfermedad infecciosa
- Descubrimiento de la implicacin de levaduras en la fermentacin
- Aplicacin de la pasteurizacin y tcnicas de desinfeccin
- Inmunizacin contra la rabia
Los fermentos son en realidad seres vivos, grmenes de organismos microscpicos que abundan en la superficie de todos
los objetos, en el aire y en otras localizaciones.
La teora evolutiva frente a la de la generacin espontnea se apoy en un experimento realizado con un extracto de carne
dispuesto en un matraz de cuello de cisne, no esterilizado. Se someti a ebullicin, de modo que los microorganismos
moran en el caldo y se eliminaban las partculas contaminantes Al dejarlo abierto, los microorganismos del aire
contaminaron las partes dl matraz expuestas al mismo. En el lquido, sin embargo, no poda existir la vida hasta que no se
pusiesen en contacto los microorganismos del aire con el ambiente all creado. Por tanto, si inclinaban el lquido hasta entrar
en contacto con la parte externa del tubo, all crean los microorganismos. As se demostr que los microorganismos solo
podan existir a parir de otros microorganismos, y no por generacin espontnea.
3. Reinoculacin en animales que estn sanos y enfermen con los mismos sntomas.
4. Reaislamiento en cultivo puro.
Ehrlich, De Boering, Mechnikov (1912): avances en inmunologa y quimioterapia.
Fleming (1950): descubrimiento de los antibiticos.
1979: erradicacin de la viruela
1983: descripcin del VIH
Genmica microbiana: actualidad.
Posteriormente, Pace introduce el uso de la subunidad pequea del ribosoma (rRNA 16S, estructura lineal plegada con regiones
complementarias) como herramienta filogentica y marcador molecular evolutivo, que cumple las siguientes caractersticas:
Presente en todos los organismos (16S o 18S)
Misma funcin en todos los microorganismos, no existiendo divergencia de funciones (aunque cierta diversidad del rRNA en cuanto a
su estructura)
Regiones conservadas en todos os organismos
Regiones diferenciadas para establecer las diferencias (V1-V9 regiones).
El rbol filogentico de Doolittle es aquel en el que debido a mutaciones y/o recombinacin entre los distintos organismos, adems de la
seleccin natural, se obtienen nuevas especies. Evolutivamente hablando existen evoluciones transversales y verticales (transferencia
horizontal de genes y evolucin). Aqu se demuestra que la evolucin no es lineal, sino intrincada o saltatoria.
El dominio Archea es uno de los menos estudiados, no por falta de inters sino por la dificultad de estudio de estos microorganismos.
Se sabe, que son evolutivamente ms cercanos a los eucariotas que a los procariotas, pues contienen molculas parecidas a las de los
primeros (como las histonas), por lo que debieron evolucionar desde el ancestro comn a partir de la lnea nucleoide.
Los microorganismos el dominio Archea viven en hbitats muy particulares:
Hipertermfilos acidfilos: en lugares muy cidos y de alta temperatura, donde son capaces de sobrevivir gracias a sus caractersticas
particulares. Tambin pueden vivir en fuentes termales o ambientes muy fros, cidos, con presencia de metales, etc.
Sulfolobus acidocaldarius: vive en fuentes geotemales de hierro, muy cidas debido a la oxidacin de este de Fe2+ a Fe3+.
Thermoplasma acidophillum: microorganismo acidfilo y termfilo, parecido a los mycoplasmas.
TAXONOMA MICROBIANA.
Ciencia que se encarga de la clasificacin de los seres vivos en grupos taxonmicos segn el grado de relacin entre dichos
organismos. La taxonoma es un proceso que tiene como objetivo la construccin de sistemas que permiten clasificar a los organismos
y poner de manifiesto sus relaciones filogenticas.
Finalidad:
- Organizar todos los conocimientos que se tienen de los microorganismos.
- Agrupar y dar nombre a los microorganismos
- Identificarlos, determinar a qu taxones pertenecen los microorganismos aislados
Clasificacin
Ordena los organismos en taxones segn
su similitud
Nomenclatura
Asigna nombres cientficos a los taxones,
utilizando el sistema binomial de C. Linneo
(s. XVII). As se conocen los
microorganismos mediante un nombre
admitido internacionalmente y siguiendo
normas establecidas.
- Cdigo Internacional de
Nomenclatura Bacteriana
- Comit Internacional de
Sistemtica de Procariotas
Identificacin
Determina a que taxones pertenece un
determinado aislamiento (caracteres
morfolgicos, fisiolgicos, bioqumicos,
genticos y moleculares).
Fundamentos de la clasificacin.
Existen dos formas generales para elaborar los sistemas de clasificacin:
Sistema fenotpico o fentico: no tiene implicaciones evolutivas ni filogenticas.
Agrupa a los microorganismos en funcin de sus similitudes, semejanzas y caracteres fcilmente observables. Se denomina tambin
natural, ya que hace referencia a la naturaleza biolgica de sus miembros.
- til en la identificacin, ya que emplea caracteres fenotpicos
- No se basan es estudios filogenticos, aunque estos estudios pueden revelar ciertas o posibles relaciones evolutivas.
Sistema filogentico o filtico: hace referencia a relaciones evolutivas y filogenticas.
Agrupa a los microorganismos en base a sus posibles relaciones evolutivas, segn sus relaciones filogenticas. Esto es complicado
debido a la falta de un registro fsil de las bacterias
Los dendogramas son representaciones graficas de las relaciones evolutivas, de modo que se van enraizando hacia atrs en los
distintos niveles de clasificacin taxonmica. Hablaremos de rbol filogentico cuando exista un ancestro comn. En bacterias, no se
pueden realizar este tipo de representaciones debido a la falta de un registro fsil.
Manual de Bergey: primer tratado o manual de clasificacin de bacterias.
- Manual determinativo de bacteriologa, fentica o fisiologa. Recoge una clasificacin de las bacterias que puede utilizarse en la
identificacin de nuevas especies.
- Manual de bacteriologa sistemtica: incluye aspectos filogenticos de clasificacin (no patognicos, como se hizo en la primera
edicin).
Microscopa.
Caractersticas del objeto a observar.
- Cianobacterias: emiten fluorescencia
-Resto de microorganismos: no emiten fluorescencia y son normalmente incoloros. Para poder observarlos es necesario crear un
contraste, basado en la tincin con colorantes o en la difraccin de la luz mediante las lentes del microscopio (contraste de fases=
Las tinciones son tiles para la identificacin de microorganismos y
visualizacin de estructuras. Pueden ser directas o indirectas (negativas), si lo
que se tie es el fondo con nigrosina. Adems, habr que tener en cuenta si el
montaje de la observacin se realiza en hmedo o en seco.
As pues, tras la extensin, fijado y secado de la muestra se realizan las
tinciones correspondientes, que pueden ser:
Simples: directa o negativa
Diferenciales: Gram o AAR (tincin de Zeehl-Neelsen, ms agresiva)
Las tcnicas de tincin no sirven solo para bacterias, sino tambin para otro tipo de microorganismos como algas y archeas.
Ferroplasma acidiphilum: arquea que utiliza hierro para su crecimiento, posee una forma irregular ya que no tiene pared y pertenece a
la clase Thermoplasmata. Sobrevive en cido sulfrico y se puede alimentar de alguna forma de pirita.
Riftia pachyptila: microorganismos que realizan simbiosis con bacterias que oxidan el sulfhdrico.
Planococcus halocryophilus: soporta bajsimas temperaturas de hasta -25C. y soporta altas concentraciones de sal.
Chlamydomonas nivalis: alga microscpica.
Existen ciertos microorganismos que presentan bioluminiscencia, es decir, capaces de emitir luz: Alivibrio fisheri (Vibrio fisheri), Vibrio
harveyi, etc (viven en simbiosis con los ojos de los peces).
fluorocromo (gracias a la excitacin de los electrones y vuelta al estado normal, emitiendo luz visible). A su vez, la microscopa ptica
engloba aquellos microscopios que trabajan con luz del espectro visible, utilizando lentes de cristal.
- Microscopios UV-fluorescencia
- Microscopios de campo claro
- Microscopios de campo oscuro: poseen un disco opaco entre la fuente de luz y la lente del condensado, limitando la entrada de luz a
la muestra (no es necesario teir, sino que podemos ver muestras al natural sobre un fondo oscuro).
- Microscopio de contraste e fases / interferencia.
PAG 5 DE LAS DIAPOS.
Debemos diferenciar en os microscopios pticos el lmite del objetivo que va de 0-100x y el lmite del ocular, 10x. El mximo aumento
ser por tanto 1000x.
El lmite de resolucin es la distancia mnima entre dos puntos a la que pueden distinguirse uno del otro, esto refleja el concepto de
poder de resolucin de un microscopio y determina la mxima amplificacin til de los microscopios pticos.
El mayo lmite de resolucin indica una menor potencia del microscopio. El aceite de inmersin debe poseer el mismo ndice de
refraccin que el cristal, de modo que se mejora el poder de resolucin.
El ndice de refraccin n es una medida relativa de la velocidad a la que la luz atraviesa un medio.
Tintes y tcnicas:
Calcofluor: fluorocromo utilizado en microscopia de fluorescencia (microscopia ptica), pues libera la energa absorbida al enfocarlo
con la luz. Se une a polmeros de quitina y celulosa (tabiques bacterianos).
Naranja de acridina: flourocromo metabolizado en el interior de la clula y convertido, por estas, en color verde, lo que indica su
viabilidad (vivas). Si observamos color naranja, las clulas estarn muertas.
Anticuerpos fluorescentes especficos de algunas bacterias.
Microscopio de fluorescencia utilizado en aquellos organismos que tienen fluorescencia intrnseca. (Chlorococcales)
Los microscopios electrnicos utilizan energa de baja longitud de onda, en concreto, electrones. Estos viajan a alta velocidad en el
interior de tubos a alto vaco, y se dirigen al lugar deseado, normalmente la muestra, mediante lentes electromagnticas
(electroimanes).
Microscopio electrnico de transmisin (TEM): la
muestra cortada mediante un micrtomo en cortes muy
finos, es atravesada por los electrones, ya que esta se
sita a la mitad. La tincin de la muestra se hace con sales
de metales pesados, de modo que los electrones se
conjugan con esta, rebotan o bien se transmiten. Existe
una pantalla fluorescente en el inferior que recoge los
resultados. Esto nos permite observar el interior de las
clulas y la superficie externa de las mismas.
Microscopio electrnico de barrido (MEB o SEM): la
muestra se sita en la parte baja y los electrones recorren
esta (fijada, desecada y teida con oro), de modo que se
obtiene una imagen tridimensional en relieve.
LT-SEM: modalidad del SEM que utiliza muestras a muy baja temperatura, de modo que no se fijan ni se desecan, lo que es una gran
ventaja ya que no exige una manipulacin compleja de la muestra.
Caractersticas de la microscopa electrnica (TEM y SEM): los electrones difractados se recogen en una pantalla donde se
observa la imagen.
- Electrones propagados a alto vaco
=0,004nm
LR=0,002m-0,0005m
Amplificacin: 10000-500000x
- Utiliza electroimanes como sistema de lentes
- Preparacin de la muestra: cortes ultrafinos y tinciones especiales
- Recepcin en pantallas o filmes.
Las limitaciones que presentan son que las clulas observadas mueren por alto vaco y que las tcnicas especiales de contraste
son poco efectivas, debido a la poca penetracin de los electrones en la muestra (ya que estas estn recubiertas de metales
pesados).
La preparacin de las muestras en microscopa electrnica es compleja.
- Se pueden utilizar cortes finos de muestras, para lo que es necesario fijarlas, deshidratarlas y posteriormente endurecerlas. As
estarn preparadas para ser cortadas en un micrtomo y conseguir muestras ultrafinas. Posteriormente se realiza una tincin de
contraste, con metales pesados, oro, etc El fundamento de esta tincin reside en que los electrones quedaran adheridos a estos
metales en las zonas donde estn presentes, mientras que no lo harn si estos no estn. De este modo, los electrones transmitidos o
difractados, difieren de aquellos que han rebotado o se han quedado conjugados a los metales pesados. As podemos obtener
imgenes tridimensionales, relieves, ver el interior de las clulas, etc.
- Las tinciones pueden ser directas (con metales pesados como oro, platino, paladio) o tinciones negativas o indirecta. Estas se
utilizan para estructuras superficiales y finas como flagelos y tambin para virus.
- El sombreado metlico es una tcnica de tincin en oblicuo y en vertical, de modo que se consigue una tincin parcial de la muestra,
creando una sombra o punto ciego. As, se consigue es aspecto de una imagen tridimensional aunque en realidad estemos observando
una imagen bidimensional.
- Criofractura: tcnica basada en la ultra congelacin con nitrgeno lquido a -198C, y por posterior tratamiento metlico se consigue la
ruptura de la muestra. As, podemos observar el interior de los microorganismos en superficie. A veces se aade sombreado y
tratamiento qumico.
Otros tipos de microscopa derivados de la microscopa electrnica TEM y SEM:
- Microscopa con lser confocal (CLSM): Microscopio de fluorescencia con lser confocal: las muestras teidas con un fluorocromo
(naranja de acridina e isotiocianato) emiten luz que pasa a travs de una apertura pequea, eliminndose la luz desenfocada y
consiguiendo imgenes mucho ms ntidas y con mayor resolucin que con otros microscopios. Adems, as las bacterias se pueden
ver a distintas profundidades.
- SEM-BSE: los electrones son dispersados cuando contactan con la muestra, pero este microscopio lleva acoplado un refractor de
rayos X que realiza el anlisis cuantitativo y cualitativo de los mismos, proporcionando finalmente la imagen.
- LT-SEM: modalidad del SEM que utiliza muestras a muy baja temperatura, de modo que no se fijan ni se desecan, lo que es una gran
ventaja ya que no exige una manipulacin compleja de la muestra. til para la observacin de biofilmes y exopolimeros. Los
exopolimeros son polisacridos combinados con DNA, producidos en los biofilmes al formarse. As somos capaces de recoger una
imagen de un biofilme donde se observan bacterias entrelazadas cubiertas por una especie de velo (dicho exopolmero).
- Microscopios de fuerza atmica (AFM): utiliza sondas de distinta resolucin de modo que el laser golpea el recipiente que recoge la
muestra, siendo la luz captada por un fotorreceptor que detecta las diferencias de orientacin y da lugar a la imagen, ampliando adems
la muestra.
- Microscopio de deconvolucin: obtencin de sismogramas y reconstruccin tridimensional de los cortes mediante un tratamiento
matemtico.
Una vez que el complejo inicial se ha formado en el exterior de la membrana, el peptidoglicano puede incorporar o unir otras molculas
de la pared.
En la sntesis del peptidoglicano, intervienen facilitandola o inhibiendola las siguientes molculas:
- D-cicloserina: inhibe la conversin de L-ala a D-ala
- Bacitracina: antimicrobiano que interfiere con la desfosforilacin del transportador undecaprenol dificultando su vuelta a la
conformacion inicial. Inhibe el giro del transportador decaprenol o fosfolpido de membrana.
- Vancomicina y Ristocetina: frmacos cuyo mecanismo de accion se basa en alterar la accin de la transpeptidasa por impedimento
estrico. As, inhibe nuevas uniones transversales y la desaminacion de la D-ala del pentapptido.
- Penicilinas y cefalosporinas: son -lactmicos que se unen al PG una vez en el exterior.
El PG, como ya sabemos, difiere levemente entre los distintos tipos de paredes celulares. Esta diferencia molecular desemboca en una
marcada diferencia estructural, dando lugar a caractersticas diferenciadas en las bacterias. As pues, existen tres tipos de paredes:
Gram +: en la pared existen cidos teicoicos, lipoteicoicos y teicurnicos. Adems de la protena A (identificado en Staphylococcus)
Gram -: presenta lipopolisacridos o lipooligosacridos y porinas. El peptidoglicano, adems, es mucho ms duro ya que en la 3
Enterobacterias: antgeno O muy importante en la identificacion de las mismas (E.Coli enterohemorrgica O157H7)
Neiseria gonorrhoeae: coco Gram que posee un lipopolisacrido mutado, que se identifico como lipooligosacrido (LOS). Presenta
diferentes azcares (que las enterobacterias) en el Ag.O y todos eran iguales. Diferentes propiedades de adherencia a clulas (ms
difciles).
Francisella tularensis: modifica el LPS en funcion de la temperatura, cambiando las propiedades de los cidos grasos del lpido A.
Produce la turalemia, transmitid por contacto con roedores. A bajas temperaturas disminuye la longitud de los a.g. lo que le puede
ayudar a evadir el sistema inmune; si los hiciese ms largo, sirven para protegerse de temperaturas extremas. Cambios en la
permeabilidad, susceptibilidad a bactericidas, antibiticos, modificacin de la virulencia
La pared celular de ls bacterias, como se explic al principio, es muy importante para poder
llevar a cabo al division celular. Adems, protege a las clulas del ambiente, les da forma y
tamao definidos, presenta caractersticas de patogenicidad o antignicas, protege de los
cidos gastrointestinales, etc. Sin embargo, las bacterias pueden sobrevivir sin la pared, en
forma de protoplastos, siempre que se encuentren en un medio isosmtico. La pared puede
no existir de forma natural (como en Mycoplasma) o haber sido eliminada por medio de la
enzima lisozima (rompe los enlaces 1-4). En las bacterias Gram -, quedaran esferoplastos
rodeados de dos membranas. As, podran sobrevivir pero no dividirse.
Paredes AAR.
Los microorganismos que presentan paredes AAR, poseen una gran capacidad de resistencia a diferentes medios agresivos. Presentan
cidos miclicos en un 60% de su pared, adems de una capa de arabinogalactano adyacente al PG (existen enlaces 1-3). Tambin
presentan porinas. Esto les proporciona caractersticas especficas de resistencia y tincin. Las bacterias que presentan dicha pared,
cido-alcohol-resistente son los gneros Mycobacterium, Nocardia, Rhodococcus, Caseobacter, Gordonia, Tsukamurella
Corynebacterium es una Gram + que presenta cidos parecidos a los miclicos, dando positiva la tincion AAR.
Las paredes fngicas o de los hongos son muy diversas, como Aspergillus y Penicillium, o las de hongos con forma de levaduras
como S.cereviseae (levaduriforme con cicatriz de gemacin), incluso la de los hongos dimrficos como Candida albicans (una de las
formas se asocia a patogenicidad, la ms alargada, aunque tambin existe una forma redondeada). Existen hongos dimrficos no
patgenos y con ciclo sexual como Yarrowia lipolytica.
La pared suele ser gruesa y se suelen dividir por gemacin, es decir, por formacin de una yema o gema en un extremo de la pared, de
modo que cuando alcanza el tamao adecuado se separa, quedando en la clula madre la cicatriz de gemacin, por donde no se
podrn formar nuevas yemas.
Las hifas permanecen unidas por tabiques y dan lugar a filamentos.
Las paredes de los hongos no tienen peptidoglicano, sino que presentan las caractersticas de paredes eucariotas. Su pared posee
quitina, siendo la quitobiosa la unidad bsica (2-n-acetilglucosamina). Los polmeros de quitina se forman mediante enlaces 1-4 de la
2NAcG.
Posee capacidad de unin al calcofluor y se entrelaza alrededor de la membrana plasmtica. Tambin pueden existir glucanos,
manoporteinas y celulosa.
Otra caracterstica de las bacterias, la cual es posible gracias a los flagelos, son las respuestas sensoriales o taxis, como la
quimiotaxis, fototaxis o reotaxis. Las bacterias son capaces de detectar gradientes a corto plazo, hasta llegar al quimioatractante
principal. Para ello enrolla todos los flagelos en un extremo segn el tramo de gradiente en el que se encuentre, y as consigue
desplazarse en ambos sentidos.
La energa necesaria para el movimiento de los flagelos procede del ATP. Podemos determinar el gasto de protones, los cuales van
saliendo al exterior a medida que se transportan los electrones al interior. Se puede medir el gasto energtico sabiendo los H+
necesarios (254) por vuelta del flagelo. Los protones sern captados por una ATPasa de membrana en su salida al exterior, de modo
que de ellos se obtiene la energa necesaria. Gasto alto.
Los flagelos tambin presentan diferencias estructurales en funcin de si pertenecen a
Gram +, Gram o Archeas. Los flagelos de Gram + son los ms simples, pues poseen un
anillo de anclaje a la membrana y otro al peptidoglicano; sin embargo, los de Gram y
Archeas son ms complejos, con diversas uniones a las estructuras de membrana y pared.
Los mesosomas son invaginaciones de la membrana, unidos a ella o separados de la misma (presentes en bacterias Gram + y Gram ). Fueron descubiertos por tcnicas de criofractura, de modo que se acepta su existencia. Su funcin reside en la intervencin durante
la divisin celular, como sitio de unin o anclaje del cromosoma, o bien como lugar de formacin del septo transversal.
Los sistemas de membrana son plegamientos complejos (formas laminares, vesiculares o tubulares) y extensos que presentan,
principalmente, las bacterias con ciclo fotosinttico y las bacterias del azufren aunque pueden estar presentes en otras, sirviendo para
la fijacin de nitrgeno o incluso en cianobacterias. Los sistemas de membrana proporcionan una extensa superficie donde se adhieren
los sistemas enzimticos del metabolismo que se encuentran anclados a la membrana.
El citoplasma bacteriano es una solucin acuosa de sales, azcares, aminocidos, vitaminas, coenzimas y otros componentes
esenciales, junto con inclusiones insolubles y orgnulos. El citoplasma bacteriano, por supuesto, contiene el material gentico de la
clula: dicho material gentico puede observarse mediante tinciones bsicas, contraste de fases y ME. Se trata de un DNA de doble
cadena, circular, que se encuentra muy plegado y compactado en una localizacin algo indeterminada, pues no existe membrana
nuclear. Adems, los microorganismos pueden poseer material gentico extracromosomico que codifica para la expresin de caracteres
adicionales (patogenicidad, propiedades no esenciales, etc), como son los plsmidos y otros fragmentos de DNA de doble cadena
circular de replicacin independiente.
La importancia de los ribosomas en todas las clulas es muy significativa, incluyendo en las bacterias. Los ribosomas bacterianos
presentan dos subunidades compuestas de rRNA y protenas. Su funcin es la de sintetizar protenas a partir de mRNA, proceso
conocido como traduccin. Poseen una estructura 70S, con dos subunidades, la pequea formada por el 30S y la grande por el 50S. En
la subunidades pequea encontramos el rRNA 16S utilizado como marcador molecular evolutivo.
Los ribosomas son una diana de antibiticos. Adems, difieren de los de Archeas y eucariotas.
Las inclusiones antes citadas son acmulos de compuestos orgnicos e inorgnicos que las bacterias acumulan como fuerte de
azufre, glucgeno y energa. Los materiales orgnicos presentes en estas inclusiones son principalmente polmeros de carbono como el
glucgeno, el PHA (cido polihidroxibutrico) y PHB (cido polihidroxibutirato), de poca densidad que se visualizan transparentes al
microscopio. Las -proteobacterias como Agrobacterium tumefaciens, Rhizobium teguminosarum y Rhodovibrio sodomensis sintetizan
PHB que es hidrolizado cuando la bacteria necesita energa.
Los compuestos inorgnicos principales que existen en las inclusiones, son compuestos nitrogenados como cianoficina (arginina y
aspartano), azufre elemental proveniente del H2S (Gram -, como Thiomargarita namibiensis) y fosfatos o fsforo inorgnico en forma de
polifosfatos (sntesis de ATP, c teicoicos, LPS, etc), grnulos de volutina o corpsculos metacromaticos (se tin de color diferente al
tinte, presentes en Lactobacillus y Corynebacterium).
Orgnulos: los orgnulos son pequeas estructuras intracitoplasmticas, independientes, que proporcionan diferentes caractersticas a
la clula para que esta pueda llevar a cabo sus funciones. En las bacterias, existen ciertos orgnulos particulares como:
- Clorosomas: orgnulos llenos de clorofila presentes en bacterias acuticas y fotosintticas.
- Carboxisomas: orgnulos de bacterias auttrofas que fijan el anhdrido carbnico mediante el ciclo de Calvin. Necesitan RuBisCo,
pero l exceso de enzima cristaliza formando cristales polidricos que se acumulan en los carboxisomas. Presente en
cianobacterias, bacterias nitrificantes, fotosintticas y quimiolitotrofas.
- Vesculas de gas: bacterias que viven en ambientes acuticos y cianobaceras, presentan estas estructuras altamente
especializadas con composicin proteica de protenas en disposicin helicoidal y laminar. Entre los huecos de las protenas se
retienen los gases, de modo que les permite a las bacterias desplazarse arriba y abajo segn la cantidad de gas retenido n la
estructura polidrica.
- Magnetosomas: inclusiones de xido ferroso y frrico, junto con inclusiones de magnetita. Las bacterias que lo poseen se
comportan como un dipolo magntico, alinendose los magnetosomas segn el campo magntico de la tierra, lo que les permite
desplazarse.
As se crea una espora libre que pose resitencia a colorante (difcil tincin), agentes qumicos y fsicos antimicrobianos, bactericidas,
desecacin, radiaciones, etc. Todo esto es posible gracias a la alta deshidratacin de las esporas (mejor mantenimiento), la estructura
especial del PG, el dipocolinato-clcico, la cubierta de protenas y el exosporio.
Germinacin.
La germinacin es el proceso mediante el cual la espora vuelve a
dar lugar a la celula bacteriana activa. Esto ocurre ante un choque
trmico o frente a la presencia de nutrientes en el medio, de modo
que cesa el estado de latencia y la espora se rehidrata,
comenzando la actividad metablica en el interior de la misma.
Una de las primeras actividades que se recupera es la sntesis de
material gentico y mRNA, junto con la acumulacin de agua, de
modo que emerge la clula vegetativa. La germinacin se produce
en minutos.
Jonh Tyndall fue un microbiologo que consiguio inducir la
germinacin de las esporas y el ataque a la salida de ka clula
germinativa y vegetativa, en un proceso denominado tindalizacin, muy util para acabar con las formas de resistencia.
Exosporas bacterianas.
Las exosporas son formadasfuera del cuerpo de la bacteria, en gran cantidad. Se trata de formas de multiplicacion y no de resistencia
(igual que las de los hongos), que se forman en un nmero elevado. Su hbitat comn es el suelo y el agua.
Son producidas por bacterias filamentosas Gram + como los actinomicetos. Las colonias son grandes y ramificadas, dando lugar a un
micelio aereo donde se forman las esporas, y un micelio no areo o sustrato. Los micelios estn formados por hifas.
Los actinomicetos, adems, procuen geosminas (olor a tierra mojada)
Inters industrial por la produccion de antibiticos (Streptomyces) y ecolgico por su capacidad de fijacion del nitrgeno, mineralizacion
y enrequecimiento de la tierra. Normalmente son saprfitos aunque, a veces, pueden causar acinomicosis.
Las exoesporas se forman en el micelio aereo y pueden ser lisas o rugosas, verucosas, espinosas, con distintos agrupamientos y
pigmentos, mviles o inmviles, etc.
Tipos:
Conidiosporas: formadas en el extremo final de una hifa, donde se forman septos que contienen cada uno una copia del genoma (se
pueden presenciar hasta 300 septos o tabiques). Esta septacin ocurre en un solo plano dando lugar a los conidios, donde se desarrolla
cada conidiospora.
Esporangiosporas: no se forman por tabicacion del extremo de una hifa, sino que en la parte apical o apendice de la misma, se
produce la ramificacion de una estructura concreta, dando lugar al esporangio (esporangioforo, redondo o con forma de maza), donde
se forman ms de 1000 esporas moviles o inmoviles.
As pues, los sistemas de secrecin son estructuras de membrana encargadas de secretar sustancias
como antibiticos, toxinas, pigmentos, precursores del flagelo, componentes de pelos y fimbrias y
otras molculas capaces de actuar como PAMPs. Se trata entonces de sistemas de secrecin de
molculas procariotas al exterior de la propia clula. Existen dos tipos de sistema de secrecin
fundamentales:
Independiente de SEC
Dependientes de SEC o va de secrecin general. Son dependientes de un sistema de secrecin
adicional compuesto por dos subunidades, SEC A que utiliza las bombas ATPasa y SEC B, parte
encargada de transportar el producto de secrecin.
Sistemas de secrecin en Gram -: son complejos, pues se debe atravesar la membrana externa.
Tipo I o ABC (caset de unin al ATP): consta de una regio ATPasa de membrana y es independiente de SEC.
Tipo II: transportan protenas desde la membrana externa que hayan salido anteriormente hasta esta localizacin desde el citoplasma
gracias a la actividad SEC. Estos sistemas atraviesan toda la pared de las Gram -.
Tipo III: estructuras compactas de multicomponentes independientes de SEC. Son las encargadas de inyectar factores de virulencia a
animales o plantas, como toxinas, inhibidores de la fagocitosis, molculas reorganizadoras del esqueleto (shigella y Neiseria),
molculas inductoras de apoptosis, etc.
Tipo IV: son los sistemas de secrecin principales para transferir DNA en la conjugacin, mediante la formacin del pelo conjugativo.
Tambin se denomina sistema de secrecin tipo jeringa. Este tipo de sistema de secrecin participa en:
- Pelo conjugativo de E.Coli
- B.pertusis: salida de la toxina
- H. pylori: induce en la clula eucariota la formacin de pseudopolipos, a travs de este tipo de secrecin.
- Agrobacterium: transferencia del plsmido T.I.
- Rickettsias: inhiben la destruccin por vacuolas mediante liberacin de molculas propias.
Tipo V: misma funcionalidad que el tipo II.
Sistemas de secrecin en Gram + son mucho ms sencillos, ya que deben atravesar menos capas, siendo el principal el de tipo I o
ABC.
Los microorganismos auxotrofos y prottrofos son utilizados para ensayos biolgicos o bioensayos, siendo muy comn utilizar cepas de
E.Coli, Streptococcus, Lactobacillus, Lauconostoc, Haemophilus influenze (molcula que se encuentra en la sangre como NAD y
hemina).
Los organismos fotoauttrofos principales son las cianobacteria, que realizan fotosntesis oxignica (igual que las plantas) y que
fueron responsables de la vida aerobia en la tierra. El O2 que producen procede del donador de electrones, que en este caso es una
molcula inorgnica, el agua. Otras bacterias fotoautotrofas como las bacterias verdes o rojas del azufre obtienen los electrones del
H2S o del azufre.
Los fotohetertrofos, (fotoorganohetertrofos o hetertrofos fotoorganotrficos) obtienen la energa lumnica necesaria y para sus
procesos metablicos y a su vez, utilizan fuente de carbono y electrones orgnica (son hetertrofos y organotrofos). Suelen encontrarse
en aguas contaminadas.
Los quimioautotrfos son aquellos microorganismos que obtienen la energa procedente de la oxidacin de algn compuesto orgnico
o inorgnico, muchos de estos microorganismos viven en el suelo.
Los quimiohetertrofos utilizan con frecuencia la misma molcula como fuerte de carbono, de energa y como fuente de H/e-. En este
grupo encontramos a microorganismos como E.Coli, Salmonella, Staphylococcus aureus
Clasificacin de los organismos segn sus fuentes de carbono, energa e hidrgeno/electrones.
Segn la fuente de carbono diferenciamos organismos:
- Auttrofos: utilizan CO2 como fuente de carbono
- Hetertrofos: fuente orgnica de carbono, que adems suelen proporcionar H+ (algunos microorganismos utilizan solo celulosa, otros
varias molculas hidrocarbonadas, Pseudomonas y Burkholderia son capaces de utilizar todo tipo de molculas orgnicas, los
actomicetos se nutren de fuente de carbono muy complejas, etc)
Segn la fuente de energa:
- Fototrofos: energa lumnica
- Quimiotrofos: fuente qumica de energa.
Segn la fuente de protones y electrones.
- Litotrofos: molculas inorgnicas reducidas
- Organotrofos: molculas orgnicas.
Fuentes de nitrgeno.
N2 atmosfrico, fijacin del nitrgeno: microorganismos que poseen el sistema de la nitrogenasa (2 enzimas) son capaces de fijar el
nitrgeno por s mismos y enriquecer el ambiente donde viven (suelos, plantas...), Convierten molculas inorgnicas en nitrgeno
orgnico. Algunas bacterias (Cianobacterias, bacterias de vida como Azotobacter, bacterias como Rhizobium en simbiosis con plantas
leguminosas)
Fuente inorgnica de nitrgeno (NO2-, NO3-, NH4+): la mayora de microorganismos utilizan estos compuestos inorgnicos como fuente
de nitrgeno.
Fuente orgnica de nitrgeno (aminocidos, protenas, peptonas). Las peptonas son molculas orgnicas proteicas usadas en
cultivos, donde son microlizadas o digeridas por distintos tipos de protenas, hasta obtener nitrgeno orgnico.
Fuentes de fsforo.
Fuente inorgnica (PO43-): la mayora de microorganismos utilizan estos compuestos inorgnicos como fuente de fsforo.
Fosfatos orgnicos: algunas bacterias son capaces de aprovecharla mediante sistemas fosfatasas, que actan como sistemas tampn
de fosfatos (adems de una fuente de fsforo son amortiguadores).
Fuentes de azufre.
Fuente inorgnica (SO42- S2O32- SH2 S): la mayora de microorganismos. Viven en minas o zonas azufradas con un pH muy cido.
Fuente orgnica (aminocidos azufrados): algunas bacterias.
Fermentacin
- Oxidacin de un compuesto qumico orgnico
- Reduccin de un compuesto qumico orgnico
- No existe cadena de transporte de e- No aceptor exgeno de electrones (aceptor endgeno que suele
derivar del donador)
- Formacin de ATP por fosforilacin a nivel de sustrato
- Bajo rendimiento energtico
Ruta de Entner-Doudoroff: solo en procariotas, se trata de una sustitucin de la glucolisis donde se obtiene 1ATP, 1NADH,
1NADPH y metabolitos precursores.
Pentosa fosfato: obtencin de 2NADPH (biosntesis), metabolitos precursores R5P (cidos nucleicos) y eritrosa5P (aminocidos
aromticos), se obtiene ATP si la clula lo necesita, conexionando con la glucolisis.
Tras los procesos de transformacin de la glucosa, los precursores obtenidos y las molculas con poder reductor, suelen entrar en
el Ciclo de Krebs, primera etapa de la respiracin y donde se consigue un elevado rendimiento energtico, adems de aumentar el
nmero de molculas de poder reductor NADH y FADH2 que posteriormente sern los donadores en la cadena de transporte de
electrones.
El ciclo de Krebs se basa en la trasformacin del
piruvato obtenido en la gluclisis.
Aqu podemos diferenciar a los microorganismos
fermentativos de los no fermentativos. Los
microorganismos no fermentativos realizan el ciclo
de Krebs, transformando el piruvato en ACoA,
molcula que comenzara dicho ciclo. Po cada
piruvato se obtienen 4NADH y 1FADH2 y 1ATP, sin
embargo, son dos piruvatos los que proceden de
cada molcula de glucosa, por lo que obtenemos
8NADH y 2FADH2 y 2ATP. Este poder reductor o
priridin nucletidos reducidos transfieren electrones
a la cadena de transporte de electrones, que
transforman todo el poder reductor en fuerza motriz
de protones que a su vez, por quimioosmosis
generar ATP. As, al final de la transformacin de la
glucosa se obtienen 6CO2 + 38ATP.
En los procariotas no se bombean tantos protones en la cadena de transporte de electrones, sino que es una cifra menor, no
conocida exactamente. Se obtiene menos de 1/3 del rendimiento energtico eucariota.
En la respiracin anaerbica se obtiene 1/3 de rendimiento energtico.
La fermentacin es el proceso llevado a cabo por los organismos fermentativos, que no pueden realizar el ciclo de Krebs. Estos
microorganismos pueden realizar la gluclisis, transformando en piruvato la glucosa. A partir del piruvato, realizan la fermentacin.
Pueden realizar distintos tipos de fermentaciones, como la Fermentacin butilen-gliclica o la fermentacin cida mixta (succnico,
etanol, etc). Tambin es comn la fermentacin lctica y la fermentacin alcohlica. Otros productos fermentativos son el etanol,
acetato, butanol, butirato, 2,3.bitanodiol, propinico y CO2 (bacterias del cido propionico del queso), isopropanol, etc. Durante la
fermentacin, el poder reductor obtenido en la gluclisis es utilizado, y las molculas ya oxidadas vuelven de nuevo a la ruta
metablica que las reduce (glucolisis). As pues, el nico rendimiento energtico ser los 2ATP de la gluclisis.
Obtencin de energa a partir de otros sustratos.
- Degradacin de protenas mediante proteasas, de modo que se obtiene energa a partir de los aminocidos, que son desaminados
y convertidos en cidos orgnicos que entran en la glucolisis y el ciclo de Krebs.
- Degradacin de lpidos mediante lipasas, obteniendo glicerol, metabolito incluido en la gluclisis; y cidos grasos, que se
convierten en acetilo y finalmente en ACoA, molcula que inicia el ciclo de Krebs.
Como conclusiones debemos saber que los
microorganismos anaerobios realizan la
respiracin, pero con un aceptor final
diferente del O2. Los microorganismos
fermentativos no poseen cadena de
electrones y, por ello, no realizan el ciclo de
Krebs sino que obtienen sustratos y energa
mediante la glucolisis y la fermentacin.
La fuerza motriz de protones tambin es responsable del transporte inverso de electrones (bacterias oxidadoras de azufre).
Los malos donadores utilizan componente como citocromos para ceder electrones a las molculas de NADH y NADPH, y obtener as
poder reductor. Sin embargo, se obtendr poco ATP y por tanto, existir un crecimiento o desarrollo lento.
Si no existen microorganismos competentes esto no es un problema (ocurre con el S, N, Fe)
Fototrofa: generacin de energa y flujo de carbono.
Tanto los microorganismos fotoautotrofos como los microorganismos fotohetertrofos obtienen energa de la luz solar, lo que provoca
un flujo de electrones que dar lugar a una fuerza motriz de protones, encaminada a conseguir ATP. Sin embargo, la obtencin del
carbono es diferente: los fotoautotrofos utilizan una fuente inorgnica de carbono (CO2), mientras que los fotohetertrofos se nutren de
una fuente orgnica.
La fotofosforilacion se lleva a cabo en las clorofilas, componentes de los cloroplastos. Los electrones comienzan su flujo desde un
fotosistema, pudiendo volver al mismo (cclica) o cedindose al NADPH (acclica). En ambos caso se genera una fuerza motriz de
protones consecuencia del flujo y transporte de electrones, generando ATP.
Captacin de la luz solar.
Las cianobacterias son microorganismos fotoautotrofos y poseen clorofila A. Realizan una fotosntesis acclica oxignica, pues se
libera el O2. El donador principal de electrones es el agua, es decir, un donador exgeno. Las cianobacterias son microorganismos muy
cercanos en estructura y funcin a los conocidos cloroplastos en eucariotas (misma lnea evolutiva, teora endosimbiontica). Pues bien,
los electrones excitados gracias a la luz llegan finalmente a una molcula de NADP, que se
transforma en poder reductor. Durante el transporte de electrones se genera una fuerza
motriz de protones que dar lugar al ATP. Lo citado hasta ahora corresponde a la fase
luminosa de la fotosntesis oxigenica. Posteriormente, ocurre la fase oscura, proceso en el
que se generan azucares y molculas orgnicas.
Las bacterias rojas y verdes del azufre realizan la fotosntesis cclica anoxigenica. Se
trata de una forofosforilacion cclica, donde los fotosistemas son otros pigmentos que
absorben longitudes de onda mayores (bacterioclorofilas) . El poder reductor se forma por la
llegada de electrones a partir de compuestos inorgnicos externos que actan como
donadores de electrones, aunque tambin pueden ser compuestos orgnicos (fotoautotrofos
o fotohetertrofos respectivamente). Tambin existe una transporte de electrones, pero en
las dos direcciones, normal e inverso. No se libera O2, por ello es anoxignica.
donador.
- Fotohetertrofos: microorganismos que obtienen el carbono de una
fuente orgnica, y lo transforman gracias a la captacin de luz. Como
las bacterias rojas y verdes no del azufre.
Auttrofos
Captan el CO2 del ambiente, molcula inorgnica que mediante el ciclo de Calvin son capaces de transformarla en materia orgnica
(normalmente glucosa).
- Quimioautotrofos: compuestos inorgnicos (N, S, Fe) son utilizados para generar ATP mediante un proceso de fosforilacion oxidativa.
Los electrones llegaran a distintos aceptores finales, bien O2 u otros.
- Fotoautotrofos: utilizan la luz solar para generar ATP, mediante la fotofosforilacin.
Sintrofa.
Asociacin de microorganismos que viven en el mismo ambiente y que liberan componentes o productos de los que otros se alimentan.
Algunos o ambos sales favorecidos.
Asociacin de microorganismos en la que el crecimiento de uno de ellos depende o se ve aumentado por factores de crecimiento,
nutrientes o sustratos proporcionados por otros organismos que viven cerca. A veces ambos microorganismos se benefician.
Ejemplo: Syntrophomonas, Syntrophobacter (fermentadores secundarios y productores de H2) y organismos metangenos. Unos toman
los productos de degradacin de molculas complejas utilizados para dar H2, que a su vez utilizan los microorganismos metangenos.
Cultivo de microorganismos.
En un cultivo microbiano es necesario que existan los nutrientes y condiciones necesarias en el medio de cultivo para que los
microorganismos crezcan y se dupliquen de forma controlada. A veces, los productos de deshecho de los microorganismos pueden
alterar o modificar las condiciones del medio de cultivo: este factor debe estar controlado.
Se deben conocer las necesidades del microorganismo para preparar el cultivo.
No todos los microorganismos se han conseguido cultivar, por ejemplo Mycobacterium leprae, agente etiolgico de la lepra solo crece
en la almohadilla del armadillo de 9 bandas. Treponema pallidum, causante de la sfilis, se desarrolla en clulas de testculo de conejo.
Los medios de cultivo siempre llevan agua, donde se diluyen los nutrientes. Los medios, suele solidificar con agar: agente solidificante
que se hace lquido a 100C y que es slido-gelatinoso a 40C. No se degrada ni se funde. Normalmente 1-2% de agar disuelto se
consigue un medio slido. A menor proporcin, hablamos de medios semislidos o viscosos.
Segn su composicin:
- Definidos o sintticos: composicin qumica conocida. Cantidades conocidas de compuestos orgnicos e inorgnicospuros. Se conoce
su composicin exacta.
- Complejos: composicin qumica no definida y variable, nutrientes complejos (extractos de carne y levadura, peptonas, sangre, etc.)
Segn su naturaleza fsica o su estado:
- lquidos (caldos): nutrientes disueltos en agua
- slidos: solidificados con agar
- semislidos: contienen una baja proporcin de agar
Segn su utilizacin:
- Generales: permiten el desarrollo de una gran variedad de microorganismos
- Selectivos: favorecen el crecimiento de ciertos microorganismos, suprimen el de otros (colorantes, antibiticos, sales biliares,
Salmonella en las heces)
- Diferenciales: aquellos en los que se destacan propiedades que poseen cierto tipo de microorganismos y diferencian las colonias por
su aspecto (agar-sangre, donde ciertos microorganismos productores de hemolisina degradan los eritrocitos, apareciendo colonias con
aros blancos a su alrededor)(lactosa, levine, medio selectivo que inhibe Gram + y lleva tambin lactosa, por lo que es un medio
diferencial para E.Coli, fermentadora de lactosa)
- De enriquecimiento: favorecen el crecimiento de ciertos microorganismos sin llegar a inhibir totalmente el crecimiento del resto
Factores ambientales: Oxgeno.
- Aerobios estrictos u obligados: necesitan el O2.
(Pseudomonas)
- Anaerobios: no necesitan el O2 para vivir.
Diferenciamos entre anaerobios estrictos u
obligados, aquellos que no crecen en presencia de
O2 (Clostridium toxina botulnica , Bacteroides
toxina tetnica)
Existen los microorganismos anaerobios facultativos,
que crecen en presencia de oxgeno y algo peor sin
l, pero al tener otros aceptores pueden vivir en
condiciones anerobios (E.Coli, Scharomyces)
Los microorganismos anaerobios tolerantes, como
Lactobacillus y Strptococcus toleran el O2, aunque
viven mejor sin l.
- Microaerofilos: viven en atmsferas con menos de
un 10% de oxigeno
- Capnofilicos: viven en presencia de pequeas
cantidades de oxgeno.
Reduccin de oxigeno hasta agua mediante incorporacin secuencial de electrones: todos los intermediarios que se forman son
altamente reactivos y txico para las clulas (superoxidos, perxidos de hidrogeno, radical hidroxilo). Por ello, muchos
microorganismos poseen enzimas necesarias que actan sobre las especies moleculares de oxgeno:
a) Catalasa: H2O2 + H2O2 2 H2O + O2 La poseen los microaerofilos y aerobios estrictos y facultativos.
b) Peroxidasa: H2O2 + NADH + H+ 2 H2O + NAD+
c) Superxido dismutasa: 2 O2- + 2H+ H2O2 + O2 anaerobios aerotolerantes
d) Los anaerobios estrictos no tienen ninguna de las enzimas (cmara anxica)
Bacterias intracelulares.
Las bacterias intracelulares obligadas, como Rikettsia, Coxiela y Chlamydia
necesitan vivir en el interior de una clula husped para llevar a cabo sus
funciones metablicas. Se trata de patgenos que sufren fagocitosis, formndose
el fagosoma y fundindose con los lisosomas en el interior de la clula. Tienen
que poseer mecanismos de evasin que les permita huir del fagolisosoma y las
enzimas degradativas.
Rikettsia.
Bacterias pleomrficas Gram que inducen su fagocitosis (endocitosis dirigida con gasto de energa) de modo que entran a la clula.
En el interior del fagosoma producen una lipasa esencial para salir del mismo, de modo que vive en el citoplasma celular. Necesita
metabolitos ya preformados incluso puede aprovecharse del ATP celular (aunque ella misma es capaz de formarlo). Se multiplica en el
citoplasma o en el ncleo celular, y sale de esta mediante lisis u otros mtodos.
R. prowazekii (tifus exantemico transmitido por pijos), R, typhi (tifus murino), R. conorii (fiebre botonosa mediterrnea)
Coxiela burnetii.
Bacterias Gram que en principio se consideraron Rikettsias. Recuerdan a las endosporas bacterianas (Gram + ) ya que poseen
cuerpos densos pequeos y resistentes a condiciones ambientales desfavorables. Su ciclo celular es complejo. Son fagocitados por la
clula y se forma el fagolisosoma. En estos momentos la bacteria produce o vierte hidroblastos y enzimas degradativas que inhiben el
fagolisosoma. En este pH cido se multiplican. Posteriormente salen del fagolisosoma y se forma el cuerpo denso, que finalmente sale
de la clula mediante lisis.
Produce la fiebre Q.
Chlamydia.
Microorganismo Gram que se comporta como un parsito energtico. Posee un ciclo de replicacin bifsico. El cuerpo elemental,
inactivo metablicamente, pequeo y extracelular es capaz de inducir una endocitosis dirigida. En el interior de la clula forma un
cuerpo reticulado metablicamente activo tras su modificacin en la vacuola o vescula. Se multiplica dando lugar a cuerpos de
inclusin o microcolonias. Tras 2-3 das replicndose, sale de la clula y vuelve al comienzo del ciclo.
C.trachomatis: Tracoma, LGV (distintos serotipos), conjuntivitis de inclusin, uretritis (mismo serotipo)
Se forman a partir de una clula planctnica o clula liberada de un biofilme anterior y que tiene la capacidad de adherirse a una
superficie. Existe una cooperacin entre microrganismos para formar poblaciones, secretando molculas que se liberan si no existen
muchos microorganismos en el biopelicula en formacin, pero que no difunden si esta posee los suficientes (comunicacin: quorum
sensing). Esto les indica a los propios microorganismos la densidad de poblacin para poder comenzar a sintetizar el polmero: son
autoinductores.
Algunas bacterias pierden el flagelo, lo que es una seal para que se expresen genes que codifican para molculas quimiotacticas, al
adherirse y no flotar.
Finalmente se produce una dispersin de las clulas colonizadoras
Pseudomonas aeruginosa: infecciones pulmonares, personas con enfermedad desde nios (muestran viscosidad en las secreciones).
Clasificacin de virus: comit internacional de taxonoma de virus (ICTV)Actualmente se conocen 2618 especies de virus, las cuales se clasifican mediante el Sistema Baltimore, atendiendo al genoma y a la
sntesis de mRNA. Baltimore fue el descubridor de la transcriptasa inversa. As, segn la estrategia de los virus para la sntesis de
mRNA:
DNA
ds
mRNA
ARN
ds
Desnaturalizacin del RNA ds y,
consiguiendo un RNA a partir
del cual se obtiene el mRNA
(RNApolRNAdep).
ARN+
No necesitan enzimas para
transcribirse, directamente son
traducidos Desde el punto de
vista funcional ya es mRNA
Liberacin.
Los virus con envuelta salen por exocitosis, normalmente, As, en su salida adquieren la membrana de la clula que han infectado. Los
virus desnudos suelen salir por lisis de la clula.
Los bacterifagos, en su mayora, son liberados mediante lisis celular. Los bacterifagos filamentosos poseen un material gentico que
va atravesando la pared y los capsomeros se acoplan durante este transcurso. A veces salida por exocitosis sin lisis celular.
Replicasas
DNApol
DNAdep
RNApolDNAdep
propia o del
huesped
mRNA
protenas
Estos virus utilizan transcriptasas propias o del husped para transcribir la hebra
de DNA bicatenario a mRNA. Sin embargo, para la replicacin del material
gentico para general el virin utilizan DNA polimerasas DNA dependientes.
DNA ds
Familia Poxviridae.
Virus muy grandes observables al microscopio ptico. Se replican a nivel citoplasmtico y son los causantes de la viruela, enfermedad
que se transmite por vas respiratorias y cursa con exantemas cutneos caractersticos, vesiculopustulares (macula, papula, fluido en la
vescula, pus y costra). Enfermedad erradicada a nivel mundial mediante la vacunacin. Orthopoxvirus: virus de la viruela.
Familia Herpesviridae.
Ms de 77 virus pertenecen a esta familia, de los cuales 8 son capaces de infectar al hombre. Producen patologas importantes en
personas inmunodeprimidas, aunque no es grave en sanos. La enzima de replicacin (replicasa), es de origen vrico.
Gnero Simplexvirus.
- Virus herpes humano, herpes simplex 1
- Virus herpes humano, herpes simplex 2
Presentan latencia en neuronas, donde no causan dao, y afectan a clulas cutneas a las que migran. La sintomatologa es
principalmente la lisis de las clulas epiteliales cuando el virus se reactiva (herpes).
Gnero Varicellovirus.
Causantes de una infeccin primaria respiratoria que transcurre durante la infancia en individuos inmunocompetentes, de carcter leve.
Cursa con un exantema cutneo. Tambin se encuentra en latencia en neuronas y puede reaparecer en estados de inmunosupresin y
edad avanzada (herpes zster = culebrilla): se da el transporte retrogrado a zonas de la piel, muy doloroso. Virus varicela-zoster.
Gnero Lymphocryptovirus.
Linfotrofos y linfoproliferativos en LB. Virus de Epstein-Barr: Transmision a travs de la saliva (a veces causantes de linfomas).
Enfermedad conocida como mononucleosis. Se trata de un virus oncognico: carcinomas noseofaringeos y linfoma de Burkift.
Gnero Cytomegalovirus.
Muy ubicuos, permaneciendo en forma latente en LT y monocitos. Principal causa vrica de lesiones congnitas en el neonato (muy
grave): ocurre mediante la transmisin de fluidos corporales, natales o transmisin congnita. Fiebre glandular, infecciones neonatales y
en inmunodeprimidos. Virus citomegalovirus.
Gnero Roseolovirus. Virus de la rosola (herpes)
Gnero Rhadinovirus. Virus del sarcoma de Kaposi.
Familia Adenoviridae.
Virus desnudos con espculas externas en la cpsida. Replicacin y ensamblaje en el ncleo, clasificacin A-F segn los serotipos
determinados por las protenas de las espculas. Cada serotipo posee un tropismo ms marcado (digestivo, respiratorio, conjuntivo)
se excretan por heces y excreciones respiratorias que se dan en enfermedades como gastroenteritis, faringitis, conjuntivitis, etc.
Da lugar a infeccin lticas y latentes, en estas segundas no se expresan las protenas vricas ni existe sintomatologa, pero si se tiene
el material gentico del virus. Se pueden utilizar como vehculos de terapia gnica incorporando genes exgenos de inters que se
expresen en la clula a la que infecta. Adenovirus humano del gnero Mastadenovirus.
Familia Papillomaviridae.
Virus del papiloma humano, con gran variedad de serotipos, que causa cncer de crvix y verrugas genitales.
Virus DNA monocatenario.
DNA +
replicasa
DNA
+/-
Transcriptasa del
husped.
mRNA
protenas
replicasa
DNA +
o-
Familia Parpoviridae.
Virus desnudos que pertenecen al gnero Erythrovirus, siendo el ms representativo el ParpovirusB19, causante de un eritema
infeccioso con proceso febril asociado en nios.
Virus DNA bicatenario RT.
DNA bc
RNApol del
husped en
el nucleo
mRNA
+
RT vrica
citoplasmtica
cDNA
Estos virus utilizan aunque son DNA bicatenarios pasan por un intermedio de RNA para general el nuevo material gentico. Para ello
utilizan RNA polimerasas DNA dep del husped en el ncleo del mismo, transcribiendo el DNAbc a mRNA. Este RNA posee polaridad
positiva y puede usarse para sintetizar protenas (traduccin a partir de RNA monocistrnicos, pequeos fragmentos de cada protena).
Tambin, a partir del de, la retrotranscriptasa vrica acta en el citoplasma convirtindolo en CDNA. Esta enzima, llamada partcula
Dome adems posee actividad ribonucleasa de la cadena de RNA y es capaz de generar los cebadores, para despus con la actividad
polimerasa intrnseca copiar el cDNA molde y conseguir una doble cadena de cDNA. Este no se encuentra completo hasta que entra en
la clula siguiente para conseguir una doble hebra de DNA.
La familia Hepadnaviridae es la que presenta este proceso de multiplicacin. El gnero Orthohepadnavirus, donde encontramos el virus
de la hepatitis B (HVB), es el ms representativo. Son virus envueltos que a veces poseen capsulas vacas. Se transmiten mediante va
sexual, parenteral o vertical (madre-hijo). En un 65% de los casos son asintomticas, pero el 25% de los casos cursa con hepatitis
aguda y el resto con hepatitis crnica (hepatitis culminante, cirrosis, hepatomegalia, hepatocarcinoma). Vacuna con un antgeno de la
partcula Dome muy efectiva.
replicasa
RNA+/-
RNA +
Familia Togaviridae.
Virus envueltos donde encontramos el virus de la rubeola, perteneciente al gnero Rubivirus. La rubeola es una enfermedad
exantmica que si afecta a mujeres embarazas sin vacunas, puede tener consecuencias graves en el feto.
Familia Picornaviridae.
Muy pequeos y resistentes al pH cido.
Gnero Enterovirus:
Enterovirus: transmisin ruta fecal-oral, se excretan oor las heces y normalmente afectan al tubo digestivo del hombre desde donde se
dieminan a sangre y a diferentes tejidos diana segn el serotipo (sintomatologa especifica).
Dentro de este gnero encontramos a los Poliovirus: virus de la polio que produce la poliomielitis infantil: afecta a la corteza motora y
produce paralisis muscular. Existen vacunas de virus atenuados (eliminacin de genes del proceso de infecion pero s inmunognico) o
inactivados (muertos). Tambin se engloban aqu los Rhinovirus: resfriado comn, transmitidos por va area.
Gnero Hepatovirus: virus de la hepatitis A.
Familia Flaviviridae.
Transmision por artrpodos, conocidos como agrovirus.
Flavivirus: Virus de la fiebre amarilla, sndrome gripal y finalmente hemorragia.
Virus del dengue.
Hepacivirus: Virus de la hepatitis C (HCV)
RNApolRNAdep
vrica (transcriptasa)
mRNA
RNA+
RNApolRNAdep
vrica (replicasa)
RNA
bc
Familia Reoviridae.
El gnero Rotavirus es el ms representativo dentro de este grupo. Posee RNA bc que es frangmentado en 10-12 partes segn el
serogrupo (variantes en las protenas de superficie). Posee una doble cpsida. El rotavirus A, B y C es el causante de gaestroenteritis
infantil (10millones de muertes al ao), que se transmite mediante va fecal-oral. Existen vacunas de virus atenuados.
RNApolRNAdep
vrica (transcriptasa)
mRNA
RNA+
RNApolRNAdep
vrica (replicasa)
RNA -
protenas
Familia Orthomyxoviridae.
Se trata de virus envueltos donde la familia citada es la ms representativa, pues recoge los virus del gnero Influenza. Estos virus son
el virus de la gripe, influenza A, influenza B. Producen una enfermedad respiratoria que cursa con fiebre, mucosidad y que es
comnmente conocida como gripe. Poseen morfologa pleomorfica, helicoidal, envoltura laxa Su material gentico se divide en 8
fragmentos de RNA mc. Las espculas de la envoltura son de hemaglutinina HA y neuraminidasa. Las variedades en estas espculas
les proporcionan caractersticas antignicas distintitas: la gran variabilidad provoca que cada ao se necesite una nueva vacuna.
La replicacin ocurre en el ncleo, despus se excreta el RNA de dicho compartimento.
Virus RNA mc + con retrotranscripcin.
RNA
+
mRNA
RT
cDNA
protenas
RT actividad
polimerasa
DNA bc
circular
integrasa
Genoma
de la
clula
RNApolDNAdep
RNA
+ al
virin
Estos virus, conocidos como Retrovirus, poseen un ciclo de replicacin complejo. Parten de RNa monocatenario, pero necesitan pasar
por un intermedio de DNA bicatenario para multiplicarse. Para ello utilizan una retrotranscriptasa vrica que posee actividad
transcriptasa inversa, actividad ribonucleasa y actividad polimerasa. As se consigue un cDNA bicatenario, circular en este caso.
Adems, poseen una enzima con actividad integrasa que integra el DNA del virus en el de la clula infectada, dando lugar a un provirus.
As, este se replica junto con el material gentico celular. A partir de aqu, se puede tambin transcribir en RNA + que se englobar en
el virin.
- Virin con RE e integrasa
- Provirus
- Integracin en el cromosoma y DNA celular
- Transcripcin/replicacin asociada al genoma
- Presencia de secuencias promotoras y potenciadoras
Estos virus son envueltos, y el ms conocido pertenece a la familia Lentivirus: este es el VIH (1,2) o virus de la inmunodefinciencia
humana. Produce SIDA y un efecto inmunosupresor, ya que afecta al receptor CD4 de macrfagos y LT. La fase de maduracin o
ensamblaje del virus, ocurre casi a nivel de la membrana de la clula infectada o en el propio proceso de liberacin por lo que necesita
una proteasa vrica (investigada como diana farmacolgica).
Bacterifagos.
- Son los virus ms estudiados, pues son utilizados como herramienta de biologa molecular y biotecnologa.
- Muy importantes en gentica microbiana: transduccin (evolucin)
- Conversin fgica o lisognica: algunos fagos confieren propiedades a las bacterias husped.
As pues, los bacterifagos son virus o fagos de bacterias, es decir, que infectan a las clulas bacterianas. Se clasifican en funcin de
su material gentico, de su morfologa y de la envuelta (la mayora son desnudos).
Ciclos de vida de los bacterifagos.
- Virus lticos o virulentos (T4 de E.Coli)
- Virus atenuados, atemperados o lisognicos (Fago ): el material gentico del virus se integra en el de la bacteria, dando lugar a un
provirus. Las protenas vricas se encuentran silenciadas, no hay expresin de genes vricos. La bacteria no sufre alteracin, sin
embargo, en cada replicacin se transmite el virus de forma indefinida a la progene. Hablamos de una cepa bacteriana lisgena.
La induccin es el proceso por el cual el material gentico vrico se libera del bacteriano y comienza a multiplicarse de forma
independiente dando lugar a un ciclo ltico.
No todos los bacterifagos son lisognicos.
Conversin fgica o lisognica.
En el material gentico vrico se codifican genes no necesarios para su multiplicacin pero que aportan o confieren informacin
adicional a la bacteria, que tendr un significado fenotpico en la clula hospedadora (toxinas). As se produce la conversin de cepas
no productoras de toxinas a cepas productoras de factores de virulencia (patgenas).
La alteracin gentica de la clula hospedadora es en este caso eficiente y tiene gran importancia evolutiva.
El fago posee genes que codifican para protenas Cro, que inducen o favorecen el ciclo ltico, y protena represora CI, que bloquea la
expresin de genes vricos y permite la integracin y lisogenia a travs de las integrasas. Sin embargo, el represor es ms sensible a
las proteasas y a la degradacin, junto con la respuesta SOS (proteasas que degrada al represor), por lo que predominar Cro.
Funcin lisognica: viabilidad de las clulas hospedadoras para mantener los virus.
Lisogenia no integrativa: el fago P1 no expresa genes vricos, aunque el material gentico de los virus no est integrado con el de la
clula hospedadora (extracromosmico).
Hasta la fase de liberacin el cico dur 20-60min en bacterias. La UFP/C representa el nivel de fagos o de infectividad / patogenicidad de
los viriones. La titulacin es el mtodo utilzado: no todas las partculas vricas son capaces de infectar a bacterias (bacterifagos
respecto a la cantidad total de virus), se trata de un mtodo indirecto.
El cultivo en los embriones de pollo posee ciertas caractersticas: la infectividad de virus en animales son muy bajas, se necesita un
tiempo de hasta 40h para la liberacin de los virus. Los virus se pueden implantar en distintas zonas del embrin.
Los cultivos en lneas celulares poseen alta efectividad, Se pueden usar lneas celulares primeras (clulas susceptibles de ser
infectadas, en monocapa o en suspensin) y secundarias. Se utilizan tambin clulas inmortalizadas (tumores Hela, mutagnesis
qumica de una lnea primaria, infeccin virooncognica de dichas lneas
Titulacn de virus (infectividad): recuento de las placas de lisis UFP/C o de efectos citopticos en cultivos a partir de diluciones
decimales. Cada virus causa un foco de citopatologa.
Disciplinas genmicas.
Genmica estructural: orden preciso de los
nucletidos en la molcula de DNA mediante
estudios de secuenciacin. La secuenciacin es
el mtodo mediante el cual, con nucletidos
marcados con distintos fluorescentes, podemos
hacer que se complementen a una secuencia
genmica completa y estudiar esta en funcin de
la fluorescencia emitida, mediante un
secuenciador.
La secuenciacin ha ido avanzando a lo largo de
las pocas aumentando la productividad Kb/da.
- Secuenciacin de Sanger (manual
- Secuenciacin automtica (1 y 2 generacin)
- Secuenciacin masiva
El primer eucariota secuenciado fue S.cereviseae y el primer procariota Haemophylus influenze. Gracias a la secuencia de nucleotidos
podemos obtener informacin funcional de los genes y promotores, mediante la genmica funcional. (caja TATA del promotor: ATG - - - - - - - - - stop) Potencial marco abierto de lectura, luego se puede expresar como un gen o no hacerlo.
Mycoplasma genitalum es el microorganismo ms pequeo secuenciado, y Bradyhizobium japonicum el ms grande. Depende del ciclo
de vida de un organismo o su complejidad el tamao del material gentico.
Un endosimbionte utiliza la maquinaria metablica de la clula hospedadora para llevar a cabo su ciclo.
Gracias a la secuenciacin se ha podido comprobar que los organismos procariotas poseen un n d genes correlacionado con el
tamao del genoma, que cumple una relacin lnea, ya que existe muy poca regin no codificante (gran diferencia con los eucariotas).
Adems, en eucariotas hay un nmero variable de cromosomas (S.cereviseae 16, Aspergillus 8 cromosomas aunque genoma de mayor
tamao).
Genmica funcional: asigna la funcin a cada uno de los genes de un organismo previamente seleccionados. Las tcnicas utilizadas
son:
Estudios de mutagnesis dirigida en genes especficos y anlisis especifico de los mismos. Se observan los resultados al omitirlos
(existen genes esenciales o vitales). LA mutagnesis dirigida busca crear una coleccin genmica de mutantes a los que se eliminan
distintos genes. Si poseemos poblaciones de 6000 cepas, a cada una se le eliminar un gen distinto con el objetivo de estudiar la
funcin de ese gen debido a la disfuncin producida cuando este es eliminado.
Mdulo artificial que codifica para el marcador de seleccin: introduccin de un modulo y recombinacin gentica del gen de inters con
el mdulo, de modo que el gen se ausenta. Para ello es necesario que el modulo posee extremos homlogos cohesivos a los del gen.
Hay que fabricar tanto mdulos de interrupcin como genes a sustituir.
Mutagnesis por transposicin: coleccin de muntantes no especficos, sino que los marcadores se integran en el genoma de forma
no sistemtica (al azar). Debemos utilizar un fenmeno reverso: condiciones y extraccin del DNA para confirmar el gen en el que se ha
insertado el transposon.
Estas tcnicas nos permiten conocer el fenoma: conocer todos los caracteres de la
coleccin de mutantes en diferentes condiciones, tanto en colecciones sistemticas como
en las que no. De esta manera se han ido determinando los genes esenciales para la
vida, conocidos como el sistema celular mnimo, en las condiciones determinadas (puede
haber genes esenciales en unas condiciones que no lo sean en otras).
La biologa sinttica es la ciencia que sintetiza genomas en los tubos de ensayo con el fin
de insertarlos en clulas a las que se eliminan su propio genoma.
Estudios de expresin gnica mediante Microarryas de DNA. Transcriptmica.
Cuando y cuanto se expresan todos los genes de un organismo, estudiado a nivel de
mRNA de cada gen, es campo de la Transcriptmica. La transcriptmica se define como el estudio de los niveles de expresin (la
transcripcin) de los genes de un genoma completo en distintas condiciones.
Para ello se utilizan Mycroarrays de DNA: se parte de una coleccin de molculas de DNA (genes). nicas e identificadas, que son
inmovilizadas a escala microscpica en posiciones conocidas, sobre un soporte slido con capacidad de hibridar. En cada SPOT se
cola una secuencia especfica (sonda) del gen concreto que estas estudiando dentro de un genoma, de modo que las secuencias de
cDNA de dicho gen hibridarn con la sonda (que normalmente posee un marcador d fluorescencia u otra forma de identificacin).
El estudio de las bacterias en varias condiciones se realiza mediante la extraccin de RNA en cada condicin y sntesis del cDNA,
combinado o marcado con un fluorocromo. Esa solucin obtenida se deposita sobre el microarray donde se encuentra la sonda, de
modo que si estos hibridan se produce una seal de fluorescencia de distinta intensidad, que determina los genes que se han transcrito
en cada condicin, de modo que se sabe la influencia e importancia que tienen esos genes en esa situacin. El nivel de expresin es
modulante.
Estudios protemicos: electroforesis bidimensional y espectrometra de masas.
Estudio a gran escala de la estructura, funcin y regulacin de las protenas codificadas por un genoma. As pues, la proteomica estudia
todas las protenas presentes en una clula en un momento determinado.
Para ello se utilizan dos tcnicas de separacin de la mezcla compleja de protenas y pptidos:
- Electroforesis bidimensional: separacin por tamao y por punto isoelctrico en distintos planos en un gel de poliacrilamida.
- Espectrometra de masa: los grandes pptidos se hidrolizan mediante una proteasa, y son ionizados de manera especfica con un
lser. Posteriormente se mueven en un tubo de vaco a lata velocidad, caracterstica segn la relacion masa/carga del pptido. El
software as determina la secuencia de aminocidos de cada protena. Existen variaciones de esta tcnica, como las espectrometra de
masas en tamdem (mayor cantidad de pptidos hidrolizados y con gases inertes en el tubo): preveemos la secuencia aminoacidica
sabiendo la secuencia nucleotidica de ADN segn los pptidos identificados. Comparacin de protenas frente a organismos o genomas
secuenciados.
Plsmidos bacterianos.
Molculas de DNA extracromosomicas
Generalmente circulares (2-200kb)
Autorreplicativas (contienen orgenes de replicacin autnomos al del
cromosoma). Replicacin bidireccional a partir del origen de replicacin mediante
dos horquillas o replicacin crculo rodante, donde una hebra se corta y sirve de
molde (la cadena libre sirve de molde para la complementaria, incluso algunos
bacterifagos son capaces de replicarse as).
Heredables
Distinto nmero de copias dependiendo de la importancia de las protenas para las
cuales codifican
No codifican para protenas indispensables: curacin eliminacin del plsmido del portador.
Tipos de plsmidos:
Segn grupos de incompatibilidad plasmdica (grupo Inc): regiones que no permiten la replicacin de otro mismo grupo si ya est
replicndose.
Segn el nmero de copias: alto (30-40) o bajo (2-3)
Segn su espectro, amplio o restringido: no todos los plsmidos se replican en cualquier tipo de bacterias, sino que existen algunos
muy especficos de ciertas especies.
Segn su mecanismo de replicacin: bidireccional o crculo rodante.
Clasificacin de los plsmidos segn su funcin.
- Plsmidos R de resistencia a antibiticos (suelen tener transposones)
- Plsmidos Col: produccin de bacterocinas, toxinas que afectan a otras bacterias de otras especies y genes que codifican proteinas
frente a esas bacteriocinas.
- Plsmidos de virulencia: adhesinas, toxinas
- Plsmidos metablicos: capacidades degradativas (azucares, compuestos aromticos), biosntesis, fijacin de N
- Plsmidos conjugativos: factor F de fertilidad, capacidad de autrotransmitirse entre clulas de la misma generacin mediante pelos
conjugativos.
Un plsmido puede estar categorizado en varios grupos.
La nomenclatura de los genes mutados es diferente en procariotas y eucariotas. Si afecta a un fenotipo observable diferenciamos
entre prototrofos (s sintetizan +) y auxotrofos (no sintetizan -).
La alteracin fenotpica es una revelacin de una mutacin genotpica (muy importante en el laboratorio).
Mutacin.
Alteracin permanente y heredable en la secuencia de nucletidos del DNA, con o sin expresin fenotpica.
Mutaciones espontneas.
- Errores en la replicacin (la DNA polimerasa posee una pequesima tasa de error). Cuando se incorpora una base equivocada al
DNA durante la replicacin se transmite la alteracin gnica a de la poblacin hija (semiconservativa).
- Lesin fortuita: cambios en la tautomera de las bases y con ello en la complementariedad.
Mutaciones inducidas: mutgenos (f) qumicos, fsicos y biolgicos.
Mutaciones gnicas, cromosmicas o genmicas
Mutaciones gnicas en secuencias reguladoras o genes estructurales (promotor, operador, gen, terminador)
Podemos adems clasificar las mutaciones en:
- Macrolesiones: recombinacin a nivel de la secuencia de nucletidos: insercin, deleccion, translocacin o inversin.
- Microlesiones o mutaciones puntuales: sustitucin, insercin y deleccion de uno o dos nucletidos.
A nivel del cdigo gentico nos referimos a las mutaciones como silenciosas
(cuando el cambio de los nucletidos no genera un cambo en los aminocidos), sin
sentido (no codifica para aa) o cambio de sentido conservador y radical (dar lugar
a un aminocido diferente, dando lugar a su vez a una alteracin en la funcin, por
ejemplo en el centro cataltico, en la estructura cuaternaria de la protena, etc).
A nivel de la funcin hablamos de mutaciones silenciosas, mutaciones que
producen un cambio en la funcin o una prdida de la funcin. Las inserciones y
delecciones cambian los tripletes de aminocidos, los codones de terminacin o tal
vez no hay modificacin (segn el nivel de deleccion o insercin).
Consecuencias fenotpicas de las mutaciones.
- Mutaciones letales
- Mutaciones condicionales: en genes esenciales en determinadas circunstancias,
cambio en la funcionalidad respecto al tipo silvestre (mutantes termosensibles o
criosensibles).
- Mutacin estructural
- Mutacin morfolgica
- Mutacin de resistencia o sensibilidad respecto a compuestos fsicos y qumicos
- Mutacin nutricional: biosntesis y degradacin (auxotrofos)
- Mutantes superproductores: ganancia de funcin (fin buscado en la industria).
El test de complementacin es una tcnica que permite determinar si dos mutaciones estn afectando al mismo gen (Cis) o a genes
diferentes (Trans, como en operones). Es til en rutas biocinticas para un producto en el que intervienen varios genes. Para ello, en la
cepa mutante A hemos de introducir los diferentes genes silvestres: si introducimos el gen silvestre A se recupera la funcin, mientras
que s es otro no se recupera el fenotipo.
La prueba Ames (estudios de carcinogenicidad). Anlisis de la tasa de reversin de cepas de Salmonella con mutaciones en el operon
de biosntesis de His (his-) y efectos en reparacin del DNA y pared celular. Al aadir mutagenos podemos conseguir que reviertan a
His + (agente potencialmente mutageno que recupera el fenotipo y genotipo de His, aunque puede afectar a otro caracteres).
RNA en cDNA y posteriormente lo integran en el genoma. Esto ocurre en eucariotas (desde levaduras hasta clulas animales o
vegetales).
El fago forma parte de un transposon y se replica como un trasnposn replicativo (secuencia para la transposasa + secuencia de
genes), se replica por tanto dependiendo de la actividad transposasa y se integra en otras localizaciones del material gentico.
Integrones.
Fuente de variabilidad gentica basada en un elemento gentico dinmico en el
que, por un mecanismo de recombinacin de sitio especfica se acumula una
combinacin de genes estructurales organizados en opern. Todos los genes
estn controlados por el promotor del opern, no son mvil, sino fijos que captan
mdulos concretos de material gentico, de los que adems poseen promotor
para ser controlados (promotor del propio integrn = control).
El integrn posee una integrasa que ayuda a la recombinacin sitio especfica.
4. Finalmente podr tanto ser degradado por tanto o recombinar con el cromosoma bacteriano (DNA) y ser una variacin perdurable
del genoma bacteriano.
Transformacin artificial:
Competencia inducida produca en bacterias no competentes naturalmente como E.coli mediante:
Tratamientos qumicos: tratamiento con cloruro clcico, Rb, Li, enzimas lticas
Tratamientos fsicos: choque trmico, electroporacin (generacin de poros en la membrana por campos elctricos pulsantes)
Plsmidos: mtodo ms utilizado con una ventaja frente a los DNAs lineales y es que son autoreplicativos, no hace falta que se
recombine con el genoma si no que es capaz de replicarse de forma autnoma. No se degradan con tanta facilidad como los
fragmentos lineales
Conjugacin bacteriana: estos gneros aportan plsmidos conjugativos, que son autotransmisibles con capacidad de intercambiarse.
Gram -: enterobacterias como Salmonella o E.coli, Pseudomonas
Gram +: Enterococcus, Streptomyces, Staphylomices, Bacillus
En este caso se rompe una cadena y va pasando a la clula aceptora que segn entra va copiando a la complementaria y la cadena
sencilla que queda en la clula aceptora tambin sirve de molde para copiar la complementaria, teniendo ambas el plsmido F al final
siendo F+ y la aceptora ser capaz de sintetizar el pili (recordar que se sella el poro).
El mismo plsmido no puede entrar en la bacteria F+ porque los receptores para el pelo sexual quedan bloqueados por accin de las
regiones Tra.
El plsmido F se puede integrar en el genoma e la bacteria usando secuencias de insercin comunes y dndose una recombinacin
homloga. Las bacterias que lo presentan integrado en el cromosoma se denominan bacterias Hfr (alta frecuencia de recombinacin,
cuando transmitan el plsmido s que hay eventos de recombinacin cromosmica no como el caso anterior cuando simplemente
estaba el plsmido en el ambiente extra cromosmico). El plsmido F es capaz de transmitir la informacin gentica plasmdica y de
sintetizar el pili.
Ahora mismo tenemos el cromosoma de E. coli, genes de la bacteria que codifica y tenemos el plsmido F integrado. El inicio de la
transferencia lo marca el oriT donde comienza el corte de la hebra que se va a transferir. Lo que se dona a la clula aceptora es DNA
cromosmico de la bacteria, los arrastra a estos genes cromosmicos si el oriT coincide con el plsmido F. Si se pudiese mantener el
contacto durante 100 minuto se transmite el genoma y el plsmido completo integrados a la nueva bacteria, pero en el medio con la
inestabilidad ambiental la unin se interrumpe en tiempos cortos, de tal forma que solamente un pequeo fragmento de DNA de origen
cromosmico ser transferido a la clula aceptora y como es DNA lineal lo ms normal es que se degrade o que si existe alguna
homologa en la bacteria que lo recibe puede haber eventos de recombinacin en la clula a la que se dona este material gentico.
Dependiendo del tiempo el nmero de genes cromosmicos movilizados desde la donadora a la aceptora ser mayor.
Gracias a esta posibilidad de E.coli se pueden llevar experimentos de acoplamiento interrumpido se pudieron elaborar mapas genticos
y conocer en qu orden se encontraba los genes en el genoma (usamos cepas Hfr).
En E.coli las secuencias de insercin se conoce donde se localizan en el cromosoma (hay 4) y por tanto podr generar 8 cepas Hfr
debido a que se puede producir una doble recombinacin dependiendo del sentido en el que entre en esta secuencia de insercin,
movilizndose genes en un sentido u otro.
Cuando la escisin es perfecta, dara lugar a una cepa F+ y se puede conjugar perfectamente pero si el plsmido F falla en la escisin
arrastra algn gen colindante de la bacteria Hfr. Se conoce como una cepa F con informacin adicional de la bacteria donadora. Por
tanto podr llevar genes cromosmicos arrastrados sin necesidad de recombinar (cuando se transmita llevar la informacin de F ms
los genes cromosmicos de la primera clula donadora, que podr recombinar o no). Algunas cepas pueden ser merodiploides para
algunos genes: puede haber un mismo gen tanto en el plsmido F arrastrado y en el genoma de la bacteria (gen repetido en plsmido y
cromosoma). La bacteria que recibe este plsmido F siempre ser F.
Resumen del proceso de conjugacin:
- Solo transmisin de plsmido: cruce de F+ con F- = dos F+
- Integracin de plsmido en cromosoma: cepa Hfr. Si conjuga con cepa F-: la cepa Hfr sigue siendo Hfr (se transmite solo un fragmento
del plsmido que despus se restituye) y la otra es F- (no tiene plsmido completo) recombinante (algn carcter puede recombinar con
su cromosoma y la informacin gentica queda en su cromosoma).
- A partir de una cepa Hfr se escinde todo el plsmido: si conjuga con F- da lugar a F+ pero si se lleva parte de la informacin de la
bacteria dar lugar a dos clulas F (una primaria y otra secundaria dado que no tendrn la misma secuencia).
Gram -: enterobacterias (E.coli), pseudomonas
Gram +: enterococcus, streptomyces, staphylococcus, bacillus.
No pelos o fimbrias sexuales. LAURA
Transferencia de genes entre bacterias se puede producirse entre una misma especie, entre especies diferentes y entre gneros
diferentes.
Tambin existen los plsmidos movilizables: no son autotransmisibles pero si coinciden en el genoma con un plsmido conjugativo (F)
puede utilizar su maquinaria y transmitirse a otra clula mediante regiones que poseen que se llaman mob, careciendo normalmente de
oriT o de Tra que lo adquieren de la otra.
Transduccin:
Proceso mediado por bacterifagos, virus. Hay dos mtodos fundamentales que son la traduccin generalizada y especializada.
Generalizada: descubierta por Zonder y Ledeberg. Es la transferencia de cualquier fragmento de ADN bacteriano (de forma aleatoria).
Requiere recombinacin para mantenerse estable (no forma parte de un fago infectivo). Transduccin abortiva (DNA no integrado). El
tamao del genoma que se incluya en el fago depende del tamao de la cpsida. Si tiene xito habr una recombinacin gentica
estable. De forma errnea, en vez de incluir material gentico vrico dentro de su cpsida va a incluir genoma bacteriano. Es una
partcula rara y se denomina partcula transductora: cuando encuentra una nueva bacteria susceptible le inyecta material gentico de la
bacteria que no lleva ningn ciclo de multiplicacin vrica y la partcula se denomina partcula vrica defectiva y el material gentico
bacteriano introducido puede degradarse o recombinarse de forma homloga no recproca y se integra en el genoma de la bacteria que
es recombinante de por vida. Tpico de Salmonella typhimurium y E.coli
Especializada: solamente tiene lugar en fagos lisognicos. En el ciclo de vida de los bacterifagos se poda silenciar la expresin de
los genes vricos e integrarse en el cromosoma bacteriano, las protenas estaban silenciadas y no se pone de manifiesto la presencia
del virus. Sin embargo llegado a un tiempo puede escindirse del genoma bacteriano y retomar el ciclo ltico a partir del lisognico.
Normalmente el fenmeno de escisin es perfecto (solamente se escinde el material gentico vrico) pero si hay un error en el proceso
de escisin, al escindirse el fago lambda (por ejemplo) de su forma lisognica se lleva una regin colindante perteneciente al genoma
bacteriano. A partir de ese momento todas las partculas vricas poseern una informacin hbrida entre el genoma vrico y el bacteriano
que se ha llevado. Los genes que se llevan siempre sern adyacente a la zona de insercin, no aleatorio como en el caso de la
generalizada y en general a costa de algn gen vrico que pierde.
Todos estos procesos que hemos estudiado por tanto tendrn un resultado en la que se adquiere informacin gentica metablica y
relacionada con factores de patogenicidad, de una bacteria otra de la misma generacin, generando una ventaja evolutiva
Seleccin de mutantes
Necesitamos seleccionar los mutantes con las caractersticas que buscamos. Para ello podemos emplear:
Seleccin directa o positiva: podemos detectar directamente la caracterstica que buscamos (pej. Si busco una bacteria resistente a la
penicilina, primero llevo a cabo la mutagnesis en una cepa bacteriana y si busco una bacteria resistente a penicilina la hago crecer en
una presencia de antibitico que mate a la poblacin normal y solamente sobreviven aquellos que resisten al antibitico). Tambin
podemos emplear inhibidores qumicos (por ejemplo cepas resistentes a determinada temperatura) u observar cambios morfolgicos
producidos en la poblacin mutante.
Como caracterstica es que es una seleccin fcil, no necesita enriquecimiento, pero como dificultad es que no encontramos la
condicin ptima del agente.
Seleccin indirecta o negativa: estamos buscando la prdida de una propiedad no seleccionable directamente, como por ejemplo si
buscamos una bacteria auxtrofa para la histidina (la necesita para poder crecer o no crece si no est en el medio de cultivo). La
poblacin mutagenizada se siembra sobre una placa Petri con un medio de cultivo rico y se pasan por un filtro de tela en la que quedan
retenida, situando el agar sobre el filtro y creando copias de la placa original pero con condiciones distintas: el medio de cultivo ser
mnimo, de tal forma que falta la sustancia para la que el mutante es auxtrofo. Comparamos ambas para obtener los mutantes viendo
las que faltan en el medio con la sustancia para la que es auxtrofa. Si se busca una prdida de funcin es obligatoria hacer crecer
antes a la poblacin bacteriana. La placa original se suele crecer en presencia de penicilina (a partir de las cuales van a formarse
placas): mtodo de enriquecimiento. La penicilina lo que hace es matar bacterias cuando estn activas en su crecimiento. Como los
mutantes no puede crecer sin leucina, as igualamos la poblacin.
Adems las representaciones y pendientes pueden varias segn la poblacin sea uniforme, mixta o sea una poblacin con esporas:
Poblacin uniforme, la recta ser uniforme pues todos los microorganismos son iguales.
Mixta, al haber varios tipos de microorganismos, habr algunos microorganismos que tarden ms en morir y la recta disminuye su
pendiente en el tramo final.
Una poblacin con esporas en primer lugar mostrara una pendiente positiva debido a la germinacin de las esporas y, despus,
poseera pendiente negativa
Calor como agente microbicida. El calor puede ser evaluado mediante una medida de su eficacia:
Punto de muerte trmica (PMT): menor temperatura a la que se matan todos los microorganismos de una suspensin en 10 minutos.
Este vara segn la bacteria a la que se enfrente (E.Coli a 55)
Tiempo de muerte trmica (TMT): menor tiempo para destruir todos los microorganismos de una suspensin a una temperatura
determinada en unas condiciones definidas.
Tiempo de reduccin decimal (D): tiempo necesario para destruir el 90% de los microorganismos o esporas a una temperatura
especfica, normalmente aumenta al disminuir la temperatura y viceversa. (Ej: D121 a 121C)
Resistencia relativa de un microorganismo (Z): incremento de la temperatura necesario para reducir D a 1/10 de su valor (un ciclo
logartmico), por ejemplo si (D) era 10 minutos buscaramos reducirlo a 1 minuto, y para ello habra que ascender la t en cierta
cantidad.
Geobacilus stearotermophilus es la bacteria con las esporas ms resistentes al efecto de la temperatura.
No ionizantes como la radiacin ultravioleta cuya est entre los 200-400nm. La radiacin UV tiene un efecto mximo a 260 nm
donde degrada el DNA. Su utilizacin produce la formacin de dmeros de timina. No es una luz muy penetrante. Se utiliza para la
fotorreparacin de alteraciones en el DNA (escisiones, reparaciones y recombinaciones).
La luz UV sirve para tratar superficies, laminas delgadas de agua, aire de quirfanos, habitaciones de hospital.
Ventajas: sencillo, barato y no produce residuos.
Inconvenientes: poca energa y penetracin, cierto peligro y alteracin de algunos materiales.
Dentro de los mtodos mecnicos de control microbiano, nos encontramos la filtracin. Este mtodo es usado desde hace siglos, y con
las mejoras y tecnologa actual se ha aumentado su eficacia.
Filtracin.
Es un proceso que elimina a los microorganismos pero no es microbicida, no los mata. Los filtros pueden tener diferentes luces de malla
o de poro:
- Luz de 0,45nm: retienen bacterias
- Luz de 0,2nm: retienen esporas y bacterias
- Luz de 0,01nm para virus y protenas grandes.
Distinguimos distintos tipos de filtro segn sean de profundidad (provocan absorcin y retencin), de membrana (solo retienen) o filtros
nucleopore (retienen nicamente).
La filtracin se utiliza para esterilizar soluciones termolbiles y aire. Sus ventajas son que es poco degradativo, que es til para
soluciones termolbiles (antibiticos, enzimas, vitaminas), medios de cultivo y sueros. Se trata de un proceso que elimina a los
microorganismos retenindolos mecnicamente.
Las desventajas que presenta son que es caro a nivel industrial (filtro HEPA) y que provoca la contaminacin del aire.
El mtodo qumico utilizado por excelencia, y que se ha desarrollado a lo largo de los aos con el fin de una mayor capacidad de control
de los microorganismos es la esterilizacin qumica, que se basa en la utilizacin de distintos agentes qumicos para eliminar o detener
el crecimiento de los microorganismos.
Esterilizacin qumica.
Como hemos dicho, la esterilizacin qumica se basa en el uso de diferentes agentes que realizan actividades qumicas distintas con el
fin de controlar los microorganismos. As, podemos distinguir entre:
Agentes alquilantes que interaccionan con los grupos OH SH COOH NH2 de protenas.
Formaldehido: gas estable slo a concentracin elevada y a elevada t. Tiene efecto esterilizante (34-38% o 2% en metanol
durante 3h y a una humedad relativa superior al 60%) y es esporocida (penetra en el interior) y se usa en la descontaminacin del
ambiente (en forma gaseosa) y en la esterilizacin de instrumentos (en solucin acuosa: formol). Sus inconvenientes son que es
inestable y reactivo, irrita ojos y mucosas, es cancergeno y poco penetrante.
Glutaraldehido: es barato, eficaz frente a bacterias, micobacterias, virus, hongos y esporas, siendo unas 10 veces ms eficaz que
el formaldehido. Se utiliza en la esterilizacin de instrumentos de uso clnico, y para ello es necesario someter el material a un 2%
de solucin alcalina CIDEX que desinfecta en 1-20min y esteriliza en 3-20h. Como desventajas tiene que es irritante, corrosivo y
forma capas proteicas en contacto con residuos orgnicos.
xido de etileno: Estado lquido si la t <10C y se comporta como un gas inflamable en contacto con el aire a t >10C. Se utiliza
para esterilizar instrumentos y equipos mdicos desechables. Para ello se usa a concentracin elevada (0,4 - 1 g / litro),
temperatura ambiente y tiempo prolongado, diluido con gases inertes y si es posible, una humedad de 35-60 % que mejora su
penetracin en materiales.
Ventajas: es muy penetrante, verstil, y la temperatura de uso es baja (max. 60C).
Inconvenientes: Explosivo (mezclas), txico (cancergeno), aireacin cada 24 h y necesidad de grandes instalaciones.
Desinfectantes y antispticos.
Compuestos qumicos que se utilizan sobre objetos inanimados o sobre tejidos vivos, respectivamente. No existe un nico agente que
sea eficaz frente a todos los microorganismos y en todas las circunstancias, sino que en cada caso se utilizan diferentes compuestos.
Las caractersticas fundamentales de desinfectantes y antispticos:
- Amplio espectro antimicrobiano
- Elevada actividad
- Estabilidad, solubilidad en agua, en grasas y aceites.
- Toxicidad mnima
- No corrosivo para metales, madera, plstico y pintura
- Desodorante, sin olor o con olor agradable
- Econmico
Se suelen utilizar en forma de mezclas para incrementar su efecto: el agua potencia al etanol.
Dichos antispticos son rpidos y no dejan residuos. Sin embargo, la desventaja es que se inactiva con la materia orgnica, no acta
frente a esporas y desecan la piel.
Se utiliza en la piel antes de poner inyecciones o sacar sangre.
Alteracin de la membrana celular y desnaturalizacin de protenas.
Fenoles: compuestos que alteran la membrana celular y son capaces de desnaturalizar protenas. Se empezaron a usar en la
desinfeccin (al principio de aparecer esta). Son desinfectantes de nivel medio: tuberculocidas como el fenol, ortocresol y ortofenilfenol.
Tienen olor desagradable y son irritantes, pero son eficaces en presencia de materia orgnica y permanecen en la superficie donde se
pulveriza.
Sin embargo, actualmente el Hexaclorofeno se utiliza como antisptico. Forma parte de jabones o incorporado a desodorantes,
champs... Pero es potencialmente txico para SNC y tiene buena persistencia en la piel. Ha sido utilizado en la desinfeccin de suelos,
paredes, etc.
Triclosan (0,1-2%): Muy utilizado en jabones antimicrobianos, champs, lociones y colutorios. No txico en piel pero se han
encontrado restos en aguas, peces, alimentos, orina, etc. por el gran uso del producto.
Bisguanidas: son antispticos, como la Clorhexidina, conocida comercialmente como Hibitane o Cristalmina. Se usa en lavado
quirrgico, como colutorio, antisptico bucal y farngeo. Es incompatible con jabones y provoca dao ocular.
Este antisptico es persistente en piel y mucosas, no inactivado por materia orgnica, poco txico excepto en ojo.
Detergentes: compuestos que se utilizan como desinfectantes, detergentes catinicos o son agentes surfactantes (tensoactivos). Su
mecanismo de accin se basa en la desnaturalizacin de protenas, afectan a la produccin de energa, alteracin la MP, al ser
Los aniocnicos se aaden en el lavado de ropa mientras que los catinicos (amonio cuaternario) se emplean como antimicrobianos
(cloruro de benzalconio). Buena limpieza, estables, no txicos pero no actan contra esporas ni micobacterias ni Gram positivos, se
inhiben en presencia de materia orgnica.
Los mecanismos de accin delos frmacos antimicrobianos utilizados hoy en da son muy variados:
- Impidiendo la sntesis de la pared
- Alterando la permeabilidad de la membrana citoplasmtica
- Inhibiendo la sntesis proteica
- Bloqueando la sntesis de los cidos nucleicos
- Interfiriendo en vas metablicas.
La toxicidad selectiva es lo que buscaba Ehrlich (bala mgica). Ser toxico par ale patgeno e inocuo para el hospedador. Para ello el
antibitico debe afectar a estructuras diferentes en la clula del patgeno, que no estn presentes en el hospedador: puede afectar a
los ribosomas 70S, enzimas capaces de replicar el ADN, pared celular, membrana
citoplasmtica Se resaltan estructuras que tienen estos microorganismos
(estructuras exclusivas) y no los hospedadores, y usarlos como dianas.
El grado de toxicidad selectiva puede expresarse en trminos de:
Dosis teraputica o efectiva: nivel de frmaco necesario para el tratamiento de una
infeccin determinada
Dosis toxica o letal: nivel de frmaco al que el agente resulta excesivamente txico
para el hospedador.
La relacin entre dosis toxica (letal) y dosis teraputica (efectiva) se denomina ndice teraputico o margen teraputico. Cuanto mayor
sea, es decir, mayor diferencia entre ambas dosis, mejor es el antimicrobiano:
- Penicilina: acta sobre el peptidoglicano de la pared celular de bacterias, tiene un ndice teraputico alto y un alto grado de toxicidad
selectiva. Las autolisinas van formando huecos en la pared y el PG se va regenerando, sin embargo, gracias a la penicilina se
incorporan subunidades alteradas o sin enlaces interpeptdicos, de modo que no se regenera correctamente la pared y bacteria termina
lisando.
- La anfotericina B acta sobre la membrana plasmtica y tiene un ndice teraputico bajo y una
toxicidad selectiva baja.
- Los aminoglicosidos actan sobre la sntesis proteica. La diana de los mismos son los
ribosomas 70S (alta toxicidad selectiva). Son sin embargo nefrotxicos y otorxicos (ndice
teraputico menor al esperado por su toxicidad).
Cuando un antimicrobiano alcanza una clula lo primero que hace es penetrar y alcanzar la
diana (que estar en el interior). Luego interacciona con la diana causando as la muerte o la
inhibicin del crecimiento bacteriano.
El modo de accin de un antibitico depende en gran parte de que sea bacteriosttico o bactericida. La penicilina es bactericida (no
deja que se forme adecuadamente el peptidoglicano). Otras veces depender ser bactericida o bacteriosttico del microorganismo al
que se enfrente el antibitico, un mismo antibitico sobre diferentes microorganismos puede tener comportamientos diferentes (Por
ejemplo, el Cloranfenicol sobre H.influenzae es bactericida, pero se comporta como bacteriosttico en E.Coli). Tambin depende de
otros factores como la dosis, el tiempo de contacto o la fase de crecimiento del microorganismo.
Sensibilidad y resistencia.
La sensibilidad es la respuesta de las bacterias a la accin de los antimicrobianos. Estos actan en la poblacin inhibiendo su
crecimiento o produciendo su muerte.
La actividad antibacteriana de un antibitico puede cuantificarse en el laboratorio. Se determinan 2 parmetros:
Concentracin mnima inhibitoria (CMI): La menor concentracin de antibitico capaz de inhibir el crecimiento (g/mL)
Concentracin mnima bactericida (CMB): La menor concentracin de antibitico capaz de matar a la bacteria (si el antibitico es
bactericida). Para ello hay que subcultivar los tubos que no presentan crecimiento en placas para ver si los microorganismos crecen o
no, pues si no lo hacen, estamos ante la CMB.
Tambin se pueden examinar concentraciones plasmticas y tisulares, referidas a las concentraciones necesarias en sangre y otros
tejidos respectivamente.
Los ensayos de sensibilidad de antimicrobianos nos permiten estudiar la interaccin entre los antibiticos y las bacterias de una forma
artificial, determinando la CMI de una bacteria frente a uno o varios antibiticos. Los resultados obtenidos de todos estos parmetros
nos permiten clasificar los microorganismos en:
- Sensibles: cuando la CMI de un antibitico se puede conseguir in vivo con dosis teraputicas habituales del antimicrobiano y la
experiencia ha demostrado su eficacia
- Resistentes: cuando el microorganismo no es inhibido por las concentraciones del antimicrobiano que habitualmente se alcanzan en
sangre o tejidos. (la CMI es mayor que la concentracin mxima en sangre del antibitico o tolerada por el hospedador). La resistencia
es la sensibilidad reducida o nula de una cepa bacteriana a un antimicrobiano.
- Intermedio: cuando las bacterias se inhiben a concentraciones que no se alcanzan con dosis teraputicas pero que pueden alcanzarse
con dosis ms altas (sin llegar a ser toxicas)( por ejemplo la penicilina).
Espectro de accin.
Rango de microorganismos sobre los que el antibitico acta. Si el rango de los mismos es pequeo, hablaremos de rango reducido o
restringido, mientras que si afecta a gran cantidad de microorganismos nos referimos antibiticos de espectro amplio.
Para definir el espectro se consideran los diferentes grupos de bacterias sobre los que puede actuar el antibitico:
- Cocos Gram + (suelen ser resistentes)
- Bacilos gram
- Patgenos propios del hospital: nosocomiales (muy resistentes)
- Bacterias sin pared (Mycoplasma)
- Bacterias acido-alcohol resistentes (Mycobacterias)
- Bacterias anaerbicas
Los antibiticos de amplio espectro tienen como ventaja que son activos frente a una gran diversidad de microorganismos y que son
rpidos en su mecanismo de
accin, y por tanto en el
tratamiento. Sin embargo, pueden
destruir la biota normal.
La penicilina por ejemplo tiene un
rango reducido, solo acta sobre
Gram +.
La tetraciclina tiene un amplio
espectro, acta sobre Gram ,
Gram+ , Chlamydias,
rickettsiasetc
Aunque normalmente para tratar infecciones microbianas se utiliza un nico antibitico, existen situaciones en las que se utiliza ms de
uno a la vez. Por ejemplo, en la colitis pseudomembranosa (Clostridium difficile), se utiliza en el primer caso un antibitico de amplio
espectro y posteriormente un segundo antibitico de espectro restringido, concreto contra dicho patgeno.
El usar dos antibiticos a la vez, se basa en razones como:
- Potenciar la actividad de los antimicrobianos
- Ampliar el espectro
- Tratar infecciones polimicrobianas (peritoneo, intestino se utiliza ms de uno por las distintas sensibilidades de los microorganismos)
- En algunos casos puede retrasar la aparicin de resistencia (tuberculosis).
Combinacin de antimicrobianos.
Los mecanismos de accin de los antibiticos pueden interferir entre si cuando se utilizan simultneamente, tanto e un aspecto positivo
como en uno negativo.
Los efectos de la actividad combinada de los antimicrobianos se clasifican en:
Indiferencia: la presencia de uno no influye sobre la actividad del otro
Adicin: el efecto de la combinacin de los dos antimicrobianos es la suma de sus efectos por separado.
Sinergismo: el efecto de la combinacin es mayor que la suma de las actividades de los dos antimicrobianos por separado. Se
La eleccin de un antimicrobiano es compleja, pues no solo existe relacin entre el antimicrobiano y el microorganismo, sino que hay
que tener en cuenta las interacciones entre el antimicrobiano, microorganismo y hospedador.
Factores que influyen en la eleccin de un antimicrobiano:
1. Factores del microorganismo:
La nueva diana tiene menor afinidad por el antibitico. Se debe a una mutacion o por un gen de resistencia adquirido. Las
modificaciones no se dan en el frmaco, sino en el lugar en el que este actua.
Protenas: los antibiticos pueden actuar sobre enzimas ribosmicas, precursores de la pared o enzimas esenciales. Se modifica la
afinidad del antibitico por las mismas, pero no el lugar de accin.
Ribosomas: modificados mutacin de la protena S12 (M.tubercolosis) adquiriendo resistencia a la estreptomicina, aminoglicsidos,
tetraciclinas, cloranfenicol, macrlidos y lincosamidas.
Precursores de la pared alterados: resistencia de enterococos a glicopptidos. La vancomicina, por ejemplo, es un antibitico de unin
al dmero D-ala. Si se modifican los pptidos del pentapptido, la vancomicina no se une y se adquiere resistencia. Los enterococos
producen infecciones graves y de difcil tratamiento.
Modificacin o mutacin de enzimas sobre las que acta el antibitico, como la modificacin de las PBP (blanco de los -lactmicos) o
de la DNA girasa (quinolonas, antimicrobianos de sntesis) o de la RNA polimerasa que se trataba con Rifampicina (medicamento de
reserva para el tratamiento de la tuberculosis).
Hiperproduccin de la diana PBPs: resistencia a ampicilina ya que no todo el antibitico es capaz de unirse l total de PBPs. Esto
ocurre en Enterococcus.
4. Rutas metablicas alternativas.
La adquisicin de una ruta metablica alternativa o bypass es un proceso realizad por algunas bacterias mediante el cul se consigue
resistencia frente a, por ejemplo, trimetoprim y sulfamidas.
Se utilizan nuevas enzimas (en este caso dihidropteroato sintetasa y dihidrofolato reductasa) que pueden esta codificadas en
plsmidos. Estas nuevas molculas, por ejemplo, las enzimas pueden realizar la misma funcin que la original pero no unirse al
frmaco, de modo que las funciones de la clula se mantienen normales.
Penicilinas.
Derivan todas del ncleo 6-APA (cido 6 amino penicilnico).
Naturales.
Producidas por especies de Penicillium. No penetran a travs de las porinas de la mayora de Gram por lo que poseen un espectro
reducido a Gram +.
- Penicilina G (benzil-penicilina): es muy activa sobre bacterias Gram + y solo tiene actividad sobre unas pocas Gram como algunos
cocos y espiroquetas.
- Penicilina V (fenoximetil-penicilina): uso oral
Aminopenicilinas.
La penicilina no penetra en la mayora de los Gram -. Hay que modificar la estructura del lactmico, aadiendo un grupo amino. Se
consiguen as penicilinas semisinteticas mas solubles a travs de la membrana Modificacin de su estructura por introduccin de
grupos aminos, lo que las carga negativamente permitiendo el paso de las mismas a travs de las porinas de membrana de Gram -. Se
trata de penicilinas de amplio espectro. Son activas por va oral frente a bastantes bacterias Gram y Gram +. Ej: ampicilina,
amoxicilina.
Estas penicilinas anteriores presentan problemas de resistencia, pues muchos Staphylococcus (cocos Gram +) producen actualmente
penicilinasa (-lactamasa).
Los principales mecanismos de resistencia a betalactmicos son:
- Alteracin o prdida de porinas debido a mutaciones (solo en Gram -, impidiendo o dificultando la entrada del -lactmico)
- alteraciones de las PBPs por mutaciones o adquisicin de nuevos genes de resistencia (transposones), perdiendo afinidad por el
antibitico (por ejemplo. S.aureus cambia PBP2 por PBP2a. S.aureus es muy resistente, otros cocos Gram + tambin han adquirido
resistencias).
- Produccin de -lactamasas que hidrolizan estos antibiticos, pudiendo producirse tanto en Gram como en Gram + (muy importante
en Gram -). Se encuentran codificadas a partir de plsmidos o trasposones mayoritariamente. Adems, una vez se rompe el anillo
pueden hidrolizarse otras molculas, pues no se quedan unidas a ellos.
Para ello se realizan modificaciones en la estructura de las penicilinas, obteniendo:
Penicilinas anti-estafiloccicas.
Espectro muy reducido a los Staphylococcus (Meticilina, Cloxacilina, etc).
Sin embargo, como hemos dicho antes muchos Staphylococcus han adquirido la
nueva PBP2a que no se une a -lactmicos y realiza sin embargo las mismas
funciones que la PBP2. Se denominan de estafilococos meticiln-resistentes,
aunque en realidad son resistentes a todos los -lactmicos (30% de cepas resistentes en Espaa).
Otros cocos Gram + tambin han ido adquiriendo resistencias por cambios en las PBPs.
Existen bacterias Gram resistentes a la ampicilina, aunque se trate de una aminopenicilina no consigue penetrar en las porinas de
Gram como Pseudomonas y otros nosocomiales.
Penicilinas anti-Pseudomonas.
- Carboxipenicilinas, antibiticos semisintticos con un grupo carboxi en el sustituyente 6, mejorando la solubilidad de las penicilinas a
travs de las porinas de Pseudomonas. (como carbenicilina, la cual es txica a dosis elevadas y Ticarcilina, ms potente y menos
txica, tiene efectos sinrgicos con aminoglicosidos y se administra va parenteral)
- Ureidopenicilinas, derivadas de las aminopenicilinas (piperacilina frente a Pseudomonas aeruginosa).
Se trata de penicilinas de muy amplio espectro ante bacterias Gram -, pero estos microorganismos son capaces de resistir frente
dichos -lactmicos debido a que poseen -lactamasas codificadas por transposones, siendo la ms comn la tipo TEM. Tienen un
resto serina en el centro activo que permite la unin al anillo del frmaco y su ruptura.
Cefalosporinas.
Los -lactmicos incluyen a las Cefaloporinas. Se trata de
molculas obtenidas a partir del hongo Cefalosporidium, que
presentan un anillo comn, sin embargo, no se usan las
naturales (mala farmacocintica y accin antimicrobiana, aunque
resistente a la accin de penicilinasas y activa frente a Gram -).
Se utilizan actualmente derivados semisintticos, obtenidos a partir del ncleo del cido 7-amino cefalospornico (7-ACA): el
sustituyente 7 modifica las propiedades antimicrobianas y el sustituyente 3, todo lo relacionado con la farmacocintica del antibitico.
Cefalosporinas de 1 generacin.
- Cefalotina (la primera utilizada)
- Cefazolina (la ms utilizada actualmente)
- Cefalexina (orales)
Molculas de vida corta, que se utilizan fundamentalmente en la profilaxis y no se hidrolizan por penicilinasas producidas por
Staphylococcus, pero s por -lactamasa tipo TEM y cefalosporinasa ampC.
-lactamasas:
Penecilinasa de Gram +: suele ser plasmdica y no afecta a las cefalosporinas. La producen los Staphylococcus.
-lactamasa TEM: suele ser plasmdica y codificada por transposones. La producen muchas bacterias y afecta a pocas cefalosporinas.
ampC: cefalosporinasa cromosmica producida por algunos bacilos Gram - . Gen inducible producido en presencia de antibitico.
En el laboratorio se ponen de manifiesto depositando un asa de cultivo sobre un disco de papel impregnado de cefalosporinas
cromognicas, que cambian de color cuando se hidrolizan (rojo), lo que indica presencia de estas enzimas.
Cefalosporinas de 2 generacin.
- Cefuroxima, cefamandol
- Cefixima (orales)
Amplio espectro, en general mejoran su actividad sobre Gram aunque puede empeorar sobre Gram +. No alcanza a microorganismos
como Pseudomonas, ni otras bacterias nosocomiales. Son hidrolizadas por la cefalosporina cromosmica ampC. Pueden ser orales,
parenterales, etc.
Otros -lactmicos.
Carbapenemas.
Restringidas a uso hospitalario. La Tienamicina, de origen natural, es la carbapenema a partir de la cual se
han sintetizado nuevas derivadas de ella, pues este compuesto natural es inestable. El Imipenem y el Meropenem, son carbapenemas
de muy amplio espectro, que sirven para Gram +, Gram , aerobios y anaerobios, y Pseudomonas. Muy estables frente a todas las lactamasas, salvo a las carbapenemasas (muy raras). Se utilizan como reserva a infecciones que no respondan a otro tipo de
antibiticos.
Monobactamas.
El Aztreonam, solo activo frente a Gram -. Posee una cadena lateral en el anillo principal y se inactiva por lactamasas de espectro ampliado.
Carbacefemas, oxacefemas
Inhibidores de -lactamasas.
Los -lactmicos tienen poca toxicidad y gran variedad de aplicaciones pero son destruidos por las -lactamasas. Sin embargo, se han
desarrollado inhibidores de dichas enzimas como:
cido clavulnico: inhibidor suicida obtenido de Streptomyces clavuligerus, que sirve de sustrato a esta enzima impidiendo su accin
sobre los -lactmicos. La -lactamasa rompe el anillo del cido clavulnico y se queda secuestrada en este compuesto, de modo que
ya no puede actuar sobre el antibitico.
Sulbactama
Tazobactama
Se usan siempre asociados a -lactmicos de farmacocintica
similar.
Ampicilina/Clavulnico
Ticarcilina/Clavulnico frente a Pseudomonas.
Piperacilina/Tazobactama frente a Pseudomonas.
Cefoperazona/Sulbactama
Sin embargo, no todas las -lactamasas son sensibles a estos
inhibidores.
Glicopptidos.
Son compuestos polipeptdicos complejos de tamao muy voluminoso, por ello las Gram son resistentes de forma intrnseca a estos
antibiticos (a la vancomicina, por ejemplo), ya que no es capaz de penetrar por las porinas de la membrana externa.
La vancomicina, est producida por Actinomicetos (bacterias del suelo). La vancomicina es un compuesto en forma de copa.
La vancomincina, junto con la teicoplanina son dos de los glicopptidos ms representativos. Estos se unen al dipeptido de D-alanina
provocando una interferencia estrica que impide que se formen los puentes entre las cadenas de peptidoglicano (no se puede realizar
la transpeptidacin ni la transglicosilacin). Se usan contra cocos Gram + resistentes a penicilinas,
sobre todo frente a neumococos y estafilococos meticiln-resistentes (SARM).
-
Vancomicina
Teicoplanina
Avoparcina (usado en pienso): se prohibi para no crear resistencias de animales en humanos.
Telavancina (derivada de la primera, ms potente)
Dalbavomicina (derivada de teicoplanina).
Algunas de la especies de enterococos presentan resistencia a glicopptidos. La resistencia a glicopptidos esta mediada por genes
que se encuentran en transposones, que contienen las secuencias necesarias para codificar para precursores modificados de la D-ala.
As, cuando el precursor de la D-ala se encuentra en la pared del peptidoglicano, y sale a la zona externa, no es el dipptido D-ala el
que est unido a la cadena peptdica, sino un precursor de este. El glicopeptido entonces no encuentra diana con la que interaccionar.
En este caso, la transpeptidasa si es capaz de romper el residuo terminal del pentapptido y se puede producir la transpeptidacin y
transglicosidacin, manteniendo la integridad del PG.
Aminoglicosidos.
Familia de antibiticos que va a unirse a la subunidad 30 S del ribosoma de
forma irreversible por lo que tiene efecto bactericida. Se produce un bloqueo
del complejo de iniciacin donde el ARNm queda secuestrado, de modo que
no se sintetizan las protenas, pues se impide el inicio de la sntesis proteica,
por lo que si la protena que codificaba ese mRNA es fundamental para la
supervivencia del microorganismo, se produce la muerte bacteriana
A bajas concentraciones de aminoglicsido, an se sintetizan protenas
aunque de forma anmala. Se cree que son responsables de la lisis
bacteriana.
Antimicrobianos de amplio espectro excepto la espectinomicina, y actan
sobre Gram y ciertos Gram + (Staphylococcus). No son activos frente
anaerobios, estreptococos, neumococos ya que los aminoglicosidos entran al interior celular mediante transporte activo y estas bacterias tienen una
cadena de electrones que aporta poca energa, dificultando los mecanismos de transporte activo. Tampoco sobre bacterias intracelulares como
rickettsias y clamidias.
A diferencia de los -lactmicos, actan sobre microorganismos en crecimiento activo y sobre los que estn en fase estacionaria.
Se denominan as porque estn constituidos por dos aminoazcares unidos por un aminociclitol.
Aminoglicosidos
o Estreptomicina: activo frente al tuberculosis, frente a yersinia pestis y brucella (agentes etiolgicos de la fiebre de malta). Casi en desuso.
o Neomicitol o neomicina: uso tpico porque es toxica y dentro de las toxicidades son ototoxicos y nefrotoxicos. Va oral para la descontaminacin
intestinal ya que no se absorbe y puede matar a los microorganismos. Son todos de uso parenteral.
o Kanamicina (poco usado)
o Gentamicina: frente a gram + y combinado con -lactmicos (sinergismo)
o Tobramicina: frente a Pseudomonas
o Amikacina: activo frente a Gram , Mycobacterium tuberculosis y otras mycobacterias atpicas
Aminociclitoles:
- Espectinomicina: se empelaba en pacientes alrgicos a penicilina para tratar Neisseria gonorrhoeae, ahora est en desuso.
En general se emplean en infecciones grave. Tienen una toxicidad importante y aunque hay muchas bacterias sensibles a estos agentes, son txicos
para el rin y odo y la administracin suele ser en hospitales para controlar la funcionalidad renal y la capacidad auditiva. Su administracin es va
parenteral (no se absorbe por va oral)
Son tiles frente a enterobacterias y P. aeruginosa. Son sinrgicos con penicilinas empleados para Enteroccous y otras bacterias, como S. aureus,
Lysteria monocitogenes (enfermedades de transmisin alimentaria pero puede causar una infeccin asintomtica y puede llegar al embrin
produciendo aborto, enfermedades del recin nacido).
Resistencia a aminoglicosidos.
Expulsin del antibitico o disminucin de la penetracin: poco importante. Mutaciones que afectan el sistema de transporte de electrones
Produccin de enzimas modificantes: son importantes porque las enzimas modifican el antibitico introduciendo grupos qumicos, nucletidos,
grupos amino y de modo que modifican su mecanismo de accin, su afinidad por la diana y otros factores importantes. Dichas enzimas se adquieren
por plsmidos, los genes se encuentran en integrones y transposones, es decir, es transmisible horizontalmente.
Enzimas modificantes de los aminoglicsidos:
Tipos de enzimas:
- Acetilasas o acetil transferasas, AAC transfieren el NH2
AAC 6
AAC3 II (los nmeros romanos significan que inhiben varios antibiticos)
- Adenilasas o nucleotidil-transferasas: las enzimas ANT catalizan la unin de un nucletido del ATP y al OH
- Fosforilasas APH: fosfotransferasas transfieren un grupo fosfato y se unen a un -OH
La Kanamicina tiene varios zonas de la molcula que pueden ser modificadas; La Amikacina tiene un grupo grande y es ms resistentes porque
impide la entrada de enzimas.
Modificaciones de la diana: las dianas son los ribosomas por lo que estos se pueden alterar. Son mutaciones poco frecuentes y se altera la protena
S12 de la subunidad 30S (resistencia a estreptomicina)
Tetraciclinas.
Las tetraciclinas naturales no se emplean comnmente, pero s las semisintticas. Las
tetraciclinas actan sobre la subunidad ribosomal 30S, uniendose de forma reversible,
por lo que es bacteriosttico. Su mecanismo de accin se desencadena tras la
formacin del complejo de iniciacin, bloqueando la entrada de los nuevos aminoacil
tRNA y as la elongacin de la cadena peptdica.
Naturales: a partir de microorganismos del genero Streptomyces, hoy poco utilizadas
(Tetraciclina, oxitetraciclina, clortetraciclina)
Semisinteticas: son derivados con mayor actividad antimicrobiana.
- Doxiciclinas
- Minociclina: glicilciclinas, derivadas de modificaciones de la minociclina como la
tigeciclina.
Originalmente son de muy amplio espectro (Gram positivos y Gram negativos, aerobios y anaerobios, intracelulares, micoplasmas, micobacterias y
espiroquetas). Son molculas hidrofbicas, por lo que si entran las bacterias en el interior de clulas del hospedador, tambn lo hacen las
tetraciclinas que se emplean frente a Ricketssia y Chlamydia (intracelulares).
Las tetraciclinas tambien son activas frente a Mycoplasma, que no tiene pared y Mycobacterium (son AAR).
La tigeciclina adems es activa frente a bacterias resistentes a tetraciclinas. Se emplea para infecciones de piel y tejidos blandos, infecciones
intraabdominales complicadas.
Existe gran resistencia a las tetraciclinas, posiblemente debido a su extenso y prolongado uso, tanto en hombre como animales (se usaba con fines
de engorde). Por ello, se ha limitado su uso a casos concretos como:
- Bacterias intracelulares, clamidias y rickettsias
- Bacterias sin pared (Mycoplasma)
- Espiroquetas
- En casos severos en el acn
Reacciones adversas: no se pueden administrar en nios <4 aos, mujeres embarazadas
o lactantes porque se acumula en los huesos que estn creciendo dando lugar a
manifestaciones crnicas como los dientes sucios
Resistencia a tetraciclinas.
Bombas de expulsin o de eflujo, a travs de un sistema de transporte dependiente de la
energa. Tpicas de bacterias Gram + y -.
Modificacin de la diana: protena que se une al ribosoma, impidiendo la interaccin con el antibitico
En ambos casos los genes se han adquirido mediante plsmidos de resistencia
Cloranfenicol.
Es un antibitico natural producido por Streptomyces venezuelae, pero que se obtiene industrialmente por sntesis. Se trata de un antibitico de muy
amplio espectro, aunque de alta toxicidad para el hospedador (se utiliza poco debido a esto). Acta sobre bacterias Gram +, -, aerobias y anaerobias,
clamidias, rikettisas, Mycoplasma y espiroquetas.
Normalmente es bacteriosttico, aunque segn las bacterias sobre las que acte tambin puede ser bactericida (sobre S.pneumoniae, H.influenzae,
N.meningitidis).
Se ha abandonado su uso por su toxicidad en mdula sea y produce alteraciones hematolgicas graves y puede causar la muerte.
Adems, han aparecido muchas resistencias debidas a las enzimas codificadas por genes plasmdicos, acetilantes que producen el acetilcloranfenicol.
P. aeruginosa o E. coli tienen bombas de flujo al exterior y tienen formas de resistencia.
Est reservado para casos para fiebre tifoidea y meningitis especialmente justificados.
Macrlidos.
Inhiben tanto la transpeptidacin como la translocacin.
Reciben este nombre porque se constituyen por un anillo grande entre 14 y 22 tomos de C. Tienen actividad bacteriosttica (detiene el crecimiento
de las bacterias) a concentraciones elevadas y cuando estn activos. Pueden pasar al interior de clulas fagocticas, acumulandose en lisosomas, y
as pudiendo ejercer su accin frente a bacterias intracelulares. Pueden emplearse frente a Clamidias, rickettsias, mycoplamsa y espiroquetas.
El primero que fue descubierto fue la Eritromicina, de 14C y de amplio espectro. Uso: en bacterias Gram + como alternativa a las penicilinas en
personas alrgicas, ahora se utiliza de igual manera y adems frente a Legionella (Gram -), campylobacter, micoplasmas, clamidias, etc.
Es inestable en pH acido, se debe administrar en forma de sal.
Derivados de sntesis de la eritromicina son, la Claritromicina: 14C con espectro similar a la eritromicina pero algo ms activos sobre Gram -. Se
emplean para el tratamiento de infecciones respiratorias, de la piel y contra H. pylori (Gram -), Se combina con protectores estomacales.
La Azitromicina es otro derivado de 15C, de la subclase azalidas. Son ms activas sobre Gram -, menos sobre Gram +. Se emplean para el
tratamiento de ETS, tratamiento de infecciones respiratorias, de la piel (Chlamydia y N. gonorrhoeae)
Resistencia a macrlidos:
Modificaciones de la diana (subunidad 50S): metilacin de una de las molculas de ARN de la sub. grande del ribosoma. La metilacin provoca la
prdida de afinidad de todos los antibiticos de estos grupos, por lo que se da una resistencia cruzada a MLSB (macrolidos, licosamidas y
estreptograminas B). La metilasa est codificada por genes localizados en transposones, y es inducible por bajas concentraciones de antibiticos de
estos grupos.
Lincosamidas.
Son antibiticos con el mismo mecanismo de accin que el cloranfenicol (interfieren en la reaccin de tranaspeptidacin por unin reversible a la
peptidil-transferasa). Tienen accin bacteriosttica pero dependiendo del microorganismo, inculo o en altas dosis son bactericidas.
Amplio espectro, son efectivas frente a Gram + y Gram anaerobios. Es el caso de Bacteroides fragilis
- Lincomicida: producida por Streptomyces, muy poco utilizada actualmente
- Clindamicina: 7-clorolincomicina. Es muy eficaz contra anaerobios, infecciones abdominales, pulmonares y ginecolgicas, acn (tpica)
Efectos adversos: colitis pseudomembranosa por Clostridium difficile
Resistencia a Lincosamidas:
Modificaciones de la diana (subunidad 50S): metilacin de una de las molculas de ARN de la sub. grande del ribosoma. La metilacin provoca la
prdida de afinidad de todos los antibiticos de estos grupos, por lo que se da una resistencia cruzada a MLSB (macrolidos, licosamidas y
estreptograminas B). La metilasa est codificada por genes localizados en transposones, y es inducible por bajas concentraciones de antibiticos de
estos grupos.
Enzimas inactivantes de lincosamidas: se ha descrito una adenilasa o nucleotidil transferasa mediada por plsmidos, que incorpora un OH en la
posicin 4. Es importante en infecciones por anaerobios.
Estreptograminas.
Se unen a la subunidad grande, 50S del ribosoma. Son antibiticos naturales producidos por Streptomyces, son pptidos cclicos.
Grupo A: macrolactonas poliinsaturadas cclicas, inhiben la formacin del enlace peptdico
Grupo B: hexadespsipptidos cclicos, interfieren con la posicin correcta del peptidil-tRNA en el lugar P.
Son bacteriostticos aunque cuando se combinan son bactericidas. Activas sobre Gram +, Gram (menos) y anaerobios.
- Pristinamicina y virginamicina en desuso
- Quinupristina (grupo B), dalfopristina (grupo A) 30/70, sinrgicas y bactericidas
Indicaciones:
Infecciones graves por cocos Gram positivos resistentes a antibiticos: MRSA, S.aureus vancomicinaR, etc. (excepto Enterococcus faecalis).
Infecciones por algunos Gram negativos como Neisseria spp., Moraxella, Legionella, algunas cepas de H.influenzae.
Infecciones por anaerobios
Resistencia:
Modificacin de la diana: Resistencia cruzada MLSB por metilacin del RNA ribosmico 23S (grupo B)
Bombeo al exterior (grupo A) en Enterococcus
Inactivacin enzimtica por acetilasas plasmdicas (grupo A). Metilasa.
Antibiticos que se asocian a la subunidad 50S de los ribosomas, impidiendo el complejo de iniciacin al situarse en la interfase de ambas
subunidades, pequea 30S y grande 50S, de modo que impide en ensamblaje.
El mayor representante es Linezolid, cuyo mecanismo de accin est basado en impedir la unin de la subunidad 50S a la subunidad pequea.
- Activo frente estafilococos y enterococos (bacteriosttico)
- Activo frente a estreptococos (bactericida)
Indicaciones:
Tratamiento de infecciones por Enterococcus vancomicina
Tratamiento de neumona nosocomial por S.aureus (MRSA) o S.pneumoniae
Infecciones complicadas de piel por bacterias resistentes con MRSA, S.pyogenes o S.agalactiae
Resistencia por mutaciones en el gen que codifica para el rRNA 23S.
cido fusdico.
Antibitico natural obtenido del hongo Fusidium coccineum, estructura esterodica sin actividad hormonal ni antiinflamatoria.
La diana es el ribosoma acta tal que cuando se va a producir la translocacin, el movimiento no tiene lugar.
Acta sobre bacterias Gram + (en especial emplea por infecciones por S. aureus resistente a otros antibioticos). Y para desinfecciones
Resistencia cruzada con el cloranfenicol, se inhibe por la misma enzima (acetilasas).
En las bacterias existe otra topoisomerasa, la topoisomerasa IV que cataliza la separacin de las dos molculas hijas de DNA tas la
replicacin, permitiendo que se separen y migren a los polos de las clulas. Es decir, perimite que los dos cromosomas generados
lleguen a las clulas hijas.
Sobre ellas tambin actan las quinolonas, en este caso sobre el complejo DNA-topoisomerasa bloqueando el proceso de particin de
las molculas hijas del DNA, lo que conlleva la muerte celular. La topoisomerasa IV es la diana de las quinolonas en Gram +.
Quinolonas de 1 generacin espectro reducido.
- cido Nalidxico: es un compuesto de sntesis que acta solo sobre los bacilos Gram -. Espectro
reducido y mala farmacocintica, pues no llega a sangre en concentraciones suficientes. Solo
alcanza conc entraciones eficaces en orina, por lo que se utiliza como antisptico de las vas
urinarias (el desarrollo rpido de resistencias ha disminuido su uso)
- cido pipemdico: algo ms activo que el anterior.
Quinolonas de 2 generacin: 6-fluoroquinolonas amplio espectro.
Las 6-fluoroquinolonas son quinolonas a las que se le ha introducido en la posicin 6 un tomo de
flor, adems tienen en posicin 7 un anillo piperaznico. Son de amplio espectro y mucho ms
activas que las quinolonas de 1 generacin (100-1000veces ms): actan sobre bacilos y cocos
Gram y en menor grado sobre cocos Gram +. Son capaces de penetrar en macrfagos, por lo que
es utilizado para tratar la neumona atpica por Legionella, Mycoplasma, ClhamydiasTambin activo frente a P.aeruginosa)
- Norfloxacino: solo se usa en infecciones urinarias, pues las concentraciones plasmticas no son suficientes.
-Ciprofloxacino: usado en infecciones sistmicas, ya que las concentraciones plasmticas son eficaces.
- Ofloxacino: usado en infecciones sistmicas, ya que las concentraciones plasmticas son eficaces.
Quinolonas de 3 generacin espectro ampliado.
De 2-8 veces ms potentes que las de amplio espectoro de 2 generacin. Se diferencian en que
poseen un sustituyente pirrolidnico en 7. Adems, son ms activas sobre cocos Gram + como S.
aureus y S. pneumoniae.
- 8-metoxi-6-fluoroquinolona: Gatifloxacino, Levofloxacino
Quinolonas de 4 generacin espectro ampliado.
8-metoxiquinolonas y otras que presentan actividad frente a anaerobios, como el Moxifloxacino
(grupo grande diazabicclico en posicin 7) .
Resistencia a quinolonas.
Las quinolonas tienen pocos efectos adversos y se administran por va oral. Por ello, su amplia utilizacin ha provocado el desarrollo de
cepas resistentes. Actualmente, se han reducido las posibilidades, no solo por el uso descontrolado en tratamientos, sino por su uso en
animales de granja (crendose cepas resistentes de microorganismos del intestino de animales como Salmonella, Campylobacter)
No recomendado su uso en mujeres embarazadas, lactantes y nios: puede generar dao permanente en el cartlago y en el
crecimiento.
Mutaciones que afectan a las topoisomerasas.
Pierden la afinidad por el frmaco de forma progresiva, al acumular mutaciones en los genes que codifican para estas enzimas.
La resistencia es cruzada
Recientemente se ha descrito un plsmido conjugativo que codifica para protenas que protegen a la DNA-girasa, compitiendo con la
quinolina en su unin a la enzima (Klebsiela, Shigella)
Descenso en la entrada de quinolonas.
Por cambios en las porinas: disminucin de la permeabilidad
Por presencia de sistemas de expulsin o bombeo activos (Gram + y Gram -) Aparece con mucha facilidad en las quinolonas no
fluoradas, lo que ha hecho abandonar su uso.
Produccin de la enzima acetilante o inactivante.
Antimetabolitos.
Sulfamidas
Antibiticos bacteriostticos que inhiben la sntesis de bases pricas y pirimidnicas y con
ello la sntesis de cidos nucleicos.
Esto es debido a que las sulfamidas son muy parecidas estructuralmente a metabolitos que
participan en la va de sntesis del cido flico (cofactor en la sntesis de bases pricas y
pirimidnicas). Al interrumpir dicha va biosinttica, se frena la sntesis de a.n. Inhiben la
sntesis de las bases puricas y pirimidinicas, y con ello la sntesis de cidos nucleicos.
La sulfamida es muy semejante al cido paraminobenzoico (PABA). La enzima
dihidropteroato sintetasa acta entonces sobre la sulfamida y no se forma el cido
dihidropteroico, precursor del cido dihidroflico que a su vez dar lugar, tras varias etapas,
al cido flico. Es decir, se trata de un mecanismo de inhibicin competitiva por la enzima
de la ruta biosinttica.
Son frmacos de amplio espectro, pues se aplican frente a Gram +, Gram -, Nocardio y
Chlamydia, pero han cado en desuso debido a la aparicin de resistencias en estrptococos,
estafilococos, enterobacterias y Pseudomonas. Actualmente, casi no se utilizan.
Sin embargo, si se utilizan en el caso de asociacin con Trimetoprim. Bien es conocida la
asociacin de Trimetoprim-sulfametoxazol (que es una sulfamida). Ambos antibiticos
asociados dan lugar a una accin sinrgica, y juntos son bactericidas. Esto se debe a que el
Trimetoprim es anlogo etructural del cido dihidroflico, por lo que compite con otra de las
enzimas de la ruta (dihidrofolato reductasa), de modo que el cido dihidroflico no pasa a
cido tetrahidroflico. Como ambos antibiticos realizan una inhibicin competitiva en etapas
de la va de biosntesis, al juntarse ocurre un efecto sinrcico. Trimetoprim:Sulfametoxazol
(1:5) = Cotrimoxazol.
La resistencia a esta combinacin ocurre por la aparicin de una nueva enzima
dihidropteroado sintetasa y dihidrofolato reductasa.
El cotrimoxazol tiene toxicidad selectiva. Nosotros incorporamos el cido flico de la dieta,
por lo que no existe ruta de sntesis que inhibir (algunas bacterias tambin lo obtienen del
exterior y por tanto, no actan estos antibiticos frente a ellos). Tambin las bacterias pueden
obtener las bases pricas y pirimidnicas de tejido necrtico (en ciertas infecciones donde se
liberan las bases), sin necesidad de realizar la ruta, por lo que resistiran a los antibiticos.
Tratamiento de la tuberculosis: Ac. PAS (para-amino-saliclico) (uso en TB multirresistentes, como segunda eleccin)
Tratamiento lepra: Dapsona
Nitrofurantoina.
Antisptico de las vas urinarias. Bacteriosttico.
Su mecanismo de accin es poco conocido, sabiendo que produce lesiones en el DNA, inactiva o altera protenas ribosmicas u otras
molculas.
Requiere una activacin por el microorganismo: las formas activas son productos de su reduccin (necesaria la enzima
nitrorreductasa)
Espectro: bacilos Gram excepto Pseudomonas, y cocos Gram +.
Las resistencias son poco frecuente y solo se dan si disminuye la actividad de la nitrorreductasa
Indicaciones:
No recomendada en casos donde la bacterias es Proteus: da lugar a orina alcalina, pues posee catalasa que interacciona con la
nitrofurantoina.
Infecciones urinarias causadas por bacilos Gram y cocos Gram + (P.aeruginosa resistente)
Metronidazol.
Activo contra bacterias anaerobias: bactericida
Inhibe el transporte de electrones y desestabiliza la doble hlice, finalmente rompiendo el DNA
Requiere activacin por el microorganismo: las formas activas son sus productos de reduccin. Se necesita nitrorreductasa (rutas
metablicas con bajo potencial redox)
Resistencia por la menor captacin de antibitico o menores niveles de la enzima (nitrorreductasa)
Indicaciones:
Infecciones intraabdominales (tambin en profilaxis de ciruga abdominal) y en colitis pseudomembranosa (C.difficile)
Infecciones de piel y estructuras
Infecciones ginecolgicas por anaerobios, vaginosis, etc
Septicemia
Meningitis y abscesos cerebrales por anaerobios.
Erradicacin de Helicobacter pylori (asociado a otros frmacos)
La pared fngica posee distintos componentes como quitina, glucanos, mananos y ciertas glucoproteinas no presentes en las culas
eucariotas humanas. La quitina, es un polisacrido constituido por subunidades de NAcG. Los antibiticos que inhiben la sntesis de
quitina, a su vez producirn alteraciones estructurales de la pared celular.
- Inhibidores de la sntesis de quitina: Nikkomicinas, polioxinas
- Inhibicin de la sntesis del 1,3--glucano que constituye ms del 50% de la pared:
equinocandinas (caspofungina) y pneumocandinas
- Alterantes del manano: pradimicinas
Otros:
- Inhibicin de la sntesis de cidos nucleicos: 5-flurocitosina
- Impiden la formacin de los microtbulos: griseofulvina
Dichos compuestos no se unen al ergosterol, sino que interrumpen su sntesis. Su mecanismo de accin de se basa en la inhibicin de
la enzima que transforma el Lanosterol (producto intermedio de la ruta de sntesis), de modo que impedirn la sntesis final de
ergosterol. Adems, su efecto acumulativo es txico.
- Constituyen el grupo ms importante de antifngicos.
- Anillo azlico con dos tomos de nitrgeno (imidazoles) o tres (triazoles).
- Inhiben la enzima -1,4-desmetilasa, dependiente del citocromo P450. Esta enzima es la encargada de la transformacin de
Lanosterol, y por ello impiden la sntesis de ergosterol.
- Fungistticos, no fungicidas.
- Amplio espectro de accin.
- Uso en micosis sistmicas
- Toxicidad heptica y renal
- Resistencias
Imidazoles.
La mayora se usan por va tpica, siendo los ms caractersticos:
Miconzol: va sistmica, casi no se usa
Ketoconazol: uno de los ms utilizados para la infeccion por Candida y dermatofitos (uas, pelo, piel). No alcanza el LCR (oral y
tpico)
Clotrimazol: infecciones mucocutaneas por Candida albicans y por hongos. Uso exclusivamente tpico.
Triazoles de primera generacin.
- Gran avance en el tratamiento de infecciones fngicas
- Amplio espectro de accin (levaduras y hongos filamentosos)
Fluconazol: parecido al Ketoconazol, pero con capacidad para penetrar en el lquido cefalorraqudeo por lo que se usa en
Criptococosis (tipo de meningitis transmitida por heces de palomas). Administracin oral e intravenosa. No activo frente Aspergillus.
Itraconazol: mala penetracin en el LCR pero si embargo, activo frente a Aspergillus. Slo administracin oral.
Triazoles de segunda generacin.
- Mucho ms potentes que los anteriores
- Amplio espectro
- Se distribuyen ampliamente en tejidos y LCR
- Menor toxicidad
Voriconazol: recomendado en aspergilosis invasivas y Candida albicans resistente a fluconazol. Va oral e intravenosa.
Posaconazol: solo va oral
Existen compuestos que dan lugar a sinergismo en combinacin con los azoles.
Grupo de antifngicos de estructura compleja (lipopptidos, semisintticos). Los ms usados o conocidos son la Caspofungina
(procedente de Glarea lozoyensis o mediante semisnteiss), micafungina y anidulafungina.
Inhiben la actividad de la -1,3-D-glucano-sintetasa que cataliza la polimerizacin de UDP-glucosa, en el -1,3-D-glucano, componente
esencial en la estructura de la pared fngica, constituyendo casi un 50% de la misma. De esta manera, la pared pierde estabilidad y se
deteriora, por lo que sin la pared fngica, es posible que ocurra la lisis celular.
Indicaciones:
- Micafungina y anidulafungina: Infecciones por Candida, siendo la primera menos txica.
- Caspofungina: Aspergilosis invasiva resistente a anfotericina B o a itraconazol. Tambin se utiliza para candidiasis invasiva grave.
Las equinocandinas se administran va intravenosa
Mecanismos de resistencia.
Incapacidad del frmaco para alcanzar la diana dentro de la clula: barreras de permeabilidad o sistemas de bombeo activo.
Cambios en la interaccin frmaco-diana: aumento del nmero de copias de la diana y modificaciones de la diana (mutaciones
puntuales). Tambien puede deberse a cambios en la concentracin intracelular del antibitico, por la sobreexpresin de mecanismos de
resistencia como las bombas de expulsin de azoles: cuando los azoles penetran se inhibe la
ergosterolasa y por tanto la ruta sinttica del ergosterol; no hay salida del antifngico, la enzima
esta inhibida y el hongo es sensible. En una clula resistente a azoles, estos penetran y se
encuentran con una enzima modificada y sobreexpresada sobre la que no tienen afinidad. Los
azoles adems son expulsados porque las bombas estn sobreexpresadas (CDRs y MDRs),
ppor lo que disminuye la concentracion intracelular de antibitico.
Modificaciones de enzimas de las rutas metablicas. Cambios en la diana: mutaciones
puntuales o que causen sobreexpresin.
Alteraciones del procesamiento intracelular: cambios en la concentracin por degradacin o
modificacin del antifngico.
Inhibicin de etapas: esenciales para la multiplicacin vrica en las que no interviene el metabolismo de la clula
hospedadora, de espectro restringido
- Inhibicin de la replicacin: tienen toxicidad, se ataca a las enzimas vricas o fcos activados por enzimas vricas
- El interferon es de amplio espectro porque puede salir de las clulas y producir un estado de restriccin o
resistencia a las clulas.
Dependiendo de qu tipo de clulas afecten, el tipo de virus, el espectro es ms amplio
La resistencia se produce por modificacin de la diana por mutacin.
1. Existen algunos cidos neutralizantes, monoclonales frente a protenas de exclusin o el tejido sinttico para evitar la
fijacin y
Amantadina o Rimantadina: antivirales de espectro muy reducido que solo actan frente al virus de la gripe A, encargndose de inhibir
la perdida de envoltura. Inhiben la fase de decapsidacion mediante el bloqueo de la protena M2 (protena que forma un poro en la
cpsida, permitiendo la entrada de protones al interior y desencadenando la decapsidacin).
Es til en la prevencin y tratamiento (la mejora es mnima), pero sobre todo en la profilaxis.
Utilizacin prctica muy reducida (no actan sobre el tipo B, resistencias, efectos secundarios adversos como nerviosismo e insomnio)
4. Transcripcin del genoma vrico.
Los llamados oligonuceotidos sin sentido, como el Fomivirsen, son secuencias oligomricas cortas complementarias a las secuencias
especficas del genoma vrico. Inhiben especficamente la replicacin de Cytomegalovirus, y son tiles para el tratamiento de
coriorretinitis por CMV, en inmunodeprimidos y en enfermos de SIDA.
Suministro de inyeccin intravtrae.
4. Inhibicin de la replicacin de los cidos nucleicos.
Cidofovir, adefovir
Anlogos de los pirofosfatos como el Foscarnet, inhibidor no competitivode la DNA-polimerasa vrica y de la retrotranscriptasa. Se
administra por va intravenosa y acta frente a Herpesvirus, virus de la hepatitis B y VIH-1.
Agentes antirretrovricos como:
- Inhibidores de la transcriptasa inversa anlogos de los nuclesidos: Zidovudina (AZT), didanosina (DDL), lamivudina.
- Inhibidores de la RT no nuclesidos pero s anlogos de los nucletidos: Nevirapina, efavirenz.
- Inhibidores de la proteasa: Indinavir y ritonavir. Las protesas rompen las poliproteinas que formaran parte de la cpsida del virus para
que ests se acoplen de forma correcta. Cuando las proteasas se inhiben, las poliprotenas no son cortadas y las cpsulas no maduran.
- HAART (terapia antirretroviral altamente activa): rgimen que incluye normalmente dos inhibidores de la transcriptasa inversa
anlogos de nuclesidos, y un inhibidor de la proteasa. Se emplean combinaciones de antivirales y ha servido para que disminuya la
mortalidad por VIH en los pases desarrollados.
5. Bloqueo de la salida de los virus.
Estos antivirales impiden la salida del virus de la clula hospedadora, de modo que aumentan su agregacin en la misma pero
disminuyen su dispersin por otras clulas del organismo.
Zanamivir (aerosol inhalado) y Oseltamivir son antivricos anlogos del cido silico. Los virus, para su salida de la clula, requieren de
la neuraminidasa, la cual interacta con los restos de cido silico para ayudarles a salir. Estos, al ser anlogos del cido silico, se
unen a la neuraminidasa y no dejan que se libere el virus, formndose acmulos de este y no diseminndose.
Son tiles sobre todo en la prevencin, pues no son curativos.
Los interferones son protenas (citoquinas) sintetizadas en las clulas eucariotas en respuesta a una variedad de estmulos entre los
que destacan las infecciones vricas. INF INF INF.
No tienen una accin antivrica directa, pero inducen en la clula hospedadora la sntesis de protenas antivricas, con lo que se inhibe
la replicacin vrica. Hacen que las clulas cercanas a las invadidas se hagan resistentes, ya que por sus mecanismos de
inmunomodulacion inducen la sntesis de protenas antivricas. Tambin tienen un efecto antiproliferativo.
Se ha obtenido el interfern alfa por tecnologa de DNA recombinante.
Actualmente, existen interferoes pegilados: unin de PEG a INF para mejorar su farmacocintica (retrasar su eliminacin, prolongar su
actividad y mejorar su rendimiento).
Los interferones (tanto solos como combinados con PEG) se han utilizado para el tratamiento de enfermedades como la hepatitis B y C.
Tambin en el tratamiento de condiloma acuminado y sarcoma de Kaposi.
Vaginal.
Lactobacillus la disminucin en la poblacin da lugar a enfermedades, pues no compite con la microbiota patgena.
Peptostreptococcus: coco gram + anaerobio
Gardnerella vaginalis: si se descompensa su crecimiento genera vaginosis.
Candida: hongo dimrfico
Uretra.
Staphylococcus gram +, coagulasa Streptococcus gram +
Estmago.
10 UFC/ml aislados en el estmago. Se trata de un nmero de microorganismos reducido que soportan el pH cido. Lactobacillus,
Peptostreptococcus, Staphylococcus , Streptococcus
Microbioma.
El proyecto microbioma humano busca encontrar a partir de un estudio metagenomico de muestras de nuestro intestino, la
secuenciacin de los genomas presentes con objeto de saber que microorganismos nos estn colonizando.
As pues, se compara la secuencia gentica obtenida en individuos enfermos (o susceptibilidad a la enfermedad), obesos, con
peculiaridades en la digestin de los alimentos o la sntesis de vitaminas: as se puede establecer la funcin de la microbiota normal en
comparacin con otras circunstancias orgnicas.
Se han descubierto rutas metablicas en las que participan genes no humanos, aunque con funciones enzimticas aun desconocidas.
Esto lleva a pensar que la microbiota, no es posee solamente una relacin de comensalismo, sino ms bien, un mutualismo, beneficioso
tanto para el hospedador como para los microorganismos.
Postulados de Koch.
Conjunto de criterios para demostrar la etiologa de enfermedades infecciosas (demostrado en la tuberculosis debida a Mycobacterium
tuberculosis y en el carbunco por Bacillus anthrax).
Koch estableci los postulados de Koch: actualmente existen algunas variaciones en cuanto a la metodologa pero no para el
razonamiento o los conceptos, que son aun vlidos. Permiten demostrar que un microorganismo es el agente etiolgico:
1. El microorganismo patgeno debe estar presente en todos los casos de la enfermedad y ausente en todos los individuos sanos.
Excepciones: patgenos oportunistas.
2. El microorganismos debe aislarse en cultivo puro e identificarse: actualmente lo primero supone una dificultad. Excepcin:
microorganismos no cultivables o infeccin polimicrobiana (Treponema pallidum: sfilis)
3. Reinoculacin en animales que estn sanos y enfermen con los mismos sntomas. Este cultivo puro anterior, inoculado en individuos
sanos, debe producir la enfermedad. Excepciones: ausencia de modelo animal y microorganismos capaces de producir distintas
enfermedades.
4. El mismo microorganismo debe poder ser aislado en cultivo puro a partir del animal enfermo. Reaislamiento en cultivo puro.
Inmunidad innata.
Piel.
La piel es una barrera principalmente fsica, aunque tambin qumica, de entrada a los microorganismos, por lo que forma parte de la
inmunidad innata. Poseemos de 1,5-2 m2 de piel. Los microorganismos acceden por la piel mediante heridas, quemaduras, vectores
naturales (artrpodos) o artificiales (jeringuillas) Las zonas ms susceptibles de actuar como va de entrada, por ser un contacto con
el exterior, y de lugar de residencia de los microorganismos son la glndula sebcea, las glndulas sudorparas y los folculos pilosos.
En la piel, existen defensas inespecficas como cidos grasos secretados por las glndulas sebceas (que disminuyen el pH hasta 4-5)
o la presencia de lisozimas y la elevada salinidad (gracias a las glndulas sudorparas), lo que puede suponer una dificultad para los
microorganismos. Adems, la piel est conformada por varias capas gruesas de queratinocitos (clulas tpicas de la epidermis) que
producen citocinas (ILs, TNF), por lo que es una barrera difcil de superar en condiciones saludables. Adems existe el tejido linfoide
asociado a la piel (SALT) que da lugar a clulas de Langerhans y linfocitos intraepidermicos (T). Tambin en la piel existe una
microbiota de microorganismos gram + que compite con los posibles patgenos.
En las capas ms profundas de la piel, existen adems de defensas inmunitarias inespecficas, otras ms especficas como son los
macrfagos y los linfocitos T presentes en la dermis.
Mucosas.
Se trata de una gran superficie repartida en distintas
estructuras de nuestro cuerpo, como la vagina, nariz, boca,
etc. Se trata de una monocapa de clulas mucosas que
secretan moco, y que puede ser algo ms penetrable que la
piel (300m2). Sin embargo, el moco que secretan, junto con
lisozimas (actividad degradativa del peptidoglicano),
lactoferina (secuestra Fe2+ fundamental para la multiplicacin de microorganismos) y lactoperoxidasa (libera radicales reactivos de
oxgeno) suponen una defensa frente a los microorganismos.
Las mucosas, poseen unas defensas intrnsecas debido a las estructuras que las conforman. Las clulas de Paneth son las
encargadas de secretar lisozima y criptina. En los alveolos, existen macrfagos alveolares que combaten a agentes extraos. El pH
cido de la urea y la vagina conforma un ambiente hostil para los microorganismos. La lgrima y la mucosa conjuntiva poseen lisozima,
lactoferina e IgA.
Las defensas inmunitarias que encontramos a este nivel son:
- MALT (tejido linfoide asociado a mucosas) que corresponde a los folculos linfoides (a nivel intestinal las placas de Peyer y en la
faringe las amgdalas).
- Clulas M: transportan patgenos al interior de las mucosas, donde son fagocitados por macrfagos y son presentados mediante
clulas dendrticas o clulas presentadoras de antgeno a los LT y LB del folculo linfoide (respuesta de inmunidad adaptativa o
especfica).
- En la zona submucosa y en el tejido linfoide encontramos macrfagos, linfocitos intraepiteliales Tc, linfocitos TH y linfocitos B. Estos
ltimos se diferencian en clulas plasmticas que secretan IgA a nivel de las mucosas (posteriormente pueden diferenciarse en clulas
de memoria). La IgA en el lumen de la mucosa es capaz de bloquear toxinas y dificultar la adherencia de los microorganismos.
Mecanismos inespecficos.
Fagocitosis.
La fagocitosis es un proceso llevado a cabo por clulas del sistema inmunitario encargadas de mediar la entrada del microorganismo en
las mismas, con el fin de poder destruirlo y posteriormente presentar los antgenos a clulas especficas del sistema inmunitario. Las
clulas fagocticas son, fundamentalmente, los macrfagos, las clulas dendrticas y los neutrfilos, siendo las dos primeras las
capaces de actuar como clulas presentadoras de antgenos (CPA).
Para que la fagocitosis sea posible, las clulas fagocticas deben reconocer la presencia de un agente extrao, un microorganismo
extracelular. Esto es posible debido a los antgenos del patgeno. Los receptores PRR (reconocimiento del patrn) reconocen
secuencias que estn presentes en la mayora de microorganismos. Sin embargo, estos receptores PRR estn constituidos por una
serie de receptores, siendo la familia de los receptores TOLL (TLR) la ms estudiada: estos reconocen especficamente a PAMS
(patrones moleculares asociados a patgenos) como pueden ser estructuras de superficie caracterstica y especficas (LPS de gram -,
PG de gram +, flagelina, cido lipoteicoico, ssRNA vrico, dsRNA vrico, glucano fngico). Los receptores Toll median unas uniones
concretas con dichos PAMS, gracias a las cuales comienza la fagocitosis. Se trata de interacciones hidrofbicas (por ejemplo el
receptor RGD para el motivo RGD Arg-Gly, Aps de una protena bacteriana o la del receptor de carbohidratos que se une a la lectina
flagelar).
Gracias a esta unin comienza la fagocitosis, formndose primero el fagosoma, tratndose de una envoltura lipdica formada por la
invaginacin de la propia membrana celular, endocitando as al agente extrao. Posteriormente este fagosoma se fusiona con un
lisosoma, en cuyo interior existen sustancias degradativas: este fagolisosoma formado se encarga de la destruccin del patgeno
mediante la liberacin de estos grnulos. Posteriormente, la clula fagoctica se encarga de presentar al antgeno sobre molculas de
tipo II del complejo mayor de histocompatibilidad (CMH).
Sin embargo, los microorganismos pueden intentar evadir la fagocitosis: por ejemplo, Candida albicans en un hongo dimorfico que
cambia de levadura a hifa en el proceso de infeccin para no ser fcilmente fagocitado.
Natural Killer.
Las clulas NK son clulas que poseen receptores para la regin constante FC de los anticuerpos, que estarn dispuestos sobre
antgenos extraos. Se trata de una toxicidad celular mediada por anticuerpos.
Pero adems, las natural killer son clulas que matan indiscriminadamente a todas las clulas que no presente molculas de clase I del
CMH, que normalmente son presentadas por todas las clulas propias. Sin embargo, no se expresan en aquellas que han sido
infectadas por virus. En este caso no se libera la seal inhibidora de las NK, de modo que ellas secretan sobre estas clulas porfirinas y
granzimas que estimulan la apoptosis celular por desequilibrio inico. Esta clula es fagocitada antes de morir para evitar la liberacin
de posibles viriones ya formados.
Sistema del complemento.
Activacin del complemento mediante distintas vas que finalmente confluyen en la activacin de la C3 convertasa.
- Va clsica: La interaccin antgeno-anticuerpo o la formacin del complejo inmunitario Ag-Ac es uno de los desencadenantes del
sistema del complemento.
- La va alternativa comienza sin existencia de anticuerpos, sino que el complemento reconoce estructuras repetidas de polisacridos de
bacterias sin necesidad de que aun hayan sido reconocidas por los Ac.
- Va de la lectina: se une a la superficie del patgeno si existen manosas reconocidas por la protena de unin a manosa (es una
protena de fase agua)
Esto desencadena una cascada de seales cuya consecuencia final es la formacin del MAC (se forma un complejo sobre la clula
extraa, provocando poros en la misma y finalmente la lisis, sobre todo en Gram y virus envueltos (poco efectivo en gram + debido a
la gran pared)), la induccin de la inflamacin y la opsonizacin.
Respuesta inflamatoria.
La respuesta inflamatoria es un proceso mediado por compuestos qumicos inflamatorios, que provocan un aumento de flujo sanguneo
y dilatacin capilar, adems de quimiotaxis (migracin de neutrfilos y otros leucocitos) al foco inflamatorio, adhesin al endotelio y
finalmente diapdesis al lugar daado.
Interfern.
Las clulas infectadas por virus secretan interferones que poseen una accin antivrica y son reconocidos por receptores de clulas
vecinas de modo que estas:
- Bloquean la traduccin
- Activan mecanismos de destruccin del material gentico vrico.
CPA con Ag
sobre
MHC-II
Hay que tener claro que un nico antgeno puede presentar diferentes eptopos o determinantes antignicos.
LB, actuan
como clulas
presentadoras
y adems
estimulan a TH2
Anticuerpos
Los superantgenos provocan la activacin inespecfica de muchos linfocitos y clones (30%), debido a la modificacin de la presentacin
sobre las MCH-II, producindose un colapso celular y prdida de gran parte de la poblacin de clulas inmunitarias.
Ej: enterotoxina de S.aureus (toxina del sndrome del shock txico TSST-1)
2. Autoinmunidad.
Se trata de un mimetismo antignico por el cual se adquiere una tolerancia al patgeno o bien ataque al patgeno y a las clulas
propias, provocando como consecuencia fiebres reumticas. Ocurre porque el patgeno presenta antgenos similares a molculas del
propio organismo.
Ej: S.pyogenes.
3. Inmunosupresin.
Disminucin de la poblacin de linfocitos y por tanto de la respuesta mediada por los mismos y de la produccin de anticuerpos, lo que
permite al microorganismo superar el equilibrio establecido entre patgeno-hospedador.
Ej: HIV (infeccin de linfocitos), sarampin y lepra
4. Hipersensibilidad tipo III.
Un exceso de antgeno y formacin a nivel renal de gran cantidad de inmunocomplejos Ag-Ac, los cuales no pueden ser filtrados y
comienzan a activar el complemento y otras acciones, dando lugar a dao endotelial de las propias estructuras (pueden causar
glomerulonefritis e incluso insuficiencia renal).
Ej: S. pyogenes VHB.
5. Hipersensibilidad tipo IV.
Activacin constante de linfocitos T y macrfagos, de modo que se produce una respuesta crnica o retardada, mediada por clulas,
que produce dao en el tejido epitelial el cual es sustituido por tejido conjuntivo. Tpica de infecciones crnicas de microorganismos
intracelulares, como la causada por Mycobacterium tuberculosis. Se forman granulomas en el tejido pulmonar al intentar aislar la zona
infectada mediante tejido conectivo formado alrededor del patgeno, que hace que aumente el nmero de linfocitos, provocando dao a
hospedador.
Ej: Mycobacterium (granulomas)
Adhesinas.
Especificidad respecto a la clula a la que se va a adherir el patgeno debido a la presencia de receptores de superficie para dichas
adhesinas.
Las fimbrias o pili son apendices largos y delgados, formadas por subunidades proteicas, queposeen una molcula terminal lectina
que acta como ligando unindose a receptores especficos (receptores de carbohidratos como glicolipidos, glicoprotenas o
glicopolisacridos).
Neisseria: dos microorganismos del mismo gnero, gonococo y meningococo, poseen un tejido de adhesin distinto debido a la
diferencia molecular de la fimbria (mucosa genital o glosofarngea).
E. Coli: se une al epitelio urinario gracias a las fimbrias aunque es capaz de unirse tambin a los capilares sanguneos en los plexos
coroideos (venosos cerebrales, causando meningitis)
Fimbrias TCP de Vibrio cholerae: L-fructosa
Protenas de superficie: Bordetella pertusis (pertactina), Treponema pallidum (protena F)
cidos teicoicos: Staphylococcus aureus (LTA)
Exopolisacridos.
Tambin son molculas de superficie que median la adhesin.
La cpsula (polisacrido): media una adhesin inespecfica a las clulas y favorece la evasin de la respuesta inmune al disminuir la
hidrofobicidad, pues el contacto con los fagocitos es a travs de uniones hidrofbicas.
S. pneumoniae: coco gram +
N. meningitidis: coco gram H. influenzae: cocobacilo
Otro tipo de polisacaridos son aquellos que participan en la sntesis de ezimas extracelulares glicosil-transferasas y en la formacin de
biofilmes, que pueden ser polimeros de glucosa, fructosa y manosa.
Relacin importante en la formacin de biofilmes, pues los diferentes polmeros azucarados de la cpsula favorecen la estabilidad del
mismo. Streptococcus mutans pose mutano, polmero derivado de la glucosa que permite la inclusin microbiana. Formacion de placa
dental y el desarrollo de caries.
P. aeruginosa posee alginatos que ocusasionan complicaciones en la fibrosis qustica.
Toxinas.
Componente microbiano que produce efectos txicos en el hospedador. Las toxinas ocasionan dao tisular o alteracin de las funciones
fisiolgicas. Podemos diferenciar entre endotoxinas y exotoxinas (segn se secreten o no al exterior celular), en funcin de su liberacin
tras la lisis (por macrfagos) o si se liberan de forma constante por el metabolismo.
Los efectores traslocados se consideran un tipo de toxinas.
- Toxigeneicidad: capacidad de producir toxinas.
- Toxemia: presencia de la toxina en la sangre del hospedador.
- Toxoide: toxina inactivada utilizada en vacunacin mediante agentes qumicos o t, mantiene la capacidad antignica pero no es
txica.
- Antitoxina: anticuerpo neutralizante frente a una toxina especifica
Endotoxina: el lpido A tpico de bacterias gram pues es un componente del LPS de elevada termoestabilidad. Es poco
inmunognico y no sirve para disear toxoides, pues la DL50 en un tiempo determinado es relativamente alta (poco txico).
El lpido A estimula la actividad de los macrfagos que liberan IL-1 y TNF dando lugar a fiebre. En este caso se considera una
endotoxina favorable o positiva, ya que en pequeas cantidades el ocasionar fiebre es beneficioso para combatir la infeccin. Sin
embargo, la multiplicacin excesiva del microorganismo a nivel
del
torrente sanguneo, y la presencia de lipA en este medio puede
causar un choche sptico (N. meningitidis y H.influenze:
causando inflamacin, lesiones en el endotelio, vasodilatacin
excesiva..)
Otros componentes bacterianos que tambin se comportan
como endotoxinas, estimulando la liberacin de IL-1 y TNF:
lipoprotenas de las espiroquetas y fragmentos de
peptidoglicano de G+,G- y micobacterias.
La clula pierde el equilibrio osmtico cuando se crean estos poros. Estos son creados por las citolisinas o toxinas citolticas,
cuyo mecanismo de accin consiste en:
- Realizar un poro fsico al insertarse en la membrana, asocindose con el colesterol de la clula eucariota .
Estroptolisina O (S.pyogenes)
Listeriolisina O (L.monocytogenes)
- Fosfolipasas, de modo que se hidrolizan los fosfolpidos de membrana y desorganizan la estructura de esta (fosfolipasas con
diferentes afinidades por fosfoglicina, esfingomielina, etc).
L.monocytogenes posee gran capacidad membranoltica, pues codifica para dos lipasas (PlcA y PlcB)
-toxina de C. perfringes.
Estas toxinas muchas veces se comportan como hemolisinas (lisan a eritrocitos y son fciles de detecta en medio agar-sangre).
Algunas son leucocidinas, desorganizando la membrana de los leucocitos.
3. Toxinas A/B de dos componentes: uno de adhesin y otro de actividad enzimtica.
La subunidad A posee actividad enzimtica y debe ser incorporada al citoplasma de la clula eucariota, donde comienza su
actividad txica o bioqumica. Adems puede poseer varias o una subunidad B, que reconoce a los receptores especficos de la
clula diana mediando la unin a las mismas (no se sabe si el mecanismo es va endoctica o mediante poros).
ADP ribosilacion de la protena G: aumento de
actividad adenilato ciclasa y aumento de AMPc en el
interior, dando lugar a un cuadro disentrico (diarrea
acuosa, en el caso de Shiga). Bordetella pertuis,
Vibrio cholerae, E.Coli, Shigella dysenteriae
ADP-ribosil-transferasa: del factor de elonfacion de
la traduccin a nivel del ribosoma (EF-2), impidiendo
la sntesis de protenas (inhibiion de la sntesis
proteca) lo que conlleva la muerte celular.
Neurotoxinas tetnica o botulnica: actividad
endopeptidasa dependiente de Zn. Inhiben el
transporte de vesculas que contienen
neurotransmisores: la toxina tetnica inhibe la seal
inhibidora de sinapsis (parlisis rgida) y la botulnica inhibe la seal de sinapsis activadora o excitadora de la placa central
(parlisis flcida).
Sistemas para traslocar efectores, es decir, factores de virulencia que son inyectados directamente en la clula eucariota
(inyectisoma). Se trata de protenas que afectan a las rutas de transmisin de seales, de modo que dirigen la clula
- YopH paraliza a los macrfagos antes de que puedan fagocitar
- Polimerizacin de actina y capacidad de fagocitar cuando normalmente no pueden: induccin de la fagocitosis).
- Capacidad de polarizar el citoesqueleto yopE
- Yersinia, Salmonella y Shigella utilizan los filamentos de actina como sistema de propulsin, de modo que pueden pasar de una
clula a otra sin contacto intercelular con factores inmunes (evasin del sistema inmune).
- Mediador de apoptosis yopP
Las exotoxinas estn relacionadas con la conversin lisognica,
pues muchos fagos lisognicos codifican para este tipo de toxinas.
Mismas cepas de una misma especie pueden presentar
caractersticas distintas segn su lisogenia o no, poseyendo
diferente capacidad fenotpica. Las exotoxinas, adems, pueden
estar presentes en plsmidos (elementos extracromosmicos).
Exoenzimas.
Componentes con actividad enzimticas que son secretados por
bacterias. Facilitan la propagacin tisular al ser capaces de destruir
colgeno, degradar cido hialurnico, elastasas, actividad coagulasa
(S.aureus: impide el acceso de defensas al patgeno),
estreptoquinasas y estafiloquinasas que degrada coagulos de fibrina.
Actividad IgA proteasa (destruyen oor la regin bisagra y separan la
fraccin a-b de la fraccin c). La IgA2 no es susceptible a estas
proteasas.
HGT.
En los genomas de estas bacterias (Salmonella, Yersinia, P.aeruginosa, Shigella, E.Coli) se encuentran secuencias enormes en un
contenido G+C no caracterstico, indicativo de que dicha regin tiene un origen diferente (transferencia horizontal). Se trata de una isla
de patogenicidad con diferentes genes en tndem que codifican para diferentes factores de virulencia. Adems, contienen extremos 35
caracteristicos (cohesivos).
Tambin existen plsmidos de virulencia que codifican extracromosomicamente para un factor de virulencia)
Patogenicidad fngica.
- Infecciones crnicas que pueden provocar una respuesta alrgica.
- Micotoxinas (aflatoxinas de Aspergillus o tricotecenos que inhiben la sntesis proteica por Fusarium, control de alimentos)
- Infecciones superficiales, subcutneas y sistmicas
- Infecciones en inmunodeprimidos.
Factores de virulencia.
Proteasas o exoenzimas : Candida, Trichophyton
Capsula para evitar fagocitosis: Cryptococcus
Transicion dimrfica: Candida albicans, como mecanismo de evasin de la fagocitosis pasa de levadura a hifa filamentosa.
Inmunizacin.
Inmunizacin natural pasiva.
Es aquella adquirida de la madre en el desarrollo fetal y en el
nacimiento mediante la toma de leche, como las IgG y las IgA,
que son utilizadas por el neonato hasta que el nio comienza a
desarrollar su sistema inmunitario (a partir de los 6 meses).
Inmunizacin natural activa.
Corresponde a las defensas propias, desarrollo de inmunidad al
entrar en contacto con los patgenos. A partir de los 6 meses el
sistema inmunitario comienza a desarrollarse, pues se producen
clulas de la inmunidad (neutrfilos, macrfagos, linfocitos, etc). Al entrar en contacto con un agente extrao estos llevan a cabo sus
funciones, pudindose formar entonces clulas de memoria a partir de los linfocitos B. As, el organismo queda inmunizado ante una
enfermedad y posee proteccin frente a repeticiones de la misma.
Corta vida de la terapia (la expresin del gen teraputico no es perpetua, sino a menudo transitoria)
Respuesta inmunitaria frente al virus recombinante no patgeno que estamos utilizando como vector, aunque estemos utilizando el
virus recombinante avirulento. (ser necesaria la repeticin de tratamientos)
Problemas con los vectores virales (toxicidad, lugar de integracin que muchas veces es desconocida o aleatoria, lo que indica que no
es un tratamiento completamente definido, pudiendo integrarse el DNA en una localizacin del genoma responsable de otra funcin,
etc)
Uso limitado para desordenes multigenticos: la restauracin de funciones de forma coordinada de varios genes, y la regulacin de su
expresin (para que se expresen de forma coordinada y den lugar al fenotipo concreto), es complicada cuando existen varios genes
alterados.
Posteriormente se necesita una mejora de las cepas industriales, de modo que se consiga una produccin de metabolito o
producto deseado rentable. Se trata de optimizar la rentabilidad, desde una produccin natural hasta una produccin
modificada til industrialmente.
Por ejemplo Brevibacterium flavum 60g/L de Lys. Esta cepa se modific gracias a la aspartoquinasa, enzima que participa en la ruta de
sntesis. La Lys hace de regulador negativo (feedback -) de la enzima en condiciones normales, ya que la necesidad de Lys est
cubierta. En este caso, se realizaron dos mtodos para conseguir las cepas hiperproductoras:
Utilizacin de la ingeniera metablica: modificacin del sitio de unin de la Lys a la aspartoquinasa.
Aplicacin de mgatenos y buscar hipeproductores en los que la aspartoquinasa ha sido modificada y no es sensible a la lisina
(mutaciones en el gen de la aspartoquinasa). Se consigue un hiperproductor.
La obtencin de mutantes inducidos tambin se basa en la introduccin de precursores que se aade al medio de cultivo, de modo que
se sintetiza ms cantidad de producto partiendo de dichos precursores. Por ejemplo, el cido fenilactico era utilizado como precursor
para la sntesis de penicilina: sin embargo, al aadir una cantidad muy alta se inhibe la ruta (toxico a elevadas concentraciones), es
decir, puede ser que P.chrysogenum resista a los componentes del medio. As, se buscaron mutantes de P.chrysogenum resistentes a
cido fenilactico. Seleccin directa o +: la cepa silvestre no crece pero si el mutante.
Obtencin de recombinantes genticos.
Transferencia de informacin gentica entre organismos diferentes (conjugacin, transduccin, transformacin): procesos naturales
lentos y seleccin lenta.
Fusin de protoplastos: fue muy utilizado durante una poca, fusin de hongo A y B, al quitarle las paredes. Posteriormente, surgen
recombinantes y habr que realizar un rastreo gentico para buscar la cepa de inters y el producto al que da lugar.
Utilizacin de la ingeniera gentica: ingeniera metablica. Alteracin de las rutas bioqumicas del metabolito de inters o anlogos
del metabolito con mayor inters econmico. (o incluso conseguir que la cepa parta de precursores ms baratos)
En el proceso de biosntesis de penicilina, se producen otros metabolitos adems del de inters. Dichos productos son txicos para la
propia bacteria u hongo. Si se consigue modificar un gen que consigue degradar dichos productos, se elimina el efecto inhibidor de la
produccin de estos productos junto con la penicilina (se seguirn produciendo pero la cepa no ser sensible a ellos).
Conservacin de microorganismos.
Objetivos:
Que el cultivo a conservar sea puro, evitando que se produzcan contaminaciones durante el proceso de conservacin.
Que durante el tiempo de conservacin sobrevivan al menos el 70-80% de las clulas.
Que estas clulas permanezcan genticamente estables
Mtodos:
Congelacin (Factores: velocidad de congelacin, t, crioprotectores que evitan que los cristales lisen al microorganismo)
Liofilizacin
Alternativas: transferencia peridica (pasado), suspensin en agua, desecacin en papel, alginato, sal
Colecciones de microorganismos.
Aislados del hbitat natural y seleccionados
Mejora gentica
Patentes y colecciones de cultivos tipo (ATCC, CECT)
Otras patentes y colecciones: plsmidos, genes clonados, vectores de clonacin y de expresin
Identificacin de dianas teraputicas microbianas y ensayos de cribado farmacolgico a gran escala. High throuput
Requisitos de una diana de antimicrobianos:
Fisiolgicos: esencial para el crecimiento y supervivencia del patgeno
Toxicidad selectiva: sin homlogo en clulas humanas
Bioinformtica (genmica comparativa): Comparacin de genomas microbianos y de estos con genomas humanos, buscando
diferencias entre ellos. As buscamos qu genes estn presentes en un microorganismo patgeno y difieren en otro no patgeno
(incluso entre dos cepas, patgena y no, de un mismo microorganismo).
A veces una diana teraputica no tiene que ser esencial para la viabilidad del microorganismo, sino muchas veces se deben bloquear
los factores de virulencia, de modo que eliminas la patogenicidad del microorganismo (bacteriosttico).
En trminos de toxicidad selectiva interesa que el gen no se encuentre en las clulas humanas, que no existan genes homlogos en el
genoma humano.
Genmica funcional: para la caracterizacin de las dianas.
- Mutagnesis por reemplazamiento gnico dirigido: Para saber si un gen es esencial para un microorganismo, debemos eliminar de
forma individual dicho gen (tantas cepas como genes del genoma, sustituyendo cada gen por un marcador). Genes esenciales
potenciales identificados en estudios de inactivacin gnica a gran escala en microorganismos patgenos.
- Mutagnesis por transposicin: Mtodo indirecto de seleccin utilizando transposones: el transposon se inserta de modo que
interrumpe un gen esencial (no conocido el genoma), y despus se estudia dicho gen.
As se identifican estos genes esenciales susceptibles de ser dianas de antimicrobianos.
- Requiere conocimiento de la estructura tridimensional que queremos inhibir (purificacin y cristalizacin). Bioinformtica
- Requiere conocimiento del mecanismo de accin molecular (zona que hay que inhibir, proceso muy especfico)
- Sntesis qumica
- Elevadsima especificidad
El diseo racional se refiere al conocimiento bioqumico de las dianas terapeuticas con el fin de encontrar una inhibicin de las mismas.
Para ello es necesario conocer la estructura tridimensional y su mecanismo de accin, de modo que se averige el lugar necesario para
la inhibicin. Un ejemplo son los inhibidores de la neuraminidasa del virus de la gripe (Zanamivir y Oseltamivir, patentados por Roche).
La neuraminidas permite la liberacin de los virus maduros: con estos frmacos la neuraminidasa queda inhibida y el ciclo ltico
bloqueado, sin afectar el virus a las clulas adyacentes.
Estas colecciones de compuestos tienen diferentes orgenes: naturales y sntesis qumica (coleccin de compuestos qumicos
obtenidos por qumica combinatoria o biosntesis combinatoria: pueden haberse conseguido mediante sntesis qumica aleatoria o
dirigida, de modo que existe un mecanismos de combinacin que introduce radicales a una molcula inicial, conteniendo gran cantidad
de productos derivados, que luego debern pasar el screening farmacolgico).
Caractersticas del HTS: 10.000-100.000 sustancias analizadas al da.
- Diseo: identificacin de diana y tipo de ensayo
- Automatizacin: robtica acoplada a un fenmeno de miniaturizacin (dispensacin en multipocillos o multiplacas)
- Miniaturizacin: alta densidad de pocillos y pequeo volumen (nanotecnologa). Millones de reacciones.
- Deteccin que indique que la sustancia o HIT ha interaccionado con la diana problema y la ha inhibido: fluorescencia,
quimioluminiscencia
Tipos de ensayos:
In vitro (bioqumico): se utiliza un componente celular (enzima, receptor) como diana y se detecta:
La inhibicin/activacin enzimtica mediante la variacin de la concentracin sustrato/producto
La interaccin receptor-ligando (antagonista o agonista)
Ventajas: alta especificad bioqumica y sensibilidad, capacidad de identificacin de compuestos no permeables: se detectan
compuestos que no sabes su capacidad de penetracin y actividad en el interior celular in vivo.
In vivo: se utilizan clulas vivas, en concreto se enfrentan clulas del patgeno frente a las posibles sustancias. Se evidenciar la
inhibicin del crecimiento de microorganismo patgeno.
- Se utilizan clulas del patgeno en placas multipocillos
- Medida del efecto biolgico de un compuesto sobre la clula (fenotipo)
- Inhibicin o recuperacin del crecimiento o muerte celular: despus habr que caracterizar la molcula y continuar con los filtros
HTS (biodisponibilidad, farmacocintica, toxicidad)
Ventaja: se puede ver directamente el efecto pues la sustancia penetra en la clula. Esto a su vez permite un mantenimiento ptimo
del microambiente de la diana. Dichos ensayos tienen capacidad de deteccin de profarmacos (no sucede en ensayos in vitro).
Eliminacin de inhibidores no activos sobre la clula entera (puede ser tambin desventaja).
En algunos casos se pueden usar cultivos celulares (como en virus) o sistemas microbianos (bacterias y hongos).
Tambin sistemas microbianos sistemas microbianos humanizados (inhibicin in vitro de actividades enzimticas para evitar el
riesgo de trabajar con bacterias patgenas). Ej: A.fumigatus con la diana en levaduras.
Tambin evita el efecto toxico de precursores u otros componentes del medio, as como efectos osmticos. Prolonga la etapa de
formacin de producto y mantiene las condiciones de cultivo dentro de la capacidad de aireacin del fermentador.
Elementos traza: Co, Cu, Fe, Mn, Mb en general estn presentes en el agua y materias prima, a veces el rendimiento se ve afectado
por su concentracin. Presentes en medios complejos.
Vitaminas: presentes sobre todo en medio complejo.
Aspectos a considerar:
- El recipiente debe operar aspticamente durante largo tiempo
- Debe proporcionar un sistema apropiado de mezclado
(agitacin) y de aireacin
- Bajo consumo de energa y materiales econmicos
- Sistemas de control (pH, T, oxigeno)
- Facilidad de inoculacin y toma de muestras
-Pocas perdidas pro evaporacin y posibilidad de refrigeracin
- Mnimo tiempo de mantenimiento, limpieza y recoleccin
- Materiales resistentes al calor, corrosin, que no liberen iones (cristal o acero inoxidable)
- Versatilidad
- Superficies lisas sin recovecos
- Geometra adaptable a diferentes escalas
- Control por ordenador.
Tamao y forma:
-Depende del proceso (hasta 500.000 L con vino, cerveza)
-Volumen total = volumen de trabajo + volumen superior vaco (necesario para el gas liberado y la espuma) VTRABAJO = 80% VTOTAL
- Relacin altura / dimetro de base: 2:1, 3:1 o incluso 6:1
- Regin hemisfrica en la base para favorecer el drenaje
Salto de escala: transferencia de un proceso desde la pequea escaa de un equipo de laboratorio hasta un equipo comercial a gran
escala. Todas las fermentaciones comienzan en el laboratorio
1. Matraz de laboratorio
2. Fermentados de laboratorio (1-10 L)
3. Planta piloto (300-3.000 L)
4. Fermentador comercial (10.000-500.000 L)
Propsitos de la agitacin: dispersar el aire en el caldo de cultivo, homogeneizar para igualar temperatura y concentracin de
nutrientes, mantener los microorganismos y sustratos no solubles en suspensin, dispersar lquidos inmiscibles.
Principal prpoposito de la aireacin: proporcionar el suficiente oxigeno (solubilidad: menos de 10mg/L)
Son procesos interconectados: la entrada de aire produce turbulencias que agitan y la agitacin favorece la transferencia de oxgeno al
medio.
Tipos de agitacin:
- Agitadores mecnicos que utilizan un motor: de turbina (sin contracorrientes) marino (con contracorrientes) y de turbina con
cortacorrientes.
- Neumticos: aire a presin y burbujeo directo del medio. Se puede incorporar oxgeno u otro gas.
- Hidrodinmicos: arrastre del medio de cultivo a travs de una bomba exterior, de modo que se crea un circuito cerrado de medio de
cultivo que crea corrientes.
Recuperacin del producto.
separacin celular del medio de cultivo se realiza normalmente mediante centrifugacin o filtracin, siendo muy importante la
localizacin del producto, intracelular o extracelular.
Para obtener un producto intracelular es necesaria la disrupcin celular, es decir, la rotura de las clulas. Posteriormente es necesaria
la separacin de los restos celulares del sobrenadante (centrifugacin, filtracin y extraccin). Esto es ms costoso, por lo que es mejor
en trminos de productividad los productos que se secretan al medio, por ello, a veces, se modifica mediante ingeniera gentica la
protena que se va a obtener, con el fin de que sea secretada (a pesar de ser de forma constitutiva una protena intracelualar).
As, se realiza pues la separacin o concentracin dl producto obtenido. Para ello se utilizan mtodos de extraccin, destilacin,
adsorcin y ultrafiltracin.
El paso de purificacin es muy importante, pues supondr la calidad final del producto. Tcnicas de cromatografa y precipitacin.
El refinado, se utiliza a veces, sobre todo la cristalizacin (penicilina y otros antibiticos) y el secado.
Sulfitosis: Na2SO3 bloquea todas las cistenas presenetes candidatas a formar puentes S-S, con el fin de impedir replegamientos
incorrectos o que se unan a otros compuestos de proteccin. A veces se aade en la
zona terminal una cola de Hys tags con el fin de facilitar luego la purificacin
(cromatografa, columnas de afinidad a esa cola, pues la Histidina tiene afinidad por el
Ni de las columnas).
La conversin de la proinsulina a insulina se consigue mediante la eliminacin del
pptido C con proteasas (como tripsina y carboxipeptidasas como ocurre en el ap. de Golgi).
La fase de restauracin consiste en conseguir la renaturalizacin de la insulina para que se generen los S-S. Esto se hace con
diferentes buffers (solo el 70% se renaturaliza de forma correcta).
Posteriormente se cristaliza, purifica y comercializa.
Poblacin alctona.
Microorganismos contaminantes del agua, no deben estar en ella, proceden de contaminacin (normalmente fecal). Son
microorganismos patgenos, patgenos oportunistas o indicadores fecales.
Caractersticas: gran diversidad metablica, fuentes de C variadas, mesofilos, patgenos oportunistas, Gram negativas en su gran
mayora.
Origen: exterior
Fuentes de contaminacin:
- Acufero: aguas superficiales, residuales.
- Aguas de ros y mar: ganadera, agricultura, vertederos de residuos slidos urbanos, actividades industriales y minera.
Envase: recipiente (vidrio, plstico), tapones, proceso de envasado (controlar mucho filtracin, puede haber bacterias en filtros y
tuberas o ir acumulndose en ellas poco a poco).
Enfermedades transmitidas por el agua:
Vibrio cholerae clera
Cianobacterias (toxinas) gastroentiritis y dermatitis. Producen
dos tipos de toxinas, neurotoxinas y hepatotoxinas (afectacin
gastrointestinal y alteraciones en el hgado). Las toxinas se
transmiten a partir del contacto de la piel (contacto directo),
actividades recreacitivas (nadar, remo), laborales (arrozal), bao y
ducha contaminada, agua de bebida, ingestin accidental al nadar
en u rio o lago, marinocultura, instalaciones deportivas, etc.
Enfermedades vricas: adenovirus humanos (infecciones respiratorias,
gastroenteritis, infecciones oculares, conjuntivitis en piscinas), enterovirus
(poliomelitis), hepatovirus (hepatitis), rotavirus (causa nmero 1 de gastroenteritis
infantil en lactantes), astrovirus (gastroenteritis).
Las caractersticas microbiolgicas dependen de parmetros microbiolgicos de obligado cumplimiento (E.coli, enterococos y
Clostridium perfringes 0 ufc/ml) y parmetros indicadores que puede que no se cumplan (recuento de colonias a 22C 100 ufc/ml y
coliformes 0 ufc/100 ml). Si no se cumplen estos parmetros, la autoridad sanitaria valorar la calificacin del agua como apta o no
apta para el consumo humano segn el riesgo de esta a la salud.
Si Clostridium perfringes es positivo y la turbidez del agua es elevada (>5UNT), hay que buscar otros microorganismos y parsitos a la
salida del depsito, entre ellos la presencia de Crypstosporidium parvum.
Aguas minerales envasadas: hay una variacin de los parmetros, no es en 100 ml sino en 250 ml.
E. coli, enterococos y Pseudomonas aeruginosa (0ufc/250 ml), recuento de colinas a 22C/incubacin 72 horas y recuento de colonias a
37C/incubacin 24 horas (100ufc/ml y 20ufc/ml respectivamente) y Clostridium sulfito reductores (0ufc/50 ml).
Aguas de bebida envasadas.
Aguas minerales naturales: aquellas bacteriolgicamente sanas (aptas para el consumo humano tal y cual salen, no se pueden
potabilizar) que tengan su origen en un estrato o yacimiento subterrneo y que broten en uno o varios puntos de alumbramiento
naturales o perforadas. Con importancia mineral.
Aguas de manantial: son las potables que emergen espontneamente en la superficie de la tierra o se captan mediante labores
practicadas al efecto con las caractersticas naturales de pureza que permiten su consumo.
Aguas preparadas: hay dos tipos, aguas potables preparadas y aguas de abastecimiento publico preparada. Las primeras proceden
de manantial o captacin y son sometidas a tratamientos de aguas potables porque antes no eran potables; las segundas proceden de
una red de abastecimiento que han vuelto a potabilizarse.
Todas las anteriores estn regulada por Reales Decretos que regulan su explotacin y comercializacin.
Aguas de consumo pblico envasadas: el envasado solo se realiza puntualmente para la distribucin domiciliaria con el nico objeto
de suplir ausencias o insuficiencias accidentales de las aguas de consumo pblico distribuidas por la red general de forma gratuita y por
lo tanto no existe comercializacin, parece conveniente su exclusin del mbito de aplicacin del real decreto 1074/2002. En otras
palabras, el agua de grifo se embotella y reparte cuando hay algn problema.
Aguas marinas
Microorganismos alterantes de los alimentos: gran variedad de microorganismos, depende de las propiedades fsicas y qumicas de
los alimentos.
Alimentos perecederos:
Carne, pescado, marisco
Bacterias como Aeromonas, Pseudomonas, Micrococcus, Acintobacter y hongos como Cladosporidium, Rhizopus, Mucor, Penicillium.
Frutas y verduras: bacterias como Pseudomonas y Corynebacteium, Erwinia.
Hongos como Aspergillus, Penicillium, Botrytis, Geotrichum, Rhizopus Botrytis produce cinrea en uvas y cebolla. A veces es una
podredumbre noble interesante en la elaboracin de vinos (Tokay, Gautermes): se extraen ms azucares y taninos, obtienes vino con
ms gradacin alcohlica y CH.
Podredumbre blanda por Rhizopus: pan, tomate, peras, cebollas, ctricos.
Leche: hay gran cantidad de patgenos como Mycobacterium tuberculosis, Brucella (fiebre malta), Salmonella, E.coli, S.pyogenes.
Streptococus, Leuconostoc, Lactococcus, Lactobacillus
Toxinas estafilococas, micotoxinas como aflatoxinas de Aspergillus flavus y mohos en leches en polvo (Penicillium cyclopium viridansy
P.stolonifer).
Huevos y derivados: el patgeno principal es la Salmonella, puede llegar desde el propio ovario, en el momento de la puesta o cuando
ya est fuera.
En la cascara hay muchos alterantes, fecales como Enterobacterias y Enterococcus y ambientales como Pseudomonas, Flavobacterium
y Alcaligenes, y hongos como Mucor y Peniciilum. Toxiinfecciones: Salmonella (salmonelosis) y S.aureus (durante su manipulacin). Se
recomienda lavar el huevo justo antes de utilizarlo.
Seguridad alimentaria
No hay seguridad absoluta
Siempre que se ingiere un alimento existen riesgos de distinto tipo (txicos, qumicos, microbiolgicos) y nunca hay un riesgo cero.
Durante el proceso de produccin, transporte, preparacin, almacenamiento o distribucin, cualquier alimento o bebida puede
contaminase por sustancias toxicas o bacterias patgenas, virus o parsitos.
El consumo de un producto que contenga cantidades suficiente de sustancias toxicas o microorganimos patgenos producir una
enfermedad transmitida por alimentos (intoxicaciones, infecciones o toxiinfecciones, enfermedades de declaracin obligatoria)
Objetivos de la seguridad alimentaria.
Seguridad alimentaria: mxima concentracin de un peligro microbiano en un alimento listo para el consumo, que proporciona un nivel
adecuado de proteccin.
Propiedades: cuantitativos, verificables y flexibles. Todos los objetivos tienen como finalidad minimizar el riesgo.
A nivel europeo, conseguir:
- Enterotoxina estafiloccica en queso < 1 g / 100 gramos.
- Listeria monocytogenes en alimentos listos para el consumo < 100 ucf / gramo hasta 100 no tiene riesgo sanitario.
El TEMA 37 no existe porque los profesores se liaron al numerar (seguramente uno de los que van combinados sea un tema
ms, y claro, ya no cuadra el resto). Pero el temario en s, est todo.
SUERTE.
LETICIA CUARENTAL