DNA e RNA

Genes e Genomas
Profa Angelica Boldt
angelicaboldt@gmail.com

Funes do material gentico

Transmitir a informao gentica (ser capaz

de se replicar)
Deve controlar a expresso do fentipo
Deve permitir mudanas (= mutaes)

A natureza do material gentico

1867 - Friedrich Miesher: nuclena

Experimento de Frederick Griffiths 1928

Linhagens de Streptococcus pneumoniae

PRINCPIO TRANSFORMANTE!

Oswald Avery, Colin MacLeod e Maclyn MacCarty: 1944

CONCLUSO: A transformao s ocorre

quando o DNA est presente.
O DNA O PRINCPIO TRANSFORMANTE!

 Regras de Erwin Chargaff

Pirimidinas ( T + C) ocorrem nas mesma

quantidade que purinas (A+ G).

A quantidade de T = quantidade de A,
A quantidade de C = quantidade de G,
A quantidade de T + A no necessariamente igual
quantidade de G + C
cada espcie tem quantidades caractersticas de
purinas e pirimidinas

Deduza se DNA ou RNA

fita simples ou dupla

A
B
C
D
E
F

%A
33
33
26
21
15
30

%G
17
33
24
40
40
20

%T
33
17
0
21
0
15

%C
17
17
24
18
30
20

%U
0
0
26
0
15
15

Estrutura por difrao de raios X

Molcula Helicoidal ( Espiralada)

Watson e Crick 1953

Propuseram um modelo de estrutura do DNA.

Tamanho e configurao espacial

dos nucleotdeos;
Respeitava os dados de Chargaff
Dados obtidos pela difrao de
raios-X.

Estrutura do DNA
Nucleotdeos: grupamento fosfato + pentose + base

nitrogenada
Duas cadeias (lado a lado) formando uma dupla hlice.
Fitas antiparalelas ( deve haver complementariedade de
bases): uma das fitas apresenta-se no sentido 5 a 3,
enquanto que a outra est no sentido 3 a 5
O grupo fosfato e o acar (parte hidroflica) esto
localizados na parte externa da molcula.
As bases nitrogenadas (parte hidrofbica) esto
localizadas na parte interna da molcula.

Composio
Nucleotdeo

A = Adenina
G = Guanina

Purinas

FOSFATO
Base
Nitrogenada
Aucar Desoxirribose
Nucleosdeo

T= Timina
C= Citosina

Pirimidinas

Nucleotdeo

POLINUCLEOTDEO

RNA

RIBOSE

UNIFILAMENTAR
1957 Descobriram que RNA
estocava a informao gentica de
alguns VIRUS.

URACILA

Fitas complementares e
antiparalelas!

Tipos de ligaes qumicas na

dupla hlice de DNA.
Ligaes qumicas unindo cada

componente da molcula
Nucleotdeo a outro = Fosfodister
Uma base na outra = Pontes de
Hidrognio
T - A = 2 pontes de hidrognio
C G = 3 pontes de hidrognio.

Ligaes fosfodister

Pontes de
Hidrognio

 Considere as seguintes temperaturas de

fuso de cinco molculas de DNA: 73C,

69C, 84C, 78C e 82C. Coloque-as em
ordem crescente segundo a quantidade de
pares G-C.

Universalidade do material gentico

Procariotos

Em comum!
Todas as clulas

(procariotos e eucariotos)
estocam a informao
hereditria em um mesmo
tipo bsico de cdigo
qumico linear (DNA).
Lembrando que... vrus no
sao clulas e podem
apresentar somente RNA
(retrovrus)!

 Todas replicam essa informao por polimerizao das

subunidades do cdigo (nucleotdeos) segundo um

molde pr-estabelecido

 Todas transcrevem partes da informao

numa mesma forma intermediria (RNA)

 Todas traduzem esta informao da mesma forma bsica

(cada trs nucleotdeos = um aminocido) utilizando o

mesmo equipamento (ribossomo)

Prximo passo: o que um gene?

Gene -> fator hereditrio

Gene -> bloqueio metablico

(Garrod e alcaptonria)
Gene -> protena (que pode
ser uma enzima)
Hermann Muller: raios X induzem mutaes

Conceito atual de gene

o fragmento de DNA imprescindvel para a

sua expresso (transcrio do DNA em RNA,

que pode ou no ser traduzido em protena)
inclui pores necessrias regulao da sua
expresso.
Muitos RNAs so produtos finais de genes!
Ex.: rRNAs, tRNAs, snRNAs.

Gene em procarioto (cstron)

Possui:
promotor: regio reguladora a 5 do gene, reconhecida pela

RNA polimerase
operador: regio reguladora a 5 do gene, reconhecida por
fatores de transcrio (protenas reguladoras)
seqncia codificadora (normalmente no interrompida, pode
codificar mais de uma protena)
Ex.: Operon Lac: mRNA policistrnico

Gene em eucarioto
Promotor: regio reguladora a 5 do gene, reconhecida por

fatores de transcrio e protenas reguladoras

Exon: regio codificadora em protena (com codons no

mRNA) ou codificadora em RNA funcional

Intron: regio entre os exons, no codificadora (delimitada

geralmente por GT .............. AG)

Regio no traduzida: regio a 5 e a 3 da regio

codificadora (primeiro e ltimo exon), pode afetar a

estabilidade do RNA
Intensificador/Silenciador: regio que pode estar distante

da regio codificadora, mas afeta a sua expresso.

Gene em eucarioto
Ex.: Gene da lectina ligante de manose (MBL2)
os exons esto freqentemente relacionados aos
domnios da protena:
Gene MBL2

643

~1350

~800

RNAm

Protena

CRD

Devido ao processamento alternativo do RNAm, genes eucariticos podem

codificar protenas diferentes!

Genoma: totalidade de sequncias no material gentico

(conjunto cromossmico) de uma clula ou um
organismo (ALBERTS et al. 2002; GRIFFITHS et al. 2011; KREBS et al. 2008)

Genoma viral
Pode ser:
RNA fita-simples (retrovrus)
RNA fita-dupla

DNA fita-simples
DNA fita-dupla (DNA vrus)

Capaz de se integrar ao genoma do

hospedeiro!
Ciclo lisognico

Ciclo ltico

Genoma bacteriano
Geralmente circular e super-

helicoidizado
Composto de:
cromossomo bacteriano

plasmdeo

Empacotado sem histonas

Com uma s origem de

replicao

Ligado membrana plasmtica

Genoma de procariotos
Em procariotos, o tamanho do genoma (0,6 a <0,8Mb)

proporcional ao no de genes e geralmente no contm DNA

repetitivo.
O tamanho mdio do gene de uns 1000 pb.
Introns podem ocorrer, mas so raros
Todos os genomas de procariotos parasitas tm tamanho
inferior a 1,5Mb e apresentam uma reduo significante no
no de genes codificadores de enzimas metablicas (que so
substitudas pelas do hospedeiro) e de produtos envolvidos
na regulao da expresso gnica.
Archaeans tm propriedades biolgicas intermedirias entre
os outros procariotos e eucariotos.

Bactrias patognicas
Apresentam grandes regies de 10-200 kb presentes no seu

genoma porm ausentes nas variantes no patognicas,

denominadas ilhas de patogenicidade
As ilhas tem genes que codificam fatores de virulncia como
toxinas, prots de invaso celular, sistemas de secreo,
resistncia a antibiticos, etc). O seu contedo GC difere do
resto do genoma, e a sua propagao provavelmente ocorre por
meio de um processo de transferncia horizontal.
Por ex, a bactria causadora do anthrax (Bacillus anthracis)
apresenta dois grandes plasmdeos, um dos quais contm uma
ilha de patogenicidade que inclui o gene codificador da toxina.

Genoma de eucariotos
No-circular e superhelicoidizado
Compe vrios cromossomos
(com centrmero e telmeros)
Empacotado com histonas no
ncleo
Cromosomo 3 humano de Science
Human Genetic Map, Genome Map V (Life Technologies)

 DNA
Com duas histonas

de cada tipo: H2A,

H2B, H3 e H4, em
nucleossomos
Reunido com a
histona H1 numa
solenide
Em alas num
esqueleto proteico
Cromatina
Cromossomo
metafsico

Qual o nmero mnimo de genes?

O no mnimo de genes aumenta com a

complexidade de um organismo:
bactria intracelular (parastica): 500 genes
bactria de vida livre: 1500 genes
eucarioto unicelular: 5000 genes
eucarioto multicelular (nematodo): 13000 genes
plantas superiores: 25000 genes
mamferos: 25000 genes

Famlias gnicas
Em bactrias e eucariotos unicelulares, a

maior parte dos genes nica.

Em eucariotos multicelulares, vrios genes
pertencem a famlias gnicas que apresentam
homologia de sequncia e compartilham uma
ancestralidade comum.

Homologia gnica
Genes ortlogos: genes de duas espcies

diferentes que derivam de um mesmo gene

ancestral
Organismo ancestral

Especiao

Espcie A

Espcie B

Homologia gnica
Genes parlogos: genes resultantes de um evento

de duplicao em uma nica espcie

Organismo ancestral

Duplicao e divergncia
1

Organismo derivado
2

Homologia gnica
Genes ortlogos e parlogos so genes

homlogos.
Duplicao e divergncia
Genes 1 e 2

Especiao

Genes 1A e 2A

Genes 1B e 2B

Inovaes genticas
(linhagem germinativa)
Original

Inovao

Transferncia horizontal

Duplicao gnica

3
+
4

Rearranjo de segmentos

Mutao intragnica
gene

> Complexidade > Tamanho do genoma?

Valor C: quantidade de DNA de um genoma

haplide
Porcentagem de DNA no
codificador em genomas
completamente seqenciados.
Fonte: Barry, P (2007). Science
News online, 172 (10): 154.

O paradoxo do valor C
1. Com o aumento no tamanho do gene e a presena de

seqs repetitivas em eucariotos, a relao entre o tamanho

do genoma e a complexidade organsmica perdida

Por ex, o genoma da ameba de vida livre + de 200 x maior que

o humano (670 Gb x 3 Gb)!

2. H um excesso de DNA em eucariotos comparado

com a quantidade esperada para a codificao de

protenas (muitas seqncias no codificadoras so
importantes na regulao da expresso gnica)
3. H diferenas enormes entre os valores C de espcies
com complexidade similar.

Mdia e
intervalos dos
valores C
dentre
diferentes
grupos de
organismos
(mais de
10000
espcies).
Fonte:
Gregory, TR
(2005). Nature
Reviews
Genetics 6:
699-708.

Tipos de DNA em clulas animais

Em eucariotos, a cintica de reassociao do DNA aps a sua

desnaturao permite a distino de seqs pela freq de repeties

no genoma:
no repetitivo (varia muito entre grupos taxonmicos),
moderadamente repetitivo (seqs relativamente curtas repetidas
10-1000 x, dispersas no genoma e responsveis pela formao de
estruturas 2rias nos mRNAs, inclui os transposons, de ~ 1kb)
altamente repetitivo (seqs muito curtas <100pb, presentes
muitas milhares de vezes no genoma, frequentemente
organizados como LTRs).

Eucariotos apresentam mais...

20% em eucariotos unicelulares
50% em pluricelulares
(at 80% em anfbios)

DNA repetitivo

Altamente
repetitivo

DNA satlite

Genes de
mltiplas cpias
Genes de
RNAr

Medianamente repetitivo

Repeties em
tandem

Minisatlites

Microsatlites

VNTRs

Dinucleotdeos

Retrotransposons
dispersos

Genmica
Termo escolhido por Victor McKusick e Frank

Ruddle para uma nova revista cientfica em 1987

(LEDERBERG e McCRAY, 2001)
Estudo de genomas em sua totalidade

(GRIFFITHS et al. 2011)

Genmica
Estrutural
Funcional

Comparativa
Evolutiva

Muitos genomas j sequenciados!

OMIM

Science, 18.01.13 E agora??

Referncias Bibliogrficas
Griffiths A.J.F., Miller J.H., Suzuki D.T., Lewontin R.C.,

Gelbart W.M., Wessler S.R. Introduo Gentica. 8

ed. Guanabara Koogan, Rio de Janeiro, 2006.
Snustad, D.P., Simmons, M.J. Fundamentos de Gentica.
4a Ed. Guanabara Koogan, Rio de Janeiro, 2006.
Lewin B. Genes IX. 9 ed. Jones & Bartlett Publishers,
2007.
Alberts B. et al. Molecular Biology of the Cell. 4 ed.
Garland Science, Nova Iorque, 2002