Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
Facultad de Medicina
Escuela Luis Razetti
Ctedra de Bioqumica
TEMA 2
ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LAS
PROTENAS
Mdulo I: Estructura y Funcin de los
aminocidos
Noviembre, 2009
2
Objetivos generales del Tema 2
Explicar con ejemplos la relacin que existe entre la estructura de las protenas y
7) Interpretar la curva de
titulacin de los aminocidos
8) Representar las formas
inicas de los aminocidos a
diferentes pH
9) Calcular la carga neta de los
aminocidos a diferentes pH
y el punto isoelctrico
Contenidos
Carbono alfa, grupo amino, grupo carboxilo y
cadena lateral (R)
Cadenas alifticas, aromticas, cidas y
bsicas
Polaridad, carga elctrica, grupos aromticos,
propiedades cido-base
Ionizacin de los grupos alfa amino, alfa
carboxilo y cadenas laterales
Carga del aminocido
Representacin de pH versus equivalentes de
base aadidos a soluciones de aminocidos
monoamino-monocarboxlico, aminocidos
diamino-monocarboxlico y aminocidos
monoamino-dicarboxlico.
Identificacin de pKs y pI
Ionizacin de los grupos alfa amino, alfa
carboxilo y cadenas laterales a la
concentracin de H+
Suma algebraica de cargas de los grupos alfa
amino, alfa carboxilo y cadenas laterales
Actividad de Aprendizaje
Asiste a las clases tericas del tema.
Consulta alguno de los siguientes libros:
Champe, P., Harvey, R. y Ferrier, D. (2005) Bioqumica. 3ra ed. Mxico:
Editorial Mc Graw Hill.
Devlin, Thomas. (2004). Bioqumica. Libro de texto con aplicaciones clnicas.
4ta ed. Editorial Revert S.A.
Mathews-Van Holde-Ahern. (2003). Bioqumica. 3ra ed. Editorial Addison
Wesley.
McKee, T. y McKee, J.R (2009) Bioqumica. 4ta ed. Madrid: Editorial Mc Graw
Hill.
Murray, R.; Bender, D.; Botham, K.; Kennelly, P. Rodwell, V. y Weil, P. (2010)
HARPER, Bioqumica ilustrada. 28o ed. Mxico: McGraw Hill.
Nelson, D. y Cox, M. (2005). Lehninger. Principios de Bioqumica. 4ta ed.
Editorial Omega.
Smith, C.; Marks, A. y Lieberman, M. (2006). Bioqumica bsica de Marks. Un
enfoque clnico. 2da ed. McGraw Hill-Interamericana.
Voet, D.; Voet, J. y Pratt, C. (2007). Fundamentos de Bioqumica. La vida a
nivel molecular. 2da ed. Editorial Mdica Panamericana.
Puedes utilizar cualquier libro de Bioqumica ya que ste tema se encuentra en
todos ellos.
Actividad de Prctica
4
1. Partiendo de la frmula general de los aminocidos:
1.1 Identifica los grupos ionizables
Trata cada uno por separado: R-NH3+y R-COOH. En este caso R es todo el resto
del aminocido.
1.1 Escribe la reaccin de ionizacin del R-NH3+:
R-NH3+
5
2. Ahora trabajemos con ambos grupos ionizables presentes en la misma molcula,
por ejemplo la glicina:
pK1= 2,35
pK2= 9,78
Na+ + OH-
6
un pH igual al pK del grupo amino. Recuerda que a este pH ya todo el grupo
carboxilo se encuentra disociado:
2.7 Cul es la carga neta que a este pH tendrn molculas de glicina?.
2.8 Dibuja la forma inica de la glicina a un pH 12:
2.9 Cul es la carga neta que a este pH tendrn las molculas de glicina?.
El punto isoelctrico es un valor de pH al cual el aminocido no tiene carga neta.
Este valor se puede calcular. Para el caso de la glicina, y de los otros aminocidos
que tienen un grupo amino y uno carboxlico, es igual a la semisuma de los pK de
ambos grupos.
Debes poder dibujar las formas moleculares a pH muy bajo, muy alto, igual a cada
uno de los pK y al punto isoelctrico del aminocido. Es fcil si comprende lo que
esta pasando.
3. Ahora consideremos un aminocido con un grupo disociable extra en la cadena
lateral o R. Por ejemplo uno que tenga un grupo carboxilo extra en la cadena
lateral, como el cido glutmico:
pK1= 2,19
pKR= 4,28
pK2= 9,66
El cual, para simplificar vamos a representar as, solo tomando en cuenta los grupos
disociables:
8
Aminocido
Acido asprtico
Acido glutmico
Alanina
Arginina
Glicina
Histidina
Leucina
Lisina
Serina
pK1
COOH
2,09
2,19
2,34
2,17
2,34
1,87
2,36
2,17
2,21
pK2
-NH3+
9,82
9,67
9,69
9,04
9,6
9,17
9,60
9,04
9,15
pKR
3,86
4,25
12,48
6,0
12,48
5. Identifica las cadenas laterales de los aminocidos que pueden interactuar con el
agua (polares). Dibuja algunas de esas interacciones.
6. Identifica las cadenas laterales de los aminocidos que no pueden interactuar con
el agua (no polares).
10
14. El siguiente grfico muestra la curva de titulacin de un aminocido:
a) Representa las formas inicas
predominantes en los puntos
A, B, C y D.
b) Cul es el rango de pH en
que el aminocido presenta
carga
neta
negativa
y
capacidad buffer?
c) Cul es la forma inica
comn presente en los puntos
B y C?. Explique
d) Calcula su pI.
Investiga en lnea
Pgina donde se pueden ver las curvas de titulacin de todos los aminocidos:
http://cti.itc.virginia.edu/~cmg/Demo/markPka/markPkaApplet.html
Pgina en espaol con una excelente animacin de la ionizacin de los aminocidos:
http://av.bmbq.uma.es/av_biomo/Mat2c.html