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OBJETIVOS .......................................................................................................... 3
PROGRAMA DEL CURSO ........................................................................................ 3
SEMINARIOS ......................................................................................................... 4
PROGRAMA DEL CURSO PRCTICO ........................................................................ 4
Cuestionarios Gua .......................................................................................... 6
1. Generalidades de nutricin. Macronutrientes y obesidad ............................................ 7
Micronutrientes.................................................................................................... 7
2. Metabolismo de aminocidos .............................................................................. 9
3.
4.
OBJETIVOS
1. Complementar el conocimiento bioqumico bsico adquirido por los estudiantes en el
curso de Bioqumica I con temas de la bioqumica que son motivo de investigacin y
desarrollo biotecnolgico en la actualidad.
2. Introducir a los estudiantes en el manejo de bibliografa cientfica y de herramientas
audio-visuales, imprescindibles para su desenvolvimiento en el rea cientficotecnolgica, durante el desarrollo de los seminarios semanales.
3. A nivel de los trabajos prcticos se desarrollan ensayos relacionados con la temtica
terica, atendiendo a la actualidad y pertinencia de las tcnicas y con nfasis al aporte
de conceptos y herramientas de diseo y estadsticas imprescindibles para la formacin
de los educandos como investigadores.
SEMINARIOS
S1. Nutricin (artculo y cuestionario 1).
S2. Metabolismo de aminocidos (cuestionario 2).
S3. Metabolismo de aminocidos (cuestionario 2).
S4. Molculas derivadas de aminocidos. Catecolaminas y tiroxina (presentaciones
1 y 2).
S5. Modificaciones postraduccionales (cuestionario 3).
S6. Cascadas proteolticas. Digestin y coagulacin (presentaciones 3 y 4).
S7. Generalidades sobre lpidos (cuestionario gua 4).
S8. Lipoprotenas plasmticas y alteraciones del metabolismo lipdico (presentaciones 5 y 6).
S9. Sistemas antioxidantes enzimticos y no enzimticos (presentaciones 7 y 8).
S10. Citocromo P-450 y COX (presentaciones 9 y 10).
S11. pH (cuestionario gua 5)..
Aclaraciones 2012:
Los tericos, 20 en total, tienen una duracin de 2 horas y se dictan lunes y
mircoles de 10 a 12 hs, desde el 13 de agosto al 26 de octubre.
Los seminarios, 11 en total, son de asistencia obligatoria y se extendern
desde el 15 de agosto al 24 de octubre y se dictarn en dos turnos: 10:3012:30 y 14:30-16:30 hs. Por razones debidamente justificadas estos podrn ser
realizados a distancia (consultar).
Los prcticos son de asistencia obligatoria y tendrn una frecuencia diaria y
una carga horaria de 4 horas por da. Se extendern desde el 29 de octubre al
16 de noviembre. La inscripcin para los turnos se har con los docentes del
curso.
La evaluacin del curso constar de: evaluacin continua del desempeo en
seminarios y prcticos, adems de dos parciales a realizarse los das 26 de
setiembre y 24 de octubre sobre contenidos tratados en seminarios y tericos.
Los contenidos del programa, as como el material suplementario estarn
disponibles a travs del EVA (solicitar clave a los docentes).
Las consultas se evacuarn a travs del EVA o en persona slo los das
viernes de 14 a 16 hs.
Bioqumica II
Cuestionarios Gua
Cuestionarios Gua
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Micronutrientes
1. Vitaminas y ciclo del cido ctrico
a. Enumere cuatro vitaminas hidrosolubles que participan en reacciones del ciclo
del acido ctrico (ciclo de Krebs) como coenzimas.
b. De qu coenzimas forman parte?
Cuestionarios Gua
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2. Metabolismo de aminocidos
1. Las enzimas transaminasas o aminotransferasas ocupan un rol importante en el metabolismo.
a. Describa la reaccin que catalizan y su funcin.
b. Cul coenzima participa y de qu manera?
2. a. Por qu algunos aminocidos son esenciales?
b. En la especie humana, cules son los aminocidos esenciales?
c. Explique si la siguiente afirmacin es verdadera o falsa:
Dado que el nitrgeno del glutamato puede ser redistribudo por transaminacin, el glutamato es
un buen suplemento para protenas pobres desde el punto de vista nutricional.
3.
a. Existe una fuente de reserva de carbohidratos en los mamferos? Cul?
b. Y de lpidos?
c. Y de protenas?
4.
a.
b.
c.
O
C
NH3+
CH
CH2
C
O
Aspartato
5. Una persona adulta debe ingerir alrededor de 50 gramos de protena por da.
a. Qu pasa si ingiere ms?
b. Su respuesta al punto anterior sera diferente si considera independientemente a los
aminocidos glucognicos de los cetognicos?
Aminocido Reposo Ejercicio
c. Cules son los intermediarios y las vas de
(M)
(M)
ingreso para la formacin de estos en cada
Alanina
313
378
caso?
6. a. Qu se entiende por balance de nitrgeno?
b. Una persona que est consumiendo una dieta
vegetariana estricta, desbalanceada y diseada
sin asesoramiento profesional, presenta
balance de nitrgeno negativo. Explique.
.
7. En la tabla se muestra la concentracin plasmtica
de aminocidos determinada en una persona sana, en
reposo y durante ejercicio fsico intenso.
a. Comente acerca de la abundancia relativa de
los aminocidos. Cul es el ms abundante?
Se le ocurre el fundamento bioqumico?
b.
Cuando se determina la concentracin de
aminocidos durante el ejercicio, se observa
que la concentracin de alanina aumenta.
c.
Se le ocurre porqu?
Cuestionarios Gua
Arginina
Aspartato
Cistina
Fenilalanina
Glutamato
Glutamina
Glicina
Histidina
Isoleucina
Leucina
Lisina
Metionina
Prolina
Serina
Treonina
Tirosina
Valina
82
14
57
55
91
520
209
88
66
128
174
27
177
113
83
51
215
85
13
ND
54
94
ND
203
90
56
105
172
26
ND
112
80
55
174
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d.
8. El glutamato es responsable del quinto sabor, umami, presente en alimentos como la salsa de
soja y el caldo de carne. El umami es un sabor agradable, asimilable a la carne, que se suma a
los sabores cido (protones), dulce (sacarosa y otros compuestos), salado (iones sodio) y
amargo (alcaloides y otros compuestos). En los ltimos aos, se han encontrado receptores
especiales en la lengua para el glutamato. El glutamato monosdico se comercializa como
aditivo para alimentos (Ajinomoto).
e.
Se le ocurre el sentido evolutivo del desarrollo de un
sistema para sensar glutamato?
f.
Es un aditivo seguro para la salud humana? Cmo hara
para demostrarlo?
Glutamato monosdico
g.
Cmo se cataboliza el glutamato?
h.
Describa por lo menos tres reacciones enzimticas importantes para el organismo en
las que participe el glutamato, analizando su relevancia.
O
HO
NH3+
OH
OH
NH3+
NH3+
Lisina
Intermediario A
Carnitina
HO
O
N
Triptofano
NH3+
N
Serotonina
NH3+
N
Melatonina
CH3
HN
O
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12.
a. La fenilalanina es un aminocido esencial pero la tirosina no. Discuta el fundamento
bioqumico de esta afirmacin.
b. Algunos refrescos advierten del contenido de fenilalanina en la etiqueta. Se le ocurre el
fundamento bioqumico de esto?
13.
a. La vitamina B6 ocupa un rol importante en el metabolismo de aminocidos. Qu coenzima se
forma a partir de ella y qu rol(es) tiene?
b. Si un individuo presenta una deficiencia de vitamina B6, indique cul de los siguientes
aminocidos puede an ser sintetizado a pesar de dicha deficiencia: serina, tirosina, alanina,
cistena, aspartato. Justifique.
14. A la derecha se muestra la sntesis de epinefrina a
partir de tirosina, que se da en la mdula adrenal. Con
sus conocimientos de bioqumica, describa qu tipo de
reaccin ocurre en cada paso del proceso. Proponga qu
cosustratos y coenzimas o grupos prostticos podran
participar en cada paso.
NH3+
CH2
HO
COO-
CH
Tirosina
1
HO
NH3+
CH2
HO
CH
COO-
DOPA
2
HO
CH2
HO
CH2
NH3+
Dopamina
3
HO
HO
OH
CH
CH2
NH3+
Norepinefrina
4
HO
HO
OH
CH
CH3
CH2
NH2+
Epinefrina
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Cuestionarios Gua
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2.
3.
Cules son los tejidos que los emplean como fuente de energa y bajo qu
condiciones?
4.
Existen lpidos esenciales, o dicho de otra manera es necesario consumir este tipo
de molculas? Si los hay, por qu son esenciales y cules son? Para qu los emplea
el organismo? Cules son sus fuentes dietticas?
5.
6.
Cmo se generan los lpidos que forman los acmulos de grasa en el interior de las
clulas del tejido adiposo y qu relacin guardan con cada uno los componentes de
la dieta (lpidos, protenas, glcidos, etc)?
7.
8.
9.
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Cuestionarios Gua
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Cuestionarios Gua
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Bioqumica II
Protocolos Prcticos
Cuestionarios Gua
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Mdulo I. Nutricin.
Determinacin de capacidad antioxidante en alimentos.
Introduccin
Las oxidaciones son reacciones qumicas de transferencia de electrones entre un agente
oxidante y un reductor. Bajo determinadas condiciones estas reacciones redox pueden generar
molculas altamente inestables capaces de reaccionar con oxgeno o con otras molculas
generando un desbalance redox, en el cual las oxidaciones se propagan a molculas vecinas.
Un antioxidante es una molcula capaz de retardar o prevenir la oxidacin de otras molculas,
impidiendo o terminando las oxidaciones en cadena. Aunque las reacciones de oxidacin son
cruciales para la vida, tambin pueden ser perjudiciales; por lo tanto las plantas y los animales
mantienen mltiples sistemas antioxidantes, tales como glutatin y otros tioles, vitamina C, y
vitamina E, as como enzimas tales como la catalasa, superxido dismutasa y varias
peroxidasas. Por su parte en los vegetales los polifenoles son muy importantes como
antioxidantes.
En los ltimos tiempos la determinacin del contenido de antioxidantes se ha empleado como
una herramienta para promover el consumo y sumarle valor agregado a productos de origen
natural tales como: el vino, la miel y los propleos, entre otros.
Preparacin de extractos etanlicos (EE)
Preparar el EE (40 g/L) pesando 2 g de tejido molido (propleos (M1), palta (M2), manzana
(M3)), agregarle 20 mL de EtOH 75% y calentar a 50-60 C con agitacin durante 30 min. Dejar
enfriar, filtrar, y llevar a 25 mL con EtOH 75%.
Preparacin de Soluciones para el mdulo
Buffer Fosfato 75 mM, pH 7.4 (BF)
cido 6-hidroxi-2,5,7,8-tetrametilcroman-2-carboxlico (Trolox) 2 mM en etanol, 3 mL
2,4,6-tripiridil-s-triazina (TPTZ) 10 mM en 40 mM HCl, 15 mL
Buffer acetato 300 mM, pH 3.6, 150 mL
FeCl3 20 mM, 15 mL
PBS pH 8.0, 100 mL
ABTS 5.00 10-4 M en PBS pH 8.0, 100 mL
Persulfato de sodio 6.89 x 10-3 M en PBS pH 8.0.
Para la preparacin de ABTS.-. Se mezcla 1 mL de la solucin de persulfato con 99 mL de la
solucin de stock de ABTS, incubndose durante 16 hrs en la oscuridad.
Fundamento terico
Ferric Ion reducing antioxidant
power (FRAP)
Es una tcnica sensible y simple de
realizar,
que
se
emplea
habitualmente para medir la
capacidad antioxidante de diferentes
fluidos del organismo, as como de
diferentes
componentes
y
complementos de la dieta. En esta tcnica una sal de hierro, el Fe(III)(TPTZ) 2Cl3, acta como
oxidante y cromforo, ya que la forma reducida absorbe a 593 nm, no as la forma oxidada.
Procedimiento:
Preparar el reactivo FRAP, mezclando inmediatamente antes de usar:
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T1
T2
T3
T4
T5
T6
T7
T8
10
11
12
M1
M1
M1
1/10
1/100
1/1000
M1
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M2
M2
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M5
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M5
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1/10
1/100
1/1000
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1
A
B
T=1
T=1
2
T=2
T=2
3
T=3
T=3
4
T=4
T=4
5
T=5
T=5
6
T=6
T=6
7
T=7
T=7
T=8
T=9
T=8
T=9
10
11
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M1
M1
M1
dil -1
1/100
1/1000
M1
M1
M1
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1/100
1/1000
M1
M1
M1
T=1
T=2
T=3
T=4
T=5
T=6
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T=8
T=9
dil -1
1/100
1/1000
M2
M2
M2
M3
M3
M3
M4
M4
M4
M5
M5
M5
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
1/1000
M2
M2
M2
M3
M3
M3
M4
M4
M4
M5
M5
M5
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
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dil -1
1/100
1/1000
M2
M2
M2
M3
M3
M3
M4
M4
M4
M5
M5
M5
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
1/1000
dil -1
1/100
1/1000
BLANCO
Procesamiento de datos
Graficar el delta absorbancia en funcin de la concentracin de Trolox.
Calcular la concentracin de antioxidante o equivalentes de Trolox en las muestras.
Reportar los resultados obtenidos con cada tcnica independientemente y graficar
comparativamente (grfico de Bland-Altman).
Referencias
Huang D, Ou B, Prior R (2005). "The chemistry behind antioxidant capacity assays". J. Agric.
Food Chem. 53: 184156.
Genta, G. Evaluacin de las propiedades antioxidantes de propleos uruguayos. Tesina de grado
de la Licenciatura de Bioqumica, Facultad de Ciencias, Universidad de la Repblica, 2009
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La ALAT se encuentra predominantemente en hgado, mientras que la TGO tiene dos isoformas
la TGO1 presente en glbulos rojos y corazn y la TGO2 en mitocondrias hepticas.
El fosfato de piridoxal, la forma biolgicamente activa de la vitamina B6
es el cofactor de las reacciones catalizadas por estas enzimas.
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Volumen (L)
Tubo 1
Tubo 2
200
200
150
150
150
150
500
------
------
500
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Tubo 2
100 L
-----100 L
-----------
Tubo 3
100 L
----------100 L
------
Tubo 4
100 L
------------------100 L
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piruvato + CO2
Materiales:
Bao termostatizado a 37 C
Cronmetro
Espectrofotmetro
Tubos y gradilla
Cubas de espectrofotmetro
Hgado de pollo, fraccin citoslica.
Reactivos a preparar:
Sustrato TGO: 100 mM de L-aspartato y 2 mM de -cetoglutarato en buffer fosfato 100 mM, pH
7,4.
Sustrato TGP: 200 mM de dl-alanina y 2 mM de -cetoglutarato en buffer fosfatos 100 mM, pH
7,4.
Reactivo 2,4-dinitrofenilhidracina (DNPH): solucin conteniendo 2 mM DNPH en HCl 1 M.
Diluyente para Enzimas concentrado: solucin de hidrxido de sodio 0.4 M. (Dilur la solucin 4
M 1/10).
Estndar: solucin de piruvato de sodio 2 mM. Listo para usar en la curva de TGP, diluir 1:2 con
sustrato para la curva de TGO
Procedimiento:
Rotular tubos del 1 al 9, por duplicado, para la curva de calibracin y por triplicado los tubos para
el blanco (B), muestra (M) y control (C) para cada una de las transaminasas y proceder a
preparar los tubos como se indica
Tubo
1
2
3
4
5
6
7
8
Agua
destilada
L
600
575
550
525
500
475
450
400
Piruvato
Sustrato
Muestra
L
0
25
50
75
100
125
150
200
L
-----------------
L
-----------------
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Tubo
B
M
C
Agua
destilada
(L)
100
--500
Piruvato
(L)
Sustrato
(L)
Muestra
(L)
-------
500
500
---
--100
100
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IIA
PMSF
Ac. etilendiaminotetractico
Iodacetamida
Fluoruro
de
fenilmetanosulfonilo
proteasas cistenicas
proteasas sernicas
184,9
174,2
10-100 M
(preparar antes de usar)
Proteasas
blanco
proteasas metlicas
proteasas activadas por metales
372,24
Peso molecular
(sal disdica dihidratada)
Concentracin 1-10 mM.
efectiva
Solucin stock
Notas
10-100 mM en agua
(preparar antes de usar)
No es especfico para el
residuo de cistena del sitio
activo de las proteasas
Tambin
inhibe
cistenicas y puede inhibir
proteasas cistenicas
muchas
otras
enzimas.
Tambin reacciona con tioles
de bajo peso molecular como
-mercaptoetanol.
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A1
EDTA
A2
IAA
A3
PMSF
Ac
-
Bibliografa
1. Barret AJ, Rawlings ND y Woessner JF. Handbook of Proteolytic Enzymes, 2004,
Academic Press, London.
2. Beyond RJ, Bond JS. Proteolytic Enzymes: A Practical Approach., 2001, IRL Press,
Oxford
3. Valls D., Furtado S. and Cantera A. M. B., 2006. Characterization of news proteolytic
enzymes from ripe fruits of Bromelia Antiacantha Bertol. (Bromeliaceae). Enzyme and
Microbial Technology 40 (2007) 409413
Page 30
Heladeras y hielo
METODOS
La determinacin de colesterol se basa en el empleo del sistema enzimtico colesterol
esterasa/colesterol oxidasa acoplado a peroxidasa/perxido/4-aminofenazona (4-AF)
desarrollado por Ramrez et al. (2005).
colesterol
O2
H 2O2
AF
CHOD
POD
colesten 3 ona
H 2 O2
quinonimin a roja
Para determinar el colesterol unido a HDL se precipitan las lipoprotenas ms grandes y menos
densas (LDL y VLDL), mediante polianiones en presencia de cationes divalentes (sulfato de
dextrano-cloruro de magnesio), las HDL quedan en el sobrenadante y el colesterol unido a stas
se cuantifica empleando el sistema enzimtico descripto previamente.
Las LDL se separan del suero precipitndolas selectivamente mediante el agregado de
polmeros de alto peso molecular (sulfato de polivinilo). Luego de centrifugar, se cuantifica en el
sobrenadante el colesterol unido a HDL y VLDL. El colesterol unido a LDL se determina a partir
de la diferencia entre el colesterol total y el determinado en el sobrenadante.
Procedimiento:
1. Obtencin de fracciones enriquecidas en HDL
Preparar el reactivo precipitante mezclando volmenes iguales de sulfato de
dextrn y cloruro de magnesio, cantidad necesaria.
A un tubo eppendorf rotulado con el nmero 1, agregar 50 L de reactivo
precipitante a 500 L de suero.
Homogeneizar sin invertir e incubar en hielo durante 30 minutos.
Centrifugar a 1500xg durante 30 minutos a 4 C.
Separar el sobrenadante inmediatamente y conservar para la determinacin de
colesterol como se describe en 3.
2. Obtencin de fracciones reducidas en LDL
A un tubo eppendorf rotulado con el nmero 2, agregar 100 L de reactivo
precipitante (sulfato de polivinilo) a 200 L de suero.
Homogeneizar sin invertir e incubar a temperatura ambiente durante 15 minutos.
Centrifugar a 3000 rpm durante 15 minutos.
Separar el sobrenadante inmediatamente y conservar para la determinacin de
colesterol como se describe en 3.
3. Determinacin de colesterol en las fracciones enriquecidas en HDL (aislada en 1), las
reducidas en LDL (aislada en 2) y suero sin fraccionar (colesterol total).
Rotular tubos eppendorf de A a E para preparar diluciones de colesterol que
usaremos como estndar.
Tubo
Concentracin de Reactivo de trabajo Colesterol (2 g/L)
colesterol (g/L)
A
0.25
175 L
25 L
B
0.5
150 L
50 L
C
0.75
125 L
75 L
D
1
100 L
100 L
E
1.5
50 L
150 L
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Page 33
Bibliografa
Report of the national cholesterol education program expert panel on detection, evaluation and treatment
of high blood colesterol in adults. Ach. Int. Med., 1998; 148:36-69.
Stykowski P, et al. Changes in risk factors and the decline in mortality from cardiovascular disease. The
Framinghan Heart Study. New Engl. J. Med. 1990; 322:1635-1641.
Neaton JD, Nentworth D. Serum cholesterol, blood pressure, cigarette smoking and death from coronary
heart disease. Overall findings and differences by ages for 316.099 white men. Mltiple Risk Factor
intervention Trial Research Group. Arch. Intern. Med. 1992;152:56-64.
Stewart BF. et al. Benefits of lipid lowering therapy in men with elevated apoliprotein B are not confined to
those with very high low density lipoprotein cholesterol. J.A. Coll. Cardiol.1994; 23:899-906.
Ramrez A, et al. Comparacin entre la determinacin analtica del colesterol-LDL y su estimacin por
clculo. Mem. Inst. Invest. Cienc. Salud , 2005 Vol. 3 (1), 43-46.
Page 34
Modificado bajo autorizacin de: Trostchansky, A.; Trujillo, M.; Castro, L.; y Rubbo, H. Estudio
de las modificaciones oxidativas de la lipoproteina de baja densidad (LDL): anlisis de la
oxidacin del componente lipdico y proteico. Actividad Prctica UTI-DREMR Departamento de
Bioqumica Facultad de Medicina, 2007.
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LH
RH
INICIACION
HOO
O2
LOOH
OO
PROPAGACION
LOO
L + L
LOO + LOO
L + LOO
XH + L
XH + LOO
LH
LL
LOOL + O 2
LOOL
X + LH
X + LOOH
TERMINACION
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DIA 3
PRCTICO 2
OXIDACIN DE COMPONENTES NO LIPDICOS EN LDL
Objetivo 1.
Estudiar la oxidacin de los carotenoides presentes en la LDL por diferentes oxidantes
Reactivos
LDL purificada
CuSO4 (5 mM)
H2O2 (100 mM)
Amortiguador fosfato 50 mM, pH 7.4
Medida de oxidacin de carotenoides.
1) Determinar la concentracin de LDL mediante la medida de absorbancia a 280 nm ( 280 = 1
mg/mL, PM: 500.000 g/mol).
2) Realizar un espectro de absorbancia para la LDL entre 380 y 550 nm para determinar el
mximo de absorbancia para los carotenoides.
3) Tome 4 tubos y prepare un volumen final de 1 mL con las siguientes condiciones:
A)
B)
C)
D)
4) Sin demora pase el contenido de los tubos a cubetas de 1 mL y realice medidas puntuales a
460 nm (o el mximo determinado en el espectro) cada 3 minutos, durante 60 minutos para
las tres condiciones.
No olvide ajustar previamente el cero del espectrofotmetro con agua o buffer
5) Preparacin de muestras para electroforesis (objetivo 2) prepare un duplicado de A y C. Para
el tubo A retire 40 L a tiempo 0 y 60 min, para el tubo C retire 40 L a tiempo 30, 45 y 60
min. A medida que vaya obteniendo las alcuotas agregue 10 L de buffer de la muestra 5x.
Page 39
Objetivo 2.
Estudiar la oxidacin de Apo B100 por CuSO4/H2O2
Reactivos
Muestras obtenidas en objetivo 1
Buffer de corrida Tris-glicina stock 10x pH=8,3.
Gel de agarosa al 0,5%
Buffer de muestra 5x
Solucin de Destain
Solucin de tincin Coomasie Brillant Blue R-250
Solucin de fijacin de etanol:actico:agua (60:10:30).
Electroforesis en agarosa.
a. Se siembran por pocillo hasta 20 L de solucin de muestra con una cantidad final de
protena entre 10 a 20 g.
b. Corrida: 40 minutos a 65 voltios constante (aprox.30 mA) + 15 minutos a 90 voltios
c. Fijacin: 10-20 minutos en solucin de fijacin (antes de fijar poner en el congelador la
solucin de fijacin y de tincin).
d. Deshidratar el gel por peso entre papel de filtro seco (45 minutos mnimo)
e. Coloracin: 10 minutos en solucin de tincin
f. Decoloracin: 1 hora (o hasta que exista buen contraste bandas/fondo) en destain con
cambios sucesivos de la solucin
Procesamiento de datos
Calcular la concentracin de la LDL purificada
Presentar espectro de la LDL, sealando el mximo de absorbancia para los
carotenoides.
Calcular las pendientes para cada una de las condiciones y discutir el resultado obtenido
con los diferentes oxidantes utilizados.
Graficar las medidas realizadas en funcin del tiempo identificando, donde amerite, las
fases de latencia, propagacin y terminacin.
Para el caso de la electroforesis, y de acuerdo a la literatura, identificar las especies
presentes en cada carril.
Bibliografa
Herrera E. Metabolismo de las Lipoprotenas. In: Graw-Hill IM, ed. Elementos de Bioqumica, 1993.
Esterbauer H, Gebicki J, Puhl H, Jurgens G. The role of lipid peroxidation and antioxidants in oxidative
modification of LDL. Free Radic Biol Med 1992; 13:341-90.
Westhuyzen J. The oxidation hypothesis of atherosclerosis: an update. Ann Clin Lab Sci 1997; 27:1-10.
Cosgrove JP, Church DF, Pryor WA. The kinetics of the autoxidation of polyunsaturated fatty acids. Lipids
1987; 22:299-304.
Trostchansky, A., Batthyany, C., Botti, H., Radi, R., Denicola, A., and Rubbo, H. Formation of lipid-protein
adducts in low-density lipoprotein by fluxes of peroxynitrite and its inhibition by nitric oxide. Arch. Biochem.
Biophys. 395: 225-232.; 2001
Trostchansky, A., Ferrer-Sueta, G., Batthyany, C., Botti, H., Batinic-Haberle, I., Radi, R., and Rubbo, H.
Peroxynitrite-mediated LDL oxidation is inhibited by manganese porphyris in the presence of uric acid.
Free. Rad. Biol. Med. 35: 1293-1300; 2003
DIA 4
Objetivo 1.
Oxidacin lipdica de LDL por consumo de oxgeno
Reactivos
LDL purificada
CuSO4 (5 mM)
Amortiguador fosfato 50 mM, pH 7.4
Equipo
Oxmetro con electrodo tipo Clarck y bao termostatizado
Medidas de consumo de oxgeno.
CALIBRACIN: El oxmetro se calibra al 100% de oxgeno mediante el burbujeo con pipeta
pasteur durante algunos minutos para saturar con aire la cmara que contiene agua solamente.
Posteriormente esperar a que se estabilice la medida y llevar a 100% con la perilla de CAL. La
concentracin de O2 correspondiente al 100% depende de la temperatura:
Temperatura (C)
O2 nmoles/mL
5
397
10
351
15
314
20
284
25
258
28
244
30
237
35
222
37
217
Una vez calibrado se puede empezar a trabajar.
No olvidar dejar con agua la cmara una vez que se termina de trabajar.
La oxidacin de la LDL se lleva a cabo a 25C en presencia de Cu(II) de acuerdo a
Batthyany C. et al (Arch. Biochem. Biophys., 2000).
En un volumen final de 2 mL, se incuba LDL (0.5 mg/mL, concentracin final) en buffer
fosfato 50 mM, pH 7.4 con CuSO4 en una relacin LDL/Cu(II) de 1:75. La mezcla de reaccin se
coloca sin demora en la cmara del oxmetro de 1.6 mL de volumen final con agitacin
constante.
El consumo de oxgeno se registra cada 3 min. durante 100 minutos.
Page 41
Objetivo 2.
Oxidacin lipdica de LDL por TBARS.
La tcnica se basa en la reaccin de ciertos compuestos aldehdicos (provenientes de la
lipoperoxidacin) con el cido 2-tiobarbitrico.
Reactivos
LDL purificada
CuSO4 (5 mM)
Amortiguador fosfato 50 mM, pH 7.4
MDA (malondialdehdo) 100 M
Sol.TCA/TBA/HCl
BHT 2.5 % w/v en etanol (0.05 g en 2 mL)
TCA: cido tricloroactico
TBA: cido tiobarbitrico
TMP = MDA: malondialdehdo
Realice la siguiente curva de calibracin
MDA (M)
0
0.5
1
2
3
5
7
9
Page 42
Procesamiento de datos
1) Graficar los datos obtenidos en la oximetra identificando las fases de latencia, propagacin y
terminacin.
2) Indicar para cada fase los principales intermediarios involucrados y que funcin cumplen:
reductor u oxidante.
Referencias
Herrera E. Metabolismo de las Lipoprotenas. In: Graw-Hill IM, ed. Elementos de Bioqumica, 1993.
Esterbauer H, Gebicki J, Puhl H, Jurgens G. The role of lipid peroxidation and antioxidants in oxidative
modification of LDL. Free Radic Biol Med 1992; 13:341-90.
Westhuyzen J. The oxidation hypothesis of atherosclerosis: an update. Ann Clin Lab Sci 1997; 27:1-10.
Cosgrove JP, Church DF, Pryor WA. The kinetics of the autoxidation of polyunsaturated fatty acids. Lipids
1987; 22:299-304.
Trostchansky, A., Batthyany, C., Botti, H., Radi, R., Denicola, A., and Rubbo, H. Formation of lipid-protein
adducts in low-density lipoprotein by fluxes of peroxynitrite and its inhibition by nitric oxide. Arch. Biochem.
Biophys. 395: 225-232.; 2001
Trostchansky, A., Ferrer-Sueta, G., Batthyany, C., Botti, H., Batinic-Haberle, I., Radi, R., and Rubbo, H.
Peroxynitrite-mediated LDL oxidation is inhibited by manganese porphyris in the presence of uric acid.
Free. Rad. Biol. Med. 35: 1293-1300; 2003
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La alta proliferacin de clulas tumorales lleva al desarrollo de masas tumorales que por su
rpido crecimiento no se vascularizan adecuadamente, dejando poblaciones celulares distantes
de los vasos sanguneos y como consecuencia son hipxicas. A pesar de que la hipoxia tumoral
es un problema al conferir resistencia a las terapias antitumorales actuales, en las circunstancias
apropiadas puede ser visto como una ventaja. La identificacin de la sobreexpresin de algunas
enzimas en clulas tumorales hipxicas como DT-diaforasa, CYP450, xantina oxidasa y aldehdo
oxidasa llev al desarrollo de un grupo especial de agentes citotxicos conocidos como
profrmacos bio-reducibles en hipoxia. Estos profmacos son compuestos inactivos per se que
se reducen enzimticamente in vivo a un intermediario, frmaco que es citotxico, siendo este
proceso reversible en presencia de oxgeno. De esta forma disear un profrmaco sustrato de
alguna de estas enzimas puede ser una buena estrategia para el desarrollo de frmacos
antitumorales ms selectivos.
Esto llev al desarrollo de profrmacos derivados de dixidos de fenazinas, diseadas como
posibles interactuantes con ADN (figura 1). Los dixidos de fenazina poseen grupos N-xido que
pueden bio-reducirse en condiciones de hipoxia. De manera que los dixidos de fenazina
pueden ser reducidos a la correspondiente fenazina (totalmente reducida, frmaco II, figura 1).
Este proceso en condiciones de oxigenacin normal (normoxia) es revertido.
O2
O2
O
N
NH2
normoxia
NH2
2 OH
Br
N
O
hipoxia
2 electrones
DT-diaforasa
Br
Fenazina
Dixido de fenazina
Page 44
Es as que en base a la hiptesis que los dixidos de fenazinas son capaces de sufrir procesos
de bio-reduccin en hipoxia, llevaremos a cabo un estudio enzimtico para verificar si
efectivamente estos compuestos son capaces de bio-reducirse. Para ello se estudiar la bioreduccin de un derivado de dixido de fenazina en presencia de fraccin citoslica de
hepatocitos de rata y un sistema generador de NADPH (cofactor de algunas de las posibles
enzimas involucradas en la bio-reduccin) en condiciones de hipoxia y oxigenacin normal. A su
vez se estudiar si la bio-reduccin es exclusivamente enzimtica realizando el mismo
procedimiento en ausencia del sistema generador de NADPH y por otro lado utilizando fraccin
citoslica inactivada trmicamente.
Tambin se confirmar la participacin de la enzima DT-diaforasa en la bio-reduccin. Para ello
se utilizar dicumarol, inhibidor de la actividad de esta enzima y se analizar los productos
formados durante la incubacin de las fenazina con fraccin citsolica pre incubada con este
inhibidor. La ausencia de productos de bio-reduccin, en el ensayo con el agregado de
dicumarol, confirmara la participacin de esta enzima en el proceso de bio-reduccin.
Tcnicas experimentales.
1)Bio-reduccin1. Se agrega un volumen a determinar de amortiguador fosfato (0.1M, 1.5 mM
EDTA, pH 7.4), 10 L de cada uno de los componentes de un sistema generador de NADPH
(1.3 mM MgCl2, 40 M NADP+, 3.5 mM glucosa-6-fosfato, 0.5U/mL glucosa-6-fosfato
deshidrogenasa), 10 L del dixido de fenazina disuelto en DMSO (40 mM) y un volumen a
determinar para que la concentracin final sea de 1mg/mL de fraccin citoslica (obtenida del
homogeneizado de hgado de rata Wistar de 3 semanas de 200g de peso corporal) para un
volumen final de 1mL. Se incuba durante 30 minutos a 37C. La bio-reduccin en condiciones
de hipoxia simulada se realiza gaseando con nitrgeno previamente la mezcla de buffer y
el sistema generador de NADPH durante 20 minutos, luego se agrega el dixido de
fenazina y la fraccin citoslica y se incuba durante 30 minutos a 37C.
2) Aislamiento de los productos resultantes de la bio-reduccin. La reaccin se detiene
agregando 400 L de metanol. Los productos se aslan realizando tres extracciones con 400 L
de acetato de etilo. El disolvente orgnico se destila a vaco y se resuspende en un volumen
mnimo de acetona o acetato de etilo.
Page 45
Concentracin
40 mM, en DMSO
21.53 mg/ml
1.3 mM
40 M
3.5 mM
0.5U/mL
40 mM, en DMSO
Referencias:
1. Lind, C.; Cadenas, E.; Hochstein, P.; Ernster, L. DT-diaphorase:
purification, properties and function. Methods in Enzymology, 186, 287301, 1990.
2. Danson, S.; Ward, T.; Butler, J.; Ranson, M. DT-diaphorase: a target for
new anticancer drugs. Cancer Treatment Reviews, 30, 437-439, 2004.
3. Lavaggi, M.; Cabrera, M.; Cerecetto, H.; Gonzlez, M. Differential
enzymatic reductions governing the differential hypoxia-selective
cytotoxicities of phenazine 5,10-dioxides. Chemical Research in
Toxicology. 21, 1900-1906, 2008.
4. Sun, Z-C.; Botros, E.; Su, A-D.; Kim, Y.; Wang, E.; Baturay, N.Z.; Kwon,
C-H. Sulfoxide-containing aromatic nitrogen mustards as hypoxiadirected bioreductive cytotoxins. Journal of. Medicinal. Chemistry. 43,
4160-4168, 2000
Page 46
Page 47
Absorbancia
2. Determinacin de la concentracin de
0.8
albmina. La albmina del plasma se
cuantificar utilizando el colorante prpura
0.6
BCP + HSA
de bromocresol (BCP), cuya absorbancia a
BCP
603 nm aumenta cuando est unido a la
0.4
albmina (Fig. 1). El valor de absorbancia
obtenido para el plasma se comparar con
0.2
una curva de calibracin realizada con
albmina bovina estndar. Cada dilucin se
0.0
realiza por triplicado. La actividad se realiza
300 350 400 450 500 550 600 650 700
completando la tabla de datos adjunta.
Longitud de onda (nm)
2.1. Preparacin de diluciones para la
Fig. 1. Espectro UV-vis de prpura de
curva de calibracin.
bromocresol (BCP, 40 M en amortiguador
- Rotular 7 x 3 tubos de ensayo.
actico, 0.1 M, pH 5.2) en ausencia (lnea
- Colocar 0, 5, 7.5, 10, 12.5, 15 y 20 L
punteada) y presencia (lnea continua) de
-1
de albmina bovina (BSA) estndar.
albmina humana (0.066 g L , 1 M).
- Completar a 20 L con agua.
2.2. Preparacin de diluciones de la muestra problema de plasma ovino.
- Rotular 2 x 3 tubos de ensayo.
- Colocar 5 y 20 L de plasma ovino.
- Completar a 20 L con agua.
2.3. Desarrollo de color y lectura de la absorbancia.
- Agregar 1 mL de BCP a cada tubo y agitar.
- Leer la absorbancia a 603 nm. Previamente, asignar una absorbancia cero colocando
agua en la celda.
- Anotar los valores de absorbancia en la tabla de datos.
2.4. Procesamiento de los datos.
- Calcular la concentracin de albmina en cada condicin de la curva de calibracin y
anotarla en la tabla de datos.
- Graficar absorbancia a 603 nm versus concentracin de albmina.
- Considerando la porcin lineal de la grfica, determinar la mejor recta y sus parmetros.
- Intrapolar en la curva de calibracin, utilizando los valores correspondientes a la dilucin
que caiga dentro de la grfica.
- Expresar la concentracin de albmina del plasma ovino en mg/mL de plasma y en M,
sabiendo que el peso molecular es de 66 kDa.
Tabla de datos para la determinacin de la concentracin de albmina
Tubo
Volumen
Volumen Volumen Volumen [BSA]
Absorbancia
BSA
agua
plasma BCP
final
a 603 nm
-1
(L)
(L)
(L)
(L)
(mg mL ) (blanco agua)
1a
0
20
1000
0
1b
0
20
1000
0
1c
0
20
1000
0
2a
5
15
1000
2b
5
15
1000
2c
5
15
1000
3a
7.5
12.5
1000
3b
7.5
12.5
1000
3c
7.5
12.5
1000
4a
10
10
1000
Page 48
4b
4c
5a
5b
5c
6a
6b
6c
7a
7b
7c
8a
8b
8c
9a
9b
9c
10
10
12.5
12.5
12.5
15
15
15
20
20
20
-
10
10
7.5
7.5
7.5
5
5
5
0
0
0
-
5
5
5
20
20
20
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
1000
O2N
NO2
COO-
R-S
NO2
-OOC
O2N
S-
absorbancia a 412 nm. Se deber restar las contribuciones a la absorbancia del reactivo y el
plasma por s solos.
- Segn tabla adjunta, rotular 3 x 3 tubos de ensayo.
- Colocar 150 L de agua (tubos 1, para controlar la contribucin del reactivo).
- Colocar 150 L de plasma (tubos 2 y 3).
- Colocar 1 mL de DTNB en los tubos 1 y 2.
- Colocar 1 mL de pirofosfato 0.1 M, pH 9, amortiguador en el cual se disuelve DTNB, en
los tubos 3, para controlar la contribucin del plasma.
- Leer la absorbancia a 412 nm. Previamente, asignar un valor de absorbancia cero a la
celda conteniendo agua.
- Determinar la concentracin de tioles totales en el plasma utilizando el valor del
coeficiente de absortividad del tionitrobenzoato, 412 = 14150 M-1 cm-1.
Tabla de datos para la determinacin de tioles totales
Tubo
Volumen Volumen Volumen Volumen Absorbancia
agua
plasma
DTNB pirofosfato
a 412 nm
(L)
(L)
(L)
(L)
(blanco agua)
1a
150
1000
1b
150
1000
1c
150
1000
Page 49
2a
2b
2c
3a
3b
3c
150
150
150
150
150
150
1000
1000
1000
-
1000
1000
1000
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Riener, C. K., Kada, G., and Gruber, H. J. (2002) Quick measurement of protein sulfhydryls with Ellman's
reagent and with 4,4'-dithiodipyridine. Anal. Bioanal. Chem. 373, 266-276.
Turell, L., Botti, H., Carballal, S., Radi, R. and Alvarez, B. (2009) Sulfenic acid - A key intermediate in
albumin thiol oxidation. J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 877(28):3384-92.
Alvarez, B., Carballal, S., Turell, L. and Radi, R. (2010) Formation and reactions of sulfenic acid in human
serum albumin. Meth. Enzymol. 473, 117-136.
Page 51