Pencucian harus dilakukan pada instrumen sebelum disinfeksi atau sterilisasi.
Pencucian merupakan komponen esensial dalam pemrosesan peralatan kesehatan. Sterilisasi tidak akan pernah tercapai tanpa pencucian yang baik. Kotoran dapat melindungi mikroorganisme dari kontak dengan agen pembunuh yaitu bahan disinfektan dan sterilan. Kotoran juga dapat bereaksi dan menginaktivasi bahan pencuci instrumen. Pencucian fisik, dengan penggosokan dapat mengurangi banyak kontaminasi mikroorganisme yang tersembunyi dalam kotoran yang terlihat. Praktek pencucian yang aman penting dilakukan untuk mengurangi mikroba kontaminan pada permukaan peralatan kesehatan. Rekomendasi pabrik harus diperhatikan dan dilakukan saat melakukan pencucian peralatan kesehatan. Hindari kontak dengan objek yang terkontaminasi. Kontak dengan objek terkontaminasi dapat meningkatkan resiko kontaminasi silang dan kontaminasi lingkungan. Instrumen yang dapat dilepaskan atau dibongkar harus dilepas atau dibongkar sebelum dicuci. Sehingga kotoran yang berada di sela-sela instrumen dapat dibersihkan. Faktor yang mempengaruhi proses pencucian: 1. Energi Kimia: Deterjen dan agen pencuci 2. Energi Termal: Suhu Pencucian 3. Energi Mekanis: Friksi dari penggosokan.