Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
Replikacija u prokariota
Pomou 5-3egzonukleazne aktivnosti intaktne
DNA polimeraze I moe se sintetizirati
segment DNA (ili RNA) koji se moe spariti sa
lancem kalupa.Ovaj proces se naziva translacija
zarezivanjem (nick translation). Translacija
zarezivanjemjeveoma vana za popravak DNA
molekule i za uklanjanje RNA primera tokom
replikacije.Veina DNA polimeraza nema
53egzonukleaznu aktivnost.
Pogled sa strane.
Sivo obojene podjedinice okruuju
dvostruki heliks DNA (svijetlo i tamno
plav).
Razdvajanje
lanaca
uzrokuje
topoloki stres u uzvojnikoj
strukturi DNA, koji se rjeava
djelovanjem topoizomeraza.
OriC, poetak replikacije u E.coli sadri 245 bp. Mada sekvence koje se
ponavljaju nisu identine, odreeni nukleotidi su visoko konzervirani i ine
tzv. konsenzusne sekvence. Na poloajima gdje ne postoji konsenzus, N
predstavlja bilo koji nukleotid. Strelice pokazuju orijentaciju nukleotidnih
sekvenci.
Kljune sekvence su sekvence sastavljene od 13 baznih parova koje se
ponavljaju uzastopno tri puta i etiri ponavljanja sekvenci koje sadre devet
baznih parova.U otpoinjanju replikacije sudjeluje najmanje devet enzima ili
proteina.Oni otvaraju DNA uzvojnicu na poetku (originu) i stvaraju kompleks
koji omoguava dalje reakcije.
(a)
Sinteza
Okazaki
fragmenata.Primaza
u
intervalima
sintetizira
RNA
primer
za
novi
Okazaki fragment. Ako
postavimo dva matrina
lanca jedan kraj drugoga
moemo primijetiti da se
sinteza tromog lanca odvija
u smjeru suprotnom od
smjera sinteze vodeeg
lanca.
(b) Svaki primer se
produava pomou DNA
polimeraze III.
(c) sinteza DNA lanca se nastavlja dok lanac ne dostigne primer prethodno
dodatog Okazaki fragmenta. Novi primer se sintetizira u blizini replikacijskih
ralji i proces se ponavlja.
Ovako gledano sinteza svakog Okazakijevog fragmenta ini se jednostavnom.
U stvarnosti radi se o mnogo kompleksnijem procesu, jer sintezu oba lanca
vri jedan asimetrini dimer DNA polimeraze III, a sinteza vodeeg i sporog
lanca DNA mora se odvijati koordinirano. Pri tome se spori DNA lanac svija u
petlje da bi se poravnale dvije take polimerizacije.
Sinteza
vodeeg
(sporog) lanca DNA.
tromog
Uklanjanje klice i
popunjavanje nastalog
jaza vri DNA
polimeraza I, a rez
koji preostaje
popunjava DNA ligaza.
Mehanizam reakcije
DNA ligazeDNA ligaza
katalizira stvaranje
fosfodiesterske veze
izmeu 3hidroksilnog
kraja jednog
fragmenta DNA na
sporom lancu i
5fosfata drugog
Okazaki fragmenta.
DNA ligaza je vaan
reagens u
eksperimentima s
rekombinantnom DNA.
Direktni popravak
Neke lezije u DNA popravljaju se bez uklanjanja baza ili nukleotida.Takav
primjer je direktna fotoreaktivacija ciklobutanskog pirimidinskog dimera.Ovu
reakciju zapoinje DNA fotoliaza koja koristi apsorbiranu svjetlosnu
energiju u pirimidinskom paru da bi katalizirala reverzibilnu reakciju
stvaranja monomernih pirimidina.
Rekombinacija V i J
genskih segmenata
ljudskog IgG kappa
lakog lanca.
Transkript (c) se
procesira pomou
RNA povezivanja (d),
a zatim se vri
translacija (e) uz
nastanak polipeptidalakog lanca. (f) Laki
lanac se moe
kombinirati sa bilo
kojim od 5.000
moguih tekih
lanaca da bi nastala
molekula antitijela.