NUCLETIDOS

Dra. Teresa Garca Gasca

Maestra en Nutricin Humana
Curso de Nivelacin

cul es la estructura de un
nucletido?
Los nucletidos
estn
formados por
una base
nitrogenada,
una pentosa y
uno, dos o tres
grupos fosfato.

A veces, los nucletidos contienen ms de un grupo fosfato, unidos entre s

mediante un enlace anhidro.

 Nucletidos de adenina: NAD+, NADP, FAD Y CoA

FADH2 (coenzima reducido)

Coenzima A

NADH (coenzima reducido)

NADPH (coenzima reducido)

" Intermediarios en biosntesis de otras biomolculas:

UDP-Glu, CDP-diacilglicerol

" Reguladores metablicos: AMPc, GMPc

AMP cclico (AMPc)
Algunos nucletidos actan como
intermediarios de la accin hormonal
(mensajeros qumicos). Son nucletidos
cclicos, en los que el cido ortofosfrico
esterifica dos hidroxilos (el 3' y el 5') de la
misma ribosa. Los ms comunes son la
adenosina-3', 5'-monofosfato o AMP cclico
(AMPc) y la guanosina-3',5'-monofosfato o
GMP cclico (GMPc).

Purinas
NH2
I
C
HN

Pentosas
O
II
C

HN

HO CH2

CH

CH
HC

H 2N

N
I
R5P

Adenina

N
I
R5P

Guanina

N
I
C
C

C
O

N
I
C

C
N
H

HN

C
O

C
N
H

CH3

OH
Desoxiribosa

Pirimidinas

HN

Ribosa
O
I
C
HN

C
O

HO CH2

Timina

OH

C
N
H

OH
Citosina

OH

Uracilo

OH

Desoxiribosa

POLINUCLETIDOS
Los polinucletidos son cadenas lineales de
nucletidos en los que los grupos fosfato estn
esterificados a los hidroxilos 5' y 3' de dos
nucletidos consecutivos
Como consecuencia, cada polinucletido contiene
nicamente un OH libre en el grupo fosfato en
posicin 5' (extremo 5' fosfato) y un OH libre en
posicin 3' (extremo 3').
Por convencin, la secuencia de los polinucletidos se
representa en el sentido 5'
3'. Los dos
polinucletidos presentes en los seres vivos son el
cido ribonucleico (RNA) y el cido
desoxirribonucleico (DNA).

DIFERENCIAS ENTRE EL DNA Y EL RNA

Peso molecular

DNA

pentosa

alto
desoxirribosa

RNA

bases nitrogenadas

timina

bajo
ribosa

uracilo

estructura

RNA
Es el AN ms abundante en la clula, y puede purificarse fcilmente. Una
clula tpica contiene 10 veces ms RNA que DNA. Segn las modernas
teoras sobre el origen de la vida, parece bastante probable que el RNA
fue el primer biopolmero que apareci en la corteza terrestre durante el
transcurso de la evolucin.

Existen diferentes tipos de RNA de acuerdo a su peso molecular

RNA HETEROGNEO NUCLEAR (RNAhn)

Es un RNA de alto peso molecular, tambin conocido como transcrito
primario del RNA, ya que es el RNA recin sintetizado por la RNA
polimerasa en el proceso de transcripcin.

En clulas procariotas, el transcrito primario acta directamente como

molde para la sntesis de protenas. En el ncleo de las clulas eucariotas
acta como precursor de los dems tipos de RNA que se encuentran en el
citoplasma. La fragmentacin del RNAhn para formar otros tipos de RNA
constituye la maduracin o procesamiento del RNA.

RNA PEQUEO NUCLEAR (RNAsn)

El RNA pequeo nuclear (RNAsn)
est presente en el ncleo, y es
de pequeo tamao. Est
implicado en los procesos de
maduracin del RNAhn. En este
proceso, el RNAsn se asocia a
protenas formando las
ribonucleoprotenas pequeas
n u c l e a r e s ( R N Psn) q u e s e
encargan de eliminar los
intrones. Cuando las RNPsn se
unen al precursor del RNAm para
eliminar los intrones se forma un
complejo RNA-protena de gran
tamao (espliciosoma).

RNA TRANSFERENTE (RNAt)

Las molculas de RNA transferente (RNAt) tienen entre 75 y 90
nucletidos, y su peso molecular es de unos 25000 dalton. Se conocen
unos 60 RNAt distintos, y se encuentran en todas las clulas.
Intervienen en la sntesis de protenas, ya que van unidos a un aminocido.
Su estructura secundaria presenta un plegamiento complejo en donde
alternan zonas apareadas y zonas no apareadas, y en donde se pueden
distinguir zonas crticas, como la zona de unin a aminocidos y la zona que
reconoce los codones del RNAm

RNA RIBOSMICO (RNAr)

Se conocen 3 4 tipos distintos de RNAr.

Su estructura secundaria y terciaria
presenta un plegamiento complejo que le
permite asociarse tanto a las protenas
integrantes de los ribosomas como a
otros RNAr y participar en el proceso de
sntesis proteica.

RNA MENSAJERO (RNAm)

El RNA mensajero (RNAm) se sintetiza sobre un molde de DNA y sirve de
pauta para la sntesis de protenas (traduccin).
Su peso molecular es alto y contiene nicamente los nuclotidos A, U, G y C.
Adems de contener codificada la secuencia de una protena, contiene
seales para la iniciacin (codn AUG, que codifica al aminocido metionina)
y terminacin de la sntesis (codones UAA, UAG o UGA).
En eucariotas, el RNAm maduro presenta en su extremo 5' una estructura
compleja llamada "capucha" (cap), y en su extremo 3' una cadena de poliA de
longitud variable. Estas modificaciones tienen por objeto aumentar la vida
media de estas molculas en el citoplasma.

La presencia de la cola de poliA en el extremo 3' de una

molcula de ARNm facilita enormemente su purificacin en una
cromatografa en columna de afinidad, ya que forma hbridos
con residuos de poliU unidos a una resina empaquetada en el
interior de la columna.

RNA VRICO (RNAv)

El RNA vrico (RNAv) es el que consituye el patrimonio gentico de ciertos
virus (retrovirus) como el bacterifago MS2, el virus del mosaico del
tabaco, el poliovirus, el virus de la rabia, el virus de la gripe o el virus del
SIDA. Su hallazgo supuso replantear el dogma central de la biologa:

Virus del SIDA

Virus de la gripe

RIBOZIMAS
Se conocen casos en los que las molculas de RNA se cortan y empalman por
sitios especficos, en ausencia de protenas. Estas molculas de RNA reciben
el nombre de ribozimas.
Las ribozimas presentan actividad cataltica en ausencia de protenas y
participan en el corte y enpalme de molculas precursoras de RNA que darn
lugar al ARNr.
Ciclo cataltico de una ribozima
La ribozima y
el sustrato

La ribozima se
une al sustrato

La ribozima
corta el
sustrato

Separacin de la
ribozima y los
productos finales

RNA interferente (RNAi)

DNA
Los cidos nucleicos fueron descubiertos por
Freidrich Miescher en 1869.
En los aos 20, el bioqumico Phoebus Levene determin que
el DNA estaba formado por 4 tipos distintos de nucletidos.
Cada nucletido estaba formado por desoxirribosa, fosfato
y una base nitrogenada (A, C, T o G).

En 1949, el bioqumico Erwin Chargaff analiz el

contenido molar de las bases de DNA procedente de
diversos organismos y descubri que en todos los casos
[A]=[T] y que [G]=[C], o lo que es lo mismo, [A+G]=[T+C]
([purinas]=[pirimidinas]). Esta es la llamada ley de
Chargaff.

A principios de los aos 50 Maurice Wilkins y Rosalind

Franklin realizaron los primeros estudios fsicos con
el DNA mediante la tcnica de difraccin de rayos
X y observaron que
1. La molcula de DNA es una cadena extendida con
una estructura altamente ordenada
2. La molcula de DNA es helicoidal y tiene 20 de
dimetro
3. La hlice del DNA est compuesta por dos hebras
helicoidales y
4. Las bases de los nucletidos estn apiladas con los
planos separados por una distancia de 3,4 .
Patrn de
difraccin
de rayos X
del DNA

En 1953, James Watson y Francis Crick combinaron los datos qumicos y

fsicos del DNA, y propusieron un modelo estructural del DNA.

Las dos hebras estn enrolladas una alrededor de la otra formando

una doble hebra helicoidal
Las dos cadenas de polinucletidos se mantienen equidistantes, al
tiempo que se enrollan en torno a un eje imaginario.
El esqueleto azcar-fosfato (formado por una secuencia alternante de
desoxirribosa y fosfato, unidos por enlaces fosfodister 5'-3') sigue
una trayectoria helicoidal en la parte exterior de la molcula.
Las bases se dirigen desde cada cadena al eje central imaginario. Las
bases de una hebra estn enfrentadas con las de la otra, formando los
llamados pares de bases (PB).
Las bases interaccionan entre s mediante puentes de hidrgeno. Las
dos bases que forman un PB estn en el mismo plano y dicho plano es
perpendicular al eje de la hlice.

La A se empareja siempre con la T mediante dos puentes de hidrgeno,

mientras que la C se empareja siempre con la G por medio de 3 puentes de
hidrgeno

Las dos hebras son antiparalelas.

Por convencin, la secuencia de bases de una hebra sencilla se escribe
con el extremo 5'-P a la izquierda.

ESTRUCTURA SECUNDARIA

En procariotas, as como en las mitocondrias y cloroplastos, el DNA se

presenta en forma circular, en la que la doble hlice se cierra por sus
extremos. Este DNA circular puede presentar diversos grados de
superenrrollamiento
En virus, el DNA puede presentarse como una doble hlice cerrada, como
una doble hlice abierta o simplemente como una nica hebra lineal.

En las clulas eucariotas, el DNA se encuentra localizado principalmente

en el ncleo, en forma de cromosomas, que son complejas asociaciones de
DNA y protenas

HISTONAS

1. Doble hlice

2. Collar de perlas

Nucleosoma

3. Solenoide
4. Bucles

6. Cromosoma

5. Espirales
condensadas

FACTORES QUE DETERMINAN LA ESTRUCTURA DEL DNA

La estructura helicoidal del DNA se mantiene gracias a
interacciones no covalentes. Por un lado, el apilamiento entre las
bases adyacentes de una misma hebra favorece interacciones
hidrofbicas entre stas, y por otro lado, cada base est unida a
su pareja mediante puentes de hidrgeno.
Es posible desnaturalizar al DNA mediante un simple aumento de
la temperatura.

La grfica que representa la medida de A260 en funcin

de la temperatura se llama curva de fusin del DNA. Esta
curva presenta las siguientes caractersticas:
1.- La A260 permanece constante hasta
temperaturas por encima de las
fisiolgicas. En este intervalo, la
molcula est en forma de doble hebra.
2.- El aumento de A260 tiene lugar en
un estrecho rango de temperaturas (6-8
C). El nmero de PB que se rompen
aumenta con la temperatura, y con ella
la A260. 3.- La A260 mxima es
aproximadamente un 37% mayor que el
valor inicial, y corresponde al estado en
que las dos hebras estn completamente
separadas.

Un parmetro muy til para caracterizar la evolucin de la fusin

es la temperatura a la que el aumento de la A260 ha llegado a la
mitad de su camino. Esta temperatura se llama temperatura de
fusin (Tm).
Se ha comprobado que la Tm aumenta con el contenido de G+C.
Como el par de bases G-C est unido por tres puentes de
hidrgeno (a diferencia del par A-T que slo presenta 2) se
requiere una temperatura ms alta para desnaturalizarlo.
Temperatura de fusin del
DNA (Tm)

Dependencia de Tm con el
contenido en G+C del DNA

Los reactivos que incrementan la

solubilidad de las bases (como el etanol)
disminuyen la Tm, ya que reducen la
interaccin hidrofbica que las mantiene
unidas

RENATURALIZACIN
DEL DNA

La renaturalizacin es un fenmeno de
unin al azar

Para que tenga lugar la renaturalizacin

deben cumplirse dos requisitos:
1. La concentracin salina debe ser alta
([NaCl] entre 0,15 y 0,5 M) para eliminar
la repulsin entre los grupos fosfato de
las dos hebras.
2. La temperatura deber ser lo
suficientemente elevada como para
romper los puentes de hidrgeno
intracatenarios producidos al azar en el
DNA monocatenario, y lo suficientemente
baja como para estabilizar los
apareamientos correctos entre las bases
de hebras distintas. La temperatura
ptima de renaturalizacin es de unos 20
a 25 C por debajo de la Tm.

HIBRIDACIN DEL DNA

Cuando el DNA renaturalizado se forma a partir de molculas
de DNA de distinto origen la renaturalizacin se conoce como
hibridacin.

Una caracterstica importante de la

hibridacin es que no slo se puede
producir entre dos DNA distintos, sino
tambin entre DNA y RNA, siempre
que sus secuencias de nucletido sean
complementarias.

PROPIEDADES BIOLGICAS DEL DNA

En las clulas eucariotas, el DNA est presente en el ncleo,
as como en mitocondrias y cloroplastos. En procariotas, el
DNA se encuentra en el citoplasma celular.
RESISTENCIA A LA ALTERACIN DE LAS BASES (MUTACIN)

Si aparece una base incorrecta, su

emparejamiento se ve impedido, y la doble
hlice se altera. Estos errores pueden ser
reparados por medio de diversos mecanismos
celulares.

DUPLICACIN DEL MATERIAL GENTICO

Las clulas hijas deben tener la misma dotacin gentica que su
progenitora. Para obtener esta duplicacin exacta, basta la
separacin de las dos cadenas de la doble hlice progenitora y
la sntesis de las hebras complementarias

TRANSCRIPCIN DE LA INFORMACIN GENTICA

La complementariedad de
bases permite a la clula
sintetizar una molcula de
RNA m con una secuencia
complementaria a la de una de
las hebras del DNA. Este
proceso se denomina
transcripcin. La molcula de
RNAm recin sintetizada
servir como molde para la
sntesis de protenas en un
proceso denominado
traduccin. Esta serie de
procesos se conoce como el
dogma central de la Biologa.