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Historique de Microbiologie

Ds lAntiquit, on croyait lexistence dagents infectieux transmissibles,


invisibles lil nu. Les micro-organismes seront observs pour la premire fois
en 1677 par Antoine van Leeuwenhoek et son microscope.
A partir de 1857, Louis Pasteur met en vidence le rle des micro-organismes
dans les fermentations lactique et alcoolique.
En 1884, Hans Christian Gram dveloppe une technique de coloration (nomme
coloration de Gram ) qui permet la classification des bactries.
Il faudra attendre 1928 pour quAlexander Fleming dcouvre les proprits
antibactriennes de la pnicilline ; puis 1997 pour que le premier gnome
bactrien (celui dEscherichia coli) soit squenc.

A. Antoine van Leeuwenhoek (1632-1723)


Antoine van Leeuwenhoek a amlior
le microscope en 1677, en polissant
des lentilles la main. Cet outil qui
grossissait 300 fois a ainsi permis la
dcouverte des bactries. Cest le
premier avoir tudi les microorganismes et la biologie cellulaire.

B. Louis Pasteur (1822-1895)


A partir de 1854, Pasteur tudie les
processus de fermentation. Ses
recherches staleront sur 15 ans. Il
constate, grce au microscope, que
toutes les fermentations sont luvre
de micro-organismes : les ferments.

lextrieur dehors, Pasteur tablit les


rgles de bases de lasepsie.

En 1862, grce lexprience du


ballon col de cygne, il dmontre
quun liquide reste inaltr en
prenant la prcaution de le mettre
labri des micro-organismes. En
revanche, si ce liquide est laiss
lair libre, de nombreux microbes sy
dveloppent. (Cest la dcouverte de
la notion de strilit dun milieu).
Louis Pasteur isolera 3 germes entre
1878 et 1880 : le streptocoque, le
staphylocoque et le pneumocoque.
En affirmant que chaque maladie a
son microbe et que celui-ci vient de
1

En 1880, Pasteur travaille sur le cholra des poules. Il dcouvre que les animaux
ne meurent pas si on leur injecte la culture dun microbe vieilli. De plus, ces
mmes poules inocules quelques jours plus tard avec une culture trs virulente,
demeurent en parfaite sant : elles sont vaccines. Louis Pasteur russit
affaiblir le virus de la rage en suspendant une moelle contamine dans un bocal
dont lair est assch. Il applique pour la premire fois, avec succs, son vaccin
antirabique un jeune garon, Joseph Meister, le 6 juillet 1885.
Il recherchera ensuite les causes possibles des altrations du vin. Il dmontre que
les responsables sont des germes bactriens parasites au processus de
fermentation naturel. Il apprend alors aux industriels ne travailler quavec des
germes purs et leur montre comment des instruments mal lavs deviennent
rapidement le refuge de germes parasites. Il invente une technique appele
pasteurisation. Elle consiste chauffer le liquide quelques minutes une
temprature situe entre 55 et 60C afin dliminer les germes indsirables du
milieu.

C - Robert Koch (1843-1910)


Lobservation du bacille du
charbon (Bacillus anthracis) dans
le sang de patients dcds,
isolement de la bactrie et rinnoculation des animaux sains
--> conduit la maladie et
l'isolement de la mme bactrie
qui est donc l'agent infectieux.
-Isolement de Mycobacterium
tuberculosis (bacille de Koch)
Robert Koch (1843-1910)
Postulats de Koch
1er isoler l'agent suspect dune victime de la maladie
2me croissance de l'agent en culture pure
3me infecter un hte sain et montrer que cet organisme prsente alors les
mmes symptmes cliniques
2

4me r-isoler le "mme" agent de la nouvelle victime

D- QUELQUES DATES MARQUANT LHISTORIQUE DE LA


MICROBIOLOGIE

Ds l'Antiquit, on postulait l'existence d'agents infectieux transmissibles


invisibles l'il nu.
1546 : Jrme Fracastor impute la transmission des maladies des germes
vivants, qu'il appelait seminaria .

1677 : Dcouverte des bactries par le microscopiste hollandais


Antoine van Leeuwenhoek.

1828 : Christian Gottfried Ehrenberg utilise pour la premire fois le terme


bactrie.

1840 : Le pathologiste allemand Jacob Henle propose une thorie des


germes pour les maladies.

1857-1876 : Louis Pasteur met en vidence les rles des microorganismes dans la fermentation lactique et alcoolique. Il dveloppe les
techniques de pasteurisation et de strilisation lui permettant la mise en
place de cultures pures de micro-organismes. La possibilit de culture a
permis de dmontrer que la gnration spontane tait une aberration.

1877-1895 : Louis Pasteur dmontre que des maladies sont la


consquence de la prsence de ces micro-organismes. Premires
recherches systmatiques sur l'origine de certaines maladies, ainsi que la
vaccination (connue depuis Edward Jenner pour la variole - maladie virale).

1873-1882 : Robert Koch met en vidence le bacille responsable de la


tuberculose (Mycobacterium tuberculosis). Koch a tabli les rgles
(toujours utilises) qui permettent de dmontrer rigoureusement qu'une
bactrie donne est l'origine d'une infection.

1884 : Hans Christian Gram dveloppe une technique de coloration qui est
la plus utilise dans l'tude et la classification des bactries en deux
grands groupes : les bactries Gram positif et celles Gram ngatif.

1912 : Paul Ehrlich dcouvre le premier traitement efficace (driv


d'arsenic) contre la syphilis. C'est la premire fois qu'on traite avec un
agent chimiothrapeutique une maladie bactrienne.

1917 : Dcouverte des bactriophages par Frederick Twort et Felix


d'Herelle.

1928 : Frederick Griffith dcouvre la transformation bactrienne et tablit


les fondements de la gntique molculaire.

1929 : Alexander Fleming dcouvre les proprits antibactriennes de la


pnicilline produite par Penicillum. L'humanit entre dans l're des
antibiotiques.

1944 : Albert Schatz et Selman Waksman dcouvrent un autre antibiotique:


la streptomycine qui sera bientt utilise contre la tuberculose.
3

1960 : Franois Jacob, David Perrin, Carmen Sanchez et Jacques Monod


proposent le concept d'opron pour le contrle de l'expression des gnes
bactriens.

1977 : Carl Woese tudie l'ARN ribosomal pour dcouvrir une troisime
forme de vie, les Archae, distincte gntiquement des bactries et des
eucaryotes.

1986 : En utilisant une enzyme de la bactrie Thermus aquaticus, Kary


Mullis invente la technologie de PCR (Polymerase Chain Reaction). La
technique de PCR est devenue l'outil de base de la biologie molculaire.

1995 : Squenage complet du premier gnome bactrien (Haemophilus


influenzae) par Craig Venter et ses collgues du TIGR. La microbiologie
entre dans l're de la gnomique.

II. Classification et caractristiques


L'analyse de la structure interne a permis de dterminer deux groupes de micro-organismes :
les procaryotes (ou bactries, munis d'un proto-noyau) et les eucaryotes (munis d'un vrai
noyau)

Procaryotes (groupe polyphyltique comprenant en fait des taxons de


rangs distincts)
o Archaea, archobactries
o

Eubactries

Eucaryotes (groupe monophyltique ou taxons simples)


o

Algues

Champignons

Protozoaires

Les deux groupes se sont diffrencis trs tt du point de vue phylogntique.

A.

Les Procaryotes

1-Les Archobactries
Les archobactries sont des bactries primitives qui se distinguent des
Eubactries (bactries vraies ) par certains caractres biochimiques comme la
constitution de la membrane cellulaire ou le mcanisme de rplication de leur
ADN (Acide DsoxyriboNuclique).

Le groupe des Archobactries ou Archaea ne comprend essentiellement que des


espces anarobies, cest--dire nayant pas besoin doxygne. Elles sont trs
diversifies. Certaines sont connues pour leur capacit vivre dans des milieux
extrmes et occupent des niches cologiques quelles sont souvent seules
occuper comme les milieux trs acides, trs sals ou trs chauds. Par exemple,
Acidophilus thermophilus sest adapte aux conditions (acides et brlantes) de
vie dans les geysers. Dautres vivent dans des milieux plus courants comme le
sol, la mer ou lintestin des animaux.

2- Les Eubactries
On retrouve les bactries dans notre quotidien, sol, nourriture

B.

Les Eucaryotes

Les Eucaryotes ont un systme membranaire interne enfermant des organites


comme le noyau, les mitochondries ou les vacuoles. Le noyau contient le matriel
gntique de la cellule. Les mitochondries librent lnergie fournie par les
aliments : ce sont les centrales nergtiques de la cellule. Les vacuoles sont de
petites cavits membranaires charges dune multitude de fonction dont la
dcomposition de substances absorbes par la cellule (digestion).
Ils prsentent un cytosquelette interne constitu de tubules et de filaments qui
peuvent se contracter. Ils sont essentiels pour les mouvements internes et la
division (mitose) de la cellule.
Les protistes regroupent les tres vivants mobiles et unicellulaires. Le rgne des
protistes se divise principalement en trois groupes : les protozoaires affinits
animales, les protophytes affinits vgtales et les myxomyctes affinit
fongique.

1. Les protozoaires
Ils se trouvent dans le sol, leau douce, leau de mer, mais aussi comme parasites
des animaux et des Hommes. Les protozoaires ne possdent pas de paroi
cellulaire. Ils se nourrissent par endocytose : le protozoaire met dans la direction
de sa proie des protubrances cytoplasmiques (pseudopodes) qui l'enveloppent,
puis les pseudopodes se rejoignent, et la proie est alors enferme dans une
vsicule dans le cytoplasme-mme. Elle sera digre grce l'intervention
d'enzymes digestives.
Remarque : selon la taille du matriel absorb, on distingue la pinocytose
(ingestion de fluides ou de macromolcules) et la phagocytose (absorption de
grosses particules voire de cellules).
Parmi les protozoaires, on peut citer les amibes avec leurs pseudopodes, les cilis
qui possdent deux noyaux (macro et micronuclus) et les sporozoaires qui sont
des parasites.

2. Les algues
Contrairement aux champignons et aux protozoaires, les algues ont des pigments
chlorophylliens. Ce sont des tres vivants capables de photosynthse dont le
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cycle de vie se droule gnralement en milieu aquatique.Les algues sont


prsentes dans le sol, les plantes, leau douce et leau de mer.
Elles sont autotrophes, cest--dire quelles ont la capacit de produire de la
matire organique en procdant la rduction du carbone minral (dioxyde de
carbone). Cela s'accompagne d'un prlvement de sels minraux dans le milieu.
La majorit des protophytes constitue le phytoplancton.

3. Les champignons
Les champignons sont prsents dans le sol, les plantes, les dbris vgtaux, le
lichen. Ils peuvent tre parasites de lHomme, des animaux et des plantes.
Les champignons sont absorbotrophes (ils se nourrissent par absorption). Ils
secrtent des enzymes qui digrent des polymres dans le milieu extrieur : ce
mcanisme chimique transforme par exemple les glucides en petites molcules
qui sont ainsi absorbes.
Parmi les champignons on peut citer les levures. Ce sont des champignons
unicellulaires qui provoquent la fermentation de matires organiques animales ou
vgtales. Elles sont employes pour fabriquer le pain, la bire, le vin (dans ce
dernier cas, Saccharomyces cerevisiae intervient cf Annexe 1).

4. Les lichens (association champignon-algue)


Un lichen est une association entre un champignon htrotrophe (ascomycte) et
une algue verte (cyanobactrie). Cette symbiose est durable et reproductible:
elle donne naissance de nouveaux individus. Le champignon fournit le support,
les sels minraux et la rserve d'humidit, tandis que l'algue apporte les
nutriments issus de la synthse chlorophyllienne.

III.Taille des micro-organismes


Un microscope optique peut distinguer les objets de moins dun micromtre
tandis quun microscope lectronique peut dtailler ceux infrieurs 0,1
nanomtre (milliardime de mtre).
Les cellules eucaryotes ont un diamtre allant de 5 30 micromtres. Une
bactrie mesure environ le dixime de la taille dune cellule animale ou vgtale.

procaryotes (bactries) : de l'ordre de 0,5 3 m (pour la largeur), pas de


limite en longueur ; le pouvoir sparateur de l'il humain est de 100 m
(10-6m soit 0.1 mm), ces micro-organismes sont donc tous invisibles l'il
nu.
eucaryotes : trs variable de 2 200 m (pour la largeur), pas de limite en
longueur ; certains eucaryotes sont visibles l'il nu (notamment les
algues), d'autres ne sont visibles que sous forme d'agrgats (cas des
champignons, dont les parois plasmiques mettent des filaments sur une
grande longueur relativement leur taille). Tous les eucaryotes ne
s'agrgent pas ainsi (notamment les protozoaires, invisibles l'il nu).
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DIFFERENCE ENTRE CELLULE EUCARYOTE ET CELLULE PROCARYOTE

CELLULE EUCARYOTE ET CELLULE PROCARYOTE : SHEMAS

LE MONDE MICROBIEN : CLASSIFICATION

Espace Etudiant
Cours de Bactriologie Gnrale
Objectifs : Connatre les principes de classification des organismes vivants et la place des
procaryotes
DEFINITIONS, CLASSIFICATION ET NOMENCLATURE DES BACTERIES
PLACE DES BACTERIES DANS LE MONDE VIVANT
En 1673, Antoni Van Leeuwenhoek (1632-1723) fut le premier observer les bactries quil appela
animalcules. En plus de la premire description des globules rouges et des spermatozoides, ce drapier
hollandais observa pour la premire fois les bactries et dcrivit leur diffrentes formes.

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Ce nest que deux sicles plus tard que le rle des bactries dans les processus de fermentation et
dans la transmission des bactries a t dcouvert et que leur tude a commenc. Les scientifiques les
plus illustres de cette poque furent Louis Pasteur et Robert Koch.

Louis Pasteur

Robert Koch

Luniversalit du code gntique a montr que tous les organismes vivants, eucaryotes et procaryotes,
descendent dun seul et mme anctre. Ltude de gnes existants chez tous les tres vivants, du fait
de fonctions mtaboliques particulirement importantes, comme ceux codant pour les ARN
ribosomiques, a montr que leurs squences ont peu vari au cours des ges et que la comparaison de
ces squences permet de trouver les relations existant entre organismes.
Les procaryotes, prsents lorigine de la vie, ont donn naissance aux Archaebactries et aux
Eubactries donnant le classement suivant :
la branche des Eucarya (ou eucaryotes avec 4 rgnes : animal, vgtal, champignons, et
protistes),
la branche des Archaea (archaebactries vivant dans les milieux hostiles : mthanognes,
halophiles, Sulfolobus),

la branche des Eubacteria (bactries proprement dites).

Grce aux tudes comparatives, il est propos un autre classement, plus ou moins arbitraire, des
formes de vie en 5 rgnes, tous issus directement dun anctre commun :

les Monres (ensemble des procaryotes, cellules sans noyau),


les Protistes (ensemble des procaryotes unicellulaires avec noyau),

les Myctes (ou champignons, qui regroupent les organismes eucaryotes htrotrophes et
possdant une paroi),

les Vgtaux (organismes autotrophes avec paroi),

les Animaux (organismes eucaryotes htrotrophes sans paroi).

La sparation entre les Monres et les autres rgnes est facile. Les limites entre les quatre autres
rgnes sont plus floues.
Dans aucune classification, les virus ne forment un rgne en tant que tel. Ils ne sont pas considrs
comme des tres vivants. Les virus sont classs en ordre, famille, genre, et espce.
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De nombreuses thories existent sur la phylognie des tres vivants : larbre phylognique reprsent
ici exprime lune des thories.
Organisation des cellules eucaryotes et procaryotes
Structure cellulaire
Taille
Noyau
Nuclole
Membrane nuclaire
Mitochondrie
Lysosome
Appareil de Golgi
Rticulum endoplasmique
Ribosome

eucaryote
2 - 20 mm
prsence
plusieurs chromosomes
prsence
prsence
prsence
prsence
prsence
prsence
prsence
association au RE rugueux

procaryote
0,3 - 2,5 m
absence
un seul chromosome
absence
absence
absence
absence
absence
absence
prsence

TAXONOMIE ET CLASSIFICATION DES BACTERIES


La taxonomie est lensemble des principes et thories qui permettent de classer et de valider le
classement des organismes.
Les microorganismes sont classs en taxons, ou groupes, sur la base de leurs relations phntiques
et/ou phylogntiques. La classification des bactries est maintenant tablie de manire
phylogntique. Les mthodes molculaires utilises permettent de connatre les relations entre les
bactries.
Luniversalit du code gntique a montr que tous les organismes vivants, eucaryotes et procaryotes,
descendent dun seul et mme anctre. Ltude de gnes existants chez tous les tres vivants, du fait
de fonctions mtaboliques particulirement importantes, comme ceux codant pour les ARN
ribosomiques, a montr que leurs squences ont peu vari au cours des ges et que la comparaison de
ces squences permet de trouver les relations existant entre organismes.
Les procaryotes, prsents lorigine de la vie, ont donn naissance aux Archaebactries et aux
Eubactries donnant le classement suivant :
la branche des Eucarya (ou eucaryotes avec 4 rgnes : animal, vgtal, champignons, et
protistes),
la branche des Archaea (archaebactries vivant dans les milieux hostiles : mthanognes,
halophiles, Sulfolobus),

la branche des Eubacteria (bactries proprement dites).

Grce aux tudes comparatives, il est propos un autre classement, plus ou moins arbitraire, des
formes de vie en 5 rgnes, tous issus directement dun anctre commun :

les Monres (ensemble des procaryotes, cellules sans noyau),


les Protistes (ensemble des procaryotes unicellulaires avec noyau),

les Myctes (ou champignons, qui regroupent les organismes eucaryotes htrotrophes et

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ntroduction la taxonomie bactrienne :


Introduction | Actinobacteria | Bacteroidetes | Chlamydiae | Firmicutes | Fusobacteria | Proteobacteria | Spirochaetes

La taxonomie (on dit aussi taxinomie) est la science qui en Biologie tudie la classification des tres
vivants. Ce besoin de classification provient du fait que tous les organismes vivant actuellement et
aussi ceux dont l'espce est teinte, proviennent d'organismes ancestraux, par le mcanisme
complexe
de
l'volution
des
espces.
De par la diversit des tres vivants rencontrs, ce classement est trs difficile effectuer et en fait, il
n'est pas "arrt", mais en constante volution, au fur et mesure que de nouvelles tudes et de
nouvelles
dcouvertes
sont
ralises.
Les trs nombreuses espces de bactries connues entrent dans cette classification et c'est ce que
nous
allons
voir
brivement
ici.

Un

anctre

commun

ou

bien

une

communaut

d'anctres

Voici reprsent schmatiquement les trois grands domaines d'tres vivants, drivant tous
sembletait-il,
d'un
anctre
commun
:
-

Les
les

archaebactries
bactries
les

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(ou
(ou

archobactries)
eubactries)
eucaryotes

Reprsentation schmatique de "l'arbre de la vie".


Il est noter que la notion d'anctre commun est de plus en plus discute et semble peut-tre remise
en question au sein de la communaut scientifique. En effet, il serait possible qu'un grand nombre
"d'organismes ancestraux" plus ou moins proches les uns des autres et ne drivant pas forcment
tous d'un anctre commun unique, aient t l'origine de la diversification ultrieure en bactries,
archaebactries
et
eucaryotes.
NB : Il est noter que les virus sont des "organismes" part, parasites, sans noyaux, et qu'ils
n'entrent dans aucune des trois catgories ci-dessus. On peut les regrouper sous le vocable
d'ACARYOTES.
De nos jour, la connaissance de la squence nuclique de certaines molcules comme les ARNs
ribosomiques par exemple, permet de dresser des schmas dit philogntiques tablissant la
distance gntique qu'il existe entre les espces. En effet, plus la squence nuclique sera proche,
plus les espces tudies seront voisines. A l'inverse, si la squence nuclique est moins homologue,
on pourra considrer que les espces en questions sont plus loignes.
Voici une reprsentation schmatique de la parent des grands domaines de la vie, obtenu par une
mthode
de
comparaison
de
squences
nucliques
inter-espces
:

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Reprsentation schmatique d'un arbre philogntique obtenu partir de donnes


molculaires.

Comment

classifier

les

bactries

La classification des bactries entre elles repose sur plusieurs types d'observations et d'tudes. Les
bactries
peuvent
ainsi
tre
classes
et
donc
identifies
en
fonction
:

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- de leur morphologie microscopique (bactrie de type coque, bacille, vibrion ; isols, par deux, en
chanettes...)
- de leur morphologie macroscopique (taille, forme, couleur... des colonies sur milieux de culture
gloss)
de
leur
mobilit
(mobilit
ou
immobilit

une
temprature
donne)
de
la
prsence
de
spores
(
l'tat
frais
ou
aprs
coloration)
- du rsultat de la coloration de Gram (coloration de Gram positive ou ngative)
de
la
temprature
de
croissance
(4
C,
20
C,
30
C,
37
C...)
- du type respiratoire (arobie, anarobie strict, aro-anarobie facultatif, microarophile..)
- des besoins nutritionnels (ncessit de substances particulire pour le dveloppement)
- de la capacit utiliser certaines sources de carbone ou dazote (on parlera de biotypes ou
biovars,
de
zymotypes
ou
zymovars)
Une donne importante pour la classification bactrienne est le pourcentage en nuclotides G et C
(% G + C) de chaque gnome. Ainsi, deux espces bactriennes proches auront des pourcentage en
G
et
C
voisins.
En bactriologie mdicale, les bactries sont classifies en fonction du type de pathologie occasionn.
Ainsi parlera t'on de pathotypes ou pathovars. Dans le cadre de la bactriologie mdicale, souvent,
l'tude de la sensibilit bactrienne aux antibiotiques, l'tude des caractristiques antigniques et
enfin l'tude de la sensibilit certains bactriophage (virus spcifiques des bactries) : on parlera
respectivement d'antibiotypes, de srotypes ou srovars, et de lysotypes ou lysovars.

Classification

Les organismes procaryotes (Procaryotae) regroupent les organismes unicellulaires ne prsentant


pas de noyau individualis, c'est dire les Bactries et les Archaebactries. Les Eucaryotes
(Eucarya) regroupent quand eux l'ensemble des organismes unicellulaires ou multicellulaire noyau
individualis.
Le rgne (Procaryotae) est le premier niveau de classification. Vient ensuite le domaine (Bacteria), le
phylum, la classe, l'ordre, la famille, le genre, et l'espce. Cette dernire constitue l'unit de
classification. Toutefois, il est souvent ncessaire de subdiviser une espce en diffrentes sousespces
(subspecies).
Voici

la

classification

du

colibacille

bien

rgne
-

connu,

ou

Escherichia

coli

domaine
phylum
classe
ordre
famille
genre
espce
:

Procaryotae
Bacteria
:
Proteobacteria
:
Gammaproteobacteria
:
Enterobacteriales
:
Enterobacteriaceae
:
Escherichia
Escherichia
coli
:

L'on notera que les noms latins s'crivent en italique et qu'au niveau de la dnomination d'une espce,
le nom du genre prend une majuscule : Escherichia, ce qui n'est pas le cas du nom de l'espce : coli.
On emploi souvent la notation suivante E. coli, ou le nom du genre est reprsent par l'initiale.
Le phylum des Protobactries (divis en plusieurs classes : Alpha- Beta-, Gamma-, Delta- et Epsilon-

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proteobacteria) auquel appartient Escherichia coli est l'un des nombreux phyla bactrien connus.

IV.

La classification du monde vivant:

Pour commencer : il faut bien faire la diffrence entre :


- un rangement qui consiste placer les tres vivants dans un certain ordre
croissant ou dcroissant. Exemple : du plus petit au plus grand
- un tri qui consiste discriminer des objets en fonction de la prsence ou de
labsence dun caractre. Ces caractristiques dichotomiques servent de cls de
dtermination pour reconnatre une espce. Exemple : ont ou nont pas de
vertbres.
- une classification qui regroupe des tres vivants pour crer des ensembles
embots qui refltent uns cause sous-jacente.

1. 1. la classification:
Quelques dfinitions :
- systmatique : tude de la classification, de la nomenclature et de la
description des tres vivants.
- taxonomie : tude de la classification des tres vivants
La classification se base donc sur lexistence de caractres homologues entre
diffrents individus et qui rvle une origine commune entre les espces.
- caractres homologues : 2 structures qui chez des organismes diffrents sont
:
Soit hrites dun anctre commun (homologie stricte), soit qui ont les mmes
connexions avec lorganisme quelle que soit leur forme et leur fonction
(homoplasie).
- caractres analogues : 2 structures qui chez des organismes diffrents ont la
mme fonction mais avec des plans dorganisation diffrents.
La notion despce :
Afin de pouvoir faire un classement des tres vivants, il faut dterminer si les
individus font partie despces diffrentes ou non. Une espce est un ensemble
dindividus se reconnaissant comme partenaires sexuels et capables de donner
une descendance fconde.
Les catgories systmatiques :
En fonction du degr de ressemblance, les espces peuvent tre regroupes en
genre, famille, ordre, classe, embranchement et finalement en rgne.
La nomenclature binomiale des espces :
Le nom des espces est form du nom latin du genre avec une majuscule, suivi
du nom latin de lespce en italique et en minuscule.
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Exemple : le chat domestique : Felis, cattus


Les arbres phylogntiques :
Le regroupement des espces selon leurs homologies permet de crer des
groupes embots en fonction des caractres communs!
A partir dun tel classement il est possible de reconstruire un arbre
phylogntique qui se base sur les parents volutives (phylogense).

Les premires classifications tatient essentiellement bases sur la ressemblance


des espces: plus des espces taient proches dans leur apparence, plus elles
taient considres proches volutivement. Aujourdhui, la systmatique se base
sur des caractristiques molculaires. LADN, support de linformation des
individus, permet de dterminer le rapprochement de 2 espces. Deux
squences dADN ou de protine seront dautant plus similaires que les 2 espces
sont proches volutivement.

2. 2. Les 3 domaines du vivant:


La classification a beaucoup volue avec le dveloppement des mthodes
d'analyse gntique. Nous ne nous basons plus exclusivement sur l'aspect des
espces. Il est accept actuellement que le monde vivant se spare en 3
domaines:
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- Les bactries ou monres: organismes unicellulaires, procaryotes (sans noyau).


- Les archeabactries: ce sont des bactries ancestrales, vivant dans des milieux
extrmes, dont le fonctionnement est trs diffrent de celui des bactries que
nous ctoyons.
- Les eucaryotes: les organismes dont les cellules sont pourvues d'un noyau
contenant l'ADN. Le domaine des eucaryotes est subdivis en 4 rgnes:

LES MYCETES : organismes uni ou pluricellulaires, htrotrophes se


nourrissant par absorption.
LES VEGETAUX : organismes pluricellulaires autotrophes
photosynthtiques.

LES ANIMAUX : organismes pluricellulaires, htrotrophes se nourrissant


par digestion.

LES PROTISTES : organismes uni ou pluricellulaires, auto ou htrotrophes,


regroupant tous les organismes que lon ne peut pas classer ailleurs.

Il est intressant de remarquer que selon cette classification, les hommes sont
plus proches d'un champignon que 2 types de bactries entre elles!!!!!
Remarquons aussi que les critres de classification sont arbitraires, ils changent,
voluent au fur et mesure des dcouvertes et analyses scientifiques. C'est
l'homme qui essaie de faire des catgories pour classer la diversit du vivant,
mais la nature ne suit pas cette logique. De nombreuses espces sont difficiles
classer:
Les lichens sont une association symbiotique entre un champignon et une algue.
Doit-on le considrer comme un champignon? comme un vgtal? comme un
organisme d'une autre catgorie?
Et les virus dans tout a? et bien les virus ne font pas partie de cette
classification, car on ne les considre pas comme vivant (ils sont dpendants
d'autres cellules pour leur reproduction)

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20

21

Tableau avec dautres classifications

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Caractristiques des principaux groupes de microorganismes

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