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Este documento discute a origem, evolução e papel dos microssatélites nos genomas dos eucariontes. Brevemente, explica que microssatélites são seqüências repetidas de 1-6 nucleotídeos que apresentam alta taxa de mutação e são usados como marcadores moleculares. Também descreve funções dos microssatélites na organização da cromatina, regulação do DNA e atividade gênica, e padrões de distribuição entre diferentes tipos de seqüências.
Este documento discute a origem, evolução e papel dos microssatélites nos genomas dos eucariontes. Brevemente, explica que microssatélites são seqüências repetidas de 1-6 nucleotídeos que apresentam alta taxa de mutação e são usados como marcadores moleculares. Também descreve funções dos microssatélites na organização da cromatina, regulação do DNA e atividade gênica, e padrões de distribuição entre diferentes tipos de seqüências.
Este documento discute a origem, evolução e papel dos microssatélites nos genomas dos eucariontes. Brevemente, explica que microssatélites são seqüências repetidas de 1-6 nucleotídeos que apresentam alta taxa de mutação e são usados como marcadores moleculares. Também descreve funções dos microssatélites na organização da cromatina, regulação do DNA e atividade gênica, e padrões de distribuição entre diferentes tipos de seqüências.
PROGRAMA DE PS-GRADUAO EM GENTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS
LGN 5799 Seminrios em Gentica e Melhoramento de Plantas
Departamento de Gentica Avenida Pdua Dias, 11 - Caixa Postal 83, CEP: 13400-970 - Piracicaba - SP http://www.genetica.esalq.usp.br/semina.php
MICROSSATLITES: ORIGEM, EVOLUO E PAPEL NO GENOMA DOS
EUCARIOTOS. Aluna: Helen Alves Penha Orientador(a): Maria Lucia Carneiro Vieira Para a maioria das espcies, apenas uma pequena parte do genoma consiste de genes que codificam protenas. O restante do genoma, durante muito tempo, foi considerado como DNA lixo, ou seja, sem funo, e nessa parte incluam-se os microssatlites. Entretanto, recentes estudos vm demonstrando que diversas funes esto relacionadas quelas seqncias repetitivas, inclusive dentro de regies codantes. Os genomas de eucariotos so densamente povoados por microssatlites ou seqncias simples repetidas (SSRs), as quais consistem de 1 a 6 nucleotdeos repetidos em tandem, e so classificadas pelo motivo repetido, podendo ser mono, di, tri, tetra, penta e hexanucleotdeos e, tambm, pelo tipo de seqncia repetitiva, como microssatlites perfeitos, imperfeitos, interrompidos ou compostos. Os microssatlites possuem um alto polimorfismo, decorrente das altas taxas de mutao nestes locos, que variam de 10-2 a 10-6 por gerao. No entanto, so flanqueados por sequncias nicas e por isso podem ser amplificados atravs de PCR, o que fazem deles timos marcadores moleculares. Existem alguns modelos que explicam essas altas taxas de mutao, como o crossing-over desigual, o slippage durante a replicao e os elementos transponveis Alu. As seqncias dos microssatlites evoluem por um mecanismo similar ao slippage, comeando com a duplicao de poucas bases por substituies ou inseres, formando um proto-microssatlite de duas repeties que, posteriormente, podem ser estendidas por slippage. O nmero de repeties, o tipo de repetio, a seqncia flanqueadora e a recombinao so fatores que influenciam na evoluo dos microssatlites.
Recentes estudos demonstram diversas funes dos microssatlites, tanto na
organizao da cromatina quanto na regulao dos processos metablicos do DNA e da atividade gnica. Como conseqncia se tm, por exemplo, o surgimento de doenas humanas, a ativao ou inativao de genes e a produo de protenas truncadas.H padres especficos de distribuio dos diferentes motivos repetidos nos diferentes tipos de seqncias: codantes, no codantes, ntrons e regies intergnicas. Esses padres ainda variam entre txons, em termos da freqncia de microssatlites e de tipos de repeties preferenciais. Esta especificidade pode ser explicada, em parte, pela interao de mecanismos evolutivos atravs da seleo diferencial em regies do genoma e em diferentes espcies. Pelas razes apresentadas, os microssatlites vm sendo utilizados em diversos estudos, principalmente na construo de mapas genticos, associao entre instabilidade do nmero de repeties e doenas genticas humanas, estrutura gentica de populaes e anlises de paternidade. BIBLIOGRAFIA RECOMENDADA: LI, Y.C.; KOROL, A.B.; FAHIMA, T.; BEILES, A.; NEVO, E. Microsatellites: genomic distribution, putative functions and mutational mechanisms: a review. Molecular Ecology, v.11, p.2453-2465. 2002. LI, Y.C.; KOROL, A.B.; FAHIMA, T.; NEVO, E. Microsatellites within genes: Structure, function and evolution. Molecular Biology and Evolution, v.21, p.991-1007. 2004. MORGANTE, M.; HANAFEY, M.; POWELL, W. Microsatellites are preferentially associated with nonrepetitive DNA in plant genomes. Nature Genetics, v.30, p.194-200. 2002. OLIVEIRA, E.J.; PDUA, J.G.; ZUCCHI, M.I.; VENCOVSY, R.; VIEIRA, M.L.C. Origin, evolution and genome distribution of microsatellites. Genetics and Molecular Biology, v.29, p.294-307. 2006. ROSE, O.; FALUSH, D. A threshold size for microsatellite expansion. Molecular Biology and Evolution, v.15, p.613-615. 1998. SCHLTTERER, C. Evolutionary dynamics of microsatellite DNA. Chromossoma, v.109, p.365-371. 2000. ZHU, Y.; STRASSMANN, J.E.; QUELLER, D.C. Insertions, substitutions, and the origin of microsatellites. Genetics Research, v.76, p.227-236. 2000.