Dfinitions
La mycologie est l'tude des champignons. La
mycologie mdicale est une branche de la
microbiologie, lie toutes les spcialits de la
mdecine et qui a pour objet d'tudier les
maladies fongiques et des champignons qui les
produisent.
Initialement, les champignons ont t considrs
comme plantes infrieures dans la catgorie des
cryptogames et dans le phylum Thallophytes. En
1969, Robert H. Whittaker les a class dans le
rgne Fungae et a rassembl les tres vivants dans
cinq rgnes dans l'chelle biologique : Monera,
Protiste, Fungae, Plantae et Animalia. En 2002,
Bryce Kendrick reposant sur d'autres techniques
(immunologie et biologie molculaire) les a
classs en sept rgnes: Archaebacteria,
Eubacteria, Chromista, Protozoa, fungi, Plantae et
Animalia. Les deux premiers ont des cellules
procaryotes et sont appeles domaines; les autres
sont des eucaryotes; de point de vue
phylogntique, les animaux sont proches des
champignons. Cette classification est celle
accepte aujourd'hui.
Mycoses
Les infections causes par des champignons
microscopiques sont appeles mycoses et
prennent le nom de la partie de l'organisme quils
envahissent (onychomycoses) ou du champignon
qui les cause (coccidiodomycoses). Les agents
des mycoses sont environ 100 agents et peuvent
tre d'origine endogne et exogne.
Chez l'homme, il existe des mycoses comme la
teigne des pieds et les candidoses (candidose), qui
sont aussi frquents que le rhume commun; on ne
connat pas l'incidence vritable car ils ne sont
pas toujours notifis.
Les champignons endognes sont rencontrs dans
les muqueuses ou tguments de sujets sains, et
cest seulement dans des cas particuliers de l'hte
(immunosuppression, diabte, antibiothrapie)
Buccopharynx
Oreille externe
Vagin
sporotrichose,
le
myctome
et
la
chromoblastomycose (tableau 2)
Dans les mycoses systmiques, les spores du
champignon
pntrent
par
inhalation
(coccidiodomycose,
histoplasmose,
paracoccidiodomycose, blastomycose), aprs
quoi on a une colonisation et, chez la plupart des
gens dans les zones endmiques, on a apparition
dune infection pulmonaire asymptomatique; dans
un faible pourcentage il se produit une mycose
pulmonaire primaire (pneumonie aigu) qui
s'accompagne de symptmes gnraux (Figure 1).
Dans les deux cas, on a une gurison ou volution
vers une maladie pulmonaire chronique; la
dissmination vers tout autre organe ou un
systme est peu frquente, en particulier le foie et
la rate (tableau 3) de mme pour la ractivation
endogne. L'inoculation cutane primaire est
exceptionnelle et se prsente comme une blessure
granulomateuse
local
accompagne
dadnopathie.
Les mycoses systmiques peuvent affecter la peau
Tableau 3. Mycoses systmiques.
Blastomycose
Paracoccidiodomycose
Coccidiodomycoses
Adiaspiromycose
Histoplasmose
Pnicilliose
Aspergillose
Cryptococcose
Candidose
Gotrichose
Tableau 2.Trichosporonose
Mycoses sous-cutanes.
(infection dissmine)
Phaeohyphomycose
et Hyalohyphomycose
Blastomycoses sous-cutane
systmique
Chromoblastomycose
Pseudalleschriose
Sporotrichose
Entomophtoromycoses (basidiobolomycose et
conidiobolomycose)
Eumyctome ( grains blancs et noirs)
Hyalohyphomycose sous-cutane
Phaeohyphomycose (kyste mycosique)
Lacaziose (Lobomycose) Rhinosporidiose
D'autres : Aspergillose
Inhalation
Colonisation
Infection
Eucaryotes
La paroi de chitine
Pneumonie
Absorbent
nutriments
Asymptomatique
Prsentent un thalle ou
myclium
CHRONIQUE
Maladie
Pulmonaire
Progressive
Maladie
Pulmonaire
Chronique
Gurison
Ractivation
Endogne
Dissmination
Extrapulmonaire
Caractristiques
fondamentales
Les
caractristiques
fondamentales
champignons (tableau 4) sont :
des
Tous
sont
htrotrophes
(chimioorganotrophes) car ils doivent se
nourrir de matire organique prforme quils
utilisent comme source d'nergie et de
carbone.
Sont eucaryotes, c'est--dire prsentant un
noyau diffrenci membrane bien organise.
Ont une membrane cellulaire compose de
l'ergostrol; ainsi qu'une paroi cellulaire
compose de polysaccharides polypeptides et
chitine (qui leur confre des proprits
antigniques); cette paroi est rigide, ils ne
peuvent pas phagocyter les particules
alimentaires mais ils absorbent les nutriments
Figure 4. A) Structure d'un thalle ou myclium de moisissures et levures. B) dans la partie infrieure sont apprcis deux formes peu fr
Figure 8. Schma
de formation
de la et
colonie.
De Cours suprieur
de pigment
mycologievu
m
Figure 6. A) aspect macroscopique d'un champignon
filamenteux
(moisissures)
d'une (Proprit
levure; b)de
champignon
filamenteux
Figure 5. Phase myclienne et de levure avec thalle reproducteur et vgtatif.
Thalle
Il est constitu de deux parties :
1) thalle vgtatif (immerg) qui assure le
dveloppement, la nutrition, la fixation et
l'dification de la partie reproductrice, et
2) thalle reproducteur (arien), o se forment
les organes de reproduction. Il peut tre
reprsent par des hyphes, des levures ou
pseudohyphes (blastopores qui ne se sparent pas)
(figure 5).
Si le thalle est dissoci (blastomycte), des
colonies de levures de croissance rapide se
produisent, de consistance crmeuse et sont
ensemences comme des bactries en points ou
en stries (figure 6). Si le thalle est filamenteux
Modifications du thalle
Les champignons prsentent, dans leurs forme et
constitution, des variations importantes pour les
Figure
9. Modifications
du thalle.de
(Proprit
Cours
suprieur
de mycologie
mdicale.
Institut en
Pasteur,
1980.)
Figure
11. Sporothrix
schenckii,
desParis.
associations
cormies.
Figure
10. Madurellamicroscopiques
mycetomatis, prsence
sclrotesde(10).
Structure
Lhyphe (figure 18) est un tube de longueur
variable form par une paroi cellulaire rigide, o
s'coule le protoplasme.
Le diamtre varie de 1 30 m; il se termine par
un point, qui est la zone d'extension et reprsente
la rgion de croissance.
Les champignons suprieurs montrent des
cloisons transversales appeles " septa" et
forment un myclium cloisonn (figure 5); qui
possde des pores qui permettent le passage du
cytoplasme et les noyaux, de sorte que les hyphes
ne font pas apparatre des cellules mais des
compartiments (figure 18). Les champignons
infrieurs ont un myclium coenocytique
continue, qui ne montrent pas (asepts) (figure 5)
ou trs peu de cloisons et se prsentent
uniquement pour isoler les parties anciennes ou
reproductrices (figure 18).
nuclole;
les
organites
cytoplasmiques
comprennent
mitochondries,
rticulum
endoplasmique, vacuoles, ribosomes 80s (les
bactries ont 70s) et appareil de Golgi li la
production de vsicules scrtoires, corps
lipodiques, inclusions cristallines (l'ergostrol) et
microcorps; il peut aussi y avoir des ranges de
microtubules et glycogne.
Dans les espces suprieures de champignons,
chaque cloison est li un corpuscule de
Aggregations mycliennes
ure 12. Schma de la structure microscopique du sclrote, la cormies et la pycnide. (Proprit de Cours suprieur de mycologie mdicale.
Figura 17. Schma de la structure microscopique des corps fructifis sexus: A) clistothce, B) apothcie, C) prith
Figure 18. Schma ultrastructurale des champignons. (Proprit de Cours suprieur de mycologie mdicale. Paris: Institut Pas
Besoins physiologiques
Les champignons doivent trouver dans les
milieux de culture le ncessaire pour leur
croissance et dveloppement :
a) Matires azotes comme peptone;
b) sucres comme glucose ou le maltose, qui sont
indispensables;
c) un support solide, comme la glose, qui permet
aux champignons filamenteux de dvelopper un
Reproduction
Pour conserver leur capacit d'adaptation, les
champignons doivent se reproduire avec facilit.
Les hyphes se dveloppent partir d'une spore
par mission d'un tube germinatif; la forme la
plus simple se fait par croissance apical des
hyphes; il ny a pas de croissance
intercalaire, mais les cellules non terminaux
Figure 21. Schma de la reproduction sexue et asexue chez les Zygomycotina (mucoromycotina).
Reproduction sexue
Comprend une srie de phnomnes tels que :
1) Production d'organes sexus et gamtes.
2) Fusion de protoplasme (plasmogamie).
3) Fusion nuclaire (caryogamie).
4) Miose en champignons haplodes.
5) Apparition de facteurs gntiques.
Schma de la reproduction sexue en Basidiomycotina,b)fibule ou clamp sur les hyphes vgtatifs,c)lamelles du BasidiomycteCortinariu
Reproduction asexue
La reproduction mitosporique (imparfaite) est la
plus connue et, en gnral, sert identifier le
champignon; souvent elle est effectus par des
spores gnres par une cellule spcialise ou
conidiogne, lesquelles sont externes et
s'appellent conidies, et cest seulement chez les
Zygomycota
quils
sont
internes
et
s'appellent endospores ou sporangiospores (figu
re 26).
Endospores
Ce sont des spores internes qui caractrisent les
champignons infrieurs. Ils Se divisent en spores
mobiles ou zoospores qui ne sont pas observes
chez les champignons pathognes pour l'homme,
et spores immobiles ou sporangiospores
(aplanospores), contenues dans une vsicule ou
sporange. Ce dernier, son tour, est soutenu par
un filament porteur ou sporangiophore, qui
possde une cloison de forme spciale ou
columelle. Ces spores sont librs par la rupture
de la vsicule; les fragments de cette dernire qui
restent unis la columelle constituent la collerette
(figure 26).
Conidiogense
Par ce mcanisme se produisent les conidies, qui
sont les formes de reproduction asexue
caractristiques des hyphomyctes. La figure 323 indique les critres de conidiogense plus
pertinentes pour l'identification des champignons
d'importance mdicale ainsi que des illustrations
de leurs mcanismes de formation. Les cellules
par
exemple, Scopulariopsis (figure
figures 31-6, 31-12).
3-23C;
Familles
Arobies
Anarobies
Micropolysporaceae
Micropolyspora
Saccharopolyspora
Dermatophilaceae
Dermatophilus
Frankiaceae
Frankia
Causerina
Alnus
Myrica
Micobacteriaceae
Nocardia
Rhodococcus
Mycobacterium
Gordona
Skermania
Tsukamurella
Corynebacteriaceae
Corynebacterium
Dietzia
Thermomonosporace
ae
Nocardiopsis
Thermomonospora
Saccharomonospora
Maduromycetaceae
Actinomadura
Microbispora
Microtetraspora
Streptomycetaceae
Streptomyces
Nocardioides
Actinomycetace
ae
Actinomyces
Rothia
Propionibacterium
(Arachnia)
Oerskovia
Bifidobacterium
Actinomyctes
Traditionnellement ils ont t tudies en
mycologie, mais en ralit ils constituent un
groupe htrogne de bactries qui un moment
donn de leur cycle de croissance dveloppent
des filaments
ramifis
qui se fragmentent
en familles
Les
actinomyctes
pathognes
classs
dans
Tableau
2. Caractristiques
de certaines
actinomyctes
d'intrt
mdicalsont
(figures
3 5).
lments coccodes, bacillaires ou les deux.
les procaryotes, phylum Schizomycota, classe
Eubacter et ordre Actinomycetales. Cet ordre
comprend les principaux genres arobies:
Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia,
Rhodococcus,
Gordona,
Tsukamurella,
Actinomadura, Streptomyces et Dermatophilus,
ET ANAROBIES comme Actinomyces,
Arachnia et Rhotia. Ils sont gnralement
htrotrophes et utilisent une grande varit de
substances comme sources d'azote et du carbone,
grandissent sur glose avec pH neutre ou
lgrement alcalin. Donnent une odeur
caractristique des eaux et du sol; ils ont une
activit dans les processus de fertilisation,
produisent des antibiotiques (Streptomyces), ils
sont utilises comme sources de vitamines ou
dsintgrent diffrentes substances et produits
alimentaires.
Les actinomyctes sont peu pathognes, par
consquent, ils considrs comme opportunistes
et regroupent un large ventail de microorganismes qui vont des simples bacilles
diphtrodes jusqu' des variantes filamenteuses
complexes.
Les actinomyctes prsentent des caractristiques
de bactries, comme leur petite taille (moins de 1
m) (figures 2 et 3), noyaux procaryotes (c'est-dire avec l'ADN distribu de faon libre dans la
cellule et non organis dans le noyau), la prsence
d'acide muramique dans la paroi cellulaire, ne pas
contenir de chitine ni de cellulose et synthse de
la lysine partir d'acide diaminopimlique;
arrivent produire myclium (ensemble de
filaments) qui se fragmente en forme
perpendiculaire et de fragmentation en lments
coccodes et bacillaires; certains genres, comme
Mycobacterium et Nocardia synthtisent cires et
acides mycolique qui leur confrent une
rsistance l'acide-alcool. Presque tous sont gram
positifs et sont sensibles aux antibiotiques
antibactriens mais pas aux antifongiques
(chapitres 24 et 25).
Figura 5. Aperu de la structure microscopique des actinomyctes arobies (Micropolysporaceae, Dermatophilaceae et Thermomonospor
Figure 4.Schmas des structures microscopiques des cinq familles dactinomyctes anarobies 1988.)
Les
actinomyctes
ressemblent
des
champignons par leur croissance atypique
(figures 3 6), prsence de filaments et les
ramifications dans les tissus ou des cultures et la
production de maladies chroniques. Ces microorganismes produisent des filaments fins et
minces de 0.5 0.8
m de diamtre
(microsiphonns, si ils mesurent <1 m), avec
des ramifications dichotomiques; certains peuvent
gnrer de myclium arien (figures 2 et 3). Dans
les milieux solides, ils donnent lieu des masses
de filaments, et dans les milieux liquides ils ont
tendance former des grappes ou lobes avec des
ramifications dendritiques; ils produisent des
spores isoles ou en chanes; ils peuvent avoir
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