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Aminoacil RNAt
sintetasas. Reconocen secuencias en la regin interna del RNAt. Tienen muy alta especificidad pues
distinguen entre 40 RNAt que tienen una estructura similar, solamente con algunos cambios en la
secuencia de bases. Reconocen elementos de identidad en el RNAt que incluyen: Regin anticodn
Pares de bases en el tallo aceptor.El codn del RNAm es reconocido por la secuencia anticodn del RNAt La
interaccin ocurre por apareamiento de bases complementarias. Las dos molculas de RNA son
antiparalelas. La sntesis de protenas se lleva a cabo en los ribosomas El ribosoma procarionte se puede
disociar en dos subunidades. Cada una de stas se compone de RNAr y muchas protenas. Sitio de unin al
ribosoma En los RNAm procariontes hay una secuencia altamente conservada que est entre 8 y 13 nts del
codn de inicio. Esta secuencia es rica en purinas y el consenso es: 5-AGGAGGU-3 Esta secuencia se
aparea por interacciones de puentes de hidrgeno con la secuencia 3-UCCUCCA-5 que se encuentra en el
RNAr 16S de la subunidad pequea del ribosoma. Se llama Secuencia de Shine-Dalgarno o sitio de unin al
ribosoma. Sirve para posicionar de manera correcta al RNAm en el ribosoma con respecto al codn de
incio. Formacin del complejo de iniciacin Ensamblaje del ribosoma en el RNAm Se requiere de:
Subunidad pequea del ribosoma Subunidad grande del ribosoma RNAm Aminoacil-RNAt (formil-Met)
Factores de iniciacin (IF) IF1 e IF3 => se unen a la subunidad 30S y previenen la unin de 50S en
ausencia de RNAm IF2-GTP ayudan a la unin del aminoacil-RNAt de iniciacin. Formacin del complejo
de Iniciacin. Los factores IF1 e IF3 se unen a la subunidad 30S del ribosoma y previenen la unin de la
subunidad 50S RNAt En procariontes, el codn de inicio es reconocido por un aminoacil-RNAt que acarrea
formil-Met El grupo formilo se aade despus de la carga del RNAt, por una enzima (transformilasa) que
usa formiltetrahidrofolato. Solamente el RNAtf-Met se usa para formar el complejo de iniciacin. Todos los
dems aminoacil-RNAt requieren que el ribosoma est completamente ensamblado. Formacin del
complejo de Iniciacin. La unin de AA-RNAt(fMet) al codn de inicio es un proceso dependiente de la
hidrlisis de GTP. El IF2 se une a GTP acompaa al AA-RNAtf-Met Al disociarse IF1, se une la subunidad 50S
del ribosoma. Queda formado el complejo de iniciacin
Fase de elongacin Factores de elongacin EF EF-Tu / EF-Ts/ EF-G Aminoacil-RNAt del resto de los
aminocidos. GTP Complejo de Iniciacin La fase de elongacin se divide en tres etapas Ocupacin
del sitio aminoacil Formacin del enlace peptdico Translocacin Formacin del enlace peptdico El
grupo amino del AA-RNAt del sitio A est bien posicionado para atacar el enlace ster entre el RNAt que
ocupa el sitio P y el aminocido. Mecanismo de Formacin del Enlace Peptdico Se forma un intermediario
tetradrico que es estabilizado por la peptidil transferasa El grupo amino del AA-RNAt del sitio A est bien
posicionado para atacar el enlace ster entre el RNAt que ocupa el sitio P el aminocido que acarrea.
Mecanismo de Formacin del Enlace Peptdico El intermediario se cierra para formar el enlace peptdico y
liberar al RNAt que est ocupando el sitio P. Translocacin P A EF-G La translocacin es mediada por el
factor EF-G, guado por la hidrlisis de GTP . La actividad de peptidil transferasa se encuentra en el RNA
ribosomal 23S con participacin de algunas protenas de la subunidad grande del ribosoma. El centro
cataltico responsable de la actividad de la peptidil transferasa se encuentra altamente conservado
filogenticamente. Terminacin. El ribosoma llega al codn de trmino del marco de lectura del RNAm
La principal diferencia en la traduccin entre procariontes y eucariontes radica en la fase de iniciacin. Los
RNAm eucariontes carecen de una secuencia consenso de unin al ribosoma (Shine-Dalgarno). Hiptesis
del scanning o barrido. La subunidad 40S del ribosoma se une al extremo 5 del RNAm y hace un barrido
hasta encontrar el codn AUG. La subunidad 40S Este codn se debe encontrar en el contexto correcto
que es: 5-CCRCCAUGG-3
El proceso de elongacin es similar a los procariontes y la actividad de peptidil transferasa se encuentra
en.... El proceso de terminacin es similar al de los procariontes y se reconocen los mismos codones de
trmino: UAA UAG UGA
Transporte de las protenas en la clula. La localizacin final de una protena en la clula frecuentemente
est determinada por alguna secuencia corta de aminocidos presente en la protena. En procariontes, los
destinos posibles de una protena: Secretada hacia el exterior de la clula Membrana plasmtica
Citosol
En eucariontes, las protenas pueden tener varios destinos: Ncleo, mitocondria, peroxisomas,
cloroplastos, retculo endoplsmico, aparato de Golgi, lisosomas. Las protenas contienen ciertas
secuencias de aminocidos que son reconocidas por receptores en el organelo blanco o por otras protenas
que las transportan. Hay dos mecanismos generales: Direccionamiento post-traduccional: ncleo,
mitocondria, cloroplasto peroxisoma. Direccionamiento co-traduccional: retculo endoplsmico, aparato de
Golgi, lisosomas, membrana plasmtica, secrecin.