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Definicin

Los cidos nucleicos son una macromolcula localizada en las clulas. Al igual que las
protenas y los polisacridos, las otras macromolculas, los cidos nucleicos son
molculas grandes formadas por muchas unidades similares vinculadas.
Hay dos clases de cidos nucleicos: cido desoxirribonucleico (ADN) y cido ribonucleico
(ARN). Cada uno est formado por cuatro nucletidos diferentes: adenina, citosina,
guanina, timina y en el ADN: adenina, citosina, guanina y uracilo en el ARN.
ADN
El ADN es una molcula hereditaria que mantiene y transmite la informacin que las
clulas necesitan para sobrevivir y crear descendencia. Tiene dos funciones: replicarse
durante la divisin celular, y dirigir la transcripcin (la creacin) de ARN. La informacin
que contiene se encuentra en los genes, que son secciones a lo largo de la molcula de
ADN que contienen un "cdigo" que la clula utiliza para crear el ARN y, en ltima
instancia, las protenas. El ADN es una doble hlice, esta estructura ayuda a almacenar
informacin de manera segura manteniendo esencialmente una doble copia de su
informacin.
ARN
El ARN se crea cuando la clula "lee" los genes del ADN y hace una copia de los mismos.
Tambin puede funcionar como una molcula hereditaria, almacenando la informacin de
forma permanente como lo hace el ADN, en los virus. En las clulas no virales, el ARN
mensajero (ARNm) copia la informacin del ADN y la lleva a la maquinaria celular para la
creacin de las protenas, los ribosomas, que utilizan la informacin en el ARN como
modelos para crear protenas y llevar a cabo casi todas las funciones de la clula. El ARN
de transferencia (ARNt) lleva aminocidos a los ribosomas para sintetizar las protenas.
Importancia de los cidos nucleicos. Dirigen y controlan la sntesis de protenas. Los
cidos nucleicos son macromolculas formadas por la unin de muchos monmeros
denominados nucletidos.
La estructura de los cidos nucleicos
La estructura del cido nucleico se refiere a la morfologa de cidos nucleicos como
el ADN y el ARN. Los detalles de la estructura de los cidos nucleicos permitieron revelar
elcdigo gentico. Por lo general, dicha estructura desarrollada por el modelo de James
Watson y Francis Crick se divide en cuatro niveles diferentes:

La estructura primaria, que es la secuencia de bases nitrogenadas de cada una


de las cadenas que componen el ADN.
La estructura secundaria, que es el conjunto de interacciones entre las bases
nitrogenadas, es decir, qu partes de las cadenas estn vinculados uno al otro.

La estructura terciaria, la ubicacin de los tomos en el espacio tridimensional,


teniendo en cuenta las limitaciones geomtricas y estricas.
La estructura cuaternaria, que es la organizacin de ms alto nivel del ADN en la
cromatina, o las interacciones entre las unidades de ARN en el ribosoma o
espliceosoma.

Estructura del ADN


El azcar es la 2-desoxi-D-ribosa y se une con enlaces covalentes, llamados enlaces Nglucosdicos, a las bases nitrogenadas, formando as un nuclesido. El azcar tambin se
une al cido fosfrico por medio de un enlace ester que, con la base nitrogenada forma el
nucletido.
Clasificacin

Monocatenario

Lineal
Virus

1 hebra
DNA o ADN

Circular

cido
desoxirribonucleico

Lineal

Ncleo de clulas
eucariotas

Bicatenario
2 hebras
Circular

Bacterias, mitocondrias,
cloroplastos
ARN mensajero (RNAm)

RNA o ARN

Monocatenario

ARN transferente (RNAt)


ARN ribosmico (RNAr)

cido ribonucleico
ARN nucleolar (RNAn)
bicatenario

Propiedades Biologicas de los cidos nucleicos.

VIRUS

Las ms importantes desde el punto de vista biolgico son: a) propiedades cido-base,


debido a los grupos fosfato y a las bases nitrogenadas (particularmente importantes en el
mantenimiento de los puentes de hidrgeno; b) solubilidad: son solubles en agua y poco
solubles en disolventes orgnicos; c) viscosidad: mayor en bicatenarios que en
monocatenarios; d) densidad: mayor en RNA y monocatenarios que DNA y bicatenarios;
mayor en los SC que OC y stos que los lineales; mayor cuanto mayor contenido (G+C), y
en base a todo ello se pueden separar distintos DNA; e) absorcin de luz a 260 nm,
debido a las bases nitrogenadas, y que es mayor en los monocatenarios que en los
bicatenarios.
Propiedades fsico-qumicas de los cidos nucleicos
Los polinucletidos de DNA y RNA son hidrfilos debido a que se pueden formar
puentes de hidrgeno entre el agua y los fosfatos, o el agua y los OH de la pentosa. Por
tanto, son ms solubles que las bases que los forman.
A pH fisiolgico, los grupos fosfato presentan dos cargas negativas (el pK ms alto es
6), por lo que los polinucletidos son de naturaleza cida.
Debido a que los polinucletidos son molculas muy largas en relacin a su dimetro,
proporcionan soluciones viscosas.
Qumicamente son muy estables, especialmente en el caso del DNA por carecer del 2OH. Es precisamente este radical el que proporciona las principales diferencias entre
ambos cidos nucleicos, adems de ser el principal responsable de la actividad
cataltica de las ribozimas.
1.- Apilamiento de las bases
Este fenmeno fue descubierto por Wilkins y Atsbury en 1941 al tratar de validar el
modelo del tetranucletido. En esta disposicin, se minimiza la interaccin de los anillos
de las bases con la molcula polar, que es el agua, por lo que es muy favorable:
se produce la interaccin electrnica entre las nubes de electrones de las bases
(interacciones hidrfobas), situacin incompatible con las interacciones polares
con el agua.
se disminuye la tensin superficial generada entre
las bases y el agua. Al disponerse el agua por fuera
del polinucletido de una manera ordenada, ste
tiende an ms a agregarse, por lo que se genera una
especie de cavidad estable en el agua.
El apilamiento se puede detectar mediante el efecto
hipercrmico: a medida que se apilan ms las bases, va
disminuyendo el coeficiente de extincin molar, y tambin disminuye (pero mucho
menos perceptiblemente) la longitud de onda a la que se obtiene ese valor. El
apilamiento no es un fenmeno cooperativo, puesto que dos bases se aparean a igual
velocidad si estn solas que si estn formando parte de un polinucletido. Lo que s se
ha observado es que el apilamiento es ms perfecto y ms favorecido energticamente
cuantas ms bases se apilen.
2.- Reactividad qumica

Aunque hoy en da esta caracterstica no es de vital importancia, s que ha ayudado


mucho a comprender la estructura, el funcionamiento y la purificacin de los cidos
nucleicos. Por ello, vamos a ver las reacciones o modificaciones qumicas ms
importantes.
Hidroxilamina (NH2OH)
La reaccin con los polinucletidos provoca una mutacin. A pH
cido (5 a 6) provoca la hidroxilacin del 4-amino de la citosina.
Esta hidroxicitosina puede aparearse con la Ade, con lo que un
cido nucleico que tenga el par C:G puede pasar a T:A (transicin).
A pH muy alcalino (>10) reacciona con cada nucletido de uracilo
haciendo que se hidrolice el anillo de uracilo y quede 1hidroxiamino-rribosa ms urea. No se hidrolizan ni afectan (si el
tratamiento no es drstico) los enlaces fosfodister, por lo que se
puede conseguir una eliminacin selectiva de los uracilos en un RNA.
Bisulfito (HSO3-)
Es un mutgeno cuya accin se basa en la reversibilidad de la reaccin. Como
consecuencia, las citosinas pasan a uracilo. Se puede luego acoplar la reaccin de la
hidroxilamina para eliminar los uracilos, con lo que eliminaramos realmente las Cyt del
DNA.
Las clulas veremos que son capaces de reparar los Ura en el DNA, pero si la
modificacin se produce en una metil-citosina (muy frecuente, pues el DNA est
metilado en este nucletido), la clula ya no lo reconoce como Ura y no lo repara.
Agentes alquilantes
Los ms utilizados son los haluros de alquilo y los teres sulfricos o sulfnicos. Los
agentes alquilantes son muy cancergenos en ms del 90% de los casos. Su forma de
reaccionar es metilar las bases nitrogenadas, aunque tambin son capaces de metilar
las pentosas. La facilidad de metilacin comienza por las purinas (principalmente las
posiciones N7 y N3 de la guanina), y algo ms difciles de metilar son las pirimidinas.
Estas metilaciones provocan la ruptura del enlace -N-glucosdico, por lo que han sido
muy usados para las despurinacin de los cidos nucleicos. En consecuencia se
obtienen todo tipo de mutaciones. Tambin favorecen la ruptura de los esqueletos
ribosa-fosfato
cido nitroso (HNO2)
Provoca la desaminacin de las bases (prdida de un grupo amino NH2 y aparicin, en
su lugar, de un grupo oxo), con lo que la C U, la A hipoxantina (la base del
nucletido inosina) y la G xantina. Esto provoca un cambio de apareamiento de
nucletidos en todos los casos, por lo que resulta mutgeno.
Luz (reaccin fotoqumica)

Debido a que los electrones


de los orbitales de los
anillos de las bases
nitrogenadas absorben luz
UV por estar
deslocalizados, los
electrones pasan a un nivel
energtico superior.
Cuando regresan a su nivel
normal, la energa sobrante
sirve para catalizar una
reaccin entre bases nitrogenadas muy cercanas. Una de ellas es
la fotohidratacin que elimina los dobles enlaces del anillo de pirimidina. Las bases
fotohidratadas ya no absorben al UV y son estables. Para su viabilidad, la clula ha de
eliminarlas, como en el caso de que una C pase a U muy frecuente.
La reaccin ms habitual es la formacin de dmeros de timina cuando hay dos T
consecutivas en una secuencia. En la dimerizacin ms conocida, se forma un anillo de
ciclobutano muy estable, de manera que las clulas han tenido que desarrollar un
mecanismo especfico para deshacer esta estructura. Esta propiedad es muy utilizada
por los agentes mutgenos como el 5-bromo-uracilo que tienen gran tendencia a
dimerizar y la clula lo elimina con dificultad.
Hidrlisis del enlace -N-glucosdico
Se puede separar la base nitrogenada del esqueleto del polinucletido mediante
la hidrlisis cida con un cido dbil, que protona el O de la pentosa. Los
desoxirribonucletidos son muy sensibles a este tratamiento, pero los ribonucletidos
tienen el 2-OH que atrae electrones de la base y el O de la pentosa es ms difcil de
protonar.
Las purinas (A, G) se hidrolizan antes que las pirimidinas; a veces, al hidrolizar las
pirimidinas, se acaba hidrolizando tambin la pentosa.
En medio alcalino se considera que el enlace es estable.
Las modificaciones de las bases, principalmente la alquilacin, debilitan mucho el
enlace N-glucosdico.
Hidrlisis del enlace fosfodister
Mediante hidrlisis alcalina en NaOH
diluido se rompe el enlace PO del
enlace fosfoster en 5 puesto que el 2OH ataca al P y forma un intermediario
cclico 2-3-fosfato que luego se hidroliza
por igual a 3 o 2 fosfato. Esta hidrlisis
solo ocurre en el RNA puesto que es
absolutamente dependiente del 2-OH.
De manera contraria a lo que ocurre con la hidrlisis cida del enlace N-glucosdico, las

purinas son ms resistentes a hidrolizar el 3 fosfato de su nucletido que las


pirimidinas.
Funcin
ADN: Almacena y transmite la informacin gentica. Dirige el proceso de sntesis de
protenas. Constituye el material gentico y forma los genes, que son las unidades
funcionales de los cromosomas.
ARN: Ejecuta las rdenes contenidas en el ADN, se encarga de sintetizar protenas.