TEMA 1.

INTRODUCCIN
1. CONCEPTO DE MICROBIOLOGA

MICRO (pequeo), BIO (vida) y LOGOS (tratado): Es el estudio de los MICROORGANISMOS, o seres de
pequeo tamao que slo son visibles al microscopio.

1 m = 0,001 mm

MICROBIOLOGA AMBIENTAL es una subdisciplina de la MICROBIOLOGA que estudia la funcin y

diversidad de los microorganismos en los ambientes naturales (suelo, agua, aire, macroorganismos), y
tambin el papel de estos seres vivos en los procesos de biorremediacin, o en los de produccin de
bienes de inters medioambiental.

Es el estudio de todos los procesos efectuados por microorganismos que ocurren en el suelo, el agua,
alimentos, etc. es decir, considera los efectos a gran escala de la presencia de microorganismos y su
actividad.

La ecologa microbiana es el estudio del comportamiento y las actividades de los microorganismos en

sus medios naturales (medio ambientes).

2. BREVE HISTORIA DE LA MICROBIOLOGA AMBIENTAL

Antiguedad - S. XVII (primeros microscopistas):

Perodo Especulativo sobre la existencia y naturaleza de los microorganismos. Las enfermedades estn
causadas por organismos invisibles.

Ao 1676, Leeuwenhoek observa microorganismos (animlculos).

Ao 1688, Redi publica su trabajo sobre la generacin espontnea de gusanos.

Hook inventa el primer microscopio.

S. XVIII S. XIX: Nacimiento de la Microbiologa como Ciencia

1. Polmica sobre la generacin espontnea de los microorganismos

A favor: Needham (Ao 1748); Pouchet (Ao 1859)

En contra: Spallanzani (Aos 1765/76); Schwann y Scheleiden (Ao 1838); Pasteur (Ao 1861); Tindall
(Ao 1877).

Spallazani: Hizo un experimento en el que puso en un recipiente un lquido llamado caldo

nutritivo, tap dicho recipiente y lo calent, demostrando que no aparecan microorganismos.
Pasteur: En un recipiente de vidrio coloc un caldo nutritivo y deform la entrada de aire del
recipiente en forma de s de manera que el cuello tuviera forma sigmoidal. Hirvi ese caldo
nutritivo y, a pesar de que el caldo estaba en contacto con el aire, permaneca inalterable.
dedujo que los microorganismos eran transportados por el aire (polvo o adheridos a aerosoles
atmosfricos). Conforme pasaba el tiempo se depositaba polvo en el cuello, pero no aparecan
microorganismos. tanto si inclinaba el caldo permitiendo que entrara en contacto con el polvo
como rompiendo el matraz, crecan microorganismos. Esto era producido por el contacto del
caldo con el polvo, demostrando as que los microorganismos eran producto del inculo de
otros microorganismos.
 Tindall: A pesar de calentar el caldo, al cabo de un tiempo podan crecer microorganismos. El
tratamiento de pasteurizacin mata a clulas microbianas que estn metablicamente activas,
pero el calentamiento hasta ebullicin no mata a aquellos microorganismos que estn en
clulas de resistencia o esporas. para algunas esporas microbianas un tratamiento por calor
supone la activacin, y un segundo calentamiento tras 8h mata todos los microorganismos
activados anteriormente (tindalizacin).

2. Reconocimiento de los m.o. como agentes infecciosos, responsables de las enfermedades

El cultivo axnico y los Postulados de Koch Robert Koch fue el primero que desarroll las tcnicas
de aislamiento de microorganismos en cultivo en medio slido, y con ellas la obtencin de cultivos
puros tambin llamados cultivos axnicos a partir de un microorganismo.

El cultivo axnico consiste en inocular un a muestra de microorganismos sobre una superficie slida
nutritiva (rodaja de patata cocida), donde stos formaban colonias (poblacin clonal, clulas
microbianas idnticas procedentes del crecimiento celular de una nica clula microbiana). dicha
poblacin clonal ser la denominada cultivo axnico.

Ao 1798, Jenner prepara una vacuna contra la viruela

Ao 1876, Koch demuestra que el carbunco est causado por una bacteria: Bacillus anthracis

Ao 1880, Laveran descubre el agente de la malaria: Plasmodium

Ao 1881, Pasteur prepara la vacuna contra el carbunco

Ao 1882, Koch descubre el bacilo de la tuberculosis: Mycobacterium tuberculosis

Ao 1885, Pasteur prepara la vacuna contra la rabia

Ao 1892, Iwanovsky descubre el virus de la enfermedad del mosaco del tabaco

3. Funcin de los microorganismos en las transformaciones de la materia

Ao 1857, Pasteur demuestra que la fermentacin cido-lctica es producida por un

microorganismo. Observ que el producto final de la fermentacin era un compuesto orgnico en
constituido nicamente por molculas en forma L. pens que este hecho era debido a la actividad
microbiana, que slo utilizaban para la fermentacin la forma L de una sustancia qumica con
proporciones iguales de D y L.

Aos 1887/90, Winogradsky y Beijerinck demuestran la participacin de m.o. en los ciclos

biogeoqumicos del carbono, nitrgeno y azufre. Elaboran un mtodo de cultivo de
microorganismos denominado columna de Winogradsky.

La columna de Winogradsky

En contraste con los estudios sobre cultivos puros de otros microbilogos como Pasteur o Koch, estos
investigadores se centraron en estudiar las relaciones entre diferentes tipos de microorganismos en
comunidades mixtas.

La columna de Winogradsky es una demostracin clsica de cmo los microorganismos ocupan

microespacios altamente especficos de acuerdo con sus tolerancias ambientales y sus necesidades
vitales (requerimientos de C y energa) y que, adems, ilustra cmo diferentes microorganismos
desarrollan sus ciclos y la interdependencia que llega a existir entre ellos (las actividades de un
microorganismo permiten crecer a otro y viceversa). esta columna es un sistema completo y autnomo
de crecimiento, mantenido slo por la energa de la luz.

a columna aqu descrita se centra sobre todo en el ciclo del azufre, pero se podra desarrollar en otros
ciclos biogeoqumicos equivalentes para el nitrgeno, carbono y otros elementos.
El montaje consta de un cilindro ancho de cristal que se lena con lodos ricos en materia orgnica (1/3).
se aaden restos orgnicos de diferente origen (celulosa, races, carne, etc) y un suplemento compuesto
de CaSO y CaCO (que actan como fuente de sulfato y tampn respectivamente). la mezcla se cubre con
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papel de aluminio y se deja reposar.

a lo largo de la columna se formarn diferentes poblaciones bacterianas en funcin de los

requerimientos ambientales:

Zona anaerobia (sin oxgeno) - bacterias anoxignicas

En la zona inferior se desarrollan organismos que desarrollan procesos fermentativos que

producen alcohol y cidos grasos como subproducto de su metabolismo, que a su vez es sustrato
para el desarrollo de bacterias reductoras de sulfato. Como resultado se liberan sulfuros que
difunden a la zona superior oxigenada creando un gradiente en el que se desarrollan bacterias
fotosintticas del azufre.

Hay dos tipos de organismos anoxignicos: los que fermentan la materia orgnica (degradan MO
inorgnica) y los que realizan la respiracin anaerobia (degradacin completa a CO utilizando una
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sustancia distinta a O como aceptor de electrones). En el nivel ms bajo de la columna, e el

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ambiente con alta concentracin de SH y celulosa, aparecern bacterias fermentadoras de celulosa

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(gnero Clostridium) y bacterias reductoras del azufre (Desulfovibrio) generando grandes cantidades
de SH . Las bacterias verdes del azufre (Chlorobium) procesan los sulfatos a azufre y un poco ms
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arriba, con una concentracin menor de sulfato, se desarrolla una zona de bacterias prpuras del
azufre (Chromatium). Un poco por encima de esta zona nos encontramos una franja de bacterias
prpuras no del azufre (Rhodospirillum y Rhodopseudomonas).

Zona aerbica (con oxgeno) - bacterias toxignicas

La parte superior de la columna es ms rica en oxgeno y ms pobre en azufre. Sin embargo, por
difusin llega cierta cantidades de SH , que ser oxidado a sulfato por bacterias sulfato oxidadoras
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(Beggiatoa y Thiobacillus). En las zonas superiores pueden crecer cianobacterias fotosintticas, que
se caracterizan por ser las nicas que realizan una fotosntesis similar a la de las plantas (teoria
endosimbiotica).
S. XX XXI: Interaccin de la Microbiologa con otras disciplinas [Bioqumica, Biologa Molecular,
Ingeniera Industrial]

Descubrimiento de viroides y priones

Desarrollo de la quimioterapia
Desarrollo de la Biotecnologa Industrial
Desarrollo de la Biotechnologa Ambiental
Desarrollo de Tcnicas moleculares para el estudio de los microorganismos en el ambiente

3. LOS RETOS ACTUALES EN MICROBIOLOGA AMBIENTAL

Noticias en prensa en el ltimo ao:

1. Influencia de la actividad microbiana en la biosfera/geosfera/atmsfera:

Un incremento sbito de O2 explica el origen de los animales EL PAIS 29/07/2013

Bacterias en las nubes EL PAIS 30/01/2013
El plancton es una esponja de carbono EL PAIS 18/03/2013
Bacterias de peso EL PAIS 08/09/2013

2. Las ltimas fronteras de la vida:

Noticias relacionadas sobre la diversidad microbiana del lago Volstok EL PAIS 15/01/2013,
8/03/2013, 8/07/2013, 12/07/2013
La vida bulle en la sima del mundo EL PAIS 18/03/2013
El proyecto Malaespina est secuenciando genomas del ocano profundo EL PAIS 12/06/2013

3. La biodiversidad microbiana como fuente de recursos:

Plantas, animales y microbios son tambin recursos renovables EL PAIS 15/02/2013

Un nuevo antibitico nacido en el fondo del mar EL MUNDO 05/08/2013

4. Los microorganismos como agentes de biorremediacin

Una salida para el biocombustible EL PAIS 15/08/2013

Debajo del oro hay arsnico EL PAIS 18/12/2012

4. NATURALEZA DEL MUNDO MICROBIANO

Virus

A. Virus del Mosaco del Tabaco B. Bacterifagos

Bacterias: Escherichia coli

Levaduras: Saccharomyces cerevisiae

Hongos filamentosos: Penicillum sp

Protozoos

Plasmodium malariae Trypanosoma gambiense

Algas unicelulares

5. LOS MICROORGANISMOS EN LOS SISTEMAS DE CLASIFICACIN DE LOS SERES VIVOS

6. LOS MICROORGANISMOS EN LOS HITOS ESENCIALES DE LA EVOLUCIN BIOLGICA

7. ANLISIS EVOLUTIVO DE LOS MICROORGANISMOS: EL GEN rRNA COMO RELOJ MOLECULAR

Qu es un reloj molecular?,

son molculas presentes en todos los tipos celulares, y de las cuales depende el funcionamiento de las
clulas. As son molculas estables relacionadas con los procesos de replicacin, trascripcin y
traduccin (sntesis proteica).

DNA, gen rRNA, gen tRNA

Qu reloj molecular es ptimo para medir la evolucin celular?,

Los cambios de nucletidos (al azar) se acumulan en la secuencia proporcionalmente al tiempo

transcurrido.

Estos cambios no interfieren en la funcin gnica (no hay presin selectiva). - Secuencia primaria
informativa (compuesta por muchos nucletidos).

Genes rRNAs

Estructuras primaria y secundaria del 16S rRNA

de E. coli (aprox. 1450 bases)

RNA ribosmico

Procariotas

16S
23S
8S

Eucariotas

18S
28S
5S
5,8S

8. RBOL FILOGENTICO UNIVERSAL DE LOS SERES VIVOS

Relaciones evolutivas basadas en la secuencia del 16S/18S rRNA

9. EL ORIGEN DE LA CELULA EUCARIOTA

La clula eucariota se form por endosimbiosis primaria

(a) de una Bacteria (ancestro de la actual mitocondria) y una clula primitiva con ncleo diferenciado, o
bien,

(b) de una Bacteria (ancestro de la actual mitocondria) y una Arquea, provocando en la clula resultante
el posterior desarrollo de un ncleo diferenciado.

Posteriormente, la endosimbiosis primaria de una Bacteria (ancestro del actual cloroplasto) y un

Eucariota, provoco la divergencia de los eucariotas fotosintticos.

10. PRINCIPALES CARACTERISTICAS DE LOS DOMINIOS BACTERIA ARQUEA Y EUKARYA

Los dominios Bacteria, Arquea y Eukarya presentan, no obstante, caracteres comunes entre ellos (dos a
dos), indicndonos que compartieron algn momento de su historia evolutiva.