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Ingeniera gentica: Aplicaciones biotecnolgicas

Produccin de GMOs: vegetales


Otro tipo de vectores para producir otros GMOs

En vegetales:
Agrobacterium tumefeciens
Ingeniera gentica: Aplicaciones biotecnolgicas
Produccin de GMOs: vegetales
Otro tipo de vectores para producir otros GMOs
Alimentos transgnicos

PLAY
http://www.youtube.com/watch?v=L7qnY_GqytM&feature=related

Tema expo: Mtodos de Produccin de GMOs animales


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Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca

1. Productos menos txicos


2. Reduccin de gasto energtico
3. Reduccin de derivados
4. Economa atmica
5. Empleo de fuentes renovables
REQUERIMIENTOS
DE LA QUMICA 6. Catlisis
VERDE 7. Prevenir produccin de residuos
8. Sntesis qumica segura
9. Reduccin de sustancias auxiliares
10. Productos degradables
11. Monitorizacin en tiempo real
12. Empleo de sustancias seguras.
Oxford University Press. Anastas (1998)
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Catlisis y Qumica Sostenible

Reacciones ms rpidas a temperaturas ms bajas(actividad).

Menos subproductos y Ahorro de pasos de purificacin


(selectividad - especificidad).

Ingeniera y Economa del proceso (estabilidad).


Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Biocatlisis para la industria

LOS BIOCATALIZADORES SON CAPACES DE CATALIZAR LOS PROCESOS


QUMICOS MS COMPLEJOS

CONDICIONES SUAVES

Eficiencia energtica.
Ausencia de subproductos (enzimas).
Ausencia de reactivos txicos.
Respeto por el medio ambiente.

PROCESOS SOSTENIBLES
Ingeniera gentica: Aplicaciones biotecnolgicas
Ingeniera de Biocatalizadores
Cmo mejorar el biocatalizador

BIOLOGA MOLECULAR
Diseo de enzimas recombinantes de organismos termoalcalficos

Purificacin

CRISTALOGRAFA
QUMICA DE SUPERFICIES
(Estructura 3D)

INMOVILIZACIN

INGENIERA DEL MEDIO

Optimizacin de la estabilidad y la reactivacin Optimizacin de la selectividad Aumento de la actividad


Bases de la biotecnologa: Ingeniera gentica
Biotecnologa Blanca: Ingeniera de Biocatalizadores
Cmo mejorar el biocatalizador

- Ingeniera de protenas.
- Ingeniera de inmovilizacin.
- Ingeniera del medio de reaccin.

Ingeniera de protenas: mutagnesis dirigida, al azar, modificaciones qumicas,


mtodos in silico.

Ingeniera de inmovilizacin: heterogeneizacin y estabilizacin; mtodos


reversibles e irreversibles, uso de macro y nanopartculas.

Ingeniera del medio de reaccin: cambio en el diseo de reactores, cambio del


medio de reacccin, uso de aditivos (cosmotropos, cosolventes, detergentes),
Optimizacin.
Ingeniera gentica: Aplicaciones biotecnolgicas

Cmo mejorar la protena o biomolcula recombinante


obtenida.
Al azar (no racional) : se promueven mutaciones durante la PCR o
en los clones generados (con mutgenos) y despus se ve el
resultado en la protena.

Mutagnesis Sitio-dirigida (racional): se cambian ciertos aminocidos de lo


(cambios en el gen que se conoce su funcin probable en la protena por otros para
condificante de la
protena de inters verificar hiptesis y producir mutantes con nuevas propiedades.
para cambiar sus AAs)

Combinatoria (semi-racional): usada en evolucin dirigida y se


dan cambios de fragmento del gen asociados al sitio activo u
otros dominios; sobre el fragmento se realizan diversas
combinaciones (todas si es saturacin) posibles de cambios de
aminocidos; cada cambio genera una protina mutantes sobre
la cual se puede hacer un nuevo cclo de mutagnesis.
Bases de la biotecnologa: Ingeniera gentica
Biotecnologa Blanca: Ingeniera de Biocatalizadores
Cmo mejorar la protena o biomolcula recombinante
obtenida. Sitio-especfica (racional): ej. Whole Plasmid Mutagenesis
Primers
con
mutacin

Mutagnesis Nuevo
(cambios en el gen plsmido
codificante de la con mutacin
protena de inters
para cambiar sus AAs)

La enzima DpnI slo hidroliza el plsmido


original por estar metilado (el nuevo no).

El nuevo plsmido
mutado se usa
para transformar
clulas.

http://www.genomics.agilent.com/article.jsp?pageId=384
Ingeniera gentica: Aplicaciones biotecnolgicas
Biotecnologa Blanca: Ingeniera de Biocatalizadores
Cmo mejorar la protena o biomolcula recombinante
obtenida. Sitio-especfica (racional): Ej. cambio de Ser x Ala
Triada Cataltica : Asp-His-Ser x Asp-His-Ala

Mutagnesis
(cambios en el gen
condificante de la
protena de inters
para cambiar sus AAs)

"Catalytic triad of TEV protease" by Thomas Shafee - Own work. Licensed under CC BY-SA 3.0 via Wikimedia Commons - http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Catalytic_triad_of_TEV_protease.png#/media/File:Catalytic_triad_of_TEV_protease.png
Ingeniera gentica: Aplicaciones biotecnolgicas
Biotecnologa Blanca: Ingeniera de Biocatalizadores
Cmo mejorar la protena o biomolcula recombinante
obtenida.

La subtilisina, una enzima usada en detergentes , se ionactiva con H2O2

Enzima inactivada
Ingeniera gentica: Aplicaciones biotecnolgicas
Biotecnologa Blanca: Ingeniera de Biocatalizadores
Cmo mejorar la protena o biomolcula recombinante
obtenida. Sitio-especfica (racional): Ej. cambio de Met x Ala
Sustitucin en Subtilisina de Met 22 x Ala 22

Mutagnesis
(cambios en el gen
condificante de la
protena de inters
para cambiar sus AAs)

Ala

Enzima resistente a blanqueador


Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis (fermentacin) enzimtica

Inmovilizacin de enzimas (o clulas)

Confinamiento espacial, varia maneras de hacerlo:

a) Atrapamiento
b) Encapsulamiento
c) Inmovilizacin en slido
d) Entrecruzamiento
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Inmovilizacin de enzimas (o clulas) en slidos

S
o
p
o
r
t
e Enzima/ clula
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Inmovilizacin de enzimas (o clulas) en slidos

S
o
p Nuclefilo Electrofilo
Catinico Aninico
o Aninico Catinico
r Hidrofbico Hidrfbico
t Enzima/clula M(II) Polihis
Inhibidor Centro activo
e Lectina Oligosacarido
Anticuerpo Antgeno
Grupo Disulfuro Grupo tiol
Dienfilo Dieno

La naturaleza de la unin puede se reversible o irreversible; unipuntual


o multipuntual.
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Inmovilizacin de enzimas

Proceso de Inmovilizacin
Sustrato
Enzima soluble Enzima inmovilizada

+ Soporte

Derivado

Re-uso o uso continuo


Control de la reaccin ms sencillo
Proceso ms limpio Producto

Inmovilizacin Mejora de las propiedades de las enzimas?

Immobilization of Enzymes and Cells. Guisn (2006).


Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Inmovilizacin de enzimas

Ventajas Desventajas
Posibilidad de re-uso del Problemas de
biocatalizador generado transferencia de masa.
Mayor estabilidad Posibles sobrecostos
Modulacin de Dependencia frente a
propiedades catalticas de proveedores de soportes.
Derivado= enzima+soporte
la enzima inmovilizada
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis
Principales tipos de biocatalizadores

Enzimas vs. Clulas enteras


Mayor actividad especfi ca Procesos de varios pasos para ir de SP
Mayor control (especificidad) Produccin de sus propios cofactores
Mas estabilidad Ms problemas de difusin por
Fcil caracterizacin (pH,T,Km,etc) membranas celulares que deben ser
atravesadas.
Ms costosas (necesidad de su
previa purificacin )
Menos subproductos.
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Algunos hitos de la biocatlisis aplicada


Enzimas
Hidrlisis selectiva de penicilina G (PGA)
Produccin de acrilamida (nitrilhidratasa)
Resolucin de mezclas racmicas (lipasas, acilasas)
Almidn . Fructosa (amilasa, glucoamilasa, GI)
Hidrlisis de lactosa a galactosa y glucosa (beta-gal)
Sensores de glucosa (glucosa oxidasa)
Detergentes (proteasas, lipasas)

Clulas enteras
Depuradoras lodos activos.
Fermentaciones industriales (Hongos, Bacterias).
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Requisitos de los microorganismos como biocatalizadores

- Ser capaz de producir la sustancia de inters con altos rendimientos.

- Ser capaz de ser cultivado y de producir el producto a gran escala.

- Ser capaz de reproducirse por si solo.

- Ser capaz de crecer en medio de cultivo lquidos y en condiciones


econmicas.

- No debe ser patognico ni para el ser humano ni para animales o plantas


de inters comercial.

- Debe ser genticamente manipulable (prerrequisito conocer su genoma


y bioqumica).
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Requisitos de los microorganismos como biocatalizadores

- Ejemplos:
BACTERIAS
E. coli. (metabolitos secundarios y protenas recombinantes)
Corynebacterium glutamicum (cido glutmico, esteroides y biorremediacin)
Xanthomonas (goma Xanthan)

HONGOS:
Levaduras (Sacharomices cervisae ; Pichia pastoris): etanol proteinas
recomb.
Aspergillus
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Produccin y Escala

Cultivo con cantidad


Equilibrio de nutriente limitada.

Adaptacin

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c0/Bacterial_growth_en.svg/250px-Bacterial_growth_en.svg.png
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Produccin y Escala (contexto industrial):


Metabolito Primario y Secundario

Taller: listado de al menos 5 ejemplos de metabolismo de cada


grupo.
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Produccin y Escala: Fermentadores

Tamao del fermentador (L) Producto


0-10L ; 300-3000 L Laboratorio ; Planta piloto
1.000-20.000 Enzimas para diagnstico, sustancias
para biologa molecular.
40.000-80.000 Algunas enzimas y antibiticos.
100000-150000 Penicilina, antibiticos tipo
aminoglicsido, enzimas industriales,
transformaciones de esterides,
aminocidos, vino y cerveza
200.000-500.000 Aminocidos (glutmico), vino y
cerveza.
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Produccin y Escala: Fermentadores

~10000L

10,000-100,000 USD
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Produccin y Escala: Fermentadores

Partes crticas.

1. Sistema de aireacin (difusor+


agitador): aire estril para cultivo
aerbico.

2. El agitador: homogeniza el cultivo .

3. Chaqueta de agua o vapor: para


previa esterilizacin y posterior
termostatizacin del cultivo.

4. Control en tiempo real con sondas y


vlvulas automatizadas: ej. para pH,
oxgeno, glucosa, amoniaco, etc.
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Escalado: del laboratorio a la industria

T+I

I+D
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Escalado: del laboratorio a la industria


Principales retos:

1. Comportamiento a escala de laboratorio no son necesariamente


iguales que a escala industrial.

2. Problemas de transferencia de masa

Problemas de mezclado: garantizar


homogeneidad y suficiente aire para el cultivo
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis

Escalado: del laboratorio a la industria Industria


>10.000 L

ETAPAS DE ESCALADO

Planta
piloto
(300-3000L)

Laboratorio
(10L)
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Produccin de medicamentos
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Produccin de medicamentos: antibiticos


Antibiticos son sustancias por microorganismos para matar o detener el crecimiento de
otros microorganismos, generalmente son metabolitos secundarios.

Agrupacin de Bacillus polimixa

Micelio de un Penicillium spp.


Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Lnea histrica
del desarrollo
de Antibiticos
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Descubrimiento de nuevos antibiticos: etapas y tiempos

Naturaleza

15 aos y 1 billn USD.


Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Descubrimiento de nuevos antibiticos: sntesis y validacin

Sintticos
o semisintticos
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Descubrimiento de nuevos antibiticos

Naturaleza
Mtodos
in silico
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Descubrimiento de nuevos antibiticos: aislamiento de


microorganismos

Cultivo liquido
Cultivo slido
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Descubrimiento de nuevos antibiticos: aislamiento de


microorganismos porductores de antibitico

Adicin
Cultivo slido de
patgeno
(ej. S. aureus)

Zonas de inhibicin de
crecimiento alrededor
de colonias candidatas
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Descubrimiento de nuevos antibiticos: espectro de actividad

Mtodo de cross-streaking: cultivo de colonias candidatas

colonia
colonia en
consolidada
crecimiento

Difusin de antibitico en el agar


Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial

Descubrimiento de nuevos antibiticos: espectro de actividad

Mtodo de cross-streaking
Inoculacin de patgenos
e incubacin.

a b c d e a b c d e

a = E. coli
b = B. subtilis
Es nuevo el antibitico producido por c = S. aureus
el organismo candidato? d = K. pneumoniae
e = M. smegmatis
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial
Produccin y Purificacin de antibiticos

Naturaleza

Bioprospeccin GMO

Aislamiento
y
Seleccin Ing. gentica
y metablica
Aumento en rendimiento produciendo
el metabolitos difundibles de inters

y/o

Seleccin natural
Procesos Biotecnolgicos: Biotecnologa Blanca
Biocatlisis industrial
Produccin y Purificacin de antibiticos

Purificacin y cristalizacin.

Pirgenos

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