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En 1944: O. Avery, C.Macleod y M.McCarty se propusieron descubrir la naturaleza del principio transformador.
-Repitieron los experimentos de transformacin en un tubo de ensayo.
-Descubrieron que podan convertir la cepa R en cepa S simplemente aadiendo un extracto sin clulas de la cepa S a la cepa R.
Pero qu haba en este extracto sin clulas capaz de convertir la cepa R en cepa S?
Era una protena?
Era un cido nucleico?
Era un lpido?
Para poder llegar a una conclusin, tomaron el extracto sin clulas y lo trataron con varias enzimas para probar si segua siendo
efectivo a la hora de transformar R S.
1) Trataron el extracto sin clulas con proteasas (que cortan protenas) el extracto segua siendo activo, por lo que no se trataba
de una protena
2) Trataron el extracto sin clulas con ribonucleasa (corta el ARN) el
extracto segua siendo activo, por lo que no era el ARN.
3) Trataron el extracto sin clulas con deoxiribonucleasa (corta ADN)
NO era activo, DEBA SER EL ADN.
b) Base: en el ADN hay 4 tipos: La base est ligada al carbn C1 del azcar.
El ADN est compuesto de monmeros denominados desoxiribonucletidos trifosfato (dNTPs). Los dNTPs estn ligados entre s
mediante uniones de azcar-fosfato, que constituyen el esqueleto del ADN:
El azcar (la desoxiribosa) est ligada covalentemente al grupo fosfato a travs de una unin fosfodiester.
Estos virus se denominan bacterifagos (virus o patgenos viriones (partculas de virus). La clula se va lisando
que infectan a las bacterias). conforme se va liberando la descendencia del virus,
resultando as la muerte celular.
Cmo tiene lugar el proceso de infeccin?
Inyecta el bacterifago su ADN, su cpside proteica o
ambos?
Para poder identificar qu material se introduca en la clula,
era necesario distinguir entre el ADN y las protenas.
Para encontrar la ubicacin del ADN y de la protena en el
interior de la clula, emplearon radioistopos.
- Utilizaron el istopo 32P para marcar el ADN viral (slo
seala el ADN, porque el fsforo no est presente en las
El material gentico del virus se almacena en el interior de
protenas).
una cpsida proteica.
- Utilizaron el istopo 35S para marcar la protena viral (slo
Cuando el fago infecta las bacterias, inyecta su ADN viral en
seala la protena, porque el azufre no est presente en el
el interior de la clula. El ADN se replica y se crean nuevos
ADN).
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Las partculas de virus, ms pequeas que las bacterias, permanecieron, tras la centrifugacin, o bien en la parte lquida o en el
sobrenadante de la mezcla del tubo de ensayo. Las bacterias, por el contrario, y debido a su mayor peso, formaron una pequea
aglutinacin en el fondo del tubo de ensayo.
Conclusin: Ya que en el interior de las clulas se encontr principalmente ADN, concluyeron que el ADN era el material gentico.
Se encontr una cierta cantidad de marcador 35S asociado a las clulas bacterianas, por lo que algunas personas creyeron que el
material gentico era la protena que estaba pegada a la clula.
PERO, en general, la mayora de la gente crey que el ADN era el material gentico.
Estos experimentos reforzaron las nociones propuestas anteriormente por Avery, MacLeod y McCarty.
Reglas de Chargaff
%A=%T
%G=%C
Entonces, ahora que ya se haba deducido el modelo del ADN, qu es lo que haca del ADN algo realmente emocionante?
Era el ADN el secreto de la vida? Cmo transmite uno la herencia a los hijos?
El conocimiento de la estructura del ADN permiti que se comenzasen a elaborar respuestas para algunas de estas preguntas.
Cada hebra de la doble hlice de ADN es una copia complementaria de la otra hebra.
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El modelo de doble hlice del ADN sugera la existencia de un mecanismo para la replicacin (copia) del ADN.
Si cada hebra sirve de molde para la replicacin del ADN, la replicacin del ADN debera tener lugar mediante un mecanismo
semiconservativo: esto es, cada nueva molcula de ADN est compuesta de una hebra nueva y otra vieja.
El mecanismo semiconservativo de la replicacin del ADN fue propuesto por Watson y Crick.
1957 M. Meselson y F. Stahl queran confirmar si la replicacin del ADN tena lugar mediante un mecanismo semiconservativo.
Para ello, utilizaron un istopo pesado (15N) de 14N (nitrgeno).
Experimentos:
1) - Cultivaron bacterias E. Coli en un medio que contena 15NH4Cl como nica fuente de nitrgeno.
- El 15N se incorpora a las bases de pirimidina y purina; por lo tanto, el ADN pasa a ser ms pesado de lo habitual.
- Cultivaron muchas generaciones de bacterias en 15N para que las hebras de ADN contuviesen 15N. Aislaron una parte de este ADN
pesado.
2) Tomaron las bacterias cultivadas en 15N y las transfirieron a un medio que contena 14NH4Cl. El ADN fue aislado en varias
ocasiones a partir de la nueva ubicacin de la bacteria en el medio 14N. Cultivaron las bacterias durante dos generaciones ms y
aislaron el ADN.
3) Utilizaron la tcnica denominada centrifugacin por gradiente de densidad, que permite separar entre s molculas de ADN segn
su densidad.
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Tal como muestran las autoradiografas, el uracilo (y por tanto el ARN) migra desde el ncleo hacia el citoplasma. Con esto se
confirma la posibilidad que el ARN sirve de intermediario entre el gen del ADN y la sntesis de protenas. Con posterioridad, a esta
molcula se le llam ARN mensajero o ARNm.
De esta manera, el flujo de la informacin gnica se podra representar de la siguiente manera:
Transcripcin
La expresin gnica se concretiza por la transformacin de la informacin gentica desde molculas de ADN a molculas de ARN y
desde estas hasta los polipptidos correspondientes.
Las molculas de ARN son sintetizadas usando como molde a segmentos especficos de ADN, en la reaccin de polimerizacin que
es catalizada por la enzima conocida como ARN polimerasa.
Existen 3 clases principales de ARN, todas ellas participan en la sntesis de protenas: ARN ribosomal (rRNA), ARN de
transferencia (tRNA) y ARN mensajero (mRNA): todos ellos son sintetizados a partir de moldes de ADN en un proceso denominado
transcripcin.
En 1958, Francis Crick resumi la relacin entre ADN, el ARN y las protenas en un diagrama de flujo que nombr como el DOGMA
CENTRAL DE LA BIOLOGA MOLECULAR:
"el ADN dirige su propia replicacin y su transcripcin a ARN, el cual a su vez dirige su traduccin a protenas"
La unin de la Holoenzima con el promotor, determina el Complejo Promotor Abierto, y esto es posible
gracias a la presencia del factor
La ARN polimerasa es lo bastante grande como para tomar contacto con muchas bases del ADN, as la enzima cubre
aproximadamente unas 60 pb (pares de bases), aunque el segmento de ADN desenrollado, y que sirve como molde, comprende
nicamente unos 17 pb.
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Sntesis de Protenas
La secuencia de bases de un gen es colineal con la secuencia aminoacdica de su producto polipeptdico. El cdigo gentico es la
relacin entre la secuencia de bases en el ADN (o su ARN transcrito) y la secuencia de aminocidos en una protena.
Los aminocidos son codificados por un grupo de tres bases (llamadas codones) comenzando de un punto determinado (ver fig.
12).
Se pueden definir cuatro caractersticas generales del cdigo gentico:
1) El cdigo no requiere de puntuacin ni seal alguna para indicar el final de un triplete y el comienzo del siguiente, es decir el
cdigo gentico no tiene comas. nicamente requiere de una molcula de mARN que este ubicada correctamente para su
lectura (53) adems de contar con el codn de inicio, AUG (en procariontes codifica la incorporacin de N-formilmetionina
y en eucariontes metionina).
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2) 61 de 64 codones especifican algn aminocido en particular. De esta forma, para la mayora de los aminocidos hay ms
de un triplete (o codn). En otras palabras, el cdigo es DEGENERADO. Codones que especifican el mismo aminocido son
llamados sinnimos. La mayora de los sinnimos difieren solamente en la ltima base del triplete. Esto presenta una
ventaja, debido a que la mayora de las mutaciones conducen a la formacin de tripletes sinnimos no provocando un cambio
en la secuencia peptdica.
3) La tercera base de los tripletes es menos especifica que las dos primeras. La degeneracin implica solamente la tercera base
en la mayora de los casos (excepto para Arginina, Leucina y Serina).
4) 3 de los 64 tripletes no codifican para aminocido alguno y estos son UAG, UAA y UGA llamados originalmente codones sin
sentido que constituyen las seales de termino de la sntesis de la cadena polipeptdica.
La sntesis de protenas tienen lugar en la superficie de los ribosomas. Dicha sntesis requiere que los aminocidos sean
activados en el citoplasma por la accin de aminoacil- tARN-sintetasas, que catalizan la formacin de steres de
aminocidos de tARN homlogos (unin de un aminocido con su tRNA respectivo) y en forma conjunta en el proceso de activacin
se hidroliza ATP produciendo AMP y pirofosfato. Las aminoacil-tARN-sintetasas son altamente especficas tanto para el
aminocido como para su correspondiente tARN.
El aminocido se une al extremo 3 del tARN que posee la secuencia CCA, mientras que el anticodn esta a 80 de distancia en
el otro extremo (ver fig. 13).
Sitio de unin al
aminocido
3
A
C
5 C
anticodn
Figura 13. Estructura de hoja de trbol caracterstica de un tARN
El ARN mensajero reconoce el anticodn de un tARN en vez de reconocer el aminocido. Un codn en mARN se aparea con el
anticodn en el tARN. Algunos tARNs reconocen ms de un codn porque la tercera base que se aparea de un codn es menos
especifica que las otras dos ( ver cdigo gentico).
Los Ribosomas.
La sntesis de protena tiene lugar en los ribosomas, que estn formados por una subunidad mayor y una menor, cada una de las
cuales estn compuestas de dos tercios de ARNs y un tercio de protenas. En E. coli, por ejemplo, el ribosoma 70 S ( 2.500
kdal) est formado por una sub-unidad de 30 S y una de 50 S. En cambio en eucariontes el ribosoma es de 80 S, formado por uno
de 40 S y uno de 60 S.
Hay tres fases en la sntesis de protena: inicio, elongacin y trmino.
CADENA NASCIENTE
40 S
5' 3'
STOP
INICIO
INICIO
ELONGACION TERMINO
40 S 60 S
60S
40 S
60 S
Inicio.
En procariontes el ARN mensajero, la formilmetionina- tARN y la sub-unidad ribosomal 30 S, forman el complejo iniciacin de la
sntesis (en cambio para eucariontes este complejo est formado por mARN, metionina-tARN y la sub-unidad 40 S, ver fig. 14).
La seal de inicio en el mARN es AUG y esta precedida por una secuencia rica en purina que puede aparearse con el rARN 16 S
de la sub-unidad 30 S del ribosoma. La subunidad mayor ribosomal de 50 S se une a este complejo para formar un complejo de
iniciacin de 70 S, (ver fig. 15) que esta listo para la siguiente fase (elongacin). En el proceso de iniciacin estn participando
una serie de factores protecos que son descritos en la Tabla IV.
mARN
fMet.tARNMet
30S
IF-1 IF-3 IF-1 IF-3
IF-2 GTP
IF1
IF2
50 S
Sitio P
GTP GDP+ Pi
Inicio de un
nuevo ciclo Formacin del enlace
peptdico catalizado por
la peptidil transferasa
f- Met Sitio A
| vaco f- Met
Arg |
| Arg
|
Translocacin
GDP + Pi GTP
Figura 16. Fase de elongacin de la cadena peptdica: unin del aminoacil-tARN, formacin del enlace peptdico y translocacin.
Termino.
La sntesis de protena es terminada por factores de liberacin, que reconocen los codones de terminacin UAA, UGA y UAG
provocando la hidrlisis entre el polipeptido y el tARN (Tabla VI).
La energa requerida tanto en la formacin del complejo de iniciacin son 70 S como en la unin del aminoacil- tARN al ribosoma,
y en la transposicin son obtenidos de la hidrlisis del GTP ( ver Tabla VII ).
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Varios pasos en la sntesis de protena son especficamente inhibida por toxinas y antibiticos. Por ejemplo, puromicina inhibe la
sntesis de la cadena peptdica por su interaccin con el peptidil - tARN en la ribosoma, formando peptidil- puromicina que libera el
complejo ribosomal ( ver Tabla VIII).
Por otro lado, los polirribosomas, tambin denominados polisomas, consisten en molculas de mARN a las que estn adheridos
muchos ribosomas, cada uno de los cuales, leen el mARN independientemente y construyen una cadena polipeptdica. En las
clulas eucariticas, la sntesis proteca puede tener lugares en ribosomas libres, o bin, en los ribosomas unidos al retculo
endoplasmtico.
Tambin existe sntesis proteca en las mitocondrias y en los cloroplastos, los cuales poseen mARNs, tARNs especficos,
aminoacil- tARN-sintetasas y ribosomas.
SNTESIS DE ADN
Requerimientos para la duplicacin del ADN.
En todos los organismos los requerimientos generales para la sntesis de ADN son los mismos:
- una hebra de ADN como molde, en otras palabras una seccin de ADN que ser copiado.
- la enzima encargada de copiar el ADN, llamada ADN polimerasa.
Mg+2
d (NMP)n + d NTP d (NMP) n+1 + PPi
ADN polimerasa
- ADN polimerasa I.
Es una de las enzimas que es capaz de catalizar la sntesis
de ADN.
Posee una sola cadena polipetdica de 109 kDa.
Contiene un tomo de zinc como cofactor.
Esta enzima sintetiza en la direccin 5-->3 ( ver fig. 2).
Todas las ADN polimerasas poseen una actividad exonucleasa; esto corresponde a la actividad de hidrolizar el ADN de hebra
simple, removiendo deoxirribonucleotidos terminales desde el extremo 3 (actividad exonucleasa 3 5) o desde el extremo 5
(actividad exonucleasa 5 3).
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- ADN polimerasa II
Esta enzima sintetiza ADN en forma similar a la ADN polimerasa I, pero no tiene actividad exonucleasa 5 3.
Origen de duplicacin.
La sntesis del cromosoma de E.coli siempre comienza en el mismo punto, llamado sitio ori C, una regin de 245 pares de bases.
oriC
Las hebras de ADN son antiparalelas y la cadena del ADN que va en direccin 3 5 es copiada directamente por la enzima
ADN polimerasa III. La hebra hija sintetizada (5 3) es llamada HEBRA PRINCIPAL o ADELANTADA.
La otra hebra del ADN padre que tiene la direccin opuesta, 5 3, no puede ser copiada directamente, debido que no es sustrato
para la enzima y solamente puede ser sintetizada hasta que una parte del ADN se ha desdoblado. La hebra hija resultante se llama
HEBRA RETRASADA y es sintetizada en forma discontinua.
Esta sntesis discontinua resulta de la formacin de cortas secciones de ADN de aproximadamente 1000 a 2000 nucletidos que
reciben el nombre de FRAGMENTOS DE OKASAKI. Estas secciones son unidas por la accin de la enzima ADN ligasa
produciendo una hebra de ADN continua, que algunas veces se conoce como ADN+.
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Helicasas
(desdobla ADN) Primosoma (hace el primer)
Holopolimerasa III
Primer (agrega dNTPs)
Topoisomerasa El primer es
(relaja tensin) removido y
llenado el espacio
Hebra
Adelantada Hebra
Pol I
Retrasada
Ligasa
Previo a la sntesis.
Previo al proceso de sntesis del ADN propiamente tal, el ADN padre de doble hebra debe desenrollarse, para lo cual se requiere
la accin de la protena REP o HELICASA que necesita energa proveniente del ATP. Adems en este proceso de desenrollamiento
participa la enzima ADN girasa, que acta dando giros negativos al ADN padre cuando este se encuentra sobre enrollado.
Como mencionamos anteriormente las ADN polimerasas I. II y III poseen la actividad exonucleasa que permite aumentar la
fidelidad de la duplicacin o replicacin del ADN, removiendo los nucletidos que fueron puestos erradamente.
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Durante el proceso de duplicacin del ADN circular (E.coli) se produce una estructura caracterstica, formada por dos horquillas (o
frentes) de duplicacin.
Direccin de la
replicacin
- HELICASA: son enzimas requeridas para desdoblar y abrir la molcula de ADN padre debido que esto no ocurre
espontneamente. Las helicasas requieren ATP como cofactor.
Dos diferentes helicasas han sido descritas, una de ellas se mueve en direccin 3 5 del ADN padre y recibe el nombre
de REP o HELICASA II o COPOL III (subunidad beta de la ADN polimerasa III) y las otras se mueve en direccin 5 3
, llamadas HELICASA I y III.
- PROTEINAS QUE SE UNEN A HEBRA SIMPLE (SSB): Las hebras simples de ADN generadas por las helicasas
son mantenidas separadas por la unin de las protenas SSB a la hebra de ADN. (ver figura 3 y Tabla II)
- ADN LIGASA es una enzima que cataliza la formacin de enlaces fosfodiester entre polinucletidos preformados. La
ADN ligasa esta involucrada en la sntesis de ADN discontinua, uniendo los fragmentos de OKASAKI una vez que se ha
reemplazado el partidor de RNA. Ellas tambin estn involucradas en los mecanismos de reparacin del ADN daado.
Existe un solo tipo de ADN ligasa en procariontes y dos en eucariontes; ambas funcionan en el ncleo.
Protenas Funciones
Protena N o dnaB Capacita a la primasa para comenzar la duplicacin
Primasa Sintetiza el ARN partidor.
Helicasas Desdobla la doble hlice.
Protenas SSB Estabiliza regiones de hebra simple.
ADN girasa Introduce giros a la superhlice.
ADN polimerasa III Sintetiza el ADN.
ADN polimerasa I Saca la hebra partidora y completa los espacios.
ADN topoisomerasa I Corta una hebra de ADN.
ADN topoisomerasa II Corta ambas hebras de ADN.
ADN ligasa Une los extremos de los polinucleotidos preformados.
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Algunos virus poseen otra forma de sintetizar ADN, debido que tienen una enzima llamada TRANSCRIPTASA REVERSA (Inversa)
capaz de usar como hebra molde la molcula de ARN.
3 Procariontes
3 5 3 5
Hebra Hebra
adelantada retrasada
Pol
3'
5'
Helicasa
PCNA
Pol
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EJERCICIOS
1. Cules eran las hiptesis de partida sobre la naturaleza de la molcula de la herencia? Cul era la hiptesis ms apoyada por
la comunidad cientfica?
2. Explica a travs de un mapa conceptual el experimento de Griffith y su principio transformante
3. Explica a travs de un mapa conceptual el experimento de Avery, C.Macleod y M.McCarty.
4. De acuerdo a las hiptesis razonables de partida, por qu crees que Avery, McLeod y McCarthy experimentaron con cinco
fracciones: polisacridos, lpidos, protenas, ARN y ADN?
5. Qu cientficos aportaron la primera evidencia experimental de que el DNA es el material gentico?
6. En el experimento de Griffith (1928), cuando mueren los ratones.
7. Si el ADN de una bacteria contiene una cadena marcada con N15 y otra sin marca (N14) es colocada sucesivamente en medios
N14, entonces como sern las cadenas de ADN en la cuarta generacin.
8. En el experimento de replicacin del DNA de Meselson y Stahl, qu porcentaje del DNA est formado por una hebra ligera y otra
hebra pesada despus de una generacin creciendo en un medio que contiene 14N?
11. Avery, MacLeod y McCarty (1944) investigaron sobre la naturaleza qumica del principio transformante a travs de anlisis
qumicos, enzima-ticos, serolgicos y de espectroscopia ultravioleta. Llegaron a establecer que la "fraccin activa" (transformante)
no contena protenas, ni lpidos, ni polisacridos serolgicamente activos, sino que consista principalmente, si no exclusivamente,
de una "forma viscosa de cido desoxirribonucleico altamente polimerizado". El valioso aporte de Avery y colaboradores respecto de
la naturaleza qumica del material hereditario fue ms meritorio an, por cuanto la mentalidad cientfica de la poca atribua dicha
capacidad transformante a las protenas cromosmicas, y ninguna, o escasa participacin a los cidos nucleicos.
a. En relacin con lo relatado, qu resultados experimentales debieron haber obtenido Avery y col. en los tratamientos enzimticos
que se enumeran ms abajo, corno para llegar a concluir que principalmente el DNA deba ser el principio transformante? Complete
la Tabla 5.2.
TABLA 5.2
Conservacin de la actividad del principio transformante en extractos celulares tratados con diferentes enzimas
Extracto celular Tratamiento Actividad del principio transformante
enzimatico
a) Extracto celular Ninguno S
b) Extracto celular Lipasas
c) Extracto celular Proteasas
d) Extracto celular Ribonucleasas
e) Extracto celular DNAsas
b. Considera Ud. que los resultados experimentales de la Tabla 5.2 son probatorios de la naturaleza del principio transformante?
12. Stardate 7.012.10.4.00 Diario personal del Mdico militar del USS Hackerprise: Al regresar de una misin en Europa, su
compaero de tripulacin, Noslen, se pone muy enfermo. Explora a Noslen en bsqueda de seales de infeccin y descubre que
est incubando un virus aliengena.
Descubre que este virus porta cidos nucleicos, protenas y lpidos. Tambin averigua que este Virus puede infectar a las clulas de
E. coli, pudindose as analizar fcilmente en el laboratorio.
I. Si cultiva este virus con uno de los siguientes radioistopos: 32P, 3H , o 35S.
a) Qu macromolcula viral ser marcada con 32P?
b) Qu macromolcula viral ser marcada con 3H?
c) Qu macromolcula viral ser marcada con 35S
13. Escribir la secuencia complementaria en direccin 5 3, luego transcriba la hebra complementaria y tradzcala.
a) 5- GATCAA- 3
b) 3- ACTGGCCTAA -5
c) 5- ACCTAGGGTA -5
d) 3- CCTGGATTAAG -5
14. Escribir las secuencias de los mARN sintetizados de los siguientes ADNs
a) 3- ATTGCCATGCTA-5
b) 5- AGCTACTTAACG-3
c) 3-GGACCTACGTT.5
Adems indique cuales son los codones sin sentido presentes.
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15. Cuantos aminocidos pueden ser codificados de las siguiente secuencia de mARN.
a) Asumiendo que comienza la lectura en el extremo 5 inmediatamente.
b) Comenzando en forma normal establecida por el cdigo gentico.
3. 1- 5- UUGCCUAUGGAUUGGAUG-3
3. 2- 3-AUGUAGGUAAAGGUAGGCC-5
3. 3- 3- AGCGCCAGUGACCAUGUA-5
16. Que secuencia es formado por la adicin de un poli (UUAC) a un sistema de sntesis de protenas.