Texto Auxiliar - Proteína - 03 PDF

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AULA
Protenas 1 uma
introduo
Meta da aula
Introduzir o conceito de nveis
organizacionais das protenas, apresentando
o que a estrutura primria desses
compostos e sua importncia.
objetivos
Esperamos que, ao final desta aula, voc seja

capaz de:
1 identificar ligaes peptdicas;
2 descrever a formao de pontes dissulfeto;
identificar a importncia da seqncia primria

3
para a funo de uma protena.
Bioqumica I | Protenas 1 uma introduo
INTRODUO As protenas so os principais constituintes celulares, com grande importncia

na manuteno da vida, por desempenharem diversas funes. Conhea
algumas:
A contrao dos nossos msculos, que proporciona nossos movimentos,
acontece pela atuao de algumas protenas, sendo as principais a actina
e a miosina.
O processo de transporte e utilizao de oxignio e gs carbnico realizado
pelo nosso organismo tem participao das protenas hemoglobina e
mioglobina (mais adiante, na Aula 16, teremos um captulo especial
dedicado a essas duas protenas, que so completamente adaptadas ao
transporte desses gases de uma maneira belssima!).
A defesa do nosso organismo contra invasores garantida pelos anticorpos,
que tambm so protenas.
A fotossntese, realizada pelos seres autotrficos, ocorre devido presena
de pigmentos que ficam ligados s protenas.
Penas, chifres, venenos de serpentes, cabelos, unhas e diversas estruturas
animais so compostos por protenas.
As enzimas, que esto envolvidas em quase todas as reaes metablicas
celulares, tambm so protenas. Elas participam de uma enormidade
de funes no nosso organismo; por exemplo, a quebra da glicose, a
utilizao de lipdios como fonte de energia, a formao de ATP, (nossa
moeda energtica), a sntese de colesterol, de lipdios, de glicognio e de
muitas outras molculas.
Na Aula 8, voc viu que essas molculas to fundamentais vida so formadas
pelos aminocidos. Agora voc vai dar um passo frente e aprender como
as protenas se organizam no espao. Vamos l?
Aprendendo mais sobre as protenas...

Voc sabia que o nome protena vem do grego proteios, que
quer dizer primeiro, mais importante? Sabia que 80% do peso
dos nossos msculos desidratados so atribudos s protenas?
Quer saber mais ainda sobre esses compostos? Visite http:
//www.qmc.ufsc.br/qmcweb/artigos/proteinas.html.
8 CEDERJ
MDULO 1
NVEIS ORGANIZACIONAIS DAS PROTENAS
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As protenas podem ser descritas considerando diferentes nveis
AULA
de organizao. Elas possuem estruturas primria, secundria, terciria
e quaternria.
Resumidamente, dizemos que:
estrutura primria: a seqncia linear dos aminocidos da protena;
estrutura secundria: a maneira como esses aminocidos se organizam
no espao. Os elementos de estrutura secundria mais comuns so as
D hlices (l-se alfa-hlices), as fitas E (l-se fitas-beta) e as voltas.
estrutura terciria: a maneira como a protena se organiza no espao
tridimensional, isto , o movimento, a organizao das D hlices, fitas
E e voltas no espao tridimensional;
estrutura quaternria: quando a protena tem mais de uma SUBUNIDADE,
isto , forma dmeros (duas subunidades associadas); trmeros (trs SUBUNIDADE
subunidades associadas); tetrmeros (quatro subunidades associadas) Subunidade de uma
protena uma
e oligmeros (mais de quatro subunidades associadas). cadeia (seqncia)
de aminocidos que
interage com outra(s)
Voc vai aprender nesta disciplina sobre cada um desses nveis cadeia(s) (seja(m)
ela(s) igual(is) ou
de organizao. Na aula de hoje, vamos aprofundar os conhecimentos diferente(s)) para
formar a estrutura
sobre a estrutura primria. da protena em nvel
quaternrio.
1 nvel: estrutura primria
A estrutura primria de uma protena , simplesmente, sua

seqncia de aminocidos. Em outras palavras, a ordem na qual
aparecem os aminocidos em uma dada protena (difcil de imaginar?
Leia o boxe Formando protenas, logo adiante). Essa estrutura apresenta
apenas uma dimenso, j que ela s diz respeito ordem em que esto
dispostos os aminocidos.
A estrutura primria de uma protena pode tambm ser chamada
de seqncia primria. Para entender o que esta seqncia primria,
necessrio saber o que e como se forma uma ligao peptdica.
CEDERJ 9
Formando protenas
Fonte: http://www. Fonte: http://www. Fonte: http://www. Fonte: http://www.

sxc.hu/photo/598140 sxc.hu/photo/516821 sxc.hu/photo/598119 sxc.hu/photo/598121
Formar uma protena pode ser analogicamente comparado a formar uma

palavra. Calma, calma, voc j vai entender!
Imagine que voc queira escrever a palavra AMOR. Voc precisa, para
isso, de quatro letras: A, M, O e R, dispostas nesta ordem. Se voc quiser
escrever ROMA, voc precisa das mesmas quatro letras, mas agora em
uma ordem diferente. Neste exemplo, cada letra a unidade formadora
de uma palavra e, dependendo da ordem em que forem dispostas, do
origem a uma palavra diferente.
Com os aminocidos e as protenas acontece algo semelhante: os
aminocidos (letras) so as unidades formadoras dessas macromolculas
(palavras). Assim, colocando um aminocido em seguida do outro (e
unindo-os por uma ligao qumica, que voc ver como se forma a
seguir), formamos uma protena, assim como colocando uma letra ao
lado da outra podemos formar palavras. A ordem em que os aminocidos
so ligados uns aos outros e quantos so utilizados para constituir uma
protena importante porque permite a enorme diversidade existente
dessas macromolculas. Assim como podemos formar um nmero
gigantesco de palavras com apenas 24 letras, podemos formar um nmero
tambm muito alto de protenas com apenas 20 aminocidos!
O QUE E COMO SE FORMA UMA LIGAO PEPTDICA?
Para que se forme uma seqncia linear de aminocidos (a

estrutura primria de uma protena), necessrio que um aminocido
se ligue quimicamente a outro. Quando esta reao (aminocido +
aminocido) acontece, dizemos que se formou uma ligao peptdica.
A ligao peptdica uma ligao covalente que se estabelece
entre a carboxila (COO) de um aminocido e o grupo amino (NH3+)
do aminocido adjacente. Quando esta ligao se forma, h perda de
uma molcula de gua. Veja:
10 CEDERJ
MDULO 1
So liberados dois Forma-se uma molcula
liberado um oxignio
11
hidrognios durante de gua: 1 oxignio da
durante a reao Forma-se a ligao
a reao carboxila +
peptdica
AULA
2 hidrognios do amino
Dipeptdeo
Aminocido 1 Aminocido 2 (unio de dois aminocidos)
Figura 11.1: A formao de uma ligao peptdica acontece pela sada de um oxignio da carboxila de um
aminocido e de dois hidrognios ao grupo amino de um segundo aminocido. Um dipeptdeo e uma molcula
de gua so os produtos desta reao.
Ento, quando acontece uma ligao peptdica entre dois

aminocidos, um dipeptdeo formado. interessante ressaltar que a
ligao peptdica forma um dipolo eltrico. Isto ocorre porque o oxignio
atrai a nuvem eletrnica e assume um carter parcialmente negativo;
conseqentemente, o nitrognio assume um carter parcialmente positivo
em um mecanismo parecido com aquele que voc viu para a formao
do dipolo eletrnico da molcula de gua (se tiver dvida, vale a pena
voltar Aula 3 e dar uma olhada na seo Como uma molcula de
gua?). Assim, um dipeptdeo apresenta um dipolo eltrico.
Outra caracterstica da ligao peptdica que sempre que acontece
este tipo de ligao, h sada de uma molcula de gua. Alm disso,
possvel formar uma protena com nmero variado de aminocidos. Ao
dipeptdeo que voc viu se formar na Figura 11.1, possvel adicionar
mais aminocidos, formando tripeptdeos, polipeptdeos e, finalmente, as
protenas, que podem ter um nmero variado de RESDUOS DE AMINOCIDOS. RESDUOS DE
AMINOCIDOS
Chamamos resduos
de aminocidos os
aminocidos que
esto formando um
peptdeo ou uma
protena. Este termo,
resduos, indica
que, nas protenas,
os aminocidos
no se apresentam
exatamente como so
quando esto livres, j
que, conforme vimos,
h perda de uma
molcula de gua a
cada ligao peptdica
que se forma.
CEDERJ 11
ATIVIDADE
1
1. Caracterizando ligaes peptdicas
Parte I: A seguir, voc v duas possveis reaes qumicas. Dentre elas,
identifique, circulando a letra correspondente, aquela(s) que no (so)
ligao(es) peptdica(s). Justifique sua resposta.
a.
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b.
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MDULO 1
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Parte II Responda: Quantas molculas de gua so perdidas na formao
AULA
de um pentapeptdeo?
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RESPOSTA COMENTADA
Se voc marcou a opo b como aquela que representa uma ligao
peptdica, acertou! Nesta opo, h dois aminocidos que se ligam
pelo grupamento carboxila de um ao grupamento amino de outro,
com a perda de uma molcula de gua. Esta a definio de ligao
peptdica, inclusive!
Na letra a, repare na estrutura representada esquerda. No um
aminocido, pois no tem o grupamento amino na sua estrutura.
Portanto, no possvel que esteja acontecendo uma ligao
peptdica!
Na parte II, perguntamos quantas molculas de gua se perdem na
formao de um pentapeptdeo. Para calcular isso, voc poderia ter
tentado fazer um pentapeptdeo e contar o nmero de molculas de
H2O liberadas ou, simplesmente, pensar assim: na formao de um
dipeptdeo, acontece uma ligao peptdica e se forma uma molcula
de gua; de um tripeptdeo, duas ligaes e duas guas. O nmero de
molculas de gua sempre igual ao nmero de ligaes e o nmero
de ligaes sempre igual ao nmero de aminocidos menos 1! Logo,
para formar um pentepeptdeo, ocorrem quatro ligaes peptdicas.
A seqncia primria de uma protena, portanto, a unio de

vrios aminocidos por ligaes peptdicas. No entanto, estas no so os
nicos tipos de interao envolvidos na formao da estrutura primria
de uma protena...
CISTENA
S para voc
AS PONTES DE ENXOFRE (OU PONTES DISSULFETO) relembrar a estrutura
da cistena:
Alm das ligaes peptdicas que formam a seqncia primria
(cadeia) de uma protena, outras interaes podem ocorrer tambm entre
os aminocidos dessa cadeia.
Conforme voc viu na Aula 8, a CISTENA um aminocido que
possui um tomo de enxofre na extremidade de seu grupamento R.
Cistena
CEDERJ 13
A presena deste enxofre na cistena serve como uma espcie de tomada,

j que dois enxofres, quando se aproximam, podem formar uma ponte
de enxofre ou ponte dissulfeto. Duas cistenas unidas por uma ponte de
enxofre formam o que chamamos de cistina. Veja a Figura 11.4:
Ponte de enxofre ou
Cistena 1 Cistena 2 ponte dissulfeto
Ou simplesmente...
cistena SH + HS cistena lcistena S S cistena
ponte de enxofre
cistina
Figura 11.2: A formao de uma ponte de enxofre se d pela interao entre os

enxofres de duas cistenas e a sada de dois tomos de hidrognio. O composto
formado (cistena + cistena) chamado cistina.
!
E a metionina?
A cistena e a metionina so os dois nicos aminocidos
que possuem enxofre em sua constituio. Na cistena,
este tomo est na extremidade do grupamento R,
disponvel para interagir com outros grupamentos
sulfeto (SH). Na metionina, embora haja enxofre, este
no ocupa a posio terminal do grupamento R, e
no pode, por causa disso, formar pontes de enxofre
com outra metionina ou cistena.
Metionina
14 CEDERJ
MDULO 1
Quer ver como estas pontes de enxofre acontecem em uma protena
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de nosso organismo? Na Figura 11.3, voc v a seqncia primria da
AULA
insulina. A insulina um hormnio cuja principal funo participar na
regulao do nosso metabolismo energtico. Ela apresenta duas cadeias
peptdicas: a cadeia A e a cadeia B. A cadeia A apresenta 21 resduos
de aminocidos; a cadeia B apresenta 30 resduos. Estas duas cadeias se
conectam por meio de pontes dissulfeto.
Cadeia A
5 15 21
Gli He Val Glu Gln Cis Cis Ala Ser Val Cis Ser Leu Tir Gln Leu Gln Asn Tic Cis Asn
Cadeia B
5 10 15 20
Fen Val Asn Gln His Leu Cis Gli Ser His Leu Val Glu Ala Leu Tir Leu Val Cis Gli Glu
Arg Gli Fen Tir Tre Pro Lis Ala
25 30
Figura 11.3: Estrutura primria da insulina, um hormnio peptdico envolvido na regulao do nosso metabolismo
energtico, especialmente no metabolismo de um acar, a glicose. A insulina um hormnio protico que possui
duas cadeias polipeptdicas A e B, que representam sua seqncia primria. Estas duas cadeias so ligadas por
pontes dissulfeto entre a cadeia A e B.
ATIVIDADE
2
2. Estabelecendo pontes dissulfeto
Est achando esquisito uma atividade no meio da seqncia do texto?
Sentiu falta das pontes dissulfeto ligando a cadeia A e B da insulina na
Figura 11.3? Estabelecer estas pontes exatamente a sua tarefa, dividida
em duas etapas:
a. identifique (circulando), na Figura 11.3, quais resduos de aminocido
da cadeia A e B poderiam formar pontes dissulfeto para unir estas duas
cadeias;
b. mostre como se forma uma ponte de enxofre entre dois resduos de
aminocidos.
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RESPOSTA COMENTADA
Fazer uma atividade a melhor maneira de fixar um conceito. Voc
aprendeu nesta seo da aula que pontes dissulfeto se formam
apenas entre resduos de cistena. Sendo assim, possveis candidatos
so:
Cadeia A
S S
5 15 21
Gli He Val Glu Gln Cis Cis Ala Ser Val Cis Ser Leu Tir Gln Leu Glu Asn Tir Cis Asn
S S
Cadeia B
S S
5 10 15 20
Fen Val Asn Gln His Leu Cis Gli Ser His Leu Val Gln Ala Leu Tir Leu Val Cis Gli Glu
Arg Gli Fen Fen Tir Tre Pro Lis Ala
25 30
De fato, a maior parte desses resduos participam da unio entre

as duas cadeias, como voc pode ver pelas linhas que os unem
(representando as pontes). Observe que h pontes de enxofre que
que unem as cadeias A e B as pontes intercadeias; alm dessas,
existem tambm pontes de enxofre intracadeia que, no caso da
insulina, acontecem dentro da cadeia A.
Estas pontes se formam entre os grupamentos SH de duas cistenas,
com a sada dos hidrognios, como voc viu na Figura 11.2, qual
voc pode retornar para tirar qualquer dvida. Tenha em mente
que, independente de acontecerem intra ou intercadeias, as pontes
dissulfeto so elementos de estrutura primria.
Nas Aulas 13 e 14, voc ver como as pontes dissulfeto so

importantes na manuteno da estrutura terciria das protenas.
Por enquanto, que tal saber um pouco mais sobre o que faz com
que tenhamos tantas protenas diferentes na natureza?
DIVERSIDADE DAS PROTENAS
As protenas possuem tamanhos variados. Existe uma protena

no melo que impede a quebra de outras protenas (o que feito por
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MDULO 1
enzimas chamadas proteinases). Este inibidor de proteinase III do
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melo, por exemplo, possui apenas 30 aminocidos. O citocromo c
AULA
humano, que participa do processo de respirao celular (que voc
vai relembrar e aprender mais a respeito na disciplina Bioqumica II)
possui 104 aminocidos. J a RNA POLIMERASE de um vrus de bactria RNA POLIMERASE
(bacterifago), chamado T7, possui 883 aminocidos. Est achando Enzima que participa
da sntese do RNA
muito? A titina humana, uma protena que ajuda a arranjar as fibras nos seres vivos.
musculares, contm 26.926 resduos de aminocidos, sendo, de fato,
uma protena gigante!
!
Obviamente, quanto maior uma protena, mais complicada a sua montagem
ou enovelamento, conforme veremos nas aulas seguintes.
Mas o tamanho no o nico fator que influencia a tamanha

diversidade de protenas que encontramos na natureza. A composio de
aminocidos destas protenas (para saber mais, veja o boxe Compondo
diferentes protenas), bem como a ordem em que eles se apresentam
ligados, tambm um determinante.
Compondo diferentes protenas

Embora existam 20 aminocidos diferentes constituindo protenas
(conforme voc aprendeu na Aula 8), os estudos tm mostrado que alguns
deles so mais abundantes nas diversas protenas, sendo os mais comuns
a leucina, a alanina, a glicina, a valina e o cido glutmico. Os mais raros,
por sua vez, so triptofano, cistena, metionina e histidina. Ser que voc
saberia dizer por que estes aminocidos so mais raros?
Voc viu, na Aula 8, que h uma classificao dos aminocidos que os
dividem em essenciais ou no essenciais dieta. Dizer que um aminocido
essencial significa que nossas clulas no sabem sintetizar estes
aminocidos (isto , no temos as enzimas necessrias para sua sntese)
e, por isso, precisamos encontr-los na nossa dieta. Este o caso do
triptofano, da histidina e da metionina, por exemplo. Se as protenas que
comemos tm baixo contedo destes aminocidos, j que no so muito
abundantes, precisamos tomar cuidado para que eles no nos faltem na
dieta para no causar um desequilbrio nutricional.
CEDERJ 17
Este assunto to importante que merece uma seo s para

explic-lo. Veja a seguir!
VOC SABE O QUE DETERMINA A SEQNCIA DE UMA

PROTENA?
Falando agora sobre a ordem em que os aminocidos se unem para

formar uma protena, voc saberia explicar como ela determinada?
Uma protena o produto da traduo de uma informao contida
no nosso cdigo gentico. Este cdigo gentico est contido no DNA, uma
seqncia de nucleotdeos que est confinada no ncleo de nossas clulas.
A informao contida na seqncia de nucleotdeos da molcula de
DNA origina uma fita de RNA (RNA mensageiro RNAm) que carrega
a informao gentica para o citoplasma, onde ela pode ser traduzida
em protenas. Resumindo, temos que:
seqncia de DNA o seqncia de RNA o seqncia da protena.
A relao entre os nucleotdeos do DNA e os aminocidos
TRADUO
Leitura de um RNA
chamada cdigo gentico, que constitui a base da vida e da evoluo
mensageiro por um das espcies em nosso planeta.
ribossoma para sntese
de uma protena. Em torno de 1960, estabeleceu-se que cada aminocido na
Este processo
acontece no seqncia primria de uma protena era resultado da leitura de um
citoplasma da clula cdon do RNA. Um cdon de RNA um trio de nucleotdeos que,
e o que d origem a
uma protena recm- durante o processo da TRADUO, decodificado em um aminocido.
sintetizada.
Sendo assim, observe:
Cdon de RNA UUU CUC ACC GCG GUG GAG
Seqncia da
PROTENA Fenilalanina Leucina Treonina Alanina Valina Ac. Glutmico
Cada trio de bases do RNAm representa um aminocido da

seqncia primria de uma protena. Assim, a seqncia de bases do
RNA (que vem da seqncia de bases do DNA o cdigo gentico)
responsvel pela seqncia de aminocidos de uma protena. Uma
protena produto da traduo de um gene. Em outras palavras, todo
pedao do DNA que capaz de, quando transcrito em um RNAm, ser
traduzido em uma protena, chamado gene.
18 CEDERJ
MDULO 1
O DNA um cido nuclico enorme, que contm muitos milhares de
11
genes; esse milhares de genes, por sua vez, do origem a milhares de protenas
AULA
e aqui est o motivo da enorme diversidade delas. Como se no bastasse,
ainda h possibilidade de acontecerem mudanas na seqncia do DNA,
que podem acarretar graves conseqncias para um organismo... Veja
mais sobre o assunto no boxe Mutao: o que e o que causa?.
Mutao: o que e o que causa?

Mutao qualquer alterao na
seqncia de bases do DNA, quer
seja por retirada de um nucleotdeo
ou substituio por outro diferente.
Uma mutao no DNA pode acarretar
em alteraes da seqncia primria
da protena e a conseqente perda
de funo desta.
Muitas vezes, ouvimos falar de
algumas substncias que so
mutagnicas e esto presentes no
nosso dia-a-dia. Esse o caso do
benzantraceno, que est presente
no cigarro. Fonte: http://www.sxc.hu/photo/369103
A prpria radiao ultravioleta (UV)
um agente mutagnico; da, os mdicos recomendarem a exposio
ao sol em horrios nos quais esta radiao no to forte como, por
exemplo, no incio e no fim do dia.
A luz UV capaz de alterar as bases do nosso DNA, promovendo mudanas
irreversveis. Este DNA mudado dar origem ao RNA que carregar a
informao errada, resultando em uma protena alterada. Se essa protena
for responsvel por alguma reao envolvida no nosso ciclo celular, pode
acontecer de este ciclo ficar descontrolado e a clula comear a se dividir
sem controle, levando ao cncer.
SEQNCIA PRIMRIA E FUNO DA PROTENA
A funo de uma protena depende de sua seqncia primria.

Qualquer mudana desta seqncia gera uma protena diferente que
pode at perder sua funo biolgica.
Usando o exemplo da insulina (Figura 11.3 e Atividade 3), se
houvesse a substituio da cistena 7 da cadeia A por outro aminocido
qualquer, no se formaria aquela ponte intercadeia e, certamente, a
insulina resultante no seria a mesma.
Falando em insulina, voc sabia que este hormnio sintetizado
contendo 84 aminocidos e secretado na corrente sangnea com apenas
CEDERJ 19
51? Entenda o porqu disso logo depois de fazer a atividade a seguir, que
fundamental para voc entender a relao entre seqncia primria e
funo de uma protena!
ATIVIDADE
3
3. Relacionando funo e seqncia primria de uma protena
O sistema olfativo um dos sensores que temos para perceber o meio
externo. O nosso sistema olfativo funciona da seguinte maneira: existem, ao
longo do epitlio da nossa cavidade nasal, clulas sensoriais que produzem
protenas capazes de interagir com molculas de cheiro presentes no ar.
Isso que faz com que a gente sinta o cheiro das coisas! Estas protenas so
chamadas de receptores de odor e as molculas de cheiro, odorantes.
Bulbo olfativo (parte

do crebro que percebe
o cheiro)
Clulas sensoriais
Perfil anatmico de um Epitlio da cavidade nasal, Odorantes (que

SEQNCIA DE ser humano, destacando onde esto as clulas entram na cavi-
AMINOCIDOS a parte sensvel a odores sensoriais que produzem dade nasal com
APRESENTADA da cavidade nasal os receptores de odor o ar)
possvel representar
os aminocidos
por dois cdigos de A interao entre um odorante e um receptor de cheiro bastante
letras. Em um deles
especfica, ou seja, cada receptor capaz de perceber com maior afinidade
so utilizadas trs
letras (exemplo: um determinado odorante. Pequenas alteraes no receptor fazem com
ARG = arginina); que ele perca esta afinidade pelo odorante. Analise as informaes a
em outro utilizada
seguir, especialmente as SEQNCIAS DE AMINOCIDOS APRESENTADAS (cada
uma letra apenas
para representar letra representa um aminocido diferente). Unindo as informaes da
cada aminocido sua anlise com o que voc acabou de ler no enunciado desta questo,
(exemplo: M = proponha uma hiptese para explicar a diferena do odorante reconhecido
metonina). Este
ltimo cdigo est pela protena receptora de cheiro apresentada no Quadro 1 e a apresentada
expresso nesta no Quadro 2.
atividade.
20 CEDERJ
MDULO 1
11
AULA
1
Animal: Camundongo
Molcula: Protena receptora de cheiro I7-I206
Pedao da seqncia de aminocidos constituintes de I7-I206:
(...) NLSCTDMSTA ELTDFILAIF ILLGPLSVTG (...)
Odorante reconhecido: octanal
2
Animal: Camundongo
Molcula: Protena receptora de cheiro I7-V206
Pedao da seqncia de aminocidos constituintes de I7-V206:
(...) NLSCTDMSTA ELTDFVLAIF ILLGPLSVTG (...)
Odorante reconhecido: heptanal
RESPOSTA COMENTADA
Como voc viu no enunciado da questo, a sensao de cheiro
percebida por ns pela interao que acontece entre molculas de
cheiro presentes no ar e protenas receptoras para esses odorantes,
presentes na cavidade nasal. Pequenas modificaes na protena
receptora de odor fazem com que esta protena possa ou no
detectar um determinado cheiro. Analisando a seqncia primria
dos receptores apresentados no Quadro 1 e no 2, voc deve ter
percebido que h um resduo de aminocido diferente entre eles:
1
Pedao da seqncia de aminocidos constituintes de I7-I206:
(...) NLSCTDMSTA ELTDFILAIF ILLGPLSVTG (...)
Odorante reconhecido: octanal
2
Pedao da seqncia de aminocidos constituintes de I7-V206:
(...) NLSCTDMSTA ELTDFVLAIF ILLGPLSVTG (...)
Odorante reconhecido: heptanal
CEDERJ 21
Esta nica diferena na seqncia primria foi responsvel pela

mudana da capacidade do receptor reconhecer o odorante (no
Quadro 1, o receptor reconhece o octanal e, no 2, o heptanal). Em
qualquer dos casos, essa modificao de um aminocido no fez com
que esta protena passasse a exercer uma funo completamente
diferente ela continua sendo um receptor de cheiro. No entanto,
o cheiro que ela era capaz de reconhecer com uma isoleucina em
sua estrutura (I) mudou quando esse aminocido foi trocado por
uma valina (V).
A importncia da seqncia primria para a funo de uma protena
enorme, como voc pde verificar nesta atividade. Os dados
apresentados no so fictcios: eles foram publicados, em 1998,
em uma revista cientfica internacional de grande prestgio, como
parte de um esforo dos pesquisadores em elucidar o funcionamento
do nosso olfato!
MODIFICAES PS-TRADUCIONAIS
As mudanas que ocorrem nas protenas, dentro das clulas, aps sua
sntese so ditas mudanas ps-traducionais, pois traduo como se chama
o processo de sntese de uma protena a partir da seqncia do RNA.
Muitas protenas so modificadas aps sua sntese. Por exemplo,
alguns resduos podem ser removidos para produzir uma protena
madura, como o caso da insulina (Figura 11.4).
Esta protena sintetizada como um precursor com 110 resduos.
Existe um pedao da seqncia primria que chamado peptdeo-sinal,
responsvel por direcionar a insulina para as vesculas secretrias do
pncreas, de onde ela poder ser lanada na corrente sangnea e
participar da regulao do metabolismo de nosso organismo (voc vai
aprender isso em Bioqumica II). Depois de direcionar a insulina, esse
peptdeo-sinal (que possui 24 aminocidos) no tem mais funo, sendo
eliminado da seqncia. Formam-se, em seguida, as pontes dissulfeto
entre as cistenas da cadeia A e da cadeia B, como voc j viu nesta aula
na Figura 11.3. O peptdeo C (constitudo por 35 aminocidos), outro
pedao da cadeia que fica sem funo aps a ligao da cadeia A com
a B, tambm clivado (cortado); fica pronta a insulina madura, que
22 CEDERJ
MDULO 1
a que circula no nosso sangue aps uma refeio. Dos 110 resduos de
11
aminocidos do precursor (pr-pr-insulina), a forma madura da protena
AULA
conta com apenas 51 resduos.
Cadeia C Cadeia C
S S
Cadeia A COOH Cadeia A COOH H2N Cadeia A COOH
S S S S
S S S S
H2N Cadeia B H2N Cadeia B H2N Cadeia B COOH
Peptdeo- Pr-pr-insulina Pr-insulina Insulina

sinal
Figura 11.4: Modificaes ps-traducionais da insulina.
Alm deste tipo de modificao (remoo de pedaos da cadeia),

as protenas tambm podem receber adio de carboidratos, fosfatos,
dentre outros, em posies especficas, aps sua sntese. Estes grupos
muitas vezes so essenciais para o funcionamento da protena.
Resumindo, podemos dizer que h diversos mecanismos de gerar
diversidade de protenas. Mas... se uma protena funciona bem em um
organismo desempenhando um determinado papel, no interessante
que, evolutivamente, essa protena no sofra muitas modificaes? Esse
o nosso prximo assunto!
O QUE SO PROTENAS HOMLOGAS?
Dizemos que protenas homlogas so aquelas que se relacionam

evolutivamente. Em geral, realizam a mesma funo em espcies diferentes.
Um exemplo o citocromo c, uma protena que possui aproximadamente
100 aminocidos, contm ferro e participa da transferncia de eltrons na
membrana das mitocndrias das clulas eucariticas. Em Bioqumica II, voc
ver mais detalhes sobre a funo desta protena. No momento, podemos
adiantar que esta protena tem sido usada para se estabelecer relaes
filogenticas (relao de parentesco) entre os seres vivos. Como assim?
Se imaginarmos que protenas homlogas devem desempenhar
funes muito parecidas nas espcies em que elas se encontram, podemos
concluir que sua seqncia primria no pode variar muito. Ou, pelo
CEDERJ 23
menos, no pode haver trocas dos aminocidos que estejam mais

estreitamente relacionados com a funo especfica da protena, pois tal
funo est intimamente ligada a sua seqncia de aminocidos.
No caso de citocromo c, os aminocidos diretamente relacionados
ao transporte de eltrons no podem jamais ser substitudos por outros;
caso contrrio, o transporte ficaria prejudicado e a protena perderia a
capacidade de atuar como transportadora. Por outro lado, existem regies
da protena que no esto diretamente ligadas ao transporte de eltrons
e que, se sofressem alteraes, no causariam perda de funo.
Desta forma, se ao longo do curso evolutivo esta protena
acumulou mutaes nas regies que permitam mudanas sem perda
ou comprometimento da funo (veja o boxe Um pouco mais sobre
protenas homlogas), poderamos esperar que duas espcies distantes
filogeneticamente apresentassem mais diferenas em suas seqncias
primrias do que espcies mais prximas evolutivamente. E foi exatamente
isso que os estudos revelaram! S para voc ter uma idia, existem 48
diferenas de seqncia primria entre o citocromo c de cavalo e o de
fungos, duas espcies que esto completamente separadas na rvore
evolutiva. Entretanto, apenas duas diferenas de seqncia primria
foram encontradas entre o citocromo c de pato e de galinha, o que
bvio, pois so espcies bem prximas filogeneticamente.
Assim, possvel construir-se uma rvore evolutiva, comparando
a seqncia primria de uma protena que est presente em todas as
espcies eucariticas, como o caso do citocromo c.
Um pouco mais sobre protenas homlogas
Fonte: http://www.sxc.hu/photo/399249
24 CEDERJ
MDULO 1
11
AULA
CEDERJ 25
Para entender protenas homlogas, vamos ao seguinte exemplo: nas

fotos apresentadas, voc v um carro, uma bicicleta, um patinete, um
caminho. Precisamos comprovar que todos eles so meios de transporte.
Se escolhssemos como critrio o motor, certamente erraramos, pois
diramos que o patinete e a bicicleta, por no terem motor, no so meios
de transporte. Ento, para podermos classificar tais objetos nesta categoria,
precisamos escolher algo comum a todos, como, por exemplo, ter rodas.
assim que se faz para dizer se uma espcie mais prxima ou mais distante
da outra. Primeiro, precisamos escolher uma protena comum a todas elas
(normalmente uma enzima) e depois determinar a seqncia primria desta
para saber quem mais prxima evolutivamente de quem.
Mamferos Homo Sapiens, Macaco

Chimpanz
Camundongo 4
2 Pssaros e rpteis
5 Avestruz
Canguru
9
Coelho 3 1 1 Galinha
3 Pombo 1Pingim
Cavalo, porco, ovelha, vaca 2 Tartaruga
2 1 1 Pato 6
Cavalo, foca, morcego 1
2 1 1
Hipoptamo 2 6 6
Peixes sseos Carpa Peixe-cachorro
9
Atum 1 4
6 Peixes cartilaginosos
Anfbios 3
Sapo 2 2 Lampria
8
7
Aneldeos Equinodermas
Minhoca 9
Peixe-estrela
Mariposa Abelha
23 8 Insetos
Mosca
9 16
16
Levedos
Fungo 15 Trigo
13
7
Candida 7 Girassol
14 17
Arroz
Neurospora 3 1
12 5 Plantas
1
31 33 11 Espinafre
12
Humicola
Figura 11.5: rvore evolutiva dos eucariontes construda em funo das

diferenas existentes entre os aminocidos do citocromo c nas diversas espcies.
Os nmeros representam os aminocidos diferentes em relao ao ancestral.
26 CEDERJ
MDULO 1
11
No caso das fotos apresentadas, poderamos dizer que, em funo do
nmero de rodas, o carro e o caminho constituiriam um grupo, ao passo
AULA
que a bicicleta e o patinete formariam outro grupo.
A escolha da protena para usar de referencial na construo

de uma rvore filogentica bastante importante. Existem protenas
bastante conservadas, que apresentam seqncia primria muito parecida
nas diversas espcies. o caso de uma protena chamada HISTONA H4. HISTONA H4
A histona H4 da ervilha e da vaca apresentam diferenas em apenas duas Protena que liga e
empacota DNA em
posies de aminocidos dos seus 102 resduos. Tal fato surpreendente, eucariotos.
se levarmos em conta que estas espcies j divergiram h mais de 1,2
milho de anos!
Essa baixa taxa de variao entre organismos to divergentes
significa que o gene que codifica a histona H4 muito intolerante a
mutaes. Se estas ocorrem, geram histonas incapazes de se ligar ao
DNA e, portanto, sem funo.
A evoluo no aceita alterao no gene que codifica as histonas,
mas aceita melhor as mutaes no gene do citocromo c. Podemos concluir,
ento, que a taxa de mutao de uma determinada protena depende da
extenso em que a mudana afeta a sua funo. Afinal, como voc j
aprendeu, a seqncia primria est diretamente relacionada funo
de uma protena.
Genmica e Protemica: definies e aplicaes

No ano de 2001, foi divulgado pela televiso e pelos jornais, o trmino
do seqenciamento do genoma (seqncia de genes do DNA) humano.
Alm deste, que certamente foi o mais extenso e complicado genoma j
seqenciado, outros tambm o foram, tais como os genomas de bactrias
(Escherichia coli, Synechocystis sp., Haemophilus influenza), de leveduras
(Saccharomyces cerevisiae) e o de um pequeno verme (Caenorhabditis
elegans).
No Brasil, tambm tivemos nosso incio na era da genmica com uma
importante contribuio neste campo: o seqenciamento do genoma
da Xylela fastidiosa, um fitopatgeno responsvel pela doena do
amarelinho que destri grande parte das laranjas (veja o quadro a
seguir, com informaes sobre alguns organismos que tiveram seu
genoma seqenciado).
CEDERJ 27
Tamanho
do
Organismo Genoma Interesse biolgico
(milhes
de bases)
Mycoplasma pneumoniae 0,8 Causa pneumonia
Treponema palidum 1,1 Causa sfilis
Borrelia burgdorferi 1,3 Causa doena de Lyme
Helicobacter pylori 1,7 Causa lcera gstrica
Haemophilus influenza 1,8 Causa meningite
Algumas linhagens podem
Escherichia coli 4,6
ser patognicas
Saccharomyces cerevisiae 12,1 Eucariota unicelular
Verme multicelular usado
Caenorhabditis elegans 97 em estudos de Biologia
celular
Fitopatgeno. Ataca
Xylela fastidiosa 2,7
plantaes de laranja
3 bilhes
Homo sapiens sapiens de pares Somos ns!
de bases
O conhecimento do genoma das espcies impe novos desafios aos

cientistas, como o de conhecer as protenas que so, de fato, expressas
pelos organismos. Os pesquisadores cunharam o termo proteoma, em
paralelo ao termo genoma, com o intuito de descrever o repertrio de
protenas que so, de fato, codificadas pelo DNA de um organismo. Para
se conhecer este repertrio, importante isolar essas protenas, conhecer
seu tamanho e, muitas vezes, determinar sua seqncia primria de
aminocidos. Desta forma, possvel saber, exatamente, de que protena
estamos tratando e investigar a participao dela em quadros de doena,
inflamao etc.
Quer saber mais sobre esse assunto que est to em voga no mundo da
pesquisa? Visite os sites:
http://biodados.icb.ufmg.br/sebio/proteomics_ciencia_hoje.pdf
http://educar.sc.usp.br/licenciatura/2001/genoma/Projetogenoma.html
ATIVIDADE FINAL
Relaes de parentesco?
Imagine que voc seja orientador de um estagirio que acabou de entrar no ensino
superior e no seu grupo de pesquisa. Esse estagirio foi conversar com voc sobre um
projeto que buscar estabelecer relaes filogenticas entre espcies, baseando-se
em seqncias primrias de protenas expressas por essas espcies.
28 CEDERJ
MDULO 1
Ele lhe mostrou os seguintes grupos de seqncias:
11
Grupo 1
AULA
Humano nlhglfgrkp gqapgysyta
Pato nlhglfgrkt gqaegfsytd
Grupo 2
Humano sasfepapen kcekcgqcnt
Pato sgtfgprpgn kvektaqcht
a. Analisando as seqncias dos dois grupos e levando em considerao que os

fragmentos representados expressam o grau de semelhana entre as seqncias
completas, qual voc recomendaria ao seu estagirio para usar na anlise
filogentica dos grupos?
______________________________________________________________________________
______________________________________________________________________________
______________________________________________________________________________
b. Imagine que seu estagirio, a partir da informao que voc deu (na letra a desta
atividade) para a escolha da protena para usar na pesquisa, tenha selecionado mais
cinco seqncias de organismos diversos para estabelecer relao evolutiva entre
as espcies. Que tipo de anlise ele deve fazer nessas seqncias para estabelecer
essas relaes? O que ele deve buscar nas seqncias, para saber qual organismo
evolutivamente mais prximo de um ou de outro?
______________________________________________________________________________
______________________________________________________________________________
______________________________________________________________________________
CEDERJ 29
RESPOSTA COMENTADA
a. Como voc viu na aula, a variao da seqncia de uma protena
ao longo do tempo (e das espcies), permite estabelecer relao
entre organismos diferentes. Embora precise haver alguma variao,
a protena tem de existir e manter sua funo em todas as espcies
a serem relacionadas, o que implica em que a variao tambm no
seja muito grande. Nas seqncias apresentadas pelo estagirio, o
primeiro grupo mostra algumas modificaes quando comparamos
os dois organismos e o segundo grupo apresenta seqncias muito
diferentes. Diante dessas duas opes, o estagirio deve escolher as
seqncias do grupo 1, cujos fragmentos apresentados diferem em
apenas 2 aminocidos.
b. Para analisar as seqncias na busca de relaes evolutivas entre
as espcies, preciso tentar encontrar o grau de identidade entre elas.
Grau de identidade uma expresso bastante utilizada pelos cientistas
dessa rea, e se refere a quanto a seqncia de uma protena idntica
de outra. Quanto maior o grau de identidade, mais prximas as
espcies so evolutivamente!
RESUMO
As protenas apresentam quatro possveis nveis de organizao das suas estruturas:

o primrio (seqncia de aminocidos), o secundrio (formao de estruturas
organizadas espacialmente), o tercirio (estrutura tridimensional) e o quaternrio
(associao de subunidades de uma protena).
No nvel primrio, temos a seqncia de aminocidos, formada pela unio de
um aminocido a outro por uma ligao peptdica. Uma ligao peptdica a
ligao entre o grupamento amino de um aminocido ao grupamento carboxila
de outro, com a sada de uma molcula de gua. Alm da ligao peptdica que
forma a seqncia primria, pode haver pontes de enxofre na estrutura primria,
originadas pela ligao de dois resduos de cistena.
A enorme diversidade das protenas se deve s diferentes composies e tamanhos
que elas podem apresentar, bem como s modificaes ps-traducionais que elas
podem sofrer.
30 CEDERJ
MDULO 1
11
AULA
A seqncia primria de uma protena determinada pela seqncia de bases
do DNA, e responsvel pela funo da protena. Alteraes de determinados
aminocidos em uma protena (geradas por mutaes no DNA) podem acarretar
perda da funo desta, ao passo que alteraes em outros stios da protena
podem no ser nocivas; ao contrrio, so boas medidas para estabelecer relaes
filogenticas entre as espcies.
CEDERJ 31
Protenas 2 Voc sabe o
12
AULA
que estrutura secundria
de uma protena?
Meta da aula
Apresentar o que a estrutura secundria
de uma protena e seus elementos
caractersticos.
objetivos
Ao final desta aula, voc dever ser capaz de

caracterizar os trs elementos que formam a
estrutura secundria de uma protena:
1 as D-hlices;
2 as folhas E;
3 as voltas.
Pr-requisitos
Para fazer um bom aproveitamento desta aula, importante voc
relembrar o que so e como se formam as pontes de hidrognio, conceito
apresentado na Aula 3. Alm disso, seria interessante ter mo a Aula 8,
para que voc possa consultar as estruturas de alguns aminocidos.
Bioqumica I | Protenas 2 Voc sabe o que estrutura secundria de uma protena?
INTRODUO Na aula passada, voc viu que as protenas tm quatro nveis organizacionais e
comeou estudando o primeiro nvel: a estrutura primria.
A estrutura primria de uma protena sua seqncia de aminocidos. Esta
seqncia primria pode ser comparada a um colar de contas esticado: cada
conta seria um aminocido e o colar, a protena.
Fonte: http://www.sxc.hu/photo/314788 Fonte: http://www.sxc.hu/photo/258629
Figura 12.1: A seqncia primria de uma protena pode ser analogicamente comparada a um
colar de contas, no qual cada conta representa um aminocido e o colar, a protena inteira.
Mantenha esta imagem do colar na cabea: para estic-lo, necessrio que

voc segure as duas extremidades e puxe-as de forma que o colar fique como
uma linha reta. Voc est gastando energia para isso. Essa conformao do colar
(esticado como uma linha) no , necessariamente, a que ele assumiria se voc
no o estivesse segurando. Se voc o lanar em cima de uma mesa, ver que ele,
provavelmente, assumir uma forma mais irregular. Isso acontece porque, em
cima da mesa, no h nada impondo energia para mant-lo esticado.
Na natureza, as molculas se comportam mais ou menos como o colar em cima
da mesa: elas tendem a assumir a conformao que requer menos energia para
ser sustentada. Assim como o colar no se mantm esticado em cima da mesa
naturalmente quando voc o lana sobre ela de qualquer maneira (porque
precisaria de energia para isso), as protenas tambm no se mantm esticadas
na natureza. Quando elas comeam a assumir formas no espao as quais
favorecem uma configurao que gasta menor energia para ser mantida , temos
a estrutura secundria dessas protenas. Esse o assunto da aula de hoje.
34 CEDERJ
MDULO 1
ESTRUTURA SECUNDRIA
12
AULA
A estrutura secundria de uma protena diz respeito ao arranjo
local dos aminocidos no espao, isto , a como uma determinada
seqncia se organiza no espao.
Os elementos mais importantes da estrutura secundria so: as D-
hlices, as folhas E e as dobras (ou voltas). As D-hlices e folhas E foram
previstas por LINUS PAULING e Robert Corey, em 1951.
Veja o que so esses elementos e por que somente essas poucas
maneiras de organizao esto presentes nas protenas.
LINUS PAULING (1901-1994)

Poucos estudantes de Qumica, atualmente, tm
idia da importncia de Linus Pauling. Ele comeou
a se interessar por Qumica com 15 anos, ainda no
Ensino Mdio, o qual nunca concluiu por causa da
disciplina Histria Americana. Na cincia, recebeu
diversos prmios, e foi intitulado membro mais jovem
da Academia Nacional de Cincias (dos EUA) com
apenas 32 anos.
As obras de Linus Pauling so consideradas as mais
citadas na literatura qumica. Este pesquisador
Fonte: Oregon State
ganhou, em 1955, o prmio Nobel de Qumica
University
por suas pesquisas sobre a natureza das ligaes
qumicas e sua aplicao na elucidao da estrutura
de substncias complexas, como as protenas.
Alm disso, Pauling era militante contra as guerras mundiais, os testes de bombas
atmicas e o desenvolvimento de armas nucleares. Ele ganhou o prmio Nobel da
Paz em 1962 por essas aes. H muito mais o que se dizer sobre Linus Pauling
e, por isso, recomendamos que voc visite o site do canal de cultura da qumica
da Universidade de So Paulo, no endereo http://lqes.iqm.unicamp.br/canal_
cientifico/lqes_cultural/lqes_cultural_cultura_quimica5-1.html. Voc no vai se
arrepender: a vida desse cientista realmente uma lio!
AS D-HLICES
Certamente voc j viu uma espiral como, por exemplo, o fio do

telefone ou a espiral de um caderno. Uma estrutura semelhante a essa
pode acontecer em uma protena pelas interaes entre aminocidos, e
chamada de D-hlice (Figura 12.2).
CEDERJ 35
Detalhes das pontes

de H
(IIII)
Carbono
Carbono
Hidrognio
Hidrognio
Nitrognio
Nitrognio
Oxignio
Oxignio
Grupo R
Grupo R
(a) (b)
(c)
Figura 12.2: Esquema das D-hlices. Pense em um basto imaginrio como um eixo ao redor do qual voc enrolasse
Podemos fazer uma analogia entre as D-hlices e o colar: a seqncia primria da protena (colar de contas) se
um colar de contas. Dependendo da espessura do basto, para circund-lo seriam necessrias mais ou menos contas.
enrola ao redor de um eixo imaginrio de tal forma que, para dar uma volta ao redor deste eixo, so necessrios
voc v a estrutura de uma protena do nosso plasma sangneo que possui apenas D-hlices: como elementos da
3,6 aminocidos (contas). Esta estrutura estabilizada por pontes de H (b) e interaes de Van der Waals. Em (c),
estrutura secundria: a albumina.
36 CEDERJ
MDULO 1
Em uma D-hlice, cada volta da espiral possui, em mdia, 3,6
12
ANGSTRM ()
resduos de aminocidos (isto , trs aminocidos e 60% de um quarto
Angstrm uma
AULA
aminocido), o que ocupa 5,4 . Isso significa que um aminocido (por unidade de medida
exemplo, na posio 1) em uma D-hlice far pontes de H com outro

que equivale a 1010m.
Para voc dimensionar
melhor:
cerca de quatro posies sua frente (no exemplo, com o aminocido
1mm = 10-3m
na posio 5). 1m = 10-6m
1nm = 10-9m
Na espiral, os grupamentos R dos aminocidos ficam voltados 1 = 10-10m
para o exterior, j que muitos deles so volumosos e, por esta razo,
dificilmente se ajustariam ao interior da hlice.
As D-hlices so altamente estveis devido presena de um grande
nmero de pontes de hidrognio (representadas na Figura 12.2 e no quadro
a seguir por | | | |) que se formam entre o hidrognio do grupamento amino
de um resduo de aminocido e o oxignio do grupamento carboxila de
outro resduo, situado quatro posies frente:
Quadro 12.1: Estabilizao das D-hlices por pontes de hidrognio formadas entre
o grupamento amino de um aminocido e o grupamento carboxila de outro quatro
posies frente.
NH | | | | O = C
Aminocido 1 Aminocido 5
(grupamento amino) (grupamento carboxila)
Ponte de H
Ponte de H
Estrutura de uma D-hlice, mostrando

as pontes de H que se formam entre
os resduos de aminocidos).
As pontes de H se formam naturalmente, pois h interao entre

as nuvens eletrnicas daqueles tomos de hidrognio e oxignio de que
falamos. Uma espcie de malha invisvel se forma ao redor da espiral,
fazendo com que a hlice mantenha esta conformao.
CEDERJ 37
A manuteno da estrutura da hlice garantida, ainda, pelas

INTERAES (OU
CONTATOS) DE interaes de VAN DER WAALS que acontecem em seu interior, fazendo com
VAN DER WALLS que esta regio seja bastante empacotada (veja o boxe a seguir).
So interaes fracas
que se estabelecem
entre dois tomos que
se aproximam muito
um do outro. Cada O que significa empacotadas?
tomo apresenta uma Para entender melhor este conceito de
como empacotar uma protena em uma
D-hlice, imagine uma mola. Uma mola
nuvem de eltrons que
influencia o tomo
vizinho, atraindo-o ou uma espiral, e possui estrutura anloga da
repelindo-o. hlice. Se tivssemos no interior dessa mola
foras capazes de fazer com que o dimetro
dela diminusse, o que voc veria seria um
van der walls proporcionam D-hlice!

fenmeno parecido com o que as foras de
Fonte: http://www.sxc.hu/
photo/651534
Agora pense um pouco mais: voc j aprendeu que, na constituio

de protenas, pode haver vinte aminocidos diferentes. Essas diferenas
esto nas suas estruturas e se refletem nas propriedades qumicas que
apresentam (hidrofobicidade x afinidade pela gua, carter bsico x
carter cido etc). Ser que, em uma seqncia primria, todos os
aminocidos se comportam da mesma maneira, isto , ser que todos
eles formam D-hlices, por exemplo?
A arrumao dos aminocidos nas hlices
A resposta para a pergunta anterior NO! Vamos entender o

porqu?
Se aminocidos com grupamentos R volumosos, como a asparagina,
serina e treonina aparecem lado a lado na seqncia primria de uma
determinada protena, dificultam a organizao em hlice. Por outro lado,
como vimos na Aula 8, que apresentou os aminocidos, existem alguns
que so carregados positiva ou negativamente em pH neutro (relembre
as caractersticas dos aminocidos no boxe a seguir). Ter isso em mente
importante para entender o que vem logo em seguida.
38 CEDERJ
MDULO 1
12
Relembrando caractersticas dos aminocidos
AULA
Os vinte aminocidos constituintes de protenas
Aminocidos Aminocidos Aminocidos Aminocidos
apolares aromticos polares sem carga polares carregados
Glicina
Serina Lisina (+)
Alanina
Fenilalanina Treonina Arginina (+)
Valina
Tirosina Cistena Histidina (+)
Leucina
Triptofano Asparagina Aspartato ()
Isoleucina
Glutamina Glutamato ()
ProlinaMetionina
Lembra-se de como se formam pontes de hidrognio nas D-hlices?

Ento, agora, analise a seqncia de aminocidos a seguir. O que voc
acha que aconteceria com ela? Ser que ela seria uma boa formadora
de D-hlice?
Posio 1 2 3 4 5 6 7
Resduo serina aspartato leucina alanina valina glutamato treonina
A seqncia anterior uma boa formadora de hlice?

( ) Sim ( ) No
A resposta no.
A explicao para isto que a
serina (posio 1) tenderia a formar
uma ponte de hidrognio com a valina
(posio 5), que o quarto aminocido
sua frente na seqncia primria. At a, tudo bem! Entretanto, o cido
asprtico (posio 2), que um resduo que em pH neutro se encontra
carregado negativamente, deveria formar uma ponte de hidrognio com
o cido glutmico (posio 6), quatro posies sua frente, tambm
carregado negativamente. Ser que este encontro seria favorecido?
Voc aprendeu que cargas de mesmo sinal tendem a se repelir.
Logo, o cido asprtico (negativo) no capaz de interagir com o cido
glutmico (tambm negativo), desestabilizando a hlice, fazendo com
que ela se desmonte.
E se pensarmos nesta mesma seqncia sendo que, no lugar de
termos um cido glutmico (posio 6), tivermos uma lisina ou arginina,
CEDERJ 39
ambas aminocidos carregados positivamente em pH neutro? Ser que

esta seqncia formaria uma D-hlice? A resposta sim!!!! O encontro do
cido asprtico (negativo) com um resduo de lisina (positivo) fortalece
a D-hlice, j que forma um par inico.
O mesmo raciocnio pode ser empregado no que se refere aos
aminocidos aromticos e apolares, como o triptofano, a tirosina e
a fenilalanina. Se eles se encontram separados na seqncia por um
intervalo de trs aminocidos (ou seja, quatro posies frente), podem
formar contatos chamados de interao hidrofbica, j que vo tender
a ficarem juntos e longe da gua. A interao hidrofbica entre esses
aminocidos fortalece a D-hlice. Veja o exemplo:
Posio 1 2 3 4 5 6
Resduo ...isoleucina serina alanina treonina leucina lisina
A isoleucina (posio 1), bastante apolar, faria interao

hidrofbica com a leucina, tambm apolar, que est quatro posies a
sua frente, fortalecendo a hlice.
Uma pergunta que voc pode estar se fazendo neste momento :
ser que existem aminocidos que no participam da formao de uma
D-hlice?
Os resduos prolina e glicina so os piores formadores de D-hlice.
RELEMBRE A
Por qu? Por causa das suas estruturas.
A PROLINA m formadora de D-hlice porque possui seu tomo de
ESTRUTURA DA
PROLINA
nitrognio como parte de um anel, o que impossibilita que a ligao N-CD

gire para formar uma espiral. Alm disso, por causa de caractersticas
qumicas da estrutura da prolina, o nitrognio da prolina envolvido neste
anel no dispe de hidrognios para formar as pontes de hidrognio
necessrias formao de uma hlice. Dessa forma, muito raro
encontrar prolinas no meio de uma D-hlice.
Outro aminocido que tambm no funciona bem na formao de
D-hlices a glicina. A glicina uma m formadora de D-hlice devido
sua grande flexibilidade. Por ser um aminocido pequeno (o menor deles),
a glicina apresenta grande mobilidade no espao, o que desestabiliza
tanto D-hlices quanto folhas-E (que voc ver o que so em seguida).
40 CEDERJ
MDULO 1
Somente as estruturas conhecidas como voltas permitem que as glicinas
12
se movimentem mais livremente, e a que podemos encontrar uma
AULA
concentrao grande deste aminocido.
Resumindo, podemos dizer que so quatro os fatores que facilitam

ou dificultam a formao de uma D-hlice:
1. a repulso ou a atrao eletrnica entre resduos carregados positiva
e/ou negativamente;
2. o tamanho das cadeias laterais de resduos vizinhos;
3. as interaes entre resduos hidrofbicos separados entre si trs ou
quatro aminocidos de distncia na seqncia primria (interaes
hidrofbicas);
4. a presena de prolinas e glicinas.
ATIVIDADE
1 2
1. Caracterizando D-hlices
Considere os quatro tpicos que voc leu no pargrafo anterior sobre
fatores que facilitam ou dificultam a formao de D-hlices. A partir deles,
analise a seqncia a seguir:
leucina-histidina-valina-fenilalanina-alanina
Agora, responda: esta seqncia pode formar uma D-hlice? Por qu?
Justifique com base nos quatro itens discriminados no boxe de ateno
antes desta atividade e consulte o boxe Relembrando caractersticas dos
aminocidos.
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
RESPOSTA COMENTADA
Se voc concluiu que a seqncia apresentada uma boa formadora
de D-hlice, acertou! Voc provavelmente deve ter justificado essa
resposta assim:
1. No h cargas de mesmo sinal se repelindo nesta seqncia.
2. No h dois aminocidos volumosos prximos para desestabilizar
a hlice.
3. Leucina e fenilalanina vo formar interao hidrofbica que
fortalece a hlice.
4. No h prolinas e glicinas na cadeia.
CEDERJ 41
AS FITAS E
As folhas E so a segunda maneira de os aminocidos da seqncia

primria de uma protena se organizarem no espao. As folhas E formam
estruturas semelhantes a um ziguezague, semelhantes s pregas de uma
saia de colegial ou a um leque. As fitas so como tiras que voc cortasse
do leque, perpendicularmente orientao de suas tiras. O conjunto
dos ziguezagues formado com dois ou mais cortes deste equivale a uma
folha E.
E como se formam as fitas E em uma protena para que, em
seguida, possamos ter uma folha E?
Os aminocidos de uma cadeia polipeptdica, como voc bem
sabe, tm caractersticas qumicas variadas. Estas caractersticas fazem
com que a seqncia primria da protena no seja linear no espao
(lembre do exemplo do colar de contas, que, quando solto em cima da
mesa, tende a assumir uma conformao no-linear). Em alguns casos,
as caractersticas dos aminocidos fazem com que eles se organizem na
forma de uma D-hlice, como voc viu na seo anterior desta aula. Em
outros casos, eles podem promover uma dobra na cadeia polipeptdica,
colocando lado a lado e alinhados dois ou mais pedaos da protena.
Difcil de visualizar? Veja a Figura 12.3:
(a)
Folha E
Fita E
(b)
Fita E
Figura 12.3: Semelhana entre as fitas E e o ziguezague das dobras de um leque

ou das pregas de uma saia de colegial. Em (a) voc v a folha E de cima. Repare
que duas partes da cadeia polipeptdica esto ligadas por pontes de H, e que os
cadeia principal, onde se encontram os carbonos D (esferas pretas). Em (b) voc

grupamentos laterais (esferas com R) esto para cima ou para baixo do plano da
v as fitas E lateralmente, e poder perceber com facilidade o ziguezague desta

estrutura, semelhante a um leque ou a uma saia de colegial.
42 CEDERJ
MDULO 1
As fitas E, assim como a folha E, so estabilizadas por pontes de H,
12
que proporcionam a esta estrutura bastante estabilidade e um certo grau
de rigidez. O padro de formao de pontes de hidrognio das folhas E
AULA
completamente diferente do padro observado nas D-hlices.
Para que se forme uma folha E, necessrio que se estabeleam
contatos entre as fitas E, ou seja, as pontes de hidrognio fazem com que
duas fitas E formem uma folha E. Como ficam os grupamentos R dos
aminocidos nas folhas E? Eles ficam voltados para cima ou para baixo
do plano em que corre a folha E, conforme voc pode ver na Figura 12.3.
Esta maneira de se posicionar permite que grupamentos volumosos no
interfiram com a organizao das folhas E.
Existem dois tipos de fitas E: as paralelas e as antiparalelas (Figura
12.4). Toda vez que uma protena se dobrar de forma que a extremidade
carboxila esteja orientada no mesmo sentido da extremidade amino,
teremos uma fita E paralela; quando amino-terminal e carboxi-terminal
estiverem em sentidos opostos (seguindo-se o fio da protena),
estaremos diante de uma fita E antiparalela.
(a)
N C
(b) (c)
N C N
Fita E paralela Fita E paralela
Figura 12.4: Esquema de formao das fitas E paralelas e antiparalelas. Imagine a

seqncia primria de uma protena (representada em a) sofrendo dobras por causa
alinharem, possvel que se forme uma fita E (setas em b e c). Se a fita se formar
das propriedades qumicas dos seus aminocidos. Se duas partes da seqncia se
entre um pedao da protena e outro que est no mesmo sentido da extremidade

amino da protena (N), teremos uma fita paralela; caso se forme entre dois pedaos
em orientaes de sentido opostas, a fita ser chamada de antiparalela.
CEDERJ 43
Um ponto importantssimo no que diz respeito s folhas E que

elas podem ser formadas por fitas que esto muito distantes na seqncia
primria da protena, separadas por hlices ou voltas (Figura 12.5). No
se preocupe, pois sobre estas ltimas voc aprender ainda nesta aula,
mais adiante.
Fita Fita Fita Fita
Hlice
Volta
(a) (b)
Figura 12.5: Estruturas como as fitas/folhas podem

aproximar regies distantes de uma protena, como os
aminocidos de uma extremidade (amino - N-terminal)
e de outra (carboxila C-terminal).
Assim como nos perguntamos para as D-hlices: ser que qualquer

aminocido fica bem acomodado numa folha E? Obviamente, quando
as fitas E que formam uma folha E esto muito prximas, a presena de
grupamentos R muito volumosos dificulta essa aproximao.
Peter Chou e Gerald Fasman, analisando a composio secundria
de diversas protenas, elaboraram, em 1978, uma tabela com a propenso
de cada resduo para formar uma D-hlice ou folha E (veja o Quadro 12.2).
Quanto maior o valor de P (probabilidade), maior a propenso daquele
resduo para formar uma dada estrutura secundria. Esta tabela pde
auxiliar os pesquisadores na previso da estrutura secundria de uma
determinada seqncia desconhecida.
44 CEDERJ
MDULO 1
Quadro 12.2: Probabilidade de um dado aminocido ser encontrado nos dois
12
principais tipos de estrutura secundria. Quanto maior a barra cinza, maior a
probabilidade de acharmos o resduo formando as estruturas
AULA
D-Hlice Fita E
Glu
Met
Ala
Leu
Lis
Fen
Gln
Trp
Ile
Val
Asp
His
Arg
Tre
Ser
Cis
Asn
Tir
Pro
Gli
P P
Caso em que as folhas E fazem diferena no

mundo visvel!
A fibrona da seda uma protena produzida
por insetos e aracndeos e que est presente
na formao dos casulos, teias, ninhos etc.
A fibrona da seda da mariposa Bombyx
mori, por exemplo, constituda de folhas
antiparalelas possuindo uma repetio de seis
aminocidos ao longo de sua estrutura primria.
So eles: Gli-Ser-Gli-Ala-Gli-Ala.
Nas folhas E da fibrona, as fitas E se empilham
de modo que os grupamentos R dos resduos de
glicina de uma fita se encaixam perfeitamente
na fita E adjacente. Do mesmo modo, os
grupos R das serinas ou alaninas se encaixam
na fita E adjacente formando uma estrutura
bem empilhada e empacotada. A resistncia Fonte: http://www.sxc.hu/photo/700563
das teias e sedas se deve a esta organizao
das folhas E, conforme voc vai ver com mais
detalhes na Aula 15.
CEDERJ 45
As folhas E, portanto, podem acontecer entre diversos resduos de

aminocidos de uma seqncia primria. Sua ocorrncia importante
por proporcionar protena uma estrutura mais resistente; dependendo
da funo desta protena, isso pode ser fundamental.
ATIVIDADE
2
2. Caracterizando folhas E
Voc aprendeu que as fitas E so formadas pela ligao entre dois trechos
distantes da seqncia da protena.
A seguir, voc ver dois pequenos trechos de uma protena que, aps
esta comear a assumir uma conformao tridimensional, ficaram lado
a lado.
Trecho 1
N-terminal TRIPTOFANO TREONINA FENILALANINA VALINA
C-terminal VALINA TREONINA TIROSINA ARGININA
Trecho 2
N-terminal PROLINA ISOLEUCINA SERINA
GLUTMICO LISINA LISINA C-terminal
Perguntas:
a. Qual desses dois trechos no forma uma fita E? Justifique sua resposta.
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
b. Que tipo de ligao necessrio que acontea para que se forme uma
fita (ou folha) E?
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
c. No trecho que forma fita E, quais so as orientaes destas fitas (paralelas

ou antiparalelas)?
_______________________________________________________________
_______________________________________________________________
46 CEDERJ
MDULO 1
12
RESPOSTA COMENTADA
AULA
Se voc consultou o Quadro 12.1, viu que somente o trecho 1
que pode constituir uma fita E. Isso porque, nele, esto presentes
aminocidos com alta probabilidade de participar deste tipo de
estrutura. O trecho 2 constitudo por aminocidos que tm baixa
propenso para assumir conformao de fita E. Os aminocidos
do trecho 1, pareados como mostrado no enunciado da questo,
formaro uma fita pelo estabelecimento de pontes de H, que deve
ter sido sua resposta para a letra b. S para complementar, essas
pontes so formadas entre o oxignio do grupamento carboxila de
um aminocido com o hidrognio do grupamento amino de outro
aminocido, localizado paralelamente ao primeiro.
Quanto orientao das fitas (letra c), devemos levar em conta as
posies do C-terminal e do N-terminal da protena em questo.
Como N-terminal e C-terminal do trecho 1 esto em sentidos opostos
(se seguirmos o fio seqncia primria da protena), esta fita
E antiparalela.
AS VOLTAS
As voltas conectam diferentes segmentos das protenas, podendo

mudar a direo da cadeia. Podem estar presentes (1) entre duas D-hlices,
(2) conectando uma D-hlice a uma fita E ou vice-versa, ou, ainda, (3)
conectando duas fitas E para a formao de uma folha E antiparalela.
Neste ltimo caso, so ditas voltas E (Figura 12.6).
Figura 12.6: As voltas E, formadas por quatro aminocidos. Na figura, cada esfera
preta representa o carbono a de um aminocido. O grupamento amino do primeiro
se liga, por ponte de hidrognio, ao grupamento carboxila do ltimo (N | | | | O),
formando a volta.
CEDERJ 47
As voltas E so formadas por quatro aminocidos que se mantm

formando uma espcie de estrutura em semicrculo, em que o primeiro
resduo da volta faz uma ponte de hidrognio com o quarto resduo da
volta. Os dois resduos centrais no mantm nenhum contato especfico.
Ser que tambm existem resduos que se apresentam com mais
freqncia nas voltas? Mais uma vez, a resposta positiva! Prolinas e
glicinas so timas formadoras de voltas, exatamente pelos mesmos
motivos que fazem desses dois aminocidos maus formadores de D-
hlices.
IMINOCIDO A glicina, por ser muito flexvel e pequena, fica bem acomodada
Um iminocido um nessas voltas. A prolina, por ser um IMINOCIDO, assume uma conformao
aminocido que possui
seu nitrognio (do propcia para este tipo de estrutura.
grupamento amino)
formando um ciclo.
ATIVIDADE FINAL
1 2 3
Estrutura secundria de uma protena
A estrutura secundria de uma protena constituda por D-hlices, folhas E e

voltas. Analise a seqncia a seguir, de uma protena hipottica (os nmeros na
frente das linhas indicam a posio do primeiro aminocido daquela linha na
seqncia total):
1 leucina-histidina-valina-fenilalanina-alanina-
6 -prolina-glicina-alanina-prolina-valina-
11 -treonina-tirosina-arginina-prolina-glicina-
16 -serina-glicina-valina-fenilalanina-treonina-
21 -tritopfano
a. Identifique possveis stios (regies) de formao de voltas E (escreva na linha

a seguir os nmeros dos aminocidos envolvidos na volta E).
______________________________________________________________________________
______________________________________________________________________________
48 CEDERJ
MDULO 1
b. Identifique a regio na qual esta protena assumir uma conformao D-hlice.
12
______________________________________________________________________________
AULA
______________________________________________________________________________
c. H possibilidade de formao de fita E? Entre quais aminocidos?
______________________________________________________________________________
______________________________________________________________________________
RESPOSTA COMENTADA
Esta atividade oferece um grau de dificuldade maior do que as outras
por ser mais integradora e abordar todos os elementos que constituem
a estrutura secundria de uma protena. Alm disso, ela mostra uma
seqncia partida em cinco linhas para voc visualizar por inteiro e
identificar regies de volta, hlice e fita E. , no era simples, mas,
certamente, muito valiosa para a sua aprendizagem!
Pedimos que voc identificasse as possveis voltas E primeiro pois
elas eram as mais fceis. Voc aprendeu na aula que as voltas E so
formadas entre quatro aminocidos, especialmente glicinas e prolinas.
A primeira volta formada pelos aminocidos 6, 7, 8 e 9; a segunda,
entre os resduos 14, 15, 16 e 17. Estes dois grupos de aminocidos
so majoritariamente constitudos por glicinas e prolinas.
Em seguida, voc deve ter identificado a D-hlice, constituda pelos
primeiros cinco aminocidos. Entre eles no h cargas contrrias se
repelindo, aminocidos volumosas em conflito, glicinas e prolinas, boas
condies para a formao da D-hlice.
Com a formao da segunda volta (entre os resduos 14-17), os
aminocidos valina-treonina-tirosina-arginina (10-13) e valina-
fenilalanina-treonina-tritopfano (18-21) se aproximam. Estes
aminocidos tm grande propenso a formar fita E quando se
encontram pareados, como o caso. Assim, estes resduos se associam
por pontes de H e formam uma fita E.
CEDERJ 49
RESUMO
A estrutura secundria de uma protena a organizao espacial dos seus

aminocidos em trs estruturas: D-hlices, folhas E e voltas.
As D-hlices se formam pelo enovelamento da seqncia primria ao redor de um
eixo imaginrio, simulando uma estrutura semelhante a uma espiral de caderno.
Esta estrutura estabilizada por pontes de H e por interaes de Van de Waals.
As folhas E so tambm arranjos espaciais que a seqncia primria pode tomar.
Sua maior caracterstica o fato de unir regies bastante distantes de uma
protena, formando uma espcie de ziguezague semelhante a um leque ou a
uma saia de colegial. Quando dois pedaos da protena se ligam por pontes de
H formando uma tira do leque, dizemos que se formou uma fita E. Quando
vrias fitas E se associam (formando uma estrutura semelhante ao leque inteiro),
temos as folhas E.
O terceiro arranjo espacial chamado de voltas. As voltas so tores na seqncia
primria, que tambm podem ser estabilizadas por ponte de H. No caso das voltas
E, temos sempre quatro aminocidos envolvidos, e o primeiro se liga ao quarto
por uma ponte de hidrognio.
Todas essas trs estruturas estabilizam a estrutura terciria de uma protena,
importante para que ela execute sua funo no organismo/natureza.
INFORMAES SOBRE A PRXIMA AULA
Voc aprendeu hoje, isoladamente, como uma protena pode comear a se organizar
no espao. Na prxima aula, voc ver como estas conformaes (D-hlices, folhas
E e voltas) fazem uma protena se arrumar no espao, imaginando todos esses
elementos ao mesmo tempo em uma cadeia polipeptdica. At l!
50 CEDERJ
13
AULA
Protenas 3 Agora, sim:
as protenas no espao!
Metas da aula
Apresentar as estruturas terciria e
quaternria de protenas, as foras que
mantm essas estruturas e as tcnicas
utilizadas para desvend-las.
objetivos
Ao final desta aula, voc dever ser capaz de:
1
relacionar as interaes moleculares e a
manuteno das estruturas terciria e quaternria;
2
identificar tcnicas para determinao da estrutura
terciria de uma protena;
3
diferenciar estrutura terciria e quaternria
de protenas;
4 identificar um grupamento prosttico associado

a uma protena.
Pr-requisitos
Para acompanhar esta aula, voc precisa ter em mente o que
so as D-hlices, as folhas E e as voltas, temas abordados
na aula passada, sobre estrutura secundria das protenas.
Bioqumica I | Protenas 3 Agora, sim: as protenas no espao!
INTRODUO Os cientistas estimam que o homem sintetize cerca de 100 mil protenas
diferentes em seu organismo. Estas molculas, como voc j sabe, so
responsveis por funes vitais do nosso corpo, como gerao de energia,
contrao muscular (incluindo o msculo cardaco), entre outras.
Algumas doenas so causadas por disfunes de determinadas protenas,
quer seja excesso, falta ou mau funcionamento. Um exemplo o mal de
Alzheimer, causado pelo acmulo de uma protena especfica (protena
E-amilide) no crebro.
Figura 13.1: O mal de Alzheimer uma doena que afeta a atividade

dos neurnios (neurodegenerativa) e que acomete, principalmente,
indivduos de idade mais avanada. Esta doena causada pelo
acmulo de uma protena (protena -amilide) no crebro do
indivduo, prejudicando a manuteno de informaes recentes,
ou seja, causando perda de memria.
Conhecer a estrutura das protenas fundamental para que a Cincia possa

trabalhar no desenvolvimento de drogas especficas contra certas patologias.
Uma droga que se ligue protena -amilide, por exemplo, poderia favorecer
sua degradao ou impedir seu acmulo, prevenindo a manifestao do mal
de Alzheimer.
Nesta aula, voc continuar aprendendo sobre a estrutura das protenas, s que
agora ver como elas se organizam no espao (de maneira tridimensional).
52 CEDERJ
MDULO 1
A ESTRUTURA TERCIRIA DE UMA PROTENA
13
O arranjo tridimensional das D-hlices, folhas E e voltas no espao
AULA
conhecido como estrutura terciria da protena (Figura 13.2). Para
melhor entendermos isto, imagine um cadaro de sapato. Esticado, ele
equivale seqncia primria; quando voc faz a primeira dobra para
comear o lao, equivaleria estrutura secundria. Para amarrar o seu
sapato, preciso que o seu cadaro se dobre sobre si mesmo mais de
uma vez, at formar o lao. mais ou menos isto o que acontece com as
protenas. Os elementos de estrutura secundria (hlices, fitas e voltas)
vo se dobrando e se organizando no espao at que a protena atinge
sua conformao final. ento que ela assume sua funo, a qual pode
ser, por exemplo:
a defesa do organismo, como o caso dos anticorpos;
a regulao da expresso gnica, ativando ou reprimindo genes de
determinadas protenas;
a catlise (acelerao) de uma reao funo das enzimas;
o capsdeo (cobertura) de uma partcula viral, como o caso de
algumas protenas estruturais.
Estrutura primria
Aminocidos
Fita E D-hlice
Estrutura secundria
Estrutura terciria
Representao da fita E
Representao de D-hlice
Figura 13.2: Os trs primeiros nveis organizacionais de uma protena. A seqncia de

aminocidos (estrutura primria) pode assumir conformaes de D-hlice e de fitas
ou folhas E, o que caracteriza a estrutura secundria. Quando as D-hlices e as fitas/
folhas se organizam no espao e assumem uma conformao tridimensional, temos
a estrutura terciria de uma protena.
Mas voc sabe como essa estrutura mantida?
CEDERJ 53
FORAS QUE MANTM A ESTRUTURA TERCIRIA DAS

PROTENAS
Por diversos estudos, hoje sabemos que a estrutura terciria das

protenas mantida por pontes de hidrognio, interaes apolares,
interaes inicas, e as foras de van der Walls todas entre as cadeias
laterais dos resduos de aminocidos. Alm dessas, a estrutura terciria
mantida tambm pelas pontes de enxofre que se formam quando duas
cistenas se aproximam no espao (Figura 13.3).
Detalhe das foras que mantm a estrutura
D-hlices e das fitas-E

Estrutura terciria organizao espacial das terciria
Interaes hidrofbicas
(entre dois aminocidos
hidrofbicos)
Cadeia polipeptdica
Ponte de
hidrognio
Ponte dissulfeto
Fita E
D-hlice
Interaes inicas
Figura 13.3: Foras que mantm a estrutura terciria de uma protena. As D-hlices
e as fitas E de uma protena se organizam em um arranjo espacial mantido por
diversas interaes, como voc pode ver na figura.
Estas interaes so as responsveis pela manuteno da estrutura terciria de
uma protena.
De todas essas interaes, a mais forte , sem dvida, a ponte de

enxofre, j que a nica que envolve uma ligao covalente.
Para quebr-la, necessrio que se adicione protena um agente
redutor de pontes de enxofre. Este agente, que pode ser o ditiotreitol (DTT),
o E mercaptoetanol, a glutationa etc., funciona desfazendo a ponte dissulfeto
ao doar hidrognios para cada uma das cistenas. Veja:
54 CEDERJ
MDULO 1
Adio de agente redutor H
13
AULA
Cistena S S cistena Cistena SH e HS cistena
Ponte intacta Ponte quebrada
(cistina)
Uma ponte dissulfeto pode unir duas cistenas bastante distantes

na seqncia primria, auxiliando o arranjo tridimensional da protena.
Desfazer uma ponte dissulfeto com um agente redutor desestabilizar
a estrutura terciria de uma protena, expondo regies que estavam
voltadas para o interior da protena por algum motivo, o qual voc
descobrir logo aps realizar a Atividade 1.
ATIVIDADE
1. Mantendo as protenas no espao! 1
At agora, voc aprendeu trs nveis de organizao das protenas. Cada um

desses nveis caracterizado e depende de determinados tipos de ligaes
e interaes entre os aminocidos para serem mantidos. Relacione o nvel
de organizao protico ao tipo de interao/ligao que o mantm:
( 1 ) Estrutura primria
( 2 ) Estrutura secundria
( 3 ) Estrutura terciria
a. ( ) interaes entre aminocidos hidrofbicos;

b. ( ) ligaes peptdicas;
c. ( ) pontes de H entre a carboxila de um aminocido e o
hidrognio de outro;
d. ( ) interaes inicas;
e. ( ) interaes entre os tomos de enxofre de duas cistenas.
RESPOSTA COMENTADA
A estrutura primria de uma protena mantida por ligaes
peptdicas entre os resduos de aminocidos.
A estrutura secundria acontece por se formarem pontes de H
entre o oxignio da carboxila de um aminocido e o hidrognio do
grupamento amino de outro e por interaes apolares.
A estrutura terciria, por sua vez, mantida por pontes de hidrognio,
interaes apolares, interaes inicas e pontes dissulfeto entre as
CEDERJ 55
cadeias laterais dos resduos de aminocidos presentes. A resposta

para a atividade, portanto, :
a. 2 e 3;
b. 1;
c. 2 e 3;
d. 3;
e. 3.
Essas so as mesmas foras que mantm a estrutura quaternria
de uma protena, s que no acontecem mais em uma s cadeia,
e sim em mais de uma. Mas isso voc vai ver daqui a pouco...
DISTRIBUIO DOS AMINOCIDOS NA PROTENA

SEGUNDO SUA NATUREZA QUMICA
Um aspecto importante quando analisamos a estrutura terciria das

diversas protenas que h uma tendncia de se encontrarem aminocidos
apolares no seu interior, enquanto os aminocidos polares podem ser
encontrados na superfcie da protena. Pense um pouco: voc v alguma
razo para que tal fato ocorra?
A tendncia que os aminocidos apolares apresentam de se
esconder dentro da protena est relacionada ao fato de que no interior
de muitas dessas molculas existem poucas molculas de gua ou quase
nenhuma. Os aminocidos apolares, portanto, se situam com freqncia
no interior das protenas para evitar o contato com a gua, uma vez que
eles no conseguem interagir com esta molcula.
O mesmo no ocorre com os aminocidos polares, que interagem
com a gua formando pontes de H e, por isso, podem se localizar em
regies mais expostas gua, na superfcie das protenas.
56 CEDERJ
MDULO 1
COMO DESCOBRIR A ESTRUTURA DE UMA PROTENA?
13
Cada protena apresenta uma estrutura terciria que lhe
AULA
caracterstica. Todas as MIOGLOBINAS da espcie humana, por exemplo,
apresentam a mesma estrutura terciria.
MIOGLOBINAS
So protenas presentes
nas clulas musculares,
capazes de transportar/
armazenar oxignio
unicamente para as
clulas nas quais residem.
As mioglobinas so
capazes de desempenhar
esta funo porque,
associada sua estrutura,
h uma molcula capaz Molcula capaz de
de se ligar ao oxignio, se ligar ao oxignio
a mesma molcula e mant-lo associado
que encontramos protena
na hemoglobina,
possibilitando o
transporte desse gs no Mioglobina, com muitas
nosso sangue. D-hlices e uma estrutura
bastante irregular
Mas como possvel desvendar e conhecer a estrutura terciria

de uma protena?
A estrutura terciria de uma protena pode ser obtida pela
utilizao de dois mtodos: difrao de raios X e ressonncia magntica
nuclear. Estas tcnicas nos permitem conhecer os detalhes da estrutura das
protenas, de forma a saber quais partes da protena esto mais prximas
e quais partes esto mais afastadas. quase como tentar entender como
se enrola um novelo de l!
Ambas as tcnicas so bastante sofisticadas, e o que fazem, em
ltima anlise, fornecer um retrato microscpico da protena. Este
retrato ento decifrado por especialistas nestas tcnicas que, com a
ajuda de computadores, acabam gerando uma imagem tridimensional,
refinada e precisa, dos contatos entre os tomos na protena.
Conhea essas tcnicas a seguir!
CEDERJ 57
CRISTALOGRAFIA DE RAIOS X
Para se desvendar a estrutura de uma protena por esta tcnica,

necessrio obter uma imagem do padro de difrao (espalhamento) de
raios X desta protena. S que, para poder fazer este experimento, voc
CRISTAL precisa, primeiro, obter o CRISTAL desta protena.
O cristal a que nos Existem diversas tcnicas para se obterem cristais de protenas, e o
referimos assemelha-se conjunto delas chamado cristalografia. Em geral, necessrio ter a protena
visualmente quele
presente no acar a ser analisada em estado altamente puro e em alta concentrao.
cristalizado (tambm
conhecido como acar Alm disso, utilizam-se agentes qumicos, como, por exemplo, o
cristal ou acar de
polietileno glicol. Um agente como este faz com que a protena se dissocie
confeiteiro). uma
estrutura formada de molculas de gua que porventura estejam ao seu redor, facilitando
pela arrumao no
espao de maneira a formao do cristal.
organizada dos tomos
da substncia que o
Assim, no cristal, a quantidade de gua reduzida e as molculas
compe. esto perfeitamente ordenadas. Isso importante para se obter um padro
de difrao (espalhamento) de raios X, e voc j vai entender o porqu.
Uma vez obtido o cristal, incide-se sobre ele radiao (raios) do
tipo X. Os tomos da protena (no cristal) recebem esta radiao, que se
espalha produzindo o que se chama de padro de difrao de raios X.
Fazer a cristalografia de uma protena fundamental para se obter
um padro de difrao homogneo. Ou seja, ter um cristal faz com que,
independentemente de em que lado da sua amostra voc v incidir os
raios X, o padro de difrao que voc vai ver ser sempre o mesmo.
Cada protena possui um padro de difrao prprio. como se
cada combinao de tomos possusse uma impresso digital prpria,
cuja anlise permite que se conheam os detalhes daquela molcula. Com
a ajuda de computadores e programas especficos, estas impresses
digitais so decifradas, chegando-se estrutura final da protena. Veja,
na Figura 13.4, a estrutura j conhecida de algumas protenas:
58 CEDERJ
MDULO 1
13
AULA
Pepsina
Citocromo c
Lisozima Albumina
Figura 13.4: Estrutura terciria, j conhecida, de algumas protenas. Observe, nas

quatro, a presena de D-hlices (representadas por espirais) e de fitas (representadas
por setas largas na pepsina e na lisozima), em um arranjo tridimensional. No primeiro
quadro, est a pepsina, protena responsvel pela digesto de protenas no nosso
estmago. direita da pepsina est o citocromo c. Junto com sua estrutura esto
representados, no centro, alguns pontos cinza-escuro, que representam uma
molcula que fica associada estrutura do citocromo c. Essa molcula capaz
de doar e receber eltrons com facilidade, o que importante para a sua funo
(participar da cadeia transportadora de eltrons, uma via que participa da gerao
de energia dentro da clula). J a lisozima uma protena presente nas lgrimas,
na saliva e em outras secrees, e que atua como defesa contra microorganismos.
A albumina, por sua vez, uma protena presente em grandes quantidades no nosso
sangue, e atua carregando molculas de um lado para o outro do corpo.
Desvendando uma protena dos nossos msculos...

Em 1958, John Kendrew, ao analisar os cristais da mioglobina, a primeira
protena a ter sua estrutura cristalogrfica determinada, observou
espantado que a estrutura desta protena era bastante complicada,
irregular e assimtrica. O que as anlises de Kendrew mostraram que
a estrutura da mioglobina faz com que esta protena apresente em sua
superfcie reentrncias, formando cavidades e bolsos.
Hoje, sabemos que esta irregularidade na superfcie das protenas,
na verdade, muito importante, por exemplo, para permitir que elas
interajam entre si, ou com outras molculas da clula, como duas peas
de um quebra-cabea que se encaixam.
CEDERJ 59
RESSONNCIA MAGNTICA NUCLEAR
A Ressonncia Magntica Nuclear (RMN) outra tcnica que permite

a elucidao da estrutura das protenas. Diferentemente da difrao de raios
X, na RMN a protena fica em soluo e no na forma cristalizada.
A protena de interesse, em soluo, levada para um equipamento
chamado espectrmetro de ressonncia. Neste equipamento, a molcula
de protena colocada sob um campo magntico muito forte. Em seguida,
PULSOS DE so aplicados PULSOS DE RADIOFREQNCIA que so absorvidos pelos ncleos
RADIOFREQNCIA
dos tomos presentes na molcula da protena, excitando-os. Quando
Exposies de uma
amostra (no caso do
esses ncleos retornam ao seu estado basal, isto , no excitado, eles
assunto da nossa aula, emitem de volta radiofreqncias que so especficas de cada um dos
protenas) a ondas
com o comprimento tomos (nas protenas encontramos sempre carbonos, hidrognios e
das ondas de rdio,
por tempos curtos. oxignios) e que podem ser medidas.
As exposies a estas Existem seqncias de pulsos especficas, que revelam no s qual
ondas desencadeiam
alteraes na o tomo, mas como ele est ligado a outros tomos, por exemplo, por
organizao dos
eltrons de um tomo, meio de uma ligao covalente. Neste caso, pode-se conhecer o tipo
deixando-o no que
de aminocido responsvel por aquelas freqncias. Existem tambm
chamamos estado
excitado. seqncias de pulsos capazes de revelar os tomos que esto prximos no
espao, mas que no esto unidos por meio de ligao covalente. Estes
sinais so oriundos de aminocidos que esto distantes, na seqncia
primria da protena, mas prximos na estrutura terciria. analisando
estas informaes que um pesquisador que trabalha com estrutura de
protenas vai, passo a passo, montando uma espcie de quebra-cabea
molecular. Obviamente a tecnologia trabalha a favor da Cincia, e a ajuda
de computadores com programas especficos possibilita a obteno da
estrutura tridimensional da protena.
Na Ressonncia Magntica Nuclear tambm necessrio que se
tenha a protena de interesse em alta concentrao e altamente pura.
No Brasil, existem diversos grupos de pesquisa que se dedicam
determinao da estrutura de protenas. Em So Paulo e no Rio de
Janeiro, existem equipamentos de RMN muito modernos, bem como
uma enorme facilidade para determinao de estrutura de protenas por
raios X, mais especificamente em Campinas e So Carlos (veja o boxe
a seguir).
60 CEDERJ
MDULO 1
13
O Brasil e a tecnologia de ponta
Em Campinas (SP) est situado o melhor centro da Amrica Latina para
AULA
elucidao da estrutura de protenas: o Laboratrio Nacional de Luz
Sncrotron (LNLS). Ele entrou em funcionamento em 1997, e possui todos
os equipamentos necessrios elucidao da estrutura de protenas, por
diversas tcnicas. L, possvel cristalizar uma protena e fazer a difrao
de raios X e/ ou analis-la por Ressonncia Magntica Nuclear.
At agora, diversas estruturas j foram elucidadas, incluindo a hexoquinase,
uma enzima que participa da primeira etapa para a utilizao do acar
glicose como fonte de energia.
Quer saber mais sobre este centro to importante? Visite www.lnls.br e
navegue vontade. L voc encontra, em linguagem bastante acessvel,
vrias informaes sobre o funcionamento deste importante plo
tecnolgico!
ATIVIDADE
2
2. Como descobrir a estrutura de uma protena?
Em toda reunio cientfica (congresso), h um espao para que os
pesquisadores que ali esto apresentem os trabalhos que esto
desenvolvendo, quer oralmente, quer em um painel (pster).
Dois pesquisadores, um dos Estados Unidos e outro da Frana, se
encontraram em um congresso internacional e descobriram que haviam
desvendado a estrutura da mesma protena. Para que nenhum dos dois
perdesse os dados que geraram, eles decidiram publicar o trabalho juntos,
somando os dados que tinham obtido. Por sorte, um deles tinha feito
experimentos de Ressonncia Magntica Nuclear e o outro, cristalografia
de raios X.
A seguir, voc encontra uma tabela que lista os procedimentos que John
Grey (o americano) e Louis Iliet (o francs) seguiram:
John Grey Louis Iliet

Procedimentos seguidos
1 Obteno da protena em grande Obteno da protena em grande
quantidade quantidade
2 Purificao da protena Purificao da protena
3 Precipitao da protena com Concentrao da protena em soluo,
polietileno glicol de um volume de 300mL para 50L
4 Manuteno da protena em uma Manuteno da protena em agitao,
cmara fria sem agitao em temperatura ambiente
5 Exposio radiao Exposio a um campo magntico
forte e a pulsos de radiofreqncia
6 Obteno de um perfil de Obteno de um perfil de emisso de
espalhamento da radiao que ondas por parte da amostra
incidiu na amostra
7 Anlise deste perfil Anlise deste perfil
8 Elucidao da estrutura Elucidao da estrutura
CEDERJ 61
Analisando as duas colunas da tabela, qual mtodo foi utilizado por que
pesquisador? Justifique sua resposta mencionando as etapas (1 a 8) que
lhe permitiram chegar a esta concluso.
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RESPOSTA COMENTADA
Os dois primeiros passos foram seguidos pelos dois pesquisadores. No
passo 3, John Grey comea a trabalhar para retirar gua associada s
molculas de sua protena de estudo, o que revela que ele optou por
estudar a estrutura desta por cristalografia de raios X. Para confeccionar
um cristal, necessrio ter a protena em alta concentrao e fora de
soluo (isto , sem estar associada gua). Isso se faz mantendo a
amostra em baixa temperatura sem qualquer movimento para que
as molculas possam se organizar na forma de um cristal. Obtido o
cristal, o passo seguinte exp-lo a raios X para observar o padro de
difrao que o cristal originar. A anlise deste padro que revela a
estrutura da protena.
Louis, por sua vez, elucidou a estrutura de sua protena por RMN. Ele
obteve uma amostra bastante concentrada, que foi mantida em soluo,
caracterstica da tcnica. Esta amostra foi exposta ao campo magntico,
aos pulsos de radiofreqncia, sendo excitada e retornando ao seu
estado normal em seguida. O perfil dos pulsos emitidos pela amostra
ao retornar ao estado inicial (no excitado) foi analisado por Louis que,
assim, tambm obteve a estrutura da protena!
Agora que voc j aprendeu o que e como mantida a estrutura

terciria de uma protena, alm de descobrir como desvend-la, podemos
dar mais um passo no estudo destas molculas.
Na Aula 11 apresentamos voc aos quatro nveis de organizao
das protenas. At agora, voc aprendeu trs deles. Vamos ao quarto?
A ESTRUTURA QUATERNRIA DE UMA PROTENA
Pense no funcionamento de uma mquina. Independentemente de

qual tenha sido sua escolha, certamente esta mquina conta com mais
de uma pea para seu funcionamento. Algumas dessas peas, inclusive,
se repetem. Em um carro, por exemplo, no basta termos um pneu para
que ele se movimente. Precisamos dos quatro!
62 CEDERJ
MDULO 1
Existem protenas que no concentram em uma nica seqncia
13
de aminocidos tudo o que precisam para exercer sua funo. s vezes,
AULA
necessrio que haja aquela mesma seqncia duplicada, ou mesmo que
haja uma outra seqncia que, organizada espacialmente, se associe
primeira. Neste contexto, cada seqncia desta protena que ser
montada chamada de subunidade.
Uma protena apresenta nvel de organizao quaternrio quando
possui mais de uma subunidade. Se a protena tiver duas subunidades,
chamada dmero; se trs, trmero; se quatro, tetrmero; cinco, pentmero,
e assim por diante. Quando usamos o termo oligmero, queremos dizer
que a protena tem vrias subunidades.
Mas, antes de seguir, pense um minutinho: voc acha que todas
as protenas alcanam o nvel de organizao quaternrio?
A verdade que no. Muitas protenas se apresentam na forma
monomrica, isto , com apenas uma subunidade. A mioglobina, que
usamos como exemplo no incio desta aula, uma protena monomrica.
J a hemoglobina, protena responsvel pelo transporte do oxignio no
sangue (funo bastante similar da mioglobina, mas em outro tecido),
possui quatro subunidades:
Mioglobina Hemoglobina
(formada por apenas (formada por apenas
uma subunidade) quatro subunidades)
Subunidade E Subunidade E
Subunidade D Subunidade D
Figura 13.5: Estruturas esquemticas da mioglobina e da hemoglobina. A mioglobina,

por ser formada por apenas uma subunidade, no possui estrutura quaternria.
quatro subunidades (duas subunidades D e duas E).

J a hemoglobina um tetrmero, ou seja, uma protena composta pela unio de
CEDERJ 63
Protenas oligomricas podem possuir subunidades idnticas,

como no caso da HEXOQUINASE, ou subunidades distintas, como no
caso da hemoglobina que apresenta cadeias D e E (que so pedaos
HEXOQUINASE
Enzima que participa
da primeira etapa da da hemoglobina que circula no nosso sangue se quiser saber mais
quebra da glicose,
processo que acontece
exemplos de oligmeros, veja o boxe Com quantas subunidades se faz
para que a clula um ribossomo?).
obtenha energia desta
molcula.
Com quantas subunidades se faz

um ribossomo?
Um bom exemplo de oligmero
o ribossomo, estrutura da c-
lula que realiza a traduo das
protenas. Os ribossomos so
formados por cerca de 50 cadeias
polipeptdicas distintas que se
associam s molculas de um
RNA caracterstico, encontrado
somente nesta estrutura (e, por
isso, chamado RNA ribossomal).
A estrutura deste grande complexo foi completamente desvendada em
2000 por pesquisadores da Universidade de Yale (Thomas Steitz e Peter
Moore), utilizando a tcnica de cristalografia de raios X.
Na Aula 17, onde falaremos de estruturas virais e de fibras amilides voc
ver outros exemplos de oligmeros e de estrutura quaternria.
Mas volte Figura 13.5 e a observe com um pouco mais de ateno.

Se voc reparar, h uma estrutura representada no meio da cadeia da
mioglobina e no centro de cada uma das subunidades da hemoglobina.
Esta estrutura no um elemento protico, isto , no um
aminocido e no faz parte da seqncia primria da protena. Sobre
este elemento estranho s estruturas representadas voc aprender na
prxima seo, logo aps realizar a Atividade 4!
64 CEDERJ
MDULO 1
ATIVIDADE
13
3
AULA
3. Como explicar?
O pesquisador Joo Souza, aps diversos procedimentos, obteve uma
amostra pura da protena de seu interesse de estudo, a XYZ. Ao verificar a
seqncia da protena pura, deparou-se com duas seqncias diferentes.
Joo se esforou mais na purificao, acreditando que poderia ter alguma
outra protena contaminando sua amostra, mas todos os resultados davam
sempre os mesmos: duas seqncias diferentes na amostra.
Em um congresso, Joo teve a oportunidade de conversar com um grande
especialista da rea, que j havia, alguns anos antes, trabalhado com a
protena XYZ. Este especialista disse a Joo que ele no tinha com o que
se preocupar, pois sua amostra continha apenas a protena XYZ, mesmo.
Joo, obviamente, ficou intrigado e, na mesma hora, perguntou: Por que
h duas seqncias, ento?
Que explicao voc daria a Joo no lugar do especialista, levando em
considerao os dois nveis de organizao das protenas que aprendeu
nesta aula?
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RESPOSTA COMENTADA
Joo se empenhou em obter uma amostra pura de sua protena,
mas sempre a conseguia com duas seqncias diferentes. Um
especialista garantiu a ele que a segunda seqncia no se referia a
uma contaminao. A explicao para isso? Joo est diante de uma
protena que possui estrutura quaternria, e no terciria apenas. Se
a protena XYZ apresentasse estrutura terciria, Joo certamente teria
em mos uma amostra com contaminao por outra protena. Como
o especialista garantiu que no h nenhuma protena alm da XYZ
na amostra de Joo, ele s pode estar diante de uma protena com
estrutura quaternria e, mais ainda, com pelo menos duas subunidades,
as quais apresentam seqncias diferentes (o que nem sempre
acontece em protenas com estrutura quaternria).
No caso especfico da protena XYZ e com as informaes que tivemos,
no podemos saber quantas subunidades a protena tem de fato (se
dmero, trmero etc.). O que podemos garantir que ela possui, no
mnimo, duas subunidades, e que elas so distintas.
CEDERJ 65
OUTROS GRUPAMENTOS NAS PROTENAS
Assim como voc viu nas representaes esquemticas da

hemoglobina e da mioglobina, muitas protenas possuem grupamentos
no-proticos aderidos. Na hemoglobina, o grupamento que voc
viu ligado a cada uma das quatro subunidades o heme (voc ver o
grupamento heme com mais detalhes na Aula 16).
Outros exemplos de protenas que possuem grupamentos no-
proticos so as protenas do complexo coletor de luz, que esto envolvidas
na fotossntese. Essas protenas possuem pigmentos aderidos a elas, tais
como a clorofila. H ainda as protenas que, para exercer corretamente
suas funes, precisam ter vitaminas associadas sua estrutura.
Os grupamentos no-proticos tm papel relevante em grande
parte das funes das protenas e, conseqentemente, se faltar um desses
grupamentos a protena perde sua funo. Um exemplo pode ser visto
no caso de uma dieta desbalanceada, na qual nos falta alguma vitamina.
As protenas que possuem esta vitamina como parte de sua estrutura, e
que dela dependem para realizar sua funo, ficaro prejudicadas. Em
aulas mais frente, voc ver como agem e quais so as vitaminas, para
que voc compreenda melhor toda essa histria.
CONCLUSO
Considerando a enorme quantidade de protenas que temos em

nosso organismo e as diversas funes que estas desempenham, qualquer
estudo sobre estas molculas parece pouco em relao sua importncia
para a vida.
Conhecer a estrutura das protenas fundamental para que
possamos pensar em maneiras de contornar doenas causadas por
disfunes destas molculas no nosso corpo. O princpio farmacolgico
disso se baseia no fato de que estas molculas apresentam grande
associao entre a estrutura que tm e a funo que realizam. Assim,
quanto mais soubermos sobre estas molculas, melhor!
66 CEDERJ
MDULO 1
ATIVIDADE FINAL
13
4
AULA
Um estranho (bastante til) no ninho...
A mucina uma protena, e tambm conhecida como protena do muco. Uma

caracterstica das mucinas que essas protenas so altamente glicosiladas, ou
seja, possuem uma grande quantidade de carboidratos associada sua estrutura.
Esses acares fazem com que essa protena seja mais difcil de ser atacada por
proteases (enzimas que quebram outras protenas).
Ela est presente em diversas partes do corpo, por fazer parte da constituio das
mucosas (membranas que recobrem as paredes internas de algumas cavidades do
nosso corpo). Uma dessas mucosas a do estmago.
Considerando que o estmago um rgo rico em pepsina, uma enzima que

quebra outras protenas, qual a vantagem de se ter a mucina recobrindo a parede
deste rgo? O que fornece essa possibilidade s mucinas?
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RESPOSTA COMENTADA
O suco gstrico (secreo que liberada na cavidade estomacal por
estmulo alimentar) rico em cido clordrico (HCl) e uma protease, a
pepsina. O cido tem duas funes: exterminar microorganismos que
venham junto com a alimentao e desfazer a estrutura das protenas
que chegam no estmago (voc aprender mais sobre esse processo
daqui a algumas aulas). A pepsina capaz de quebrar outras protenas
em peptdeos menores, que sero quebrados em aminocidos mais
adiante no processo de digesto.
Um risco de se ter cido e protease em uma cavidade dentro do corpo
o de que esses dois componentes podem destruir as clulas que
compem o tecido da parede da prpria cavidade. Qual a estratgia
para evitar isso? Recobrir a cavidade com algo que no possa ser
destrudo por essas substncias e aqui entram as mucinas!
As mucinas podem defender o tecido da digesto pela pepsina e
da acidez do HCl por causa da sua estrutura, que tem uma grande
quantidade de carboidratos associada parte protica. Esses
carboidratos (acares) so os grupamentos prostticos da mucina e,
sem eles, ela no poderia desempenhar sua funo.
CEDERJ 67
RESUMO
A estrutura terciria de uma protena a maneira como estas molculas se

organizam no espao. Ela proporcionada e mantida por diversos tipos de
interao que acontecem entre as cadeias laterais dos aminocidos que fazem
parte da seqncia primria da molcula. A mais forte destas interaes a ponte
dissulfeto, por ter um carter covalente.
Conhecer a estrutura das protenas importante por causa da enorme gama de
funes que estas molculas exercem nos organismos. Maneiras de se fazer isso
utilizar as tcnicas de cristalografia de raios X e Ressonncia Magntica Nuclear.
Na primeira, incidimos raios X sobre um cristal formado pela protena pura e em
alta concentrao. O padro de espalhamento dos raios X aps a incidncia no
cristal, ao ser analisado, revela a estrutura da protena. J na segunda tcnica, a
amostra da protena, em soluo, exposta a um forte campo magntico, e sofre a
ao de pulsos de radiofreqncia, ficando no estado excitado; ao retornarem para
o estado inicial, os tomos da molcula emitem novos pulsos de radiofreqncia,
que revelam suas identidades e a que outros tomos esto ligados.
Para algumas protenas, alm da estrutura terciria existe um quarto nvel
organizacional: a estrutura quaternria. Esta definida pela unio de subunidades
que, ligadas umas s outras, possibilitam que a protena exera corretamente sua
funo. Um exemplo a hemoglobina, que possui quatro subunidades.
Falando em hemoglobina, esta serve de exemplo tambm para mostrar que
h possibilidade de encontrarmos outras molculas no-proticas associadas
s protenas. A presena destes grupamentos tambm relacionada funo
que a protena exerce, e sua retirada pode fazer com que a protena perca sua
funcionalidade.
68 CEDERJ
Protenas 4 Como as
protenas adquirem as
14
AULA
suas estruturas tercirias
(ou quaternrias)?
Meta da aula
Apresentar como acontece o enovelamento
protico e as protenas que auxiliam este
processo.
objetivos
Ao final desta aula, voc dever ser capaz de:
analisar o experimento de Anfinsen sobre

1
enovelamento protico;
caracterizar o processo de enovelamento protico

2 assistido.
Pr-requisitos
Para acompanhar esta aula, fundamental ter claro o conceito de
estrutura terciria de uma protena, que vimos na Aula 13. Alm disso,
interessante que voc reveja, caso no se lembre, o que mutao
(Aula 11) e por que as molculas na natureza assumem a estrutura de
menor energia (Aula 12).
Bioqumica I | Protenas 4 Como as protenas adquirem as suas estruturas tercirias
(ou quaternrias)?
INTRODUO Lembra que na aula anterior usamos o exemplo de um cadaro de sapato

amarrado para mostrar como seria a estrutura terciria de uma protena?
Pois bem, continuemos usando o cadaro por analogia. Concorda que
um cadaro no se amarra sozinho? Para que ele forme um lao, existe um
agente atuando: a sua mo, que dobra o cadaro, passa um lado por cima
do outro e o amarra.
Figura 14.1: O dobramento de um lao pode

ser uma boa analogia formao da estrutura
terciria de uma protena.
E na clula, como acontece? Ser que existe uma mo, algum elemento
que auxilie este processo, ou ser que as protenas se enovelam sozinhas?
Caso exista, ou quando for necessrio, quem desempenha a funo da mo
que ajuda as protenas a se enovelarem?
sobre como as protenas adquirem as suas estruturas que voc aprender
na aula de hoje!
70 CEDERJ
MDULO 1
ENOVELAMENTO PROTICO: O EXPERIMENTO DE
14
ANFINSEN
AULA
Hoje vamos propor uma estratgia diferente para voc aprender
sobre enovelamento protico. Voc ir, passo a passo, redescobrindo este
processo, seguindo os procedimentos experimentais que fez Christian
Anfinsen (veja o boxe sobre ele mais adiante) para entender como as
protenas se enovelam dentro de uma clula. Isso ser como uma grande
atividade. Daremos os passos e, ao final, voc ter que chegar a uma
concluso. Vamos l?!
Primeiras informaes
Pesquisador: Christian Anfinsen.

poca: dcada de 1960.
Pergunta a que queria responder: como as protenas se enovelam dentro
de uma clula?
Protena que usou para seus estudos: ribonuclease A, uma enzima que
quebra o RNA em RIBONUCLEOTDEOS. Esta enzima um monmero, isto RIBONUCLEOTDEOS
, possui apenas uma subunidade, com quatro pontes de enxofre que So as unidades
formadoras do RNA
ajudam a manter a sua estrutura terciria mais rgida. Em condies (uracila, citosina,
guanina, adenina).
adequadas de pH e na ausncia de agentes perturbadores da estrutura A ribonuclease
de protenas, a ribonuclease se encontra no ESTADO NATIVO (N) e apresenta capaz de quebrar uma
molcula de RNA
atividade enzimtica. em seus constituintes
menores, isto , em
ribonucleotdeos,
destruindo a molcula
de RNA original.
Quem foi Christian Anfinsen?

Christian Anfinsen tem um currculo cientfico
admirvel. Este pesquisador nasceu em 1916 nos ESTADO NATIVO
Estados Unidos e, com 23 anos, j era Mestre em
Qumica Orgnica. Seu doutorado, no entanto, o estado natural
foi em Bioqumica, concludo em Harvard, onde das protenas no
ele trabalhou durante muitos anos, antes de qual suas estruturas
ir para o NIH (um dos centros de pesquisa em secundria, terciria
sade mais respeitados do mundo). e quaternria (se
No comeo de sua carreira, Anfinsen desen- houver) se encontram
volveu um mtodo para marcar protenas ntegras. Neste estado,
recm-sintetizadas. Isso permitiu a outros pesquisadores, pouco tempo elas esto aptas a
depois, descobrir que as protenas comeavam a ser sintetizadas pela desempenhar suas
extremidade amino, alm de conhecer quanto tempo demorava para funes.
incorporar cada aminocido molcula.
CEDERJ 71
(ou quaternrias)?
Em seguida, Anfinsen comeou a se dedicar ao estudo das relaes entre

seqncia, estrutura e funo de cada protena. Foi nessa poca que ele
realizou as descobertas que voc est estudando nesta aula, as quais
deram a este pesquisador o Prmio Nobel de Qumica em 1972.
Atualmente, ele continua estudando estrutura de protenas, agora em
parceria com um importante centro de estudos: o MIT (Massachusetts
Institute of Technology).
URIA E E-
MERCAPTOETANOL
1 passo do experimento
So agentes
desnaturantes, ou seja,
capazes de perturbar
Para comear a estudar a ribonuclease, Anfinsen usou dois agentes
o estado nativo das que perturbam drasticamente a estrutura dessas molculas: a URIA eo
E-MERCAPTOETANOL.
protenas. Os agentes
desnaturantes podem
ser de natureza
qumica (pHs Ao fazer isso, ele desenovelou a ribonuclease, deixando-a em um
cidos ou bsicos estado muito parecido com aquele no qual ela se encontrava quando
extremos, uria ou
-mercaptoetanol), ou saiu do ribossoma, aps sua sntese dentro da clula, ou seja, o ESTADO
fsica (temperatura
ou presso). No DESENOVELADO ainda sem estrutura e funo (Figura 14.2). Neste estado, as
se sabe muito bem
protenas no so capazes de exercer suas funes. Ou seja, desenovelada,
como a uria atua.
Especula-se que ela a ribonuclease no capaz de quebrar molculas de RNA!
possa aumentar a
solubilidade em gua
SH
de alguns trechos 65
Emercaptoetanol
da protena. J o Adio de uria e HS
72
-mercaptoetanol 72 HS
40
58
funciona reduzindo 58 65 SH SH
as pontes dissulfeto e, 26
110 84 HS 84
portanto, separando 95
26 95
HS
os resduos de cistena 40
HS
110
que se ligaram desta
maneira. Ribonuclease Ribonuclease
nativa (N) ativa desnovelada (D)
inativa
ESTADO
Figura 14.2: Desnaturao de uma protena. A ribonuclease,
DESENOVELADO OU
Christian Anfinsen, foi colocada em um meio com uria e E-

protena utilizada para estudos sobre enovelamento por
DESNATURADO (D)
o estado das mercaptoetanol. Estas duas molculas so agentes desnaturantes
e fizeram com que a ribonuclease perdesse sua estrutura nativa,
protenas quando
assim como sua funo.
parte ou a totalidade
de sua estrutura foi
perdida, por exemplo,
pela ao de agentes 2o passo do experimento
desnaturantes, como
a uria. Quando
so sintetizadas Qual foi, ento, o prximo passo de Anfinsen? Para verificar se a
nos ribossomas, as
protena era capaz de se enovelar sozinha novamente, ele precisava retirar
protenas tambm se
encontram no estado de perto dela os agentes perturbadores de estrutura. Em laboratrio, um
desnaturado e tendem
a passar para o estado procedimento que pode ser utilizado nestes casos a dilise.
nativo em curto tempo.
72 CEDERJ
MDULO 1
Na dilise, a protena colocada dentro de um saco de dilise, que
14
possui poros muito pequenos. Este colocado dentro de um compartimento
AULA
com bastante lquido (um tampo, para que no haja variaes de pH no
meio), que entra e sai do saco de dilise livremente.
Isto faz com que a protena seja lavada e que os agentes pertur-
badores sejam DILUDOS por todo o lquido do compartimento onde est DILUIO
o saco de dilise (incluindo o interior do saco). J fez suco de caju
alguma vez? Quando
Pense um pouco: por que ser que as protenas no saem do saco voc faz essa ao
de dilise e os agentes perturbadores de estrutura saem? to corriqueira nem
se d conta de que
____________________________________________________________ est fazendo uma
diluio: na garrafa,
____________________________________________________________ o suco de caju est
concentrado; quando
Os poros do saco de dilise so muito pequenos e conseguem reter dentro
voc coloca gua, est
dele a protena; no entanto, os agentes perturbadores so molculas muito efetuando a diluio
da polpa concentrada.
menores do que a ribonuclease. Isso faz com que, na lavagem, somente Diluio, portanto,
a uria e o E-mercaptoetanol passem para fora do saco.
a ao de diminuir
a concentrao de
Aps vrias horas de lavagem e vrias trocas de tampo, a uria e alguma coisa, quer de
o E-mercaptoetanol j foram to diludos que sua concentrao

um suco concentrado,
quer de um agente
perturbador de
insignificante e podemos considerar que no esto mais em contato estrutura!
com a enzima (Figura 14.3).
Saquinho de dilise
Ribonuclease
desnaturada
E-mercaptoetanol
Uria
Figura 14.3: Dialisando uma protena. A ribonuclease foi colocada em um saco de dilise que, em seguida, foi
colocado em um recipiente contendo tampo. Os poros do saco de dilise so de tal tamanho que permitem
a sada dos agentes perturbadores, mas no da protena. Depois de muitas horas, os agentes perturbadores
passaram para o tampo, e a protena ficou sozinha no saco de dilise.
Agora que a protena est sem os agentes perturbadores de estrutura,

como ser que ela est: enovelada ou desenovelada? Esta pergunta levou
Anfinsen ao seu terceiro passo experimental...
CEDERJ 73
(ou quaternrias)?
3 passo do experimento
Como ser que se encontra a ribonuclease? foi a pergunta que Anfinsen

se fez.
Para respond-la, o pesquisador efetuou um experimento para medir a
atividade da ribonuclease que estava dentro do saco de dilise (aps a
dilise, claro!).
Anfinsen surpreendeu-se, pois observou que ela apresentava atividade
quase idntica da protena que no tinha sido tratada com uria e
E-mercaptoetanol.
Agora, faa a Atividade 1, pois ela fundamental para continuarmos
nossa aula!
ATIVIDADE
1
1. Tirando concluses a partir de dados experimentais
At agora, voc viu com detalhes os trs passos principais do experimento
realizado por um importante pesquisador da rea do enovelamento
protico. Veja um resumo, s para recapitular:
1 passo: provocou a perda da estrutura terciria da ribonuclease pela ao

de agentes desnaturantes;
2 passo: efetuou uma dilise para livrar a ribonuclease do contato com
os agentes perturbadores de estrutura;
3 passo: mediu a capacidade da ribonuclease (que passou pelos passos
1 e 2) realizar sua funo e viu que ela era capaz.
Analisando todos os dados obtidos, a que concluso voc acha que ele
chegou sobre o processo de enovelamento protico?
________________________________________________________________
________________________________________________________________
________________________________________________________________
RESPOSTA COMENTADA
Aps estudar o experimento de Anfinsen nas pginas anteriores, voc
deve ter chegado mesma concluso que ele. Se a RNAse foi capaz
de assumir novamente sua estrutura terciria, ela deve ser capaz de
realizar a sua funo: quebrar molculas de RNA em nucleotdeos.
Os dados obtidos pelo pesquisador sugerem que a ribonuclease que
estava no estado desenovelado se reenovelou sozinha, assumindo
sua conformao original (nativa) dotada de funo.
74 CEDERJ
MDULO 1
14
S para voc saber, isso significa que at mesmo as quatro pontes de
AULA
enxofre existentes entre as cistenas foram re-formadas!
SH
65
HS
72
72 HS 58
40
E-mercaptoetanol
58 65 Adio de uria e SH Dilise
SH
26
110 84 HS 84
26
95 95
HS HS
40 110
Ribonuclease Ribonuclease Ribonuclease nativa (N)

nativa (N) ativa desnovelada ativa
inativa (D)
Generalizando, poderamos dizer que as protenas enovelam-se

sozinhas sem a ajuda de nenhum outro fator. No experimento de Anfinsen,
nada mais havia dentro do saco de dilise a no ser a prpria ribonuclease,
o que foi suficiente para que a protena reassumisse sua conformao nativa
e funcional. Voltando ao exemplo do cadaro do sapato, seria como se o
cadaro pudesse se amarrar sozinho, sem a ajuda da mo!
Com estes experimentos bastante simples, Anfinsen chegou seguinte
concluso: a seqncia primria da protena que determina sua estrutura
terciria. Isso porque, se nada mais havia no saco de dilise alm da
ribonuclease e isso foi suficiente para ela se reenovelar, a estrutura terciria foi
determinada pelas caractersticas qumicas dos aminocidos desta protena,
ou seja, sua seqncia primria (Quadro 14.1)! Por conseqncia, qualquer
alterao na seqncia primria de uma protena pode comprometer a sua
estrutura terciria e, conseqentemente, sua funo.
Quadro 14.1: Determinao da estrutura terciria de uma protena
Seqncia primria da protena o Estrutura terciria o Protena funcional
!
So caractersticas qumicas e estruturais dos aminocidos que fazem com
que uns se aproximem ou se afastem de outros. Assim, na seqncia
primria mesmo que mora a receita para que uma protena se organize
espacialmente. Esta receita a que origina a estrutura de menor energia,
ou seja, a estrutura que ser favorecida pela natureza (voc viu esta explicao
sobre menor energia na Aula 12).
CEDERJ 75
(ou quaternrias)?
Mas, um tempo depois, se descobriu que nem sempre da maneira

como Anfinsen descreveu que o enovelamento protico acontece...
ENOVELAMENTO PROTICO ASSISTIDO
O experimento que voc viu ainda agora foi o primeiro passo

importante no estudo do enovelamento protico. De fato, diversas
protenas se comportam como a ribonuclease e se enovelam sozinhas,
especialmente in vitro (em um meio experimental).
In vivo, ou seja, dentro de uma clula, milhares de protenas
ESCHERICHIA COLI so sintetizadas a todo tempo. Em uma clula de ESCHERICHIA COLI, uma
uma espcie de protena com 100 aminocidos pode ser sintetizada e montada em 5
bactria, bastante
utilizada como segundos a 37C.
modelo experimental
A sntese de protenas determinada pela necessidade de uso
por ser de fcil
manipulao, destas molculas para os processos fisiolgicos. Estas protenas precisam,
replicao e
crescimento em portanto, ficar prontas para trabalhar imediatamente.
laboratrio.
Entretanto, algumas protenas no so capazes de se enovelar
sozinhas e precisam de uma mozinha, como o cadaro que precisa
de uma mo para amarr-lo.
Em nossas clulas, existem algumas protenas denominadas
chaperonas moleculares. A funo das chaperonas interagir com
as protenas que necessitam enovelar-se, auxiliando-as a assumir a
conformao nativa. Elas podem ser encontradas em todos os organismos,
desde bactrias at o homem.
Existem duas classes de chaperonas moleculares: as protenas de
choque trmico e as chaperoninas. Veja estas duas classes em detalhe
a seguir!
Classe 1: Protenas de choque trmico
ESTRESSE TRMICO As chaperonas desta classe so rapidamente encontradas em

o que ocorre a clulas que tenham sido submetidas a um ESTRESSE TRMICO. por isto
clulas, em cultura,
que so chamadas protenas de choque trmico.
expostas a uma
temperatura mais Alm desta funo, essas protenas de choque trmico se ligam s
elevada em relao
quela que, em regies hidrofbicas de outras protenas que ainda esto desenoveladas,
geral, elas esto
acostumadas a estar
evitando que a protena se agregue. A agregao ocorre quando protenas
e que necessitam para desenoveladas, parcialmente enoveladas ou enoveladas incorretamente
crescer.
interagem umas com as outras, formando uma espcie de aglomerado
76 CEDERJ
MDULO 1
dentro da clula (Figura 14.4). Como voc pode imaginar, este
14
aglomerado no desejvel, j que a protena que nele se encontra no
AULA
pode desempenhar sua funo. A agregao de protenas um tema muito
importante nos dias de hoje, sendo a causa de vrias doenas como a da
vaca louca e a doena de Alzheimer, por exemplo, que sero tratadas
em mais detalhes na Aula 17.
Figura 14.4: Agregao protica. Diversas cpias de uma mesma

protena recm-sintetizadas e no enoveladas corretamente
tendem a formar aglomerados no interior da clula, que
so chamados de agregados proticos. Os agregados so
indesejveis pois esto concentrando diversas cpias de
uma protena, que no est exercendo sua funo; alm
disso, os aglomerados podem atrapalhar fisicamente o bom
funcionamento da clula.
Veja, na Figura 14.5, como as chaperonas moleculares auxiliam

o enovelamento protico de algumas protenas:
Ribossomo Chaperonas se Protena Protena

sintetizando ligam a protena parcialmente enovelada
protena nascente enovelada corretamente
Chaperonas
Protenas de choque trmico livres
(chaperonas)
Figura 14.5: Atuao das chaperonas moleculares protenas de choque

trmico no enovelamento correto de uma protena. As chaperonas se
ligam a uma cadeia polipeptdica durante a sntese. Quando a seqncia
primria j foi toda sintetizada, as chaperonas induzem esta cadeia a um
estado parcialmente enovelado; em seguida, se dissociam da protena
recm-sintetizada, que assume sua conformao terciria completamente
enovelada.
CEDERJ 77
(ou quaternrias)?
No citoplasma da clula, enquanto uma protena est sendo

sintetizada associada ao ribossomo, as chaperonas se ligam cadeia
nascente. Uma vez que a sntese se completou e a protena se soltou do
ribossomo, as chaperonas a induzem a um estado parcialmente enovelado.
como se as protenas precisassem apenas de uma mozinha para
adquirir suas estruturas tercirias. Uma vez que a protena recm-
sintetizada chega a este estado parcialmente enovelado, as chaperonas se
dissociam da cadeia polipeptdica, que termina seu enovelamento sozinha,
adquirindo a sua estrutura funcional (ou seja, corretamente enovelada).
Esta mesma classe de chaperonas tambm est envolvida na
manuteno de determinadas protenas no estado desenovelado, para
que elas possam ser transportadas para o interior das organelas. Neste
processo, as chaperonas se grudam s protenas assim que elas so
liberadas dos ribossomas, mantendo-as esticadas e sem estrutura at
que elas cheguem sua organela-alvo onde, ento, se enovelam.
Classe 2: Chaperoninas
As chaperoninas (Figura 14.6) so protenas complexas que

ajudam no enovelamento das protenas que no so capazes de se
enovelar sozinhas nem com a ajuda das protenas de choque trmico.
Figura 14.6: Representao de uma chaperonina

bastante conhecida, a GroEL. Esta chaperonina
encontrada em bactrias e tem seu mecanismo de
atuao completamente descrito.
78 CEDERJ
MDULO 1
Elas funcionam como uma espcie de barril que se abre permitindo
14
a entrada do peptdeo desenovelado, fechando-se em seguida. Quando
AULA
fechada, cria um ambiente livre de gua, permitindo que os resduos de
aminocidos apolares da protena que ser enovelada se encontrem e formem
o miolo ou o cerne da estrutura da protena nativa (Figura 14.7).
Protena parcialmente
Protena recm-sintetizada, enovelada
que alcanou o estado encaminhada para
parcialmente enovelado sozinha uma chaperonina
ou com a ajuda de protenas
de choque trmico
Consumo de energia
(quebra de ATP)
Figura 14.7: Mecanismo de enovelamento protico mediado por
chaperoninas. As chaperoninas so protenas grandes e complexas,
em forma de barril, que possuem 14 subunidades idnticas associadas.
Estas protenas recebem em seu interior protenas recm-sintetizadas
que no conseguiram se enovelar. dentro da chaperonina que as
regies hidrofbicas da protena recm-sintetizada se aproximam Protena enovelada
e comeam a interagir. Isso forma o ncleo da estrutura da nova corretamente
protena, a partir do qual se reestruturam as outras partes da
protena. Esse processo tem fim quando a protena nova est
completamente enovelada.
ATIVIDADE
2
2. Como acontece?
Um cientista est diante do seguinte impasse:
Uma enzima sintetizada em seu laboratrio apresentou uma atividade
(capacidade de catalisar uma reao) muito baixa em relao enzima
in vivo. As duas enzimas foram analisadas e apresentaram exatamente a
mesma composio de aminocidos.
a. Com base no que voc estudou at agora nesta aula, qual uma possvel
explicao para a diferena de atividade entre a enzima sintetizada em
laboratrio e a in vivo?
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________________________________________________________________
________________________________________________________________
CEDERJ 79
(ou quaternrias)?
b. Quais seriam duas possveis estratgias para resolver o problema da falta

de atividade da enzima? Como o cientista poderia proceder para fazer com
que a protena sintetizada em laboratrio tivesse atividade normal? Descreva
os mecanismos bioqumicos envolvidos em cada uma delas.
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RESPOSTAS COMENTADAS
a. Voc j aprendeu que a seqncia primria que determina
a estrutura da protena e, conseqentemente, sua funo.
Considerando que a seqncia das duas protenas (a sintetizada
em laboratrio e a in vivo) exatamente a mesma, provavelmente a
falta de atividade se deve a um enovelamento incorreto da protena
sintetizada no laboratrio. Este enovelamento incorreto deve estar
relacionado ao fato de que a protena em questo no capaz
de se enovelar sozinha, precisando do auxlio de chaperonas e/ou
chaperoninas para faz-lo.
b. Se o problema de atividade derivado de um enovelamento
incorreto, duas estratgias para resolver isso podem ser sintetizar a
protena (1) na presena de chaperonas ou (2) de chaperoninas.
No primeiro caso, as chaperonas se ligam protena enquanto
ela est sendo sintetizada e auxiliam na formao de ligaes
que conferem protena um enovelamento parcial correto, que
concludo quando estas chaperonas se desligam da cadeia
polipeptdica em estruturao. No segundo, a protena recm-
sintetizada abrigada no interior da chaperonina, onde regies
hidrofbicas entram em contato e formam o ncleo da protena em
formao. A partir deste ncleo, todo o resto da protena se estrutura,
e ela adquire sua conformao nativa correta.
80 CEDERJ
MDULO 1
Na classe das chaperoninas, encontramos as protenas
14
denominadas dissulfeto isomerase. Elas ajudam a formar as pontes de
AULA
enxofre de protenas que esto se enovelando e que possuem estas pontes
na sua conformao nativa (Figura 14.8).
No caso da ribonuclease que vimos na primeira parte desta aula, h
quatro pontes de enxofre, e estas se formam sozinhas, conforme Anfinsen
nos mostrou em seus experimentos. Entretanto, nem todas as protenas so
capazes de fazer (ou refazer) as suas pontes dissulfeto como a ribonuclease.
Muitas delas precisam da protena dissulfeto isomerase para que os pares
de cistena corretos se encontrem e formem as pontes.
SS S
S
S S S S
| | |
S S S S
S
S
SS
Dissulfeto
isomerase
livre
Protena que formou A mesma protena Protena com
pontes de enxofre associada agora as pontes de
incorretas dissulfeto isomerase, enxofre formadas
que quebra pontes corretamente
incorretas
Figura 14.8: Esquema do mecanismo de ao da enzima dissulfeto isomerase.

Observe que ela capaz de desfazer as pontes de enxofre erradas ao fazer pontes
de enxofre com a protena de interesse. Desta forma, a dissulfeto isomerase deixa
livre as cistenas que devem fazer as pontes de enxofre corretas, presentes na
protena nativa.
Outra protena dentro da classe das chaperoninas a peptidil

prolil isomerase. Esta chaperonina especializou-se na converso de um
ismero (veja o boxe O que so ismeros?) da ligao peptdica da
prolina em outro; estes ismeros podem existir na forma cis ou trans.
Falando grego? Calma, voc j vai entender!
CEDERJ 81
(ou quaternrias)?
O que so ismeros?
Ismeros so molculas que possuem a mesma frmula molecular (isto , a
mesma quantidade de cada tomo que as compem), mas que apresentam
pequenas diferenas na organizao destes tomos.
Voc aprendeu na Aula 8 que os aminocidos constituintes de protenas
so sempre na forma L, lembra? Esse L vem de levgero (derivado de lado
esquerdo). Um aminocido L um estereoismero de um aminocido
D (destrgero, lado direito).
Agora, voc precisa saber o que significa isomeria cis-trans. Cis e trans
so os nomes que se do a molculas que so ismeras de acordo com
um plano de referncia. Assim, molculas cis tendem a apresentar seus
grupamentos voltados para o mesmo lado do plano e molculas trans,
grupamentos voltados para lados opostos. Voc entender melhor ainda
quando vir a Figura 14.9, que vem logo a seguir.
Os resduos de prolina (chamados de prolil) podem existir

apresentando uma pequena variao na sua estrutura. Veja a Figura 14.9:
Prolil na forma trans

Carboxila da prolina
Ao da Ligao peptdica
peptidil prolil
isomerase
Outro resduo Outro resduo de

de aminocido aminocido
Ligao peptdica
Prolil na forma cis Carboxila da prolina
Figura 14.9: Ao da peptidil prolil isomerase. Esta enzima

converte os resduos de prolil (ou seja, as prolinas que esto
compondo uma cadeia de protena e que, portanto, j fizeram
suas ligaes peptdicas) da forma cis para a forma trans, que
a forma que favorece a formao das estruturas tercirias.
Considere a linha pontilhada como eixo de referncia. Agora,
imagine se voc pudesse mantendo o eixo de referncia virar
o prolil para baixo. A carboxila que estava em cima fica para
baixo, e o oposto acontece com os carbonos (CH2 que sobem).
assim que atua a peptidil prolil isomerase.
Os resduos de prolina que esto na forma cis no favorecem a

formao da estrutura terciria da protena e precisam ser convertidos
na forma trans. Com freqncia, este o passo considerado limitante no
enovelamento de protenas.
Tal converso muito lenta, necessitando de uma ajudinha.
Assim, a prolil isomerase torna mais acelerada esta reao, permitindo que
a protena se enovele rapidamente.
82 CEDERJ
MDULO 1
14
To importante quanto complicado
o seu nome...
AULA
Existem diversas peptidil prolil
isomerases capazes de atuar em
qualquer prolil cis ligado a uma
cadeia polipeptdica. Existem tambm
enzimas destas muito especficas,
como o caso de uma presente nas
moscas, chamada NinaA.
A NinaA participa do enovelamento Fonte: www.sxc.hu/photo/462292
da protena Opsina, uma protena de
membrana dos olhos da mosca, que capaz de absorver luz e desencadear
a resposta visual. Moscas com mutaes na NinaA no so capazes de
apresentar uma resposta visual apropriada.
CONCLUSO
Quando a gente come um bife ou mesmo quando olha para as

prprias mos, onde existem milhares de protenas, nem imagina a
quantidade de processos que a clula teve que fazer para sintetiz-las e
mont-las. o funcionamento perfeito desta linha de montagem que permite
o bom funcionamento dos organismos.
ATIVIDADE FINAL
Caracterizando o enovelamento de uma protena 2
Um estudante de doutorado est tentando estudar o enovelamento de uma

protena de bactria que ele havia purificado. Veja um esquema desta protena:
Cis Cis
Cis Cis
Cis
Cis
Cis
Cis
Cis Cis
Cis
Cis
No entanto, todas as vezes que ele dialisava a protena para retirar dela os agentes
desnaturantes, ele observava que a protena agregava.
Com base no que voc aprendeu at agora nesta aula e nas informaes desta
atividade (especialmente no esquema da protena), como voc aconselharia o
CEDERJ 83
(ou quaternrias)?
estudante a evitar a agregao da protena de estudo? Qual o fundamento

cientfico da sua sugesto?
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_________________________________________________________________________
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_________________________________________________________________________
RESPOSTA COMENTADA
Se voc olhar com ateno a estrutura da protena de estudo do
doutorando, ver que esta molcula bastante rica em resduos de
cistena que podem formar vrias pontes dissulfeto. J que ele observou
que a sua protena de estudo agrega com facilidade, o estudante poderia
dialisar sua amostra (para retirar os agentes redutores) incluindo na
soluo chaperoninas do tipo dissulfeto isomerase. Por qu? Porque esta
enzima capaz de se ligar a protenas que formaram pontes dissulfeto
incorretas e que, portanto, esto enoveladas incorretamente (o que as
faria agregar). A dissulfeto isomerase corrige estas pontes erradas
e auxilia a formao de pontes de enxofre entre as cistenas corretas,
proporcionando protena um enovelamento correto.
84 CEDERJ

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11

Esperamos que, ao final desta aula, voc seja

1 identificar ligaes peptdicas;

2 descrever a formao de pontes dissulfeto;

identificar a importncia da seqncia primria

INTRODUO As protenas so os principais constituintes celulares, com grande importncia

Aprendendo mais sobre as protenas...

1 nvel: estrutura primria

A estrutura primria de uma protena , simplesmente, sua

Fonte: http://www. Fonte: http://www. Fonte: http://www. Fonte: http://www.

Formar uma protena pode ser analogicamente comparado a formar uma

O QUE E COMO SE FORMA UMA LIGAO PEPTDICA?

Para que se forme uma seqncia linear de aminocidos (a

Ento, quando acontece uma ligao peptdica entre dois

A seqncia primria de uma protena, portanto, a unio de

A presena deste enxofre na cistena serve como uma espcie de tomada,

cistena SH + HS cistena lcistena S S cistena

Figura 11.2: A formao de uma ponte de enxofre se d pela interao entre os

Arg Gli Fen Tir Tre Pro Lis Ala

Arg Gli Fen Fen Tir Tre Pro Lis Ala

De fato, a maior parte desses resduos participam da unio entre

Nas Aulas 13 e 14, voc ver como as pontes dissulfeto so

DIVERSIDADE DAS PROTENAS

As protenas possuem tamanhos variados. Existe uma protena

Mas o tamanho no o nico fator que influencia a tamanha

Compondo diferentes protenas

Este assunto to importante que merece uma seo s para

VOC SABE O QUE DETERMINA A SEQNCIA DE UMA

Falando agora sobre a ordem em que os aminocidos se unem para

Cdon de RNA UUU CUC ACC GCG GUG GAG

Cada trio de bases do RNAm representa um aminocido da

Mutao: o que e o que causa?

SEQNCIA PRIMRIA E FUNO DA PROTENA

A funo de uma protena depende de sua seqncia primria.

Bulbo olfativo (parte

Perfil anatmico de um Epitlio da cavidade nasal, Odorantes (que

Odorante reconhecido: octanal

Odorante reconhecido: heptanal

Esta nica diferena na seqncia primria foi responsvel pela

Peptdeo- Pr-pr-insulina Pr-insulina Insulina

Figura 11.4: Modificaes ps-traducionais da insulina.

Alm deste tipo de modificao (remoo de pedaos da cadeia),

O QUE SO PROTENAS HOMLOGAS?

Dizemos que protenas homlogas so aquelas que se relacionam

menos, no pode haver trocas dos aminocidos que estejam mais

Um pouco mais sobre protenas homlogas

Para entender protenas homlogas, vamos ao seguinte exemplo: nas

Mamferos Homo Sapiens, Macaco

Figura 11.5: rvore evolutiva dos eucariontes construda em funo das

A escolha da protena para usar de referencial na construo

Genmica e Protemica: definies e aplicaes

O conhecimento do genoma das espcies impe novos desafios aos

Pato nlhglfgrkt gqaegfsytd

Humano sasfepapen kcekcgqcnt

Pato sgtfgprpgn kvektaqcht

a. Analisando as seqncias dos dois grupos e levando em considerao que os

As protenas apresentam quatro possveis nveis de organizao das suas estruturas:

Ao final desta aula, voc dever ser capaz de

Fonte: http://www.sxc.hu/photo/314788 Fonte: http://www.sxc.hu/photo/258629

Mantenha esta imagem do colar na cabea: para estic-lo, necessrio que

LINUS PAULING (1901-1994)

Certamente voc j viu uma espiral como, por exemplo, o fio do

Detalhes das pontes