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Enzimas
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Enzimas
So protenas capazes de promover catlise de reaes biolgicas. Possuem alta
especificidade e grande poder cataltico.

Especificidade: o substrato sofre ao enzimtica dando somente um nico produto.


Poder cataltico: mesmo sendo protenas (que so molculas frgeis) elas realizam
reaes - em meio aquoso, em pHs biolgicos e temperaturas moderadas - que na
qumica orgnica s podem ser obtidas em condies drsticas.

Tipos de Nomenclatura
Pelo nome do substrato + ASE (nome trivial)
Exemplo: FOSFATASE hidrlise de steres de fosfato
UREASE hidrlise da uria
CELULASE hidrlise da celulose
Nomes sem qualquer relao com seus substratos
Exemplo: PEPSINA hidrlise de protenas
TRIPSINA hidrlise de protenas
CATALASE H2O2 H2O + O2
Classificao Sistemtica
(de acordo com a Comisso de Enzimas da Unio Internacional de Bioqumica)

Necessria devido ao grande nmero de enzimas descobertas.


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1. OXIDO-REDUTASES (reaes de oxido-reduo)
1.1 Agindo em CH-OH
Classificao
1.2 Agindo em C=O
Internacional das 1.3 Agindo em C=CH-
Enzimas 1.4 Agindo em CH-NH2
1.5 Agindo em CH-NH-
1.6 Agindo em NADH; NADPH
etc.
(Nome das Classes, 2. TRANSFERASE (transferncia de grupos funcionais)
Nmero de Cdigo e 2.1 Grupos de um carbono
Tipo de Reao 2.2 Grupos aldedos ou cetnicos
Catalisada) 2.3 Grupos acila
2.4 Grupos glicosila
2.7 Grupos fosfato
2.8 Grupos contendo enxofre
3. HIDROLASES (reaes de hidrlise)
3.1 steres
3.2 Ligaes glicosdicas
3.4 Ligaes peptdicas
3.5 Outras ligaes C-N
3.6 Anidridos cidos
4. LIASES (adio ou remoo de grupos a duplas ligaes)
4.1 C=C
4.2 C=O
4.3 C=N-
5. ISOMERASES (reao de isomerizao)
5.1
6. LIGASES (formao de ligaes, com desdobramento do ATP)
6.1
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Classificao Internacional das Enzimas


(Exemplos das seis principais classes)

1. Oxidorredutases - Catalisam reaes de oxidorreduo, como por exemplo:

CH3 - CH - COO + +
+ NAD CH3 - C - COO + NADH + H
OH Lactato-
O
Lactato desidrogenase
P iruvato

2. Transferases - Catalisam a transferncia de grupos contendo C-, N-, ou P-, como por
exemplo:
H2O

CH2 - CH - COO + THF CH2 - COO + THF


+ Serina hidroximetil +
OH NH3 NH3 CH2
-transferase
(THF = tetraidrofolato)
Serina Glicina

3. Hidrolases Catalisam a quebra de ligaes pela adio de gua, como por exemplo:

NH2 - C - NH2 + H2O CO 2 + 2 NH3


O Urease
Uria
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4. Liases Catalisam a quebra de ligaes C-C, C-S e certas ligaes C-N, como por
exemplo:
CH3 - C - COO CH3 - CH + CO2
P iruvato-
O O
descarboxilase
P iruvato Acetaldedo

5. Isomerases Catalisam racemizao de ismeros pticos ou geomtricos, como por


exemplo:
CH3
OOC - CH2 -C -CoA OOC - CH2 -CH2 - C -CoA
Metilmalonil-CoA-
O O
mutase
Metilmalonil-CoA Succinil-CoA

6. Ligases Catalisam a formao de ligaes entre carbono e O, S, N, acoplada


hidrlise de fosfatos de alta energia, como por exemplo:

CH3 - C - COO + CO2 OOC -CH2 - C - COO


O Piruvato-
O
carboxilase
Piruvato Oxaloacetato
ATP ADP + P i
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Exemplo:

A cada enzima dado um nmero de classificao com 4 dgitos e um nome sistemtico


que identifica a reao catalisada

E
Reao: ATP + D-glicose ADP + D-glicose-6-fosfato

Observao: ATP = adenosina tri-fosfato; ADP = adenosina di-fosfato

Nome Sistemtico: ATP:glicose fosfotransferase


Catalisa a transferncia de um grupo fosfato do ATP para a glicose.

Nmero de Classificao: EC 2.7.1.1


(2) indica o nome da classe (Transferase)
(7) indica a sub-classe (Fosfotransferase)
(1) indica a sub-subclasse (Fosfotransferase com um grupo hidroxila como aceptor)
(1) indica a D-glicose como a substncia receptora do grupo fosfato

Nome Trivial: Hexoquinase


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Cofator Inorgnico - Fe2+; Mg2+; etc...


Orgnico - molcula complexa denominada de Coenzima

Zn2+ lcool-desidrogenase
Algumas enzimas contem ou Anidrase carbnica
requerem ons metlicos Mg2+ Fosfoidrolase
Fosfotransferase
Mn2+ Arginase
Fosfotransferase
Fe2+ ou Fe3+ Citocromos
Peroxidases
Catalase
Ferrodoxina

Coenzima Componente transferido


Coenzimas e as Nicotinamida-adenina-dinucleotdeo tomos de hidrognio (eltrons)
reaes de Flavina-mononucleotdeo tomos de hidrognio (eltrons)
transferncia de grupos
Coenzima Q tomos de hidrognio (eltrons)
Tiamina-pirofosfato Aldedos
Coenzima A Grupos acila
Coenzima cobamdica Grupos alquila
Biocitina Dixido de carbono
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Stio Ativo ou stio de ligao do substrato

E
Uma reao enzimtica pode ser escrita como: S P
A enzima (E) e o substrato (S) devem se combinar de alguma forma durante a reao.

A seqncia total da reao seria: S + E ES EP E + P

Embora a enzima participe da seqncia da reao, ela no sofre nenhuma


transformao.
Apenas poucas molculas de enzima catalisam a converso de milhares de molculas
de substrato a produto.

A existncia de um complexo enzima-substrato (ES) foi deduzido pelo(a):


Alto grau de especificidade apresentado pelas enzimas (cada enzima um substrato)
Forma da curva de velocidade (v) contra substrato (s) (curva de saturao)
Fato de que os substratos, freqentemente, protegem as enzimas de inativao.
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Hipteses para o Stio Ativo


FISCHER (1894)
Modelo templete ou analogia chave-fechadura: considera que a enzima possui uma
regio chamada stio ativo, a qual complementar em tamanho, forma e natureza
qumica molcula de substrato.

KOSHLAND
Modelo de enzima flexvel ou do encaixe induzido: considera que o stio ativo no
precisa pr-existir sob forma geomtrica rgida devendo, contudo, existir um arranjo
espacial preciso e especfico dos grupos R dos aminocidos; arranjo esse que
induzido pelo contato com o substrato.

Centro Ativo ou Stio Ativo


Constitudo pelo conjunto de aminocidos que entram em contato com o substrato.
Compreende o local de fixao, que se combina com o substrato por ligaes fracas, e o
centro cataltico, que atua sobre o substrato levando-o a sofrer a reao qumica.
Nas enzimas que atuam atravs de um cofator, essa estrutura encontra-se ligada
enzima na vizinhana muito prxima do centro cataltico.
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Stio Ativo - Modelos

Modelo Chave-Fechadura Modelo Encaixe Induzido

O stio de ligao do substrato consiste de Os stios de ligao so, em grande parte,


um entalhe ou sulco na superfcie de uma pr-formados, mas sofrem mudanas
enzima, complementar ao formato do conformacionais no momento da ligao do
substrato. substrato.
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Stio Ativo - Histrico


Em 1890, para a visualizao a ligao do complexo enzima-substrato (ES), foi
proposto por Emil Fisher o modelo chave-fechadura. O stio ativo da enzima (fechadura)
seria capaz de se ligar apenas a um tipo especfico de substrato (chave). O modelo
chave-fechadura, entretanto, implica em um stio ativo rgido e inflexvel.

Atualmente se sabe que h muita flexibilidade na estrutura tridimensional de enzimas,


que leva a mudanas conformacionais no stio ativo. Um novo conceito, o encaixe
induzido, proposto por Daniel Koshland em 1958, assume alteraes pequenas mas
contnuas na estrutura do stio ativo quando o substrato a ele se liga.

De acordo com Koshland, o stio ativo na ausncia de substrato uma regio da enzima
que no to bem definida. O processo de ligao do substrato induz alteraes
conformacionais especficas na estrutura da protena, especialmente na regio do stio
ativo. A forma final e as alteraes caractersticas do stio ativo no ocorrem at o
substrato estar completamente ligado.

Anlises por cristalografia de raios-X e por espectroscopia de ressonncia magntica


nuclear (NMR), das molculas de enzima livre e dos complexos enzima-substrato,
forneceram as evidncias de que tais mudanas conformacionais ocorrem durante a
formao do complexo ES.
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Esquema de uma reao enzimtica que consiste na transferncia de um


grupo qumico do composto A para o composto B.

Em (a) est representada a enzima com o seu stio ativo, que especfico para estes
compostos
Ambos os substratos alojam-se no stio ativo, resultando alteraes na estruturas da
enzima e dos substratos (b)
A reao ocorre (c)

Os produtos C e D so liberados e a enzima retorna sua configurao original (d)


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O mecanismo de ao enzimtica

Enzimas diminuem a energia de ativao de reaes qumicas. A seqncia geral de


eventos na ao enzimtica a seguinte:

1. A superfcie do substrato (S) entra em contato com uma regio especfica da


superfcie da molcula de enzima (E) chamada de stio ativo

2. Um composto intermedirio temporrio chamado de complexo enzima-substrato


(ES) formado
3. A molcula de substrato transformada pelo rearranjo dos tomos existentes;
pela quebra da molcula de substrato; ou pela combinao com outra molcula
de substrato

4. As molculas de substrato transformadas os produtos (P) da reao so


liberadas da molcula de enzima.

5. A enzima est livre para reagir com outra molcula de substrato

Como resultado desses eventos, uma enzima conduz a reao qumica


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Unidades de enzima
Como na maior parte das preparaes enzimticas, a concentrao molar real da enzima
desconhecida, a quantidade de enzima presente expressa em termos de atividade.

A Comisso sobre enzimas da International Union of Biochemistry definiu uma Unidade


Padro, para expressar as atividades

Uma Unidade Internacional (U) = enzima necessria para catalisar a formao de


1 mol de produto por minuto, em condies definidas (*)
(*) pH, temperatura, etc.

J a [E] expressa em unidades por volume (U/mL; U/L; etc..)


Atividade Especfica = Unidades /mg de protena

Observao: quando uma enzima est sendo purificada, a atividade especfica vai aumentando
at um limite que corresponde enzima pura.

Outra unidade de atividade enzimtica

1 katal = enzima necessria para catalisar 1 mol de substrato por segundo

Logo: 1 U = 1/60 katal 16,67 n katal


6
1 katal = 60 x 10 U 1 katal = 6 x 107 U
1 U = 1,667 x 10-8 katal

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