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Transcripcin

Molde
Codificante o con sentido
Direccin
RNA intervencin en la transferencia de
la informacin

Ribosomas (Citoplasma) [ ]mRNA


[ ]rRNA ?
DNA (Ncleo)

-galactosidasa---->lactosa
Glucosa enzima
Glucosa enzima (lactosa)

Molde inestable
rRNA estable
Jacob y Monod

Mutantes defectuosos
(Se expresaban sin lactosa, etc.)

Represor (regula la [ ] de mRNA)

Operador
C
Modelo de regulacin gnica (a nivel de
la transcripcin)

Represores operadores --->mRNA

Opern: Conjunto de genes contiguos


y elementos de regulacin.

Rpida sntesis--->Rpida degradacin


Inductor------------->Sin inductor

Tamao heterogneo
Copia de una de las cadenas
C
Bacteriofago T2

RNA de T2 hibrida con DNA de T2 y se


puede asociar con ribosomas formados
antes de la infeccin

Centrifugacin diferente de rRNA y


tRNA
RNA Polimerasa

50's polinucletido fosforilasa (in vitro)


RNA sin molde (aleatoria), rNDP, no
eucariotas.
Degradacin de mRNA en bacterias
Varias polimerasas

Una sola en bacterias


-rRNA
-mRNA Rifampicina
-tRNA

Tres en eucariontes
I rRNA
II mRNA -amanitina
III tRNA y 5S rRNA (pequeos)
DNA pol Vs RNA pol

C
1000n/seg 50n/seg

10 x cel 2000 x cel

Procesativa Procesativa

10(-7 - -9) error 10 (-5) error


Estructura de RNA pol de E.coli

(2) Iniciacin, interaccin con


promotores y reguladores.
Iniciacin y elongacin
' Unin al DNA
Reconoce promotor
Desconocida

Holoenzima (todas)
Polimerasa central (sin )
C
direcciona la holoenzima--->Promotor
Distintas formas--->distintos promotores

70. Genes
N. Genes de estrs al nitrgeno
H. Genes de golpe de calor

Grupos de genes funcionalmente


relacionados.
Bacterias, Arqueas y Eucariotas
Subunidades homlogas...

no homlogo en eucariotas
Factores de transcripcin
-Dirigen hacia promotores
-Complejo de iniciacin
Polimerasas de una sola subunidad

Bacterifagos T7 y SP6
Mitocondrial
Cloroplasto
Mecanismo de la Transcripcin

Iniciacin, elongacin, terminacin

RNApol --->DNA
Unin y desplazamiento Inespecfico y
de baja afinidad

RNApol--->Promotor
Complejo promotor cerrado
Complejo promotor abierto (de-10 a -1)
N
Unin rNTP (A o G)
(Igual que DNApol)

Liberacin de . Complejo estable


Transcripcin contnua

Elongacin. Se desplaza y desenrolla


Burbuja de transcripcin (18pb)
N
C
C
Reconocimiento del promotor

Crucial en la transcripcin

Misma enzima, todos los RNA

Variaciones en el promotor responsbles


de la diferencia en la iniciacin (tasa de
transcripcin)

E.coli entre 10 seg y 30-60 min


Pribnow y Schaller

Secuencia consenso
Las bases que aparecen con mas
frecuencia en cada posicin en una
serie de secuencias con una funcin
comn.

-10 TATAAAT (caja Pribnow)


-35 TTGACA

Espaciador de 17 mas eficaz


Cuanto mas igual a consenso mas
eficaz es el promotor

Mutaciones ascendentes (+ parecida)


Mutaciones descendentes (- parecida)

Regiones -10 y -35 en contacto con la


RNA polimerasa
T
Terminacin de la transcripcin

Complejo de transcripcin estable


Liberacin del transcrito

Dependiente e independiente de factor


Terminacin independiente de factor

Secuencia de los extremos 3'

1. Segmentos con alto contenido G-C


2. Cuatro a ocho Adeninas

Enzima reduce velocidad


Da tiempo (bucle troncal)
Debilitamiento del complejo
AAAA debilita aun mas
Disociacin
C
Terminacin dependiente de factor

Protena (rho)
Homohexamero
DNA-RNA helicasa
se une cerca del extremo 3'
Se desplaza hacia el extremo por el
transcrito
La actividad de helicasa lo separa del
molde.
Libera el transcrito

Polimerasa hace pausa en lugares de


terminacin dependientes de
C
Transcripcin en eucariontes

Qu se transcribe?
Cromatina
No factor

Si factores de transcripcin
Protenas especializadas para la
transcripcin del gen
Factores de transcripcin

TF --> Transcription factor


I, II, II --> Segn la Polimerasa
A, B, C...

mRNAs
Eucariontes monocistrnicos
Procariontes policistronicos

Cistrn: unidad mnima de DNA para


codificar, sin 5' y 3' UTR y reguladores
RNA pol I (rRNA)

Pequea 18S
Grande 28S, 5.8S y 5S

14 subunidades
2 factores de transcripcin (UBF1 y
SL1)

Nucleolo--> se ensambla ribosoma


C
Copias mltiples del pre-rRNA 45S

+ Protenas + 5S = Ribosoma--> Citosol


RNA pol III (RNA pequeos)

17 subunidades
Transcripcin regulada por secuencias
dentro de la regin transcrita

tRNA
rRNA 5S
Genes diseminados no en tandem
TFIIIB
TFIIIC
TFIIIA (9 dedos de zinc, surco mayor)

rRNA 5S (limita la produccin de l)

TFs dependientes de la interaccin con


el DNA (Dominios de unin a DNA)
RNA pol II

Genes estructurales--> Protenas


12 subunidades

Expresin especfica de tejido o etapa


de desarrollo
Inr Regin iniciadora

YYAN(TA)YY N: cualquiera
Y: Pir
Homlogo de Pribnow--> TATA
-20 y -30 TATAAAA

Sitios de unin a factores de


transcripcin y protenas reguladoras.
Regiones potenciadoras centenares o
miles de pb antes
Complejo mnimo de preiniciacin
TFII
TBP (Protena de unin a TATA)
D
TAF (Factores asociados de union a TATA)
A
B
F RNA Pol II
E
H
C
Fosforilacin de CTD de la subunidad
mas grande de la Pol II

YSPTSPS
Serinas --P

TFIIB cerrado > abierto


TBP dobla DNA 90
C-TFIIB
N-TFIIB --> RNA Pol II

Ligador B abre (elemento de TFIIIB)

Crecimiento de la cadena (mas de 7nt)


libera a TFIIB
C

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