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Anatomie fonctionnelle

Docteur Latifa Berrezouga

Professeur en Microbiologie-
Immunologie Mdicale

Clinicienne au service dodontologie


conservatrice-endodontie
E-mail: lberrezouga@yahoo.com
Objectifs

Quest -ce quune bactrie ?


Comment la voir ?
Quelles sont les structures qui la composent ?
Quelle est lintrt mdical de connatre la
morphologie bactrienne ?
Quelques dates:

- 1673: Antoni Van Leeuwenhoek


dcrit dans la salive de
Trs nombreux animalcules.....autant d'habitants que sur
la plante"

Microscope

http://www.ucmp.berkeley.edu/history/leeuwenhoek.html
1857. Louis Pasteur, rle des bactries dans
Le processus de fermentation de lacide lactique

1877: Robert Koch, dcouverte de Bacillus anthracis


(responsable du charbon)
Mycobacterium tuberculosis (tuberculose)

1884: Christian Gram, coloration de Gram

1890 : W. D. Miller in his book "The


microorganisms of the human mouth"
http://bacterioweb.univ-fcomte.fr/fcours.html
Dfinition-Nomenclature
Domaine Ex: Bacteria
Rgne Procaryotae
Phylum
Classe Schizomyctes
Ordre Micrococcales
Famille Micrococcacea
Genre Staphylococcus
Espce S. aureus
Classification des bactries TAXONOMIE
Bactries classes en Taxons (groupes)
Espce: regroupe des organismes qui ont plusieurs
Caractres communs
Souche: est la sous-division dune espce
Clone: une population qui descend dune mme souche

Htpp://www.homd.org/
Ecrire le nom dune bactrie en Latin et en Italique

Majuscule
Nom du Genre Nom de lespce

Abrviation: S.aureus, S. mutans

Streptococcus mutans
Caractristiques Eucaryote Procaryote
Taille habituelle 0.3 2.5 M 2 20 M
Noyau avec membrane --- +
Nombre de chromosomes 1 >1

Rplication par mitose --- +


Position de lADN Nuclode ou plasmides Noyau et certains organites
intracellulaires
Prsence dorganites Aucun Habituellement prsents
intracellulaires (mitochondries, appareil de
golgi

Membrane contenant des Aucune Souvent prsents


strols
Enveloppes cellulaires Htropolymre glucido- Cellulose et autres
peptidique polysaccharides, seulement
dans les plantes

Flagelles et cils Pas de cils Agencement typique


http://www.microbe-edu.org/glossaire/glossaire.html
Observation microscopique
Microscopie optique
Etat frais, colorations
Amliorations des performances
Fond noir, contraste de phase
Microscopie lectronique
Fractionnement et analyse des composants
bactriens
Grossissement maximum = 1000/1-1500/1
rsolution = 0,2 m
Lexamen au microscope optique se fait
partir dun prlvement biologique: exemples

opus dabcs
oLiquide articulaire (infect)
oLiquide cphalorachidien (lors dune mningite)
oSang infect (bactrimie, septicmie)

partir dune culture bactrienne


tat frais

Une goutte dun prlvement biologique


entre lame et lamelle
Permet de voir
-Morphologie des bactries
-Mobilit des bactries
-Prsence de cellules: PNN, GR
Coloration de Gram

1: Cristal Violet ou Violet de Gentiane; 2: Lugol; 3: Alcool ou


iode actone; 4: Fushine
Prlvement biologique
Fix sur une lame: Frottis
-Forme de la bactrie
-Coloration: Gram+, Gram-
-Prsence de cellules

Coloration de
Gram-Weigert
2 grandes catgories
de bactries

Gram positifs Gram ngatifs


Cocci Gram positif
Groups en amas

Ex: S. aureus Cocci Gram positif


Groups en chainettes

Ex: Streptocoque du groupe A


bacilles Gram ngatif
Groups en amas

Ex: Porphyromonas gingivalis

Ex:Treponema pallidum

bacilles Gram ngatif


Sous forme de spires
Familles des mycobacteriaceae (tuberculose)
Richesse en lipides (acides mycoliques)
Coloration de Zhiel-Neelsen
BAAR: Bacilles Acido-Alcoolo-Rsisistant
Classe des mollicutes (mycoplasmes)
Pas de peptidoglycane
Famille des spirochetaceae
Structure complexe
Bleu de Mthylne
Giemsa
Imprgnation argentique
Grossissement: 100 000/1
Rsolution: 1 nm
Les bactries en microscopie
lectronique

Virus

Transmission

Balayage Bactrie
M E balayage

Grossissement: X >10.000 fois


Bacilles spirals Forme en epi de mas
Chromatographie

Ultracentrifugation
Detector

TOF-
MS

Spectrographie de masse
Electrophorse
Dimensions et formes des bactries
Ultrastructure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
autres
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Dimensions
Visible lil nu

Invisible lil nu
Grappes

Chanettes
Coques

Bacilles

Spirochtes
Cocci Bacille Spirille

Spirochte

Hyphe
Tige

Filaments
Diplocoque
Ex: Streptococcus pneumoniae

Chaines de cocci
Ex: Streptococcus mutans

Packet
Ex: Streptococcus pyogenes
Grappe
Ex: staphylococcus aureus
Dimensions et formes des bactries
Ultrastructure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
Autres structures extracellulaires
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Cytoplasme

Chromosome

Capsule
Paroi

Membrane plasmique

Ribosomes

Pili
Flagelle
Paroi dcole du reste de la cellule chez un E. coli
trait par des antibiotiques
Paroi des Gram positif: ultrastructure

Deux couches dont


lune dense et epaisse
Paroi des Gram ngatif: ultrastructure

Trilamellaire
Anatomie et ultra-structure
Dimensions et formes des bactries
Ultra-structure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
autres
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Gram Positifs Gram Ngatifs

Bilamellaire Trilamellaire
Peptidoglycane 90% Peptidoglycane 10%
Acides techoques Phospholipides
Protenes Lipo-polysacharides
Enzymes Proteines
Enzymes
Structure schmatique de la paroi des
Gram positifs

Acide lipoteichoque
Acide teichoque
Peptidoglycane

Membrane cytoplasmique
Liaison osidique
CH 3

CH 2-OH H NH C O
H O H
H O OH H
O H
H
H
O
O
NAG ---NAM
H NH C O
CH 2OH

O CH 3

Liaison ester H3C CH C O

NH
L-Alanine
CH 3 C H
Liaisons peptidiques
C O

NH
H C CH 2 CH 2 C O Acide D-Glutamique

COOH

Peptidoglycane: NH

unit structurale H C (CH 2)


3
CH COOH
Acide meso-Diaminopimelique
C O NH 2

NH

C D-Alanine
H CH 3

C O
. Composition : La chane
polysaccharidique est forme de
chanons N-Actyl Glucosamine - Acide
N-Actyl Muramique.
Les chanes peptidiques formes au
minimum de quatre aminoacides (par
exemple L-Alanine - D-Glycine - L-
Lysine - D-Alanine)
sont toujours fixes sur l'acide
muramique. L'enchanement des
aminoacides des sries D et L est une
constante.
Ces ttrapeptides sont relis
directement entre eux ou par une
courte chane peptidique (chane
interpeptidique).
Paroi des Gram ngatifs : structure schmatique
Membrane externe: paroi
Porines: canaux pour le transport de
substances de bas poids molculaire
Lipopolysaccharides
LPS Porine

Membrane
externe

lipoprotine
Espace
Peptidoglycane Pri plasmique

Membrane
cytoplasmique
Espace periplasmique
Entre la membrane cytoplasmique et la paroi
Enzymes hydrolytiques
Enzymes inactivant les antibiotiques: B-lactamases
Protines de transport
Lipopolysaccharides
Porine

Membrane
externe

lipoprotine
Espace
Peptidoglycane Pri plasmique
Membrane
cytoplasmique
Lipopolysaccharide (endotoxine) des Gram ngatifs

Chaine O
Spcificit antignique Partie externe

Core
Antignicit Polysaccharidique
Partie interne

Toxicit
Lipide A
Morphologie
Protection de la cellule
Pression osmotique (sphroplastes)
Temprature, pH, radiations
Interface avec lextrieur
Porines
Espace periplasmique et -lactamases
Cibles de certains antibiotiques
Protines liant les pnicillines (PLP)
Anatomie et ultra-structure
Dimensions et formes des bactries
Ultra-structure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
Capsules et formations extracellulaire
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Cytoplasme

Capsule

Paroi

Ribosomes

Pili
Flagelle
Flagelles: structure

Longs filaments (6 20
m) fins et flexueux
Flagelline
Responsable de la
mobilit
phnomne nergtique
Trs antigniques
variations antigniques
Polaire monotriche Polaires lophotriches Pritriches

Mobilit unidirectionelle, rapide Mobilit pluridirectionelle, lente


Monotrichous
Lophotrichous

Amphitrichous
Peritrichous
Filaments rigides
Constitus de piline
(proteine)
Antigniques
Pili communs
Nombreux, courts
Impliqus dans ladhrence
Pili sexuels
Peu nombreux, plus longs
Impliqus dans la
conjugaison
Anatomie et ultra-structure
Dimensions et formes des bactries
Ultra-structure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
Capsules et formations extracellulaire
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Polysaccharidique acide: sucres glucuroniques et
phosphors
Antiphagocytaire: rle pathogne (facteur de
virulence)
Antignique: srotypes (antignes solubles), vaccin
anti Streptococcus pneumoniae ou anti Haemophilus
influanzae)
Facultative
Mise en vidence: coloration par lencre de chine,
nigrosine, coloration de Gram
Capsule dun Cryptocoque

Streptococcus pneumoniae
ou Pneumocoque
Pneumonie
Mningite
septicmie
Souche capsules
(virulente)

Polysaccharidique
Antiphagocytaire
Antignique (80 Souche acapsule
srotypes, vaccin) (non virulente)

Facultative
Glycocalyx : (Slime layer)

Rseau polysaccharidique lche ou polymres


entourant la bactrie
Bactries vivant en biofilm (ex. Streptocococcus
mutans
Attachement des bactries aux cellules, surfaces
dentaires, prothses, cathters
Protection contre la dssication
Rsistance aux antiseptiques, dsinfectants
antibiotiques
ADHESION DES
BACTERIES A UN SUPPORT
INERTE (cathter)
Proteique
Trs antignique
Responsable de la
virulence avec la
toxine
Antiphagocytaire
Anatomie et ultra-structure
Dimensions et formes des bactries
Ultra-structure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
Capsules et formations extracellulaire
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Bicouche
phospholipidique
Nombreuses protines
transmembranaires
Permases, enzymes
respiratoires,
Rles
Mtabolisme
respiratoire
Echanges
Dtruite par les
antibiotiques et les
antiseptiques
Anatomie et ultra-structure
Dimensions et formes des bactries
Ultra-structure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
Capsules et formations extracellulaire
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Cytoplasme

Noyau
Capsule
Cytoplasme

Ribosomes

ribosomes
form dADN (80 %), dARN et de proteines

Chromosome unique

ADN bicatnaire, circulaire, surenroul


Bicatnaire, circulaire
1 % de la taille du
chromosome
Prsence de plasmides
facultative
Plusieurs copies dun mme
plasmide ou plusieurs
plasmides diffrents
Diffrents de ceux des 30 S
eucaryotes (70S au lieu de
80S)
Sous unit 30S
ARNr 16S (trs
conservtaxonomie
molculaire)
21 polypeptides
Sous unit 50S 50 S
ARNr 23S
ARNr 5S
31 polypeptides
Anatomie et ultra-structure
Dimensions et formes des bactries
Ultra-structure densemble
La paroi
Structure: Gram +, Gram
rles
Les structures externes
Flagelles
Pili
Capsules et formations extracellulaire
La membrane cytoplasmique
Structures internes
Formes cellulaires diffrencies
Processus dadaptation aux
environnements hostiles
Rsistance
Mtabolisme modifi conomie Spore terminale
Rversible quand lenvironnement de Clostridium
redevient favorable
Botulisme: spores de Clostridium
botulinum dans les conserves
Ttanos: spores de Clostridium
tetani dans le sol aprs souillure
dune plaie
Spore centrale
Conclusion
la coloration de Gram
la morphologie
la mobilit
la capacit sporuler
la temprature de croissance
les besoins nutritionnels
le mode respiratoire
la capacit de photosynthse
lutilisation des diffrentes sources de carbone ou dazote
le G+C% du gnome.

Classification des bactries


Conclusion
Biochimiques : biotypes ou biovars)
Antigniques : srotypes ou srovars)
Pathogniques : pathotypes ou pathovars)
Enzymatiques : zymotypes ou zymovars)
de Sensibilit aux Antibiotiques : antibiotypes)
de Sensibilit aux Bactriophages : lysotypes ou lysovars)
Molculaires : identification de lADN par ribotypie,
Hybridation ADN-ADN, hybridation ADN-ARN,
Squenage de lARN ribosomique, etc

Classification des bactries


Conclusion

SI VOUS AVEZ DES QUESTIONS ?

SI VOUS VOULEZ FAIRE DE LA RECHERCHE


EN MEDECINE DENTAIRE ?

MERCI