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Traduccin:Sntesisyprocesamientodeprotenas
Cdigo gentico Sntesis ribosomal de protenas
El proceso general: adaptadores iniciacin
Caractersticas del cdigo elongacin
terminacin
tRNA y aa-tRNA-sintetasas regulacin
Estructura de tRNAs
aa-tRNA sintetasas: mecanismo y Procesamiento post-traduccional
tipos Plegamiento
Interaccin codn-anticodn: Modificaciones covalentes
Hiptesis del balanceo
Distribucin de protenas a orgnulos.
Descodificacin:adaptadortRNA
Descodificacin:adaptadortRNA
Papeles del RNA
mRNA
Enrique Castro, 2003
rRNA
tRNA
Seales de control
Codones inicio
Codones stop
ventajas de la degeneracin
resistencia a mutaciones
independencia secuencia/composicin
2011 Enrique Castro 3
Marcosdelectura
Marcosdelectura
Mutaciones de
cambio del marco de lectura
Variacionesdelcdigomitocondrial
Variacionesdelcdigomitocondrial
Latraduccinesunadescodificacinbifsica
Latraduccinesunadescodificacinbifsica
Reconocimiento del tRNA
Formacin del aminoacil-tRNA
Aminoacil-tRNA sintetasas
Enrique Castro, 2003
Balanceo:apareamientosexticosen3base
Balanceo:apareamientosexticosen3base
activacin aa
Enlace anhdrido
Correcin Todos
Varios
hidrlisis mal-esterificado Uno
AminoaciltRNAsintetasas:activacinyunin
AminoaciltRNAsintetasas:activacinyunin
EachtRNAmoleculeis
recognizedbyaspecific
aminoacyltRNAsynthetase
Figure429
2011 Enrique Castro 12
Traduccin:Sntesisyprocesamientodeprotenas
Traduccin:Sntesisyprocesamientodeprotenas
Cdigo gentico Sntesis ribosomal de protenas
El proceso general: adaptadores iniciacin
Caractersticas del cdigo elongacin
terminacin
tRNA y aa-tRNA-sintetasas regulacin
Estructura de tRNAs
aa-tRNA sintetasas: mecanismo y tipos Procesamiento post-traduccional
Interaccin codn-anticodn: Hiptesis del Plegamiento
balanceo Modificaciones covalentes
Distribucin de protenas a orgnulos.
Estructura de los ribosomas
Recambio y degradacin
Papel del rRNA
Ubiquitinacin y proteasoma
Tipos y mecanismos generales Lisosomas
Ribosomestructureinprokaryotes&eukaryotes
Ribosomestructureinprokaryotes&eukaryotes
Proteina
pequea L19(50S)
estructurales
rRNA16S(30S)
ImagereconstructionofanE.coliribosome
ImagereconstructionofanE.coliribosome
Figure434
Traduccin:Sntesisyprocesamientodeprotenas
Traduccin:Sntesisyprocesamientodeprotenas
Cdigo gentico
Sntesis ribosomal de protenas
El proceso general: adaptadores
Caractersticas
iniciacin
Enrique Castro, 2003 del cdigo
elongacin
tRNA y aa-tRNA-sintetasas
terminacin
Estructura de tRNAs
regulacin
aa-tRNA sintetasas: mecanismo y tipos
Interaccin codn-anticodn: Hiptesis del
balanceo Procesamiento post-traduccional
Plegamiento
Estructura de los ribosomas Modificaciones covalentes
Papel del rRNA Distribucin de protenas a orgnulos.
Tipos y mecanismos generales
Recambio y degradacin
Ubiquitinacin y proteasoma
Lisosomas
Shine-Dalgarno
GDP + Pi
Factoresdeiniciacin
Factoresdeiniciacin
EntradadelaatRNA:funcindeEFTu/EFTs
EntradadelaatRNA:funcindeEFTu/EFTs
Translocacin:papeldeEFG
Translocacin:papeldeEFG
Antibioticos(1)
Antibioticos(1)
H3C CH3
Cicloheximida
H C CH3
3
N
H C CH3 N
CH3 3
Procariotas, 50S N
N OH
O
HO CH N
CH3 2 O N
H C
3
OH H H
HO
O O CH3
H H
HO
NH OH
H3C CH3
C O
H2C CH3
O
O O CH3 H N C H
CH3 2
H3C
CH2
O O
OH
Inhibe peptidil-transferasa Terminacin prematura:
CH3 reemplaza a aa-tRNA
2011 Enrique Castro 27
O
Eritromicina CH3
Puromicina
Factoresdeiniciacin
Factoresdeiniciacin
Reclutamiento de 60S:
GTPasa eIF5B
2011 Enrique Castro 29
FormacindelPIC43S
FormacindelPIC43S
recycled
Ayuno/hambre
Estrs
Virus
2011 Enrique Castro 30
ReconocimientodelmRNA
ReconocimientodelmRNA
Nutrientes
Insulina Actividad helicasa eIF4A/eIF4B
elimina Est. secundaria 5'UTR
avance 50-100 nt
eIF4F =
eIF4E (unin 5'Cap)
eIF4A (helicasa)
eIF4G (andamio)
mRNA circularizado
(iF4E-5' / PAB-3')
Regulacin
eIF4-BP inactivado por fosforilacin (mTOR)
eIF4E activado por fosforilacin (MNK1)
DelPIC48Salcomplejodeelongacin80S
DelPIC48Salcomplejodeelongacin80S
Terminacin
nico eRF1 reconocimiento de codn
(=RF1+RF2). GTPasa.
eRF3: unin a eIF4G (circularizacin)
eRF3 (disociacin)
ToxinasinhibidorasdeTrad.eucariota
ToxinasinhibidorasdeTrad.eucariota
A (cataltico) B (transporte)
ADPribosilacin de EF2
Bloqueo de translocacin
(eucariotas)
Cicloheximida
Inhibicin peptidil- tranferasa
Ricina
Despurinacin A en 23 S
(cataltica)
Inactivacin de 60S
Plegamientoasistido
Plegamientoasistido
Chaperonas HSP70 ubicuo (citosol/RE)
unen zonas hidrofbicas HSP 90 (citoslico)
Enrique Castro, 2003
evitan agregacin/plegamiento
prematuro
Chaperoninas
Complejo con cavidad de plegado
Dependiente de ATP
Enzimas auxiliares
Proteina-disulfuro-isomerasa (PDI) (exclusivo ER)
Proteina-prolil-isomerasa (PPI)
Procesamiento ER/Golgi
Eliminacin Secuencia seal
Glucosilacin (N-, O-) Unin de cofactores
Insercin en membrana Enzimas
Puentes disulfuro
Proteolisis/maduracin Modificaciones funcionales
Fosforilacin constitutiva (casena)
Hidroxilacin Pro, Lys (colgeno, desmosinas)
Metilacin Lys, Glu
-carboxilacin Glu (F. coagulacin)
Distribucindeprotenassintetizadas
Distribucindeprotenassintetizadas
Ruta Ruta
citoslica secretora
2011 Enrique Castro 38
PapeldelRE/Golgienlasntesisdeprotenas
PapeldelRE/Golgienlasntesisdeprotenas
Plegamiento
plegamiento inducido por chaperonas
formacin de puentes disulfuro
Insercin en membrana
todas las transmembrana
Glucosilacin
ER: N-glucosilacin estndar
Golgi: O-glucosilacin, especfica
Maduracin proteoltica
Golgi y grnulos de secrecin
Secuenciaseal:DestinoRE
Secuenciaseal:DestinoRE
peptidasa
de seal
SRP-R
Reconocimiento SRP
GTPasa. GTP hidrolizado
Translocn
Une secuencia seal (N)
Transferencia ATP-dependiente
2011 Enrique Castro 41
Insercindeprotenasdemembrana
Insercindeprotenasdemembrana
Seales topognicas
secuencia seal N-terminal
Enrique Castro, 2003
secuencia seal interna
secuencia de parada de
transferencia
(anclada a
membrana)
(luminal)
Asistentes de plegado
chaperonas: HSP, calnexina, calreticulina
(retencin en ER)
Protena-disulfuro isomerasa
Prolil-isomerasa (cis/trans)
Control de calidad:
Slo protenas plegadas correctamente
abandonan el ER
Glicosilacinestndard
Glicosilacinestndard
Oligosacrido estereotipado
Construido ntegramente sobre Dolicol-P
Tranferido ntegro sobre N-Asn
Enrique Castro, 2003
Bloqueable por tunicamicina
-N-X-S/T-
Proalbmina
en el Golgi Albmina
en grnulos
de secrecin
Insulina
circulante
2011 Enrique Castro 45
Traduccin:Sntesisyprocesamientodeprotenas
Traduccin:Sntesisyprocesamientodeprotenas
Cdigo gentico Sntesis ribosomal de protenas
El proceso general: adaptadores iniciacin
Caractersticas
Enrique Castro, 2003 del cdigo elongacin
terminacin
tRNA y aa-tRNA-sintetasas regulacin
Estructura de tRNAs
aa-tRNA sintetasas: mecanismo y tipos Procesamiento post-traduccional
Interaccin codn-anticodn: Hiptesis del Plegamiento
balanceo Modificaciones covalentes
Distribucin de protenas a orgnulos.
Estructura de los ribosomas
Papel del rRNA
Tipos y mecanismos generales Recambio y degradacin
Ubiquitinacin y proteasoma
Lisosomas
Citoslico
sustratos:
Ubiquitina/proteasoma
Dependiente de ATP Protenas T1/2 corto (seales)
Regulado por seales en sustratos Protenas defectuosas
Lisosomal
sustratos:
Hidrolasas lisosomales (acdicas)
Protenas T1/2 largo
Independiente de ATP
Muerte por necrosis Protenas de membrana
Protenas extracelulares
Ca2+-proteasas
Citoslico sustratos:
Muerte por necrosis inespecfico
Recambioreguladodeprotenas:ubiquitina
Recambioreguladodeprotenas:ubiquitina
poli-Ubiquitinacin:
Ub-COOH --> N-Lys-Ub
E3:
Transferencia al sustrato E2:
Determinante de especificidad reserva de Ub activada
de sustrato Donador de Ub
2011 Enrique Castro
(reconocimiento de seales) 49
Sealesdeubiquitinacin:especificidadE3
Sealesdeubiquitinacin:especificidadE3
N-Terminal
mecanismo bsico (procariotas)
D-box
ciclinas
KEN-box
Securinas
Secuencias PEST
F. transcripcin hometicos
Enzimas metablicas
Protenas de sealizacin
Seales ledas por E3
(especificidad de unin)
Dao molecular
Oxidacin/desplegado
2011 Enrique Castro 50
Proteasoma26S:degradadordeprotenas
Proteasoma26S:degradadordeprotenas
19S:
Complejo 26S: impide acceso inespecfico
Barril 20S: cataltico Unin poli-Ub
Tapa 19S: reguladora Isopeptidasa (liberacin Ub)
ATPasa: transferencia a cavidad
20S:
Centro activo interno
(N-terminal de beta)
Procesiva, intermedios no
liberados
Producto:pptidos 7-9
nucleofilo interno:
previene ataque inespecfico
2011 Enrique Castro 51