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CURSO:

MODELOS DE NICHOS ECOLGICOS

Miguel Laurente
Especialista Forestal
PARTICIPANTES

Nombres?
Carrera o profesin?
Cual es tu inters en este taller?
Cual es su experiencia en SIG?
Conoces de Modelos de Nicho Ecolgico?
PROGRAMA
Jueves (16 Feb)
Introduccin a los modelos de nicho ecolgico
Aplicaciones de los modelos de distribucin
Conceptos bsicos de SIG
Introduccin ArcGis

Viernes (9 Set)
Preparacin de registros de presencia
Preparacin de variables ambientales
Modificacin de Resolucin y Extensin
Introduccin practica a R
Correlacin de variables y seleccin de variables

Sbado (9 Set)
Modelamiento de distribucin Especies
Evaluacin del modelo
Umbral de corte
Desarrollo del casos prctico
Presentacin de los casos prcticos
INTRODUCCIN A LOS MODELOS DE NICHO ECOLOGICO

QU ES LA DISTRIBUCIN DE UNA ESPECIE?


Un rea de distribucin es la superficie geogrfica ocupada por un taxn, con la que
interacta de manera no efmera (Espinosa et al., 2001).
Patrn de decrecimiento en abundancia desde el centro del rea (Brown & Gibson, 1983).

Tradicionalmente, la distribucin de las especies se ha representado de manera cartogrfica a partir de los


puntos georreferenciados sobre mapas
HBITAT?
Son los recursos y las condiciones presentes en un rea que
propician su ocupacin e influyen en la supervivencia y
reproduccin de un organismo dado. Capacidad del
ambiente de proveer las condiciones apropiadas para la Espacio ecolgico
persistencia de individuos y poblaciones (Hall et al.,
1997).

NICHO ECOLGICO

Hutchinson (1957), es un hipervolumen en un espacio


ecolgico multidimensional, determinado por los
requerimientos de la especie para reproducirse y
sobrevivir.
Hutchinson (1957)

Nicho fundamental es el rango de condiciones ambientales en las que en


teora puede vivir una especie.

Nicho realizado se define por la combinacin de


interacciones negativas, como competencia y
depredacin, que restringen la presencia de una
especie y de interacciones positivas, como
facilitacin, que amplan los rangos ambientales en
los que la especie puede crecer. H

T
Disciplinas emergentes como la Informtica de la Biodiversidad, han impulsado el desarrollo
nuevos enfoques metodolgicos como el caso de modelado de los nichos ecolgicos.
QUE ES UN MODELO?

Descripcin simplificada de un sistema fsico real, en la que aparecen algunas de sus propiedades (Joly
1988).

Los objetivos de un modelo son:


Ofrecer una versin manejable del sistema
Facilitar la comprensin de la estructura del
sistema
Generar y testar hiptesis
Explorar escenarios alternativos
Prediccin a corto plazo
Apoyo a la toma de decisiones
MODELO DE NICHO ECOLOGICO
MODELOS DE NICHO MODELO DE DISTRIBUCIN
=
ECOLOGICO DE ESPECIES

Los MDE son representaciones cartogrficas de la


idoneidad de un espacio para la presencia de una
especie en funcin de las variables.

Las principales limitaciones son:

Hiptesis de pseudo equilibrio y representatividad


Relaciones biticas
Dificultad de hacer modelos fiables para especies
generalistas.
PROCESO DE MODELADO

PRESENCIA Para el Modelo (70%) Para el Test (30%)

VARIABLES ACTUALES VARIABLES FUTURAS

climaticas climaticas

Topogrficas Topogrficas
VARIABLES
Temticas Temticas

ALGORITMOS MAXENT

CURVA ROC
EVALUACIN
DEL MODELO
UMBRAL DE
CORTE
ANLISIS MODELO DE MODELOS DE
DISTRIBUCIN DISTRIBUCIN
POTENCIAL ACTUAL POTENCIAL FUTURA

APLICACIN EFECTOS DEL CAMBIO CLIMTICO


PROCESO DE MODELADO
Tamao de muestra
PRESENCIA Para el Modelo (70%) Para el Test (30%) Sesgo de los datos
Precisin de la georreferenciacin
VARIABLES ACTUALES VARIABLES FUTURAS

climaticas climaticas

Topogrficas Topogrficas
VARIABLES
Temticas Temticas

ALGORITMOS MAXENT

EVALUACIN CURVA ROC


DEL MODELO
UMBRAL DE
CORTE
ANLISIS MODELO DE MODELOS DE
DISTRIBUCIN DISTRIBUCIN
POTENCIAL ACTUAL POTENCIAL FUTURA

APLICACIN EFECTOS DEL CAMBIO CLIMTICO


UN REGISTRO DE PRESENCIA
Es una localidad en donde se ha registrado a la especie de inters
Debera contener, al menos:
Una coordenada X
Una coordenada Y
nombre de especie

Otros datos interesantes serian:


Precisin de las coordenadas
Fecha de recoleccin
Y cualquier otro dato esencial para el
trabajo en curso

Ventajas

Ventajas Alta disponibilidad Probabilidad de Fcil generarlas Fcil generarlas


presencia

Desventajas No determina Falsa ausencia No son ausencias No para todos los


Probabilidad de reales mtodos
presencia
CONDICIONES IMPORTANTES DE LA ESPECIE

1. La especie debe estar en un estado de equilibrio con su ambiente; es decir, la


competencia y depredacin restringen los rangos ambientales, y no las limitaciones de
dispersin.
2. Las variables ambientales disponibles (como las variables climticas) usadas en la
modelacin son factores abiticos determinantes de la distribucin natural de la
especie.
3. No se deben incluir datos de presencia de especmenes cultivados en plantaciones,
colecciones en campo y jardines botnicos que estn ubicados en un ambiente por
fuera del nicho realizado de la especie.
TAMANO DE MUESTRA

Los MDE son sensibles al tamao de muestra


Pero el tamao de muestra apropiado depende de:
Algoritmo
Extensin del rea de distribucin de la especie
Especificidad ecolgica de la especie modelada

Performancia de MDE (Wisz et al 2008, Diversity


and Distributions)
SESGO
El muestreo debe hacerse a lo largo de todos los rangos ecolgicos significativos para la especie
Un esfuerzo de muestro insuficiente (solo cerca de carreteras) o mal dirigido (obviando gradientes
importantes) desemboca en un SESGO
Efecto negativo directo en MDE, porque se modelan simultneamente la distribucin de la especie y el
esfuerzo de muestreo, condicionando el resultado

PRECISIN DE LA GEORREFERENCIACIN
Es muy variable, segn la fuente (GBIF, desde metros hasta decenas de miles de metros)
Debe ser acorde a la resolucin de las variables ambientales usadas como predictores
FUENTES DE REGISTROS DE PRESENCIA
Colecciones GBIF
Mapas de vegetacin
Muestreo en campo con GPS
Planes de conservacin y recuperacin de especies amenazadas
Atlas de flora y fauna
Cada fuente es til para objetivos distintos, en funcin de la resolucin, extensin geogrfica y cantidad de
los datos

MaxEnt
FORMATOS extension .csv
Las distintas fuentes proporcionan los datos en distintos separado por coma
formatos
Estructura informtica del fichero
Estructura de los datos que contiene el fichero
Y los programas de modelado requieren que las
presencias estn formateadas de determinada manera.
PROCESO DE MODELADO

PRESENCIA Para el Modelo (70%) Para el Test (30%)

VARIABLES ACTUALES VARIABLES FUTURAS


Resolucin espacial
climaticas climaticas
Disponibilidad
VARIABLES Topogrficas Topogrficas Seleccin
Colinealidad
Temticas Temticas
Interaccin

ALGORITMOS MAXENT

EVALUACIN CURVA ROC


DEL MODELO
UMBRAL DE
CORTE
ANLISIS MODELO DE MODELOS DE
DISTRIBUCIN DISTRIBUCIN
POTENCIAL ACTUAL POTENCIAL FUTURA

APLICACIN EFECTOS DEL CAMBIO CLIMTICO


VARIABLES AMBIENTALES

Deben tener dos caractersticas:


Afectar directa o indirectamente a la distribucin de la especie
Se pueden representar como mapas digitales en un SIG
Resolucin espacial acorde a datos de presencia
Jerarqua de influencia (clima vs. topografa y usos del suelo segn escala)
Baja colinealidad

Topogrficas (elev) Climticas (T) Temticas (Suelo)


PROCESO DE MODELADO

PRESENCIA Para el Modelo (70%) Para el Test (30%)

VARIABLES ACTUALES VARIABLES FUTURAS

climaticas climaticas

Topogrficas Topogrficas
VARIABLES
Temticas Temticas
Gran diversidad de mtodos, que
requieren distintos tipos de datos
MAXENT
Envueltas bioclimticas
ALGORITMOS
Modelos de similaridad ecolgica
Mtodos de regresin
CURVA ROC
EVALUACIN Mtodos de aprendizaje artificial
DEL MODELO
UMBRAL DE
CORTE
ANLISIS MODELO DE MODELOS DE
DISTRIBUCIN DISTRIBUCIN
POTENCIAL ACTUAL POTENCIAL FUTURA

APLICACIN EFECTOS DEL CAMBIO CLIMTICO


MAXENT
Idealmente, la probabilidad de que una especie est presente dadas ciertas condiciones del
ambiente.

Describe la probabilidad relativa de las


variables sobre su rango de valores
PROCESO DE MODELADO
PRESENCIA Para el Modelo (70%) Para el Test (30%)

VARIABLES ACTUALES VARIABLES FUTURAS

climaticas climaticas

Topogrficas Topogrficas
VARIABLES
Temticas Temticas

ALGORITMOS MAXENT

Variedad de tcnicas
CURVA ROC
EVALUACIN Ignoran componente espacial
DEL MODELO No hay normas
UMBRAL DE
CORTE
ANLISIS MODELO DE MODELOS DE
DISTRIBUCIN DISTRIBUCIN
POTENCIAL ACTUAL POTENCIAL FUTURA

APLICACIN EFECTOS DEL CAMBIO CLIMTICO


EVALUACION
Articulo clave:
Fielding AH y Bell JF 1997. A review of methods for the assessment of prediction errors in conservation
presence/absence models. Environmental Conservation 24(1), 38-49
(1739 citas en mayo de 2013)

sensibilidad S = A/(A+C)
especificidad E = D/(B+D)
PROCESO DE MODELADO

PRESENCIA Para el Modelo (70%) Para el Test (30%)

VARIABLES ACTUALES VARIABLES FUTURAS

climaticas climaticas

Topogrficas Topogrficas
VARIABLES
Temticas Temticas

ALGORITMOS MAXENT

EVALUACIN CURVA ROC


DEL MODELO
UMBRAL DE
CORTE umbral de corte
ANLISIS
ANLISIS MODELO DE MODELOS DE ensamblado
DISTRIBUCIN DISTRIBUCIN
POTENCIAL ACTUAL POTENCIAL FUTURA mascara

APLICACIN EFECTOS DEL CAMBIO CLIMTICO


UMBRAL DE CORTE

Depende en gran medida del objetivo del


modelo. Algunos ejemplos:
Aplicacin de un umbral de corte (continuo
binario)
Aplicacin de mascaras
Ensamblado de modelos
Suma de modelos binarios
Uso en modelos hbridos (MDE + otra cosa)
PROCESO DE MODELADO

PRESENCIA Para el Modelo (70%) Para el Test (30%)

VARIABLES ACTUALES VARIABLES FUTURAS

climaticas climaticas

Topogrficas Topogrficas
VARIABLES
Temticas Temticas

ALGORITMOS MAXENT

EVALUACIN CURVA ROC


DEL MODELO
UMBRAL DE
CORTE
ANLISIS MODELO DE MODELOS DE
DISTRIBUCIN DISTRIBUCIN
POTENCIAL ACTUAL POTENCIAL FUTURA

APLICACIN EFECTOS DEL CAMBIO CLIMTICO


APLICACIONES DE LOS MDE

Cartografa de especies o comunidades


Muestreo de especies raras
Modelado de riqueza de especies
Planificacin de conservacin
Anlisis de invasiones biolgicas
Anlisis de paleo distribuciones
Cambio climtico y migracin
MUESTREO DE ESPECIES RARAS
Guisan et al. 2005. Using niche-based models to improve the sampling of rare species.
Conservation Biology 20(2), 501-511
Objetivo: Mejorar datos de presencia de especies raras
Mtodos: MDE como gua para buscar poblaciones
Resultados: Ahorro de un 70 % en el esfuerzo de muestreo
Conclusiones: Los MDE son tiles para localizar poblaciones desconocidas de especies
raras
MODELADO DE RIQUEZA

Lehmann et al. 2002. Assessing New Zealand


fern diversity from spatial predictions of species
assemblages. Biodiversity and Conservation 11,
2217-2238
Objetivo: Modelo espacial de diversidad de arbustos
Mtodos: Suma de MDE comparada con prediccin
directa de riqueza
Resultados: Alta congruencia entre modelos
Conclusiones: La suma de MDE permite identificar
hotspots y establecer objetivos para conservacin y
restauracin.
PLANIFICACION DE CONSERVACION

Dunwu et al. 2002. Ecological niche modeling of the


sympatric giant and red pandas on a mountain-range
scale. Biodiversity and Conservation 18, 2127-2141
Objetivo: Recomendar areas de reservas para
pandas rojo y gigante
Mtodos: Solapamiento de modelos
Resultados: Reservas actuales estn mal
diseadas
Conclusiones: Los MDE ayudan a un diseno de
reservas mas coherente
ANALISIS DE INVASIONES BIOLOGICAS

Broenninmann et al. 2007. Evidence of


climatic niche shift during biological
invasions. Ecology Letters 10, 701-709
Objetivo: Comprobar cambios en nicho
ecolgico durante invasin biolgica
Mtodos: MDE de especie invasora en
rango nativo en invadido
Resultados: La especie cambia sus
requerimientos ecolgicos durante la
invasin
Conclusiones: Los MDE predicen areas
de introduccin de especies invasoras, pero
no rangos de invasin
ANALISIS DE PALEODISTRIBUCIONES

Lorenzen et al. 2011. Species-specific


responses of Late Quaternary megafauna to
climate and humans. Nature 479, 359-364
Objetivo: Aclarar efecto del clima y el hombre
en la distribucin de a megafauna del
Cuaternario
Metodos: MDE, registro fosil, ADN
Resultados: Especies presentan respuestas
diferentes a cambio de clima y efecto humano
Conclusiones: El cambio del clima explica
algunas extinciones, pero otras no pueden
entenderse sin la accin del hombre
CAMBIO CLIMATICO Y MIGRACION

Skov y Svenning 2004. Potential impact of climatic


change on the distribution of forest herbs in Europe.
Ecography 27, 366-380
Objetivo: Evaluar consecuencias del Cambio
Climtico en la distribucin plantas europeas
Mtodos: Envueltas bioclimticas difusas
Resultados: Observan perdidas moderadas de
hbitat para todas las especies
Conclusiones: La escasa dispersin natural de
estas plantas va a impedirles migrar al ritmo exigido
por el cambio climtico
CAMBIO CLIMTICO
TIEMPO, CLIMA Y CAMBIO CLIMTICO

Tiempo:
Estado de la atmsfera en un tiempo especfico (corto plazo)
Clima:
Promedio del tiempo en un perodo (30 aos, Organizacin
Meteorolgica Mundial).
Descripcin estadstica de la media y su variabilidad
CAMBIO CLIMTICO
- Convencin Marco de las Naciones Unidas sobre el Cambio Climtico, 1992, p. 3.
- Karl & Tremberth (2005)

Concentracin de Gases de Efecto Invernadero


Cambio climtico:
Cambios de la media o
150% variabilidad del clima de
manera persistente en el
tiempo (p. e. dcadas).
Atribuido directa o
ppm

indirectamente a las
actividades humanas

40%
20%

C2O CH4 N2O


1750 234.6 0 259.2
2011 391 1803 324
El cambio climtico es el resultado de desequilibrios en el balance energtico
El FR antropognica total de 2011, en relacin con 1750, es de 2,29 W/m2, positivo (IPCC, 2013).

IPCC (2013)

Figura N1. Estimaciones de forzamiento radiativo en 2011 respecto de 1750.


Evidencias

El calentamiento del sistema climtico es inequvoco, la temperatura media


global muestra un incremento de 0,85 C (entre 0,65 C y 1,06 C) en el
perodo 1850-2012.

El nmero de das y noches fras ha disminuido y el nmero de das y


noches clidas ha aumentado a nivel global.

la precipitacin ha aumentado en las zonas terrestres de latitudes medias,


pero estn decreciendo en las zonas tropicales.

La capa superior del ocano se ha calentado, los glaciares y los mantos de


hielo estn perdiendo masa, el nivel medio del mar a nivel global ha
aumentado en 0,19 m en el perodo 1901-2010 (IPPC, 2013).
Efectos en Organizacin y poblaciones

Cambios en los patrones de


abundancia (Parmesan & Yohe, 2003).

En los patrones de desarrollo (Crick et


al., 1997),

Cambio climtico: Disminucin en la tasa de sobrevivencia


(Alford et al., 2007).

Modificando patrones geogrficos de


diversidad (Heikkinen et al., 2006).

Generando extinciones locales y


globales (Pounds & Crump, 1994).
Estudiar la distribucin presente y proyectar los cambios a futuro, es fundamental para planificar y
eventualmente mitigar los impactos sobre la biodiversidad o especies.

Una de las lneas de investigacin ms desarrolladas son los MDE.


ESCENARIOS DE CAMBIO CLIMTICO

Los escenarios de cambio climtico estn representados sobre una base climatolgica
coherente por lo que permiten generar teoras de las posibles consecuencias del cambio
por actividad antropognica.

Desde 1992 el IPCC ha realizado estudios para la generacin de escenarios de cambio


climtico. El IS92, que consideraban aspectos socioeconmicos, demogrficos,
ambientales, emisiones de CO2, entre otras y que su momento fueron innovadores, sin
embargo se encontraron deficiencias sobre las interacciones de energa, la economa y el
cambio de uso de suelo.
En el 2000 el IPCC public un nuevo escenarios llamados Special Report on Emission
Scenarios (SRES)

Definen cuatro lneas evolutivas, identificadas como A1, A2, B1 y B2. Cada una representa diferentes
desarrollos demogrficos, sociales, econmicos, tecnolgicos y ambientales que difieren en formas cada vez
mas irreversibles (IPCC, 2001).
Despus del informe del IPCC (2007) se hizo clara la necesidad de nuevos escenarios de
emisiones, puesto que, las que existan no representaban los efectos de las posibles
polticas o acuerdos internacionales tendientes a mitigar las emisiones

Paso de los escenarios del SRES a los Representative


Concentration Pathways (RCP) o Vas de concentracin
representativa.
MODELOS DE CIRCULACIN GENERAL

Los modelos de circulacin general (MCG) son complejos modelos matemticos que
simulan el clima global, considerando la atmsfera, la tierra, la crisfera (capa de hielo) y
los ocanos (Raper & Gioigi, 2005), Santoso et al. (2008) son tiles para modelar el
comportamiento del sistema climtico global ante los cambios de las emisiones de Gases
Efecto Invernadero (GEI).

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