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So Paulo
2013
Cid Rodrigues de Andrade
So Paulo
2013
Cid Rodrigues de Andrade
Orientador:
Prof. Dr. Luiz Antonio Baccal
So Paulo
2013
Dedicatria
Esta dissertao foi elaborada durante uma jornada na qual pude contar com
ajuda, apoio e compreenso de muitas pessoas, todas muito especiais.
Ana Lcia e Las, minhas esposa e filha, que por tantas vezes tiveram de abrir mo
de momentos e oportunidades importantes para que eu tivesse tempo e condies de
prosseguir neste trabalho. No h quantidade mensurvel de palavras que possam
ser ditas ou escritas para demonstrar o quanto sou grato a elas e minha gratido ,
certamente, menor do que tudo o que elas fizeram por mim.
Prof. Dr. Luiz Antnio Baccal, meu orientador, que soube ponderar e dosar
a exigncia com o encorajamento e mesclar isto com o partilhamento de sua viso
esclarecida sobre a Cincia, a Engenharia e a Vida.
Profs. Drs. Lcia Vilela Leite Filgueiras, Renato Anghinah e Koichi Sameshima,
pelas contribuies inestimveis.
Profs. Drs. Afonso Carlos Correa Fleury, Andr Fbio Kohn, Claudia Ins Gar-
cia, Ftima de Lourdes dos Santos Nunes Marques, Fernando Jos Barbin Laurindo,
Helton Hideraldo Biscaro, Joo Batista Camargo Junior, Joo Jos Neto, Kthia Ma-
ria Honorio, Lenidas de Oliveira Brando, Marcelo Schneck de Paula Pessoa, Maria
Alice Grigas Varella Ferreira, Renato de Castro Garcia, Ricardo Lus de Azevedo da
Rocha, Ricardo Nakamura e Romero Tori, por todo conhecimento partilhado.
Profs. Drs. Jorge Rady de Almeida Jr. e Sebastio Gomes dos Santos Filho e
em seus nomes a todos os gestores da Programa de Ps-Graduao em Engenharia
Eltrica da USP.
Prof. Dr. Marcos Alberto Bussab, Diretor dos Cursos de Informtica da Universi-
dade Nove de Julho e em seu nome a todos os gestores desta Instituio de Ensino
Superior, que tanto souberam cooperar e incentivar este trabalho.
Cludia Cristina Marcelino, Marcelo Vantini e Simone dos Santos, sempre dispos-
tos a procurar caminhos e solues.
Os colegas Adriano Arrivabene, Ana Carolina Caldas Dias Jordan, Anderson Luiz
Coan, Camila Mariane, David Pereira Barbosa, Jos Paulo Lima, Karen Slvia Car-
valho Homem, Keith Seixas, Leila Bergamasco, Marcos Alexandruk, Priscilla Viana
Cunha, Renata Madeo, Sidnei Alves De Araujo e Wilson da Silva Loureno, pelas
trocas de ideias e experincias.
1 Introduo p. 1
1.1 Hiptese . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . p. 3
1.2 Justificativa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . p. 3
1.4 Contribuies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . p. 4
2 Objetivos p. 6
3 Reviso bibliogrfica p. 7
4 Metodologia p. 30
5 Resultados p. 33
5.1 Desenvolvimento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . p. 33
5.2 Avaliao . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . p. 38
5.2.1 Anlise dos dados . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . p. 43
6 Discusso p. 46
Referncias Bibliogrficas p. 51
1
1 Introduo
O processamento dos sinais de EEG tem potencial para agilizar e dar maior preci-
so interpretao mdica do resultado do exame, o que configurar-se-ia como uma
significativa vantagem. Neste contexto, algumas tcnicas de processamento do sinal
de EEG podem tornar-se relevantes. (Baal, Boomsma e Geus 2001) apontam como
uma destas a coerncia de EEG, um ndice da conectividade cortical do encfalo.
1 Introduo 2
(Kirner e Siscoutto 2007) afirmam que depois de um longo perodo no qual o ser
humano teve de se ajustar s formas de representao possveis de serem feitas com
as tecnologias da poca de sua criao, encontrar maneiras de fazer com que os
frutos da tecnologia se ajustem s necessidades das pessoas uma postura compa-
tvel com a Engenharia de Software contempornea. Em decorrncia disto surge a
necessidade de aplicaes como a aqui proposta, que amplia o leque de opes de
representao do EEG para dispositivos cada vez mais comuns de serem encontrados
entre estudantes e profissionais.
No podemos, contudo, ignorar que (Nuwer 1997) indica que propostas de aplica-
tivos como o aqui descrito esto mais relacionados com as pesquisas acadmicas do
que com a prtica clnica. Poucas destas inovaes so avaliadas, verificadas e re-
produzidas de forma abrangente. A utilizao destas ferramentas no cotidiano mdico
deve ocorrer aps a anlise do EEG tradicional e de acordo com protocolos propostos,
definidos e aceitos pela comunidade mdica.
1.1 Hiptese
A anlise deste cenrio permite pressupor ser possvel desenvolver uma aplicativo
mvel com uma interface que possa representar de forma flexvel e dinmica resulta-
dos de um exame de EEG e que este aplicativo possa ser til no ensino e treinamento,
como ferramenta acadmica e como apoio ou alternativa para a prtica mdica.
1.2 Justificativa
ograma
6 https://play.google.com/store/apps/details?id=com.macropinch.hydra.android, capaz de medir a
frequncia cardaca utilizando a presso do dedo do usurio sobre cmera do smartphone para leitura
1.3 Organizao da dissertao 4
1.4 Contribuies
Por fim, mas no menos importante, apresentou-se aqui uma metodologia de vali-
dao de aplicativos com este tipo de abordagem. Esta metodologia oferece a possi-
1.4 Contribuies 5
2 Objetivos
O objetivo principal deste trabalho foi desenvolver uma aplicativo mvel com uma
interface que possa representar de forma flexvel e dinmica resultados de um exame
de EEG. Ele foi idealizado para ser utilizado no ensino e treinamento, como ferramenta
acadmica e como apoio ou alternativa para a prtica mdica.
1 http://www.gnu.org/licenses/quick-guide-gplv3.html
7
3 Reviso bibliogrfica
Para subsidiar este trabalho foi realizada uma reviso bibliogrfica que apresenta-
se aqui da seguinte forma:
Nos ltimos anos foram feitos diversos estudos sobre o EEG. do interesse desta
pesquisa, em particular, os que envolvem a interpretao e representao dos dados
deste exame. A seleo dos artigos utilizados neste trabalho foi realizada utilizando-se
3.1 Reviso Sistemtica 8
EEG mapping
EEG interpretation
EEG visualization
na rea acadmica. Quando conveniente, estas expresses foram traduzidas para o portugus (para
contemplar documentos publicados no Brasil).
3.1 Reviso Sistemtica 9
E1: Ser editorial ou outro tipo de documento que no artigos, anais de eventos
cientficos e outras revises sistemticas
O critrio de excluso E1 foi garantido, sempre que possvel, diretamente nas ferra-
mentas de busca das fontes pesquisadas. Destarte, bastaria aplicar os outros critrios
de excluso ao conjunto de documentos obtidos.
A aplicao destes critrios foi realizada primordialmente com a leitura dos ttulos
dos documentos. Quando esta leitura no se demonstrava suficientemente elucida-
tiva para a aplicao dos critrios, procedeu-se leitura dos resumos (abstracts) para
o esclarecimento. Ao final, foram selecionados apenas os documentos que atende-
ram aos critrios de incluso sem que tenha sido aplicado nenhum dos critrios de
excluso.
A partir da leitura da ntegra dos documentos selecionados foi realizada uma busca
suplementar por algumas das referncias destes documentos, como forma de obten-
o de uma cobertura mais abrangente sobre os temas pesquisados. A leitura integral
9 Scientific Eletronic Library Online
10 http://www.bibtex.org
11 http://www.mendeley.com/
12 http://jabref.sourceforge.net
3.1 Reviso Sistemtica 11
dos documentos foi realizada com o cuidado apropriado para a extrao dos seguintes
dados:
Autores
Ano de publicao
Peridico ou evento
Tcnica de avaliao
obter nos artigos o tamanho, estado de sade e faixa etria da amostra, alm de quais
profissionais foram envolvidos na avaliao e como ela foi realizada.
A leitura na ntegra dos artigos foi necessria para estabelecimento das formas de
destaque dos dados representados. A listagem destas formas de destaque apre-
sentada no quadro 3.3.
As faixas etrias dos pacientes que tenham participado das avaliaes das solu-
es propostas foram as indicadas no quadro 3.4.
Os artigos selecionados mostram que at 1994 a anlise do sinal de EEG era reali-
zada utilizando-se, majoritariamente, tcnicas de transformadas de Fourier. Entretanto
haveria vantagens no uso de transformadas wavelet, tcnica introduzida cerca de dez
anos antes. Estas seriam menos utilizadas do que aquelas em decorrncia de alta
demanda de recursos computacionais, segundo (Schiff et al. 1994). Novos algoritmos
permitiram o uso conveniente de sistemas computacionais da poca sem degradao
na interpretao do resultados.
A proposta de (Principe e Reid 1990) foi a primeira selecionada nesta reviso. Ela
props que o sinal do EEG fosse visualizado no espao de fases, em oposio
representao tradicional no domnio do tempo e analisada no domnio da frequncia
e tempo. O resultado demonstrava claramente resultados do EEG como ondas lentas,
fases de sono profundo ou eventos relacionados epilepsia. Entretanto no houve
avaliao da utilizao clnica do mtodo.
proposto pelos pesquisadores foi transcrever medidas dos sinais de onda registrados
em papel no EEG e representar a amplitude e frequncia na interface tridimensional.
Esta representao dar-se-ia com o uso de tons de cinza. Os prprios autores do
artigo avaliaram o programa e concluram que ele apresentava claras vantagens em
relao ao registro tradicional de sinais eltricos.
um programa capaz de representar certos dados de interesse sobre uma cabea esti-
lizada, que pode ser visto na figura 3.6. O foco principal deste programa era o intervalo
de tempo () entre ativaes sncronas de eletrodos vizinhos. A avaliao destes
intervalos til para a avaliao de problemas psiquitricos e neurolgicos. Estes in-
tervalos so calculados de forma assncrona, ou seja, aps a realizao do exame de
EEG. O programa classifica estes intervalos de tempo em quatro categorias e exibe
16 http://wacong.org
3.2 Artigos selecionados 18
Figura 3.6: Aplicativo no World Automation Congress, por (Asakawa et al. 2010)
No mesmo ano (Poli et al. 2010) apresentaram o Eigenbrains, que pode ser vista
na figura 3.7. Ele baseia-se em um modelo das propriedades eltricas do encfalo e
apresenta uma representao bidimensional com uso de escala de cores.
Mais recentemente foram publicados diversos trabalhos com sugestes nesta rea
de estudo. Um destes o estudo de (Koenig et al. 2011) que introduziram o Ragu
(Randomization Graphical User Interface) para realizao de anlises estatsticas em
EEG e MEG. Esta ferramenta pode ser vista na figura 3.8.
Outro destaque recente uma proposta de (Stopczynski et al. 2011), com uso de
aplicao mvel. Trata-se de uma soluo de baixo custo com uso de um headset
de 14 eletrodos que conecta-se de forma wireless a um smartphone. Neste aparelho
implementou-se uma interface sensvel ao toque que exibe o resultado do EEG em
tempo real e sobre uma representao tridimensional de um encfalo 17 , como pode
ser visto na figura 3.9.
de EEG e MEG. A aplicao foi desenvolvida com Java embutido em scripts MATLAB
e distribuda como Sofware Livre.
Vimos tambm o NUTMEG, de (Dalal et al. 2011). uma ferramenta que com-
bina dados de Magnetoencefalografia (MEG), EEG e EEG intracraniano, aglutinando
a exibio dos resultados em uma nica interface, que pode ser vista na figura 3.13.
(Brunet, Murray e Michel 2011) apresentaram outra ferramenta que aglutina resul-
tados de exames distintos. Esta ferramenta o CARTOOL e sua interface est na
figura 3.14.
A unificao de resultados de MEG e EEG foi abordada por mais uma ferramenta,
a SPM8, de (Litvak et al. 2011). Sua interface pode ser vista na figura 3.15
Alm destas ferramentas a literatura da rea compreende outros artigos com so-
lues de menor destaque como:
3.2 Artigos selecionados 25
Figura 3.14: Interface do CARTOOL, proposto por (Brunet, Murray e Michel 2011)
3.2 Artigos selecionados 26
Este tipo de avaliao no apresentou-se como sendo algo comum. O primeiro dos
artigos analisados com indicao deste tipo de avaliao foi de 1997. Foi um estudo
realizado por (Nakagawa, Tsai e He 1997), com o exame de EEG em 5 voluntrios
saudveis com idades entre 21 e 36 anos. Entretanto, no foi realizada avaliao da
ferramenta proposta por outras pessoas que no os prprios autores do trabalho.
O artigo de (Caat, Maurits e Roerdink 2007) foi o nico com indicao da seleo
de amostra que utilizou tanto um grupo de controle com pessoas saudveis como ou-
tro com pessoas com diagnstico de algum problema de origem neurolgica. Este
mesmo trabalho o nico, dentre todos analisados, que submeteu a soluo proposta
a uma avaliao por terceiros. Esta avaliao foi realizada por doze profissionais divi-
didos em trs grupos, cada uma com um grau de experincia, prtica clnica e conhe-
cimento na interpretao de exames de EEG. Foram cinco estudantes de programas
de Mestrado ou Doutorado, quatro pesquisadores e trs profissionais com experincia
clnica. Foram avaliados o tempo mdio para anlise e interpretao de resultados.
Alguns documentos apresentaram solues que oferecem mais do que uma forma
de visualizao de dados. Estes tiveram sua soluo classificada em mais de uma
categoria. A distribuio das categorias pode ser vista na figura 3.16
presentes com o passar do tempo - como vemos no quadro 3.5 e no grfico 3.17 -,
apresentando-se como tendncias para trabalhos futuros. Certamente isto deve-se
evoluo e barateamento de recursos computacionais. Os artigos selecionados,
entretanto, no investigaram a existncia de vantagem significativa no uso de repre-
sentaes tridimensionais.
Dos artigos analisados verifica-se que 63% deles representam aspectos da onda
do sinal eltrico do EEG. Destaca-se tambm que 16,7% dos documentos seleciona-
dos oferecem visualizao para resultados de anlise de coerncia de EEG.
Dentre os autores dos artigos destacam-se a equipe Michael ten Caat, Natasha
M. Maurits e Jon B.T.M. Roerdink, dos Pases Baixos, autores de dois trabalhos:
Robert Oostenveld, tambm dos Pases Baixos, tambm participou de dois artigos:
Por fim, Thomas Koenig, da Suia, completa a lista de autores envolvidos em dois
artigos:
Convm que novas pesquisas com desenvolvimento de interfaces para EEG faam
avaliao rigorosa da aplicabilidade da soluo. Esta avaliao deve ser realizada
por terceiros, ou seja, no deve ser conduzida somente pelos prprios autores dos
sistemas propostos.
Ao levar em conta a evoluo dos trabalhos propostos nesta rea, possvel ava-
liar que novos estudos devem continuar propondo uso de tecnologias em consolida-
o, como o caso das interfaces sensveis ao toque. Outra evoluo esperada o
uso de tablets e phablets, com telas maiores do que as de smartphones.
31
4 Metodologia
Em paralelo, foi desenvolvida uma aplicao com intuito de atender aos requisi-
tos aqui expostos. Esta foi elaborada para execuo em tablet capaz de executar o
sistema operacional Android.
Cada mdico ou residente deve ter um treinamento padro para utilizao do pro-
grama em questo. Aps o referido treinamento, devem ser chamados a realizar trs
anlises de exames, compostas por um EEG tradicional e dois por intermdio da apli-
cao proposta: um de paciente so e outro de paciente no-saudvel. Para cada
anlise devem ser registrados os seguintes itens:
Identificao do teste
Estes dados devem receber o tratamento estatstico necessrio para que seja pos-
svel extrair resultados como, ao menos:
1 https://play.google.com/store
34
5 Resultados
5.1 Desenvolvimento
Entre as duas opes em anlise optou-se pelo Android em virtude dos seguintes
motivos:
Android DDMS
Para criao do aplicativo foi criado um projeto de uma aplicao Android voltada
verso 4.0 da plataforma. A aplicao foi denominada PDC. As classes desta apli-
cao foram organizadas em um pacote denominado br.usp.poli.lcs.pdc.
br.usp.poli.lcs.pdc
br.usp.poli.lcs.pdc.common
br.usp.poli.lcs.pdc.eeg
O primeiro tem classes que controlam cada uma das distintas telas do aplicativo.
O segundo abriga uma classe utilizada para se manter dados sobre quais eletrodos
foram selecionados para serem examinados. O terceiro e ltimo pacote contm as
classes que representam os dados do EEG em si.
Ao todo foram utilizadas oito classes, que podem ser conhecidas no quadro 5.1.
As trs classes que controlam telas so associadas a arquivos XML que descrevem
estas telas.
foi utilizada a biblioteca GraphView, de (Gehring 2011). Trata-se de uma biblioteca com
licena LGPL 13 que facilita a tarefa de traar grficos, em especial os com mltiplas
sries de dados. O grfico foi configurado para ser possvel alterar sua escala com um
movimento de pina com os dedos sobre o mesmo.
Nesta tela possvel pressionar no boto para mostrar o resultado do PDC para
que a coerncia de EEG baseada neste mtodo seja calculada e seu resultado exibido.
Utiliza-se da mesma figura do topo da cabea, indicando-se o grau de conectividade
entre os eletrodos com linhas traadas entre os eletrodos.
5.2 Avaliao
Este processo teria incio pelo registro em Comit de tica na Pesquisa dos proce-
dimentos aqui descritos, de forma a garantir que estes ocorram de forma condizente
com o respeito devido aos envolvidos. As observaes deste Comit podem levar a
revises destes procedimentos doravante descritos.
Definir-se-ia com estes parceiros quais patologias seriam indicadas para serem
testadas com a utilizao da ferramenta proposta. Este passo importante para a
definio da amostra de indivduos a serem submetidos a exames de EEG.
que seriam submetidos a exames de EEG. Este exames seriam utilizados para for-
necer os dados necessrios para avaliao e testes da ferramenta em questo. Esta
amostra seria definida envolvendo-se profissionais da rea mdica e estatsticos. A
amostra deveria ser composta considerao variveis como:
Dentre pacientes que tenham procurado o hospital envolvido e que tenham apre-
sentado diagnstico negativo para as patologias em questo
5.2 Avaliao 41
Residentes
Em relao ao EEG padro, voc diria que este mais fcil ou mais complexo
para realizao de diagnstico ou encaminhamento?
Respostas possveis:
A seleo dos eletrodos a serem examinados foi uma tarefa simples ou com-
plexa?
Respostas possveis:
Muito simples
Ligeiramente simples
Ligeiramente complexo
Muito complexo
Muita dificuldade
Ligeira dificuldade
Ligeira facilidade
Muita dificuldade
Caso voc considera que teria sido se tivesse sido possvel utilizar este aplica-
tivo como ferramenta de aprendizado e estudo durante seu perodo no curso de
Graduao?
Respostas possveis:
Muito produtivo
Pouco produtivo
Ligeiramente improdutivo
Totalmente improdutivo
Provavelmente sim
Provavelmente no
Do seu ponto de vista, quais funcionalidades deveriam ser removidas deste apli-
cativo?
A primeira anlise que seria realizada a partir dos dados obtidos focaria o tempo
consumido. Far-se-ia a comparao do tempo consumido mdio e o desvio-padro
desta medida na anlise do EEG tradicional e com o aplicativo. Alm da comparao
geral, seria realizada tambm a comparao segmentada por perfil do examinador.
Este passo teria como objetivo avaliar se o aplicativo ofereceria vantagem em relao
ao mtodo tradicional no que se refere ao tempo para interpretao. Um objetivo se-
cundrio seria avaliar se este diferencial de tempo afetado pelo tempo de experincia
ou vis profissional do examinador.
6 Discusso
Por outro lado, h fraquezas a serem corrigidas na mesma. Algumas das solues
encontradas na literatura oferecem mltiplas opes de visualizao para os dados,
enquanto a aqui proposta ainda utiliza somente do sinal tradicional e da representao
da conectividade cortical sobre mapeamento topogrfico. Os novos processadores
oferecidos em dispositivos mveis mais recentes permitiriam uma verso que pudesse
manipular trechos maiores de sinal de EEG.
A observao dos resultados aqui obtidos permitem indicar que este trabalho fez
surgir a necessidade de realizao de novas investigaes que permitam, entre outros
objetivos, implementar o mtodo de avaliao aqui descrito. O desenvolvimento de
novas verses deste aplicativo pode trazer-lhe mais funcionalidades, em especial as
que possam ser apontadas no prprio mtodo de avaliao.
50
O resultado foi um aplicativo mvel, para tablets e phablets, que permite visua-
lizar de forma alternativa os sinais de exame de EEG, permitindo filtragem de ele-
trodos e perodo a serem visualizados. Tem-se tambm condio de realizao de
ps-processamento, exibindo-se o resultado da coerncia de EEG pela abordagem
de Partial Directed Coherence (PDC).
Uma das possveis utilizaes deste aplicativo seria como ferramenta para apren-
dizado e estudo durante a formao do profissional. Para a comunidade acadmica
ele representa outra alternativa a ser analisada em pesquisas futuras. Os profissionais
da rea podem vislumbrar a possibilidade de desenvolvimento de ferramentas mveis
que lhes sirva como apoio ou alternativa em suas atividades prticas.
cena GPL permite que outras pessoas possam desenvolver verses dele ou outros
aplicativos baseados nele, desde que estes tenham a mesma licena.
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