Licence 2 ; Semestre 3 ; Module "Ecologie Gnrale"

Ecologie gnrale
Introduction

Domaines de l'cologie
Niveaux Individu / Population / Communaut / Ecosystme
Ecologies fondamentale et applique

L. Amsellem
Btiment SN2 ; Porte 104
laurent.amsellem@univ-lille1.fr
Lensemble "Fort" est form dun ensemble important despces vgtales et animales (uni ou pluricellulaires)

Ces espces ne sont pas retrouves toutes ensemble dans un autre milieu (pas d au hasard)
Lensemble est structur spatialement
Lensemble est "reconnaissable" pour tre nomm "Fort"
Lagencement spatial dpend des conditions physico-chimiques (ex: climat, sol, )
Structure modifiable court terme dans le temps (cycle saisonnier)
A plus long terme, la structure se maintient malgr la mort de ses lments
 Cellule = "collection" dorganites
Organe ou tissu = "collection" de dont chacun a un rle prcis
cellules plus ou moins spcialises
Etre vivant = "collection" dorganes
(cerveau, cur, poumons, ) qui ne
sont pas anarchiquement disposs
Relations et contrles qui assurent
lintgrit de lensemble (contrles
endocriniens, pression osmotique,
dbit cardiaque, ) Proprits communes peuvent tres mises en vidence

Pour un "ensemble" vivant dune chelle suprieure lorganisme, cette

succession d'chelles croissantes est-elle valable et peut-elle tre complte?
Quels sont les lments constituants?
Comment cet ensemble se forme-t-il?
Quels sont les flux dinformation / nergie / matire?
 Les regroupements hirarchiques
Biomes
Ecosystme
(= Biotope + Biocnose)

Communaut /
Peuplement
(= Biocnose)
Population
Individu
 mergence dun concept nouveau : lcosystme

Auparavant :
Jusquau milieu du 18me sicle : Grandes expditions gographiques et cartographiques (connaissance des
Ocans et Terres lointains)
18-19me sicle : zoologie & botanique taient essentiellement descriptives (grandes expditions
naturalistes)
Louis Antoine de Bougainville : 1er voyage (1766-69) avec un botaniste bord, Philibert Commerson
James Cook quitte lAngleterre (1771) avec son bord un botaniste et un naturaliste

Le nombre despces dcrites augmente considrablement cette poque!

19me sicle : Approche pas uniquement taxonomique, mais bauche "gographique" est tente :
A. von Humboldt : essai sur la gographie des plantes (1807). Paramtres physiques proposs pour
expliquer la rpartition des plantes (lumire, temprature, nature du sol, ) = 1re notion
d"association vgtale"
A. P. de Candolle : ides similaires = "stations" ("milieux deaux douces stagnantes") & "habitation"
(Alpes, Europe) = 1re notion de comptition inter-spcifique pour expliquer les rpartitions despces
A. P. de Griesbach : "La vgtation du globe daprs sa disposition suivant les climats" (1872)
Les climats sont le principal facteur de rpartition des formations vgtales

La description d'espces nouvelles n'est plus uniquement un simple "catalogue"

Dsormais, approches :
cologique (paramtres abiotiques locaux qui expliquent la prsence des espces)
biogographique (paramtres abiotiques plus large chelle spatiale : climats, prcipitations, etc.)
 Ecologie = "Science de l'Habitat"
"Etude des interactions entre les organismes et leur environnement, et dont C. Darwin se rfre dans
l'expression "les conditions de la lutte pour la survie" ("Struggle for life") (E. Haeckel, 1870)

Elle essaie d'expliquer la rpartition et l'abondance des organismes

L'cologie (au sens scientifique) n'est pas (seulement) "l'impact de l'Homme sur l'environnement" ;
! la protection des baleines ou des phoques n'est qu'une application (parmi d'autres) de cette discipline!!
Attention donc avec la drive politique de ce terme : "Ecologue" : scientifique ; "Ecologiste" : politique

L'cologie est une discipline centrale en Biologie

Elle fait appel plusieurs autres disciplines : chimie, gologie, physique, mathmatiques

Les questions cologiques sont indissociables d'autres domaines de la Biologie, dont :

la gntique
l'volution
l'thologie
la physiologie

 Gologie
Palo-environnements
Palobotanique
Palynologie

Ecologie

Autres disciplines Ecologie

applique

de la Biologie Gestion de
Biologie Cellulaire
Zoologie l'environ-
Botanique
nement
Intervenant(s) Domaine Titre et description Mots-cls Disciplines connexes

Cours : Ethologie (2 sances) - Comportement animal - Ecologie

Dcouvrir cette discipline par la prsentation de deux problmes actuels (techniques et - Processus volutif - Evolution
Ecologie du mode de raisonnement). Il est fait rfrence aux processus volutifs et aux contraintes - Adaptation - Neurophysiologie
M. Delsaut - Capacits cognitives
comportement environnementales.
TD : Faire apparatre les capacits d'adaptation d'une espce au travers de la liaison - Convergence volutive
forte entre les contraintes du milieu et les rponses comportementales.

Cours : Ecologie volutive (2 sances) ; Slection sexuelle (1 sance) - Reproduction - Ecologie

Dcrire les concepts thoriques et les facteurs qui rgissent l'volution au travers - Slection Naturelle - Evolution
aires
d'exemples naturalistes et de situations cologiques varies. - Caractres sexuels II - Gntique
Analyser les bases biologiques des cots et bnfices de la reproduction chez les deux - Slection intra-sexuelle - Biologie molculaire
Ecologie
L. Amsellem sexes afin d'expliquer des comportements reproducteurs ou des caractres sexuels qui - Slection inter-sexuelle
volutive
semblent a priori contradictoires avec la thorie de la Slection Naturelle.
TD : Etude de documents prsentant divers vnements de convergence morphologique
chez les mammifres en rponse des contraintes environnementales similaires

Cours : Ecotoxicologie (2 sances) - Polluants - Toxicologie

Lien entre cotoxicologie et disciplines connexes. Panorama des principaux polluants et - Toxiques - Biochimie
toxiques, typologie des sources de pollution. Effets des substances chimiques toxiques - Biomarqueurs - Chimie des milieux
Ecologie des sur les cosystmes diffrents niveaux dorganisation : molculaire jusquau paysage. - Indicateurs - Pdologie
A. Leprtre
stress Notion dindicateurs cologiques et de biomarqueurs de toxicit. - Gologie
TD : Etude de 2 cas concrets dutilisation dun groupe taxonomique comme indicateur
cologique (lichens pour la qualit de lair, et diatomes pour celle des eaux courantes).

Cours : Organisation gnrale de la Biosphre (6 sances) - Biosphre - Pdologie

Prsenter l'chelle globale (macroscopique) les compartiments qui interagissent avec - Hydrosphre - Cimatologie
la Biosphre (atmosphre, hydrosphre, sols), et comprendre les relations existantes - Atmosphre - Gologie
F. Goulard
Ecologie entre ces diffrents compartiments. La rpartition des tres vivants la surface de la - Biomes - Gographie
S. Lefbvre
plante est ensuite dcrite (Biomes), ainsi que les consquences des modifications - Interactions
environnementales sur cette rpartition (notamment les changements climatiques).

Cours : Fondements de lcologie microbienne (3 sances) - Ecologie - Microbiologie

Objectifs, domaines dintervention et dapplication (illustrs par exemples). Illustration - Micro-organismes Biochimie
dinteractions entre les micro-organismes et leurs environnements : vgtal (symbiose - Environnement - Ecologie
M. Chollet Ecophysiologie bactries-plantes) et animal (symbioses au sein du rumen). - Interactions - Biologie Molculaire
TD : Analyse de documents, afin de dcouvrir des micro-organismes prsentant une - Symbiose - Epidmiologie
application cologique telle que la lutte biologique. - Applications

Cours : Gestion de l'environnement (3 sances) ; Agrocosystmes (1 sance) - Conservation - Environnement

Donner un aperu des concepts et des notions relatives au diagnostique cologique des - Environnement - Bureau d'tude
Ecologie habitats et leur gestion raisonne. - Gestion - Conservation
M. Pauwels
applique Dcrire les habitats cultivs comme des cosystmes part entire, avec leur - Restauration
caractristiques et leur mode de fonctionnement.
 Jour
lundi mardi mercredi mercredi jeudi jeudi vendredi vendredi
14h00- 14h00- 10h15- 15h45- 15h45- 10h15-
Heure 8h30-10h00 15h45-17h15
15h30 15h30 11h45 17h15 17h15 11h45
Lieu SN1-Gosselet SN1-Buffon SN1-Maige SN1-Gosselet SN1-Maige SN1-Buffon SN1-Gosselet SN1-Gosselet
Section n 3 1 2 4 5 5 1 2 3 4
37 Intro 1 Intro 1 Intro 1 Intro 1 Intro 2 Intro 2 Intro 2 Intro 2
38 Ethologie 1 Ethologie 1 Ethologie 1 Ethologie 1 Ecol vol 1 Ecol vol 1 Ecol vol 1 Ecol vol 1
39 Ethologie 2 Ethologie 2 Ethologie 2 Ethologie 2 Ecol vol 2 Ecol vol 2 Ecol vol 2 Ecol vol 2
40 Eco microb 1 Eco microb 1 Eco microb 1 Eco microb 1 Biosphre Biosphre
41 Eco microb 2 Eco microb 1 Eco microb 2 Eco microb 2 Biosphre Biosphre Biosphre Biosphre
Semaine n

42 Eco microb 3 Eco microb 3 Eco microb 3 Eco microb 3 Biosphre Biosphre Biosphre Biosphre
43 Ecotox 1 Ecotox 1 Ecotox 1 Ecotox 1
44 Sl sexuelle Sl sexuelle Sl sexuelle Sl sexuelle
45 Ecotox 2 Ecotox 2 Ecotox 2 Ecotox 2 Biosphre Biosphre
46 Ecol appli 1 Ecol appli 1 Ecol appli 1 Ecol appli 1 Biosphre Biosphre Biosphre Biosphre
47 Ecol appli 2 Ecol appli 2 Ecol appli 2 Ecol appli 2 Biosphre Biosphre Biosphre Biosphre
48 Ecol appli 3 Ecol appli 3 Ecol appli 3 Ecol appli 3 Biosphre Biosphre
49 Agro-ecosys Agro-ecosys Agro-ecosys Agro-ecosys Biosphre Biosphre
50
Introduction (L. Amsellem)
Ecologie comportementale (M. Delsaut)
Ecologie volutive (L. Amsellem)
Ecologie microbienne (M. Chollet) Contrle des connaissances
Organisation gnrale de la Biosphre (F. Goulard, S. Lefbvre)
Ecotoxicologie (A. Leprtre)
Session 1 : 2 preuves :
Slection sexuelle (L. Amsellem)
1 contrle continu (1h ; 25%) Samedi 19/11 : Uniquement cours
Ecologie applique (M. Pauwels)
Absence cette preuve = passage de la session 2
Agro-ecosystme (M. Pauwels)

Contrle final (2h ; 75%) : Ensemble des cours (25%) et TD (50%)

Session 2 :
Une seule preuve (100%) : Ensemble des cours et TD
Responsable du module : S. Demuynck, Btiment SN3 ; sylvain.demuynck@univ-lille1.fr
Equipe pdagogique : - L. Amsellem ; Btiment SN2, bureau 104 ; laurent.amsellem@univ-lille1.fr
- S. Lefbvre ; Station Marine de Wimereux ; sebastien.lefebvre@univ-lille1.f
Cours Magistraux #: 33h (= 22 cours de 1h30)
Introduction* (L. Amsellem, 2 cours ; 3h)
Ecologie comportementale / thologie (M. Delsaut, 2 cours ; 3h)
Ecologie volutive* (L. Amsellem, 2 cours ; 3h)
Ecotoxicologie (A. Leprtre, 2 cours ; 3h)
Organisation gnrale de la Biosphre (F. Goulard, S. Lefbvre, 6 cours, 9h)
Ecologie microbienne (M. Cholet, 3 cours ; 4h30)
Slection sexuelle* (L. Amsellem, 1 cours ; 1h30)
Ecologie applique* (M. Pauwels, 3 cours ; 4h30)
Agro-cosystmes* (M. Pauwels, 1 cours ; 1h30)
# Les cours et polys de TD sont tlchargeables sur Moodle ; "L2S3_Ecologie gnrale", cl d'inscription : "L2S3_EG"

* Les cours de L. Amsellem et M. Pauwels seront galement tlchargeables sur http://gepv.univ-lille1.fr ;

Menu "Ressources pdagogiques" ( gauche) ; sous-menu " Licence 2 semestre 3" ; Module "Ecologie Gnrale"

Travaux Dirigs : 18h (= 9 TD de 2h)

! Les polycopis de TD sont tlcharger # et imprimer par vos soins, avant les sances concernes!
Pensez consulter rgulirement vos botes email de l'Universit pour vous tenir informs des nouveaux dpts de documents!
Ecologie volutive : "Les conditions cologiques qui mnent aux convergences volutives"
Organisation gnrale de la Biosphre
Sance 1 : "Impact de l'Homme sur les cosystmes: tude de cas"
Sance 2 : "Etude pratique d'un cosystme forestier"
Ecologie comportementale / thologie : "L'cologie du comportement social des chimpanzs"
Ecologie microbienne : "Les bactries promotrices de la croissance des plantes"
Ecotoxicologie
Sance 1 : "Les diatomes: indicateurs cologiques de la qualit des eaux de surface continentales"
Sance 2 : "Les associations lichniques pour l'valuation de la qualit de l'air"
Rhizosphre : "Ecologie et fonctionnement de la rhizosphre"
Palo-cologie : Reconstitution des communauts de foraminifres depuis des donnes fossiles
 Licence - S3
L
I
C
E Licence BOP - S4
N ("Biologie des Organismes et des Populations")
C Licence BOP - S5
E
Licence BOP - S6

Master 1 Ecologie S1
M
Master 1 Ecologie S2
A
S Master 2 Ecologie S3 Master 2 Ecologie S3
"Gestion et Evolution de la "Fonctionnement et Gestion des
T Biodiversit" (GEB) Ecosystmes Marins" (FOGEM)
E
R Master 2 Ecologie S4
( Stage long)

Plus d'informations sur le Master Ecologie :

http://master-ecologie.univ-lille1.fr
L'tude de la rpartition et l'abondance des organismes comporte 4 niveaux

Individu (Unit de la Slection Naturelle)

Survie & reproduction : L'aut(o)cologie ou cophysiologie se penche sur les aspects
physiologiques, morphologiques et comportementaux des ractions d'un organisme aux
conditions physicochimiques de son milieu
Au final : limites de tolrance des organismes aux stress cologiques dterminent o ils
peuvent vivre

Population (Unit de l'Evolution)

= Groupe d'individus de la mme espce, vivant dans une aire gographique donne un
moment prcis
Dynamique des Populations : La "Dmcologie" ou cologie des populations tudie
principalement les facteurs qui influent sur la taille et la composition des populations
(sexe-ratio, classes d'ges, )

Communaut (= peuplement)
= Tous les organismes qui habitent dans une aire donne ; assemblage de populations de
diffrentes espces
Biologie des communauts : tudie les effets des interactions entre organismes sur la
structure et l'organisation de l'ensemble

Ecosystme
= Ensemble form par les facteurs abiotiques et par la communaut d'une aire donne
A ce niveau sont tudis le flux d'nergie et les cycles biogochimiques
 Les paramtres qui agissent sur l'individu
Perte (= chaleur)
Maintien
Energie ORGANISME Survie
lumineuse (autotrophie)
( "MACHINE") Dfense
chimique (htrotrophie)
Reproduction

Ressources (= LIMITEES : dans le temps et / ou l'espace)

Eau, oxygne
[Energie solaire + nutriments + CO2] ou nourriture A maximiser de faon quilibre
Espace ( Comptitions inter et intraspcifique)
Rpartition sous forme de compromis ("trade-off")

Conditions abiotiques
Temprature
Humidit Valeurs minimale, optimale, et maximale
pH, salinit

Polluants Valeur maximale

Conditions biotiques
Comptiteurs
Prdateurs ou herbivores Influence minimiser
Parasites et pathognes

Mutualistes Influence maximiser

 Conditions abiotiques : Optimum cologique ou physiologique
Performance Performance optimale

Reproduction

Croissance
individuelle

Survie
individuelle

Facteur d'environnement
Reproduction
(TC, lumire, nourriture, )

Croissance individuelle

Survie individuelle

Rsistance = viter ou tolrer le facteur environnemental ou les fluctuations de ce facteur

Evitement ("avoidance") = li la mobilit des Tolrance ("tolerance")

organismes Le mtabolisme est chang par le facteur, mais pas
Trs mobiles : migrations saisonnires drgul
oiseaux migrateurs rsistance au sel [NaCl]
Peu mobiles : priode de stress sous une forme
physiologiquement peu active
ufs, spores, graines, rhizome,
Concepts de niche fondamentale / niche ralise

Niche fondamentale (thorique) :

Tous les paramtres physico-chimiques qui autorisent
l'existence d'une espce donne un endroit prcis
(TC, prcipitations, nature du sol, frquence des
perturbations, salinit, intensit lumineuse,

Niche ralise = niche fondamentale

restrictions dues aux interactions
essentiellement biotiques (prdateurs,
comptiteurs, pathognes, )
Etagement vertical de la vgtation marine en Atlantique

Paramtres de la zonation intertidale :

Temps d'mersion (temps l'air et sous lumire directe)
Profondeur d'immersion (longueurs d'ondes lumineuses)
 Autre exemple de zonation cologique :
Espces de diatomes trouves l'embouchure des estuaires
Algues microscopiques brunes unicellulaires constitues d'un squelette siliceux

Constituant principal du phytoplancton

Composante majeure du peuplement algal des cours d'eau
et des plans d'eau
200 genres, plus de 100 000 espces

Salinit
(g / l)
 Exemple d'un cas d'tude en cologie

Bernache cravant (Branta bernicla bernicla) :

Oiseau migrateur
Hiverne surtout sur les ctes anglaises et franaises et sur les Wadden
(Pays-bas)
Estive et se reproduit en Sibrie, sur le littoral de la pninsule de Taimyr

Lieu d'hivernage de la Bernache cravant

Aspects cophysiologiques : Adaptation au sel

Nourriture prfrentielle : Zostre (herbaces littorales submerges, rpandues dans les mers tempres)
Glandes pour l'excrtion de sel (trs concentr) au dessus des yeux
Les Wadden Mer Blanche Pninsule de Taimyr
(arrt intermdiaire) (site d'observation)

Suivis par radio-tracking de diffrentes colonies de Bernaches cravant durant leur route migratrice
 La migration vers la pninsule de Taimyr :

Printemps ( mi-mai) : Rassemblement dans les Wadden avant dpart en Sibrie

Voyage de 5000 Km avec un seul arrt intermdiaire 2300 Km
Importance de disposer de suffisamment de rserves

Reproduction

Repos

Hivernage

Date et conditions de dpart sont primordiales ( Attendre un vent favorable)

Mais dilemme :
Trop attendre : Arriver trop tardivement dans le lieu de nidification
Ne pas assez attendre : puisement = plus suffisamment d'nergie pour la reproduction

Fentre favorable pour s'accoupler, pondre, couver et lever les jeunes : 2 mois (mi-juin mi-aot)
 Aspects populationnels

Comptition (intra-spcifique) entre

Les bernaches vivent en groupe (colonies)
individus pour les ressources
surtout au printemps (normes rserves
Les ressources alimentaires (zostres) sont limites
pour migration en Sibrie)

Hirarchie distincte au sein du groupe

temps d'alimentation des femelles lorsque degr de dominance du partenaire mle

Poids des avant

temps d'alimentation des (mn / h)

60 de partir en Sibrie 2%
1570
8%

1390
50 11% % des interactions o le a "perdu"

1310
22%

40

0 1 2 3
: nombre d'interactions par 5 minutes
 Dynamiques des populations des bernaches

Les effectifs des bernaches ont beaucoup chang depuis le dbut des observations

Trs abondantes au dbut du 20me sicle (environ 100 000 avant 1930)

Chute brutale des effectifs dans les annes 1930 :

Cause directe : attaque des zostres par un champignon ( quasi-disparition de leur nourriture prfre)
Bernache s'est donc nourrie avec d'autres herbes de pr-sal et des gramines cultives (crales, )
Devenue un flau pour les agriculteurs et une proie pour les chasseurs

16500 en 1950. Protection (Pays-Bas 1950 ; Angleterre 1954 ; France 1966 ; Danemark 1972) pour restaurer
les effectifs

Actuellement : entre 200 000 et 300 000 individus

Log (taille totale de la population en janvier)

500000

100000

50000

10000

1950 1960 1970 1980 1990 2000

 Log (taille totale de la population en janvier)
500000

100000

50000

10000

1950 1960 1970 1980 1990 2000

Aprs 1975 (= protection au Danemark et restauration des effectifs) : Phnomne inattendu!

Cycles dmographiques de 3 ans :

Une fois tous les 3 ans il n'y a quasiment pas de jeunes parmi les oiseaux qui rentrent de Sibrie
2me anne : meilleure, mais variable
3me anne : pic de reproduction (part des jeunes = jusqu' 60% de la population qui rentre de Sibrie)

Comment expliquer ce cycle ?

Il s'avre qu'il est d des relations interspcifiques (= au niveau de la communaut!)

 Organigramme simplifi des relations interspcifiques

Autres consommateurs :
Omnivores
Parasites
Pathognes
Mutualistes : Transfert de Biomasse

Carnivores

Consommateurs
A l'intrieur d'un niveau trophique :
(niveaux trophiques)
comptition interspcifique possible
Chaine alimentaire

Prdateur / Proie

Matire
Herbivores
Organique morte

Producteurs
Dtritivores Dcomposeurs
primaires
Energie
solaire

Matire
minrale
????????????????????
Ce cycle de 3 ans des bernaches concide avec celui des lemmings de Sibrie

Le lemming de Sibrie (Lemmus sibericus) est un rongeur de petite taille ( 15 cm)

Oreilles et queue trs courtes
surface d'change avec l'extrieur et les risques de gel (= adaptations au froid)

La densit des lemmings varie normment, de manire cyclique

Un documentaire de Walt Disney (Le Dsert de lArctique, 1958) montre de manire mensongre des
! lemmings qui se suicident en masse lorsque leur densit devient trop leve. Ceci est une mythe, qui a
beaucoup marqu les esprits et qui est dur rfuter par les scientifiques

Il n'existe aucune relation directe entre les bernaches et les lemmings!

 Il existe une relation indirecte entre les bernaches et les lemmings!

Les prdateurs communs , dont les plus importants sont :

Le Renard polaire (Alopex lagopus) La Chouette harfang (Nyctea scandiaca)

Pelage d't

Pelage d'hiver

????????????????
Comment relier les cycles dmographiques des bernaches, des
lemmings, et de leurs prdateurs communs?
 Dynamiques des populations des lemmings

Adapts une vie sous la neige (= protection contre les prdateurs)

Trouvs uniquement en Arctique (neige pendant 8 ou 9 mois / an)
Malgr basses tempratures : suffisamment de photosynthse sous la neige (jours jusqu' 24h/24h)
Nourriture non limitante pour densit de lemmings observe

Plusieurs gnrations / hiver

Jeunes fertiles aprs quelques semaines
Jusqu' 3 portes / an chez un adulte ( 50 200 descendants / an)

Pendant l't (court) :

Neige fond deviennent la proie de nombreux prdateurs (Renard polaire, Chouette harfang, Goland
de Taimyr [Larus taimyrensis], Buse pattue [Buteo lagopus], 3 espces de Labbe [Stercorarius pomarinus, S.
parasiticus, et S. longicaudus])
 Avantages / inconvnients de quelques paramtres pour les bernaches

Choix alimentaires des prdateurs :

Renard, Harfang, Goland, Buse, Labbe = Prdateurs gnralistes
Inconvnient (Quand peu de lemmings) : prdateurs consomment aussi ufs et jeunes bernaches
Avantage (Quand beaucoup de lemmings) : bernaches peu attaques (moins de chances d'tre prdates)

Lieux de nidification :
Parfois sur le territoire dun harfang (quand suffisamment de lemmings)
Avantage : exclus d'autres prdateurs
Inconvnient : Risque si pas suffisamment de lemmings ( attaques des bernaches, mme adultes)

Parfois au sein dune colonie de golands (petites les autour de la pninsule)

Avantages :
Golands = indicateurs des les sans renards aprs fonte des glaces
Protection contre dautres rapaces
Excrments stimulent la croissance de la vgtation sur place

Inconvnient :
Golands peuvent attaquer ufs et jeunes des bernaches

Bernaches & lemmings : prdateurs communs Couplage entre leurs cycles dmographiques

???????????????????
Mais :
A quoi est d le cycle des lemmings?
Pourquoi pas une stabilisation chaque t = mme densit de lemmings / mme intensit de prdation?
 Exemple d'un systme "prdateur / proie" spcifique
Lynx et livre forment un systme avec une proie et son prdateur spcifique
Population (Effectifs estims par nombres de peaux Population
lynx du Canada dposes chez la Hudson Bay Company) livre d'Amrique
18000 200000
Attention la
16000 diffrence d'chelles 180000
entre les courbes des
14000 2 effectifs!! 160000
140000
12000
120000
10000
100000
8000
80000
6000
60000
4000 40000
2000 20000
0 0
1820 1840 1860 1880 1900 1920 Anne

Oscillations semblent couples entre effectifs du livre amricain et du lynx canadien

Modle bas sur oscillations stables d'une proie et son prdateur spcifique (Lotka & Volterra, 1920s) :
N = effectif de la proie ; C = effectif du prdateur

dN/dt = rN aCN
(C a un effet ngatif sur N ; N a un effet positif sur C)
dC/dt = -qC + faCN

En fait, les oscillations des livres sont causes par d'autres causes ; les lynx "suivent" la tendance
Le modle n'est pas entirement juste car est en temps continu mais doit tre en temps discret (gnrations)
 Exemple d'un systme "prdateur / proie" spcifique
Hermine et lemmings au Groenland forment un systme avec une proie et son prdateur spcifique
Au Groenland :
Hermine (Mustela nivalis nivalis) : prdateur spcialiste (ne consomme que des
lemmings durant toute l'anne)
Prdateurs gnralistes n'attaquent les lemmings qu'en t (et uniquement quand
sont abondants)
Densit des lemmings Densit des hermines
Observations Prdictions du modle

Attention la diffrence d'chelles entre les courbes des 2 effectifs!!

Modle thorique (bas sur paramtres estims)

prdit quasi exactement les densits observes
des lemmings et hermines
Cycle "proie / prdateur" a thoriquement
tendance se dstabiliser, sauf si proies
limites par leurs ressources (pas le cas ici)

Prdateurs gnralistes stabilisent le cycle car interviennent uniquement lorsque la

densit des lemmings dpasse un certain seuil ( probabilit de choix)
 L'cosystme : flux d'nergie et cycle de matire

Chaleur CO2
: Transfert de Biomasse
avec nergie chimique
Carnivores

Chaleur CO2
CO2 CO2

Chaleur Chaleur

Herbivores Dtritivores Dcomposeurs

Chaleur CO2

Producteurs Matire
primaires Organique morte
Energie
solaire
CO2 Matire minrale
 Le cycle de la matire
CO2

Carnivores

CO2
CO2
CO2

Herbivores Dtritivores Dcomposeurs

CO2

Producteurs Matire Organique

primaires morte
CO2

Cycle de N, P, K,
 Chaleur
L'cosystme : flux d'nergie
Carnivores

Chaleur Chaleur Chaleur

Herbivores Dtritivores Dcomposeurs

Chaleur

Energie solaire Producteurs Iaires Matire Organique morte

Energie solaire Energie chimique

(structure ; "ordonne") (structure ; "ordonne")

Matire organique
(dont macromolcules)

Chaleur Matire minrale

(non-structure ; (non-structure ;
"dsordonne") "dsordonne")

Loi de la thermodynamique :
Dans un systme ferm la quantit d'nergie reste constante

Or : Notre plante ; les cosystmes ; les organismes : sont des systmes ouverts !
 Ple Nord
60 N
Grand angle d'incidence
Rayonnement solaire
30 N
Tropique du Cancer

Angle d'incidence faible ou nul 0 (Equateur)

Tropique du Capricorne
30 S

Grand angle d'incidence

60 S
Ple Sud
Atmosphre

La quantit d'nergie solaire qui atteint la Terre varie suivant la latitude, les conditions
atmosphriques locales, et le relief
L'nergie solaire que reoit un cosystme est un facteur limitant de la productivit primaire nette
("Net Primary Productivity" ; NPP ; Producteurs Iaires)
 Prcipitations annuelles (en cm) NPP (Productivit Primaire Nette)

La NPP est directement lie :

La latitude (flux d'nergie et de ressources)
La NPP est indirectement lie la quantit de
la quantit de matire organique (flux de matire)
carbone organique dans le sol

Carbone organique dans le sol ( 1 m de profondeur) (NPP) %age de

surface
Type d'cosystme
terrestre
(Kcal/m/an) (Kcal/m/jour) merge
Forts tropicales 9000 25 11%
Estuaires 9000 25
3%
Marais & marcages 9000 25
Savanes 3000 8
21%
Prairies tempres 2000 6
Forts tempres
6000 16
dcidues 22%
Fort Borale 3500 10
Toundra 600 2
33%
Dsert < 200 1
 Exemple d'cologie applique : Comprendre le rchauffement climatique
"Effet de serre" = TC gnrale moyenne de surface Rchauffement du climat

Rayonnement solaire : Ondes courtes chauffent la surface de la Terre, puis r-mis sous forme de
rayonnement infrarouge (= Chaleur)

"Effet de serre" = Chaleur pige dans l'atmosphre par certains gaz (H2O ; CO2 ; CH4 ; fluorocarbones ;
Diverses sources [industrielles, mode de vie, ])
Se rchauffent
Re-mettent cette chaleur vers la Terre (plutt que dans l'espace [= permettrait de se refroidir])
 Un milieu en grand changement : l'Arctique
Arctique = un des endroits les plus sensibles au changement climatique

Automne et hiver dans l'Arctique = paisse couche de glace recouvre la surface

Permet le dveloppement des algues = 1er maillon de la chane alimentaire (= producteur Iaire) :
Permet la survie jusqu'aux prdateurs (consommateurs IIaires : ours polaires, phoques, renards
polaires, )
Circulation, protection, et reproduction des proies, ainsi que territoires de chasse des prdateurs
Poissons et mammifres marins se dveloppent et se nourrissent

Surface blanche (= albdo faible)

Absorption rayonnement solaire 0 Absorption du
rayonnement TC de l'Ocan
solaire
Effet de serre :
TC
Rtroaction (="feedback")
= auto-entretien
Amplification du phnomne
l'chelle plantaire
Surface de
l'Ocan
Glaces fondent
(couleur sombre
Changement climatique
= albdo fort)
plantaire (TC )

Changement de couleur de la surface de l'Arctique (Blanc de la glace Sombre de l'Ocan) amplifie

lvation de la temprature, et pousse au changement climatique encore plus radicalement ("auto-
entretien")
Processus d'amplification l'chelle de la Plante (fin du sicle : TC moyenne augmente de 3,5C)
 Un milieu en grand changement : l'Arctique

Baisse de la surface de glace en Arctique depuis 1979

Banquise arctique en aot 2010
(Ligne rose = surface antrieure)

Moyenne 1979-2000 : 7,7 millions de km

pente de la rgression : - 8,9 % / dcennie

Fonte de la banquise et survie de la faune locale

(Ours polaires, manchots, phoques, ) sont lies!
 Un milieu en grand changement : l'Arctique

Consquence du rchauffement climatique = Surface de la Glace ; Surface de l'Ocan

Ouverture de nouvelles routes maritimes!
Intrts stratgiques, commerciaux, et gopolitiques

Essentiellement 2 axes majeurs de passage :

"Route maritime du Nord(-Est)" (Russie)
"Passage du Nord-Ouest" (Canada)

Distances entre ports (kms) selon la route maritime emprunte

Londres - New York - Hambourg -
Itinraire
Yokohama Yokohama Vancouver

Panama 23 300 18 560 17 310

Suez et
21 200 25 120 29 880
Malacca

Cap Horn 32 289 31 639 27 200

Passage du
15 930 15 220 14 970
nord-ouest

Passage du
14 062 18 190 13 770
nord-est

Distance maximale Distance minimale

 Un milieu en grand changement : l'Arctique

Problmes dus l'intervention de l'Homme :

Introduction d'espces "exotiques" ( rupture de l'quilibre tabli dans la communaut)
Surexploitation prsente et venir (pche, exploitation ptrolire, )
Pollution (l'image d'une rgion totalement immacule n'est plus si vraie)
Rchauffement climatique : la surface en glace diminue de 34000 km par an !
 Ecologie applique : prserver la Biodiversit ( "Plan de gestion")

Anthropisation des milieux : Fabrication de nouveaux habitats (agro[co]systmes, milieux urbains, )

Grande richesse en Biodiversit!
Plan de gestion ; But = conserver cette nouvelle Biodiversit en partie cre par laction humaine!

Notion de patrimoine naturel

Zone tropicale : Tout changement cologique est irrversible (en gnral), et reconstruction primaire
est plus lente
Rseau dinteractions est trs long se reconstituer
Mise en place d'cosystmes secondaires beaucoup moins riches

Europe : Activit humaine conduit des cosystmes naturels anthropiss beaucoup plus riches
qu'habitats "naturels"
Dynamique naturelle = fermeture du milieu
= Retour des habitats type "primaire" (paradoxalement = perte de biodiversit!)

Objectif des plans de gestion = freiner la dynamique naturelle de ces milieux!

On ne conserve pas que les habitats primaires ("ultra naturels") nexistent plus trop
! Plan de gestion effectus sur des habitats secondaires
Niveau lgislatif : un site peut tre protg et bnficier d'un plan de gestion si class "Site Natura 2000"
Issu de la directive "Habitat" (= directives europennes)
Objectif = 10% des habitats nationaux protgs (critre dentre dans l'Union europenne)

Objectifs du rseau "Natura 2000" :

Evaluer les sites
Les classer par type dhabitat
Dfinir pour chaque type dhabitat les moyens les plus adapts pour les prserver / amnager

http://www.natura2000.fr

Dmarche :
1) Rendre le site ligible "Natura 2000"
= Dcrire le site daprs les relevs floristiques La premire approche est donc botanique
2) Mise en place dun plan de gestion = programme propos pour grer lhabitat
3 tapes principales :
Diagnostic cologique de la zone retenue
Identification des menaces
Proposition de gestion
Propos par la structure responsable du site (parc naturel rgional, )
Validation par ministre ou DIREN ("DIrection REgionale de l'ENvironnement")
Valable pour 5 annes (puis rvalu pour reconduction ventuelle)
 Les zones classes Natura 2000 dans le dpartement du Nord
Site d'intrt communautaire (SIC) Zone de protection spciale (ZPS)
 Cas dtude : Plan de gestion dans la commune de Rametz (Avesnois)
Etude ralise en 2004, lors d'un stage de Master 2 "Ecologie" ("Gestion et Evolution de la Biodiversit")

1) Diagnostic cologique de la zone retenue :

a) Milieu physique (= "Biotope")

Prairies
Mas embroussailles Climat (temprature, pluviomtrie)

Topographie gologique
Stade
prforestier Types de sols (schistes, argile, craie, etc)
Ici : seulement calcaire

Pelouse
Mas
b) Utilisation du milieu (par la Biocnose)
Mare
2 parcelles entoures par des champs de mas
Mas Carte de vgtation Ici: 3 habitats diffrents
Sentier
Pelouse : hauteur 10 cm (= herbaces)
Milieu trs riche en espces
Prairies embroussailles : hautes herbaces +
quelques ligneux
Milieu plus dense
Mas Stade prforestier : jeune fort
Disparition herbaces apparition arbustes/arbres
 Cas dtude : Plan de gestion dans la commune de Rametz (Avesnois)
Etude ralise en 2004, lors d'un stage de Master 2 "Ecologie" ("Gestion et Evolution de la Biodiversit")

1) Diagnostic cologique de la zone retenue :

c) Distribution et dynamique des zones de vgtation ( approche botanique)
En 1998 En 2004
Prairies
Mas Mas embroussailles

Stade
prforestier

Pelouse
Mas Mas

Mare

Mas Mas Sentier

Mas Mas
1) Diagnostic cologique de la zone retenue :
d) Localisation des espces patrimoniales et remarquables ( approche botanique)

Tableau phytosociologique et Indice Patrimonial ("I.P.")

Espces I.P. Pelouse Prairie embroussaille Stade Prforestier Indice Patrimonial :
Orchis ustulata* 100 + "0" : Espces invasives
Gymnadenia conopsea 10 1 "10" : Espces assez rares et intressantes
Plathanthera chlorantha 10 2 "100" : Espces trs rares
Polygala calcarea* 100 +
Bromus erectus 1 3 2 Densit de prsence (par quadrat) :
"+" : Qques inds (pas assez pour estimation)
Briza media 1 1
"1" : < 5% recouvrement
Thymus praecox 1 1 1 "2" : 5-25%
Sanguisorba minor 1 1 "3" : 25-50%
Avena pubescens 1 2 etc
Polygala vulgaris 1 1
Linum catharticum 1 1
Ophris apifera* 10 1 1
Cornus sanguinea 1 + 2
Ligustrum vulgare 1 + 2
Crataegus monogyna 1 + 1
Hedera helix 1 + 1 3
Juniperus communis 10 + +
Pyrola rotundifolia* 100 + +
Listera ovata 1 1
Orchis purpurea 1 1
Sanicula europea 1 1
Prunus avium 1 1
Reynoutria japonica* 0 2 +
Fagus sylvatica 1 +

Espces diffrentes selon milieux

Biodiversit : pelouse (milieu ouvert) > prairie > fort (milieu ferm)
Valeur patrimoniale = plus forte pour pelouses
1) Diagnostic cologique de la zone retenue :
d) Localisation des espces patrimoniales et remarquables ( approche botanique)
Espces patrimoniales Espces remarquables

Mas

Ophrys apifera Reynoutria japonica

Mas Arbres remarquables

- Merisier (Prunus avium)
- Genvrier (J. communis)
Orchis ustulata

Mas

Polygala calcarea

Mas
Pyrola rotundifolia
2) Identification des menaces :

Progression du bois
Biodiversit ; disparition des espces fort Indice Patrimonial
Sentier (pitinement par les passants)
Espce invasive : Renoue du Japon (expansion rapide)
Se situe souvent sur des zones de transition cologiques et milieux perturbs (nitrophiles) (ici = proche
de champs)
Fragmentation du milieu (rserves entoures de champs) = risques possibles d'isolement des populations
Rupture des flux migratoires / de gnes

Autres menaces frquemment rencontres :

Dcharges "sauvages" d'ordures

Lignes haute tension ( oiseaux migrateurs, grands rapaces, )
Cvennes : lignes haute tension enfouies pour la protection des vautours
Chasse (rserves ne sont pas forcment "intgrales")
3) Proposition de plan de gestion :
a) Ouvrir le milieu (= entretien d'une forte Biodiversit)

Mas Prairies Mas

embroussailles

Stade
prforestier

Mas Mas
Pelouse

Mas Mare Mas

Sentier

Mas Arbres Mas

remarquables

= Permettre lextension des zones herbaces

Abattage (ligneux ; trononneuse)

Laisser toutefois un peu de stade prforestier : oiseaux + insectes qui s'y maintiennent
Garder les merisiers = mosaque dhabitats :
Limite les perturbations de la faune des stades ferms
Augmente la diversit au niveau de la parcelle
Laisse intact le secteur des plantes invasives (vite la propagation par graines ou boutures)

Fauche (prairies ; dbroussailleuse)

3) Proposition de plan de gestion :
a) Ouvrir le milieu (= entretien d'une forte Biodiversit)

Que faire des coupes?

Si laisses sur place pourrissement installation dune flore nitrophile (type "ortie")

Exportation (incinration, dcharge, revente des industriels) appauvrit le sol

Favorise les espces rares et herbaces

Mais, si coup une seule fois milieu va de nouveau se refermer

Comment maintenir le milieu ouvert?

Coupe rgulire?
Chantiers trs lourds (beaucoup de travail)
Aspect "sociologiques" ngatifs ( les gens naiment pas quon coupe les arbres!)

Une solution utilise :

Pturage par herbivores (moutons, vaches, chevaux, ) extensif ou intensif sur priodes courtes (=
transhumances) (cf. actuellement sur Campus de Lille 1)
= Aspects pdagogiques positifs
3) Proposition de plan de gestion : Ecologie gnrale - Henk van Dijk - 2009
b) Remdier la fragmentation des parcelles (= mise en place de connections haies + bandes enherbes)

Mas Prairies
embroussailles

Stade
prforestier

Mas
Pelouse

Mas
Mare

Sentier

Mas Arbres
remarquables

Connections = corridors pour les dplacements des espces

Haies (procd souvent utilis) = dplacement des espces de sous-bois (oiseaux)
Bandes enherbes = dplacement des espces de prairies et pelouses (rongeurs, insectes, amphibiens)

Inconvnients :
Demande de l'entretien
Empite sur les surfaces agricoles
Nouvelles directives europennes ("Contrat Agriculture Durable") devraient favoriser ces dmarches au
niveau des exploitations agricoles
3) Proposition de plan de gestion :
c) Mise en place du suivi dmographique des espces rares et invasives

Mas Prairies
embroussailles

Stade
prforestier

Mas
Pelouse

Mas
Mare

Sentier

Mas
Arbres
remarquables

Espces invasives : Surveiller leur devenir (aucune solution actuelle pour maintenir ou faire rgresser
ces espces)
(Parfois mme effet inverse : mieux vont donc surveiller plutt qu'agir)

Espces rares : le suivi permet de valider le plan de gestion

Dynamiques particulires des populations d'espces rares et invasives :

Prdire l'volution des effectifs en fonctions des paramtres du milieux et de lois mathmatiques simples
Frontire entre cologie fondamentale et applique (Gestion / Conservation)
3) Proposition de plan de gestion :
d) Protection de la parcelle (= fermeture de chemins, acquisition foncire, sentiers dinterprtations

Mas Prairies
embroussailles
Plusieurs niveaux possibles de protection :
Totalement inaccessible (= "Rserve intgrale")
Inaccessible au public, mais gestion possible Stade
prforestier

Mas
Pelouse

Mare
Acquisition
foncire Sentier
Fermeture de chemins o espces rares sont concentres
Mise en place de dviations
= crer un autre chemin = souvent acquisition foncire Mas
Arbres
Partie dlicate : acquisition par structure ou commune remarquables

Formation d'un sentier en boucle

Plus facile pour visites de groupes
Guide le public et vite passages trop frquents dans certaines zones

Sensibilisation
Sentiers d'interprtation "Natura 2000" (= dans la charte)
Viser plusieurs publics Rserve situe en milieu urbain :
Rflchir sur le contenu pdagogique Public nombreux
Valeur patrimoniale forte
Accueil du public
Structures "en dur" (expositions, documentations)
Infrastructures (Parkings, aires de pic-nic ; accessibilit aux personnes handicapes, )
 Mise en place d'un plan de gestion :

Synthse et intgration l'interface biologie ; lgislatif ; politique ; sociologie ;

pdagogie
Implique souvent :
Intervention d'cologues, enseignants, sociologues
Coopration avec agriculteurs, voisins, chasseurs, (parfois) paysagistes, ...

Formation pour y accder : Master 2 "Ecologie"

"Gestion et Evolution de la Biodiversit" (GEB)

Plus d'informations sur :

http://master-ecologie.univ-lille1.fr