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UNIVERSITE INTERNATIONALE ABULCASIS DES SCIENCES DE LA SANTE RABAT

PLAN DU COURS
ELEMENT DE MODULE : VIROLOGIE
1. Identification du module

UPR UPR Microbiologie


Titre du module Microbiologie-Immunologie
Code du module 2S3MD15
Elment du module Virologie
Coordinateur Pr El Ouenass
Population cible Etudiants concerns : 2me anne Mdecine
Enseignants participants au Pr M. SEFFAR
Module
Session 1er Semestre
Volume horaire total : 22 h
Nb dheures / sance : 2h
Volume horaire
Localisation des sances dans la semaine : Vendredi de
8h 12h
Salles 14-15, Universit internationale Abulcasis des
Lieu
Sciences de la sant de Rabat (UIASS)
Site Web :
Pr Myriam SEFFAR
Contact e mail : myriamseffar@yahoo.fr
m.seffar@chis.ma

2. Introduction
Place de llment de module Virologie dans le cursus de formation :

Prsentation de llment de module Virologie


UNIVERSITE INTERNATIONALE ABULCASIS DES SCIENCES DE LA SANTE RABAT

Llment de module Virologie est dispens la deuxime anne de Mdecine et


fait partie du module Microbiologie-Immunologie qui englobe en plus la
Bactriologie et lImmunologie.
Cet lment de module vise faire acqurir aux futurs mdecins les connaissances
de base en Virologie, indispensables lacquisition de comptences pour la prise en
charge des maladies infectieuses dorigine virale.

But de llment de module Virologie :

Le but de lenseignement de Virologie est de permettre au futur mdecin de situer


les virus pathognes pour lhomme dans le monde du vivant, de dfinir leur
structure, rplication, modes de transmission, de dcrire les mthodes
diagnostiques dune infection virale et matriser les principes de base de leur
prvention et de leur traitement.

Description gnrale :
Llment de module Virologie comporte 13 cours : 8 cours de 2 h et 5 cours de 1
h

1. Structure et classification des virus (2h)


2. Multiplication intracellulaire des virus (2h)
3. Mcanismes gnraux des infections virales (1h)
4. Diagnostic virologique : mthodes classiques et molculaires (2h)
5. Orthomyxoviridae (2h)
6. Paramyxoviridae (1h)
7. Herpesviridae (2h)
8. Picornaviridae (1h)
9. Virus des hpatites transmission entrale (2h)
10. Virus des hpatites transmission parentrale (2h)
11. Retroviridae (2h)
12. Togaviridae (1h)
13. Rhabdoviridae (1h)

3. Les objectifs dapprentissage

Objectifs gnraux
1- Acqurir les connaissances virologiques fondamentales.
2- Comprendre les maladies infectieuses virales.
3- Dcrire les mthodes de diagnostic virologique.

Programme et objectifs spcifiques

Prsentation de llment de module Virologie


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Cours n1 : Structure et classification des virus Dure : 2 h

Objectifs Contenus essentiels (titres de chapitres)


- Dfinir un virus. - Structure des virus : gnome, capside, enveloppe.
- Citer les particularits des virus dans le monde - Classification des virus ( International Committee on
du vivant (bactries, parasites,..). Taxonomy of Viruses , ITCV).
- Dcrire la structure gnrale dun virus.
- Citer les critres de classification des virus.

Cours n2 : Multiplication intracellulaire des virus Dure : 2 h

Objectifs Contenus essentiels


- Prciser les conditions ncessaires la - Multiplication dun virus : Elments ncessaires la
multiplication dun virus. biosynthse cellulaire des virions (rplication).
- Expliquer les tapes de la multiplication virale - Cycle de multiplication virale : attachement, pntration,
dans une cellule. dcapsidation, rplication, assemblage, libration.
- Consquences de la multiplication virale pour la cellule
infecte.

Cours n3 : Mcanismes gnraux des infections virales Dure : 1 h

Objectifs Contenus essentiels


- Dcrire les modes de propagation des virus - Propagation du virus dans lorganisme : voies de
dans lorganisme. pntration, diffusion du virus, organes cibles, voies
- Distinguer entre virus nus et virus enveloppe dexcrtion.
en termes de rsistance aux conditions physico- - Les diffrents types dinfection virale : infections aiges,
chimiques infections persistantes.
- Expliquer laide dexemples les modes de
-Facteurs intervenant dans la pathognse : facteurs lis au
transmission et les diffrents types dinfections
virus, facteurs lis lhte.
virales.

Cours n4 : Diagnostic virologique : mthodes classiques et molculaires Dure : 2 h


Objectifs Contenus essentiels
- Dcrire le mode de recueil et dacheminement - Nature, recueil et transport des prlvements virologiques
au laboratoire des prlvements pathologiques -Techniques de diagnostic direct : microscopie lectronique,
destins lanalyse virologique. dtection immunologique des constituants antigniques du
- Dcrire les techniques de diagnostic direct et virus, culture cellulaire.
indirect des infections virales. -Techniques de diagnostic indirect : technique
-Dcrire le principe de lhybridation molculaire immunoenzymatique de type ELISA, technique dimmuno-
et son application en virologie humaine. empreinte (Western Blot, Immunoblot), technique
-Dcrire le principe des mthodes dimmunofluorescence indirecte.
damplification gnique et leurs applications -Mthodes dhybridation molculaire et damplification
en virologie humaine. gnique : principe, intrt, limites et applications en
virologie clinique

Prsentation de llment de module Virologie


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Cours n5 : Orthomyxoviridae Dure : 2 h


Objectifs Contenus essentiels
- Dcrire le schma gnral de la structure des 1. Caractres gnraux des virus influenza
virus influenza. 2. Multiplication des virus influenza
-Dcrire l'organisation gnomique et les 3. pidmiologie
caractres antigniques des virus influenza. 4. Physiopathologie de linfection grippale
-Dcrire lpidmiologie et la physiopathologie 5. Diagnostic virologique
de linfection grippale. 5.1. Indications
- Dcrire les indications et la mise en uvre du 5.2. Diagnostic direct : prlvements et transport, Isolement
diagnostic virologique. viral, identification des virus influenza (types, sous-types et
variants), dtection des antignes viraux, dtection du
gnome viral par RT-PCR
5.3. Diagnostic srologique : prlvements et techniques

Cours n6 : Paramyxoviridae Dure : 1 h


Objectifs Contenus essentiels
-Dcrire le schma gnral de la structure des virus 1. Caractres gnraux des Paramyxoviridae
de la famille des Paramyxoviridae. 2.Multiplication des virus : VRS, PIV, oreillons, rougeole
- Dcrire l'organisation gnomique et les caractres 3.pidmiologie : VRS, PIV, oreillons, rougeole
antigniques des virus de la famille des 4. Physiopathologie : VRS, PIV, oreillons rougeole
Paramyxoviridae. 5. Diagnostic virologique
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie des 5.1. Indications
infections Paramyxoviridae. 5.2.Diagnostic direct : prlvements et transport,
- Dcrire les indications et la mise en uvre du isolement viral, dtection des antignes viraux,
diagnostic virologique des infections dtection du gnome viral par RT-PCR
Paramyxoviridae. 5.3.Diagnostic srologique : prlvements et techniques

Cours n7 : Herpesviridae Dure : 2 h


Objectifs Contenus essentiels
1. Caractres gnraux des Herpesviridae
- Dcrire le schma gnral de la structure des
2. Epidmiologie
virus de la famille des Herpesviridae.
3. Physiopathologie : tropisme cellulaire, organes cibles,
- Dcrire l'organisation gnomique et les
sige de l'infection latente.
caractres antigniques des herpesvirus
4. Diagnostic virologique
humains.
4.1. Indications
- Expliquer l'pidmiologie et les particularits
4.2. Diagnostic direct : prlvements et transport, isolement
de la physiopathologie des diffrents
viral, dtection des antignes viraux
herpesvirus humains.
(immunocytodiagnostic, ELISA), dtection du gnome viral
- Dcrire les indications et la mise en uvre
par PCR qualitative et quantitative
des diffrents examens virologiques pour le
4.3.Diagnostic indirect : prlvements, techniques et
diagnostic.
interprtation des rsultats

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Cours n8 : Picornaviridae Dure : 1 h

Objectifs Contenus essentiels


- Dcrire le schma gnral de la structure des 1. Caractres gnraux des Picornaviridae
virus de la famille des Picornaviridae. 2. Epidmiologie : rservoir, transmission, zone de diffusion
- Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie 3. Physiopathologie
des infections entrovirus. 4. Diagnostic virologique
- Dcrire les indications et la mise en uvre du 4.1. Contexte du diagnostic
diagnostic virologique des infections 4.2. Diagnostic direct : prlvements et transport, isolement
entrovirus et rhinovirus. viral, identification du srotype viral, dtection du gnome
viral par RT-PCR
4.3. Diagnostic srologique: raction de sroneutralisation
du pouvoir infectieux en culture cellulaire utilisant la souche
du malade

Cours n9 : Hpatites transmission entrale Dure : 2 h

Objectifs Contenus essentiels


- Dcrire le schma gnral de la structure des 1. Caractres gnraux des virus
virus responsables dhpatites entrales. 2.Epidmiologie: rservoir, transmission, zone de diffusion
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie, 3. Physiopathologie
des infections virus de lhpatite A et E 4. Diagnostic virologique
- Dcrire les indications et la mise en uvre du 4.1. Indications
diagnostic virologique des infections virus de 4.2. Diagnostic indirect : diagnostic srologique par
lhpatite A et E. mthode ELISA (IgM et IgG).
4.3. Diagnostic direct : dtection du gnome par RT-PCR
dans le plasma et/ou dans les selles

Cours n10 : Hpatites transmission parentrale Dure : 2 h

Objectifs Contenus essentiels


- Dcrire la structure et lorganisation gnomique 1. Caractres gnraux des virus HBV, HDV et HCV
des virus HBV, HDV, HCV. 2. Epidmiologie
- Dcrire lpidmiologie et la physiopathologie des 3. Physiopathologie
virus HBV, HDV, HCV. 4. Diagnostic virologique
- Dcrire les indications, la mise en uvre des 4.1. Diagnostic direct : mise en vidence du virus et/ou
diffrentes techniques utiles pour le diagnostic et la de ses constituants (techniques ELISA,
surveillance virologique des infections par HBV, HDV immunohistochimie, techniques damplification par PCR
et HCV.
qualitative et quantitative, techniques de gnotypage,
squenage)
4.2. Diagnostic indirect : prlvements, techniques
ELISA, cintique des marqueurs virologiques dans le
srum en cas dhpatite aigu et chronique.

Prsentation de llment de module Virologie


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Cours n11 : Retroviridae- Les virus de l'immunodficience humaine (VIH1 et 2) Dure : 2 h

Objectifs Contenus essentiels


-Dcrire la structure, lorganisation gnomique, 1. Caractres gnraux des virus HIV
et le mode de rplication du VIH. 2. Epidmiologie
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie, 3. Physiopathologie
de l'infection par le VIH. 4. Diagnostic virologique
-Dcrire les diffrentes techniques de diagnostic 4.1. Indications
virologique utilises pour le diagnostic et le 4.2.Diagnostic indirect: prlvements, tests de
suivi thrapeutique des sujets infects par les
dpistage/ELISA, tests rapides, tests de confirmation par
VIH.
Western Blot ou Immunoblot.
4.3. Diagnostic direct : mise en vidence du virus et/ou de
ses constituants (antignmie p24, recherche qualitative et
quantitative de lARN viral par PCR, surveillance biologique
des traitements antirtroviraux)

Cours n12 : Togaviridae- Rubivirus Dure : 1 heure

Objectifs Contenus essentiels


- Dcrire le schma gnral de la structure du 1. Caractres gnraux du virus de la rubole
virus de la rubole. 2. Epidmiologie
- Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie, 3. Physiopathologie
de l'infection virus de la rubole 3.1. La rubole de lenfant et de ladulte (notions de primo-
- Dcrire les indications et la mise en uvre de infection et rinfection).
la srologie virale. 3.2. La rubole congnitale
4. Diagnostic virologique
4.1. Contexte du diagnostic: dpistage systmatique,
dpistage effectu dans un contexte clinique vocateur,
diagnostic de linfection congnitale.
4.2. Diagnostic srologique : prlvements et techniques de
diagnostic

Cours n13 : Rhabdoviridae- Lyssavirus Dure : 1 heure

Objectifs Contenus essentiels


- Dcrire le schma gnral de la structure des 1. Caractres gnraux du virus de la rage
Lyssavirus. 2. pidmiologie
-Dcrire l'pidmiologie et la physiopathologie 3. Physiopathologie
de la rage humaine. 4. Diagnostic virologique
-Dcrire les indications et la mise en uvre des 4.1. Objectifs du diagnostic
examens virologiques utiles pour le diagnostic 4.2. Diagnostic direct : prlvements et techniques
de la rage. 4.3. Diagnostic srologique

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4. Les mthodes denseignement et les activits dapprentissage

Mthodes denseignement de la Virologie

Cours magistral illustr


Sances de rvision
Contrles continus

Mthodes dapprentissage :

Cours magistral illustr interactif: la prsence est obligatoire, le


contenu du cours et le support dimages permettra de mieux
mmoriser les cours de virologie fondamentale sous tous ses aspects.

5. Modalits dvaluation

En fin de semestre, date fixe par lUniversit: preuve de


Microbiologie-Immunologie incluant les programmes de
Bactriologie, Virologie et Immunologie.
Dure : 30 min / 2h (dure totale de lpreuve)
Modalits: QCM
Note de lpreuve de Virologie : sur 20 (30% du module)

6. Autres informations

Personnes ressources : coordinateur du module et enseignant


de llment de module
Rfrences recommandes
*Trait de Virologie mdicale. Jean-Marie Huraux, Jean-
Claude Nicolas, Henri Agut, Hlne Peigue-Lafeuille. Editions
ESTEM De Boeck, 2003.
* Virologie mdicale. Collection Azay. A. Mammette.
Presses universitaires de Lyon, 2002.
* Prcis de Virologie humaine. Coordonn par Alain Le
Faou. Biosciences et techniques 2012.

Prsentation de llment de module Virologie