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Herana Extranuclear

Karla Yotoko
Departamento de Biologia Geral DBG UFV
Viosa, 27 de outubro de 2008.
Introduo

Quando estudamos gentica, principalmente gentica bsica, acabamos por solidificar a idia de
que a hereditariedade se concentra nos cromossomos, que por sua vez localizam-se no ncleo das
clulas. Quando Mendel props as leis da hereditariedade, no sabia onde seus fatores (genes) se
localizavam, sabia apenas que um carter herdado dos parentais (um masculino e um feminino) e que
o fentipo depende da combinao dos fatores herdados (gentipo). O avano da biologia clelular
mostrou que os genes se localizam nos cromossomos, j que os cromossomos se comportavam, durante
a meiose e a mitose, exatamente como os genes ou os fatores de Mendel.

A partir da, o problema da hereditariedade estava praticamente resolvido: bastava ento saber
qual das molculas que compem os cromossomos a verdadeira responsvel pela hereditariedade.
Muitos anos de estudos e um acmulo enorme de evidncias levaram descrio da estrutura do DNA
(Watson e Crick, 1953), que por sua vez permitiu que fosse inferido um mecanismo de replicao, que
mais tarde se mostrou verdadeiro. Definidos estrutura e forma de replicao, e logo depois transcrio e
traduo, estava definitivamente resolvido o problema da hereditariedade. Numa viso reducionista
disso, somos o resultado da expresso de nossos genes, que por sua vez foram herdados de nossos pais,
que herdaram dos pais deles e assim por diante at o ancestral comum a todos ns, que viveu h mais
de trs bilhes de anos, no incio da vida na Terra.

claro que sempre soubemos que o fentipo o resultado da combinao da expresso dos
nossos genes e do ambiente. Como muito difcil medir o quanto de cada caracterstica influenciado
pelos genes ou pelo ambiente, em geral esta combinao fica subentendida nos textos de gentica.

No entanto h caractersticas que no so herdadas de ambos os parentais. Estas caractersticas


em geral so herdadas apenas de nossas mes, ou das mes de todos os organismos sexuados. So
caractersticas citoplasmticas, herdadas do citoplasma do vulo que deu origem ao zigoto. Lembre-se
que durante a fecundao, apenas o ncleo do espermatozide penetra no vulo e se funde com o
ncleo do mesmo. Com isso, todas as organelas citoplasmticas, bem como o prprio citosol, so
herdados da fmea.

Mitocndrias e Cloroplastos

Dentre as organelas citoplasmticas de eucariotos, as mitocndrias se destacam por possuir um DNA


prprio. Se pensarmos em organismos fotossintticos, como as plantas, alm das mitocndrias, os
cloroplastos tambm esto presentes, e estes tambm possuem um DNA prprio, independente do DNA
do ncleo.
Vrias teorias foram propostas para explicar a existncia destas organelas com o prprio material
gentico. Uma delas postula que tanto mitocndrias quanto cloroplastos tiveram origem em fragmentos
de membrana da prpria clula e fragmentos do DNA da mesma, ou seja, que estas organelas tiveram
origem da prpria clula eucaritica.

Outra teoria, que hoje a mais aceita, e logo voc entender porque, prope que mitocndrias
e cloroplastos se originaram a partir de bactrias de vida livre que foram fagocitadas pelo ancestral dos
eucariontes, um organismo heterotrfico anaerbico primitivo.

Para distinguir entre uma teoria e outra foram utilizados mtodos filogenticos, ou de
comparao de organismos para tentar inferir graus de parentesco (Ver Box-1).

Felizmente existem milhes de seqncias disponveis, ento foi possvel comparar as


seqncias do DNA de mitocndrias e cloroplastos com as seqencias de todos os organismos presentes
nos bancos pblicos de dados.

Os resultados revelaram que as seqncias de DNA de mitocndrias so muito mais parecidas


com as seqencias de DNA de bactrias de vida livre que com seqncias nucleares de qualquer
eucarioto. Mais especificamente, as seqncias de DNA de mitocndrias so muito prximas a
seqncias das -proteobactrias. Por outro lado, seqncias de cloroplastos apresentam alta
similaridade com seqncias de cianobactrias. Portanto, nenhuma dessas organelas se originou a partir
do ncleo e sim de diferentes bactrias de vida livre. O Box-2 conta um pouco desta histria.

Genes Mitocondriais e Plastidiais

A comparao do genoma completo das mitocndrias com o genoma completo de -


proteobactrias sugere que as mitocndrias perderam muitos de seus genes ao longo do tempo. Alguns
deles devem de fato ter sido perdidos, mas a maioria foi, de alguma forma, transferida para o ncleo da
clula. Nas clulas da maioria dos animais, por exemplo, as mitocndrias possuem apenas cerca de 37
genes, sendo 13 deles codificadores das protenas pertencentes cadeia de fosforilao oxidativa, dois
que so traduzidos em RNAs ribossmicos e 22 que so traduzidos em t-RNAs.

Por outro lado, cerca de 900 protenas mitocondriais so codificadas por genes nucleares.
Possivelmente a maioria destes genes era de genes da bactria original que migraram para o ncleo.
Estes genes so transcritos em mRNAs que so traduzidos no citoplasma das clulas. As protenas
resultantes so marcadas com seqncias sinalizadoras acrescentadas s suas extremidades amino-
terminais. Depois de produzidas e retiradas do ribossomo, as protenas mitocondriais so modificadas
por chaperonas e encaminhadas a receptores no exterior das membranas das mitocndrias.
Mecanismos de transporte especficos encaminham as protenas a seu destino final na organela e s
depois disso as protenas sinalizadoras so retiradas. Este tipo de marcao tambm ocorre nas
protenas dos cloroplastos que so produzidas pelo ncleo das clulas.

Cdigo gentico das mitocndrias mas o cdigo no era universal?


Apesar de o cdigo gentico ser em geral apresentado como universal (figura 2A), existem
algumas excees, como as mitocndrias, algumas bactrias e alguns eucariotos unicelulares, que
apresentam pequenas diferenas, ou seja, um mesmo cdon pode significar um aminocido em um
organismo e outro aminocido, ou um cdon de parada num segundo organismo. Conforme j
mencionado, as mitocndrias produzem apenas uma pequena parte (10 a 20) das centenas de protenas
que utilizam. Para produzir estas protenas, contam com seus prprios t-RNAs. Isso significa que o cdigo
gentico diferenciado das mitocndrias no afeta as protenas do ncleo.

A B

Fig. 2. A - Cdigo gentico universal, encontrado na maioria dos organismos. B- Cdigo gentico encontrado nas
mitocndrias.

A modificao mais comum do cdigo encontrada nas mitocndrias envolve os cdons de


terminao (figura 2, tabela 1). Conforme j mencionado, as mitocndrias animais produzem apenas 22
tRNAs, que so capazes de transportar todos os aminocidos graas a um pareamento oscilante entre
cdon e anticdon nas mitocndrias. Isso possvel porque em algumas famlias de cdons (nas quais
um aminocido determinado completamente determinado pelas duas primeiras bases do cdon),
apenas um tRNA, que tem um resduo de Uracila na primeira posio do anti-cdon (que se pareia com a
terceira posio do cdon), o responsvel pelo transporte do aminocido.

Outros tRNAs reconhecem cdons tanto com A ou G na terceira posio do cdon (o tRNA do
triptofano, ou da metionina, por exemplo), outros ainda reconhecem U ou C (o tRNA da cistena, ou da
fenil-alanina). Portanto, quase todos os tRNAs mitocondriais reconhecem dois ou quatro cdons
diferentes.

OBS: A quantidade de tRNAs no genoma nuclear varia de espcie para espcie. Pelo nmero de
cdons que codificam aminocidos no cdigo universal, seria de se esperar que houvesse 61 tRNAs
diferentes (64 cdons 3 cdons stop = 61 cdons). No entanto, em algumas espcies, h mais do que
61 tRNAs e em outras menos que isso. Isso se explica pelo fato de que alguns cdons tenham mais de
um tRNA; enquanto vrios cdons podem ser supridos pelo mesmo tRNA, como no caso das
mitocndrias.

Fig. 3 - Pareamento cdon-anticdon durante a traduo de protenas. Nas mitocndrias, o cdigo gentico
diferente do universal, e grande parte dos cdons no apresentam pareamento nas trs bases. Este tRNA, por
exemplo, codifica a treonina (trh), seja qual for o cdon para treonina presente no mRNA.

No cdigo usual, somente dois aminocidos so codificados por cdons exclusivos: metionina e
Triptofano (ver figura 2). Se todos os cdons codificam mais de um aminocido nas mitocndrias,
esperaramos mais de um cdon para estes dois aminocidos. De fato, uma das principais diferenas
entre o cdigo usual e o mitocondrial o uso do cdon UGA, cdon de parada no cdigo usual, como
codificador do triptofano nas mitocndrias. Com isso, o triptofano inserido quando o cdon UGA ou
UGG. A metionina inserida tanto na presena de AUG (igual ao cdigo universal), quanto na presena
do cdon AUA, que codifica a isoleucina no cdigo usual.

Tabela 1: Significado usual dos cdons (cdigo gentico universal) e o significado modificado em
mitocndrias.

Cdon Usual Mitocondrial


UGA Stop Trp
AGA Arg Stop
AGG Arg Stop

AUA Ile Met

AGA Arg Ser


DNA citoplasma tico e herana materna

Os primeiros indcios de que nem toda a herana dos eucariotos se concentra no ncleo das
clulas provieram de caractersticas que eram herdadas exclusivamente de linhagens maternas (ou seja,
o gentipo do pai no interferia no fentipo da prole). Diversas doenas esto associadas herana
citoplasmtica (presente em mitocndrias e cloroplastos) em diversas espcies de animais, fungos e
plantas.

Repare que a herana citoplasmtica diferente da herana ligada aos cromossomos sexuais.
Neste caso, machos e fmeas possuem, por exemplo, o cromossomo X (no sistema XY de determinao
do sexo). Com isso, os cruzamentos recprocos produzem resultados diferentes daqueles esperados nos
cromossomos autossmicos. No caso da herana mitocondrial ou plastidial, toda a prole tem o fentipo
condicionado pelo gentipo da me, j que apenas o vulo capaz de transmitir as organelas para a
prxima gerao.

Se pensarmos na tecnologia de clonagem de mamferos, um vulo no fecundado tem seu ncleo retirado e em
seu lugar colocado um ncleo diplide de um outro indivduo a rigor estes indivduos no vo ser iguais, j que
a herana citoplasmtica ser distinta!

Mitoco ndrias e Cloroplastos nos estudos de evolua o humana

Como a herana das mitocndrias exclusivamente materna, possvel rastrear uma mesma
linhagem atravs das geraes, sem interferncia de recombinaes como ocorre com o genoma
nuclear.

Em estudos envolvendo indivduos da mesma espcie, o DNA mitocondrial revelou-se


especialmente til, j que a taxa de evoluo dos genes mitocondriais seja muito mais alta que a
apresentada por genes nucleares. Isso talvez se explique pelo fato de que a mitocndria produz radicais
livres durante a fosforilao oxidativa, o que aumenta a taxa de mutao do DNA mitocondrial em
relao ao nuclear.

Este tipo de abordagem em estudos de evoluo humana vem revelando parte de nossa histria,
tanto de migrao da frica para os outros continentes quanto da sia para a Amrica, e at mesmo
aspectos da histria do Brasil. Um estudo recente revelou que uma amostra da populao brasileira que
se auto-declarava como branca apresenta mitocndrias de origem Africana, Europia e Asitica (que
tambm so as mitocndrias dos amerndios) em igual proporo (Alves-Silva et al. 2000). Por outro
lado, quando so avaliados os cromossomos Y, tambm de uma amostra de indivduos auto-declarada
branca, a maioria tem origem europia (Carvalho-Silva et al. 2001). Isso significa que um mesmo
indivduo pode ter a mitocndria de origem africana, o cromossomo Y de origem europia e se auto-
declarar branco. Com isso, muito complicado definir raas na espcie humana tomando como base
marcadores genticos.
Box1 - Mtodos de Comparao de Organismos.

Em estudos evolutivos, existem mtodos que nos permitem comparar


diferentes organismos e tentar elucidar os graus de parentesco entre eles. Estes
mtodos se baseiam principalmente em similaridades apresentadas por diferentes
organismos, que podem ser medidas em caractersticas morfolgicas, fisiolgicas,
bioqumicas, comportamentais etc. A partir destes mtodos foi possvel estabelecer
nosso parentesco com outros primatas, em especial com os chimpanzs, que
parecem ser nossos parentes mais prximos.

Molculas de DNA tambm so utilizadas neste tipo de comparao. Para isso,


basta seqenciar um determinado fragmento em vrias espcies distintas e
simplesmente contar quantas bases diferentes h entre cada par de espcies. A
partir disto, obtemos uma matriz de distncia gentica entre estas espcies, e
podemos agrupar as mais prximas. Dizemos que quanto menor for o nmero de
substituies de nucleotdeos (mutaes de ponto) entre duas espcies, menor a
distncia entre elas e, portanto, maior o parentesco evolutivo (compartilham um
ancestral comum recente).

Veja a figura 1. Nela, temos uma representao da distncia evolutiva entre


trs espcies imaginrias, A, B e C. Poderamos chamar A de homem, B de
chimpanz e C de orangotango se voc se sentir mais vontade.

Quando este mtodo foi aplicado a mitocndrias, foram comparadas


seqncias de mitocndrias de diversos organismos com seqncias do DNA
genmico destas espcies, bem como com seqncias de bactrias de vida livre
(vrias espcies). Esta anlise mostrou que as seqncias de mitocndrias so
geneticamente mais prximas das seqncias de -proteobactrias que de qualquer
outro conjunto de seqncias. (considere agora que A na figura 1 representa
sequencias de mitocndrias, B representa seqncias de cianobactrias e C
representa seqncias do genoma nuclear de eucariotos). Isso mostrou a origem
endossimbionte das mitocndrias.

O mesmo experimento foi feito com seqncias de cloroplastos, que se


mostraram mais prximas a seqncias de cianobactrias.
Box2 - Teoria Endossimbionte

Pela hiptese endossimbionte, mitocndrias e cloroplastos so descendentes de


bactrias que algum dia foram fagocitadas por clulas eucariontes predadoras e
que no foram por elas digeridas; ou que simplesmente invadiram eucariotos
primitivos como parasitas, mas no tiveram sucesso em matar seus hospedeiros.
De qualquer forma, tanto mitocndrias quanto cloroplastos devem ter tido origem
em algum evento predatrio mal sucedido, no qual nenhuma das partes foi morta
ou digerida pela outra, mas que, pelo contrrio, comearam a conviver e esta
convivncia com o tempo se tornou obrigatria.

Acredita-se que o ancestral dos eucariotos era uma clula nucleada, anaerbica e
heterotrfica, que vivia muito bem no ambiente primitivo, pobre em oxignio. Este
ancestral teria sido, em algum momento, invadido por (ou fagocitado) uma
bactria que praticava fosforilao oxidativa, ou seja, captava oxignio e extraa
energia da oxidao de molculas de comida (matria orgnica) para produzir ATP.
Uma vez que a digesto da bactria ou do hospedeiro no ocorreu, esta bactria
permaneceu na clula eucarionte recebendo proteo e nutrio em troca da
energia que gerava para seus hospedeiros. Estima-se que esta parceria tenha se
estabelecido h cerca de 1.5 bilhes de anos, quando a atmosfera comeou a
tornar-se rica em oxignio.

Em outro momento, outro eucarioto primitivo, que j tinha uma estreita relao
com mitocndrias, teria sido invadido por (ou teria fagocitado) uma cianobactria,
um organismo capaz de produzir matria orgnica a partir de CO 2 e luz solar. Com
o tempo, esta convivncia fez com que os descendentes deste eucarioto primitivo
no precisassem mais se alimentar de outros seres para sobreviver, passaram a
ser autotrfos, graas convivncia com as cianobactrias.

Agora juntemos estes dois momentos. medida que os eucariotos autotrficos


obtinham sucesso reprodutivo pela capacidade de produzir o prprio alimento, a
concentrao de O2 deve ter aumentado significativamente na atmosfera. Com
isso, os eucariotos que continham as mitocndrias, organismos capazes de utilizar
o O2 tambm levavam vantagem em um ambiente cada vez mais intoxicado por
este gs. Note ainda que um conjunto de organismos se alimenta dos restos
metablicos do outro. Enquanto um utiliza matria orgnica e O 2 para sobreviver,
produzindo CO2 como resto metablico, o outro utiliza CO 2 para produzir matria
orgnica, produzindo O2 como resto metablico nas reaes que produzem
matria orgnica.

Existem vrias razes para se acreditar que mitocndrias e cloroplastos so de


fato descendentes de bactrias. A primeira delas que mitocndrias e
cloroplastos so similares em tamanho a pequenas bactrias, e, alm disso, tal
Referncias:

Carvalho-Silva DR, Santos FR, Rocha J, Pena SDJ (2001). THe phylogeography of Brazilian Y-Chromosome
lineages. Am. J. Hum. Genet. 68:281-286.

Alves-Silva J, Santos MS, Guimares PEM, Ferreira ACS, Bandelt J, Pena SDJ, PradoVF (2000). The
ancestry of Brazilian mtDNA lineages. Am. J. Hum. Genet. 67: 444-461.

Bibliografia consultada:

Alberts B, Johnson A, Lewins J, Raff M, Roberts K, Walter P (2002) Molecular Biology of the Cell
Fourth Edition. Taylor and Francis Group, London, UK.

Griffths AJF, Miller JH, Suzuki DT, Lewontin RC, Gelbart WM. 2002. Introduo Gentica. Editora
Guanabara Koogan, Rio de Janeiro, RJ.

Margulis L, Sagan D (2002) O que sexo? Jorge Zahar Ed. Rio de Janeiro, RJ.

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