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GUIDE PRATIQUE DE L'UTILISATEUR

BASE DE DONNEES NATIONALE


SUR LE VAUTOUR PERCNOPTERE ET SON ENVIRONNEMENT
STRUCTURE DE LA BASE DE DONNEES NATIONALE
VAUTOUR PERCNOPTERE

Ce document prsente la structure de la Base de Donnes Nationale mise en place dans le


cadre du plan de restauration national du Vautour percnoptre. Elle est accompagne dune
convention signe par les partenaires. Il sadresse en premier lieu aux diffrentes personnes
charges de ce suivi sur le terrain et constitue donc essentiellement une prsentation rapide de la
structure des fichiers et des codes utiliss.
La base de donnes et ce document ont t labors:

milie Dumont-Dayot
(06.09.01.42.94)
emilie.dum@laposte.net

Jean-Franois Cassin
DIREN AQUITAINE

95 rue de la Libert
33073 BORDEAUX Cedex
FRANCE

Pour toute question, contacter Jean-Franois Cassin par email ladresse suivante :
jean-francois.cassin@aquitaine.ecologie.gouv.fr

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INTRODUCTION
La coordination du suivi des populations de Vautours percnoptres en France repose sur la
rcolte, le stockage et lchange des donnes issues du suivi des individus dans ces diffrentes
populations. Afin de faciliter cet change, il est ncessaire quune base de donnes commune soit
mise en place. La standardisation des donnes impose que chaque intervenant utilise la mme
structure que celle de cette base et le mme type de codage pour y stocker des informations. Dans
ce souci de standardisation, les futurs utilisateurs ont rgulirement t consults. Ainsi, ce qui a t
retenu pour la version actuelle de la base repose sur leurs choix.

La Base de Donnes est constitue d'un ensemble de tables relies les unes aux autres, que
l'on peut regrouper en 4 grandes catgories fonctionnelles:

- Les tables principales regroupent les informations lies lobservation elle-mme, celles
concernant directement les Vautours (caractristiques courantes de chaque individu,
marquage, biomtrie, comportement, interactions, donnes relatives au suivi hebdomadaire
des nids) ou les autres aspects observs (autres espces, photographies)

- Les dictionnaires modifiables regroupent les informations concernant les lieux


dobservation en gnral, et en particulier les caractristiques des sites de nidification
rpertoris et des placettes dalimentation. Ils comprennent aussi les donnes relatives aux
observateurs et aux leveurs. Ces informations alimentent les tables principales.

- La base comporte 3 tables concernant un aspect particulier : le suivi photographique des


placettes dalimentation. Cette partie de la base ne concerne que le Sud-est. Elle est
intgre la base et sera dveloppe par la suite, selon les besoins et la demande.

- Enfin, la base de donnes comporte un dictionnaire non modifiable rpertoriant l'ensemble


des listes droulantes alimentant les diffrents champs prdfinis (exemple : type de
comportement, nom despce, type de menaces, etc.).

Recommandations :

Le bon fonctionnement de la base de donnes commune imposera de suivre quelques rgles de base
concernant l'ordre de saisie des donnes:
- Il est recommand dans un premier temps de saisir les donnes relatives la localisation des
nids et plus gnralement des sites connus. La cration dune liste prliminaire de ces sites
permettra par la suite de connatre directement et sans avoir les saisir chaque fois leurs
caractristiques et leur localisation gographique prcise lors de la saisie de donnes de
marquages, d'observations d'individus et de suivi rgulier des nids.
- Il est impratif que les vnements de marquages soient saisis avant les simples
observations, de faon ce que la base de donnes puisse "reconnatre" un marquage donn
et ainsi l'associer l'individu qui le porte.
- Attention : les dates doivent tre rentres sous la forme jj/mm/aaaa.
- De manire gnrale, l'usage et l'exploitation de la base de donnes commune s'avreront
plus commodes si les informations sont saisies dans l'ordre chronologique.

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PRINCIPES GENERAUX

La base de donnes est conue pour permettre une rcolte standardise des donnes lies au
marquage des oiseaux, aux contrles et reprises d'oiseaux marqus, aux observations d'oiseaux non
marqus ainsi qu'au suivi des nids et des placettes d'alimentation; elle offre aussi la possibilit de
restituer, rapidement et de manire standard, certains des rsultats.

Deux grandes tapes, correspondant deux processus diffrents peuvent tre excutes :
1) La saisie des donnes (Alimenter une table de rfrence et Rentrer des donnes)
1-1) Saisie des observations
1-1-1) Il faut, dans un premier temps, alimenter les tables de rfrence qui
correspondent aux donnes propres votre programme: liste des aires, liste des placettes,
liste des observateurs et leveurs, liste des marquages (Alimenter une table de rfrence).
1-1-2) On peut ensuite saisir les donnes relatives au marquage des oiseaux (Rentrer
des donnes nouveaux marquages)
1-1-3) Enfin, on peut saisir les observations de tout type (Rentrer des donnes -
Observations diverses) en naviguant dans les onglets aprs avoir rempli la partie suprieure
concernant les informations relatives lobservation elle-mme. Le fait d'avoir rfrenc au
pralable les aires et les lieux connus (Alimenter une table de rfrence) peut faciliter la
saisie de la localisation de l'observation.

1-2) Saisie des donnes de suivi photographique (Suivi photographique des placettes)
Ce bouton nest pas fonctionnel, mais il permettra par la suite daccder au formulaire
regroupant toutes les donnes concernant le suivi photographique des placettes. Cet aspect
sera approfondi quand la base sera largement utilise par les diffrentes structures de suivi,
et ce, selon la demande des utilisateurs.

1-3) Enregistrement de nouvelles menaces ou actions menes pour les rduire


(Menaces et actions menes)
Ce bouton permet daccder directement au formulaire contenant les champs concernant les
menaces.

2) Ldition de donnes (diter des donnes)


Ce module permet dditer de manire automatique certains des rsultats.

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LUTILISATION DE LA BASE

Quand vous ouvrez la base de donnes, trois choix vous sont proposs sur le formulaire
daccueil :

1) Alimenter une table de rfrence


2) Rentrer des donnes
3) diter des donnes

Nous allons tudier successivement ces trois modules dans les trois chapitres de ce guide.

Nous allons commencer par le module Alimenter une table de rfrence.


En effet, les "tables de rfrence" correspondent aux donnes de rfrence de votre programme
(aires, placettes, observateurs, leveurs) que vous devez renseigner dans un premier temps pour
simplifier la saisie des observations.

11)) A LIMENTER U
ALIMENTER NE T
UNE ABLE D
TABLE DEER EFERE
REFERRE NCE
ENCE

En cliquant sur Alimenter une table de rfrence, on fait apparatre les boutons suivants :

1a 1b 1c 1d

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1-a) Description aire
Ce bouton permet de rfrencer dans la base l'ensemble des aires connues.
Les champs renseigner sont les suivants :

Les champs obligatoires sont :


- code site
- code aire
- date de description
- la localisation
Les autres champs sont facultatifs.

1-b) Description placette


Les champs renseigner sont les suivants :

6
De mme que pour les aires, les champs obligatoires sont le code placette, la date et la
localisation.

1-c) Observateur
Les champs renseigner sont les suivants :

Ce bouton permet de rfrencer dans la base l'ensemble des observateurs intervenant pour la
rcolte de donnes dans le cadre du plan de restauration et de modifier des donnes relatives un
observateur dj rfrenc.

Les champs renseigner sont les suivants :

Le code observateur est form des 6 premires lettres du nom. La liste des observateurs
enregistrs apparat dans la fentre droite.

1-d) Eleveur
Les champs renseigner sont les suivants :

7
Le code leveur est form des 6 premires lettres du nom. La liste des leveurs enregistrs
apparat dans la fentre droite.

22)
)R ENTRER D
RENTRER ES D
DES ONN
DONNEEEESS

En cliquant sur Rentrer des donnes, on fait apparatre les boutons suivants :

2a 2b 2c 2d

2-a) Nouveau marquage


Ce bouton permet daccder au formulaire suivant :

Ce formulaire doit tre utilis pour la saisie de donnes rcoltes lors de sessions de capture et de
marquage doiseaux non rpertoris jusqualors dans la base.
Ce bouton permet de rfrencer dans la base l'ensemble des lieux o des oiseaux sont observs
rgulirement (abreuvoirs, charniers, reposoirs, volires). Il permet aussi de modifier les donnes
relatives un lieu dj rfrenc.
Le type de site doit tre renseign obligatoirement (il sert, ici aussi, constituer le code unique
du lieu).

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2-b) Observations diverses
Ce bouton permet daccder au formulaire suivant :

Le haut du formulaire contient tous les renseignements relatifs aux paramtres de lobservation
elle-mme (date, heure, observateur, mthode, lieu).
Le champ observateur prsente une liste droulante proposant tous les observateurs enregistrs
au pralable dans le formulaire Observateurs. Si lobservateur souhait ny figure pas, il suffit de
double-cliquer sur le champ pour accder au formulaire Observateurs.
La case observation de percnoptre est coche si des percnoptres ont t observs. On prcise le
nombre de contacts visuels (notion prciser) et le nombre de percnoptres vus simultanment.
Puis, on indique le lieu en cochant la case correspondant site, aire, placette ou autre lieu. On
choisit ensuite dans la liste droulante correspondant au type de lieu slectionn le lieu prcis de
lobservation. Il sagit du mme systme que pour le champ observateur : la liste rpertorie toutes
les aires (ou autres) enregistres au pralable.

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La partie infrieure du formulaire se dcoupe en 6 onglets, chacun se rapportant un aspect
particulier de lobservation :
- le premier concerne la mto, comme on peut le voir ci-dessus.

- le deuxime concerne le percnoptre et se prsente ainsi :

On indique donc lheure darrive et de dpart de ou des oiseaux, en prcisant sil sagit dun
couple. Si un seul individu est observ, on peut indiquer lge, le sexe, les particularits de son
plumage, le type de comportement observ et les interactions avec dautres espces sil y a lieu.
N.B. : les code_Ind ne pourront tre utiliss que lorsque les oiseaux seront marqus. Ce code est
prvu pour le cas o loiseau aurait plusieurs marquages au cours de sa vie. Il constitue le code
unique de loiseau qui le caractrisera toute sa vie dans la base. Ainsi, il est identifi non pas par
son marquage, mais par le code_Ind quon lui a attribu.

Si on a pu voir quil est marqu, on clique sur le bouton marquage observ qui mne au
formulaire suivant :

On remplit les champs de ce formulaire suivant ce que lon a pu observer.

Remarque : il faudrait prvoir une comparaison des marquages observs avec les
marquages dj enregistrs dans la base lors des oprations de marquage au nid. Ainsi, les
erreurs peuvent tre directement corriges, ou du moins signales.

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- le troisime onglet concerne les captures et/ou marquages :

Ce formulaire indique les circonstances de capture dun oiseau, sil a t remarqu cette
occasion, et sil a t relch ensuite ou gard en captivit. On peut galement indiquer sil tait
mort, la date et la cause estimes. Si on relve des mesures de biomtrie sur cet oiseau, on peut les
enregistrer dans le formulaire accessible grce au bouton Biomtrie :

On renseigne les champs correspondants aux mesures releves et on retourne sur le formulaire
prcdent par le bouton plac en haut droite.

De mme, si loiseau est marqu cette occasion, on clique sur le bouton Marquage qui
conduit au formulaire Marquage (et non pas marquage observ ) prsent plus haut.

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- longlet suivi de reproduction se prsente ainsi :

Il sagit dun bilan de la reproduction que les utilisateurs de la base peuvent renseigner au fur et
mesure selon leur interprtation personnelle des observations faites.

- Longlet autres espces :

Les autres espces prsentes sont rentres, accompagnes du nombre dindividus.

- Longlet photographies nest pas encore dvelopp. Il prvoit le rfrencement des


photographies stockes dans la base.

2-c) Menaces et actions menes


Ce bouton constitue en fait un chemin daccs direct vers le formulaire dj prsent plus haut,
celui de la description des aires. La personne ajoutera la menace observe ou laction mene dans ce
formulaire.

2-d) Suivi photographique des placettes


Ce bouton nest pas fonctionnel car les formulaires concernant le suivi photographique des
placettes na pas t ralis car cette partie de la base sintgrera compltement la base aprs sa
mise en utilisation.

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33)) E DITER D
EDITER ES D
DES ON N E E S
DONNEES
Ce module permet d'diter des donnes synthtiques issues des informations saisies dans la base.

3-1) diter le bilan des observations


Ce bilan retrace synthtiquement l'ensemble des observations faites.
Remarque : il faudrait pouvoir slectionner au pralable un lieu donn, une date prcise, un
crneau horaire, un type de lieu, etc.

3-2) diter le bilan de la reproduction


Ce bilan retrace, pour un nid donn, l'ensemble des observations qui ont t effectues durant la
saison choisie.

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STRUCTURE DE LA BASE

1- Tables principales
- Table Observation
Nom du champ Type de donnes Description
Code_observation Texte Code gnr automatiquement form des 6
premires lettres du nom suivi dun numro
Date Date/Heure Date de l'observation en jj/mm/aaaa
Heure_dbut Date/Heure Heure du dbut de lobservation en h: m
ex: 12:30
Heure_fin Date/Heure Heure de fin de lobservation en h: m
ex: 12:30
Dure observation Date/Heure Dure de lobservation en h: m (quand horaires
non connues)
ex: 12:30
Temprature Numrique
Luminosit Texte
Nbulosit Texte
Vent Texte
Pluie Texte
Nombre km parcourus Numrique Nombre de kilomtres parcourus en voiture par
lobservateur pour aller sur le site dobservation
Prsence de percnoptre Oui/Non
Nombre contact visuel Numrique
Nombre de percnoptre Numrique
vus simultanment
Mthode Texte Identification du programme de suivi
Remarques Mmo
Date_saisie Date/Heure Date de la saisie des donnes en jj/mm/aaaa
Date_export Date/Heure Date de lexport des donnes en jj/mm/aaaa
Code_placette Numrique
N_aire Texte
Code_observateur Texte Le code doit tre compos de 6 lettres
Code_site Texte
N_lieu Numrique

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- Table Percnoptre
Nom du champ Type de donnes Description
N_percnoptre NumroAuto Code gnr automatiquement
CodInd Texte Code individu unique, gnr
automatiquement
Heure arrive Date/Heure Heure de lobservation en h: m
ex: 12:30
Heure dpart Date/Heure Heure de lobservation en h: m
ex: 12:30
Age Texte
Sexe Texte Sexe
Particularit_plumage Texte
Nombre individus Numrique
Couple Texte
Cod_Ind_Conjoint Texte
Mort Oui/Non
Date_estime Date/Heure Date estime de la mort
Cause Texte Cause estime de la mort: (cf annexe1)
Marqu Texte
Bague musum observe Texte
Couleur droite observe Texte
Couleur gauche observe Texte
Circonstance_capture Texte Circonstances capture (cf annexe 6)
Remarquage Oui/Non Remarquage ?
Date relcher Date/Heure Date relcher oiseau
Lieu relcher Texte Lieu de relcher
Circonstance relcher Texte Circonstances relcher
Captif Oui/Non L'individu est-il gard captif ?

- Table Marquage
Nom du champ Type de donnes Description
N_marquage NumroAuto Code gnr automatiquement
N_percnoptre Numrique
Date_pose Date/Heure
Age cette date Texte
Sexe Texte
Lieu_pose Texte
Nom_bagueur Texte
Prnom_bagueur Texte
N_carte Numrique
Bague_museum Texte
Couleur__droite Texte
Couleur__gauche Texte

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- Table Biomtrie
Nom du champ Type de donnes Description
N biomtrie Numrique
N percnoptre Numrique
Prlvement Texte Type dchantillon collect
Lcub Numrique Longueur cubitus (mm)
L5At Numrique Longueur de la 5 rmige primaire avec tuyau (mm)
L5St Numrique Longueur de la 5 rmige primaire sans tuyau (mm)
Poids Numrique Poids en grammes
Lap Numrique Longueur de l'aile plie (mm)
Lt Numrique Longueur du tarse (mm)
Lb Numrique Longueur du bec (mm)
Ltb Numrique Longueur de la tte + bec (mm)
Hb Numrique Hauteur du bec (mm)
Divers Texte Divers

- Table Interaction
Nom du champ Type de donnes Description
N_interaction NumroAuto Code gnr automatiquement
N_percnoptre Numrique
Espce_en_conflit Texte
Type_interaction Texte

- Table Comportement
Nom du champ Type de donnes Description
N comportement NumroAuto Code gnr automatiquement
N percnoptre Numrique
Type comportement Texte Comportement observ (cf table liste)

- Table Autre espce


Nom du champ Type de donnes Description
N autre espce NumroAuto Code gnr automatiquement
Espce Texte
Nombre individus Numrique

- Table Suivi_reproduction
Nom du champ Type de donnes Description
N_suivi_reproduction NumroAuto Code gnr automatiquement
Code_observation Texte
Aire occupe Texte
Prsence_uf Texte
Nombre_uf Numrique
Prsence poussin Texte
Nombre poussin Numrique
Poussin marqu Texte
Envol Texte
Echec Texte
Type chec Texte

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- Table Photographie
Nom du champ Type de donnes Description
N_photographie NumroAuto Code gnr automatiquement
Code observation Texte
Auteur Texte
Type Texte

2- Tables de rfrence

- Table Observateur
Nom du champ Type de donnes Description
Code observateur Texte
Nom Texte
Prnom Texte
Service Texte
Adresse Texte
Code postal Numrique
Ville Texte
Pays Texte
Tlphone Numrique
Portable Numrique
Fax Numrique
E_mail Texte
Site web Texte
Prochain numro Numrique
Envoi_courrier Oui/Non
Observations Mmo

- Table Eleveur
Nom du champ Type de donnes Description
Code leveur Texte Le code doit tre compos de 6 lettres
Nom Texte
Prnom Texte
Immatriculation Texte
Adresse Texte
Code postal Numrique
Ville Texte
Pays Texte
Tlphone Numrique
Portable Numrique
Fax Numrique
E_mail Texte
Site web Texte
Envoi_courrier Oui/Non
Observations Mmo

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- Table Dico_placette
Nom du champ Type de donnes Description
Code placette NumroAuto Code gnr automatiquement
Nom placette Texte
Coordonnes X Numrique
Coordonnes Y Numrique
Latitude Numrique
Longitude Numrique
Altitude Numrique
Lieu dit Texte
Commune Texte
N carte IGN Texte
Date cration Date/heure
Surface Numrique
Dalle Oui/Non
Dimensions dalle Numrique
Suivi photographique Oui/Non
Date description placette Date/heure
Descripteur placette Texte

- Table Journal placette


Nom du champ Type de donnes Description
N suivi alimentation NumroAuto Code gnr automatiquement
Code placette Numrique
Code observateur Texte
Code leveur Texte
Date dpt Date/Heure
Priodicit Texte
Type viande Texte
Quantit dpose Texte
Quantit consomme Texte

- Table Site
Nom du champ Type de donnes Description
Code site Texte
Code site initial Texte
Dpartement Texte
DateModif Date/Heure

18
- Table RenseigConfidentSite
Nom du champ Type de donnes Description
N NumroAuto Code gnr automatiquement
Code site Texte
Nom site Texte
Coordonnes X Numrique
Coordonnes Y Numrique
Latitude Numrique
Longitude Numrique
Lieu dit Texte
Commune Texte
quantit btail Texte

- Table Dico_aire
Nom du champ Type de donnes Description
Naire Texte
Code site Texte
Nom aire Texte
Descripteur aire Texte
Date description aire Texte

- Table InfoConfidentAire
Nom du champ Type de donnes Description
N NumroAuto Code gnr automatiquement
N aire Texte
Coordonnes X Numrique
Coordonnes Y Numrique
Latitude Numrique
Longitude Numrique
Altitude Numrique
Commune Texte
Lieu dit Texte
N carte IGN Texte
Hauteur falaise Numrique
Projection Numrique
Hauteur relative de laire Numrique
Substrat rocheux Texte
Vgtation paroi Texte
Orientation aire Texte
Emplacement Texte
Visibilit Texte
Points d'observation Mmo

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- Table Autre lieu
Nom du champ Type de donnes Description
N lieu Numrique
Type de lieu Texte
Nom du lieu Texte
Coordonnes X Numrique
Coordonnes Y Numrique
Latitude Numrique
Longitude Numrique
Altitude Numrique
Commune Texte
Lieu dit Texte
N carte IGN Numrique
Remarques Texte

- Table Nids proches


Nom du champ Type de donnes Description
N nid NumroAuto Code gnr automatiquement
N aire Texte
Distance nid Numrique distance du nid l'aire du percnoptre
Espce Texte

- Table Menace
Nom du champ Type de donnes Description
N menace NumroAuto distance du nid l'aire du percnoptre
N aire Texte
Date menace Texte
Type menace Texte
Date action Date/Heure
Type action Texte
Description action Mmo

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3- Tables suivi photographique
- Table Enregistrement
Nom du champ Type de donnes Description
Enregistrement Numrique
Code placette Numrique
Code observateur Texte
Genre Texte
Lieu Texte
Date dbut Date/Heure
Heure dbut Date/Heure
Date fin Date/Heure
Heure fin Date/Heure
Observations Mmo
Nombre Km parcourus Numrique
Date saisie Date/Heure
Date export Date/Heure

- Table Ecritures
Nom du champ Type de donnes Description
Date Date/Heure
Arrive Date/Heure
Dpart Date/Heure
Espce Texte
Quantit Numrique
Observations Mmo
Enregistrement Numrique
Ligne NumroAuto Code gnr automatiquement
DateHeure Date/Heure

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ANNEXES
- Table Liste
Nom du champ Type de donnes Description
boolen Texte
Sexe Texte
Age Texte
Emplacement aire Texte
Espces Texte
Luminosit Texte
Nbulosit Texte
Orientation aire Texte
Pluie Texte
Substrat rocheux Texte
Type comportement Texte
Type interaction Texte
Type lieu Texte
Type menace Texte
Vgtation paroi Texte
Vent Texte
Visibilit aire Texte
Circonstances de capture Texte
Type photographie Texte
Type chec Texte
Cause mortalit Texte
Oui/Non Texte
Mthode Texte
peut-tre Texte

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