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Diversit, structure, et mtabolisme des acides

nucliques :

LADN est la premire molcule biologique dont la structure a t


identifie.

LADN est un acide nuclique : Nuclique car il a t dcouvert dans le noyau,


et acide car il contient de lacide phosphorique.

Il existe deux types dacides nucliques qui diffrent par leur composition en
sucre :

LADN qui contient du dsoxyribose, il est support de linformation


gntique. (dltion dun oxygne en place 2 sur ce sucre).

LARN qui contient du ribose, il sert faire fonctionner le gnome.

Chaque cellule contient environ 5 pg dADN pour une longueur denviron 1m.
LADN est compact pour tenir dans le noyau de 6 picogramme.

LADN nest pas exclusivement nuclaire : il existe lADN mitochondrial, il est trs
petit, fait 37 gnes.

Fonctionnement du message gntique : ADN se rplique, cest la


rplication, la cellule mre se dive en deux cellules filles, et transmet une partie
de son message en ARNm, cest la transcription. LARNm va sutiliser, avec des
nuclotides, pour construire la protine qui est construite dacides amins, cest
la traduction.

I) La structure des acides nucliques :


LADN est une macromolcule, cest un polymre de nuclotides. Cest un
structure trois pices : base + sucre + acide phosphorique. Ce dernier est le
plus abondant et possde trois fonctions identiques acides, avec une charge
ngative.

Les deux sucres sont donc le dsoxyribose et le ribose, le dsoxyribose


tant le plus stable des deux.

a) Le nuclotide :

Le nuclotide est lassociation dune base, dun sucre, et dun acide


phosphorique.

Le sucre

Le sucre est li de manir covalente :

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- A la base par sa fonction alcool en 1

- A lacide par sa fonction alcool en 5.

Ce sur est li la base pyrimidine en lazote en 1, et pour les bases puriques


lazote en 9.

Les bases :

On distingue des bases puriques (9 sommets) et des bases pyrimidiques (6


sommets) :

- Les bases puriques :

o Ladnine, cest un 6-amino-purine

o La guanine, cest un 2-amino-6-oxo-purine.

- Les bases pyrimidiques :

o Luracile, cest un 2,4-dioxo-pyrimidique

o La cytosine, cest un 2-oxo-4-amino-pyrimidine

o La thymine, cest une 2,4-dioxo-5-mthyl-pyrimidine.

On remarquera que la diffrence entre luracile (ARN) et la thymine (ADN), est


lajout dun mthyl en position 5, ce qui lui confre une rsistance aux mutations.

Lacide :

Lacide phosphorique partage une liaison phosphodiester au sucre par son


carbone 5, il va permettre la liaison au nuclotide adjacent par son carbone 3.
Cest la liaison 35-phosphodiester.

On distingue deux extrmits lacide nuclique : Lextrmit 5 Phosphate et


3 OH.

Bases et sucres :

Lorsque les bases sont couples un sucre on a :

- Cytosine + sucre Cystidine

- Uracile + sucre Uridine

- Thymine + sucre Thymidine

- Adnine + sucre Adnosine

- Guanine + sucre Guanosine

b) La double hlice dADN :

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LADN contient lgrement plus de pair dadnine/thymine, que de pair de
guanine/cytosine.

LADN forme une double hlice dont laxe central ne passe pas par le centre de
lhlice, et les bases sont dans un plan perpendiculaire la double hlice de
lADN. Les deux chaines polypeptidiques de lADN sont de sens oppos.

Dans lADN deux chaines vont sassembler par des liaisons hydrognes :

- 2 liaisons hydrognes entre ladnine et la thymine

- 3 liaisons hydrogne entre la guanine et la cytosine.

LADN contient lgrement plus de pair dadnine/thymine, que de pair de


guanine/cytosine.

LADN forme une double hlice dont laxe central ne passe pas par le centre de
lhlice, et les bases sont dans un plan perpendiculaire la double hlice de
lADN. Les deux chaines polypeptidiques de lADN sont de sens oppos.

La structure de lADN en double hlice a t identifie grce aux rayons X sur des
micros-cristaux dADN.

Un pas de lADN correspond a 10 bases empiler, et ceci correspond 34


Angstrom soit 3.4 nm. Son diamtre est de 2 nm.

LADN se mesure en taille, et fais une longueur de 1m pour chaque brin, donc
lADN mesure 1m. Son gnome mesure environ plus de 3 milliards de bases.

c) LARN :

Il contient du ribose, et la thymine de lADN est remplace par lUracile. Il


en existe diffrents types :

- ARNr : ribosomal, reprsente 85% des ARN

- ARNt : transfert.

- ARNm : messager, reprsente une part minime

- ARNmi : micro, ne fait quune vingtaine de nuclotide.

Elle ne comporte quun simple brun, qui se replie pour faire des structures sous
forme de boucle avec renflement.

II) Mtabolisme :
a) Fonctionnement :

Voie de rcupration :

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Lorganisme utilise les acides nucliques des cellules mortes (notamment de
lintestin) ou de lalimentation qui dgrade pour rcuprer les bases.

Elle consomme gnralement 1 ATP.

Rcupration des pyrimidines :

Nuclosides et phosphate sont associs par un nucloside kinase pour former le


nuclotide.

Rcupration des purines :

Le ribose phosphoryl et la base sont associs par une phosphoribosyl-tranfrase


(PRT) pour former le nucloside.

La voie de novo :

Elle consiste synthtiser totalement les bases :

Synthses des pyrimidines : (5 ATP)

o CTP : Il faut pour la formation dun cycle, du carbamyl-phosphate, de


lacide orotique, et du PRPP (sucre sous la forme du prcurseur
ribose).

o DTMP : DUMP en DTMP.

Synthses des purines : (7 ATP)

PRPP grce la glutamine.

b) Catabolisme des nuclotides :

1) La dgradation de lADN en nuclotides libres :

LADN va dabord tre dgrad par :

- Des exonuclases : elles dgradent lextrmit selon leurs noms


(3exonuclases ou 5exonuclases)

- Des endonuclases : elles vont cliver lADN.

2) La dgradation du nuclotide en nucloside.

Une nuclotidase clive le phosphate du nuclotide.

3) La dgradation du nucloside en base :

Une nucloside phosphorylase clive le ribose et le phosphoryle.

4) La dgradation de la base :

Seules les bases pyrimidiques peuvent tre dgrades par le corps humain. Pour
les purines, le corps tente de les rendre solubles.

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