Informe Bioqumica

universidad nacional de Cajamarca
Facultad de ciencias agrarias

Escuela acadmico profesional de industrias alimentarias
SINTESIS DE PROTEINAS
DOCENTE: EDINSON SALDAA
CURSO: BIOQUIMICA
CICLO: III
INTEGRANTES:
Diaz Llanos Jemima Gadiluz
Lopez diana
Machuca Ramos Gabriela pamela
Medina Villalobos Erlita
Ocas izquierdo Judith
Tanta Huaman Greysi
AO:
2017
1
UNIVERSIDAD NACIONAL DE CAJAMARCA
FACULTAD DE CIENCIAS AGRARIAS
ESCUELA ACADEMICO PROFESIONAL DE INGENIERIA
EN INDUSTRIAS ALIMENTARIAS
INTRODUCCIN:
En este trabajo presentaremos el mecanismo de la sntesis de protenas, un proceso llamado
traduccin porque el alfabeto de cuatro letras de los cidos nucleicos se traduce a otro
alfabeto completamente distinto: el de las protenas. La traduccin es un proceso mucho ms
complejo que la simple replicacin o transcripcin, ya que estos procesos tienen lugar en el
contexto de un lenguaje comn de bases apareadas, la traduccin necesita la interaccin
coordinada de ms de cien clases de macromolculas. Adems de los ribosomas, se requieren
molculas de RNA de transferencia, mRNA y muchas protenas distintas. Las protenas son
sintetizadas desde el grupo amino hacia el carboxilo por la adicin secuencial de aminocidos
al extremo carboxlico de la cadena polipeptdica creciente. Los precursores activados son
los aminoacil-tRNAs, en los que el grupo carboxilo de un aminocido est unido al extremo
de 3-OH del RNA de transferencia. La unin de un aminocido a su correspondiente tRNA
esta catalizada por un aminoacil-tRNA sintetasa. Esta reaccin de activacin anloga a la
activacin de los cidos grasos requiere ATP. Para cada aminocido existe al menos un tipo
de tRNA y una enzima de activacin. La sntesis de protenas tiene lugar en tres etapas:
iniciacin, elongacin y terminacin. La iniciacin consiste en la unin del tRNA iniciador
a la seal a la seal de partida del mRNA. El tRNA iniciador ocupa el lugar P (peptdico) en
el ribosoma. La elongacin comienza con la unin de un aminoacil- tRNA al lugar A
(aminoacilo) otro centro de unin del ribosoma al tRNA. Se forma entonces un enlace
peptdico entre el grupo amino del aminoacil- tRNA recin incorporado y el grupo
carboxlico de la formilmetionina transportada por el tRNA iniciador. A continuacin, el
dipeptidil- tRNA resultante se desplaza desde el lugar A hasta el P, y la molcula de tRNA,
el movimiento del peptidil- tRNAy el movimiento asociado del ribosoma hacia el siguiente
codn requiere la hidrolisis de GTP. Un aminoacil- tRNA se une entonces al lugar A vacio
para iniciar un nuevo ciclo de elongacin. La terminacin se produce cuando una seal de
parada en el mRNA es leda por un factor proteico de liberacin, lo que provoca la
disociacin d la cadena polipeptidica completa del ribosoma. En esencia, los ribosomas son
enzimas que catalizan la formacin de enlaces peptdicos dirigida por el mRNA.
Los ribosomas son grandes asociaciones de ribo nucleoprotenas que consta de una subunidad
pequea (30s) y una grande (50s). Contiene 55 protenas distintas y 3 molculas de tRNA.
El nombre de ribosomas es adecuado porque dos tercios de su masa corresponden al RNA.
De hecho, las molculas de RNA ribosmico son molculas ricas en informacin que juegan
un papel central en la traduccin. Su actividad en los ribosomas actuales proporciona pista
sobre como los ribosomas primitivos, formados nicamente por RNA, pudieron haber
llevado a cabo la sntesis de protenas.
SINTESIS DE PROTEINAS | 1
2
LAS MOLECULAS DE RNA DE TRANSFERENCIA (tRNA) TIENEN UN DISEO COMN
El tRNA acta como molcula adaptadora que reconoce tanto al enzima que aade el
aminocido correcto como el anticodn de mRNA. La primera secuencia de bases de una
molcula de RNA de transferencia fue determinada por Robert Holley en 1965.En la actualidad
se conocen ms de cien secuencias distintas. El descubrimiento sorprendente es que todas estas
secuencias pueden escribirse en un modelo de hoja de trbol en el que aproximadamente la
mitad de sus residuos tiene sus bases apareadas, as pues, las molculas de tRNA tienen muchas
caractersticas estructurales comunes. Todas las molculas de RNA de transferencia conocidas
comparten las siguientes caractersticas:
son cadenas sencillas que contienen entre 73 y 93 ribonucletidos.

Contienen muchas bases poco comunes, normalmente entre 7 y 15npor
molcula.
El extremo 5 de los tRNA esta fosforilado.
La secuencia de bases nitrogenadas 3 de las molculas de tRNA maduras es
CCA.
Alrededor de la mitad de los nucletidos en el tRNA tienen bases apareadas
para formar doble hlices.
El lazo anticodn, consta de siete bases.
EL AMINOACIDO ACTIVADO Y EL ANTICODON DE tRNA ESTAN EN LOS

EXTREMOS OPUESTOS DE LA MOLECULA CON FORMA DE L
La estructura tridimensional de una molcula de tRNA se resolvi por primera vez en 1974.
Los estudios de cristalografa de rayos X del tRNA para la fenilalanina procedente de
levadura llevados a cabo en los laboratorios de Alexander Rich y Aaron Klug han aportado
gran cantidad de informacin estructural.
La molcula tiene forma de L

Hay dos segmentos de doble hlice
La mayora de las bases de regiones no helicoidales participan en
interacciones de puente de hidrogeno poco frecuentes.
El extremo CCA que contiene el lugar de unin de aminocidos est en uno
de los extremos de la L.
El extremo CCA y la regin helicoidal adyacente no interaccionan
fuertemente con el resto de la molcula.
LA ESCISION POR MEDIO DE LA RIBONUCLEASA P DE UN PRECURSOR

GRANDE ORIGINA MULTIPLES MOLECULAS DE RNA TRANSFERENCIA
3
Los sesenta genes correspondientes a la molcula de RNA de transferencia de E. coli estn
agrupados en veinticinco unidades que se transcriben en forma de precursores multimericos.
Uno de estos transcritos es el precursor de siete tRNAs: uno especfico para la leucina, dos para
metioninas internas y dos para cada una de las dos clases de codones de la glutamina.
El transcrito primario de 95 nucletidos se rompe por accin de la ribonucleasa P en el extremo

5del primer nucletido de cada uno de los futuros tRNAs.
LA FUNCIN CORRECTORA DE LAS AMINOACIL-tRNA SINTETASAS

AUMENTA LA FIDELIDAD DE LA SNTESIS DE PROTEINAS
Las aminoacil-tRNA sintetasas son muy selectivas en el reconocimiento del aminocido que
debe ser activado y del tRNA aceptor que le corresponde. Las molculas de tRNA que
aceptan diferentes aminocidos tienen diferentes secuencias de bases. Una labor mucho ms
exigentes para estas enzimas consiste en discriminar entre aminocidos semejantes,
(ejemplo: la nica diferencia entre isoleucina y valina radica en que la isoleucina contiene
un grupo metileno que no est presente en la valina).
La energa de enlace adicional aportada por este grupo (CH2) extra (3Kcal/mol) favorece la
activcion e la isoleucina sobre la valina in vivo es unas cinco veces superior a la isoleucina
y, por consiguiente, la valina podra incorporarse errneamente a las protenas en lugar de la
isoleucina una vez de cada 40.
De hecho, la sintetasa corrige sus propios errores, la valina errnea mente activada no se
transfiere al tRNA especiico de la isoleucina. En cambio, la este tRNA promueve la hidolisis
del valil-AMP, evitando asi su incorporacin errnea a las protenas.
LAS SINTETASAS RECONOCEN EL LAZO ANTICODON Y EL TALLO
ACEPTOR DE LAS MOLECULAS DE ARN DE TRANSFERENCIA
El reconocimiento preciso de los tARNs es igual de importante tanto para conseguir una
apropiada fidelidad en la sntesis de protenas como para seleccionar de forma precisa los
aminocidos. A priori el anticodn del tARN parece ser un buen candidato para determinar
su identidad ya que cada tRNA tiene uno distinto. La prueba ms directa proviene de los
experimentos de cambio de identidad.
El anticodn CCA del triptofanil-tRN anticodn UAC del tRNA fueron reemplazados por
CAU, el anticodn metionina. Los genes de estos tRNAs modificados fueron transcritos in
vitro, y se midi la cintica de oscilacin mediante la sintetasa especfica para la metionina.
EL CODN ES RECONOCIDO POR EL ANTICODN DEL tRNA Y NO POR EL

AMINOCIDO ACTIVADO
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Ya s a mencionado que el anticodn del tRNA es el lugar de reconocimiento del codn del
mRNA y que tal reconocimiento se produce por apareamiento de bases. Primero, la cistena
se una a su correspondiente tRNA. Esta unida se convert entonces en alanina mediante la
reaccin del Cys- tRNA con nquel Raney, lo que eliminaba al tomo de azufre del residuo
de cistena activada sin afectar a su unin con el tRNA. As pues, se produca un aminoacil-
tRNA hbrido en el que la alanina estaba unida covalentemente al tRNA especfico para la
cistena
El tRNA h: reconoce que conduce normalmente a la interpolacin de cistena (codificada por
UGU) pero no de alanina (codificada por GCX).
ALGUNAS MOLCULAS DE RNA DE TRANSFERENCIA RECONOCEN MAS

DE UN CODN A CAUSA DEL BALANCEO EN EL APAREAMIENTO DE LAS
BASES
Las reglas que gobiernan el reconocimiento de un codn por el anticodn de un tRNA:
Cada una de las bases del codn forma una pareja de bases del tipo de Watson y Crick
con una base complementaria del anticodn.
El codn y el anticodn estaran entonces alineados en forma antiparalela.
El diagrama del margen la prima indica la base complementaria.
Una prediccin inherente a este modelo es que un anticodn particular podr
reconocer solamente a un codn
Algunas molculas puras de tRNA pueden reconocer ms de un codn
Por el contrario, se puede cambiar el anticodn de tRNA sin provocar ningn efecto en la
especificidad de la aminoacilacin, en otros los tRNAs las identidades estn establecidas por
diversos determinantes.
LOS ROBOSOMAS SON PARTCULAS RIBONUCLEOPROTEICAS (70S)
FORMADAS POR UNA SUBUNIDAD PEQUEA (30S) Y OTRA GRANDE (50S)
Los RNA de transferencia las molculas adaptadoras entre dos tipos de alfabeto
completamente distintos se asimilan de forma especfica y, a su vez como sus anticodones
son reconocidos por los codones. Los ribosomas, las mquinas moleculares que coordinan
las interacciones entre tRNAs, mRNA y protenas en este complicado proceso y que catalizan
la formacin de enlaces peptdicos. El robosoma de E. COLI es una asociacin
5
ribonucleproteica con una masa de unos 2700Kd, un dimetro aproximado de 200 angstrom
y un coeficiente de sedimentacin de 70S
LOS RNAs RIBOSOMICOS (5S,16S Y 23S rRNAs) JUEGAN UN FUNDAMENTAL
EN LA SINTESIS DE PROTEINAS
El prefijo ribo del nombre es adecuado, porque el ARN representa casi las dos terceras
partes de la masa de estas dos terceras partes de la masa de estas grandes asociaciones
moleculares. Los 3 ARNs presentes -5s, 16S y 23S-son fundamentales para la arquitectura y
funcin de los ribosomas.se forman mediante la ruptura de transcritos primarios de 30S y su
posterior procesamiento. Los patrones de apareamiento de estas molculas se han deducido
gracias a experimentos de modificacin qumica y digestin.
El descubrimiento del ARN cataltico nos hizo concebir la posibilidad de que el ARN tuviese
un papel mucho ms activo en la funcin del ribosoma. De hecho, varias lneas de evidencia
sugieren que los ARNs ribosmicos desempean en la sntesis de protenas funciones
directrices, que incluso pueden ser dominantes:
1. La ruptura del nico enlace del rARN de 16S por medio de la colina E3, que es una
nucleasa secretada por algunas bacterias.
2. La omisin de protenas concretas de las subunidades 30S que provoca una
disminucin de la actividad del ribosoma en lugar de la prdida total de la
funcionalidad.
3. El rARN 16S selecciona el lugar de iniciacin en el mARN.
4. La base oscilante del tARN que ocupa el lugar P del ribosoma esta con base localizada
en una secuencia de 14 nucletidos del rARN 16S, que es idntica en las ms de mil
molculas secuenciadas hasta la fecha.
5. El extremo aceptor 3 del tARN interacciona con una regin conservada del rARN de
23S.
6. El rARN de 23S es esencial para la actividad peptidil-transferansa.
7. La sntesis de protenas lo hacen mediante interacciones especificas con el ARN
ribosmico.
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LA ARQUITECTURA DEL RIBOSOMA, SUS INTERACCIONES Y SU DINAMICA

SE ESTAN CARTOGRAFIANDO MEDIANTE DIVERSAS TECNICAS
La forma del ribosoma y de sus subunidades 30S y 50S se ha reconstruido a partir de un gran
nmero de imgenes de microscopia electrnica. La microscopia inmunoelectronica, utilizando
anticuerpos especficos para protenas determinadas, ha elevado la identidad de muchos
aspectos de la superficie.
Topografa de la superficie y lugares funcionales de la subunidad 30S, de

la subunidad 50S y del ribosoma intacto 70S.
Los nucletidos que interaccionan con protenas y con otras molculas de ARN estn
normalmente protegidos frente al ataque de estas pequeas sondas qumicas. Las regiones
del rARN de 16S.Los experimentos de foto entrecruzamiento tambin han sido muy valiosos
la hora de identificar grupos que se encuentran muy prximos. Ejemplo se forma un dmero
de pirimidina entre la base oscilante del anticodn del rARN que ocupa el lugar P y la citosina
del nucletido 1400 del rARN de 16S.
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LAS PROTEINAS SE SINTETIZAN EN LA DIRCCION DEL EXTREMO

AMINICO AL CARBOXILICO
Los estudios de pulsos con marcaje de Howan Dintzis dieron una respuesta contundente.
Durante un periodo de tiempo menor al que necesita para sintetizar una cadena completa. En
cada muestra se separaron las cadenas y y estas se trataron con tripsina para obtener las
huellas dactilares. Analizaron todas las muestras, se encontr un gradiente de radioactividad
que aumentaba desde el extremo carboxlico de cada cadena. Este experimento demostr que
la direccin de crecimiento de la cadena es desde el extremo amnico al carboxlico.
Radioactividad relativa
1 141
+
H3N- Posicin -COO-
Distribucin de la 3H- leucina en las cadenas de la hemoglobina sintetizada despus de la

exposicin de los reticulocitos a leucina tritiada.
EL ARN MENSAJERO SE TRADUCE EN LA DIRECCION 5 3

Se determino la direccin de lectura del ARNm utilizando el polinucletido sinttico:
5 3
A-A-A-(A-A-A)n -A-A-C
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Como molde en un sistema de sntesis proteica libre de clulas. AAA codifica lisina,
mientras que AAC codifica asparragina. El polipptido obtenido fue:
o
+
H3N- Lys-(Lys)n -Asn-C
o-
Como el residuo carboxilo terminal era la asparragina, el codn AAC tuvo que ser el ltimo,
de hecho, el ARNm tambin se sintetiza en la direccin 5 3. En E. coli apenas se pierde
tiempo entre la transcripcin y la traduccin, el extremo 5 del ARNm interacciona con los
ribosomas muy poco despus de haber sido sintetizado, mucho antes de que se hay completado
la sntesis del extremo 3 del ARNm.
Los ribosomas ms prximos al extremo 5 del mensajero tienen las cadenas polipeptdicas
mientras que los que estn prximos al extremo 3 las tienen casi terminadas, poco despus
de la liberacin del polipptido producto, los ribosomas disocian en las subunidades 30S y
50S.
EN BACTERIAS LA SINTESIS DE PROTEINAS SE INICIA CON EL RNA DE
TRANSFERENCIA PARA LA FORMILMETIONINA
Cmo comienza la sntesis de protenas?
La posibilidad ms sencilla que existe en que los tres primeros nucletidos de RNAm actu
como principal codn; no aria falta ninguna seal especial para la iniciacin. Sin embargo,
el hecho experimental es que la traduccin no empieza inmediatamente en el extremo 5 del
RNAm.
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Una de las claves para conocer el mecanismo de iniciacin sugera a la raz del
descubrimiento de que casi la mitad de los residuos amino-terminales de las protenas de E.
coli son metionina, adems estas protenas nacientes estaban normalmente modificadas, lo
que sugera en la iniciacin participaba un derivado de la metionina.
Las sntesis de las protenas en las bacterias empiezan con N-fomilmetionina; hay RNAt
especial que coloca la fenilmetioina en el ribosoma para iniciar la sntesis de las protenas.
Este RNAt iniciador es diferente del que inserta metionina en posiciones interna de la
protena.
La metionina se une a estas RNAt por medio de la misma aminoacil-RNAt sintetasa. Un
enzima especifico formila despus de grupo amino de la metionina que est unida al RNAt.
el dador de formilo activada en esta reaccin es significativo que ni la menina libre ni la
metionil RNAt sean sustratos para esta transformilsa.
LA SEAL DE INICIACION ES AUG (o GUG ) PREDESID APOR VARIAS VASES

QUE APAREAN EL RNAr DE 16S
El codn de iniciacin el de RNAm es AUG (metionina) o bien, con mucha menor frecuencia,
GUG (valina).
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Cmo se pude distinguir los codones de iniciacin AUG o GUG de los que codifican
residuos internos de la protena?
La primera etapa para responder a esta pregunta fue el aislamiento de regiones iniciadoras de
diferentes RNAm. Esto se logr por digestin de complejos RNAm-ribosoma (formados en
condiciones que permitan la iniciacin de la cadena, pero no la elongacin) con ribonucleica
pancretica. En cada caso, una secuencia de unos 30 nucletidos quedaba proteguida de la
digestin. Como se esperaba, cada una de estas regiones de iniciacin exhiba un codn AUG
(o GUG) a dems cada regin de iniciacin contiene una secuencia rica en bases puricas cuyo
centro est ubicado unos 10 nucletidos ms all del extremo 5 del codn iniciador.
El extremo 3 de este RNA integrante de la subunidad 30S contiene una secuencia de varias
bases que es complementaria a la regin rica en purinas de los puntos de iniciacin de los
RNAm. De hecho, por digestin enzimtica del complejo de iniciacin, se aisl un complejo
formado por el extremo 3 de RNA de 16S y la regin iniciadora del RNAm. En la secuencia
de las ms de 70 regiones de iniciacin conocidas muestran que el nmero de pares de bases
entre el RNAm y el RNAr de 16S oscila entre 3 y 9. La mutagnesis de la secuencia CCUCC
cerca al extremo 3 RNAr de 16S a ACACA interfiere notablemente en el reconocimiento de
los lugares de iniciacin del RNAm.
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La sntesis de protenas se termina por medio de factores de liberacin que leen los
codones STOP.
En bacterias cuando un codn de terminacin ocupa el sitio A, tres factores de liberacin;
RF1, RF2 y RF3 contribuyen a:
1) Hidrlisis del enlace peptidil-tRNA terminal.
2) Liberacin del polipptido y 3) Disociacin del ribosoma 70S. -RF1 reconoce los
codones UAG y UAA y RF2 reconoce los codones UGA y UAA -RF3 es una GTPasa
y no est bien caracterizado.
TERMINACIN Y RECICLAJE DE RIBOSOMA
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La seal de iniciacin es AUG (GUG) precedida por varias bases que se aparean con el
ARNr de 16S
El codn de iniciacin del ARNm es AUG (metionina) o bien, con mucha menor frecuencia,
GUG (valina). Cmo se pueden distinguir los codones de iniciacin AUG o GUG de los
que codifican residuos internos de la protena? La primera etapa para responder a esta
pregunta fue el aislamiento de regiones iniciadoras de diferentes ARNms. Esto se logro por
digestin de complejos ARNm-ribosa con ribonucleasa pancraeatica. En cada paso, una
secuencia de unos treinta nucleotidos quedaba protegida de la digestin. Como se esperaba,
cada una de las regiones de iniciacin exhibia un codn AUG o GUG.
EL COMPLEJO DE INICIACION 70S COLOCA EL FORMILMETIONIL- ARNt
EN EL LUGAR P DEL RIBOSOMA.
Cmo se figan el ARNm y el formilmetionil- ARNtf al ribosoma para iniciar la sntesis de
protenas? Resultan esenciales tres protenas: los factores de iniciacin IF1, IF2 e IF3. En
primer lugar, la subunidad 30S del ribosoma forma un complejo con estos 3 factores. La
unin del GTP a IF2 facilita que tanto el ARNm como ARNt iniciador se unan al complejo,
al tiempo que IF3 se disocian del mismo.IF2 reconoce especficamente al formilmetionil-
ARNtf, y la liberacin del IF3 permite que la subunidad 50S se una al complejo. Al entrar la
subunidad 50S se hidroliza el GTP unido a IF2, lo que provoca la liberacin de IF1 y de IF2.
El resultado es un complejo de iniciacin 70S. La protena L7 y la casi idntica protena L12
de la subunidad 50S intervienen en la hidrolisis del GTP, la cual es esencial para la formacin
de un complejo de iniciacin productivo. La proyeccin L7/L12 de la subunidad grande
tambin participa en hidrolisis del GTP durante la etapa de elongacin de la sntesis de
protenas.
La formacin del complejo de iniciacin 70S significa que el ribosoma est preparado para
la fase de elongacin de la sntesis de protenas. La molecula fMel ARNtf ocupa el lugar P
(peptidilo) del ribosoma. Los otros dos lugares para las molculas del ARNt, el lugar
A(aminoacilo) y el lugar E(salida), estn desocupados.la cuestin ms importante es que el
fMet- ARNtf adopta la posicin en la que su anticodon se aparea con el codn de iniciacin
AUG o GUG del ARNm.
LA FORMA GTP DEL FACTOR DE ELONGACION TU SITUA UN AMINOACIL
ARNt EN EL LUGAR A DEL RIBOSOMA.
El ciclo de elongacin de la sntesis de protenas empieza con la insercin de aminoacil-
ARNt en el lugar A vacio del ribosoma. La especie molecular con que se inserta depende del
codn del ARNm que se ocupa el lugar A. el aminocido ARNt correspondiente no abandona
simplemente a la sintetasa para difundir hacer el lugar d A. en cambio, una protena de 43kd
llamada factor de elongacin se encarga de colocarlo al lugar A. EF- tu, al igual que IF2, est
unido a su nucletido de guanina que alterna entre las formas GTP y GDP.una vez que EF-
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tu ha colocado al aminoacil ARNt en el lugar A, el GTP se hidroliza. La forma GDP del
factor EF-Tu se separa entonces del ribosoma. EF-Ts segundo factor de elongacin, se une
al complejo EF-Tu e induce la disociacin GDP. Por ltimo, un nuevo GTP se une a EF-Tu
e induce la disociacin GDP. Por ltimo, un nuevo GTP se une a EF-Tu y simultneamente
se libera.
LA VELOCIDAD GTPasa DEL FACTOR EF Tu ESTABLECE EL RITMO DE LA

SINTESIS PROTEICA Y DETERMINA SU FIDELIDAD
El ciclo GTP-GDP de EF-Tu desempea otra funcin importante. La fidelidad de la sntesis
de protenas depende de que cuando se vaya a formar el enlace peptdico, el lugar A este
ocupado por el aminoacil - ARNt apropiado. Es este punto de neoretorno, ya que las clulas
carecen de mecanismo para eliminar un residuo de aminocidos incorrecto, una vez se ha
formado el enlace peptdico. Como era de esperar, el aminoacil-ARNt entrante es
cuidadosamente escudriado para asegurar que su anticondon sea complementario al codn
del ARNm que ocupa un lugar A. un aminoacil-ARNt que puede aparearse con dos de las
tres bases de un codn podr unirse de forma transitoria, pero normalmente abandonara el
lugar A antes antes de que se forme peptdico. Al ribosoma le cuesta cierto tiempo decidir si
el aminoacil ARNAt unido es el correcto. La sntesis de protenas seria menos precisa si el
enlace peptdico se formarse inmediatamente despus de la llegada de un aminoacil ARNt.
LA FORMACION DE UN ENLACE PEPTIDICO VA SEGUIDA DE LA
TRANSLOCACION DEPENDIENTE DEL GTP DE LOS ARNts Y DEL ARNm.
Ya tenemos un complejo en el que el aminoacil - ARNt ocupa el lugar A y el fMet-ARNtf
ocupa el lugar P. El factor EF-Tu ha dejado el ribosoma. La etapa siguiente es la formacin
de un enlace peptdico. Esta reaccin esta catalizada por la peptidiltransferasa, una actividad
enzimtica ubicada en la subunidad 50S. Experimentos recientes han demostrado que el
estremo 3-CCA del ARNt interacciona con un dominio muy conservado del ARNr de 23S,
lo que sugiere que el centro activo de la peptidiltransferasa est formado por el ARNr de 23S.
La unidad de formilmetionina activa del fMet-ARNtf es transferida al grupo amino del
aminoacil ARNt para formar un dipepptidil ARNt. El ataque del grupo amino enlace ester
para formar un enlace peptdico es una reaccin termodinmicamente favorable; el costo en
energa libre de la formacin de un enlace peptdico ya que se paga anteriormente durante la
formacin de un aminoacil ARNt.
La formacin de un enlace peptdico va acompaada de un cambio en la interaccion de los
ARNts con la subunidad 50S. Pero poseen la subunidad 50S, pero no con la subunidad 30S.
El ARNt desacilado ocupa ahora el lugar E.La siguiente etapa del ciclo de elongacin es la
translocacin. En ella tienen lugar tres desplazamientos: el ARNt abandona el lugar P de la
subunidad 30S, el dipeptidil-ARNt se desplaza del lugar A de la subunidad 30S al lugar P de
la subunidad 30S y el ARNm se desplaza a una distancia de tres nucletidos. Como resulta,
el siguiente codn est dispuesto para aceptar un nuevo aminoacil ARNt.
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En la translocacin interviene el factor de elongacin G. El EF. G al igual que el IF2 y el EF-
Tu alterna entre las formas GTP y GDP. La forma GDP del EF-G es la que dirige la etapa de
translocacin. Varias protenas de la subunidad 50S asi como el ARNr de 23S, actan de
forma concertada con EF-G para desplazar peptidil- ARNt y el ARNm. La hidrolisis del GTP
unido permite que EF-G se separece del ribosoma, L7/L12 podria actuar a modo de una
palanca en este movimiento dirigido dependiente del GTP. Despues de la translocacin, el
lugar A esta vacio libre para unirse a un aminoacil- ARNt e iniciador un nuevo ciclo de
elongacin.
LA SINTESIS DE PROTEINAS SE TERMINA POR MEDIO DE FACTORES DE
LIBERACION QUE LEEN LOS CODONES STOP
Cuando se llega a un codn stop Cmo finaliza la sntesis de una cadena poliptidica? Un
aminoacil- ARNt no se une normalmente al lugar A de ribosoma cuando el codn es UAA,
UGA o UAG. La celula normalmente no poseen ARNts con anticodones complentarios a
estas seales de parada en cambio los codones stop son reconocidos por factores de
liberacin, que son protenas. Uno de estos factores de liberacin, es RF1, reconoce UAA o
UAG, un segundo factor RF2 reconoce UAA o UGA, es interesante destacar el hecho de que
el ARNr 16S tambin juega un papel importante en la terminacin. La eliminacin de un
nico nucletido del ARNr de 16S.Hace que los ribosomas sigan leyendo a lo largo de los
codones stop UGA. Este nucletido est prximo a tripletes UCA en tndem que son
complementarios a UGA.
La unin de factores de liberacin de un codn de terminacin en el lugar A activa la
peptidiltransferasa de forma que hidroliza el enlace entre el polipptido y el ARNt en el lugar
P. la especifidad de la peptidiltransferasa se ve alterada por el factor de liberacin, de forma
que, en el agua, en lugar del grupo amino, el aceptor del fragmento peptidilo activado. La
cadena polipeptidica desprendida abandona al ribosoma seguido del ARNt ARNm. Por
ltimo, el ribosoma se disocia de las subunidades 30s y 50S antes de comenzar la sntesis de
otra molecula proteica.
LS PUROMICINA PROVOCA LA TERMINACION PREMATURA DE LA
CADENA, PORQUE MIMETIZA EL AMINOACIL- ARN DE TRANSFERENCIA.
El antibitico puromicina inhibe la sntesis de protenas liberando las cadenas polipeptidicas
nacientes de completar su sntesis. La puromicina es un analago de una porcin terminal
aminoacil-adenosina del aminoacil-ARNAt. Se acopla al lugar A del ribosoma e inhibe la
entrada del aminoacil ARNt. Adems, la puromicina contiene un grupo alfa-amino. Este
grupo amino, como el aminoacil-ARNt, forma un enlace peptdico con el grupo carboxilo de
la cadena peptdica creciente en una reaccin catalizada por la peptidiltransferasa. El
producto es un pptido que tiene un residuo de puromicina covalentemente unido a su
extremo carboxlico. Posteriormente, la peptidil-puromicina se disocia del ribosoma. Las
piromicina ha sido utilizada para determinar el estado funcional de los ribosomas.
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LOS ANTIBIOTICOS PROVOCAN ERRORES EN LA LECTURA Y BLOQUEAN
LA FORMACION DEL ENLACE PEPTIDICO Y LA TRANLOCACION
Se conoce muchos otros antibiticos que inhiben la sntesis de protenas y se establecio el
mecanismo de accin de algunos de ellos. La tetraciclina, el cloranfenicol y la eritromicima
son agentes antimicronos muy potentes que actan bloqueando distintas etapas de la sntesis
de protenas.
SINTESIS DE PROTEINAS EN EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS TIENE

MUCHOS ASPECTOS ESTRUCTURALES Y MECANISMOS COMUNES
La sntesis de protena en eucariotas es similar a las de los procariotas donde su estructura y
mecanismos se LA repiten en series superiores. Pero en los eucariotas se necesitan ms
componentes, que adems son ms complicadas.
1) Ribosomas:
Los ribosomas eucariticos son mayores y constan de una sub-unidad grande de 60 S
y otra pequea de 40 S, asi forman una partcula de 80 S.
2) ARN iniciador:
En los eucariotas los aminocidos de iniciacin es la metionina en vez de la N-
formilmetionina. Como en los procariotas tiene iniciacin en el tRNA especial.
3) Seal de iniciacin:
El codn de iniciacin en eucariotas siempre es AUG, a diferencian de procariotas
que no utilizan una secuencia.
Un mRNA eucaritico tiene un lugar de iniciacin y por eso es molde para una nica
protena. Por el contrario, los mRNAs procariotas tienen mltiples lugares de
iniciacin y puede actuar como molde para fotosntesis de varias protenas.
4) Complejos de iniciacin:
Los eucariotas poseen muchos factores de iniciacin y sus interrelaciones son ms
complicadas.
5) Factores de elongacin y terminacin:

Los factores son EF1 alfa y EF1 beta y son equivalentes a los EF TU y EF TS de
los procariotas y en el lugar A del ribosoma se coloca e aminoaci - tRNA
16
EN EUCARIOTAS LA TRADUCCION ESTA REGULADA POR PROTEINA
QUINASAS QUE INACTIVAN UN FACTOR DE INICIACION
La iniciacin es el paso limitante en sntesis de protenas.
Uno de los ejemplos de control de la traduccin surgi en el estudio de la hemoglobina. La
sntesis proteica que se obtiene gracias al inhibidor controlado por hemo (HCL).
El papel fisiolgico de la fosforilacido del IF2 por diferentes quinasas se utiliza tambin para
controlar la traduccin en otros tipos de clula, el descubrimiento de una quinasa inducida
por el interfern acta de un modo semejante a la clula infectada por virus sugiere que este
mecanismo se utilice ampliamente para controlar la expresin gentica en las clulas
eucariotas.
LA TOXINA DE LA DIFTERIA BLOQUEA LA SINTESIS DE PROTEINAS EN
EUCARIOTAS AL INHIBIR LA TRASLOCACION
La difteria fue la principal causa de muerte infantil hasta que se desarroll la inmunidad
eficaz.
Esta enfermedad se debe principalmente por Corynebacterium dephtheriae una bacteria que
crece en la parte superior del aparato respiratorio, esta se hospeda en algunas cepaz de C
deptherieae. Unos pocos de estos microorganismos de esta toxina son normalmente para
personas inmunizadas porque inhiben la sntesis de protenas.
Poco despus de entrar a la clula diana la toxina se rompe en un fragmento A de 21 kd y un
fragmento B de 40kd.
El fragmento A de la toxina cataliza la modificacin covalente de un componente clave a la
maquinaria de la sntesis de protenas, mientras el fragmento B permite el acceso del
fragmento A al cito sol de la clula.
Bibliografa
Noller,H.F., 1991.Ribosomal RNA and translation. Ann. Rev. Biochem.

60:191-227
Nierhaus, K.H., 1990. The allosteric three-site model for the ribosomal
elongation cycle:Features and future. Biochemistry 29:4997-5008.
Merrick, W.C., 1992. Mechanism and regulation of eukaryotic protein
synthesis. Microbial. Rev.56:291-315
Luver stryer, bioquimica cuarta edicion.capitulo 34.sintesis de proteinas.

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