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SIMULANDO A TCNICA DE

SEQUENCIAMENTO DO DNA

Autores: Jos Mariano Amabis e Solange Soares de Camargo


Verso inicial: Jos Mariano Amabis
Ilustraes: Pablo Candiani
Editorao: Gledsley Muller

Ficha Tcnica:
Tema central: Compreender a tcnica utilizada para o seqenciamento do DNA
rea de interesse: Biologia Molecular/Gentica
Pblico Alvo: Alunos do Ensino Mdio ou da Graduao
Nmero de participantes: 40 alunos em grupos de trs a cinco. necessrio que
se forme pelo menos 10 grupos, para que todos os nucleotdeos da fita molde possam
ser seqenciados.
Tempo da atividade: Cerca de 30 min (sem a discusso posterior)

PROJETO MICRO&GENE
Apoio Financeiro Pr-reitoria de Graduao da Universidade de So Paulo
Projeto Promat
RESUMO Esta atividade tem por objetivo ilustrar como se faz o
seqenciamento de DNA. Para tanto, cada grupo de alunos
recebe um basto de madeira contendo algumas contas com
letras que representa a cadeia de DNA a ser seqenciada. A
partir dessa cadeia molde, cada grupo sintetiza dez cadeias
complementares. A sntese das novas cadeias feita pelo
sorteio, em seqncia, do nucleotdeo complementar a cada um
dos nucleotdeos da cadeia molde. O sorteio de uma conta
branca indica que a sntese deve continuar com o sorteio do
nucleotdeo seguinte. O sorteio de uma conta colorida indica a
interrupo da sntese. A seguir, as cadeias obtidas por todos os
grupos so reunidas e ordenadas por tamanho, simulando a
separao das mesmas pela eletroforese. A traduo da cor da
ltima conta incorporada em cada uma das cadeias ordenadas
por tamanho, leva seqncia complementar da cadeia molde.

OBJETIVO Compreender a tcnica utilizada para o seqenciamento do


DNA.

JUSTIFICATIVA A Biologia Molecular o ramo da Biologia que mais tem se


desenvolvido nos ltimos anos. O conhecimento sobre os genes e
seu funcionamento deixou os laboratrios e passou a ter
interesses econmicos e ticos. Ao abordar os conhecimentos
relacionados s tcnicas empregadas em Biologia Molecular,
estamos contribuindo para que a escola cumpra seu papel de
transmitir o conhecimento socialmente produzido, e, a partir da
motivao que tais conhecimentos proporcionam, explorar aquilo
que estudiosos de pedagogia consideram contedos sempre
presentes: fatos, conceitos, princpios, procedimentos, atitudes,
normas e valores.

FUNO Esta atividade tem como funo pedaggica principal


PEDAGGICA aproximar o conhecimento cientfico do conhecimento escolar,
tornando a tcnica de seqenciamento de DNA compreensvel,
tanto para os alunos do ensino mdio como os da graduao.
Uma maior proximidade com o conhecimento cientfico pode
despertar no aluno o interesse por outras questes relacionadas
ao DNA e amplamente divulgadas pela mdia: projetos genomas,
testes de DNA, transgnicos, entre outros. despeito da ampla
divulgao, essas questes so muito mal compreendidas pelos
alunos, como atestam vrios estudos. Para a graduao, os
objetivos poderiam ser ainda ampliados de acordo com o contexto
em que a atividade fosse empregada. No incio de um curso de
Biologia Molecular, por exemplo, esta atividade poderia ser
utilizada para introduzir o conceito de replicao do DNA, ou at
mesmo para aprofundar o conhecimento j adquirido sobre a
estrutura desta molcula. Outras funes pedaggicas,
intrnsecas do trabalho em grupo podem ser ainda mencionadas:
a troca de informaes, o estabelecimento coletivo de uma
estratgia de ao, a anlise conjunta de dados, a transposio
de linguagem, entre outras.
PREPARANDO A 1. Conceitos prvios requisitados
ATIVIDADE
Para que os alunos do ensino mdio possam compreender o
significado da atividade, necessrio que eles tenham noes
sobre a estrutura do DNA e entendam a relao existente entre
DNA cromossomo, gene, ncleo e clula. Para os alunos da
graduao, alm das relaes citadas, ideal que o aluno possua
tambm algum conhecimento sobre a natureza e funo das
enzimas, o processo de desnaturao do DNA e a formao das
ligaes covalentes, pois, com a atividade, esses conceitos
podero ser compreendidos de forma mais significativa. Como
seqncia da atividade, o professor da graduao poder
explorar o processo de replicao do DNA.

2. Verificao dos conhecimentos sobre o sequenciamento


de DNA

Antes do incio da atividade interessante que o professor


verifique quais so os conhecimentos dos alunos sobre o que
seqenciar o DNA. Isto pode ser feito por meio de uma pergunta
simples do tipo: qual a primeira palavra que ocorre quando
voc ouve a expresso seqenciar o DNA?. O professor dever
registrar todas as palavras mencionadas e construir, a partir
desse conjunto, o conhecimento prvio dos alunos e sua rede
conceitual. Pode ser que os alunos fiquem intimidados e digam
que nada sabem. Cabe ao professor estimular a tempestade
cerebral e deixar que os alunos se manifestem livremente.
Algumas expresses como: Programa do Ratinho podem soar
estranhas, mas guardam estreita relao com o tema, uma vez
que o apresentador de TV um dos maiores divulgadores do
teste de paternidade que tambm emprega molculas de DNA. O
registro das manifestaes dos alunos pode facilitar as aes do
professor na preparao adequada da atividade

Material / grupo: 4 saquinhos de cores diferentes (verde, vermelho, amarelo


e azul) contendo contas brancas e coloridas;
1 placa de madeira com 2 fileiras de 10 furos;
1 basto de madeira contendo contas com letras;
10 bastes de madeira contendo contas transparentes

Material / classe: 1 placa grande de madeira


PROCEDIMENTO - 1 Organizar o material como indica a figura

2 Iniciar uma simulao de sntese da cadeia complementar


. cadeia molde atravs do sorteio da conta complementar
primeira letra da conta encontrada aps as contas transparentes
(na Fig. 1, a letra T). O saquinho escolhido para o sorteio
dever ser, portanto, o verde, pois ele contm os nucleotdeos
complementares a T, ou seja, A. A relao entre a cor do
saquinho e a conta dentro dele :

Verde Adenina (A)


Amarelo Guanina (G)
Azul Citosina (C)
Vermelho Timina (T)

Lembrar que as relaes de complementaridade so: A-T e C-G.


Fig. 1 Posicionamento
inicial dos bastes na 3 Colocar a conta sorteada no basto em frente cadeia molde
placa de madeira: contas (Fig. 2 - superior). Caso a conta sorteada seja de cor branca,
com letras (a), contas repetir o procedimento com um novo sorteio, agora relacionado
transparentes (b), placa
com a letra da 2 conta (no caso da Fig. 2, C). Caso seja
de madeira (c).
sorteada uma conta colorida, o processo deve ser
interrompido e a cadeia molde deslocada para o furo seguinte.
Reiniciar o mesmo procedimento (1 e 2) para a formao de uma
nova cadeia complementar (Fig. 2 - inferior)

4 Repetir os mesmos passos at que todas as cadeias


sintetizadas terminem com uma conta colorida ou sejam
totalmente completadas com contas brancas (Fig. 3).

Fig. 2 Movimento inicial


da cadeia molde. Fig. 3 Movimento da cadeia-modelo aps interrupo da sntese pelo sorteio
de uma conta colorida.

5 Por fim, as cadeias sintetizadas pelos grupos devem ser


ordenadas na placa grande de madeira de acordo com seus
tamanhos, ao longo do eixo maior da placa. Os bastes com
maior nmero de contas devem ser colocados nos primeiros
furos, seguidos pelos de menor nmero, e assim sucessivamente,
at que o ltimo contenha apenas uma conta colorida .
COMPREENDENDO A avaliao da compreenso da atividade, por parte dos
A ATIVIDADE alunos, poder ser feita com a utilizao de um texto que explica
o princpio da tcnica empregada. A tarefa dos alunos consiste na
substituio das palavras em negrito pelos nomes de cada
material utilizado durante a atividade.

Texto O seqenciamento do DNA baseia-se na interrupo da sntese da


cadeia complementar pela incorporao de um nucleotdeo
1) As palavras em negrito quimicamente modificado, um didesoxinucleotdeo. Na reao de
do texto ao lado podem seqenciamento, da qual esta atividade uma simulao, so
ser substitudas pelo misturados num mesmo tubo: o segmento de DNA a ser seqenciado
nome dos materiais (1), cadeias curtas de DNA denominadas de iniciadores ou
empregados na primers (2), a enzima DNA polimerase (3), os desoxinucleotdeos
atividade. Como voc das quatro bases nitrogenadas: A, T, C e G (4) e os seus
faria esta substituio? respectivos didesoxinucleotdeos (5). Inicialmente, as duas cadeias
Coloque o nmero de cada molcula de DNA so separadas, aquecendo-se a amostra a
correspondente palavra temperaturas superiores a 90C. Em seguida, a temperatura reduzida,
do texto no parntese permitindo que os iniciadores ou primers (2), se associem, por
que segue ao nome do complementaridade, ao segmento a ser seqenciado (1). A DNA
material empregado. polimerase (3) sintetiza, ento, a cadeia nova: onde houver um
Algumas palavras podem nucleotdeo de Adenina na cadeia-modelo, ser acrescentado um
ser empregadas mais de nucleotdeo de Timina e vice-versa, onde houver um de Guanina, ser
uma vez acrescentado um de Citosina e vice-versa. Como no h, por parte da
DNA polimerase, nenhuma preferncia entre os desoxinucleotdeos (4)
a) Contas brancas ( ) ou didesoxinucleotdeos (5), esses ltimos podem ser incorporados
b) Contas coloridas ( ) em lugar de um nucleotdeo normal. No entanto, quando a cadeia nova
c) Voc ou seus colegas de (6) recebe um didesoxinucleotdeo, a seqncia interrompida, uma vez
grupo ( ) que no h nesta molcula um radical hidroxila (OH) disponvel para a
d) Cadeia sintetizada ( ) formao da ligao covalente com o nucleotdeo seguinte. Cada
e) Cadeia molde ( ) didesoxinucleotdeo empregado na reao est associado a um
f) Placa grande de madeira cromforo, uma substncia que apresenta uma determinada cor quando
com furos ( ) estimulada por um feixe de laser. Desta forma, para conhecer a
g) Contas transparentes ( )
seqncia da cadeia-molde (1), um aparelho chamado seqenciador
automtico de DNA, separa os fragmentos sintetizados de diferentes
tamanhos por meio da eletroforese (7), na qual fragmentos menores
migram mais rpido que fragmentos maiores. Finalmente, o aparelho
identifica o ltimo nucleotdeo do conjunto de fragmentos de mesmo
tamanho pelo seu cromforo correspondente, obtendo-se, assim, a
seqncia da cadeia de DNA desconhecida (Fig.4).

Fig. 4 - Imagem obtida aps o seqenciamento de DNA. Cada pico colorido


representa um nucleotdeo na seqncia do DNA. Neste caso, uma seqncia
pode ser lida entre a posio 264 e 333 a partir do incio da seqncia.
Variaes para a sala Cada grupo pode utilizar somente um dos dideoxinucleotdios
de aula marcados (ou coloridos). No final, cada grupo organiza o material
obtido (as fitas novas) em uma canaleta especfica da placa
grande de madeira. O professor pode explicar que esta era a
maneira como o seqenciamento de DNA era feito na dcada de
80-90, antes que o seqenciador automtico de DNA fosse
desenvolvido. Alguns laboratrios, com menos recursos, ainda
utilizam esta metodologia. Complementando a aula, os alunos
poderiam pesquisar sobre esse tipo de seqenciamento manual e
analisar figuras de auto-radiografias de gis de seqenciamento,
tentando descobrir a seqncia de DNA da cadeia molde
Complementando a aula, os alunos poderiam pesquisar sobre o
seqenciamento manual e analisar figuras de autorradiografias de
gis de seqenciamento, tentando descobrir a seqncia de
DNA da fita molde.

Sugestes de As seguintes questes tm por objetivo avaliar o que o aluno j


atividades sabe ou o que ele aprendeu com as aulas sobre o DNA e com a
posteriores atividade de seqenciamento. Algumas so questes de resposta
direta, com o intuito principal de verificar a leitura a compreenso
da nomenclatura. Outras so questes mais investigativas, que
requerem maior elaborao mental. H tambm algumas
questes de vestibular que podem ser respondidas pelos alunos
do ensino mdio como forma de treinamento. Algumas destas
questes podem ser utilizadas na fase final da atividade ou no
incio, para avaliar o conhecimento prvio do aluno. Alguns textos
complementares sobre o tema se encontram no anexo 1 e podem
auxiliar o aluno a responder as questes.

Revendo Conceitos Fundamentais (Amabis e Martho, 2001-


Conceitos de Biologia, vol. 3, cap. 3)

1) Gene
a) o mesmo que cromossomo.
b) o mesmo que cromossomo
c) qualquer segmento da molcula do DNA.
d) conjunto de molculas de DNA de uma espcie.
e) conjunto de molculas de DNA de uma espcie.
f) um segmento de molcula de DNA que transcreve um RNA.

2) O material hereditrio dos seres vivos


a) a desoxirribose.
b) o acido desoxirribonuclico (DNA).
c) o acido ribonuclico (RNA).
d) a base nitrogenada.

Complete as frases de 3 a 5 preenchendo cada espao com um


dos termos a seguir:
(a) base nitrogenada
(b) desoxirribose
(c) nucleotdio

3) Cada uma das subunidades que constituem o polmero


conhecido pela sigla de DNA um (a) ( ).
4) ( ) um composto qumico presente no DNA, constitudo por
um ou dois anis de carbono e nitrognio, capaz de formar
ligaes de hidrognio.

5) O glicdio com 5 atomos de carbono (pentose) que entra na


composio do DNA chamado ( ).

6) Uma associao fraca de natureza eltrica entre tomos de


hidrognio de uma molecula e tomos eletronegativos de outra
molcula chamada ligao
a) de hidrognio.
b) covalente.
c) Inica
d) peptdica.

7) O modo pelo qual uma molcula de DNA se reproduz


chamado de
a) duplicao conservativa.
b) duplicao semiconservativa.
c) reproduo assexuada.
d) reproduo sexuada.

8) A polimerase do DNA uma enzima que


a) separa as duas cadeias de um RNA.
b) atua na fabricao de nucleotdios.
c) sintetiza RNA a partir de um modelo de DNA.
d) promove a unio de desorribonucleotdios.

Ligando Conceitos e Fatos (Amabis e Martho, 2001- Conceitos


de Biologia, vol. 3, cap. 3)
pg. 103

1. Se as ligaes de hidrognio de uma molcula de DNA


forem quebradas obtm-se
a) bases nitrogenadas livres.
b) cadeias polinucleotdicas isoladas.
c) desoxirriboses livres.
d) nucleotdos livres.

2. Uma substncia constituda por um fosfato, uma pentose e


uma base nitrogenada entre si um
a) acido nuclico.
b) aminocido.
c) nucleotdio.
d) polipeptidio.

3. Dizer que as duas cadeias de uma molcula de DNA so


complementares significa que
a) elas tm os mesmos tipos de bases nitrogenadas.
b) uma delas formada apenas pelas bases A e T, e a outra,
por C e G.
c) uma delas formada apenas pelas letras A e G, e a outra,
por T e C.
d) onde houver uma base A em uma delas, havera um T na
outra, e onde houver um C em uma cadeia, haver um G na
outra.

4. Um pesquisador determinou que a seqncia de bases de


um segmento de molcula de DNA ATTACGAGGTACATTCG.
A seqncia de bases do segmento correspondente da cadeia
complementar

a) ser ATTACGAGGTACATTCG.
b) ser GCCGTAGAACGTGCCTA.
c) sera TAATGCTCCATGTAAGC.
d) no pode ser determinada.

5. Um cromossomo possui
a) inmeras molculas de DNA intercaladas com molculas
de protenas.
b) inmeras molculas de DNA intercaladas com molculas
de RNA.
c) inmeras molculas de DNA intercaladas com complexos
de RNA e protenas.
d) uma nica molcula de DNA que percorre de ponta a
ponta.

6. Uma clula humana que possui 46 cromossomos, ter em


seu ncleo, aps a duplicao de seu material genetico
a) 46 molculas de DNA.
b) 46 molculas de DNA e 46 molculas de RNA.
c) 92 molculas de DNA.
d) 92 molculas de RNA.

7. As diversas clulas de um organismo multicelular so


diferentes entre si porque
a) possuem genes diferentes.
b) apesar de produzirem os mesmos tipos de RNAm, estes
so traduzidos por ribossomos diferentes com produo de
proteinas diversas.
c) apesar de produzirem os mesmos tipos de RNAm, estes
so traduzidos por RNA transportadores diferentes com
produo de proteinas diversas.
d) em cada uma delas est em fucionamento um conjunto
diferente de genes.

Questes de 1. O significado da sigla DNA


verificao de leitura: a) cido desoxirribose.
b) cido desoxiribonucleico.
c) desoxirribose nucleotdio cido.
d) cido nuclico de desoxirribose

2. So exemplos de macromolculas:

I. DNA e RNA.
II. Aminocidos.
III. Protenas.
IV. Acares.
V. Polissacardios.
a) Apenas I
b) I, III e IV
c) I, III e V
d) I, II, III, IV e V

3. O nmero de bases nitrogenadas encontradas em um


trecho de DNA de 2kb
a) 2.000.
b) 20.000.
c) 200.
d) no possvel determinar.

4. Rompendo-se as ligaes (ou pontes) de hidrognio de uma


molcula de DNA, obtm-se
a) nucleotdios livres.
b) bases nitrogenadas livres.
c) desoxirriboses livres.
d) cadeias polinucleotdicas isoladas.

5. Duas cadeias complementares de DNA so


a) duas hlices paralelas.
b) duas fitas com a mesma seqncia de nucleotdios.
c) duas cadeias de nucleotdios,nas quais A se pareia com T e
C com G.
d) duas cadeias de nucleotdeos antiparalelas.

6. Na natureza, vrias macromolculas so formadas por


subunidades menores que se repetem: o amido formado por
resduos de glicose, as protenas, por aminocidos, etc. A
subunidade que forma o DNA

a) a desoxirribose.
b) a ribose.
c) o nucleotdio.
d) a base nitrogenada.

7. As bases nitrogenadas que compem o DNA so de quatro


tipos, cujos nomes so

a) Adenina, Timina, Citosina e Guanina.


b) Adenina, Timidina, Citosina e Guanina.
c) Adenosina, Timina, Citosina e Guanina.
d) Adenina, Timina, citosina e Guanidina.

8. A enzima que participa ativamente da sntese de uma nova


cadeia de DNA a partir de um molde chamada de

a) DNA polimerase.
b) DNAase.
c) DNA sintetase.
d) DNA ligase.

9. Se um certo fragmento de DNA tem a seguinte seqncia


de nucleotdios ATTGGCTCT, a seqncia esperada na fita
complementar ser
a) TTAGGAAGA.
b) TAAGGCAGA.
c) UAACCGAGA.
d) TAACCGAGA.

10. Sobre a molcula de DNA, responda V (verdadeiro) ou F


(falso).

a) A + C sempre igual a G + T. (__)


b) A + G sempre igual a C + T. (__)
c) A sempre igual a T, e G a C. (__)
d) A relao de contedo de bases depende da espcie que
est sendo considerada. (__)

Questes de 1. (Unitau 95) No caracterstica do DNA:


vestibular:
a) o acar com cinco tomos de carbono.
b) a presena das bases nitrogenadas uracila, guanina, citosina
e adenina.
c) a presena de cido fosfrico.
d) polinucleotdeo.
e) ocorre nos cromossomos.

2. (Fuvest 2003) Qual das alternativas se refere a um


cromossomo?

a) Um conjunto de molculas de DNA com todas as


informaes genticas da espcie.
b) Uma nica molcula de DNA com informao gentica para
algumas protenas.
c) Um segmento de molcula de DNA com informao para
uma cadeia polipeptdica.
d) Uma nica molcula de RNA com informao para uma
cadeia polipeptdica.
e) Uma seqncia de trs bases nitrogenadas do RNA
mensageiro correspondente a um aminocido na cadeia
polipeptdica.

3. (Puc-rio 99) Os cromossomos so constitudos


principalmente por:

a. fosfolipdeos.
b. protenas.
c. cido ribonuclico.
d. enzimas.
e. cido desoxirribonuclico.
4. (Ufal 99) Para desempenhar sua funo como material
hereditrio, o DNA possui duas propriedades.Identifique-as e
descreva resumidamente cada uma delas.

5. (Ufrj 97) O ADN um polmero constitudo por vrios


nucleotdeos e as protenas so polmeros constitudos por vrios
aminocidos. Um gene constitudo por um nmero N de
nucleotdeos que codifica uma protena constituda por P
aminocidos.
Por que sempre encontramos N > P ?

6. (Unesp 94) No filme "Parque dos Dinossauros", um cientista


cria em laboratrio novas geraes de dinossauros, extintos h
65 milhes de anos, por meio do sangue conservado em
mosquitos que os teriam picado e que permaneceram fossilizados
no mbar. Com o sangue, foi possvel determinar o DNA dos
dinossauros, chegando-se assim frmula para recuperar a
espcie. Considere a possibilidade de que o DNA obtido pertena
a um nico dinossauro e que deste DNA foram recuperados
vrios exemplares.
a) O que se poderia dizer dos exemplares recuperados, caso um
dos animais seja sensvel a uma bactria que cause pneumonia?
b) Justifique sua resposta.

7. (Ufrj 2000) No incio do projeto do genoma humano, havia duas


estratgias a considerar:

I) seqenciar o ADN total dos cromossomos diretamente;


II) extrair todos os ARNs mensageiros, produzir ADN a partir
desses ARNs mensageiros e seqencial apenas esse ADN.

Nos dois casos, a tcnica de seqenciamento era a mesma.

Por que a segunda estratgia mais rpida e, portanto, mais


econmica?

8. (Ufrj 2001) Uma tcnica usada como uma ferramenta da


taxonomia emprega a seguinte abordagem: extrai-se o ADN de
um organismo e este , ento, marcado com fsforo radioativo. O
ADN radioativo ento desnaturado (suas cadeias so
separadas por calor) e posto em contato com o ADN de um outro
organismo, igualmente desnaturado, porm no radioativo. Aps
a hibridao (reassociao formando molculas hbridas),
possvel medir quanto ADN radioativo existe num ADN de cadeia
dupla.

Foi feito um experimento em que o ADN do organismo 1 (ADN


radioativo) foi "hibridado" com o ADN no radioativo de trs
outros organismos, obtendo-se os seguintes resultados:

ADN do organismo 1 + ADN do organismo 1 = 100% de


radioatividade no ADN hbrido
ADN do organismo 1 + ADN do organismo 2 = 10% de
radioatividade no ADN hbrido

ADN do organismo 1 + ADN do organismo 3 = 40% de


radioatividade no ADN hbrido

ADN do organismo 1 + ADN do organismo 4 = 85% de


radioatividade no ADN hbrido

Qual o organismo que pertence mesma espcie do organismo


1? Justifique sua resposta.

9. (Ufrj 2002) Em Junho de 2001, foi publicada a seqncia quase


completa do genoma humano. Esse projeto contou com a
participao de diversos laboratrios, que individualmente
determinaram a seqncia de vrios trechos diferentes do ADN
de todos os cromossomos, a partir da amostra de somente um
indivduo, que permaneceu annimo. Sabe-se, no entanto, que o
ADN era de um indivduo do sexo masculino. Por que foi
importante determinar a seqncia do ADN de um homem e no
de uma mulher?

10. (Cesgranrio 99) "EXAME DE PATERNIDADE, NO BRASIL, J


PODE SER FEITO COM SALIVA"

"Novo teste pode, pela anlise do DNA das clulas, identificar a


paternidade de uma pessoa sem a necessidade de coleta de
sangue. Esse tipo de teste particularmente indicado para bebs
e crianas pequenas."
(O GLOBO, 20/08/98)

Nesse tipo de teste, a semelhana estrutural existente entre as


molculas de DNA tomada por base para a identificao da
paternidade. Essa diferena consiste na(o):

a) seqncia de bases nitrogenadas.


b) aspecto da dupla hlice presente.
c) nmero de fosfatos contidos.
d) tipo de pentose existente.
e) tipo de desoxirriboses presentes.

11. (Fuvest 2001) O anncio do seqenciamento do genoma


humano, em 21 de junho de 2000, significa que os cientistas
determinaram

a) a seqncia de nucleotdeos dos cromossomos humanos.


b) todos os tipos de protena codificados pelos genes humanos.
c) a seqncia de aminocidos do DNA humano.
d) a seqncia de aminocidos de todas as protenas humanas.
e) o nmero correto de cromossomos da espcie humana.

1. Por que o DNA tambm chamado de molcula da


Questes para hereditariedade?
pesquisar:
2. De que forma voc ordenaria as seguintes estruturas:
Cromossomo, DNA, Gene, Ncleo? Qual o critrio voc utilizou
em sua ordenao?

3. O que acontece se durante o processo de replicao, ocorrer


a insero de um nucleotdio no complementar fita molde?
4. Qual a importncia da DNA polimerase para a clula? Por
que a sua taxa de erro deve ser baixa?
5. Quantas molculas de DNA existem no ncleo de uma clula
somtica humana (da mucosa da boca, por exemplo)?
a) Na fase G1 da interfase.
b) Na fase G2 da interfase.
c) Na metfase
6. Como voc imagina que deveria ser a definio de gene nas
diferentes pocas:
a) Quando Charles Darwin prope a teoria da Evoluo.
b) Quando Mendel publica os resultados de sua pesquisa com
ervilhas (1865).
c) Quando publicada a Teoria Cromossmica da Herana
(1902).
d) Quando Avery, Mac Leod e MacCaarthy concluem que o DNA
o material gentico (1944).
e) Quando descrito o cdigo gentico (1966).
f) Quando concluram o seqenciamento do Genoma Humano
(2003).
7. Quais so as foras que mantm a dupla hlice do DNA juntas
como uma unidade estvel? Na sua opinio, o que aconteceria a
esta unidade se o DNA fosse submetido a uma temperatura de
96C por 10 min? Justifique a sua resposta:

8. Pesquise em revistas e jornais textos nos quais as expresses:


cdigo gentico; mapa preliminar e rascunho do genoma
tenham sido usadas de forma ambgua e reescreva-o substituindo
as expresses por explicaes mais claras.

9. Depois de ler o texto a seguir, qual a sua opinio sobre o que o


autor escreve? Considera uma humilhao, ter apenas 300 genes
diferentes dos camundongos? Elabore um texto discordando ou
concordando do autor, justificando a sua opinio pessoal.

Ratos Humanos (Drauzio Varella. Folha de So Paulo,


24/02/2001)

Mulheres e homens tm apenas 30 mil genes! A divulgao deste


dado pelo Projeto Genoma foi um balde de gua fria no orgulho
humano: imaginvamos que fossem pelo menos 100 mil. Se as
moscas tm 13 mil genes, qualquer verme, 20 mil, um abacateiro,
25 mil, e os camundongos que caamos nas ratoeiras, 30 mil,
para ns, 100 mil parecia estimativa razovel (...). Admitir, no
entanto, que nosso genoma formado pelo mesmo nmero de
genes camundongos e que somente 300 genes so responsveis
pelas diferenas entre ns e eles, constitui humilhao
inaceitvel.
Respostas das Revendo Ligando Verificao Questes de
questes propostas: conceitos conceitos e de leitura vestibular
fundamen- fatos
tais
1 D B B B
2 B C C B
3 C D A E
4 A C D
5 B D C
6 A C C
7 B D A
8 D A
9 D
10 V-F-V-F A
11 A
ANEXOS O sequenciamento de DNA e o projeto Genoma Humano

Notas para o No dia 28 de junho de 2000, vrios jornais anunciaram o


professor "Mapeamento do Genoma Humano". A notcia trouxe para a
humanidade uma grande interrogao: "E agora? O que isto
significa?
As notcias na poca continham expresses como: "decifrado o
cdigo da vida", "seqenciados os 3,1 bilhes de letras do cdigo
gentico", "concludo o rascunho do trabalho, com cerca de 97%
do genoma, "conhecida a linguagem na qual Deus criou a vida" .
A busca de um significado para essas informaes requer, por
parte dos professores, a construo prvia de conhecimentos
sobre a estrutura e funo do DNA.
O DNA uma macromolcula formada por unidades que se
repetem, chamadas de nucleotdios. Cada nucleotdio formado
por um grupamento fosfato, uma pentose (a desoxirribose) e uma
base nitrogenada (A=Adenina,T=Timina, G=Guanina ou
C=Citosina) (Fig. 5).
Os nucleotdios se associam formando duas fitas
complementares que se mantm unidas por pontes de hidrognio
(Fig. 6).
Em virtude das ligaes existentes entre as fitas
complementares do DNA, esta molcula assume uma estrutura
em forma de escada em caracol, na qual as bases nitrogenadas
representaram os degraus (Fig. 7 - a) e o esqueleto acar-
fosfato representa o corrimo (Fig. 7 - b).

Nucleotdio

Fig. 5 Exemplo de um
nucleotdio que compe o
DNA. (b)

(a)

Fig. 7 Estrutura em dupla-hlice do DNA que lembra uma escada em caracol:


(a) degraus e (b) corrimo.
Vrios nucleotdios juntos formam um gene, ou parte de um
gene, como o do hormnio de crescimento humano, apresentado
a seguir:

Seqncia de parte do gene do Hormnio de Crescimento


Humano
Fonte: NCBI

gatcttaacatttttcccctatcatttttcccgtcttcatttgtcattttttccagaaaaaatcgtcattcgactcatgtcta
caacacgtctctctcggcttatcccctgacaccgcccgccgacagcccgcatggacgaatctatcaattcagc
ggagtctagttttatattgcagaatgcgagattgctggtttattataacaatataagttttcattattttcaaaaaggg
tttattgtgggtttaggtaagaaattgtctagtgctgtagccgcttcctttatgagtttaaccatcagtctgccgggtg
ggccgctgagaatcctcagcttaaagaaaacctgacgaattttgtaccgaagcattctttggtgcaagggatc
gttcccaaccattcccttatccaggctttttgacaacgctagtctccgcgcccatcgtctgcaccagctggcctttg
cctaccaggagtttgaagaagcctatatcccaaaggaacagaagtattcattcctgcagaacccccagacct
tctgtttctcagagtctattccgacaccctccaacagggaggaaacacaacagaaatccaacctagagctgc
gcatctccctgctgctcatccagtcgtggctggagcccgtgcagttcctcaggagtgtcttcgccaacagcctg
acggcgcctctgacagcaacgtctatgacctcctaaaggacctagaggaaggcatccaaacgctgatggg
gctggaagatggcagcccccggactgggcagatcttcaagcagacctacagcaagttcgacacaaactca
aacgatgacgcactagtcaagaactacgggctgctctactgcttcaggaaggacatggacaaggtcgagac
cctgcgcatcgtgcagtgccgctctgtggagggcagctgtggcttctag
Fitas complementares do
DNA Esses nucleotdios, representados apenas pelas letras
Fig. 6 Associao dos correspondentes s bases nitrogenadas que o compem, esto
nucleotdios formando as ordenados em uma seqncia especfica, e esta seqncia que
fitas complementares do caracteriza o gene do hormnio de crescimento. O gene da
DNA. insulina, por exemplo, que um outro hormnio, tem outra
seqncia.
Genes so definidos, portanto, como trechos do DNA que
contm informao para gerar, como produto final, um RNA que
pode gerar uma protena. Localizam-se no interior da clula em
estruturas chamadas cromossomos. Cada ser vivo tem em suas
clulas um nmero determinado de cromossomos: 8 como a
mosca das frutas, 16 como a cebola ou 46 como ns, humanos.
O Projeto Genoma Humano tinha por objetivo descobrir quais
so as seqncias que temos em nosso genoma. Mas, quantas
"letras" h em uma nica clula para serem seqenciadas?
Estima-se que haja cerca de 3,1 bilhes de letras em uma nica
clula humana haplide que formariam cerca de 30.000 a 40.000
genes e milhares de outras seqncias sem funo conhecida.

Do DNA s protenas Genoma e Proteoma: os dois lados da mesma moeda.


Eliana Dessen - Departamento de Biologia, Instituto de Biocincias,
Universidade de So Paulo.

O DNA o material hereditrio que passa de uma gerao a


outra e determina as propriedades inerentes de uma espcie. No
DNA a informao est codificada na seqncia de subunidades
qumicas denominadas nucleotdeos, cada um deles composto
por um grupamento fosfato, uma molcula do acar
desoxirribose, e uma das quatro bases nitrogenadas: adenina (A),
citosina (C), timina (T) e guanina (G). Cada clula de um
organismo contm um ou dois conjuntos do complemento bsico
de DNA, o genoma. No caso da espcie humana o genoma
composto por 24 molculas extremamente longas de DNA que
formam os cromossomos. No DNA cromossmico encontram-se
unidades funcionais denominadas genes que informam a clula
como produzir protenas. Os genes codificam protenas de um
modo indireto e composto por vrios passos. No primeiro passo a
informao contida no DNA copiada (transcrita) em uma
molcula de RNA mensageiro. Nos eucariotos o produto inicial da
transcrio, o transcrito primrio, processado de vrias
maneiras, antes de ser traduzido no citoplasma. O
processamento do transcrito primrio inclui uma srie de reaes
de splicing. Essas reaes removem os ntrons, segmentos
intercalados na regio de cdigo de um gene, e unem os
segmentos de cdigo, os xons, formando um RNA mensageiro
maduro. Subseqentemente, a informao contida no RNA
mensageiro traduzida (decodificada) numa fila de aminocidos,
ou seja, em um polipeptdio. Os polipeptdios, por si prprios ou
ento agregados com outros polipeptdios e constituintes
celulares formam as protenas funcionais da clula. Uma vez
sintetizadas nos ribossomos, as protenas sofrem vrios tipos de
modificaes. Elas so clivadas, eliminando assim seqncias
sinal, e podem se ligar a muitos grupamentos qumicos simples
ou a molculas mais complexas tais como aucares e lipdios.
O alto nvel de diversidade que o splicing alternativo do RNA
mensageiro de um gene pode produzir faz com que muitas
protenas diferentes possam ser produzidas a partir de um nico
gene. Por isso, a seqncia de DNA de um genoma conta apenas
uma pequena parte da histria do que uma clula especifica est
fazendo. Os pesquisadores tambm devem prestar ateno
histria contada pelo proteoma, ou seja, o conjunto de protenas
feitas de acordo com as instrues dos RNAs mensageiros
produzidos por uma clula em um dado momento.
O que nos conta a Na ltima dcada, o genoma humano foi objeto de intensa
seqncia do pesquisa biolgica e continuar a ser o centro das atenes por
genoma humano? muitos anos mais. A seqncia do genoma humano nos conta
que nosso genoma possui cerca de 3.200.000.000 de bases (A,
T, C, G). Porm, menos de 2% do genoma codifica protenas.
Estima-se que a frao do genoma que codifica protenas contm
de 30.000 a 35.000 genes, muito menos do que estimativas
anteriores previram, cerca de 100.000. Considerando-se o
nmero de genes ns somos apenas trs vezes mais complexos
que uma mosca de frutas e apenas duas vezes mais complexos
que o verme microscpico Caenohabditis elegans. Ainda no so
conhecidas as funes de mais do que 50% dos genes
descobertos. Quase um quarto dos genes que codificam protena
esto relacionados expresso, replicao e manuteno do
genoma e outros 20% especificam componentes das vias de
transduo de sinal que regulam a expresso do genoma e outras
atividades celulares em resposta a sinais recebidos do meio
externo. Todos esses genes podem ser considerados como tendo
funes que, de um modo ou de outro, esto relacionadas
atividade do genoma. As enzimas responsveis pelas funes
bioqumicas gerais da clula justificam outros 17,5% dos genes
com funo conhecida; e o restante est envolvido em atividades
como transporte de composto para dentro e para fora das clulas,
o dobramento das protenas em suas estruturas tridimensionais
corretas, e a sntese de protenas estruturais tais como as
encontradas no citoesqueleto e nos msculos.
Uma grande poro de nosso genoma (cerca de 50%)
contm seqncias repetitivas compostas principalmente por
elementos de transposio no funcionais. Esses elementos so
unidades genticas que podem se inserir num cromossomo, sair
e se movimentar para um outro sitio cromossmico. O excesso de
DNA no codificador no genoma descrito com DNA lixo,
significando seqncias sem qualquer funo aparente. Na
realidade, essas seqncias repetitivas constituem um rico
registro paleontolgico, pois fornecem indcios cruciais sobre
eventos e foras evolutivas. Como marcadores passivos, elas
possibilitam o estudo dos processos de mutao e seleo. Como
agentes ativos, as repeties deram nova forma ao genoma
promovendo rearranjos, criando genes inteiramente novos,
modificando e embaralhando os genes existentes.
A comparao da seqncia de nucleotdeos de diferentes
indivduos das populaes humanas mostra que quase 99,9%
das bases so exatamente as mesmas em todas as pessoas. As
diferenas entre genomas individuais so devidas a polimorfismos
de um nico nucleotdeo (SNPs). Esses SNPs (pronuncia-se
snips) so variaes que ocorrem quando uma nica letra do
nosso genoma alterada, por exemplo, existe um A ao invs de
um G numa determinada posio. Os geneticistas podem usar os
SNPs como marcadores em grandes trechos de cada
cromossomo permitindo assim que eles acompanhem variantes
gnicas numa populao e verifiquem o papel que elas
desempenham em doenas. Uma vez que seqncias especficas
de DNA so relacionadas a doenas, o prximo passo ir at os
genes naquela regio e procurar as seqncias tpicas que eles
contm. Os estudos dos SNPs podem revolucionar os novos
modos de previso de risco mais elevado de determinadas
doenas.
Todavia, a seqncia do genoma no nos conta quando um
gene expresso, onde seu produto est localizado, com que
outro produto gnico ele interage e que fentipo resulta se o gene
sofrer mutao.
Comparando O que ns temos em comum com moscas, vermes,
genomas leveduras e camundongos? A primeira vista, no muito. Por que
ento to importante para os cientistas conhecer essas
similaridades? A genmica comparada um mtodo importante
para a compreenso da seqncia do genoma. Similaridades
entre genes homlogos de diferentes organismos proporcionam
uma maneira de designar a funo de um gene desconhecido.
Esse um exemplo de como o conhecimento sobre o genoma de
um organismo pode ajudar a compreenso do genoma de um
segundo organismo.

Do genoma ao Existem informaes que com certeza a seqncia do


proteoma genoma fornece. Isso inclui a seqncia de aminocidos.
Entretanto, para se obter as informaes adicionais sobre a
protena incluindo as modificaes ps-traduo, as associaes
com outros polipeptdios e, como esses processos so afetados
por diferentes condies internas e externas necessrio que se
estude as prprias protenas.
O proteoma o conjunto de protenas expressas por um
genoma ou tecido. Os projetos proteoma, que tem por objetivo a
identificao e a caracterizao de todas as protenas expressas
por um tecido ou organismo, so o complemento necessrio para
a anlise em grande escala do genoma. O conceito de proteoma
fundamentalmente diferente daquele do genoma: enquanto o
genoma de fato esttico e pode ser bem definido para um
organismo, o proteoma muda continuamente em resposta a
eventos externos e internos. Por exemplo, um hepatcito e um
neurnio humano expressam protenas diferentes embora
possuam genomas idnticos. A idia da proteomica a obteno
de um quadro geral de centenas de milhares de protenas
diferentes presentes em cada tipo de clula e a verificao de
como ele muda em resposta aos estgios do desenvolvimento,
perodos de crescimento, influncias ambientais ou doenas do
organismo.
Como o proteoma converte as informaes fisiolgicas
recebidas do genoma nas aptides biolgicas da clula? O
primeiro aspecto a ser considerado a ligao direta entre a
seqncia de aminocidos da protena, determinada pelo DNA, e
suas propriedades qumicas. Alm disso, a enorme variabilidade
de protenas diferentes permite que elas desempenhem uma
vasta gama de atividades bioqumicas diferentes tais como
catlise, movimento, armazenamento, estrutura celular, transporte
de materiais, proteo e regulao de processos celulares.
As novas tecnologias da proteomica identificam, caracterizam e
acompanham as interaes de protenas numa grande variedade
de vias. Esse conhecimento permitir progressos na pesquisa
bsica e fornecer muitas ferramentas clinicas, incluindo novas
abordagens de descoberta de drogas e de diagnstico de
doenas. Estudos que combinam genes e protenas permitiro
que os pesquisadores se aproximem muito mais da compreenso
das causas moleculares das doenas e que planejem drogas que
intervenham exatamente no ponto desejado.

Onde obter http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/education/


informaes education.shtml
complementares http://www.phrma.org/issues/genomics/genomics.news.html
http://www.genome.gov
http://www.dnai.org/index.htm

GLOSSRIO Base Nitrogenada molcula que faz parte do nucleotdeo


Cromforo molcula orgnica capaz de absorver a luz e emiti-
la em uma cor especfica
Cromossomo estrutura presente no ncleo, na qual esto os
genes
Didesoxinucleotdeo nucleotdeo cujo radical OH foi removido
quimicamente
DNA cido desoxirribonuclico
DNA polimerase enzima que sintetiza DNA promovendo a
ligao de nucleotdeo e tendo uma cadeia de DNA como molde.
Eletroforese processo no qual molculas so separadas por
tamanho num campo eltrico
Enzima um tipo de protena, cuja funo auxiliar as reaes
qumicas para que aconteam de modo mais rpido.
Gene segmento de DNA responsvel por uma informao, que
poder gerar como produto final uma molcula de RNA ou uma
protena
Genoma DNA existente no ncleo haplide das clulas
Haplide clula que apresenta apenas um lote de
cromossomos (n).
Macromolcula molculas muito grandes, geralmente
formadas por subunidades que se repetem, ex: DNA, RNA e
protenas
Nucleotdeo subunidade que forma o DNA, composta por um
grupo fosfato, um acar e uma base nitrogenada
Primers ou iniciadores curtos segmentos de DNA de cadeia
simples, que tm como funo iniciar o processo de sntese de
DNA
Protena macromolcula biolgica formada por aminocidos
Radical hidroxila radical formado por um tomo de hidrognio
e outro de oxignio e que faz parte de vrias molculas biolgicas
importantes - OH
RNA cido ribonuclico. Tipo de cido nuclico de cadeia
simples que difere do DNA por apresentar em sua composio a
ribose, ao invs da desoxirribose e a uracila ao invs da timina.
Seqenciamento de DNA determinao da ordem exata de
nucleotdeos num segmento de DNA

Leituras GAINOTTI, Alba; MODELLI, Alessandra, Biologia para o Ensino


complementares para Mdio : Serie Parmetros Vol nico, pag. 334, Ed Scipione,
alunos do ensino 2002.
mdio
SILVA JUNIOR, Cezar; SASSON, Sezar; Biologia, Vol. 3, cap. 10,
1995.

AMABIS, Jos Mariano; MARTHO, Gilberto, Conceitos de


Biologia, vol. 3, cap. 3, Ed. Moderna, 2001

CHEIDA, Luiz Eduardo, Biologia Integrada, Vol. 3, cap 10, Ed


FTD, 2002.

Demais referncias ALBERTS, Bruce; BRAY, Dennis; LEWIS, Julian; RAFF, Martin;
bibliogrficas ROBERTS, Keith; WATSON, James D. Molecular Biology of the
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CAMPBELL, Neil A., REECE, Jane B., MITCHELL, Lawrence G.


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COOPER, Geoffrey M. The Cell - A Molecular Approach. 2 ed.


Sunderland (MA): Sinauer Associates, Inc., 2000.

LODISH, Harvey; BERK, Arnold; MATSUDAIRA, Paul; KAISER,


Chris A.; KRIEGER, Monty; SCOTT, Matthew P.; Zipursky, S.
Lawrence; Darnell, James Molecular Cell Biology. 5 ed. Nova
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MADER, Sylvia S. Biology. 6.ed. Boston, McGraw-Hill, Inc., 1998.

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