Macromolculas.

I. Protenas.
i. Aminocidos.
Cada aminocido tiene una estructura bsica. Un grupo carboxilo
(COO__) un grupo amino (NH3+), un tomo de Hidrogeno y un grupo
radical (R) todos ellos unidos a un carbono alfa. Existe, para cada
aminocido un ismero designado como aminocido D y L. En la
naturaleza los existen todos, pero en las protenas solo se encuentran
los L. El grupo radical les da a cada aminocido las caractersticas
especficas que van desde un simple Hidrgeno hasta los relativamente
complejos anillos aromticos. Nueve de estos aminocidos tienen un
grupo radical no polar, es decir, son hidrfobos. El resto son
hidrfilicos, pero dos de ellos son cidos por su grupo carboxilo y tres
bsicos.

ii. Pptidos.
El proceso de encadenamiento de los aminocidos para formar polmeros lineales requiere de la adicin de un nuevo
aminocido al polmero en formacin. Mediante una reaccin de deshidratacin el grupo OH y el hidrogeno provenientes
del grupo amino y carboxilo. Aunque en realidad el grupo amino transfiere los hidrgenos y el grupo carboxilo el oxgeno
como lo ilustran las imgenes.

El enlace entre el grupos carboxilo y el grupo amino se denomina enlace amida, si bien es el caso, en que los reactivos
son aminocidos, suele denominarse enlace peptdicos. Ntese que la estructura
resultante tiene en un extremo un grupo amino y del otro extremo un grupo
carboxilo. El extremo con el grupo amino se denomina N-Terminal (amino terminal) y el
extremo que del gripo carboxilo se denomina C-Terminal (carboxilo terminal).
Este proceso parece fcil, pero en realidad, es mucho ms complejo ya que la adicin de
cada aminocido requiere mucha energa e informacin. Es necesaria la energa para
activar al aminocido y unirlo a la cadena con una secuencia especfica, es decir, los
aminocidos no son ordenados de manera azarosa sino que est definida
genticamente formando cadenas polipeptdica. Ms adelante se analizar ese tema.
 iii. Protenas.
Cada protena est formada por una o varias cadenas polipeptdica. Las protenas que solo contiene un polipptido como
estructura y que sus funciones dependen del tipo de pegamento que adquieren durante su sntesis se denominan
monomricas. Muchas otras cadenas contienen ms de una cadena polipeptdica las cuales las llamaremos multimricas
y la funcin de estas depende de la forma tridimensional que adquieran.
iv. Plegamientos y enlaces.
Los plegamientos dependen del tipo de enlaces e interacciones que halla entre sus molculas.
Puente Dsulfuro. Se forman cuando los grupos sulfhdrilo de los residuos de cistena reaccionan oxidativamente. Una
vez formado, el puente dsulfuro confiere estabilidad al polipptido.
Puente de Hidrgenos. En las protenas forman hlices y plegamientos laminares. Adems los grupos radicales de
muchos aminocidos tienen grupos funcionales que son buenos donadores y aceptores de hidrgenos, dentro de los
donantes estn los grupos NH3 y el OH y como aceptores el COO y el SH. En general los puentes de hidrogeno son muy
dbiles pero la suma de ellos, ya que son muchos, hacen una fuerza considerable.
Enlaces Inicos. Dado que el grupo radical de algunos aminocidos estn cargados positivamente y otros negativamente
se atraen con gran fuerza incluso a grandes instancias. El plegamiento viene dictado por las cargas opuestas y si el pH
cambia, los enlaces se ven interrumpidos.
Interacciones de Van der Waals. Los electrones estn en constante movimiento, por tanto, la densidad de electrones
de un lado puede ser mayor en un lado que en otro. Las asimetras momentneas en la distribucin de electrones y la
separacin de cargas en una molcula se denominan dipolos cuando dos molculas que presentan estos dipolos estn
muy juntas (menos de 0.2 n.m.) y se orientan de forma adecuada, se atraen mutuamente y la distribucin asimtrica
persista en ambas molculas y de ese modo la atraccin transitoria entre molculas no polares se denominan fuerzas de
van der Waals.
Interacciones Hidrfobas. En realidad, estas no son fuerzas intermoleculares, ms bien es una tendencia al
agrupamiento entre molculas hidrfobas al ser excluidas de interacciones con el agua.
v. Niveles estructurales proteicos.
Estructura Primaria. La estructura
primaria de una protena es simplemente
una designacin formal de la secuencia
de aminocidos de un polipptido.
Cuando describimos la estructura
primaria de un polipptido estamos
describiendo la secuencia de
aminocidos tal como se sintetiza, es
decir desde el extremo N-Terminal al C-
Terminal. Una vez que se incorpora a la
cadena polipeptdica un aminocido,
este aminocido lo nombraremos
residuo aminoaclico.
La estructura primaria es importante, tanto genticamente, como estructuralmente. Desde el punto de vista gentico, la
secuencia de aminocidos deriva directamente del orden en el que estn dispuestos los nucletidos en el correspondiente
RNA mensajero. Y este a su vez fue codificado por la estructura de DNA en el gen.
Desde el punto de vista estructural, las configuraciones de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria) son
consecuencia de la estructura primaria.
Estructura Secundaria. En una hlice hay 3.6 aminocidos por vuelta y tienen la
distancia necesaria paraqu se forme un puente de hidrogeno entre el grupo amino y
el grupo carboxilo. La lamina se caracteriza por la abundancia de puentes de
hidrogeno. Estos enlaces pueden ser intermoleculares o intramoleculares, es decir,
unen polipptido adyacentes o hacen uniones en el mismo polipptido. Si las
interacciones se disponen al mismo sentido, es
decir, N-Terminal-C-Terminal, se denominan
lminas , si es lo contrario, esto es, opuestos,
son laminas antipapalelas. Dado que el
carbono constituye el esqueleto de pptido y est
por encima y por debajo del plano de la lmina, a esta estructura se le denomina
lamina plegada.
Para mostrar regiones concretas de una protena, los bioqumicos, han adoptado lo
siguiente, una regin Hlice se presenta como un espiral o un cilindro y la lmina
como listones con punta de flecha apuntando al C-Terminal.
Estructura Terciaria. La estructura terciaria depende directamente de la variabilidad del aminocido y de las
interacciones entre los radicales. Esta estructura es no repetitiva ni predecible, una vez conformada la estructura terciaria
se estabiliza y mantiene varios tipos de enlaces no covalentes e interacciones puentes dsulfuro covalentes (si los hay).
As estas protenas se dividen en dos categoras, fibrilares y globulares.
Estructura Cuaternaria. La estructura cuaternaria de una protena representa el nivel de organizacin que concierne a
las interacciones y ensamblaje de sus subunidades. La estructura cuaternaria solo puede aplicarse a protenas
multimricas. Los enlaces y fuerzas de atraccin que mantienen la estructura cuaternaria estable, son las mismas que en
la forma terciaria.
Existe, en muchos casos, un nivel de complejidad an mayor, de tal modo que las varias protenas se organizan y forman
un mismo complejo multiproteico. Tal es el caso de muchas enzimas.

II. Carbohidratos.
i. Monosacridos.
Monosacrido, del griego mono <<nicos>> y sakcharon
<<Azcar>>.
Un azcar puede definirse como un aldehdo o una cetona
con ms de un grupo hidroxilo. Existen pues dos tipos de
azucares: los aldo-azucares con un grupo carboxilo
terminal y los ceto-azucares, con un grupo carboxilo
intermedio. Dentro de cada grupo se les puede generar un
nombre de acuerdo al nmero de carbonos que tienen. Su
frmula es CnH2nOn y en ella se fundamenta el trmino
carbohidratos. Pues en un principio se pens que el
compuesto era un Hidrato de carbono Cn(H2O)n. Aunque
el trmino persiste no debe pensarse que esta molcula est formada por molculas de carbono hidratado.
 El monosacrido ms comn es la aldohexosa D-Glucosa (C6H12O6). Ntese que la Glucosa
tiene cuatro carbonos asimtricos (2, 3, 4 y 5). Hay, por tanto, 24 posibilidades de ismeros de
la glucosa pero la D-Glucosa es la ms estable. Los disacridos ms comunes son la maltosa,
la lactosa y la sacarosa, que tienen -D-Gluosa + -D.Galactosa, -D-Galactosa + -D-
Glucosa y -D-Glucosa + -D-Fructuosa, respectivamente. Formando entre ellos un enlace
Glucosdico y una reaccin de condensacin.
ii. Polisacridos
Los polisacridos cubren funciones de almacenamiento y estructurales. Los principales
polisacridos de almacn son el almidn y el glucgeno. Ambos formados por unidades de -
D-Glucosa unidos por enlaces -Glucosidicos. Se unen a las molculas adyacentes por medio
de los carbono 1 4 aunque existen ramificaciones con los carbonos 1 6 cada ocho
carbonos.

III. Lpidos.
El rasgo distintivo de los lpidos es su naturaleza hidrfoba. Aunque algunos son anfipticos, es decir, tienen una regin
polar y otra no polar. Podemos distinguir seis tipos de lpidos. cidos grasos, triglicridos, fosfolpidos, glicolpidos,
esteroides y terpenos.
cidos Grasos. La frmula general de los cidos grasos es CnH2nO2. Estn
formados por cadenas largas hidrocarbonadas no ramificadas con un grupo
carboxilo al extremo de la molcula. Es antiptica, el grupo carboxilo es, por
as decirlo, la cabeza, por lo tanto es polar y la cola hidrocarbonada es apolar.
La relacin de dobles enlaces entre tomos de carbono se denomina cidos
grasos insaturados y los que no los tienen se denominan cidos grasos
saturados.

Triglicridos o Triacilgliceroles. |

Fosfolpidos. Los fosfolpidos son muy parecidos a los triacilgliceroles pero con una diferencia estructural muy marcada
que a su vez difieren en las propiedades y en su papel dentro de la clula la clula. Los fosfolpidos los subdividiremos
en fosfoglicridos o esfingolpidos.
Los Fosfoglicridos son los fosfolpidos que predominan en las membranas. Los fosfoglicridos esterifican a una
molcula de glicerol. Sn embargo, el componente bsico de estas molculas son el cido fosfatdico, que tiene solo dos
cidos grasos y un grupo fosfato. De hecho, el cido fosfatdico es poco abundante en las membranas pero es de suma
importancia en la sntesis del fosfoglicerol.
En lugar del cido fosfatdico tienen un
pequeo alcohol hidrfilo que est unido al
grupo fosfato mediante un enlace ster
representado como un grupo radical. Los
alcoholes suelen ser la serina, etanolamina,
la colina o el inositol.

Los Esfingolpidos estn formados por el aminoalcohol esfingosina. Esta molcula tiene una larga cadena hidrocarbonada
con una nica instauracin en el extremo polar. A travs de su grupo amino, la esfingosina puede formar un enlace amida
por el que se une una cido graso de cadena larga variable en longitud e instauracin.
Glicolpidos. Los glicolpidos son derivados de la esfingosina, en unos casos del
glicerol, que contiene un grupo carbohidrato en lugar de un grupo fosfato. Los
que tienen esfingosina se denominan glicoesfingolpidos. El grupo carbohidrato
puede tener de una a seis azucares y estas pueden ser D-glucosa, D-galactosa o
N-acetil-D-galactosamina. Los carbohidratos son hidrfilos, lo cual convierte al
glicolpidos a una molcula anfiptica.
Estos tienen importancia estructural en la membrana de las clulas vegetales y
en las clulas del sistema nervioso.

Esteroides. Son derivados de un esqueleto hidrocarbonado formado por cuatro

anillos que los hacen estructuralmente distintos al resto de los lpidos. La nica
propiedad en comn es su naturaleza hidrfoba, es decir, son apolares. Los
esteroides nicamente aparecen en clulas eucariticas. El esteroide ms
abundante es el colesterol. Esta es una molcula anfiptica con una cabeza polar
(grupo hidroxilo en el carbono 3) y un cuerpo y cola hidrocarbonados (esqueleto
de cuatro anillos y cadena hidrfoba lateral en la posicin 17). El colesterol est
presente en todas las membranas excepto en la membranas internas del cloroplasto
y la mitocondria. En otras clulas aparecen esteroides similares al colesterol como
el estigmaterol y el sitoesterol en clulas vegetales o el ergosterol en clulas
fngicas. El colesterol es el punto de partida para la sntesis de hormonas
esteroideas, Entre las que se incluyen las hormonas sexuales, los glucocorticoides
y los mineralcorticoides.
 Terpenos. Los terpenos se sintetizan a partir del isopreno compuesto por cinco tomos de carbono;
por ello tambin son denominados isoprenoides. El isopreno y sus derivados se unen en varias
combinaciones para producir sustancias como la vitamina A1, los pigmentos carotenoides y los
dolicoles que estn implicados en la activacin de azucares, por ltimo los transportadores de
electrones como la coenzima Q la plastoquinona.

IV. cidos Nucleicos.

i. Nucletidos.
Cada nucletido est formado por un azcar de cinco tomos de carbono el
cual se une a un grupo fosfato y una base nitrogenada. El azcar es D-ribosa
(para RNA) o D-desoxirribosa (para DNA). El fosfato se une por un enlace
Fosfoster al carbono 5 del azcar y la base se une al carbono 1. La base
puede ser una purina o una pirimidina. Las purinas del DNA son la adenina
(A) y la guanina (G) y las pirimidinas son la citosina (C) y la timina (T). El
RNA tiene tambin la adenina, guanina y citosina, pero en lugar de la timina
tiene como pirimidina al Uracilo (U).

Si se quita el grupo fosfato de un nucletido, la molcula se denomina nuclesido. Cada pirimidina o purina pueden
aparecer como bases libres. Como indica la nomenclatura un nucletido equivale a a un nuclesido monofosfato, esta
terminologa se extiende a las molculas con dos o tres grupos fosfato. Como son el adenosin monofosfato (AMP), el
adenosin difosfato (ADP) y el adenosin trifosfato (ATP). Probablemente reconozca principalmente al ATP como fuente
de energa e intermediario en muchas reacciones.

ii. cidos Nucleicos.

Los cidos nucleicos son los polmeros lineales formados por la unin sucesiva de nucletidos mediante el grupo fosfato.
El grupo fosfato se une mediante un enlace Fosfoster al carbono 5 de un nucletido, se une por un segundo enlace
Fosfoster al carbono 3 del siguiente nucletido mediante una reaccin de condensacin entre los grupos -H y OH
provenientes del azcar y del grupo fosfato respectivamente. El polinucletido formado tiene una direccionalidad con un
grupo hidroxilo 5 en un extremo y otro hidroxilo 3 en el otro extremo.
La sntesis de cidos nucleicos requiere de
energa e informacin pues los nucletidos que
van incorporndose deben ser aadidos
secuencialmente, determinada gentica-mente.
Para la formacin de estos polmeros es
importante saber que las bases pricas y
pirimidicas cumplen con una propiedad
qumica muy importante, las relaciones de
complementariedad. Estas relaciones se deben
a los tomos de carbono, nitrgeno e hidrogeno
que interaccionan entre si formando puentes de
hidrgeno. Pero los puentes de hidrogeno no
son formados al azar sino se forma entre una
purina y una pirimidina, es decir se unen una
Adenina con una Timina (o Uracilo) formando
dos puentes de hidrogeno y una Guanina con
una Citosina que forman tres puentes de
hidrgeno. Por ahora solo diremos que los
polmeros de los nucletidos son el RNA y el
DNA, ms adelante se detallar perfectamente
su estructura.