ADN FUNCIONAL Y NO FUNCIONAL

Los cientficos del consorcio del proyecto llamado ENCODE (Encyclopedia of DNA
Elements) han analizado el 1% del genoma humano (30 megabases ) y han encontrado
numerosos elementos funcionales que no son genes. Estamos acostumbrados a pensar que
los elementos funcionales de un genoma son los genes pero esta visin est cambiando por
completo. La primera conclusin de este estudio es que la mayor parte del genoma se
transcribe casi independientemente de que sean genes o no. La segunda conclusin se
relaciona con la regulacin transcripcional en la que se ha descubierto una gran importancia
de secuencias reguladoras que no son protenas.
En este proyecto se detect un conjunto de regiones conservadas que se supone son
elementos funcionales. De este conjunto de elementos funcionales slo un 32% corresponde
a genes, un 28% corresponde a elementos conocidos situados en regiones no codificates (no
genes) y el resto que es un 40% son elementos de regiones no codificantes, sin anotacin
alguna y por tanto de funcin desconocida. Esta conclusin est totalmente de acuerdo con
mltiples hallazgos de asociacin de SNPs localizados en espacios no correspondientes a
genes con importantes enfermedades como es el caso de la diabetes tipo 2. Tambin se ha
visto que es muy importante en la regulacin de la transcripcin la accesibilidad y el estado
de las histonas. Finalmente la tercera es una visin ms sofisticada de la cromatina. Este
estudio tambin ha permitido obtener nuevas claves en la evolucin del genoma humano
basado en comparaciones de secuencias dentro del genoma humano (intra-especie) y entre
especies cercanas (inter-especie).
ANLISIS DE SECUENCIA DE ADN
La secuenciacin del ADN es un conjunto de mtodos y tcnicas bioqumicas cuya
finalidad es la determinacin del orden de los nucletidos (A, C, G y T) en
un oligonucletido de ADN. La secuencia de ADN constituye la informacin gentica
heredable que forman la base de los programas de desarrollo de los seres vivos
(de procariotas, de eucariotas en el ncleo celular, y en los plsmidos, en la mitocondria y
en cloroplastos de las plantas). As pues, determinar la secuencia de ADN es til en el
estudio de la investigacin bsica de los procesos biolgicos fundamentales, as como en
campos aplicados, como la investigacin forense. Adems, se puede utilizar la
secuenciacin del ADN para conocer las mutaciones somticas, como las sustituciones
de bases, generadas entre distintos organismos.

El desarrollo de la secuenciacin del ADN ha acelerado significativamente la

investigacin y los descubrimientos en biologa. Las tcnicas actuales permiten realizar
esta secuenciacin a gran velocidad, lo cual ha sido de gran importancia para proyectos
de secuenciacin a gran escala como el Proyecto Genoma Humano. Otros proyectos
relacionados, en ocasiones fruto de la colaboracin investigadora a escala mundial, han
establecido la secuencia completa de ADN de
muchos genomas de animales, plantas y microorganismos. A pesar de las distintas
tcnicas que permiten secuenciar el ADN, no siempre se puede llegar a conocer el genoma
completo de los organismos. Esto, puede llevar a errores en la reconstruccin de los
linajes y en la estimacin del tipo de mutaciones y del nmero de mitosis generadas.
CRIBADO DE MUTACIONES EN LA SECUENCIA
Las mutaciones pueden darse en tres niveles diferentes:
Molecular (gnicas o puntuales): Son mutaciones a nivel molecular y afectan la
constitucin qumica de los genes, es decir a la bases o letras del DNA.
Cromosmico: El cambio afecta a un segmento de cromosoma (de mayor tamao que un
gen), por tanto a su estructura. Estas mutaciones pueden ocurrir porque grandes
fragmentos se pierden (delecin), se duplican, cambian de lugar dentro del cromosoma.
Genmico: Afecta al conjunto del genoma, aumentando el nmero de juegos
cromosmicos (poliploida) o reducindolo a una sola serie (haploida o monoploida) o
bien afecta al nmero de cromosomas individualmente (por defecto o por exceso), como
la trisoma 21 o Sndrome de Down.

ESTUDIO DE EXPRESION GENICA

En el campo de la biologa molecular, el perfil de expresin gnica es la medida de la

actividad (de la expresin gnica) de miles de genes simultneamente, para crear una
imagen global de la funcin celular. Estos perfiles pueden, por ejemplo, distinguir entre
las clulas que se estn dividiendo activamente, o mostrar cmo las clulas reaccionan a
un tratamiento en particular. Muchos experimentos de este tipo analizan
un genoma completo simultneamente, es decir, cada gen presente en una clula en
particular.
La tecnologa de chip de ADN1 mide la actividad relativa de los genes diana previamente
identificados. Tambin se utilizan para perfiles de expresin gnica las tcnicas basadas
en la secuenciacin, como el anlisis en serie de la expresin gnica SuperSAGE. La
tcnica SuperSage es especialmente precisa y puede medir cualquier gen activo y no solo
un conjunto predeterminado. La llegada de tecnologas de nueva generacin de
secuenciacin ha hecho del anlisis de expresin basado en la secuencia una alternativa
digital llamada tecnologa RNA-Seq (secuenciacin masiva de transcriptoma), cada vez
ms popular comparada con la tecnologa de microarreglos. Sin embargo la tecnologa de
microarreglos es mucho ms comn, considerando los 17 000 artculos PubMed de 2006.
GENES CAUSANTES DE ENFERMEDADES MENDELIANAS QUE HAN SIDO
CLONADOS Y MAPEADOS

Hipoplasia del cartlago piloso (CHH, cartilage hair hypoplasia), identificada por
primera vez entre la poblacin Amish. Uno de cada 19 lleva una copia defectuosa del gen
recesivo, que causa no solo enanismo, sino adems alta propensin a cnceres y
desrdenes inmunolgicos
La razn de este "apartado" dentro de las enfermedades genticas recesivas es que una
vez mas los Amish, fuente aparentemente inagotable de sorpresas en gentica,
permitieron al Genetista Maaret Ridanp de la Universidad de Helsinki descubrir que
el responsable de esta enfermedad es un gen recesivo pero codificante solo para ARN,
llamado RMRP. Un cambio en solamente una base de este gen (la mutacin mas usual es
la substitucin de un G por A) resulta responsable de esta enfermedad (cuando la
mutacin se da en ambos cromosomas) .
El ARN transcripto por este gen es capaz de interactuar con protenas ( no servir de
mensaje para sintetizar una protena!!!!) y formar una enzima que altera la funcin de la
mitocondria.
Los casos son raros, a pesar de que por definicin se expresan siempre, la razn est en
la dificultad para reproducirse de los gravemente afectados.

La enfermedad de Huntington es autosmica y dominante, su resultado es la

destruccin progresiva de la clulas del cerebro. Si uno de los padres es heterocigoto (lo
cual por supuesto implica que es enfermo) el 50% de los hijos tendr el carcter y la
enfermedad. Si es homocigota el 100%. La enfermedad no se manifiesta hasta la edad de
30 aos, aunque algunos fenmenos relacionados con la enfermedad pueden presentarse
a los 20 aos.
La enfermedad, perteneciente el grupo de las enfermedades neurodegenerativas
producidas por expansin de trinucletidos

Polidactilia es la presencia de seis dedos en manos o pies. Actualmente a menudo el dedo

extra se extirpa quirrgicamente al nacer y el individuo no conoce que es portador del
carcter. Una de la mujeres de Enrique VIII tena un dedo extra . En ciertas familias del
sur de USA es mas comn. El dgito extra raramente es funcional y sin ninguna duda
causa problemas en el momento de comprar guantes