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Gac Sanit. 2017;31(4):342345

Nota metodolgica

Imputacin de valores ausentes en salud pblica:


conceptos generales y aplicacin en variables dicotmicas
Gilma Hernndez a,b , David Morina c,d y Albert Navarro d,
a
Instituto de Investigaciones Mdicas, Universidad de Antioquia, Medelln, Colombia
b
Programa de Doctorado en Metodologa de la Investigacin Biomdica y Salud Pblica, Departament de Pediatria, dObstetricia i Ginecologia i de Medicina Preventiva,
Universitat Autnoma de Barcelona, Bellaterra (Cerdanyola del Valls, Barcelona), Espana
c
Unitat dInfeccions i Cncer (UNIC), Programa dInvestigaci en Epidemiologia del Cncer (PREC), Institut Catal dOncologia (ICO)-IDIBELL,
LHospitalet de Llobregat (Barcelona), Espana
d
GRAAL-Unitat de Bioestadstica, Facultat de Medicina, Universitat Autnoma de Barcelona, Bellaterra (Cerdanyola del Valls, Barcelona), Espana

informacin del artculo r e s u m e n

Historia del artculo: Que haya valores ausentes en variables registradas en encuestas de salud es habitual, pero no lo es impu-
Recibido el 23 de noviembre de 2016 tarlos posteriormente cuando se realiza el anlisis. Trabajar con datos imputados puede tener ventajas
Aceptado el 9 de enero de 2017 en trminos de precisin de los estimadores y de identificacin sin sesgos de la asociacin entre varia-
On-line el 15 de marzo de 2017
bles. Probablemente, el proceso de imputacin sigue siendo desconocido para muchos profesionales no
estadsticos, que le atribuyen una alta complejidad y quizs un objetivo que no es exactamente el que
Palabras clave: persigue. Para aclarar estas cuestiones, esta nota pretende ofrecer una visin amena, no exhaustiva, del
Valores ausentes
proceso de imputacin, que permita conocer sus bondades para el trabajo de un salubrista. Todo ello
Imputacin
Salud pblica
en el marco de variables dicotmicas, habituales en salud pblica. Para ilustrar los conceptos se usa un
Epidemiologa ejemplo en el cual se trabaja con datos con valores ausentes, imputados de forma simple y mltiple.
2017 SESPAS. Publicado por Elsevier Espana, S.L.U. Este es un artculo Open Access bajo la licencia
CC BY-NC-ND (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Imputing missing data in public health: general concepts and application


to dichotomous variables

a b s t r a c t

Keywords: The presence of missing data in collected variables is common in health surveys, but the subsequent
Missing data imputation thereof at the time of analysis is not. Working with imputed data may have certain bene-
Imputation fits regarding the precision of the estimators and the unbiased identification of associations between
Public health
variables. The imputation process is probably still little understood by many non-statisticians, who view
Epidemiology
this process as highly complex and with an uncertain goal. To clarify these questions, this note aims to
provide a straightforward, non-exhaustive overview of the imputation process to enable public health
researchers ascertain its strengths. All this in the context of dichotomous variables which are common-
place in public health. To illustrate these concepts, an example in which missing data is handled by means
of simple and multiple imputation is introduced.
2017 SESPAS. Published by Elsevier Espana, S.L.U. This is an open access article under the CC
BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Introduccin El abordaje ms frecuente consiste en ignorar los valores


ausentes y usar la variable sin mayor consideracin. Al hacerlo con-
Que haya valores ausentes es frecuente en salud pblica. Igno- juntamente con otra variable sin valores ausentes, el anlisis tiene
rarlos conlleva la prdida de potencia del estudio y la obtencin en cuenta solo aquellos casos completos (listwise deletion [LW]),
de estimadores ineficientes y posiblemente sesgados. Los valores descartando informacin disponible. Con esta estrategia, si el an-
ausentes representan falta de informacin en el contenido de una lisis es multivariado, incluso en situaciones en que el porcentaje de
o varias variables en un conjunto de datos, y pueden deberse a valores ausentes sea bajo en cada variable, puede suponer que el
factores como la no respuesta en una encuesta, la falta de alguna nmero de casos analizados sea sensiblemente inferior al tamano
medicin, la prdida en el proceso de recoleccin, etc. Algunos muestral con el que se crea trabajar3 . Ello implica estimaciones
ejemplos en el mbito de la salud pblica son la imputacin del ins- ineficientes y, a veces, sesgadas47 .
tante de seroconversin al virus de la inmunodeficiencia humana1 La alternativa consiste en imputar los valores ausentes, consi-
o el estado fsico y mental en las personas mayores2 . guiendo que no se descarten casos. Si bien se dispone de programas
estndar, como SAS, R, Stata o SPSS, que cuentan con algoritmos de
imputacin, diramos que su uso no es habitual.
Autor para correspondencia. Existe literatura sobre imputacin en el mbito de la salud, pero
Correo electrnico: albert.navarro@uab.cat (A. Navarro). la mayora se ocupa de la imputacin de variables continuas7,8 y

http://dx.doi.org/10.1016/j.gaceta.2017.01.001
0213-9111/ 2017 SESPAS. Publicado por Elsevier Espana, S.L.U. Este es un artculo Open Access bajo la licencia CC BY-NC-ND (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-
nd/4.0/).
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G. Hernndez et al. / Gac Sanit. 2017;31(4):342345 343

no dicotmicas, muy habituales en salud pblica. El propsito de Imputacin mltiple


esta nota es ofrecer a profesionales no estadsticos una descrip-
cin general de la imputacin de valores ausentes, enfatizando en Su objetivo primario es mantener la variabilidad de la pobla-
variables de naturaleza dicotmica. cin preservando las relaciones entre variables. Tiene tres fases
(fig. 1):
Mecanismos de prdida
1. Imputation step: se crean m >1 conjuntos de datos completos
Existen tres mecanismos: donde en cada uno se mantienen fijos los valores observados
(x1i ), imputando los valores ausentes x1i imp k . El valor imputado
Missing Completely At Random (MCAR): la probabilidad de obser- para una misma observacin en cada conjunto no tiene por qu
var un valor ausente en una variable no depende de las otras ser el mismo, lo cual incorpora variabilidad a estos valores (de los
variables ni de ella misma. Los sujetos con y sin valores ausentes cuales nunca conoceremos el valor real). La obtencin de valo-
tienen las mismas caractersticas. res plausibles se consigue mediante un modelo de imputacin,
Missing At Random (MAR): la probabilidad de observar un valor que debera contener las variables que se analizarn posterior-
ausente depende de otras variables, no de los valores de la propia mente, incluida la respuesta, ms aquellas que ayuden a explicar
variable. los valores ausentes.
Missing Not At Random (MNAR): la probabilidad de observar un 2. Completed-data analysis step: cada conjunto de datos es
valor ausente depende de los valores de la propia variable, una vez analizado individualmente mediante procedimientos estn-
controladas el resto de las variables. En esta situacin no pueden dar,
 obteniendo estimadores particulares en cada conjunto
imputarse los valores ausentes.
 
X1 k y  X1 k . Los estimadores diferirn en cada conjunto a


Es importante identificar el patrn en que aparecen los datos causa de la variacin introducida en la imputacin de los valores
ausentes, ya que esto puede determinar la viabilidad de imputar y, ausentes.
en caso afirmativo, el mtodo ms eficiente3,5,7 . 3. Pooling step: combinando las estimaciones de los diversos con-
juntos de datos mediante reglas simples6 se obtienen los
estimadores definitivos ( X1 imp ), as como los errores ( X1 imp )
Imputacin simple
que incorporan la incertidumbre de los valores ausentes.
Consiste en asignar un valor al valor ausente, que poste-
riormente es analizado exactamente igual que los realmente Para profundizar en la imputacin mltiple pueden consultarse
observados. Para variables dicotmicas existen varios mtodos: Rubin6 y Van der Palm et al.2 .
entre otros, generar una nueva categora que agrupe los valores
ausentes; asignar el valor del vecino ms cercano; o el mtodo Hot- Ejemplo
Deck, que consiste en extraer al azar, del grupo de sujetos con las
mismas caractersticas que el que presenta el valor ausente, uno Tenemos una poblacin con tres variables dicotmicas: la
de los valores observados (donador). El lector interesado puede dependiente, YBin(N, =0,207); la variable con valores ausen-
profundizar en imputacin simple consultando varios trabajos4,5 . tes, X1 Bin(N, =0,399); y una sin valores ausentes, X2 Bin(N,

Id X1 X2 Y
1 x11 x21 y1
2 x12 x22 y2
3 x23 y3 Conjunto de datos original,
con valores ausentes

n x1n x2n yn

x1, x1

Fase 1: Imputation step

Id X1 X2 Y Id X1 X2 Y Id X1 X2 Y
1 x11 x21 y1 1 x11 x21 y1 1 x11 x21 y1
2 x12 x22 y2 2 x12 x22 y2 2 x12 x22 y2
3 x13_imp_1 x23 y3 3 x13_imp_2 x23 y3 3 x13_imp_m x23 y3

n x1n x2n yn n x1n x2n yn n x1n x2n yn

x1_1, x1_1 x1_2, x1_2 Fase 2: Completed-data analysis step


x1_m, x1_m

Fase 3: Pooling step

x1_imp, x1_imp

Figura 1. Esquema del proceso de imputacin mltiple para una variable X1, con dos covariables sin valores ausentes (X2 e Y).
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344 G. Hernndez et al. / Gac Sanit. 2017;31(4):342345

MCAR MAR
0,020

0,015
SE (X1)

0,010

0,005

0,000
5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35%
LW IS IM LW IS IM
Porcentaje de valores ausentes
MCAR MAR
3,5

3,0

2,5
OR (X1)

2,0

1,5

1,0

0,5
5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35%
LW IS IM LW IS IM
Porcentaje de valores ausentes
MCAR MAR
3,5

3,0

2,5
OR (X1)

2,0

1,5

1,0

0,5
5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35% 5% 15% 25% 35%
LW IS IM LW IS IM
Porcentaje de valores ausentes

Figura 2. Resultados de las simulaciones: error estndar de X1 (SE(X1 )), OR(X1 ) y OR(X2 ). La lnea discontinua indica el valor poblacional.

=0,442). Seleccionamos muestras de tamano n = 1000 con 1) porque se cree que su objetivo consiste simplemente en sustituir
diferentes porcentajes de prdidas segn MCAR y MAR (vase un valor ausente por uno imputado; 2) por la percepcin de que es
el Apndice disponible online como Material suplementario). Se una tcnica compleja; y 3) por la creencia de que ante la incerti-
estiman los coeficientes de una regresin logstica segn LW, impu- dumbre que provoca un valor ausente lo ms prudente es dejarlo
tacin simple (mtodo Hot-Deck, librera R HotDeckImputation9 ) e como tal. La primera es falsa; sobre la segunda, creemos que puede
imputacin mltiple, mediante ecuaciones encadenadas2,10 (libre- afirmarse que hay tcnicas ms complejas cuyo uso est genera-
ra R mice10 ). Se comparan los resultados en trminos de precisin lizado; y para la ltima opinamos que, a menudo, imputar puede
para la estimacin de X1 y de la asociacin entre X1 y X2 con Y. ser ms prudente que no hacerlo (con la informacin disponible
En la figura 2 se presentan los resultados de las simulaciones. e imputando podemos lograr estimadores ms eficientes y menos
En trminos de precisin de X1 puede observarse que, con LW, sesgados, si no insesgados).
a mayor porcentaje de prdida, peor precisin, mientras que al Trabajar con LW aumenta la imprecisin, y si el mecanismo de
trabajar de forma imputada esta se mantiene. En trminos de aso- prdida es MAR, generar estimadores sesgados5,7 . Hay que dis-
ciacin de X1 con Y se observa que, cuando el patrn de prdidas es tinguir entre imputacin simple e imputacin mltiple: la primera
MCAR, todos los mtodos realizan estimaciones cercanas al valor solo sustituye el valor ausente por otro que es tratado exactamente
real. Sin embargo, cuando el patrn es MAR, LW obtiene estimado- igual que uno observado; la segunda consiste en un proceso ms
res con mayor sesgo al aumentar el porcentaje de valores ausentes. elaborado que permite capturar la incertidumbre de los valores
La imputacin simple y la imputacin mltiple arrojan estimado- ausentes. A diferencia de cuando se trabaja con una variable con-
res cercanos al valor real en todos los casos, ligeramente con menor tinua, donde la imputacin simple suele subestimar el error57 ,
variabilidad con la imputacin mltiple. segn nuestros resultados para variables dicotmicas parecera que
las diferencias entre imputacin simple e imputacin mltiple no
Discusin y conclusiones son tan sensibles, siempre que el mecanismo de imputacin repro-
duzca el patrn de prdida. Y es que la validez de los resultados
En nuestra opinin, hay tres razones fundamentales por las depende de que, en el caso de la imputacin mltiple, el modelo de
que el uso de la imputacin mltiple sigue siendo poco frecuente: imputacin se realice adecuadamente3 .
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G. Hernndez et al. / Gac Sanit. 2017;31(4):342345 345

Ntese que la magnitud y la direccin del sesgo no siempre Agradecimientos


coincidirn con lo mostrado en nuestro ejemplo; depender de la
relacin entre las variables estudiadas. Siguiendo a Sterne et al.,3 Queremos agradecer a la Dra. Valeria Stuardo MA la lectura cr-
en la actualidad los procedimientos de imputacin son amplia- tica y los posteriores comentarios a una de las versiones de este
mente accesibles, por lo que no existe excusa para que los anlisis manuscrito.
potencialmente enganosos e ineficientes basados en LW sean con-
siderados adecuados sin mayor atencin. Anexo. Material adicional

Editora responsable del artculo Se puede consultar material adicional a este artculo en su ver-
sin electrnica disponible en doi:10.1016/j.gaceta.2017.01.001
Mara Victoria Zunzunegui.
Bibliografa
Contribuciones de autora
1. Prez-Hoyos S, Ferreros I, del Amo J, et al. Imputacin del instante de serocon-
versin al VIH en cohortes de hemoflicos. Gac Sanit. 2003;17:47482.
Todas las personas firmantes contribuyeron a la concepcin y 2. Van der Palm DW, van der Ark LA, Vermunt JK. A comparison of incomplete-data
el diseno del trabajo, el diseno de las simulaciones, el anlisis y la methods for categorical data. Stat Methods Med Res. 2016;25:75474.
interpretacin de los datos, la escritura del documento y su revisin 3. Sterne JAC, White IR, Carlin JB, et al. Multiple imputation for missing data in
epidemiological and clinical research: potential and pitfalls. BMJ. 2009;338:
crtica con contribuciones intelectuales importantes, y aprobaron b2393.
la versin final para su publicacin. 4. Little RJA, Rubin DB. Statistical analysis with missing data. New York: Wiley;
2002.
5. Schafer JL, Graham JW. Missing data: our view of the state of the art. Psychol
Financiacin Methods. 2002;7:14777.
6. Rubin DB. Multiple imputation for nonresponse in surveys. New York: Wiley-
Si bien este trabajo no ha tenido financiacin directa, el segundo Interscience; 2004.
7. Donders ART, van der Heijden GJMG, Stijnen T, et al. Review: a gentle introduc-
autor ha sido parcialmente apoyado por becas del Instituto de Salud tion to imputation of missing values. J Clin Epidemiol. 2006;59:108791.
Carlos III (Gobierno de Espana), cofinanciado por fondos FEDER 8. Canizares M, Barroso I, Alfonso K. Datos incompletos: una mirada crtica para su
(Fondos para el Desarrollo Regional Europeo) - Una forma de hacer manejo en estudios sanitarios. Gac Sanit. 2004;18:5863.
9. Joenssen DW. HotDeckImputation. Hot Deck Imputation Methods for Missing
Europa (referencias: RD12/0036/0056, PI11/02090) y por la Agn-
Data. 2015.
cia de Gesti dAjuts Universitaris i de Recerca (2014SGR 756) y 10. Van Buuren S, Groothuis-Oudshoorn K. MICE. Multivariate Imputation by Chai-
RecerCaixa 2015 (MD088652). ned Equations in R. J Stat Softw. 2011;45:167.

Conflicto de intereses

Ninguno.

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