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a la Identificacin y Validacin
de Dianas Teraputicas
Informe de Vigilancia Tecnolgica
Biotecnologa Aplicada
a la Identificacin
y Validacin de Dianas
Teraputicas
Informe de Vigilancia
Tecnolgica
BIOTECNOLOGA APLICADA
A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
4
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
ndice de contenido
RESUMEN EJECUTIVO 7
5
5. APLICACIONES DE LAS TCNICAS DE VALIDACIN DE DIANAS 40
8. CONCLUSIONES 61
ANEXOS 65
REFERENCIAS 116
GLOSARIO 119
6
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Resumen ejecutivo
Las dianas teraputicas son molculas localizadas correcta validacin de dianas teraputicas reduce
en cualquier parte de la clula, capaces de por tanto el tiempo y coste necesario para el
reconocer un frmaco y producir una respuesta desarrollo de un frmaco eficaz, ya que se evita
celular que modifique el curso de una continuar con los esfuerzos empleados en el
enfermedad. La evaluacin de dianas teraputicas desarrollo de frmacos cuyas dianas no han sido
constituye un proceso que incluye las etapas de validadas adecuadamente. De este modo, la
identificacin, caracterizacin y validacin de industria farmacutica conseguira optimizar sus
dianas, siendo este ltimo el paso final en la esfuerzos de I+D orientndolos hacia los proyectos
determinacin de la implicacin de la diana en el basados en dianas validadas correctamente, con
proceso patolgico. La secuenciacin del genoma mayores posibilidades de salir adelante.
humano ha revelado la presencia de un gran
nmero de potenciales dianas teraputicas, sin Las tcnicas genmicas y protemicas que se
embargo, la mayora de estas dianas no han sido emplean en la identificacin y validacin de dianas
completamente caracterizadas ni se ha son de diversa naturaleza, y se emplean
establecido su asociacin con una enfermedad generalmente en combinacin con otras tcnicas
concreta. Se ha estimado que el nmero de complementarias. La identificacin de dianas se
dianas potenciales teraputicas se encuentra en realiza principalmente mediante tcnicas de
torno a 600 y 1.500, no obstante, los frmacos anlisis de la expresin gnica o bien mediante el
que actualmente se encuentran en el mercado anlisis de interacciones protena-protena, como
actan sobre alrededor de 500 dianas diferentes. los microarrays de ADN y microarrays de protenas
El reto actual consiste en seleccionar a partir del respectivamente. En cuando a las tecnologas
conjunto de genes del genoma humano aquellos relacionadas con la validacin de dianas, la
genes que dan lugar a protenas que pueden modulacin de la expresin gnica mediante
llegar a ser dianas teraputicas. tecnologas antisentido y el empleo de modelos
vivos de la enfermedad como los ratones knock-out
La tasa de fracaso a lo largo del proceso de son las tcnicas ms relevantes. No obstante, otras
investigacin farmacutica es elevada, ms del tecnologas complementarias como los microarrays
80% de los proyectos se abandonan durante la de clulas y tejidos, clulas madre embrionarias, y
fase de descubrimiento anterior a los ensayos tcnicas de inactivacin de protenas como
clnicos, de modo que slo uno de cada cinco CALI/FALI, son alternativas cada vez ms
proyectos consigue iniciar los ensayos clnicos. Una empleadas en las etapas de validacin de dianas.
7
1. Introduccin a la validacin de dianas
El presente informe tiene por objeto el estudio de las por el organismo. Las molculas que reconocen
tcnicas que se emplean en la actualidad en la estos frmacos se denominan dianas teraputicas,
validacin de dianas prestando especial atencin a las y su modulacin permite modificar el curso de un
aplicaciones de las tcnicas genmicas y protemicas. proceso patolgico. Las dianas sobre las que
actan los frmacos pueden ser de diferente
Los frmacos se componen de sustancias activas naturaleza, pudiendo ser azcares, protenas o
o compuestos responsables del efecto teraputico, cidos nucleicos (ADN o ARN), sin embargo, la
los cuales ejercen su accin sobre la enfermedad mayora de los frmacos que se encuentran en el
cuando el compuesto es absorbido y distribuido mercado actan sobre dianas proteicas1.
Diana teraputica
Molcula localizada en cualquier parte de la clula, capaz de reconocer a un frmaco y producir una
respuesta celular que modifique el curso de una enfermedad.
El desarrollo de nuevos frmacos constituye un largo preclnicas y clnicas. Por tanto, una buena
proceso que se puede dividir en una serie de fases, caracterizacin de la actividad biolgica de las
la primera de las cuales consiste en la identificacin dianas moleculares que han sido identificadas en las
de nuevas dianas teraputicas. La identificacin de primeras fases, es fundamental para la obtencin de
compuestos activos con actividad biolgica un mayor nmero de frmacos. No obstante, debido
relacionada con las dianas previamente descritas a la complejidad de los procesos biolgicos que dan
conforma la segunda etapa de este proceso. El lugar a distintas patologas, no siempre es posible
ltimo paso consiste en el desarrollo y optimizacin identificar una diana que permita desarrollar un
del frmaco a lo largo de las distintas fases frmaco eficaz.
Validacin de dianas
Proceso que tiene por objeto demostrar que una determinada diana molecular est implicada en la
aparicin y progresin de una enfermedad. La validacin de una diana permite establecer una
relacin entre la alteracin de la diana y su potencial teraputico.
La validacin de dianas consiste por tanto en alterar el curso de una enfermedad. Sin embargo,
determinar si una diana molecular est implicada la validacin de dianas puede realizarse
en una enfermedad concreta, y por tanto es igualmente tanto a nivel molecular como gentico
potencialmente susceptible de ser considerada mediante herramientas genmicas y protemicas,
como diana teraputica a la hora de disear que permiten relacionar una diana con un estado
nuevos frmacos. Para algunos autores la patolgico determinado. El grado de validacin de
validacin de una diana se consigue nicamente una diana estar por tanto relacionado con la
cuando un frmaco se emplea con xito para cantidad de datos preclnicos y clnicos que se
1
Smith, M. B. (2003). Hitting the target. Nature, vol. 422, 341-347.
8
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
renan respecto al mecanismo biolgico de la activos3. Sin embargo, no se debe olvidar que en
diana y su relacin con la eficacia del frmaco2. la realidad muy pocas dianas identificadas
El paso de una fase a otra del desarrollo de durante las primeras fases del proceso de I+D
frmacos depende en gran medida del grado de conducen al desarrollo de un frmaco eficaz, por
validacin de la diana en cuestin y del avance en lo que el grado de incertidumbre del proceso de
el descubrimiento de potenciales compuestos desarrollo farmacolgico es muy elevado.
Optimizacin
Identificacin Validacin Seleccin de Fase Fase
de
de dianas de dianas compuestos Preclnica Clnica
compuestos
2
Epstein, D. M., et al. (2002). Target Validation with Nucleic Acid Aptamers. Mimicking small molecule therapeutics by
attacking the protein, and not the gene. Pharmaceutical Discovery and Development. PharmaVentures Ltd.
3
Whittaker, P. A. (2003). What is the relevance of bioinfomatics to phamacology? Trends In Pharmacological Sciences, 24
(8), 434-439.
4
Douglas S. A., et al. (2004). Techniques: Cardiovascular pharmacology and drug discovery in the 21st century. Trends in
Pharmacological Sciences. Vol. 25 N 4: 225-233.
5
Liu, R., et al. (2004). New approaches in identifying drugs to inactivate oncogene products. Seminars in Cancer Biology
14: 13-21.
6
Hopkins. A. L. et Groom, C. R. (2004). The druggable genome. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol. 1 727-730.
7
Lander, E. S., et al. (2001). Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. 409(6822), 860-921.
Venter, J. C., et al. (2001). The sequence of the human genome. Science. 291(5507). 1304-51.
9
Genoma humano: 20.000-25.000 genes
600-1.500
dianas teraputicas
Mltiples dianas
Identificacin de dianas
candidatas
Algunas dianas
Validacin de dianas
potenciales
Mltiples
Cribado de compuestos
compuestos
candidatos
Desarrollo clnico
Frmaco
Seguridad Dosificacin Efectividad
candidato
Frmaco final
Figura 3. Papel de la validacin de dianas en el proceso de desarrollo de nuevos frmacos.
Fuente: elaboracin propia.
10
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Transcripcin Traduccin
ARNm
ADN Protena
Anlisis de la expresin
gnica al nivel de la
transcripcin
8
Gen candidato: gen localizado en una regin de un cromosoma sospechosa de estar involucrada en una enfermedad y
cuyos productos proteicos sugieren que podra ser el gen de la enfermedad en cuestin
(http://www.conocimientosweb.net/portal/term1494.html).
9
ConocimientosWeb.net (http://www.conocimientosweb.net/portal/term1494.html).
10
Fenotipo: rasgos o caractersticas visibles de un organismo, determinado por su constitucin gentica (genotipo) y por el
ambiente en el que crece y se desarrolla.
11
El ADN (cido desoxirribonucleico) es una molcula de gran tamao que se encuentra en todos los seres vivos y que es
portadora de la informacin gentica. El ARN (cido ribonucleico) es una molcula parecida al ADN en cuanto a sus
caractersticas qumicas, que tambin est relacionada con la transmisin de la informacin gentica, ya que acta como
intermediario en el proceso de traduccin o formacin de protenas.
11
Aunque todas las clulas contienen la misma expresan de modo diferencial en dos muestras
informacin gentica, los genes se expresan en diferentes. Los resultados que se obtienen no
diferentes momentos dependiendo de la funcin proporcionan informacin acerca de la cantidad de
de la clula o tejido y de su estado fisiolgico. El ARNm y no se pueden comparar resultados
anlisis del perfil de expresin de genes consiste obtenidos en experimentos distintos13. Por este
en la identificacin y cuantificacin de los genes motivo, aunque son de gran utilidad en las
que se expresan en una clula o tejido concreto primeras etapas de identificacin de dianas, no se
en un determinado momento. El estudio del perfil suelen emplear con el fin de validar dianas14.
de expresin de genes se puede realizar a partir
de la identificacin y cuantificacin del ARN o bien
de las protenas expresadas directamente. 2.1.1. Anlisis serial de la expresin
gnica (SAGETM)
Las tcnicas de anlisis de la expresin gnica
emplean el primer tipo de abordaje, de modo que
El anlisis serial de la expresin gnica (SAGETM)
la comparacin de los genes expresados en se basa en la presuncin por la cual un segmento
muestras distintas permite descubrir los genes corto procedente de ARNm posee una complejidad
que se encuentran activados e inactivados en suficiente como para identificar un gen completo.
diferentes estados metablicos y patolgicos. Por Esta tcnica fue desarrollada por la empresa
tanto, comparando la expresin de genes de Genzyme como plataforma tecnolgica de
tejidos sanos y enfermos, es posible descubrir los descubrimiento de nuevas dianas oncolgicas15, y
genes implicados en el desarrollo y progresin de ha sido adoptada por el Instituto Nacional del
la enfermedad, as como establecer una Cncer (NCI) como mtodo de anlisis de la
asociacin entre el estado patolgico y expresin gnica dentro del Proyecto Anatoma
determinados genes que se encuentran alterados del Genoma del Cncer16.
en esa enfermedad, y por tanto validar posibles
dianas teraputicas.
Estos segmentos cortos se obtienen mediante la
accin de enzimas de restriccin, que cortan en
Las principales tcnicas de identificacin de lugares especficos el ADN complementario
dianas basadas en el anlisis de la expresin sintetizado a partir del ARN mensajero total de la
gnica son los microarrays de ADN, el Anlisis muestra. Midiendo la cantidad de copias de cada
serial de expresin gnica (SAGE), y la fragmento especfico se puede estudiar el nivel de
Electroforesis en geles de poliacrilamida (PAGE). expresin de un gen concreto, identificar
Otras tcnicas alternativas de anlisis de la simultneamente miles de fragmentos de este
expresin gnica son variantes de la PCR como tipo en una clula o tejido y cuantificar sus
RaSH, RDA, RSDD, DDRT-PCR12. La principal niveles de expresin. La comparacin de dichos
limitacin de estas ltimas radica en que son perfiles en muestras sanas y enfermas permite
laboriosas y requieren la inversin de un tiempo asociar la presencia de genes con enfermedades
considerable para identificar los genes que se concretas17.
12
Pillutla, R. C. et al. (2002). Target Validation and drug discovery using genomic and protein-protein interaction
technologies. Expert Opinion on Therapeutic Targets, 6 (4): 517-531.
13
Chanda, S. K. et Caldwell, J. S. (2003). Fulfulling the promise: drug discovery in the post-genomic era. Drug Discovery
today. Vol. 8, N 4. 168-174.
Allen, N. L. et al. (2003). Representational difference anlisis: critical appraisal and metod development for the
identification of unique DNA sequences from prokaryotes. Journal of microbiological methods. 55: 73-81.
14
Coleman, R. A. and Clark, K. L. (2003). Target validation using human tissue. Targets Vol. 2, No. 2: 58-64.
15
Serial Analysis of Gene Expression (SAGE), Genzyme
(http://www.genzyme.com/research/gzmo/discovery/discoveryplatforms2_sage_gzmo.asp).
16
SAGE Genie, Cancer Genome Anatomy Project, CGAP. (http://cgap.nci.nih.gov/SAGE).
17
Serial Analysis of Gene Expression, Sagenet web page (http://www.sagenet.org).
12
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
18
Kramer, R. et Cohen, D. (2004). Functional genomics to new drug targets. Nature Reviews. Vol. 3: 965-972.
19
El ADN est compuesto por dos cadenas enrolladas alrededor de s mismas que forman una doble hlice, cada una de
ellas formada por millones de bloques qumicos llamados bases, y denominadas por las letras A, T, G y C. Estas bases
poseen la capacidad de unirse entre s de forma especfica, de modo que las uniones entre las bases A-T y G-C son
complentarias entre s.
20
Lpez, M.; Mallorqun, P.; Vega, M. (2002). Microarrays y Biochips de ADN: Informe de Vigilancia Tecnolgica. Genoma
Espaa, Crculo de Innovacin en Biotecnologa y Fundacin General de la Universidad Autnoma de Madrid.
13
Identificacin de dianas mediante tcnicas de anlisis de la expresin gnica
ARN
Transcripcin inversa
ADN copia
SH
HS
Secuenciacin
Cuantificacin
Separacin mediante
electroforesis
Fig. 5. Validacin de dianas mediante tcnicas de anlisis de la expresin gnica.
Fuente: Velculescu, V. E. et al. (2000). Analysing uncharted transcriptomes with SAGE. Trends Genet. Oct;16(10): 423-5;
University of Miami Department of Biology Homepage
(http://fig.cox.miami.edu/~cmallery/255/255hist/ecbxp4xSDS.jpg).
21
Kramer, R. et Cohen, D. (2004). Functional genomics to new drug targets. Nature Reviews. Drug discovery. Vol. 3: 965-972.
22
Lindsay, M. A. (2003). Target discovery. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol. 2: 831-838.
14
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
23
Brown, D. & Superti-Furga, G. (2003). Rediscovering the sweet spot in drug discovery. Drug Discovery today. 8 (23):
1067-1077.
Pillutla, R. C., et al. (2002). Target validation and drug discovery using genomic and protein-protein interaction
technologies. Expert Opin. Ther. Targets, 6(4): 517-531
24
Los anticuerpos son protenas especializadas producidas por el sistema inmunolgico que se unen a partculas extraas
denominadas antgenos.
25
Kramer, R. et Cohen, D. (2004). Functional genomics to new drug targets. Nature Reviews. Vol. 3: 965-972.
26
Kumble, K. D. (2003). Protein microarrays: new tools for pharmaceutical development. Anal Bioanal Chem. 377: 812-819.
27
Wang, S., et al. (2004). Tools for target identification and validation. Curr. Op. in Chem. Biol. 8: 371-377.
28
Kramer, R. et Cohen, D. (2004). Functional genomics to new drug targets. Nature Reviews. Vol. 3: 965-972.
15
2.2.2. Sistema doble hbrido La identificacin de dianas teraputicas mediante el
sistema doble hbrido analiza las interacciones
entre dos protenas diferentes, que se unen a los
El sistema doble hbrido es una herramienta
dominios de unin de ADN y activacin de un gen
molecular que permite el estudio a gran escala de
que se utiliza como indicador respectivamente. La
las interacciones protena-protena a travs de las
unin de los dos dominios a travs de las protenas
protenas que regulan la expresin gnica,
fusionadas permite la activacin de la expresin del
denominadas factores de transcripcin29. Estas gen indicador, por lo que su presencia pondr de
protenas son las encargadas de regular la manifiesto la existencia de una interaccin entre
expresin de los genes mediante su activacin o las dos protenas31. El sistema doble hbrido
represin. La mayora de los factores de aprovecha la maquinaria celular de la levadura S.
transcripcin presentan dos regiones o dominios, cerevisiae, que se utiliza como sistema de
un dominio de unin al ADN y un dominio expresin de ambas protenas de fusin. Por otro
responsable de la activacin del gen. Ambos lado, esta tcnica permite estudiar la interaccin
dominios son esenciales para que tenga lugar la entre protenas y construir redes de interacciones
expresin gnica, aunque no tienen porqu de todo el proteoma, proporcionando una visin
formar parte de una misma protena30. global de la maquinaria molecular32.
Dom.
Activ.
Dom.
Activ.
Protena
2
Protena Protena Protena
1 2 3
La principal limitacin de esta tcnica radica en que positivos provocados por la activacin del gen
no permite analizar las interacciones entre indicador por parte de otras protenas de la
protenas localizadas en compartimentos diferentes levadura, adems de falsos negativos debido a
de la clula, limitando por tanto su aplicacin. Por problemas en la unin de las dos protenas33.
otra parte, es habitual la presencia de falsos
29
Factor de transcripcin: protenas que regulan la expresin de determinados genes, mediante la activacin o represin de
su expresin.
30
Coates, P. J. & Hall, P. A. (2003). The yeast two-hybrid system for identifying protein-protein interactions. Journal of
Pathology 199:4-9.
31
Pillutla, R. C. et al. (2002). Target validation and drug discovery using genomic and protein-protein interaction
technologies. Target Validation and Drug Discovery. 6 (4): 517-531.
32
Parsons, A. B. et al. (2003). Yeast genomics and proteomics in drug discovery and target validation. Progress in Cell
Cycle Research. Vol 5. 159-166.
33
Coates, P. J. & Hall, P. A. (2003). The yeast two-hybrid system for identifying protein-protein interactions. Journal of
Pathology 199:4-9.
16
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
34
Los oligonucletidos son molculas de cido nuclico de longitud reducida que se pueden emplear para bloquear el ARN
mensajero e impedir su funcin.
35
Ilag, LL, et al. (2002). Emerging high-throughput drug target validation technologies. Drug Discovery Today 7(18
Suppl):S136-42.
36
Stone, L. S. et Vulchanova, L. (2003). The pain of antisense: in vivo application of antisense oligonucleotides for
functional genomics in pain and analgesia. Advanced Drug Delivery Reviews 55, 1081-1112.
17
Ribosomas
Oligo antisentido
37
Hall, J. (2004). Unravelling the general properties of siRNAs: strength in numbers and lessons form the past. Nature
Reviews. Genetics 5: 552-557.
38
Lee, L. K. et Roth, C. M. (2003). Antisense technology in molecular and cellular bioengineering. Current Opinion in
Biotechnology. 14: 505-511.
39
Dykxhoorn, D. M., et al. (2003). Killing the messenger: short RNAs that silence gene expression. Nature Rev. Mol. Cell
Biol. 4, 457467.
18
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
En los ensayos de validacin de dianas, el ARNi ARNsi son reconocidos por el complejo RISC
de doble cadena se introduce en el interior de las (RNA-induced silencing complex), el cual se une
clulas mediante distintos mtodos. a molculas de ARNm complementarias,
Posteriormente, este ARNi de doble cadena es facilitando la degradacin de stas. Asimismo, es
procesado enzimticamente dando lugar a posible administrar directamente el ARNsi a la
molculas de ARN ms pequeas denominadas clula, en cuyo caso no sera necesaria ninguna
pequeos ARNs de interferencia o ARNsi (small de las etapas anteriores. De este modo, tanto el
interfering RNAs). Estos ARNsi son de doble ARNi como el ARNsi son herramientas tiles para
cadena y estn por tanto formados por dos la inactivacin especfica de la expresin de
hebras complementarias y emparejadas. Los genes40.
ARNi de
doble cadena
ARNm Reconocimiento
de la diana
Las principales ventajas de los ARNi radican en su El empleo de ARNi presenta bsicamente los
bajo coste y alta especificidad, por lo que mismos problemas que las tecnologas antisentido
constituyen una herramienta molecular que est y se refieren principalmente a las dificultades de
sustituyendo a los oligonucletidos antisentido administracin y distribucin en cultivos celulares
como mtodo de modulacin de la expresin y tejidos, vindose agravada la situacin en
gnica41. Por otro lado, el ARNi puede emplearse estudios in vivo. Estos problemas se han
como herramienta para el estudio de la biologa solucionado en parte mediante el empleo de
de organismos completos a escala genmica vehculos de administracin como liposomas, o
mediante microarrays de clulas transfectadas vectores de expresin como plsmidos y virus43.
con ARNi. Esta estrategia ha sido empleada con Por otra parte, las tcnicas de ARN interferente
xito en lneas celulares procedentes de modelos pueden dar lugar a efectos inespecficos debidos a
animales, siendo inminente su aplicacin en la unin de alguna de las dos hebras del ARNsi a
clulas humanas42. molculas de ARNm distintas del ARN diana44.
40
Wang, S., et al. (2004). Tools for target identification and validation. Current Opinion in Chemical Biology. 8: 371-377.
41
Lindsay, M. A. (2003). Target discovery. Nature Reviews: Drug Discovery. 2: 831-838.
42
Gunsalus, K. C. & Piano, F. (2005). RNAi as a tool to study cell biology: building the genome-phenome bridge.
Curr. Op. in Cell Biology 17:3-8.
43
Cocks, B. G. & Theriault, T. P. (2004). Developments in effective applicaction of small inhibitory RNA (siRNA) technology
in mammalian cells. DDT: Targets. Vol. 3(4):165-171.
44
Lee, L. K. & Roth, C. M. (2003). Antisense technology in molecular and cellular bioengineering. Current Opinion in
Biotechnology. 14: 505-511.
19
Como solucin a este tipo de problemas se han diseado molculas de ARN interferente modificadas
qumicamente que evitan la aparicin de efectos no especficos45. Por otra parte, mientras que la tecnologa
de ARNi ha sido aplicada con xito in vitro en numerosas ocasiones en la validacin de dianas teraputicas,
su empleo in vivo todava no ha alcanzado el mismo grado de desarrollo.
Otro tipo de mejoras que se estn desarrollando en tecnologas de ARN interferente incluyen la
administracin directa de ARNsi de cadena sencilla en clulas, que ha demostrado ser efectivo en muchos
tipos celulares aunque de forma transitoria. Para solucionar este problema se ha recurrido a los ARNsh
(short hairpin), molculas de ARN con secuencias repetidas invertidas que forman estructuras en forma
de horquilla, y que dan lugar a una inhibicin mucho ms estable de la expresin gnica46.
Similitudes Diferencias
Fragmentos cortos de cidos nucleicos Dos hebras para el ARNsi, una hebra para
(aprox. 20 bases). oligos antisentido.
Metodologa comn para la administracin a ARN de doble hebra es ms estable que
cultivos celulares. cidos nucleicos de una sola hebra.
Inducen el silenciamiento de la expresin Las modificaciones qumicas no son tan
gnica mediante su unin al ARNm. necesarias para su administracin en cultivos
Los ARNsi y ciertos oligos antisentido celulares en el caso de los ARNi.
provocan la ruptura del ARNm. Mediacin del complejo RISC en el ARNi.
Sus propiedades pueden alterarse mediante Activacin de la enzima ARNasa en oligos
modificacin de las bases. antisentido.
Perfiles de biodistribucin similares. Aplicacin ms extendida de la tcnica de ARNi.
3.1.3. Ribozimas
Las ribozimas son pequeas molculas de ARN que actan como enzimas y que pueden cortar otras
molculas de ARN en sitios especficos. La unin entre el ribozima y el ARN diana se produce por
complementariedad y apareamiento entre ambas molculas. De este modo, se pueden disear ribozimas
que reconozcan cualquier ARN diana simplemente variando la regin de reconocimiento del ribozima.
ARNm
Ribozima
45
Samarsk, D. & Datta, M. (2003). Expediting target identification and validation through RNAi. Expert Rev. Mol. Diagn.
4(1):11-14.
46
Walgren, J. L. & Thompson, D. C. (2004). Application of proteomic technologies in the drug development process. Toxicol
Lett. 149:377-85.
47
Paroo, Z. & Corey, D. R. (2004). Challenges for RNAi in vivo. Trends in Biotechnology. Vol. 22, No. 8: 390-394.
20
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
ADN
48
Chatterton, J. E., et al. (2004). Ribozymes in gene identification and drug discovery. Drug Discovery Today: Targets,
vol. 3, No. 1, 10-17.
49
Jamieson, A. C., et al. (2004). Drug Discovery with Engineered Zinc-finger Proteins. Nature Reviews: Drug Discovery.
Vol. 2, 361-368.
Wang, S., et al. (2004). Tools for target identification and validation. Current Opinion in Chemical Biology. 8: 371-377.
21
La principal ventaja de esta tcnica frente al resto a la funcin de la protena completa. Por este
de tcnicas de modulacin de la expresin gnica motivo, las tcnicas basadas en la inactivacin de
consiste en que es ms estable que las protenas son esenciales en la validacin de
estrategias que emplean cidos nucleicos. Por numerosas dianas teraputicas54.
otro lado, el diseo de estas protenas requiere la
identificacin previa de las secuencias de ADN En el presente apartado se agrupan tcnicas que
susceptibles de ser reconocidas por los dedos de permiten el bloqueo o inactivacin de protenas
zinc, que se corresponden con regiones del especficas de modo que stas dejan de ejercer su
genoma de baja condensacin. Este mapeado se funcin. El efecto observado tras la inactivacin
realiza mediante enzimas ADNasas, que de la protena diana permite relacionar dicha
reconocen regiones del ADN con baja protena con su funcin concreta, y de esta forma
condensacin y por tanto ms accesibles a los resulta posible asociar un fenotipo determinado a
factores de transcripcin50. Otra limitacin a tener una protena concreta.
en cuenta es la dificultad en la administracin de
protenas de dedos de zinc, que afecta por igual a
todas las tecnologas de modulacin de la
3.2.1. Qumica gentica
expresin gnica mencionadas en el presente
informe. Este problema se puede solucionar por
medio del empleo de vehculos moleculares La estrategia clsica de validacin de dianas o
llamados vectores que permitan introducir genes qumica gentica consiste en el empleo de
en las clulas . 51 pequeas molculas que se unen a las dianas de
modo especfico provocando su inactivacin. De
esta forma, se consigue inactivar la funcin de
una protena especfica, lo que permite establecer
3.2. Inactivacin de protenas una relacin entre la actividad de la misma y los
efectos que se manifiesten en los cultivos de
Debido a que la mayora de los frmacos que clulas, tejidos o animales55. A diferencia de las
actualmente se encuentran en el mercado actan estrategias genticas, la qumica gentica permite
sobre protenas, parece lgico pensar que la la alteracin del fenotipo de forma directa y
validacin de dianas proteicas ha de ser una ocurre en tiempo real. Esta modificacin en la
estrategia fundamental en el proceso de funcin proteica no es permanente, ya que su
desarrollo de un frmaco52. La validacin de efecto es reversible si se eliminan los restos de
dianas mediante tcnicas de modulacin de la estas molculas del medio. Este enfoque resulta
expresin gnica no siempre est relacionada de muy til a la hora de validar dianas mediante el
forma directa con la expresin de la protena. En empleo de pequeas molculas, ya que permite
numerosas ocasiones, se ponen en marcha una asociar un fenotipo de inters con la accin de
serie de mecanismos moleculares que modifican una determinada molcula sobre una diana
la protena hasta dar lugar a la molcula concreta56.
responsable del fenotipo final, y que por tanto
seran imposibles de identificar nicamente Adems de permitir analizar la funcin celular y
mediante tecnologas de modulacin de la validar dianas moleculares, estas pequeas
expresin gnica53. As mismo, algunas protenas molculas pueden emplearse como base para
estn formadas por varios dominios obtener potenciales frmacos. A partir del
multifuncionales, por lo que la inhibicin de la conocimiento de la estructura qumica del
expresin de uno de los genes que codifica un compuesto activo, es posible disear nuevas
nico dominio no proporciona datos extrapolables molculas de cara a su potencial aplicacin
50
Liu, P-G., et al. (2001). Regulation of an endogenous locus using a panel of designed zinc finger proteins targeted to
accessible chromatin regions. Activation of vascular endothelial growth factor. J. Biol. Chem., 276:11323-11334.
51
Peet, N. P. (2003). What constitutes target validation? Targets 2 (4): 125-127.
52
Smith, M. B. (2003). Hitting the target. Nature, vol. 422, 341-347.
53
Walgren, J. L. & Thompson, D. C. (2004). Application of proteomic technologies in the drug development process.
Toxicol Lett. 149:377-85.
54
Ilag, L. L., et al. (2002). Emerging high-throughput drug target validation technologies. DDT Vol. 7. N 18 (Suppl.) S136-142.
55
Peet, N. P. (2003). What constitutes target validation? Targets. Vol. 2, No. 4: 125-127.
56
Chanda, S. K., et al. (2003). Fulfilling the promise: drug discovery in the post-genomic era. Drug Discovery Today. Vol. 8,
No. 4: 168-174.
22
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Anticuerpo intracelular
Una de las limitaciones de los anticuerpos es su El principal problema que presentan los
inestabilidad en el interior de las clulas, por lo anticuerpos como agentes de validacin de dianas
que las estrategias que se estn desarrollando en es el bajo nmero de estas molculas que dan
la actualidad van encaminadas al diseo de lugar a una inactivacin efectiva de sus dianas
anticuerpos ms estables y eficientes. proteicas60.
57
Williams, M. (2003). Target validation. Curr Opin Pharmacol. 3(5): 571-7.
58
Los anticuerpos monoclonales son anticuerpos especficos que pueden ser producidos en grandes cantidades por clulas
que se originan a partir de una lnea celular (hibridoma). Todos los anticuerpos monoclonales producidos por una clula
hbrida son idnticos.
59
Pillutla, R. C., et al. (2002). Target Validation and drug discovery using genomic and protein-protein interaction
technologies. Expert Opinion on Therapeutic Targets, 6 (4): 517.531.
60
Ilag, L. L., et al. (2002). Emerging high throughput drug target validation technologies. Drug Discovery Today 7 (18):
136-142.
23
3.2.3. Aptmeros
Los aptmeros son nucletidos artificiales capaces de reconocer y unirse a molculas especficas debido a
su particular estructura terciaria. Es posible disear y construir aptmeros que unan e inhiban
prcticamente cualquier protena diana.
Aptmero
61
Epstein, D. M., et al. (2002). Target Validation with Nucleic Acid Aptamers. Mimicking small molecule therapeutics by
attacking the protein, and not the gene. Pharmaceutical Discovery and Development. PharmaVentures Ltd.
62
Ilag, L. L., et al. (2002). Emerging high throughput drug target validation technologies. Drug Discovery Today 7 (18):
136-142.
63
Walgren, J. L. & Thomson, D. C. (2004). Application of proteomic technologies in the drug development process.
Toxicology Letters 149: 377-385.
64
Ilag, L. L., et al. (2002). Emerging high throughput drug target validation technologies. Drug Discovery Today 7 (18):
136-142.
24
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Los pptidos presentan ciertas ventajas Al exponer estas molculas a luz lser, se inducen
como agentes de validacin de dianas daos fotoqumicos en la protena diana de modo
principalmente debido a su fcil produccin. Por irreversible en las zonas de unin al anticuerpo,
otro lado, existen diversos sistemas que permiten pptido o aptmero, inactivando la protena de
identificar los pptidos que inhiben dianas modo especfico68. Esta tcnica de validacin de
concretas, entre las que cabe destacar la tcnica dianas ha demostrado ser eficaz en el caso de su
del doble hbrido y el phage display . 65 empleo con anticuerpos, ya que se aprovecha de
La principal limitacin de los pptidos consiste en la selectividad de los anticuerpos y mejora
que presentan problemas de afinidad y sensiblemente su poder de inhibicin de la funcin
selectividad, por lo que no es una tcnica que por de la protena diana69.
s sola permita la validacin de una diana
teraputica66. Una alternativa a esta tcnica consiste en la
utilizacin de fluorforos que reaccionan ante luz
difusa y que por tanto no requieren fuentes de luz
especiales. Esta tcnica se denomina FALI70 o
3.2.5. Inactivacin por lser
inactivacin por lser mediante fluorforos71. La
mediante cromforos principal ventaja de esta tnica radica en que
y fluorforos permite modificar un rea ms amplia de la
protena, asegurando una inactivacin ms
La tcnica CALI67 o inactivacin por lser efectiva de la protena diana. Tras la inactivacin
mediante cromforos, consiste en el empleo de de la diana es necesario purificar el complejo
cromforos, molculas que absorben la luz de una formado por el anticuerpo unido al cromforo o
determinada longitud de onda, unidos a un fluorocromo junto con la protena diana, y
anticuerpo, pptido o aptmero. posteriormente identificar esta ltima72.
Figura 14. Inactivacin por lser mediante cromforos y fluorforos aplicado a la validacin de dianas.
Fuente: Hanash, S. (2003) Disease proteomics. Nature 422, 226-232.
Las tcnicas de anlisis de la expresin gnica como los microarrays de ADN permiten la identificacin de
genes implicados en procesos patolgicos. Sin embargo, la mayora de los patrones de expresin obtenidos
requieren de pasos posteriores de validacin que posibiliten realizar una asociacin entre la expresin de
un gen y su fenotipo. Las tcnicas de anlisis de la expresin gnica mediante microarrays de tejidos y
clulas son dos tcnicas empleadas en la validacin clnica y funcional de dianas respectivamente.
65
Caponigro, G., et al. (2003). Functional analisis of expressed peptides that bind yeast STE proteins. Journal of
Biotechnology 103: 213-225.
66
Henning, S. W. & Beste, G. (2002). Loss-of-function strategies in drug target validation. Current Drug Discovery May. 17-21.
67
CALI: Chromophore assisted lasser inactivation.
68
Peet, N.P. (2003). What constitutes target validation? Targets. Vol. 2, No. 4: 125-127.
69
Henning, S. W. & Beste, G. (2002). Loss-of-function strategies in drug target validation. Current Drug Discovery May. 17-21.
70
FALI: Fluorophore assisted lasser inactivation.
71
Beck, S., et al. (2202). Fluorophore-assisted light inactivation: A high-throughput tool for direct target validation of
proteins. Proteomics 2: 247-255.
72
Ilag, LL. (2003). Direct methods for modulating protein function. Current Opinion in Drug Discovery & Development 6(2):
262-268.
25
3.3.1. Microarrays de tejidos Las principales ventajas que ofrecen los
microarrays de tejidos frente a otras tcnicas de
Los microarrays de tejidos (TMAs, Tisssue validacin se basan en la naturaleza in vivo del
Microarrays) consisten en colecciones ensayo, que posibilita observar cambios
miniaturizadas de hasta 1.000 muestras de fenotpicos que no son obvios mediante tcnicas
tejidos inmovilizadas sobre un soporte, que moleculares. En la actualidad, los principales
permiten el anlisis in situ de dianas moleculares desarrollos encaminados a mejorar esta tcnica
simultneamente (ADN, ARN o protenas). se centran en la mejora de la instrumentacin
Prcticamente la mayora de los artculos dedicada a la inmovilizacin de los tejidos en el
publicados sobre microarrays de tejidos estn array, automatizacin de la obtencin de
relacionados con el anlisis de tumores, aunque imgenes digitalizadas, as como almacenamiento,
se ha demostrado su valor en otro tipo de anlisis y estandarizacin de la informacin
patologas relacionadas en el sistema nervioso73. obtenida74.
Integracin de la informacin procedente del anlisis de las dianas a nivel del ADN, ARN y protenas.
73
Sauter, G., et al. (2003).Tissue microarrays in drug discovery. Nature Review: Drug discovery 2: 962-972.
74
Mousses, S., et al. (2001). Clinical and functional target validation using tissue and cell microarrays. Curr. Op. in Chem.
Biology, 6: 97-101.
75
Wang, S., et al. (2004). Tools for target identification and validation. Curr. Op. in Chem. Biol. 8: 371-377.
76
Mousses, S., et al. (2001). Clinical and functional target validation using tissue and cell microarrays. Curr. Op. in Chem.
Biology, 6: 97-101.
Ziauddin, J. & Sabatini, D. M. (2001). Microarrays of cells expressing defined cDNAs. Nature 411:107-110.
77
Silva, J. M., et al. (2004). RNA interference microarrays: High-throughput loss-of-function genetics in mammalian cells.
PNAS 101, n 17: 548-6552.
26
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
b c
a a b
Inmovilizacin de secciones
de tejidos en un array
El avance en el conocimiento del genoma de diferentes organismos que se ha producido a lo largo de los
ltimos aos ha puesto de manifiesto la existencia de un alto grado de conservacin de la secuencia del
ADN y protenas, as como una similitud en la funcin de los genes y rutas de sealizacin en diferentes
organismos. Este elevado grado de conservacin permite el empleo de otros organismos diferentes del ser
humano como sistemas modelo en el proceso de desarrollo de frmacos. De hecho, se ha descubierto que
existe un elevado grado de similitud con las rutas moleculares implicadas en enfermedades humanas, lo
que hace que el valor de los organismos modelo en la validacin de dianas sea mayor78.
Vertebrados
Invertebrados C. elegans
Unicelulares Levadura
78
Doan, T. N. (2004). High-throughput target validation in model organisms. Drug Discovery Today: Targets. Vol. 3,
N 5: 191-197.
27
En lo concerniente a la validacin de dianas, la proporciona un grado elevado de evidencia de que
obtencin de un modelo animal que reproduzca la un gen en concreto est implicado en el proceso de
enfermedad humana constituye de por s un inters. Por otro lado, el modelo animal obtenido
proceso de validacin de la diana. Al tratarse de un es de gran valor para estudios posteriores
organismo completo, se puede as demostrar la necesarios para el desarrollo del frmaco, como
implicacin de la diana en la enfermedad in vivo, y son los estudios farmacolgicos y toxicolgicos79.
Descendencia numerosa.
3.4.1. Ratones knock-out y knock-in tejido concreto. Los knock-out inducibles permiten
interrumpir la expresin de inters en el momento
Los ratones knock-out son ratones a los que se deseado administrando una sustancia
les ha inactivado uno o varios genes mediante determinada. En este caso, el gen se expresa con
81
tcnicas de ingeniera gentica , por lo que normalidad hasta que se administra el compuesto
carecen de una determinada funcin gnica. Los concreto83.
ratones knock-out permiten estudiar la funcin
fisiolgica de genes de mamferos y son sistemas Los ratones knock-out suelen presentar problemas
modelo valiosos sobre los que estudiar la eficacia de letalidad de los embriones para determinados
de los frmacos. Se ha demostrado que el genes. En ocasiones se ponen en marcha
fenotipo de los ratones knock-out para una mecanismos de compensacin en el embrin que
determinada diana se corresponde con los efectos hacen que la ausencia del gen no de lugar a los
de los frmacos que actan sobre la diana y la efectos esperables ya que otros genes compensan
bloquean82. Los ratones knock-in, en cambio, son al gen inactivado. Los knock-out inducibles
ratones que sobreexpresan el gen de inters permiten inactivar el gen cuando el ratn ya se ha
mediante la introduccin de varias copias del gen desarrollado y por tanto evitan que se den estos
durante el desarrollo embrionario del ratn. mecanismos de compensacin y letalidad
embrionaria.
Una estrategia alternativa consiste en el
desarrollo de ratones knock-out y knock-in La principal limitacin de los ratones knock-out y
especficos de tejido o inducibles. Los primeros knock-in se refiere al tiempo y coste que requiere la
consisten en ratones en los que la expresin de manipulacin gentica de estos organismos, lo que
un gen determinado se encuentra inhibida en un dificulta la manipulacin de ratones a gran escala84.
79/80
Kramer, R. & Cohen, D. (2004). Functional Genomics to new Drug Targets. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol. 3: 965-972.
Abuin, A., et al. (2002). Full-speed mammalian genetics: in vivo target validation in the drug discovery process. Trends in
Biotechnology. Vol. 20, N 1: 36-42.
81
La ingeniera gentica es una tecnologa que permite introducir cambios en el genotipo de un organismo.
82
Zambrowicz, B. P., et al. (2003). Predicting drug efficacy: knockouts model pipeline drugs of the pharmaceutical industry.
Current Opinion in Pharmacology. 3: 563-570.
83
Trnell, J. & Snaith, M. (2002). Transgenic systems in drug discovery: from target identification to humanized mice. Drug
Discovery Today. Vol. 7 No. 8: 461-470.
Hardy, L. W. & Peet, N. P. (2004). The multiple orthogonal tools approach to define molecular causation in the validation
of druggable targets. Drug Discovery Today. 9(3): 117-26.
84
Baumeister, R. (2002). The worm in us - Caenorhabditis elegans as a model of human disease. Trends in Biotechnology.
Vol. 20, N 4: 147-148.
28
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
85
Trnell, J. & Snaith, M. (2002). Transgenic systems in drug discovery: from target identification to humanized mice. Drug
Discovery Today. Vol. 7 No. 8: 461-470.
Hardy, L. W. & Peet, N. P. (2004). The multiple orthogonal tools approach to define molecular causation in the validation
of druggable targets.Drug Discov Today. 9(3): 117-26.
86
Chanda, S. K., et al. (2003). Fulfilling the promise: drug discovery in the post-genomic era. Drug Discovery Today. Vol. 8,
No. 4: 168-174.
87
Stone, L. S. & Vulchanova, L. (2003). The pain of antisense: in vivo application of antisense oligonucleotides for
functional genomics in pain and analgesia. Advances Drug Delivery Reviews 55: 1081-1112.
29
3.4.3. Mutagnesis de ratones de ADN que se inserta en el genoma ya que ste
al azar es de secuencia conocida y puede ser localizado88.
88
Abuin, A., et al. (2002). Full-speed mammalian genetics: in vivo target validation in the drug discovery process. Trends in
Biotechnology 20 ( 1): 36-42.
89
Saccharomyces Genome Database (http://www.yeastgenome.org).
90
Parsons, A. B., et al. (2003). Yeast genomics and proteomics in drug discovery and target validation. Progress in Cell
Cycle Research Vol. 5, 159-166.
Carroll, P. M. & Fitzgerald, K. (2003). Model Organisms in Drug Discovery. Edited by John Wiley & Sons, Ltd.
30
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
3.4.5. Otros organismos modelo mutaciones pueden ser creadas por mutagnesis
qumica al azar o empleando mutaciones ya
Existen otros organismos modelo de origen conocidas. De este modo, se pueden identificar
animal diferentes del ratn que se pueden rutas nuevas que estn relacionadas con
emplear en validacin de dianas. Los ms enfermedades conocidas, lo que permite
importantes son la mosca de la fruta o Drosophila relacionar nuevas dianas y rutas con
melanogaster, el nemtodo Caenorhabditis enfermedades91.
elegans y el pez cebra o Danio rerio.
El nematodo intestinal (C. elegans) fue el
La mosca de la fruta (D. melanogaster), es una primer organismo multicelular cuyo genoma fue
mosca de pequeo tamao que se ha empleado secuenciado92 y consiste en un buen modelo para
durante el ltimo siglo en investigacin gentica y estudiar la funcin de genes asociados a la
genmica, debido a que se han descrito un gran enfermedad, y por tanto para validar dianas. Esto
nmero de mutantes que permiten estudiar la se debe a que existe una elevada similitud entre
herencia de los genes y las caractersticas su secuencia y los genes humanos (65%), y sus
controladas por los mismos. Mediante la protenas son responsables de funciones y rutas
introduccin de genes procedentes de otros metablicas similares93.
organismos es posible conseguir que la expresin
de los genes introducidos vare en funcin de los El ARN de interferencia fue descubierto en este
tejidos o estados del desarrollo. Por tanto, la organismo como un mecanismo regulador de la
mosca de la fruta se puede emplear para transcripcin, responsable del silenciamiento de
identificar nuevos componentes de rutas genes de forma especfica de secuencia. El
asociadas a enfermedades concretas. silenciamiento de genes concretos mediante
tecnologas de ARN de interferencia da lugar a
La validacin de dianas en la mosca de la fruta cambios fenotpicos que permiten asociar rutas y
puede realizarse empleando tecnologas dianas a enfermedades concretas94. Por otro lado,
antisentido como el ARNi y el ARNsi, por medio las tcnicas de transgnesis descritas para otros
de modificaciones que permiten introducir un sistemas modelo tambin pueden ser empleadas
transgen que codifique para el ARN de en C. elegans como mtodo de validacin de
interferencia. De este modo se consigue silenciar dianas.
la expresin de un gen en un organismo completo
de modo estable, sin necesidad de aadir ARN de Como modelo animal, C. elegans ha sido
interferencia de manera constante. empleado con frecuencia para el estudio de
enfermedades humanas como el cncer, la
La mosca de la fruta se ha empleado para validar depresin, la enfermedad de Alzheimer y la
dianas implicadas en la diabetes y en la muerte celular95. La ruta que controla la apoptosis
enfermedad de Alzheimer mediante la bsqueda o muerte celular fue dilucidada en C. elegans y
de modificadores genticos. Esta estrategia esta ruta tiene implicaciones importantes para el
consiste en crear fenotipos de enfermedad ya estudio del cncer. En el caso del Alzheimer,
conocidos mutando dianas ya descritas y C. elegans posee equivalentes a los genes
estudiadas, para posteriormente buscar humanos implicados en esta patologa, lo que
mutaciones que modifiquen el fenotipo. Las permite estudiar su funcin en este modelo96.
91
Kramer, R. & Cohen, D. (2004). Functional genomics to new drug targets. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol 3: 965-972.
92
WormBase (http://www.wormbase.org).
93
Baumeister, R. (2002). The worm in us - Caenorhabditis elegans as a model of human disease. Trends in Biotechnology.
Vol. 20, N 4: 147-148.
94
Jain, K. K. (2004). RNAi and siRNA in target validation. Drug Discovery Today. 9 (7): 307-309.
95
Carroll, P. M. & Fitzgerald, K. (2003). Model Organisms in Drug Discovery. Edited by John Wiley & Sons, Ltd.
96
Baumeister, R. (2002). The worm in us - Caenorhabditis elegans as a model of human disease. Trends in Biotechnology.
Vol. 20, N 4: 147-148.
31
El pez cebra (Danio rerio) es un organismo modelo gnica en el pez cebra por medio de mutaciones,
que se ha comenzado a usar recientemente en la sobreexpresin de genes del pez cebra, y la
validacin de dianas. Sin embargo, este organismo introduccin de genes procedentes de otros
es un modelo ampliamente conocido debido a que organismos. Por otra parte, existen tecnologas
sus embriones son transparentes y permiten basadas en el empleo de oligonucletidos
estudiar el desarrollo embrionario con facilidad, son antisentido sintticos especialmente adecuados
fciles de criar, tienen un ciclo de vida corto y su para su empleo en pez cebra, siendo las ms
desarrollo es rpido. Debido a que el pez cebra es empleadas los oligonucletidos tipo morfolino y
un organismo vertebrado, posee numerosas los pptidos nucleicos o PNAs98. Los oligos tipo
similitudes con los mamferos, lo que ha permitido morfolino son oligonucletidos antisentido
desarrollar modelos representativos de modificados que presentan un esqueleto con una
enfermedades humanas97. estructura qumica determinada que se denomina
morfolino, mientras que los PNAs son
En este sentido, han sido desarrolladas varias oligonucletidos antisentido modificados con un
tcnicas que permiten modular la expresin esqueleto peptdico de carga negativa.
Tecnologa
Naturaleza Funcionamiento Ventajas
antisentido
cido nucleico
Unin al ARNm especfico y
Oligonucletidos sinttico con un
bloqueo de la sntesis de la Mayor estabilidad
tipo morfolino esqueleto de
protena
morfolino
Tabla 1. Comparativa de las dos principales tecnologas antisentido empleadas para validar dianas en pez cebra.
Fuente: Doan, T. N. (2004). High-throughput target validation in model organisms. Drug Discovery Today: Targets.
Vol. 3(5): 191-197.
97
Doan, T. N. (2004). High-throughput target validation in model organisms. Drug Discovery Today: Targets. Vol. 3, N 5:
191-197.
98
PNA: Peptide Nucleic Acid.
99
Walgren, J. L. & Thompson, D. C. (2004). Aplication of proteomic technologies in the drug development process.
Toxicology Letters 149: 277-385.
Kramer, R. & Cohen, D. (2004). Functional genomics to new drug targets. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol 3: 965-972.
32
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
a los problemas legales que hay en torno a las clulas, provocando el silenciamiento de la
clulas embrionarias humanas. Recientemente, la expresin gnica101.
Comisin de Donacin y Utilizacin de Clulas y
Tejidos Humanos ha autorizado los cuatro Las clulas madre pueden diferenciarse
primeros proyectos de investigacin con clulas posteriormente mediante su cultivo en condiciones
madre embrionarias en Espaa a partir de controladas, dando lugar a clulas adultas con una
embriones sobrantes de los procesos de fisiologa similar a las clulas diferenciadas del
fertilizacin100. organismo. De este modo se pueden diferenciar
clulas madre a las que se les ha eliminado la
Las clulas madre no diferenciadas pueden ser expresin de un gen concreto y obtener clulas de
manipuladas para eliminar la expresin de un gen un tipo celular determinado en las que estudiar la
con el objeto de evaluar la funcin del mismo en la funcin de los genes concretos.
clula dando lugar a clulas madre knock-out, o
bien a clulas madre knock-in que sobreexpresen Otro tipo de estrategia de validacin de dianas
el gen de inters. Por otro lado, se pueden disear consiste en la implantacin de clulas madre no
clulas madre transgnicas modificadas diferenciadas en ratones, que dan lugar a
genticamente mediante la introduccin del gen teratomas o tumores formados por clulas de
que codifique para la diana potencial que se desea origen embrionario. Estos teratomas son de
validar, de modo que sta se exprese en la clula. utilidad para evaluar el papel de genes concretos
Entre las ltimas aplicaciones de las clulas madre en la proliferacin celular y la diferenciacin, de
para la validacin de dianas se encuentra la modo que pueden resultar de inters como dianas
tranfeccin de RNA interferente a cultivos de estas teraputicas frente al cncer.
Cambian a lo
Tumoral o Alteraciones
Anormal Ilimitada largo del Muy limitada
transformada cromosmicas
cultivo
Clulas Dependiente
Normal No proliferan Limitada No
primarias del donante
Clulas
madre Normal Normal Ilimitada Uniforme Si
embrionarias
Las clulas madre embrionarias presentan ciertas estas clulas son las nicas que pueden ser
ventajas en comparacin con los dems tipos de manipuladas genticamente con facilidad debido a
cultivos celulares que se emplean en validacin de su habilidad para sufrir recombinacin homloga
dianas. Las clulas madre embrionarias son con una frecuencia mayor que el resto de tipos
genticamente estables, uniformes en cultivo celulares. Todas estas caractersticas confieren
celular, y presentan un crecimiento normal ventajas a las clulas madre embrionarias sobre
aunque se dividen sin lmite, lo que permite las clulas primarias o las lneas celulares
mantenerlas en cultivo indefinidamente y disponer procedentes de tumores, ya que combinan las
de ellas en cantidades ilimitadas. Por otra parte, caractersticas deseadas de ambos102.
100
La Comisin de Donacin y Utilizacin de Clulas y Tejidos Humanos da luz verde a los primeros proyectos de
investigacin con clulas madre embrionarias en nuestro pas. Nota de prensa: 23 de febrero 2005, Ministerio de
Sanidad y Consumo (http://www.msc.es/gabinetePrensa/notaPrensa/desarrolloNotaPrensa.jsp?id=268).
101
Cocks, B. G. & Theriault, T. P. (2004). Developments in effective applicaction of small inhibitory RNA (siRNA) technology
in mammalian cells. DDT: Targets. Vol. 3(4): 165-171.
102
McNeish, J. (2004). Embriogenic stem cells in drug discovery. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol 3: 70-80.
33
3.5. Tcnicas bioinformticas El primero es de utilidad a la hora de asociar
frmacos potenciales a las dianas, ya que
permiten la prediccin de la estructura de las
La bioinformtica consiste en el uso de las
protenas a partir de su secuencia. El
matemticas y de las tcnicas informticas para
resolver problemas biolgicos por medio de conocimiento de la estructura tridimensional de
programas informticos y modelos matemticos. las protenas sirve para comprender mejor sus
Las herramientas bioinformticas ms relevantes funciones e identificar compuestos de bajo peso
son las bases de datos, las cuales permiten el molecular que inhiban la protena de modo
almacenamiento y manejo de la informacin selectivo. La identificacin de genes homlogos en
biolgica, y los algoritmos, que permiten elaborar otras especies puede resultar de utilidad a la hora
relaciones de asociacin entre datos contenidos de asignar nuevas funciones a genes humanos, o
en las bases de datos. La bioinformtica permite bien confirmar la utilidad de modelos animales
por tanto el estudio de una elevada complejidad para experimentos in vivo. Asimismo, la
de datos mediante el uso de herramientas con identificacin de genes homlogos con funciones
gran capacidad de almacenamiento y poder de divergentes en el genoma humano puede ser til
clculo. para valorar problemas de especificidad de
dianas. Por otro lado, la identificacin de
Los principales objetivos de la bioinformtica protenas con funciones similares mediante la
durante las fases iniciales de desarrollo de un construccin de mapas de interacciones de
frmaco se centran en desentraar la informacin protenas es posible mediante herramientas
contenida en las secuencias de ADN, ARN y bioinformticas de anlisis. Respecto al anlisis de
protenas. Las tcnicas bioinformticas presentan perfiles de expresin, existe una amplia variedad
tres aplicaciones fundamentales para la validacin de software que permite almacenar y analizar los
de dianas, la identificacin de genes diferentes patrones derivados de experimentos
103
homlogos , el anlisis de mapas de protenas y por medio de microarrays de ADN
el anlisis a gran escala de perfiles de expresin. fundamentalmente104.
El anlisis de los perfiles gnicos obtenidos con microarrays puede servir para asignar funcin
biolgica a determinados genes.
103
Genes homlogos: genes que poseen similitud entre s, tanto en la misma especie como entre distintas especies. Esta
similitud puede derivarse de una ascendencia comn (genes ortlogos) asumindose que tienen la misma funcin, o
bien surgir a partir de la duplicacin de un gen dentro de un mismo genoma (genes parlogos), que en este caso
tendran diferente funcin o especializacin.
104
Whittaker, P. A. (2003). What is the relevance of bioinfomatics to phamacology? Trends In Pharmacological Sciences,
24 (8), 434-439.
34
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Requiere cantidades
Electroforesis en Geles
Bajo coste. elevadas de muestra.
de Poliacrilamida (PAGE).
Bajo rendimiento.
Multiplexado.
Microarrays de ADN. Coste elevado.
Alto rendimiento.
Requieren cantidades
protena-protena
Baja especificidad en la
reducidas de muestra.
Interacciones
Problemas de administracin.
Facilidad de obtencin.
Toxicidad.
Resistentes a las nucleasas.
Oligos antisentido. Inestabilidad.
Actan en el ncleo de la
No puede expresarse
clula.
Tcnicas de validacin de dianas
intracelularmente.
Modulacin de la expresin
Problemas de administracin.
Mayor estabilidad.
Protenas de dedos de Incapacidad de reconocer
Permiten activar o reprimir
zinc. sitios no activos del
genes.
genoma.
Baja afinidad.
Pptidos Facilidad de produccin.
Baja selectividad.
35
Tcnica Ventajas Desventajas
Requiere la transfeccin
Microarrays de clulas. Ensayos in vivo.
de ADN a las clulas.
No requiere conocer la
Mutaciones no dirigidas.
Mutagnesis de ratones funcin de genes
Dificultad de identificar
al azar. modificados.
genes mutados.
Tcnicas de validacin de dianas
Alto rendimiento.
Facilidad de crecimiento.
Su uso se limita a ciertas
enfermedades.
Numerosos mutantes
Mosca de la fruta. Modelo invertebrado.
desarrollados.
Genoma secuenciado.
Validacin de dianas
C. elegans. Modelo invertebrado.
mediante tecnologas
antisentido.
Estabilidad gentica,
disponibilidad ilimitada y
facilidad de manipulacin
Clulas madre Disponibilidad de clulas
gentica. Permiten estudiar
embrionarias. madre.
genes que causan
mortalidad en fetos de
ratones knock-out.
Bioinformtica
36
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Gen ARN
Genes ARNs
Protena
Protenas
Bsqueda de la
diana de inters
105
Drews, J. (2000). Drug Discovery: A Historical Perspective. Science, 287: 1960-1964 .
37
En aquellas ocasiones en las que existe en ocasiones resulta difcil identificar la diana
informacin previa acerca de las dianas sobre la que se ha actuado106.
potencialmente implicadas en una enfermedad
concreta, es posible proponer su implicacin en Las tcnicas moleculares que se emplean para
el proceso patolgico. En estas ocasiones, se validar dianas son muy diversas en cuanto a su
opta por una estrategia inversa o dirigida de naturaleza. De hecho, cualquier tcnica que permita
validacin de dianas, en la cual se altera la asociar una protena o un gen a una caracterstica o
expresin de un gen o protena conocida para a un fenotipo, es susceptible de ser aplicada en la
demostrar su implicacin en el desarrollo de la validacin de dianas. Por otra parte, las tcnicas que
enfermedad. Por tanto, para esta estrategia son se emplean en la validacin de dianas pueden ser de
de utilidad aquellas tcnicas que permiten utilidad en otras etapas de la investigacin
alterar selectivamente la funcin de una diana farmacolgica, como los ensayos preclnicos
concreta y observar los cambios debidos a estas mediante cultivos celulares y modelos vivos de la
alteraciones. Las tcnicas de modulacin de la enfermedad, los cuales se emplean prcticamente a
expresin gnica como la tecnologa antisentido lo largo de todo el proceso de investigacin
y las tcnicas de inactivacin de protenas como farmacutica previo a los ensayos clnicos en
los anticuerpos monoclonales, permiten humanos. Las diferentes tcnicas descritas en el
establecer la relacion entre el fenotipo y una presente informe se pueden aplicar en diversos
diana concreta. momentos de los programas de I+D en funcin de
los recursos de los que se disponga y del grado de
En los casos en los que no se dispone de validacin que se desee alcanzar.
informacin acerca de las dianas implicadas en
la enfermedad de inters, o bien se desea El desarrollo de nuevos frmacos por parte de la
descubrir dianas novedosas para una industria farmacutica se aborda habitualmente
enfermedad concreta, la estrategia ha de ser mediante una primera identificacin de un
necesariamente diferente y se puede optar por elevado nmero de dianas potencialmente
el empleo de estrategias al azar tambin asociadas a la enfermedad. Las tcnicas de
denominadas estrategias directas. Estas validacin que se suelen aplicar en primer lugar
estrategias consisten en el estudio de los han de ser rpidas, de alto rendimiento, coste
cambios en el fenotipo debidos a la modificacin reducido y capaces de eliminar las dianas no
de genes o protenas que se realiza al azar, de vlidas, en las cuales no merece la pena invertir
modo que se desconoce la funcin del gen o mayores esfuerzos. Las tecnologas de anlisis de
protena sobre la que se est actuando y se la expresin gnica, interacciones protena-
pretende validar. Como resultado, se obtienen protena y el cribado virtual son las tcnicas que
clulas u organismos con alteraciones que dan se realizan en las etapas iniciales ya que a pesar
lugar a fenotipos diversos, entre los que alguno de que no permiten establecer una asociacin
puede estar relacionado con enfermedades robusta entre la enfermedad y la diana, permiten
interesantes. Una vez detectado el fenotipo de identificar y descartar parte de las dianas con
inters y dado que la modificacin que ha dado rapidez. Posteriormente, se aplican otras tcnicas
lugar al mismo es desconocida, se ha de buscar que si bien requieren ms tiempo y presentan un
el gen o la protena diana, es decir el gen rendimiento inferior, permiten establecer una
responsable del fenotipo de inters. De este asociacin ms concluyente entre la diana y la
modo se establece la relacin entre la diana y el enfermedad. ste es el caso de las tcnicas de
fenotipo relacionado con la enfermedad. Existe modulacin de la expresin y bloqueo de
una gran diversidad de tcnicas que permiten protenas diana, que se suelen aplicar sobre
modificar genes o protenas al azar, siendo cultivos celulares o modelos animales. Los
habitual el empleo de tcnicas como las modelos vivos de la enfermedad constituyen el
tecnologas antisentido, las tcnicas de bloqueo nivel superior de validacin de dianas y aunque
de protenas y la mutagnesis al azar en su coste es muy elevado, se emplean tanto en
organismos modelo. La principal desventaja de validacin de dianas como en la investigacin
las estrategias directas o al azar consiste en que preclnica previa a los ensayos en humanos.
106
Doan, T. N. (2004). High-throughput target validation in model organisms. Drug Discovery Today: Targets. Vol. 3, N 5:
191-197.
38
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Identificacin
Identificacin Validacin Investigacin Ensayos
y optimizacin
de dianas de dianas preclnica clnicos
del compuesto
Anlisis de la expresin
Interaccin protena-protena
Ensayos en animales Ensayos en humanos
Fase I
Fase II
Cribado virtual Fase III
Fase IV
Modulacin de la expresin
Inactivacin de protenas
Fig. 18. Aplicacin de las tcnicas de validacin de dianas a lo largo de la investigacin farmacutica.
Fuente: Whittaker, P. A. (2003). What is the relevance of bioinformatics to pharmacology? Trends in Pharmacological
Sciences. Vol. 24. N8: 434-439.
Por tanto, la validacin de una diana teraputica La aproximacin que hemos tenido en cuenta hasta
es un proceso en el cual estn implicadas ms de el momento se basa en la presuncin de que un
una nica tcnica, permitiendo establecer con la frmaco ejerce su accin nicamente sobre una
suficiente robustez la asociacin de la diana con diana, lo cual es bastante improbable debido a la
una enfermedad concreta. Una adecuada complejidad biolgica de los procesos patolgicos. Un
validacin de dianas requerir entonces la escenario ms parecido a la realidad sera aquel en el
combinacin de varias tcnicas entre s, de modo cual un frmaco interaccionara con mltiples
que se pueda asociar con un grado de dianas que estuvieran implicadas directamente en
certidumbre suficiente una diana y su ciertas patologas. El frmaco ideal consistira en un
enfermedad, y de este modo validar o descartar compuesto dirigido frente a mltiples dianas, todas
las potenciales dianas teraputicas identificadas. ellas relacionadas con el proceso patolgico de
La eleccin de las tecnologas ms adecuadas inters, de forma que el efecto teraputico se viera
vendr determinada por distintos factores. En el potenciado. El ejemplo ms caracterstico es el
caso de que hubiese que adoptar tan solo dos imanitib, comercializado por Novartis con el nombre
tcnicas, sera recomendable emplear tecnologas Glivec como frmaco frente a la Leucemia Mieloide
que acten a nivel gnico y a nivel de protena Crnica y tumores de ciertas clulas del estroma
respectivamente, ya que ofrecera una visin de gastrointestinal. Este medicamento es capaz de
conjunto ms completa acerca de la funcin de la frenar la expresin de determinadas protenas
diana. No obstante, las tcnicas elegidas vendrn anormales caractersticas de estas patologas, pero
determinadas en gran medida por el coste tambin posee la capacidad de bloquear otras vas
previsto del ensayo, el tiempo disponible, y los aberrantes de sealizacin celular relacionadas con la
resultados obtenidos a partir de los ensayos de aparicin de tumores, confirindole al producto un
validacin previos107. extraordinario valor aadido108.
107
Hardy, L. W. & Peet, N. P. (2004). The multiple orthogonal tools approach to define molecular causation in the validation
of druggable targets. Drug Discovery Today. 9(3): 117-26.
108
Glivec (imatinib mesylate, USA Gleevec), Novartis Pharmaceuticals Corp.
(http://www.glivec.com/espanol/content/site_disclaimer.jsp)
39
5. Aplicaciones de las tcnicas
de validacin de dianas
El presente apartado pretende incidir en aquellas enfermedades para las cuales es esencial la identificacin
de nuevas dianas teraputicas, as como la validacin de algunas dianas ya conocidas que forman parte de
procesos biolgicos implicados en las patologas de inters. Por otra parte, se ha realizado una revisin de
los principales tipos de dianas teraputicas descritas, junto con las estrategias tecnolgicas empleadas en
su validacin.
Numerosas enfermedades de alta incidencia en la poblacin conllevan necesidades mdicas que no han
sido resueltas por la medicina actual. Algunas enfermedades no poseen tratamientos eficaces para el
paciente, mientras que para otras patologas tan slo existen tratamientos paliativos que poseen una
eficacia limitada o bien dan lugar a efectos secundarios que limitan su uso generalizado. Gran parte de
estos problemas se solucionaran mediante la identificacin y validacin de las dianas teraputicas
implicadas en estas enfermedades. Por este motivo, la identificacin y validacin de nuevas dianas
teraputicas es una necesidad a la hora de desarrollar nuevos y mejores frmacos.
Enfermedades cardiovasculares.
Cncer.
109
Kaplan, W. & Laing, R. (2004). Priority Medicines for Europe and the World. World Health Organization. Department of
Essential Drugs and Medicines Policy.
110
AFAL, Asociacin de Enfermos de Alzheimer de Madrid. (www.afal.es).
40
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
111
TysabriTM (Natalizumab). Biogen Idec, Elan. (www.tysabri.com).
112
Mathisen, P. M. (2003). Gene Discovery and validation for neurodegenerative diseases. Drug Discovery Today. 8 (1): 39-46.
41
Enfermedad Tratamiento actual Rutas/Dianas potenciales
pases del primer mundo. El tabaco, la corazn, y los vasodilatadores que disminuyen la
hipertensin arterial, los altos niveles de tendencia de las arterias a estrecharse. Las
colesterol y grasas en sangre, la diabetes y la nuevas dianas propuestas se centran en fomentar
obesidad son los principales factores de riesgo de la vasodilatacin actuando sobre nuevas dianas
las enfermedades cardiovasculares. En la del sistema renina-angiotensina y el metabolismo
actualidad existen tratamientos para el del cido araquidnico.
tratamiento de la hipertensin y para los niveles
elevados de grasas en sangre pero su eficacia es Los tratamientos actuales para combatir los
limitada y vara entre diferentes pacientes113. No niveles elevados de grasas y colesterol en sangre
obstante, se han propuesto nuevas dianas que consisten principalmente en la administracin de
permitirn en un futuro desarrollar frmacos ms frmacos que reducen la sntesis y absorcin del
eficaces y con menores efectos indeseables. colesterol, y reductores de los triglicridos.
113
Kaplan, W. & Laing, R. (2004). Priority Medicines for Europe and the World. World Health Organization. Department of
Essential Drugs and Medicines Policy.
42
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Betabloqueantes.
Diurticos. Sistema de la renina-angiotensina.
Hipertensin. Vasodilatadores (Inhibidores del Metabolismo del cido
enzima convertidor de la araquidnico.
angiotensina y bloqueantes del
receptor de la angiotensina).
114
Brown, D. & Superti-Furga, G. (2003). Rediscovering the sweet spot in drug discovery. Drug Discovery Today.
Vol. 8 (23): 1067-1077.
115
Gallen, C. C. (2004). Strategic Challenges in Neurotherapeutic Pharmaceutical Development. The American Society for
Experimental NeuroTherapeutics. Vol. 1: 165-180.
116
Holmes, A., et al. (2003). Neuropeptide systems as novel therapeutic targets for depresin and anxiety disorders.
Trends in Pharmacological Sciences. Vol. 24. N 11: 580-588.
43
sobre otras dianas como son los antidepresivos dopamina, cuyo mecanismo de accin se asocia a
tricclicos y heterocclicos117. Estos frmacos efectos no deseados. Por otro lado, los
poseen numerosos efectos secundarios y no todos tratamientos actuales no son efectivos
los pacientes responden adecuadamente al totalmente y, debido a los efectos secundarios
tratamiento, por lo que resulta necesario que provocan, gran parte de los pacientes
desarrollar nuevos medicamentos antidepresivos. abandonan el tratamiento, por lo que existe una
En el caso de la depresin, tambin se aboga por necesidad de identificar y validar nuevas dianas
actuar sobre los componentes de las rutas de teraputicas que acten por vas diferentes119.
neuropptidos para desarrollar nuevos Existen varios receptores y rutas neuronales de
frmacos118. sealizacin sobre las que se investiga para
desarrollar nuevos frmacos ms eficaces y con
La esquizofrenia es una enfermedad psiquitrica menores efectos secundarios, como por ejemplo
que se caracteriza por la aparicin de un subtipo especfico de receptores de la
alucinaciones, delirios y comportamientos que serotonina y del glutamato. Por otro lado, se
conllevan la prdida de capacidad de trabajo, estudia la posibilidad de fomentar el efecto
relacin social, afectividad y capacidad intelectual. protector de los estrgenos sobre la
La mayora de los tratamientos antipsicticos esquizofrenia, y la posibilidad de actuar sobre el
actuales actan sobre varias dianas a la vez dao que se observa en las membranas
siendo los ms comunes los receptores de neuronales mediante cidos grasos omega-3120.
Incremento de la concentracin de
monoaminas (inhibidores de la
recaptura de monoaminas e
Depresin. inhibidores de la Sistemas de neuropptidos.
monoaminooxidasa).
Antidepresivos triclicos y
heterocclicos.
117
Garca, J. T. &. Rosete, E. M. (2002). Tratamiento farmacolgico de la depresin mayor. Rev Cubana Med Gen
Integr 3/2002 (http://www.bvs.sld.cu/revistas/mgi/vol18_3_02/mgi09302.htm).
118
Hckfelt, T., et al. (2003). Neuropeptides: Oportunities for drug discovery. The Lancet Neurology. Vol. 2: 463-472.
119
Kuperberg, G., et al. (2002). Developments in the pharmacological treatment of schizophrenia. Expert Opin. Investig.
Drugs. 11 (10) 1-7.
120
Weiden, P. J., et al. (2003). New Developments in Antipsychotic Therapy. J. Clin. Psichiatry (64)11: 1379-1381.
44
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
121
Dohrmann, C. E. (2004). Target discovery in metabolic disease. Drug Discovery Today. 9(18): 785-794.
122
Diabetes mellitus no insulinodependiente (DMNID). Enciclopedia mdica en espaol. Medline Plus. Instituto Nacional de
Salud de los Estados Unidos (http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/ency/article/000313.htm).
123
Obesidad. Enciclopedia mdica en espaol. Medline Plus. Instituto Nacional de Salud de los Estados Unidos.
(http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/ency/article/003101.htm).
124
Dohrmann, C. E. (2004). Target discovery in metabolic disease. Drug Discovery Today. 9 (18): 785-794.
45
5.1.5. Enfermedades autoinmunes dificultad que supone la regulacin de los niveles de
glucosa en sangre126. Las futuras terapias irn
Las enfermedades autoinmunes son un conjunto de dirigidas a evitar la destruccin de las clulas beta o
patologas producidas por el reconocimiento de los bien a la recuperacin de su funcin actuando sobre
propios tejidos como agentes extraos por parte del las distintas rutas implicadas en la respuesta inmune
sistema inmune, provocando una respuesta de daina, ya que de este modo se conseguira mejorar
defensa que puede afectar a diversos rganos y ostensiblemente la calidad de vida de los pacientes.
tejidos. Las principales enfermedades autoinmunes
son la artritis reumatoide, la diabetes de tipo I, La psoriasis es una enfermedad crnica de la piel
lupus, miastenia gravis, enfermedad de Crohn y caracterizada por una invasin de la misma por
psoriasis. Los tratamientos tradicionales consisten en parte de clulas inflamatorias y en consecuencia
el empleo de frmacos que producen alivio de la una proliferacin excesiva de las clulas de la piel.
sintomatologa como pueden ser analgsicos, Los tratamientos actuales se centran en el control de
antiinflamatorios e inmunosupresores. Adems de su los sntomas y en impedir infecciones secundarias
reducida eficacia, estos frmacos reducen la mediante tratamientos tpicos, fototerapia, y en
capacidad inmunolgica de los pacientes y favorecen casos severos frmacos inmunosupresores o
la aparicin de infecciones. retinoides127. Recientemente se han autorizado
nuevos tratamientos basados en la administracin
La artritis reumatoide se desarrolla cuando el de anticuerpos monoclonales o derivados de los
sistema inmune ataca el tejido que cubre las mismos que actan sobre dianas implicadas en la
articulaciones dando lugar a dolor, inflamacin, y respuesta inflamatoria, que de este modo modulan
prdida de movilidad. Los tratamientos habituales la respuesta inmune excesiva128. Existen mltiples
tienen por objeto reducir el dolor y la inflamacin de rutas y dianas que han sido propuestas como dianas
las articulaciones por lo que se suelen administrar potenciales de futuras terapias frente a la psoriasis,
analgsicos y antiinflamatorios. Por otro lado, los entre las que cabe destacar las molculas de
inmunosupresores pueden aliviar la sintomatologa y adhesin celular, receptores de factores de
ralentizan la progresin de la enfermedad. crecimiento y molculas inflamatorias129.
Recientemente han sido autorizados varios
anticuerpos monoclonales e inhibidores biolgicos La enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa se
frente a dianas implicadas en la inflamacin para el producen debido al ataque del sistema inmune sobre
tratamiento de la artritis reumatoide125. Existen el intestino que origina un proceso inflamatorio.
varios niveles sobre los que se ha propuesto actuar Ambas enfermedades son muy similares aunque
para el desarrollo de nuevos frmacos, regulando la existen diferencias en cuanto a la afectacin del
funcin de las clulas T, mastocitos y el sistema intestino y profundidad de las lesiones. El
hormonal esteroideo. tratamiento actual consiste en la administracin de
frmacos que suprimen la respuesta inflamatoria
La diabetes de tipo I es una enfermedad en la que como antiinflamatorios, inmunosupresores y
el sistema inmune ataca a las clulas del pncreas corticosteroides, lo que permite controlar los
productoras de insulina. Debido a ello el organismo sntomas y reducir los brotes de la enfermedad.
no es capaz de producir insulina, el nivel de glucosa Recientemente se ha autorizado el uso de un
en sangre deja de estar bajo control y se altera el anticuerpo frente a una diana implicada en la
metabolismo de los hidratos de carbono, lpidos y respuesta inmune para el tratamiento de la
protenas. El tratamiento actual consiste en controlar enfermedad de Crohn130. Existen varias dianas sobre
la dieta, seguir hbitos de vida adecuados y el las que se podra actuar para tratar estas patologas,
suministro diario de insulina mediante inyecciones. principalmente a nivel de la funcin de clulas T, los
Las inyecciones de insulina han de administrarse de sistemas de reparacin y defensa del intestino,
por vida y a pesar de ello los enfermos de diabetes molculas inflamatorias y procesos relacionados con
suelen sufrir problemas de salud debido a la la apoptosis131.
125
Instituto Nacional de la Artritis y enfermedades musculoesquelticas y de piel. Instituto Nacional de la Salud de Estados
Unidos de Amrica. (http://www.niams.nih.gov/hi/topics/arthritis/rahandout.htm).
126
Diabetesjuvenil.com (http://www.diabetesjuvenil.com/documentos_html/dj_investigacion.asp).
127
Psoriasis. Medline Plus. Instituto Nacional de Salud de los Estados Unidos.
(http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/psoriasis.html).
128
Fundacin Nacional de la Psoriasis de los Estados Unidos de Amrica. (http://www.psoriasis.org).
129
Igney, H. G., et al. (2004). Techniques: Species finest blend-humanized mouse models in inflammatory skin disease
research. Trends Pharmacol Sci. 25 (10): 543-549.
130
Enfermedad de Crohn. Medline Plus. Instituto Nacional de Salud de los Estados Unidos.
(http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/crohnsdisease.html#tratamiento).
131
Fundacin Americana de la Enfermedad de Crohn y Colitis. CCFA. (http://www.ccfa.org/).
46
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Analgsicos.
Antiinflamatorios (no esteroideos y
corticosteroides).
Funcin de la clulas T.
Frmacos inmunosupresores
Funcin de los mastocitos.
Artritis reumatoide. modificadores de la enfermedad:
metotrexato. Regulacin del sistema hormonal
esteroideo.
Anticuerpos inhibidores del TNF-_:
(etanercept, Infliximab, Adalimumab).
Inhibidor de la interleuquina (Anakinra).
Funcin de la clulas T.
Regular rutas inflamatorias (interleuquinas
Antiinflamatorios como los aminosalicilatos 10 y 14).
Enfermedad de Crohn y y corticosteroides Factor de necrosis tumoral (TNF`).
colitis ulcerosa. Anticuerpo quimrico frente a TNF-_ Sistemas de defensa del epitelio intestinal.
(Infliximab). Mecanismos de dao y reparacin del
intestino.
Regulacin de la apoptosis (card15/NOD2).
132
Fundacin Americana del Lupus (http://www.lupus.org/) .
133
Rus, V., et al. (2004). Gene expression profiling in peripheral blood mononuclear cells from lupus patients with active
and inactive disease. Clinical Immunology. 112: 231 234.
47
5.1.6. Cncer Los tratamientos actuales ms habituales son la
ciruga, quimioterapia y radioterapia, aunque no
El cncer consiste en un conjunto de ms de 100 son eficaces en todos los casos, por lo que la
patologas en las que se produce una proliferacin tendencia actual va dirigida hacia una estrategia
anormal de las clulas que da lugar a tumores que de terapia combinada frente a mltiples dianas
pueden invadir otros tejidos dando lugar a implicadas en el proceso canceroso. Por otra
metstasis. Dado que diferentes tumores parte, la mayora de los frmacos disponibles
morfolgicamente idnticos pueden ser consecuencia actualmente para el tratamiento del cncer
de alteraciones en un gran nmero de rutas, las presentan problemas de toxicidad, por lo que
dianas sobre las que actuar sern de distinta resulta una prioridad la bsqueda de nuevas
134
naturaleza en funcin de cada tipo de tumor . dianas teraputicas relacionadas con el cncer.
Figura 24. Tratamientos actuales frente al cncer y rutas de inters para el desarrollo de nuevos frmacos con actividad
antitumoral.
Fuente: Brown, D. & Superti-Furga, G. (2003). Rediscovering the sweet spot in drug discovery. Drug Discovery Today.
Vol. 8 (23): 1067-1077.
En los ltimos aos se han lanzado al mercado inhibe la tirosina quinasa Bcr-Abl y se emplea en
varios frmacos anticancergenos que actan el tratamiento de tumores intestinales y un tipo
sobre dianas teraputicas que han sido de leucemia137. En ltimo lugar, cabe destacar el
identificadas y validadas estudiando rutas bortezomib (Velcade)138, frmaco que inhibe el
moleculares que juegan un papel crucial en el proteosoma y que ha sido autorizado para el
cncer. El primero de ellos es un frmaco tratamiento del mieloma mltiple.
autorizado para el tratamiento del cncer de
mama, Trastuzumab (Herceptina)135, que acta Existen varias rutas y procesos sobre los que se
sobre el receptor del factor de crecimiento podra actuar para el desarrollo de nuevos
humano inhibiendo su funcin. El cido retinoico frmacos frente al cncer, ya sea impidiendo el
activa el receptor de cido retinico y ha sido crecimiento tumoral mediante la inhibicin de la
establecido para el tratamiento de un tipo de irrigacin sangunea al tumor o mediante la
leucemia. Por otro lado, el Imatinib (Glivec)136 regulacin del ciclo celular, promoviendo la
134
Sauter, G., et al. (2003). Tissue Microarrays in Drug Discovery. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol. 2, 962-972.
135
Genentech, Inc. HerceptinTM (http://www.herceptin.com/herceptin).
136
Novartis. GlivecTM (http://www.glivec.com/content/home.jsp).
137
Serrano, R. Investigacin y clnica oncolgica deben disear frmacos selectivos. Diario Mdico. 23 de mayo de 2002
(http://www.diariomedico.com/edicion/noticia/0,2458,148513,00.html).
138
Millenium Pharmaceuticals y Johnson & Johnson Pharmaceutical Research & Development. VelcadeTM.
(http://www.mlnm.com/products/velcade/index.asp).
48
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
muerte de las clulas cancerosas, impidiendo la modo que cabe decir que un nmero ostensible de
migracin o metstasis, o bien favoreciendo la dianas an no han sido explotadas.
respuesta de defensa del organismo frente al
tumor. Debido a que el cncer es un conjunto de Las 500 dianas teraputicas conocidas pueden
enfermedades diferentes debidas a alteraciones clasificarse en base a su estructura y su funcin
diversas, los tumores que presentan una misma en 130 familias de protenas, de las cuales los
morfologa no tienen porqu presentar las mismas receptores acoplados a protenas G son las ms
alteraciones ni las mismas dianas, por lo que hay importantes en nmero, seguidas de las enzimas
que considerar que frmacos desarrollados frente sern-treonin y tirosn quinasas. Cabe destacar la
a una diana pueden no ser eficaces en estos importancia en nmero de otros tipos de enzimas
casos 139
. como las zinc peptidasas y las sern proteasas.
Asimismo, los receptores nucleares de hormonas
como los esteroides son una familia de dianas
relevante en la farmacoterapia actual.
5.2. Naturaleza de las dianas
Al comparar las dianas actuales con las dianas
teraputicas para los potenciales, se observa que existen diferencias en la
frmacos actuales distribucin de las dianas en familias de protenas.
Cabe destacar que existen grandes familias de
Los avances en genmica y protemica que se han dianas potenciales para las que se dispone de
producido en los ltimos aos han permitido relativamente pocos frmacos y, por tanto, se puede
estimar en 600-1.500 el nmero de dianas considerar que estas familias de dianas no han sido
teraputicas sobre las que se podra actuar suficientemente explotadas. Entre estas familias se
mediante frmacos. Por otro lado, se conoce que encuentran las sern treonn y tirosn quinasas que
los frmacos de los que se dispone en la actualidad adems constituyen las familias de dianas
actan sobre menos de 500 dianas diferentes, de potenciales ms numerosas140.
139
Sauter, G., et al. (2003). Tissue Microarrays in Drug Discovery. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol. 2, 962-972.
140
Hopkins, A. L. & Groom, C. R. (2002). The druggable genome. Nature Reviews: Drug Discovery. Vol 1: 727-730.
49
A)
GPCRs 25%
Zn peptidasas 4%
NHRs 3%
Cys proteasas 2%
Ser proteasas 3%
Canales inicos 2%
Fosfodiesterasas 3%
Enzimas C. P450 2%
Canales catinicos 2%
B)
Ser-Thr / Tyr kinasas 22%
El Anexo IV del presente informe contiene una dianas y han dado lugar al descubrimiento de un
revisin de diversos enfoques que se han gran nmero frmacos. Por otro lado, las
empleado con xito en la validacin de dianas. tecnologas antisentido estn cobrando fuerza en
Gran parte de dichas dianas han dado lugar al los ltimos aos y estn siendo ampliamente
desarrollo de nuevos frmacos que ya han sido usadas para validar dianas teraputicas. No
lanzados al mercado o que se encuentran en obstante, se ha de destacar que las tcnicas que
diferentes etapas de los ensayos clnicos. figuran en la tabla anterior no son las nicas que
se han empleado para validar cada una de las
En la actualidad, los ratones knock-out siguen dianas descritas, sino que suelen ser varias las
siendo los sistemas preferidos a la hora de validar tcnicas empleadas de forma combinada.
50
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Dianas insuficientemente validadas en las primeras fases de identificacin de dianas y durante las
fases clnicas.
141
Jackson, L. K. & Phillips, M. A. (2002). Target Validation for Drug Discovery in Parasitic Organisms. Current Topics in
Medicinal Chemistry, 2, 425-438.
142
DiMasi, J. A. (2003). The price of innovation: new estimates of drug development costs. Journal of Health Economics,
22: 151-185.
143
Esteve, A. Biotecnologa y Salud. I curso de formacin e informacin cientfica en biomedicina y biotecnologa para
especialistas en comunicacin. 16 de diciembre de 2003. Fundacin Genoma Espaa
(http://www.gen-es.org/06_news/docs7/aesteve161203.pdf).
144
Brown, D. & Superti-Furga, G. (2003). Rediscovering the sweet spot in drug Discovery. Drug Discovery today. Vol. 8
No. 23. 1067-1077.
51
En los ltimos aos, el nmero de lanzamientos de un ritmo superior al 5% anual. Por otro lado, se ha
nuevos frmacos no se ha incrementado a pesar de producido un incremento de fracasos en frmacos
los avances que se han producido en el rea de la que alcanzan fases tardas en los proyectos de
biologa molecular. En el grfico que figura a investigacin farmacutica, principalmente en la
continuacin se puede apreciar que el nmero de fase II de los ensayos clnicos a pesar del
nuevos compuestos que se lanzan al mercado no incremento de frmacos que entran en fase I145.
ha dejado de reducirse desde el ao 1999, mientras Algunos autores sealan que esta tendencia se
que los costes en I+D no dejan de incrementarse a mantendr al menos hasta el ao 2008146.
60 60
N de molculas que llegan al mercado
40 40
30 30
20 20
10 10
0 0
1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003
Ao
Figura 26. Evolucin del lanzamiento de nuevos frmacos y de los costes de I+D en el mercado mundial durante el
periodo 1992-2003.
Fuente: CMR International, http://www.cmr.org.
145
Walker, M. J. A., et al. (2004). Functional pharmacology: the drug discovery bottleneck? Drug Discovery Today. Vol. 3,
N 5: 208-215.
146
Brown, D. & Superti-Furga, G. (2003). Rediscovering the sweet spot in drug Discovery. Drug Discovery today. Vol. 8 No.
23: 1067-1077.
147
Altshuler, J., et al. (2001). A Revolution in R&D: How Genomics and Genetics are transforming the Biopharmaceutical
Industry. The Boston Consulting Group.
52
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
7
7
6
Duracin (aos)
3 2,7
2
2 1,6
1
1
0,4
0
Identificacin Validacin Identificacin Optimizacin Desarrollo Desarrollo
de dianas de dianas del compuesto del compuesto preclnico clnico
300
260
250
205
Coste (millones de )
200
165
150
120
100 90
50 40
0
Identificacin Validacin Identificacin Optimizacin Desarrollo Desarrollo
de dianas de dianas del compuesto del compuesto preclnico clnico
Figura 27. Coste y duracin del proceso de validacin de dianas y del resto de fases de desarrollo de un frmaco.
Fuente: Altshuler, J., et al. (2001). A Revolution in R&D: How Genomics and Genetics are transforming the
Biopharmaceutical Industry. The Boston Consulting Group.
Debido a que la inversin necesaria para el queda patente al observar que la industria
desarrollo de un frmaco se ha incrementado farmacutica y biotecnolgica ha lanzado al
considerablemente durante los ltimos aos, la mercado una media de 2-3 frmacos por ao que
industria farmacutica ha tenido que idear actan sobre nuevas dianas, mientras que se
estrategias para contener sus gastos. Por un lado, aprueban entre 25-30 medicamentos que actan
la industria farmacutica centra sus esfuerzos de sobre dianas para las que ya existen frmacos en
I+D en dianas teraputicas para las que ya
el mercado.
existen frmacos en el mercado. Esto se debe en
gran medida al riesgo que supone trabajar con
No obstante, existen motivos tanto sociales como
dianas que an no han sido validadas debido al
elevado porcentaje de fracasos que ocurren. Las econmicos para investigar en nuevas dianas. A lo
dianas para las que existen frmacos en humanos largo del presente informe se han expuesto
no suelen presentar estos problemas, lo que diversas patologas que dan lugar a problemas
reduce considerablemente el tiempo e inversin sanitarios de primer orden para las cuales la
necesario para el desarrollo de nuevos frmacos sociedad demanda nuevos frmacos eficaces y
que acten sobre las mismas. Esta tendencia seguros, y que por tanto acten sobre dianas
53
especficas para estas patologas. Algunas de Cuanto ms se avance en el proyecto de
estas enfermedades generan costes elevados que investigacin y desarrollo, mayores son los costes
repercuten negativamente en el creciente gasto acumulados a lo largo del proceso. Por tanto,
sanitario de los Sistemas Nacionales de Salud. Por cuanto ms tarde se produzca el abandono de los
otro lado, la disminucin que se ha producido en proyectos que van a fracasar, mayores sern los
el lanzamiento de nuevos frmacos difcilmente costes acumulados para la empresa farmacutica.
podr ser superada si no se identifican y validan Existe por tanto una necesidad de discriminar los
nuevas dianas teraputicas. Algunas de las proyectos que no van a conducir a un frmaco
enfermedades para las que no existen exitoso en fases tempranas de la investigacin. La
tratamientos eficaces afectan a amplios sectores validacin de dianas constituye un proceso clave
de la poblacin, por lo que el descubrimiento de que puede permitir rechazar proyectos abocados
nuevas terapias permitira dirigirse a un pblico al fracaso en fases tempranas.
numeroso aportando nuevas oportunidades de
mercado para las empresas farmacuticas148.
Comercializacin
Diana A
Diana B
Diana C
Diana D
Figura 28. Beneficios de la validacin de dianas sobre el desarrollo de proyectos de I+D en la industria farmacutica.
Fuente: Elaboracin propia.
De este modo, el abandono de proyectos en fases biotecnolgicas muestran gran dinamismo a pesar
tempranas evitar el invertir recursos y tiempo en el de su reducido tamao y recursos gracias a la
desarrollo de compuestos activos que posteriormente especializacin tecnolgica y el dominio de reas
demostrarn no ser eficaces. De esta forma, se tecnolgicas punteras que hace que su nivel de
liberaran recursos que podran ser empleados para ingresos, ventas e inversin avance a ritmo slido a
finalizar proyectos con mayores posibilidades de escala mundial. En consecuencia, el punto fuerte de
conducir al lanzamiento de frmacos de exito y las empresas biotecnolgicas consiste en el
acortar por tanto la duracin de los mismos. desarrollo de tecnologas innovadoras propias que
las farmacuticas necesitan para validar dianas.
Por este motivo, las compaas farmacuticas
tradicionales buscan frmulas de colaboracin con
6.2. Estrategias de
las empresas biotecnolgicas con el fin de
implantacin de garantizarse el acceso a las nuevas tecnologas
validacin de dianas en desarrolladas por estas ltimas.
la industria farmacutica
La incorporacin de tecnologas de validacin de
El coste derivado del lanzamiento de un nuevo dianas a la industria farmacutica puede
frmaco al mercado es elevado debido producirse por medio de diferentes estrategias.
principalmente a los ensayos clnicos y, por tanto, Un gran nmero de empresas optan por la
tan slo las grandes compaas son capaces de adquisicin de tecnologa de validacin de dianas
realizar el proceso completo de desarrollo de nuevos desarrollada por empresas biotecnolgicas,
frmacos. Sin embargo, las nuevas compaas mientras que en otros casos estas ltimas ofrecen
148
Zambrowicz, B. P., et al. (2003). Predicting drug efficacy: knockouts model pipeline drugs of the pharmaceutical
industry. Current Opinion in Pharmacology. 3: 563-570.
54
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
las dianas ya validadas en su cartera de productos. En otras ocaciones, las empresas farmacuticas
recurren a alianzas estratgicas en busca de socios con tecnologa propia de validacin de dianas, o bien a
la adquisicin de estas compaas biotecnolgicas especializadas.
Las principales empresas farmacuticas multinacionales han optado por establecer colaboraciones con
empresas biotecnolgicas para hacer frente a su dficit de innovacin y reforzar sus lneas de I+D. A
continuacin detallamos algunos de los principales acuerdos que han establecido las grandes
multinacionales farmacuticas con las empresas biotecnolgicas ms relevantes.
Empresa
Empresa biotecnolgica Contribucin
farmacutica
Johnson
Lexicon Genetics Tecnologa knock-out.
& Johnson
55
Empresa
Empresa biotecnolgica Contribucin
farmacutica
BioVex Tecnologa.
Tabla 5. Principales acuerdos de colaboracin entre empresas farmacuticas y empresas biotecnolgicas relacionadas con
la validacin de dianas.
Fuente: BioCentury Publications, Inc; http://www.biocentury.com.
56
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
En cuanto a las tecnologas que son objeto de basados en oligonucletidos antisentido propios y
colaboracin entre las principales empresas ARNsi, e ISIS Pharmaceuticals presta servicios de
farmacuticas y las biotecnolgicas ms validacin de dianas basados en tecnologas
importantes, destacan las tecnologas antisentido antisentido. Ambas empresas estn investigando
y los modelos vivos, especialmente los ratones activamente en el desarrollo de terapias basadas
knock-out. De hecho, la totalidad de las en tecnologas antisentido con el objeto de poder
farmacuticas ms importantes han establecido desarrollar frmacos antisentido.
acuerdos que implican alguna de las dos
tecnologas mencionadas para garantizarse el En los ltimos aos, gran parte de las empresas
acceso a las mismas. Entre las empresas que especialistas en tecnologas de validacin de
desarrollan animales modelo cabe destacar los dianas han aprovechado su conocimiento en
casos de Lexicon Genetics, que desarrolla ratones tecnologas punteras para realizar otras fases de
knock-out y transgnicos y presta servicios de la I+D y lanzarse al desarrollo de frmacos.
validacin de dianas, y Deltagen, que desarrolla Debido a su falta de experiencia en la totalidad
ratones knock-out y dispone de bases de datos de del proceso de desarrollo, algunas compaas
genes de inters clnico obtenidos a partir de los biotecnolgicas han optado por colaborar con
mismos. Ambas empresas ofrecen sus modelos y compaas farmacuticas para desarrollar
sus servicios a la mayora de las multinacionales conjuntamente nuevos tratamientos, lo que les ha
farmacuticas ms importantes. Por otro lado, permitido adquirir el conocimiento necesario para
Atugen e ISIS Pharmaceuticals son las empresas lanzarse al desarrollo en solitario de nuevos
especializadas en tecnologas antisentido que han frmacos. De este modo las biotecnolgicas
establecido mayor cantidad de colaboraciones con consiguen obtener mayores ingresos, lo que
las grandes farmacuticas. Atugen oferta les permite rentabilizar al mximo sus
productos y servicios de validacin de dianas esfuerzos en I+D.
57
7. Empresas y proyectos en validacin
de dianas
En el presente apartado se comentan las reactivos para el uso de la tecnologas antisentido
principales empresas que ofrecen productos y en investigacin. Algunas de estas empresas han
servicios relacionados con la validacin de dianas desarrollado tecnologas y plataformas con
que operan a nivel internacional y aquellas otras marcas propias diferenciadas de la competencia,
empresas de carcter nacional relacionadas con la como es el caso de los oligonucletidos de baja
validacin de dianas. Se mencionarn las toxicidad resistentes a endonucleasa Geneblock
actividades principales de estas empresas que de Atugen y la plataforma de alto rendimiento de
prestan servicios o productos de validacin de ARN interferencia HT-RNA de Cenix.
dianas, as como la evolucin que han sufrido las
mismas en los ltimos aos. En segundo lugar en nmero se encuentran las
empresas especializadas en modelos vivos de la
Por otro lado, se estudian los proyectos de I+D enfermedad, siendo los ratones y el pez cebra los
espaoles en validacin de dianas que emplean modelos ms empleados en validacin de dianas.
las tecnologas y tcnicas expuestas a lo largo del En este caso, las empresas ms importantes son
presente informe, as como las tecnologas Exelixis, compaa que emplea modelos animales
empleadas y las patologas en las que se centra la diversos en su I+D de dianas para cncer,
I+D nacional. Deltagen que comercializa bases de datos de la
funcin de genes elaborados a partir de ratones
knock-out, Ingenium Pharmaceuticals a travs del
desarrollo de una plataforma basada en la
7.1. Empresas internacionales estrategia directa de validacin en ratones y
en validacin de dianas Lexicon Genetics, cuya estrategia de validacin de
dianas a escala genmica emplea ratones knock-
En el anexo II del presente informe figuran las out para 5.000 genes. Cabe destacar el elevado
principales empresas internacionales en validacin nmero de colaboraciones y acuerdos que han
de dianas con los productos y servicios que establecido dichas empresas con compaas
ofrecen y las colaboraciones que han establecido farmacuticas, lo que es sntoma del inters que
con otras compaas del sector. En cuanto a la despiertan las tecnologas y plataformas
actividad principal y la misin de las empresas desarrolladas por las mismas.
detalladas, gran parte de ellas desarrollan
tecnologas aplicables a la validacin de dianas en En cuanto a las empresas cuyo negocio consiste
general, mientras que otras validan dianas con en validar dianas para enfermedades o reas
objeto de descubrir nuevas dianas frente a teraputicas concretas, stas han desarrollado
determinadas enfermedades. metodologas de validacin de dianas que son
capaces de integrar la informacin obtenida
La mayora de las empresas se han especializado mediante diferentes tcnicas de validacin.
en tecnologas concretas de desarrollo propio que Debido a ello, estas compaas han desarrollado
comercializan como herramientas de validacin de plataformas de validacin de dianas que combinan
dianas. Las empresas especializadas en varias tcnicas como el anlisis de la expresin
tecnologas antisentido son las ms numerosas, gnica, las tecnologas antisentido, las tcnicas de
entre las que destacan ISIS Pharmaceuticals y bloqueo de protenas, los animales modelo y la
Atugen debido a su amplia experiencia en bioinformtica que aplican de acuerdo a una
oligonucletidos antisentido y ARN de metodologa propia. ste es el caso de la empresa
interferencia respectivamente. Otras empresas Devgen, que ofrece bases de datos de fenotipos
destacadas en el campo de las tecnologas de mutantes y knock-outs y servicios de
antisentido son Alnylam Pharmaceuticals que validacin con tecnologas de ARN interferencia en
investiga activamente en nuevos tratamientos modelos vivos como C. elegans. En el caso de
basados en el ARN de interferencia, Cenix Pharmagene, dispone de la base de datos
Bioscience que presta servicios basados en la TargetEvaluatorTM de expresin de genes en
aplicacin del ARN de interferencia a clulas tejidos normales y patolgicos que puede ser
humanas y modelos animales, y Sequitur empleada para validar y priorizar dianas, adems
(perteneciente a Invitrogen) fabricante de kits y de ofrecer servicios de genmica qumica y
58
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
149
Gray, L. (2003). Genomics-based Approaches to Drug Target Validation. Business Communications Company, Inc.
150
Progenika Biopharma, S. A. (www.progenika.com).
151
Proteomika, S. L. (www.proteomika.com).
152
Advancell, Advanced in Vitro Cell Technologies, S. L. (www.advancell.net).
153
Dominion Pharmakine, S. L. (www.pharmakine.com).
154
Oryzon Genomics S.A. (www.oryzon.com).
155
Owl Genomics, S. L. (www.owlgenoics.com).
156
Neuropharma, S. A. (www.neuropharma.es).
157
Necodex (www.neocodex.es), Sistemas Genmicos (www.sistemasgenomicos.com), Biomedal (www.biomedal.es).
59
En cuanto a las empresas espaolas que han determinadas enfermedades como medio para
desarrollado herramientas bioinformticas identificar y validar dianas teraputicas
aplicadas a los microarrays, Bioalma, Ebiointel, novedosas. Los proyectos de investigacin se
Integromics o NorayBio158 son algunos de los centran en aquellas enfermedades que en el
ejemplos ms destacados. presente informe se han identificado como
prioritarias para el desarrollo de nuevos frmacos,
En la mayora de los casos, las empresas principalmente cncer, enfermedades
espaolas que ofrecen servicios o productos de neurodegenerativas como el Alzheimer y el
validacin de dianas establecen colaboraciones Parkinson y enfermedades cardiovasculares.
principalmente con instituciones pblicas
espaolas como hospitales del Sistema Nacional
Respecto a las tcnicas genmicas y protemicas
de Seguridad Social, Universidades Pblicas,
que se emplean en los proyectos de I+D recogidas
centros dependientes del CSIC159 o el CNIO160. No
en el anexo I, se observa que la mayora de los
obstante, existen notables excepciones que han
mismos, en torno al 40% del total de los proyectos
establecido acuerdos con numerosas empresas
estudiados, emplean modelos animales para validar
privadas tanto nacionales como multinacionales lo
dianas, siendo los ratones transgnicos y knock-out
que les permite acceder a financiacin privada.
los principales modelos utilizados. Cabe destacar la
existencia de proyectos dirigidos especificamente al
Cabe destacar la existencia de dos organismos
desarrollo de nuevos modelos animales para el
vinculados a instituciones pblicas que realizan
estudio de enfermedades concretas como el cncer,
actividades relacionadas con la validacin de
la enfermedad de Alzheimer y Parkinson. Asimismo,
dianas. El primero de ellos es el Instituto de
el uso de tecnologas de anlisis de la expresin
Farmacia Industrial161, dependiente de la
gnica est ampliamente extendido y en torno al
Universidad de Santiago de Compostela, que
15% de los proyectos espaoles en validacin de
ofrece servicios de validacin de dianas,
dianas se basan en su utilizacin. La tcnica de
identificacin de compuestos qumicos y
optimizacin de los mismos. En segundo lugar, la anlisis de la expresin ms habitual la constituyen
158
Bioalma, Alma Bioinformtica S.L. (www.almabioinfo.com); Ebiointel, S.L. (www.ebiointel.com); Integromics, S.L.
(www.integromics.com); Noray Bioinformatics, S.L. (www.noraybio.com).
159
Consejo Superior de Investigaciones Cientficas - CSIC (www.csic.es).
160
Centro Nacional de Investigaciones Oncolgicas - CNIO (www.cnio.es).
161
Instituto de Farmacia Industrial (www.usc.es/farmind).
162
Unidad Mixta Almirall Prodesfarma-PCB (www.pcb.ub.es/homePCB/live/es/p516.asp).
60
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
8. Conclusiones
La secuenciacin del genoma humano marc un En la actualidad se dispone de varias tcnicas
antes y un despus en la investigacin que permiten modular la expresin de genes
farmacutica, logrndose la identificacin de especficos bien bloqueando o activando los
decenas de miles de genes y protenas que mismos. Los oligonucletidos antisentido son
pueden constituir dianas potenciales de frmacos. conocidos desde hace tiempo pero su uso se
Debido a ello, el descubrimiento de frmacos ha haba visto restringido debido a los problemas
dejado de ser el cuello de botella del proceso de tcnicos asociados a su aplicacin. El
I+D y la validacin de dianas se ha constituido en descubrimiento de la tecnologa del ARN de
el principal cuello de botella del proceso. Por interferencia y de las diferentes estrategias para
tanto, si la industria quiere ser capaz de su aplicacin, abri todo un abanico de
desarrollar frmacos a partir de los conocimientos posibilidades que permitan el silenciamiento
en genmica, ser necesario utilizar tcnicas de especfico de genes concretos. La rapidez del
validacin de alto rendimiento que permitan diseo y produccin de ARNs de interferencia
seleccionar aquellas dianas en las que invertir especficos de genes concretos y su reducido
mayores esfuerzos. coste, hacen de la misma una de las tecnologas
ms prometedoras en la validacin de dianas.
Tanto el ARN de interferencia como los
La validacin de dianas se ha revelado como una
oligonucletidos antisentido permiten cribar
etapa crtica a la hora de condicionar el xito o
genes candidatos en corto espacio de tiempo y
fracaso de los proyectos de I+D en el proceso de
obtener informacin acerca de su funcin con
desarrollo de frmacos. El principal reto de la
rapidez. Sin embargo, los problemas de
validacin de dianas consiste en asignar funciones
administracin de los ARN de interferencia a
a dianas concretas y abandonar aquellas dianas
clulas u organismos completos no han sido
que no sean adecuadas a la hora de disear
resueltos completamente. En el caso de los
frmacos eficientes. Hay que tener en cuenta que
cultivos celulares de clulas de mamferos este
un nmero elevado de dianas pueden estar
problema ha sido resuelto con xito mediante el
asociadas a una enfermedad contribuyendo en
empleo de tcnicas disponibles para la
cierto grado al fenotipo patolgico, y por lo tanto
introduccin de cidos nucleicos a las clulas.
resulta necesario validar aquellas dianas que son
Sin embargo, la administracin in vivo sigue
cruciales para el desarrollo y mantenimiento de la
siendo una asignatura pendiente sobre todo en
enfermedad.
el caso de modelos de mamferos y la mayora
de los estudios en este sentido se han realizado
La identificacin de dianas a gran escala en dianas presentes en el hgado debido a la
permite a su vez conseguir un cierto grado de mayor accesibilidad de este rgano a la
validacin, por lo que muchas de las tcnicas de administracin de cidos nucleicos.
anlisis de la expresin gnica como los
microarrays de ADN y tcnicas de interacciones Las estrategias actualmente disponibles para
de protenas, como el sistema doble-hbrido, son facilitar la administracin del ARN de interferencia
de gran valor a la hora de asignar funciones a consisten en el empleo de reactivos lipdicos,
dianas hasta entonces desconocidas. modificaciones qumicas de los cidos nucleicos y
su inyeccin intravenosa o intraperitoneal. A pesar
Las tcnicas de validacin de dianas del progreso realizado, an no est claro si el ARN
propiamente dichas se han clasificado en de interferencia presenta ventajas respecto a los
funcin de su estrategia molecular. Por un lado, oligonucletidos antisentido para su aplicacin in
las tcnicas de modulacin de la expresin vivo, y resulta indispensable abordar cuestiones de
se basan en la alteracin de la expresin de diseo qumico y farmacolgico que posibiliten la
genes bien actuando sobre el ADN o el ARN, de aplicacin del ARN de interferencia in vivo.
modo que se activen o inactiven genes
concretos. De este modo, al poner de manifiesto El descubrimiento y optimizacin del ARN de
que la expresin alterada de un gen da lugar al interferencia ha promovido que tecnologas
estado patolgico, se puede establecer una como los ribozimas hayan sido relegadas a un
asociacin entre una diana y una determinada segundo plano ante las aparentes desventajas
enfermedad. de los mismos. No obstante, los avances
61
tecnolgicos que recientemente se han producido las dianas intracelulares tanto en cultivo celular
en el diseo, eficiencia y administracin, como sobre todo en organismos modelo, por lo
posibilitan el empleo de ribozimas en la que el desarrollo de reactivos y mtodos de
validacin de dianas de modo mucho ms administracin sigue siendo una asignatura
efectivo, lo que permite afirmar que junto con el pendiente.
ARN de interferencia sigue siendo una tcnica
con un futuro prometedor por delante. Las Otras estrategias alternativas que se han
protenas de dedos de zinc permiten tanto descrito con detalle en el presente informe se
silenciar la expresin de un gen concreto como corresponden con tecnologas de alto
incrementar la expresin del mismo. El rendimiento basadas en el empleo de
incremento de la expresin no puede ser microarrays. Los arrays de tejidos ofrecen la
alcanzado por ninguno de los anteriores mtodos
posibilidad de analizar in situ los cambios
de modulacin de la expresin, mientras que las
fenotpicos en tejidos patolgicos por medio de
protenas de dedos de zinc han sido empleadas
su comparacin con tejidos sanos. La gran
con xito en la validacin de dianas.
ventaja de esta estrategia radica en la
visualizacin clnica de los cambios fenotpicos
Sin embargo, la relacin entre la expresin gnica de los tejidos implicados en el proceso
y la funcin de la protena diana no tiene por qu patolgico, por lo que aaden una informacin
ser causal, es decir, la diferencia de expresin de extra a la validacin de dianas que ninguna de
un gen concreto puede no ser la causa de la las tcnicas actuales permite. Asimismo, los
enfermedad. Por otra parte, las protenas sufren a microarrays de clulas ofrecen la posibilidad de
menudo modificaciones que no vienen analizar la expresin gnica a gran escala sobre
determinadas en los genes que las codifican, por clulas vivas.
lo que las tcnicas de modulacin de la expresin
no siempre ofrecen informacin completa acerca
Los modelos vivos de enfermedades
de la funcin de las dianas. Por este motivo, las
constituyen sistemas sobre los que es posible
tcnicas basadas en la inactivacin de
aplicar las tcnicas mencionadas anteriormente,
protenas consistentes en el bloqueo de la
por lo que su desarrollo es primordial a la hora de
funcin de las protenas, son necesarias en
validar dianas mediante un conjunto de tcnicas
numerosas ocasiones.
complementarias. El diseo de sistemas modelo
adecuados para cada patologa es un proceso
Los anticuerpos monoclonales constituyen las
muy laborioso que no siempre es viable. El
primeras estrategias de validacin de dianas que
empleo de tcnicas genmicas para su desarrollo
fueron diseadas para interferir directamente
y la bsqueda de nuevos modelos ms sencillos
con las protenas, y siguen siendo ampliamente
constituyen las principales estrategias actuales.
empleados debido a su elevada especificidad y
fcil produccin. De hecho, en los ltimos aos
ha tenido lugar un resurgir de los anticuerpos Los modelos animales permiten el estudio de la
monoclonales debido al desarrollo de frmacos funcin de dianas teraputicas en organismos
basados en su empleo como terapia completos, lo que posibilita validar dianas en su
principalmente en cncer y enfermedades contexto natural. La validacin de dianas
autoinmunes. En estos casos la validacin de mediante modelos animales proporciona el mayor
dianas mediante anticuerpos monoclonales grado de evidencia de la relacin existente entre
puede constituir la primera etapa del desarrollo una determinada diana y un estado patolgico. No
de un potencial frmaco basado en anticuerpos obstante, la administracin de agentes
teraputicos o sus derivados. El conocimiento de moduladores de la expresin o inhibidores de
los anticuerpos monoclonales ha permitido el protenas, sigue siendo uno de los grandes
desarrollo de la tcnica CALI/FALI que permite problemas de la validacin en modelos animales.
una inactivacin funcional irreversible de la Se han desarrollado enfoques que pretenden
protena diana. Esta tcnica slo puede ser sortear estas limitaciones, bien mediante el
empleada en cultivos celulares y su elevado empleo de nuevos reactivos, mtodos que
rendimiento hace que permitan validar dianas faciliten la entrada en el organismo y en las
proteicas a gran escala, lo que facilita la clulas del mismo, o mediante tcnicas dirigidas a
industrializacin del proceso y su aplicacin en la sntesis de los mismos en el interior de la
la empresa. Por otro lado, los aptmeros clula. Por otra parte, debido al elevado coste de
presentan problemas de administracin que los modelos animales, los esfuerzos actuales
siguen siendo limitantes a la hora de alcanzar estn dirigidos al desarrollo de tcnicas de
62
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
63
sea ms robusta. En la prctica, las empresas elementos de un sistema biolgico, las cuales
farmacuticas se enfrentarn a tres factores clave definan redes biolgicas que a su vez no slo
a la hora de definir sus estrategias de validacin: transmitan informacin acerca de la genmica y
protemica de un proceso, sino tambin de su
Competitividad (lanzamiento de nuevos perfil metablico. Esta novedosa aproximacin se
productos en respuesta a la competencia). ha denominado Biologa de sistemas, y requiere
la integracin de varias displinas como la biologa,
Bajo coste (disminucin del coste de desarrollo ingeniera y la informtica.
de nuevos productos).
64
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Anexos
Anexo I: Proyectos de I+D espaoles en validacin de dianas
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
65
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
66
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Centro de
Investigaciones Efectos de neurotrofinas y ligandos de receptores
Biolgicas nucleares en el proceso de mielinizacin:
2003 MCyT
(CIB-CSIC) implicaciones teraputicas en mielinopatas
Unidad Regulacin de perifricas.
la Expresin Gnica
67
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
68
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
69
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Instituto de
Investigaciones Caracterizacin en modelos celulares y animales
Biomdicas de de protenas de inters teraputico para la 2001-2004 MCyT
Barcelona enfermedad de Alzheimer.
(IIBB-CSIC)
Centro Nacional de
Microelectrnica
Prototipo de un nanobiodispositivo para la
(CNM-CSIC)
deteccin de alteraciones en genes humanos 2001-2004 MCyT
Dpto. de Dispositivos,
(NANOBIOGEN).
Sensores y
Biosensores
Instituto de Catalisis
Desarrollo de una plataforma tecnolgica de
y Petroleoqumica
farmacogenmica funcional basada en DNA 2001-2001 MCyT
(ICP-CSIC)
microarrays.
Dpto. de Biocatlisis.
70
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
71
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Instituto de
Neurociencias de
Alteracin en la glicosilacin de acetilcolinesterasa
Alicante Fundacin
en la enfermedad de Alzheimer y su implicacin en 2003
(CSIC) La Caixa
patognesis, diagnstico y tratamiento.
Unidad de
Neurobiologa Celular
Instituto de
Neurociencias de Identificacin y caracterizacin de nuevos genes
Alicante de crecimiento y proliferacin en el desarrollo
2003-2006 MCyT
(CSIC) temprano del ojo en Drosophila. Implicaciones en
Unidad Neurobiologa la etiologa de aniridia y en cncer.
del Desarrollo
Centro Nacional de
Caracterizacin de nuevas modificaciones lipdicas
Microbiologa Fundacin
implicadas en la activacin de las protenas Ras. 2004
(CNM-ISCIII) La Caixa
Evaluacin como potenciales dianas farmacolgicas.
72
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Centro Nacional de
Uso de Saccharomyces cerevisiae para la
Microbiologa 2002 FIPSE
bsqueda de nuevas dianas teraputicas de VIH
(CNM-ISCIII)
73
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
74
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
75
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Universidad
Autnoma de Madrid Modelos de ratn para la caracterizacin de genes
2002 FIS
Facultad de Ciencias supresores y modificadores en linfomas.
Dpto. de Biologa
Univ. de Barcelona
Explotacin de las diferencias metablicas entre la
Facultat de Qumica Fundacin
clula normal y tumoral en la bsqueda de nuevas 2003
Dpto. Bioqumica i La Caixa
dianas antitumorales.
Biologia Molecular
76
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Institut de
Lnea de investigacin: Bioinformtica: Disseny
Biotecnologia i de
dalgorismes i programes per a lanlisi i predicci
Biomedicina
destructura/funci de protenes. Aplicaci de la
(IIB-UAB)
Bioinformtica a lidentificaci de dianes
Unitat de Biologia
teraputiques, vacunals i per a kits de diagnstic.
Molecular
Institut de
Biotecnologia i de Lnea de investigacin: citogentica molecular de
Biomedicina tumors slids: Hibridaci Genmica Comparada en
(IIB-UAB) microarrays de DNA.
Unitat de Citogentica
Instituto Municipal de
Lnea de investigacin: molecular targets of snail
Investigacin Mdica
involved in epithelial to mesenchymal transition of
(IMIM-Univ. Pompeu
tumor cells.
Fabra).
Univ. de Girona
Lnea de investigacin: desarrollo de molculas
Facultat de Cincies
antitumorales que vayan contra dianas especficas
Grupo de Bioqumica
de las clulas cancerosas.
del Cncer
77
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Univ. de Zaragoza
Fac. de Veterinaria
Desarrollo de modelos animales de enfermedades
Dpto. de Bioqumica 2000-2003 MCyT
provocadas por alteraciones del DNA mitocondrial.
y Biologa Molecular y
Celular
Univ. de Zaragoza
Fac. de Veterinaria
Lab. de Neurobiologa. Enfermedad de Alzheimer: desarrollo de nuevos
2003 MCyT
Dpto. de Anatoma, modelos animales.
Embriologa y Gentica
Animal
Univ. Salamanca
Instituto de Clonacin y caracterizacin de receptores opioides
2000-2002 JCYL
Neurociencias de en Zebrafish II.
Castilla y Len
Univ. de Vigo
Facultad de Biologa Lnea de investigacin: hormona de Crecemento
Grupo de Investigacin (GH). Diabetes e obesidade. Modelos animais e
Fisioloxia Endocrina e humanos. GHRH, GRF, GHRP-6.
Neurofisioloxia
78
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Univ. de Cantabria
Facultad de Medicina.
Grupo de Biologa
Lnea de investigacin: estudio de la expresin del
Molecular de las
gen de la apolipoprotena E mediante ratones
Apolipoproteinas y la
knock out como cultivos celulares.
Aterosclerosis
Dpto. de Biologa
Molecular
Univ. Complutense de
Madrid
Facultad de Ciencias Accin antitumoral de los cannabinoides: anlisis
Biolgicas de la expresin gnica en gliomas mediante arrays 2005-2006 CAM
Dpto. de Biologa de DNA.
Molecular y
Bioqumica I
79
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Univ. Complutense de
Madrid Inhibidores de proteasas en Plasmodium
Facultad de Medicina falciparum para la identificacin de nuevas dianas 2003 MCyT
Dpto. de Bioqumica y teraputicas en malaria.
Biologa Molecular IV
Univ. de Alcal
Receptor del pptido intestinal y vasoactivo (VIP)
Facultad de Medicina
como posibles dianas de agentes citotxicos en 2002
Dpto. de Anatoma y
cncer de prstata.
Embriologa Humana
Univ. de Alcal
Molculas de adhesin y enfermedad renal:
Facultad de Medicina
evidencia funcional de las integrinas beta 1 2001-2004 FIS
Dpto. de Anatoma
activadas en un modelo de nefritis autoinmune.
Patolgica
80
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Univ. de Navarra
Clnica Universitaria
de Navarra Functional proteomics of heart failure in arterial Empresa
2002-2004
Dpto. de Cardiologa hypertensin. privada
y Ciruga
Cardiovascular
Univ. de Navarra
Clnica Universitaria Diseo de vectores polimricos para la liberacin
de Navarra controlada de factores neurotrficos tipo GDNF en
2004-2006 GN
Dpto. Farmacia y modelos animales de enfermedad de Parkinson.
Tecnologa Perspectivas teraputicas.
Farmacutica
81
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Univ. de Navarra
Ratones transgnicos como modelos experimentales
Clnica Universitaria 2001 MCyT
de patologas neurodegenerativas humanas.
de Navarra
Dpto. de Neurologa y
Neurociruga Coexpresin de las protenas precursoras del
amiloide y tau humanas mutadas en el cerebro de
MCyT
ratones transgnicos como modelo in vivo de
enfermedad de Alzheimer y neurodegeneracin.
Centro de
Investigacin Mdica Significado de la sobreexpresin del gen EVI1 y
Fundacin
Aplicada diseo de nuevas estrategias teraputicas
2004 Cientfica de la
(CIMA - Univ. de mediante siRNA (short interfering RNA) en
aecc. GN
Navarra) pacientes con leucemia mieloide aguda.
rea de Oncologa
Centro de
Investigacin Mdica
Terapia celular mediante clulas madre adultas en
Aplicada
modelos experimentales de Enfermedad de 2003 GN
(CIMA - Univ. de
Parkinson.
Navarra)
rea de Neurociencias
82
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Univ. de Santiago de
Compostela Potenciales sistemas de neuroproteccin en
Facultad de Medicina modelos experimentales de enfermedad de
2003 MCyT
y Odontologa Parkinson y en neuroesferas de clulas precursoras
Dpto. de Ciencias pluripotenciales.
Morfolgicas
83
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Univ. de Santiago de
Compostela
Envejecimiento cerebral en el perro. Un posible
Facultad de Veterinaria 2003 MCyT
modelo natural de la enfermedad de Alzheimer.
Dpto. de Anatoma y
Produccin Animal
Univ. de Santiago de
Compostela
Construccin de vectores y lneas celulares para el
Complejo Hospitalario 2002 FIPSE
anlisis fenotpico de la infeccin por VIH.
Universitario de
Santiago
Univ. da Corua
Facultad de Ciencias Sistema de determinacin de niveles de expresin
Dpto. de Bioloxa gnica por microarray.
Celular e Molecular
Univ. da Corua
Facultad de INBIOMED: plataforma de almacenamiento,
Informtica integracin y anlisis de datos clnicos, genticos,
2003 FIS
Dpto. de Tecnologas epidemiolgicos e imgenes orientada a la
de la Informacin y investigacin sobre patologas.
las Comunicaciones
Univ. da Corua
Instituto de Ciencias Marcadores moleculares de la patognesis de la
de la Salud cardiomiopata dilatada: estudio de la expresin 2001 MCyT
Unidad de Biologa gnica en el miocardio porcino y humano.
del Desarrollo
Univ. Castilla
La Mancha
Facultad de
Nuevas dianas teraputicas en neuroproteccin:
Qumicas/Centro 2000 CICYT
canales inicos y mecanismos antioxidantes.
Regional
Investigaciones
Biomdicas
Univ. Miguel
Transcriptional regulation in synaptic plasticity,
Hernndez
learning and memory under normal and 2004-2008 CE
Instituto de
pathological situations.
Neurociencias
Univ. de Crdoba
Facultad de
Hormonodependencia de los carcinomas de mama
Veterinaria
caninos y felinos como modelo natural del 1999-2002 MEC
Unidad Docente de
carcinoma de mama humano.
Histologa y Anatoma
Patolgica
84
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Univ. de Crdoba
Facultad de Medicina Lnea de investigacin: modelos experimentales de
Dpto. de Bioqumica Alzheimer.
y Biologa Molecular
Univ. de Len
Facultad de Veterinaria Bsqueda de dianas con potencial teraputico en
2003 MCyT
Dpto. de Farmacologa el tratamiento de la criptosporidiosis.
y Toxicologa
Univ. Valladolid
Nuevos modelos y estrategias para estudiar los
Facultad de Medicina
quimiorreptores arteriales: preparacin in vitro de
Dpto. Bioqumica y 2001-2003 FIS
ratones modificados genticamente y aplicacin de
Biologa Molecular y
microelectrodos sensibles a acetilcolina.
Fisiologa
Univ. Valladolid
Nuevos blancos moleculares de drogas anti-
Instituto de Biologa
inflamatorias: modulacin farmacolgica de la 2003-2004 JCYL
y Gentica Molecular
funcin transcripcional de NFATI.
(IBGM)
Univ. de Sevilla
Facultad de Farmacia Lnea de investigacin: patognesis de la
Farmacologia enfermedad inflamatoria intestinal y cncer
Experimental y colorrectal: mecanismos inmunoinflamatorios.
Farmacia Clnica. Nuevas dianas teraputicas.
Dpto. de Farmacologa
85
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Univ. de Sevilla
Caracterizacin de nuevas dianas en el patgeno
Facultad de Biologa
Salmonella enterica: anlisis gentico y molecular
Grupo de Gentica 2004 MCyT
de funciones de virulencia en los regulones IgaA-
Bacteriana.
RcsBC y Dam.
Dpto. de Gentica
Univ. de Sevilla
Facultad de Medicina Nuevas tcnicas de genmica funcional: anlisis
Grupo de Expresin mediante DNA-arrays de potenciales genes blanco
2003-2005 FIS
Gnica en de los immunosupresores en clulas linfoides y
Eucariontes. granulocticas.
Dpto. de Gentica
Universidad Pablo de
Olavide
Centro Andaluz de
Desarrollo de un modelo experimental de la
Biologa del Aventis-Pharma
enfermedad de Alzheimer en ratn.
Desarrollo
Divisin de
Neurociencias
Univ. de Murcia
Bsqueda de nuevos elementos genticos
Centro Regional de
responsables de la malignizacin celular inducida 2003 MCyT
Hemodonacin de
por TGF-beta.
Murcia
Univ. Extremadura
Facultad de Medicina
Dpto. de Modelling during drug development. 1998-2003 UE
Farmacologa y
Psiquiatra
Univ. Granada
Facultad de Farmacia
Lnea de investigacin: estudios en modelos de
Grupo de
Parkinson experimental, epilepsia experimental y
Comunicacin
en clnica peditrica.
Intercelular
Dpto. de Fisiologa
Univ. Granada
Facultad de Medicina
Lnea de investigacin: modelos experimentales de
Grupo de Inmunologa
inmunopatologa.
Microbiana
Dpto. de Microbiologa
U. Cdiz
Servicio de Lnea de investigacin: modelos de
Dermatologa. experimentacin en toxicologa y alergia cutnea.
Hospital Universitario
de Puerto Real
Modelos cutneos de
Lnea de investigacin: modelos de
experimentacin de
experimentacin en oncologa cutnea y sus
alergia, toxicologa y
nuevas alternativas teraputicas.
cancerologa
Univ. Jan
Grupo de
Inmunobiologa Lnea de investigacin: estudio del proceso
Tumoral metastsico en modelos experimentales murinos.
Dpto. de Ciencias de
la Salud
86
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
U. Mlaga
Facultad de Ciencias Anlisis gentico y funcional de la glutaminasa
Dpto. Bioqumica, humana: terapia gnica basada en antisentidos de 2003-2006 MCyT
Biologa Molecular y la enzima.
Qumica Orgnica
87
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Centro Superior en
Alta Tecnologa Validacin teraputica y desarrollo de
Cientfica neuroprotectores de nueva generacin basados en 2002-2004 MCYT
(CSAT-FVIB) trialquilglinas.
Lab. de Neurobiologa
Centro Superior en
Alta Tecnologa
Cientfica
(CSAT-FVIB) Estudios de estructura-funcin de nuevas posibles
Dpto. de Biologa dianas para la teraputica antimicrobiana:
2000-2003 DGESIC
Celular, Molecular y carbamato quinasa, acetilglutamatoquinasa y
Gentica aspartoquinasa
Lab. de
Reconocimiento
Molecular
88
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Fundacin Reina
Mercedes para la
Caracterizacin del mecanismo sensor de glucosa
Investigacin
en el cuerpo carotideo de rata y su modificacin 2003 MCyT
Sanitaria
en condiciones de hiperglucemia crnica.
Hospital Universitario
Virgen del Roco
Instituto Canario de
Investigacin del
Aplicacin de la tecnologa de BIOCHIPS al estudio
Cncer
de los mecanismos moleculares de la hormona de
(ICIC) 2003-2003 FULP
crecimiento Identificacin de perfiles de
Seccin de Oncologa
expresin gnica inducidos por hormonas.
Molecular y Biologa
del Cncer
Instituto Canario de
Investigacin del Micrometstasis seas de cncer de mama.
Cncer Deteccin de dianas teraputicas en clulas
2002-2003 ACAETCA
(ICIC) tumorales presentes en sangre y mdula sea de
Seccin de Nuevas pacientes de cncer de mama.
terapias para el cncer
89
Centro Ttulo Proyecto Duracin Financiacin
Fundaci irsiCaixa.
Interferencia de RNA: aplicacin en la bsqueda
Hospital Universitari 2002 FIPSE
de nuevas dianas antivirales.
Germans Trias i Pujol
Hospital La Fe
Centro de Desarrollo de un modelo hepatocelular humano
Investigacin diferenciado para estudios de metabolismo y 2003 MCYT
Unidad Hepatologa potencial inductor de nuevos frmacos.
Experimental
Hospital Gregorio
Mapas protemicos de leucocitos
Maran
polimorfonucleares neutrfilos (PMNS). Modelos
Lab. de Biologa
animal y humano.
Celular
Hospital General
Universitario de Elche
Diferenciacin celular y quimiorresistencia en
(HGUE)
cncer de colon. Identificacin de dianas
Grupo de Oncologa 1999-2002 CICYT
moleculares y diseo de estrategias
Molecular
farmacolgicas.
Unidad de
Investigacin
90
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Hospital Universitario
Bsqueda de nuevas dianas contra las infecciones
Ntra. Sra. de 2000-2006 PDCAN
causadas por estafilococos.
Candelaria
Fundacin privada
Instituto de Inhibicin de la replicacin del VIH mediada por
2003 MCYT
Investigacin del RNAs interferentes.
SIDA-Caixa
91
Anexo II: Empresas internacionales en validacin de dianas
Desarrollo de
Alnylam tratamientos basados en
Reactivos para
Pharmaceuticals ARNi para Parkinson, Merck
siRNA
www.alnylam.com degeneracin macular,
VRS y lesin medular
Anlisis de la
Servicios de apoyo en
Althea Technologies ARNsi para validar expresin gnica Expression Analysis,
las diferentes fases de la
www.altheatech.com dianas (eXpress Profiling, Inc.
I+D farmacutica
Signature Discovery)
Kits fabricacin
de ARNsi
Cenix BioScience,
Vectores de
Proveedor de productos Applied Biosystems,
Ambion expresin de ARNsi
de biologa molecular Caliper Technologies
www.ambion.com (pSilencer 5.1)
basados en ARN Corp., Sigma Aldrich
Reactivos
Corp., Qiagen
ARNsi (Silencer)
Microarrays
Desarrollo de frmacos y
anticuerpos teraputicos
Validacin de dianas Abgenix, ISIS
frente a cncer,
Amgen mediante Pharmaceuticals,
inflamacin,
www.amgen.com microarrays, Cambridge Antibody
enfermedades
protemica, ARNi Technology
metablicas, neurologa
y hematologa
Productos de biologa
Anlisis de la
Applied Biosystems molecular dirigidos a
Kits para la sntesis expresin gnica Myriad genetics,
www.appliedbiosyste investigacin bsica,
de PNAs (TaqMan, arrays, Ambion
ms.com farmacutica, y tests
LS*LIMS)
estandarizados
Aventis, Xantos
Proveedor de tejidos
Arrays de tejidos biomedicine,
humanos y productos
Ardais (Ardais tissue Astrazeneca, Bristol
relacionados para
www.ardais.com arrays) Myers Squibb,
investigacin
Tejidos humanos Affymetrix, Abgenix,
farmacutica
Curagen
92
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Aventis, Schering,
ISIS Pharmac.,
GeneBloc MetaGen Pharmac.,
Diseo, seleccin y Desarrollo de ARNi
ARNsi Byk Gulden,
Atugen sntesis de teraputicos en
Vectores Astrazeneca, Kinetek
www.atugen.com antisentidos y oncologa y
Reactivos de Pharma, Novo Nordisc,
reactivos a la carta enfermedades hepticas
administracin Arena Pharma.,
Phogen ltd., Serono,
Axys
Productos y servicios
Aviva Biosciences
Microarrays de dirigidos al
Corporation Axon Instruments
clulas descubrimiento de
www.avivabio.com
frmacos
Kits antisentido
Servicios de diseo Fabricante de kits de Promega, Tranzyme
Biognostik prediseado
de antisentidos anlisis de la funcin de Inc., Antisense
www.biognostik.com Antisentidos a la
(R.A.D.A.R.) protenas Pharma
carta
Software para
Bioinformtica aplicada
identificacin y
Inpharmatica al descubrimiento de Galapagos, Novartis,
validacin
www.inpharmatica.co. nuevas dianas Serono S.A, Chiron
(PharmaCarta,
uk teraputicas y nuevos Corp., Genentech
Biopendium,
tratamientos
Chematica)
93
Empresa Productos Servicios Actividad Colaboraciones
Desarrollo de frmacos y
anticuerpos
Celltech Anticuerpos monoclonales frente a
www.celltechgroup. monoclonales (Fab, enfermedades del Atugen, Abgenix
com SLAM) sistema nervioso,
enfermedades inmunes
y cncer
Servicios de
Cenix Bioscience investigacin basados en
ARN para validacin a Ambion, Alnylam,
www.cenix- ARNi aplicado en clulas
gran escala (HT-RNAi) Bayer, Schering
bioscience.com humanas, de Drosophila
y C. elegans
Herramientas y servicios
Arrays de protenas de investigacin en
Ciphergen Biosystems
(ProteinChip) protemica orientada al MediGene AG
www.ciphergen.com
Software desarrollo de nuevos
frmacos
Genmica para
Sequenom,
desarrollo de nuevos
Microarrays GlaxoSmithKline,
frmacos, protenas y
Curagen Corporation (CuraChip) y Roche, Bayer, Ardais,
anticuerpos teraputicos
www.curagen.com anlisis de interaccin Abgenix, Seattle
en cncer, enfermedades
de protenas Genetics, Bayer,
inflamatorias y
TopoTarget
metablicas
Servicios de
Cytogenix Desarrollo de agentes Endovasc Ltd.,
validacin con
www.cytogenix.com teraputicos de ADN Omnimmune Corp.
tecnologa ssDNA
BioXell SpA,
Desarrollo de frmacos
CombinatoRx Inc.,
Servicios de para enfermedades
DanioLabs Modelos de pez Oxagen Ltd., KS
validacin con pez neurolgicas,
www.daniolabs.com cebra Biomedix Ltd., Sosei
cebra oftalmologa,
Co. Ltd., ProSkelia,
osteoporosis
BioXell
Pfizer, GlaxoSmithKline,
Bases de datos de Herramientas y servicios Merck, Hyseq Inc., Eli
Ratones knock-out y
Deltagen funcin de genes de validacin para el Lilly and Co., Lexicon
transgnicos a la
www.deltagen.com de mamferos descubrimiento de Genetics Inc., Vertex,
carta (DeltaOne)
(Deltabase) frmacos Schering-Plough, Roche
Bioscience, Tularik Inc.
Desarrollo de nuevos
Develogen AG. Servicios de frmacos frente a Evotec OAI,
Dianas validadas
www.develogen.com validacin de dianas enfermedades DoubleTwist Inc.
metablicas
94
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Servicios de Identificacin y
validacin con ARNi, validacin de dianas y
Degven Base de datos modelos vivos, C. compuestos qumicos Genentech, Metabolex,
www.devgen.com (Pheno Base) elegans (Function para enfermedades Sumitomo Pharm. Co.
Factory) y bases de metablicas y
datos (Pheno Base) cardiovasculares
Kits, RNAs a la
carta, grupos de
Proveedor de productos Bayer, Odyssey Thera
Dharmacon siRNA validados
relacionados con ARNi y Inc., Exelixis Inc.,
www.dharmacon.com (siGENOME,
ARNsi Upstate Group Inc.
siARRAY,
SMARTpool)
Desarrollo de
Discovery Genomics,
herramientas de terapia AngioGenetics AB,
Inc. Morfolinos en pez
gnica para Sequitur Inc., Techne
www.discoverygenomic cebra (Morphant)
enfermedades de la Corp.
s.net/morphant.phtml
sangre
Microarrays
(GEArray)
SuperArray Bioscience
siRNA, LAN, PNAs a Proveedor de
Corp., Epoch
Eurogentec la carta herramientas
Biosciences Inc.,
www.eurogentec.com Anticuerpos, genmicas, protemicas
Mosaic Technologies
pptidos y biolgicas
Inc.
Microarrays de
protenas
Plataforma de
validacin GPRCs Investigacin en
Euroscreen Lneas celulares (modelos vivos, receptores acoplados a
www.euroscreen.be (AequoScreen) anticuerpos, protenas G y desarrollo
microarrays, de frmacos
AequoScreen)
LNA Comercializacin de
Exiqon Microarrays de tecnologas propias
Proligo LLC
www.exiqon.com protenas mediante licencias y
(AQ-Link) colaboraciones
Boehringer Ingelheim,
GlaxoSmithKline,
Descubrimiento de Celgene, Wyeth,
Galpagos Bases de datos Validacin mediante frmacos frente a BioFocus, Bayer, Procter
www.galapagosgenom (SilenceSelect, ARNi y cultivos osteoporosis, artritis & Gamble,
ics.com FleXSelect) celulares reumatoide, Alzheimer y Inpharmatica, Exelixis,
asma Euroscreen, Pharmacia,
Incyte Genomics, Vertex
Pharm, UCB Pharma
95
Empresa Productos Servicios Actividad Colaboraciones
Descubrimiento,
desarrollo, fabricacin y
Tecnologas comercializacin de
Lexicon Genetics,
Genentech antisentido nuevos frmacos para
Phenomix,
www.gene.com Anticuerpos oncologa e inmunologa
Inpharmatica, Devgen
monoclonales basados en el
conocimiento del
genoma humano
Proveedor de
Oligonucletidos Open Biosystems Inc.,
Gene Tools oligonucletidos tipo
antisentido Mermaid Pharm., AVI
www.gene-tools.com morfolino para
(Morfolinos) BioPharma Inc.
investigacin
Desarrollo de
anticuerpos humanos
Anticuerpos
Genmab para tratamiento de Roche, Amgen,
monoclonales
www.genmab.com enfermedades Medarex Inc.
(HuMax)
autoinmunes, infecciosas
y cncer
Desarrollo de
Genomics Muestras de suero, Bases de datos y herramientas para
Collaborative ADN y tejidos (GCI software (GCI validar dianas y
www.genomicsinc.com Tissue Access) Access) comercializacin de
dianas validadas
Produccin de anticuerpos
Anticuerpos
Genovac Purificacin, marcaje monoclonales y Adquirido por Aldevron
prediseados y a la
www.genovac.com de anticuerpos policlonales por LLC
carta
inmunizacin gentica
Ratones y ratas
transgnicas (Safe
Desarrollo de modelos Sanofi-synthelabo,
DNA Transgenesis,
Genoway genticamente SynX Pharma Inc.,
Quick Knock-in,
www.genoway.com modificados de ratn y Laboratoires Servier,
RNAi Transgenesis)
rata Altana Pharma
ARNi in vivo (SAFE in
vivo RNAi)
Identificacin y Desarrollo y
Genta validacin comercializacin de
Oasis Biosciences
www.genta.com (Antisentidos, ARNi, nuevos tratamientos
OptiSense) para cncer
96
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Diagnstico de
enfermedades y
Validacin de dianas y desarrollo de nuevos Mirus, Imgenex,
Genzyme
SAGE desarrollo de tratamientos para Celera, Myriad
www.genzyme.com
frmacos enfermedades genticas, Genetics
cardiovasculares,
inmunes y cncer
Medtronic Inc.,
MethylGene,
Isis Pharm. Inc.,
I+D y comercializacin
Tecnologas Aegera Therapeutics
de nuevas terapias
Hybridon antisentido Inc., The Immune
antisentido para cncer,
www.hybridon.com (oligonucletidos Response Corporation,
asma/alergias e
sintticos) Alnylam Pharm. Inc.
infecciones
Migenix Inc.,
Epignesis, Integrated
DNA Technologies Inc.
Servier Research
Group, Mindsense
Estudio de Descubrimiento de
Biosystems Ltd., Oxford
interacciones de frmacos mediante el
GlycoSciences plc.,
Hybrigenics protenas (doble estudio de interacciones
Lynx Therapeutics Inc.,
www.hybrigenics.com hbrido, PIM, proteicas, validacin
Genome Express, Small
LIMS) funcional de dianas y
Molecule Therapeutics
Modelos animales screening de compuestos
Inc., Apoxis, Incyte ,
Merck, XTL Biopharm.
Desarrollo de anticuerpos
Iclectus
Intracuerpos que funcionan en el
www.iclectus.com
interior de clulas
Anticuerpos Desarrollo y
ARNi comercializacin de Genzyme Molecular
Imgenex Vectores reactivos para estudio Oncology,
www.imgenex.com (GeneSuppressor) de enfermedades, kits SuperBioChip
Arrays de tejidos de diagnstico y nuevos Laboratories
(Histo-Array) tratamientos
Desarrollo de
Plataforma de tratamientos frente a Affimetrix, Novartis,
Immusol
validacin in vivo con enfermedades Medarex, Chugai,
www.immusol.com
ARNsi y microarrays infecciosas, metablicas Pfizer
y cncer
Tecnologas
Integrated DNA Proveedor de Promega Corp., Isis
antisentido a la
Technologies oligonucletidos a la Pharm. Inc.,
carta: LNA, ARNi,
www.idtdna.com carta Sequenom Inc.
ddARNi, miARN
97
Empresa Productos Servicios Actividad Colaboraciones
Desarrollo de tecnologa
ARNsi in vitro e in Qiagen, Sequitur,
Intradigm Corporation Validacin de dianas de ARNi in vivo para
vivo DirectGene,
www.intradigm.com por contrato terapia de cncer y otras
Vectores Europroteome
enfermedades.
ARNsi
Vectores
Proveedor de
Invivogen (psiRNA)
herramientas para
www.invivogen.com Software de
investigacin
seleccin de ARNsi
(siRNA Wizard)
Alnylam, Amgen,
Chiron, Abott, Pfizzer,
GlaxoSmithKline, Merck,
ISIS Pharmaceuticals Desarrollo de frmacos Aventis, Astrazeneca,
Tecnologas
www.isispharm.com/f que actan sobre ARNm, Atugen, Sequitur,
antisentido
unc_genomics.html terapias antisentido Amgen, Chiron Corp.,
Pharmacia,
Johnson&Johnson,
Celera
Microarrays de
Jerini array Desarrollo de nuevos
pptidos (PepStar, Pptidos a la carta y
technology frmacos peptdicos y
PepSpots, libreras de pptidos
www.jerini.com qumicos
RepliTope)
Descubrimiento y
desarrollo de nuevos
Kalypsis Qumica gentica, Merck, CV
frmacos frente a cncer,
www.kalypsys.com bioinformtica Therapeutics Inc.
enfermedades metablicas
e inflamatorias
Bristol-Myers Squibb.,
Genentech Inc.,
Desarrollo de frmacos
Ratones knock-out y Takeda Pharmaceutical
frente a enfermedades
transgnicos Company Limited,
Lexicon genetics humanas mediante
(Genome5000, Gene Abgenix Inc., Pfizer,
www.lexgen.com bsqueda de nuevas
Targeting, Gene Johnson & Johnson,
dianas a escala
Trapping) Aventis, Roche, Merck,
genmica
Eli Lilly, Bayer,
Immunex
Microarrays de ADNc
Perfilado de la expresin
Memorec (PIQOR)
mediante microarrays de
www.memorec.com Ratones transgnicos
ADNc
Bioinformtica
98
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Plataforma de Descubrimiento de
descubrimiento de nuevos tratamientos a
Millenium
dianas y frmacos partir del conocimiento
Pharmaceuticals Roche
basada en genmica, de los distintos procesos
www.mlnm.com
protemica y implicados en la
bioinformtica enfermedad
Tecnologas, Descubrimiento y
herramientas y comercializacin de
Mirus Servicios de Genzyme Corp.,
reactivos antisentido tecnologas y productos
www.mirusbio.com laboratorio a la carta Transgene
in vitro e in vivo innovadores basados en
(TransIT) cidos nucleicos
Kit de sntesis de
ARNi Proveedor de productos
New England Biolabs RheoGene Inc., Dyax
ARNsi y reactivos de alta pureza para
www.neb.com Corp.
(TransPass, investigacin
ShortCut)
Desarrollo y
Tecnologas de
Nucleonics comercializacin de Apath LLC, Novosom
interferencia y
www.nucleonicsinc.com terapias basadas en AG, Wyeth
vectores (eiRNA)
tecnologas de ARNi
Desarrollo de terapias
Vectores para
frente a cncer y AstraZeneca, Wyeth,
Oxford BioMedica administrar
enfermedades Merck, Biogen Idec,
www.oxfordbiomedica. tecnologas
neurolgicas basadas en Amersham, Molmed,
co.uk antisentido y genes
el conocimiento de la Arius Research, Kiadis
(LentiVector)
funcin de genes
99
Empresa Productos Servicios Actividad Colaboraciones
Microarrays
ARNi
Integrated DNA
(CodeBreaker Proveedor de reactivos
Technologies Inc.,
Promega RiboMAX) biolgicos para
Benitec, EraGen
www.promega.com Vectores investigacin y
Biosciences Inc.,
(psiCHECK, aplicaciones tecnolgicas
Serologicals Corp.
siLentGene,
siSTRIKE)
Desarrollo de
ProQinase Modelos in vitro e tratamientos para cncer
www.proqinase.com in vivo que actan sobre
proteinquinasas
Compaa biotecnolgica
Proteome Factory Validacin de dianas
especializada en
www.proteomefactory en cultivos celulares y
protemica y validacin
.com modelos de ratn
de dianas
Desarrollo y
comercializacin de
Qiagen siRNA validados y a herramientas para Ambion, Affymetrix
www.qiagen.com la carta, reactivos investigacin biolgica, Inc.
desarrollo de frmacos y
diagnstico molecular
Desarrollo y
ARNi, ratones comercializacin de
Regeneron
transgnicos y knock- medicamentos para Sanofi-Aventis
www.regeneron.com
out (Velocigene) tratamiento de obesidad,
artritis reumatoide
Desarrollo de frmacos
Estudio de rutas
para tratamiento de Novartis, Pfizer,
Rigel Inc. implicadas en la
asma/alergia, hepatitis Johnsons&Johnsons,
www.rigel.com progresin de la
C, artritis reumatoide y Daiichi
enfermedad
cncer
100
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Desarrollo de
Microarrays y tecnologas de
Rosetta Inpharmatics
software de anlisis investigacin genmica y Filial de Merck
www.rii.com
(Rosetta Resolver) anlisis de datos para
seleccin de dianas
Tecnologas Desarrollo y
Santaris antisentido comercializacin de
www.santaris.com (oligonucletidos, nuevos frmacos para el
LNA, ARNsi) tratamiento de cncer
Proveedor de productos
de anlisis gentico para CuraGen Corp.,
Sequenom Microarrays Validacin de dianas
investigacin biomdica, Morphochem AG,
www.sequenom.com (MassARRAY) en cultivos celulares
medicina molecular y Autogen Ltd.
agricultura
Desarrollo de terapias
Sirna Therapeutics Eli Lilly, Archemix,
ARNsi basadas en la tecnologa
www.rpi.com Abott
del ARNi
Tecnologas
Tecnologas basadas en
Somagenics antisentido (oligos,
ARN para diagnstico y
www.somagenics.com ARNsi, ribozimas,
desarrollo de frmacos
RNA Lassos)
Productos, herramientas
y servicios de clonaje,
Spring Bioscience Kits de ARNsi,
screening de dianas y
www.springbio.com anticuerpos
anlisis de la expresin
de protenas
Desarrollo y
comercializacin de
productos y tecnologas
Stratagen ARNsi y reactivos
de biologa molecular, Affymetrix Inc.
www.stratagene.com de transfeccin
genmica, protemica
frmacologa y
toxicologa
Desarrollo y
Identificacin y
comercializacin de Invitrogen, EMD
Tecan caracterizacin de
soluciones para I+D Biosciences, Inc.,
www.tecan.com protenas y estudio
farmacutica, genmica, Pierce
de su expresin
protemica y diagnstico
Servicios para
investigadores en
terapia gnica,
Trilink Oligonucletidos
quimioterapia con
www.trilinkbiotech.com modificados
nuclesidos,
oligonucletidos y
diagnstico
101
Empresa Productos Servicios Actividad Colaboraciones
Desarrollar productos de
anlisis de la
ARNsi (siRNA Estudio de
sealizacin celular,
Upstate siAb, siRNA interacciones Phylos Inc.,
plataformas
www.upstate.com SMARTpools, proteicas Dharmacon
tecnolgicas, servicios
pKD) (PathwayProfiler)
de investigacin bsica y
desarrollo farmacutico
Servicios de desarrollo
Genmica qumica de frmacos y de
VASTox limited
con pez cebra y toxicologa para la
www.vastox.com
Drosophila industria farmacutica y
biotecnolgica
Tecnologas de
Modelos celulares Servicios basados en
trangnesis e imagen
xenogen (Bioware) y ratones y ratas Morphochem AG,
dirigidas a la I+D
www.xenogen.com animales (LPTA transgnicas y Pfizer
farmacutica,
Animal Models) knock-out
biotecnolgica y qumica
Compaa biotecnolgica
especializada en Stemline Therapeutics
Xerion
protemica funcional y Inc., ARIUS Research
Pharmaceuticals Tecnologas
validacin de dianas que Inc., ALTANA AG,
www.xerion- protemicas y CALI
proporciona dianas PROCORDE GmbH,
pharma.com
validadas y anticuerpos Xerion Pharm., Aventis
teraputicos
Genentech Inc.,
I+D preclnica y clnica
Millennium Pharm.
de anticuerpos y
Inc., Alexion Pharm.
Xoma Anticuerpos protenas recombinantes
Inc., Chiron Corp.,
www.xoma.com monoclonales para tratamiento de
Aphton Corp., Triton
cncer, enfermedades
BioSystems, Zephyr
inmunes e infecciosas
Sciences Inc.
Modelos de pez
Desarrollo de frmacos
cebra, librera de
Znomics con pez cebra como
mutantes de pez
www.znomics.com modelo de enfermedad y
cebra
sistema de screening
(ZeneMarkTM)
Desarrollo de modelos
de pez cebra para
Becton Dickinson and
Peces cebra preclnica de frmacos
Zygogen Co., Aventis, NuTec
transgnicos (Z-Tag, frente a enfermedades
www.zygogen.com Sciences Inc., Ariad
Z-Lipotrack) cardiovasculares,
Pharm., Curis Inc.
neurodegenerativas y
cncer
Desarrollo y
Zyomix Microarrays de comercializacin de Invitrogen
www.zyomyx.com protenas plataformas de anlisis
de protenas
102
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Servicios relacionados Servicios de validacin de dianas a la carta mediante modelos celulares ad hoc
con identificacin y para el estudio de dianas concretas y screening de potenciales frmacos frente
validacin de dianas a las mismas.
Acuerdos y Pharma Mar, Smith&Nephew, Merck, Cytochroma, Grifols, ICN, Lipotec S.A.,
colaboraciones DiverDrugs SL, NorayBio, Cognis, Myrurgia, Progenika, Crystax, Oryzon,
cientficas Crystax y Laboratorios Esteve.
Bioalma, S.L.
Misin Bioinformtica.
Servicios relacionados
Consultora, formacin y desarrollo de software aplicado a los microarrays de
con identificacin y
ADN.
validacin de dianas
Acuerdos y
colaboraciones CNIO, Genetrix.
cientficas
163
Advancell (www.advancell.net)
Bioalma (www.almabioinfo.com)
Dominion Pharmakine (www.pharmakine.com)
Instituto de Farmacia Industrial (www.usc.es/farmind/doc/servicios.htm)
Oryzon Genomics (www.oryzon.com)
Progenika (www.progenika.com)
Proteomika (www.proteomika.com)
Unidad Mixta Almirall Prodesfarma-PCB (www.almirall.eswww.pcb.ub.es)
103
Biomedal S.L.
Servicios relacionados
con identificacin y Determinacin de la estructura de dianas proteicas y complejos diana-ligando.
validacin de dianas
Acuerdos y
colaboraciones Advancell, Oryzon Genomics, Uriach Laboratories.
cientficas
104
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Arrays de tejidos:
Human Hepatic Colon-Carcinoma Metastasis Tissue Array.
Organ-Specific Metastasis Melanoma Tissue Array.
Productos Multi-Organ Animal Tissue-Arrays.
relacionados con Array de tejidos personalizado.
identificacin y
validacin de dianas. Arrays de clulas:
Array de clulas especfico de hgado (humano, rata, ratn).
Array de lnea celular de melanoma humano.
Array de clulas personalizado.
Genmica funcional:
Anlisis de la expresin gnica.
Diseo de microarrays de ADN personalizados.
Frmaco-genmica.
Servicios relacionados Anlisis de sistemas de expresin modificados.
con identificacin y Protemica funcional:
validacin de dianas Anlisis de la expresin proteica.
Identificacin de protenas.
Protemica comparativa.
Frmaco-protemica.
Fenmica funcional.
I+D
Ebiointel, S.L.
Acuerdos y
colaboraciones Noray Bioinformatics.
cientficas
105
Genetrix S.L.
Productos
Biotherapix:
relacionados con
Generacin de nuevas molculas teraputicas basadas en anticuerpos para el
identificacin y
tratamiento de enfermedades infecciosas, degenerativas e inflamatorias.
validacin de dianas
Cellerix:
Plataforma propia que combina libreras de anticuerpos producidas dentro de
I+D en identificacin
la empresa con tecnologa de clulas madre.
y validacin de dianas
Determinar nuevos factores y molculas capaces de iniciar y/o mejorar
programas especficos de diferenciacin de clulas madre adultas.
106
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Integromics, S.L.
Servicios relacionados
ArrayHub (gestin de datos de anlisis de la expresin gnica).
con identificacin y
Formacin en bioinformtica.
validacin de dianas
I+D
Acuerdos y
colaboraciones Applied Biosystems, Spotfire.
cientficas
Neocodex S.L.
Servicios relacionados
con identificacin y Expresin gnica mediante microarrays de ADN.
validacin de dianas
107
Neuropharma S.A.
I+D Bioinformtica
Acuerdos y
Azeretia, H.U. La Paz, Dominion Pharmakine, Advancell, Owl Genomics, Aethia,
colaboraciones
Universidad de Barcelona, Biolex, Judo, PharmaDatum, eBiointel.
cientficas
108
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Productos
relacionados con Hepatochip: chip de ADN que permite conocer la presencia de esteatohepatitis
identificacin y no alcohlica (NASH) a partir de la coexpresin de 85 genes.
validacin de dianas
Acuerdos y
colaboraciones Owl Genomics.
cientficas
109
Protemica S.A.
Acuerdos y
Pepscan Systems BV, Algonomics NV, Proteomika, CNIO, University Louis
colaboraciones
Pasteur, UMC Utrecht.
cientficas
Direccin: Parque Tecnolgico de Zamudio, Edificio 801 -A-. 48160 Derio, Bizkaia.
Contacto
Web: http://www.proteomika.com
Servicios relacionados
con identificacin y Aplicaciones en el desarrollo de chips de ADN.
validacin de dianas
Secuenciacin de genomas.
Desarrollo de nuevas herramientas de bioinformtica para el anlisis de
secuencias a gran escala.
Optimizacin de la PCR (Polymerase Chain Reaction) a tiempo real aplicada al
diagnstico molecular.
I+D Generacin de una amplia base de datos de marcadores genticos que
contiene especies de inters agronmico.
Tecnologa de AFLPs.
Tecnologa de Microsatlites.
Aplicaciones basadas en el desarrollo de Chips de ADN, tanto en el rea del
diagnstico molecular, como en el anlisis de alimentos.
110
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Clulas knock-out
Receptor de ADP Clopidogrel
Sanofi Trombosis Comercializado Ratones knock-
P2Y12 (Plavix)
out
Antiemtico
TAK-637 (prevencin de
Abbott y Takeda
Receptor NK1 Aprepitant nusea y vmito), Comercializado Ratn knock-out
Merck & Company
(Emend) depresin,
ansiedad
Cetuximab
Merck & Company Cncer colorrectal Comercializado
(Erbitux)
Gefitinib
AstraZeneca Tumores slidos Fase III
(Iressa)
bevacizumab
Genentech Cncer colorrectal Comercializado
(Avastin)
Degeneracin
Ranibizumab
Genentech macular asociada Fase III
(Lucentis)
a la edad
Cicloxigenasa
(COX) y
Licofelone Merckle Osteoartritis Fase III Ratn knock-out
Lipoxigenasa
(LOX)
111
Principales dianas teraputicas (continuacin)
Enfermedades
cardiovasculares
(Obesidad,
Rimonabant
Receptor CB1 Sanofi-Aventis Tabaquismo), Fase III Ratn knock-out
(Acomplia)
psicosis,
esquizofrenia,
shock sptico
Enfermedades
autoinmunes
(esclerosis Ratn knock-out
Receptor de la Natalizumab Biogen Idec y
mltiple, Fase III Anticuerpos
integrina alfa-4 (Tysabri) Elan Corporation
enfermedad de monoclonales.
Crohn, artritis
reumatoide)
Receptor Glp-1 Exenatide, GLP-1 Lilly Obesidad, diabetes Fase III Ratn knockout
Enfermedad
Roflumilast pulmonar
Pfizer Fase III
(Daxas) obstructiva crnica
Fosfodiesterasa-4 (EPOC), asma Ratn knock-out
Lesiones del
sistema nervioso,
Knock-outs
mucosistis,
Enfermedad
Factor de GlaxoSmithKline
inflamatoria
crecimiento de Repifermin y Human Genome Fase III Ratn knockout
intestinal, colitis
queratinocitos 2 Sciences
ulcerosa,
enfermedad de
Crohn, lceras en
la piel
GlaxoSmithKline
Receptor 5-HT2C BVT-933 Obesidad Fase II Ratn knockout
y Biovitrum
Receptor
GW-493838 GlaxoSmithKline Dolor, migraa Fase II Ratn knockout
Adenosina A1
Diabetes no
Dipeptidil LAF-237 Novartis
dependiente de Fase II Ratn knockout
peptidasa V P32/98 Merck
insulina
Enfermedad
Receptor del Ifetroban Bristol-Myers vascular perifrica,
Fase II Ratn knockout
tromboxano A2 (BMS-180291) Squibb tromboembolismo,
lcera, isquemia
Glaucoma, fallo
cardaco
congestivo,
Receptor V2 de Sndrome
SR-121463 Sanofi-Synthelabo Fase II Ratn knockout
la vasopresina inadecuado de
ADH (hormona
antidiurtica),
hipertensin
112
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Esclerosis
multiple,
transplantes de
BMS-188667 Bristol-Myers rganos,
CTLA-4 Fase II Ratn knockout
BMS-224818 Squibb psoriasis, artritis
reumatoide,
enfermedades
autoinmunes
Enfermedad
Bristol-Myers inflamatoria
TACE BMS-561392 Fase II Ratn knockout
Squibb intestinal, artritis
reumatoide
Knock-outs
Rinitis alrgica,
GW-559090 GlaxoSmithKline Fase II
asma
Integrina _4/`1
Ratn knockout
(VLA-4)
Rinitis alrgica,
R-411 Roche Fase II
asma
Enfermedades
autoinmunes,
Receptores EDG FTY-720 Novartis Fase II Ratn knockout
trasplante de
rganos
ARNsi anti-Bcr-Abl
Tirosina quinasa Imatinib Cncer (Leucemia en lneas celulares
Novartis Comercializado
Bcr-Abl (Glivec) mieloide crnica) humanas sensibles
a imatinib
Psoriasis,
National Cancer Fase II
LMB-2 leucemia y
Institute Fase I
linfoma
Daclizumab
Roche Leucemia Fase II
Zenapax
Daclizumab
Roche Infeccin por VIH Fase I
Zenapax
Enfermedad
Canales de Morfolinos en pez
Dronedarone Sanofi-Synthelabo cardiovascular Fase III
potasio HERG cebra
(arritmia cardiaca)
113
Principales dianas teraputicas (continuacin)
Subunidad R2 de
Lorus Oligonucletidos
la ribonucletido GTI-2040 Cncer renal Fase II
Therapeutics antisentido
reductasa
European Verrugas
Pptido E6 del Organization for genitales, cncer
Vacuna de
virus del papiloma Research and genital: reduccin Fase II ARNsi
pptido E6
humano 16 Treatment of del crecimiento
Cancer celular
National Cncer
Terapia gnica Cncer Fase II
Institute
P53 ARNsi
Vacuna de National Cncer
Cncer Fase II
pptidos p53 Institute
National Institute
Protena rev del Vacuna rMVA-HIV of Allergy and
Tecnologas antisentido
National Institute
Vacuna rMVA-HIV of Allergy and
Tat Infeccin por VIH Fase I ARNsi
y rFPV-HIV Infectious
Diseases
Oligonucletidos
Oncogn Raf-1 LErafAON Neopharm Tumores slidos Fase I
antisentido
53bp1: proteina
... ... Cncer Preclnica ARNsi
de unin a p53
Neuroblastoma y
P73Dn ... ... Preclnica ARNsi
otros tumores
Hepatitis ARNsi,
Receptor Fas ... ... Preclnica
autoinmune anticuerpos
Microarrays de
ADNc
1 DDRT-PCR
COX17 ... ... Cncer de pulmn Preclnica
Oligonucletidos
antisentido
ARNsi
ARNsi, expresin
de ARNsi
Vif Infeccin por VIH Preclnica
mediante
plsmidos
114
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Protena
estructural de la Infeccin por
Preclnica ARNsi
capside del poliovirus
poliovirus
Tecnologas antisentido
Enfermedad
Protena F del
respiratoria por Preclnica ARNsi
VRS
VRS
Protena 5B y
ARNm de la Hepatitis C,
polimerasa del cirrosis, cncer Preclnica ARNsi in vivo
virus de la de hgado
hepatitis C
115
Referencias
Abuin, A., et al. (2002). Full-speed mammalian pharmaceutical research and development.
genetics: in vivo target validation in the drug Current Opinion in Biotechnology. 11: 602-609.
discovery process. Trends in Biotechnology.
Vol. 20, N 1: 36-42. Cocks, B. G. & Theriault, T. P. (2004).
Developments in effective applicaction of small
Allen, N. L., et al. (2003). Representational inhibitory RNA (siRNA) technology in mammalian
difference analisis: critical appraisal and metod cells. DDT: Targets. Vol. 3(4): 165-171
development for the identification of unique DNA
sequences from procaryotes. Journal of Coleman, R. A. & Clark, K. L. (2003). Target
Microbiological Methods. 55: 73-81. validation using human tissue. Targets Vol. 2,
No. 2: 58-64.
Altshuler, J., et al. (2001). A Revolution in R&D:
How Genomics and Genetics are transforming Crooke, S. T. (2004). Progress in Antisense
the Biopharmaceutical Industry. The Boston Technology. Annu Rev. Med. 55: 61-69.
Consulting Group.
Dickson, M. et Gagnon, J. P. (2004). Key factors
Baumeister, R. (2002). The worm in us - in the rising cost of new drug discovery and
Caenorhabditis elegans as a model of human development. Nature Reviews. Vol. 3: 417-429.
disease. Trends in Biotechnology. Vol. 20, N 4:
DiMasi, J. A. (2003). The price of innovation:
147-148.
new estimates of drug development costs.
Beck, S., et al. (2202). Fluorophore-assisted light Journal of Health Economics, 22: 151-185.
inactivation: A high-throughput tool for direct
Doan, T. N. (2004). High-throughput target
target validation of proteins. Proteomics. 2:
validation in model organisms. Drug Discovery
247-255.
Today: Targets. Vol. 3, N 5: 191-197.
Brown, D. & Superti-Furga, G. (2003).
Dohrmann, C. E. (2004). Target discovery in
Rediscovering the sweet spot in drug discovery.
metabolic disease. Drug Discovery Today. 9
Drug Discovery today. 8 (23): 1067-1077.
(18): 785-794.
Brown, D. & Superti-Furga, G. (2003).
Douglas S. A., et al. (2004). Techniques:
Rediscovering the sweet spot in drug Discovery.
Cardiovascular pharmacology and drug discovery
Drug Discovery today. Vol. 8 No. 23. 1067-1077.
in the 21st century. Trends in Pharmacological
Caponigro, G., et al. (2003). Functional analisis of Sciences. Vol. 25 N 4: 225-233.
expressed peptides that bind yeast STE proteins.
Drews, J. (2000). Drug Discovery: A Historical
Journal of Biotechnology 103: 213-225.
Perspective. Science, 287: 1960-1964.
Carroll, P. M. & Fitzgerald, K. (2003). Model
Drews, J. (2003). Strategic trends in the drug
Organisms in Drug Discovery. Edited by John
industry. Drud Discovery Today. Vol. 8 No. 9:
Wiley & Sons, Ltd.
411-420.
Chanda, S. K. et Caldwell, J. S. (2003). Fulfulling
Dykxhoorn, D. M., et al. (2003) Killing the
the promise: drug discovery in the post-genomic
messenger: short RNAs that silence gene
era. Drug Discovery today. Vol. 8, N 4. pag:
expression. Nature Rev. Mol. Cell Biol. 4,
168-174.
457467
Chatterton, J. E., et al. (2004). Ribozymes in
Epstein, D. M., et al. (2002). Target Validation
gene identification and drug discovery. Drug
with Nucleic Acid Aptamers. Mimicking small
Discovery Today: Targets, vol. 3, No. 1, 10-17.
molecule therapeutics by attacking the protein,
Coates, P. J. & Hall, P. A. (2003). The yeast two- and not the gene. Pharmaceutical Discovery and
hybrid system for identifying protein-protein Development. PharmaVentures Ltd.
interactions. Journal of Pathology 199:4-9
Fitzgerald, K. & Carroll, P. M. (2003). Model
Cockett, M., et al. (2000). Applied genomics: Organisms in Drug Discovery. John Willey
integration of the technology within Sons, Ltd.
116
BIOTECNOLOGA APLICADA A LA IDENTIFICACIN Y VALIDACIN
DE DIANAS TERAPUTICAS
Gallen, C. C. (2004). Strategic Challenges in Jamieson, A. C., et al. (2004). Drug Discovery
Neurotherapeutic Pharmaceutical Development. with Engineered Zinc-finger Proteins. Nature
The American Society for Experimental Reviews: Drug Discovery. Vol. 2: 361-368.
NeuroTherapeutics. Vol. 1: 165-180.
Kaplan, W. & Laing, R. (2004). Priority Medicines
Godfray, J., et al. (2004). The use of nucleic acid for Europe and the World. Warren Kaplan and
tools for target validation in central nervous Richard Laing. World Health Organization.
system therapy. Vol 1. No. 2: 85-91. Department of Essential Drugs and Medicines
Policy.
Gray, L. (2003). Genomics-based Approaches to
Drug Target Validation. Business Communications Kramer, R. & Cohen, D. (2004). Functional
Company, Inc. Genomics to new Drug Targets. Nature Reviews:
Drug Discovery. Vol. 3: 965-972.
Gunsalus, K. C. & Piano, F. (2005). RNAi as a tool
to study cell biology: building the genome- Kumble, K. D. (2003). Protein microarrays: new
phenome bridge. Curr. Op. in Cell Biology 17: 3-8. tools for pharmaceutical development. Anal
Bioanal Chem. 377: 812-819
Haberman, A. B. (2003). Post-genomic Target
Validation: Next Generation Approaches and Kuperberg, G., et al. (2002). Developments in
Tools for Optimizing Target Selection. CHI the pharmacological treatment of schizophrenia.
Reports. Cambridge Healthtech Institute. Expert Opin. Investig. Drugs. 11 (10): 1-7.
Hall, J. (2004). Un ravelling the general
Lander, E. S., et al. (2001). Initial sequencing
properties of siRNAs: strength in numbers and
and analysis of the human genome. Nature.
lessons form the past. Nature Reviews. Genetics
409(6822), 860-921.
5: 552-557.
Lee, L. K. & Roth, C. M. (2003). Antisense
Hanash, S. (2003). Disease proteomics. Nature
technology in molecular and cellular
422: 226-232.
bioengineering. Current Opinion in
Hardy, L. W. & Peet, N. P. (2004). The multiple Biotechnology. 14: 505-511.
orthogonal tools approach to define molecular
Lindsay, M. A. (2003). Target discovery. Nature
causation in the validation of druggable targets.
Reviews: Drug Discovery. 2: 831-838.
Drug Discovery Today. 9(3): 117-26.
Liu, R., et al. (2004). New approaches in
Henning, S. W. & Beste, G. (2002). Loss-of-
identifying drugs to inactivate oncogene
function strategies in drug target validation.
products. Seminars in Cancer Biology 14: 13-21.
Current Drug Discovery May. 17-21
Lpez, M.; Mallorqun, P.; Vega, M. (2002).
Hckfelt, T., et al. (2003). Neuropeptides:
Microarrays y Biochips de ADN: Informe de
Oportunities for drug discovery. The Lancet
Vigilancia Tecnolgica. Genoma Espaa, Crculo
Neurology. Vol. 2: 463-472.
de Innovacin en Biotecnologa y Fundacin
Hopkins, A. L. & Groom, C. R. (2002). The General de la Universidad Autnoma de Madrid.
druggable genome. Nature Reviews: Drug
Discovery. Vol 1: 727-730. Mathisen, P. M. (2003). Gene Discovery and
validation for neurodegenerative diseases. Drug
Igney, H. G., et al. (2004). Techniques: Species Discovery Today. 8(1): 39-46.
finest blend - humanized mouse models in
inflammatory skin disease research. Trends Meloni, R., et al. (2003). DNA microarrays and
Pharmacol Sci. 25 (10): 543-549. Pharmacogenomics. Pharmacological Research.
49: 303-308.
Ilag, L. L., et al. (2002). Emerging high
throughput drug target validation technologies. McNeish, J. (2004). Embriogenic Stem cells in
Drug Discovery Today 7(18): 136-142. drug discovery. Nature Reviews: Drug Discovery.
Vol 3: 70-80.
Jackson, L. K. & Phillips, M. A. (2002). Target
Validation for Drug Discovery in Parasitic Mousses, S., et al. (2001) Clinical and functional
Organisms. Current Topics in Medicinal target validation using tissue and cell microarrays.
Chemistry, 2: 425-438. Curr. Op. in Chem. Biology, 6:97-101
Jain, K. K. (2004). RNAi and siRNA in target Holmes, A., et al. (2003). Neuropeptide systems
validation. Drug Discovery Today. 9 (7): 307-309. as novel therapeutic targets for depresin and
117
anxiety disorders. Trends in Pharmacological Stone, L. S. & Vulchanova, L. (2003). The pain
Sciences. Vol. 24. N 11: 580-588. of antisense: in vivo application of antisense
oligonucleotides for functional genomicas in pain
Paroo, Z. & Corey, D. R. (2004). Challenges for and analgesia. Advances Drug Delivery Reviews
RNAi in vivo. Trends in Biotechnology. Vol. 22, 55: 1081-1112.
No. 8: 390-394.
Tan, S., et al. (2003). Zinc-finger protein-targeted
Parsons, A. B., et al. (2003). Yeast genomics and gene regulation: Genomewide single-gene
proteomics in drug discovery and target specifity. PNAS. Vol. 100, No. 21: 11997-12002.
validation. Progress in Cell Cycle Research. Vol.
5: 159-166. Thompson, J. D. (2002). Applications of
antisense and siRNAs during preclinical drug
Pauls, E. & Est, J. A. (2004). RNA interference development. Drug Discovery Today Vol. 7 No.
as a tool for target validation. Drug Discovery 17: 912-917.
Today: technologies. Vol. 1, No. 2: 135-140.
Trnell, J. & Snaith, M. (2002). Transgenic
Peet, N. P. (2003). What constitutes target systems in drug discovery: from target
validation?. Targets. Vol. 2, No. 4: 125-127. identification to humanized mice. Drug Discovery
Today. Vol. 7 No. 8: 461-470.
Pillutla, R. C., et al. (2002). Target Validation
and drug discovery using genomic and protein- Valculescu, V. E., et al. (2000). Analysing
protein interaction technologies. Expert Opinion unchartered transcriptomes with SAGE. TIG. Vol.
on Therapeutic Targets, 6 (4): 517-531. 16, No. 10: 423-425.
Rawlins, M. (2004). Cutting the cost of Drug Walgren, J. L. & Thompson, D.C. (2004). Aplication
Development? Nature Reviews: Drug Discovery. of proteomic technologies in the drug development
Vol. 3: 360-364. process. Toxicology Letters 149: 277-385.
118
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