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Adems, existen tres tipos diferentes de ARN, cada uno de los cuales desempea una funcin
diferente, el mensajero (ARNm), el transferente (ARNr) y el ribosmico (ARNr)
Podemos distinguir varios niveles estructurales en los cidos nucleicos. La estructura primaria o
secuencia indica el orden en que se encuentran los nucletidos. La ordenacin regular y estable
que adopten los nucletidos puede denominarse estructura secundaria, la ms conocida es la
estructura de la doble hlice del ADN, descubierta por Watson and Crick en 1953.
Para el desarrollo de ambos casos es necesario proceder segn una serie de pasos comunes.
-Marcaje del extremo del DNA de forma que pueda visualizarse. Normalmente se marca el
extremo 5 usando 32P, un radioistopo que emite partculas beta.
-Despus se hace una electroforesis de acrilamida de alta concentracin que permite separar
fragmentos de cidos nucleicos que se diferencian tan slo en un nucletido. El gel de
secuenciacin es un gel de poliacrilamida muy largo y muy fino que se corre a unos 70C para
evitar hibridaciones.
Las dos cadenas, que forman la doble hlice, estn unidas entre s por puentes de hidrgeno,
entre bases especficas de cada cadena. As, la guanina de una cadena est siempre unida a la
citosina de la otra (a travs de tres puentes de hidrgeno), y la adenina a la de timina (por dos
puentes de hidrgeno). Esto explicara el que molculas de ADN con mayor % G+C son ms
difciles de separar en hebras. Debido a la gran longitud de la molcula de ADN, existen
numerosos enlaces por puente de hidrgeno entre las dos cadenas, y aunque este enlace es
dbil, hacen que en conjunto el ADN sea una molcula muy estable. La disposicin de parte
hidrfoba hacia el interior y los fosfatos y ribosas hidrfilos hacia el exterior tambin contribuye
a estabilizar la estructura. Las dos cadenas son antiparalelas. Una en el sentido 5` 3`y la otra
en el sentido 3` 5`.
Las medidas de la doble hlice son muy concretas y pueden estudiarse por difraccin de rayos
X. La distancia entre las cadenas es constante e igual a 1.9 nm. Hay 10.5 nucletidos por vuelta
y el paso de rosca son 3.4 nm. La estructura de Watson and Crick del DNA se conoce tambin
con el nombre de B-DNA y es la estructura ms estable, pero tambin se han caracterizado otras
variantes.
Los ARNt pueden representarse esquemticamente en forma de hoja de trbol (Figura 10).
Comenzando por el extremo 5, los ARNt comparten las siguientes caractersticas:
Una horquilla de 3 4 bases apareadas que acaba en un lazo de cadena sencilla que contiene
frecuentemente la base modificada dihidrouridina (D). La estructura completa recibe el nombre
de brazo D.
Una horquilla de 5 bases apareadas con un lazo que contiene el anticodn, el triplete de bases
que es complementario al codn del ARNm. Esta estructura recibe el nombre de brazo
anticodn.
Una horquilla de 5 bases apareadas en un lazo monocatenario que contiene por lo general una
secuencia T-pseuouridina-C. La estructura se denomina brazo T.
Todos los ARNt acaban en la secuencia CCA con un grupo 3-OH libre.
Los ARNr : son las molculas de nucleicos que constituyen la estructura de los ribosomas. Todos
los ribosomas contienen dos subunidades . Por razones histricas, los ribosomas intactos y las
subunidades se designan por unos nmeros que describen la velocidad a la que sedimentan
cuando se centrifugan. El ribosoma intacto de E. coli (y de todos los procariotas) se llama
ribosoma 70S, siendo S una medida de la velocidad de sedimentacin, y las dos subunidades que
lo componen, que son distintas en tamao y composicin, se denominan 30S y 50S.
Los ribozimas El ARN ribosmico, al contrario de lo que se ha creido, no tiene una funcion
meramente estructural. Hay varios ejemplos de ARNr capaces de actar como biocatalizadores.
De ah que el concepto clsico de enzima haya sido ampliado ms all de las protenas. Estos
ARN con capacidad cataltica reciben el nombre de ribozimas, para distinguirlos de las enzimas
protecas. Su capacidad cataltica radica, al igual que en las protenas, en su en la complejidad y
diveridad de su estructura tridimensional, lo que les permite adaptarse al substrato, as como
en la reactividad de sus grupos funcionales. Se han podido realizar estudios cinticos con algunas
ribozimas verificando que cumplen la cintica de Michaelis-Menten tpica de las enzimas
protecas. Se piensa que las ribozimas fueron los primeros biocatalizadores que aparecieron en
la evolucin, siendo desplazados posteriormente por las enzimas ms verstiles. Los ARN seran
as las molculas primordiales de la vida, antes de que evolucionasen los ADN como portadores
de la informacin gentica y las protenas como catalizadores.