Taxonoma

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Para clasificaciones no biolgicas, vase Clasificacin.

rbol filogentico, en este caso con forma de dendrogramanota 1, como cada nodo del
dendrograma se corresponde con un clado, entonces es un cladograma. Cada clado agrupa a
todos los descendientes de una poblacin ancestral comn, es decir es un grupo monofiltico.
Los nodos terminales (aqu simbolizados por letras individuales) no pueden ir ms all de
las especies, ya que por definicin, por debajo de la categora especie las poblaciones no
evolucionan como linajes independientes.

rbol filogentico (en este caso, las lneas representan la secuencia de organismos ancestros
y descendientes, es un filogramacita 1) que muestra un ejemplo de diversificacin de una
especie ancestral en tres especies presentes en la actualidad. Cada nodo del rbol (como el
marcado con un crculo rojo) representa la divergencia de un linaje ancestral en dos linajes
que evolucionan independientemente, esto es, que tienen el potencial de adquirir su propio set
de cambios evolutivos. En barras rojas se muestran las apomorfas: los nuevos estados
del carcter. Un cladogramase puede interpretar como una secuencia de ancestros y
descendientes, lo cual es una hiptesis que se superpone al dendrograma obtenido al
determinar las apomorfas de los linajes ancestrales. No todos los investigadores estn de
acuerdo en interpretar un cladograma de esta forma, porque por ejemplo la historia
filogentica del grupo puede no haberse dado en forma de cladognesis.cita 2

Del rbol filogentico se puede derivar una clasificacin de los organismos. Los taxones
terminales se circunscriben y agrupan en taxones de rango sucesivamente ms alto. Los
anidamientos deben tener congruencia o "consistencia lgica" con el rbol filogentico,
aunque la forma en que se tiene que dar esta consistencia est en discusin.14 Ntese que la
clasificacin tiene forma de dendrograma.
La Taxonoma (del griego , taxis, ordenamiento, y , nomos, norma o regla) es,
en su sentido ms general, la ciencia de la clasificacin. Habitualmente se emplea el trmino
para designar a la Taxonoma Biolgica, la "teora y prctica de clasificar organismos"1516cita 4
Como se la entiende en la actualidad, la clasificacin biolgica tiene que ser congruente con
las hiptesis de rbol filogenticodisponibles, en ella, los organismos se agrupan en taxones
mutuamente excluyentes a su vez agrupados en taxones de rango ms alto tambin
mutuamente excluyentes, de forma que cada organismo pertenece a uno y slo un taxn en
cada rango o "categora taxonmica". En cada taxn, los organismos poseen caracteres
(singular carcter) cuyos estados del carcter los diferencian de los organismos fuera del
taxn, y son los atributos que en conjunto se utilizan para delimitar los taxones. La mayoracita 5
de los especialistas ve a las especies, a las que ubican en taxones en la categora taxonmica
del mismo nombre, como una realidad objetiva, y a los diferentes conceptos de especie como
diferentes aproximaciones para reconocer esos linajes que evolucionan independientemente,
por lo que a pesar de las discrepancias entre autores en su concepto taxonmico y por lo tanto
en general en los lmites taxonmicos de cada una, suele ser considerada la categora
taxonmica ms importantecita 6cita 7 en la clasificacin. Los taxones supraespecficos son los
que agrupan especies y se jerarquizan en categoras taxonmicas de rango cada vez ms
alto: gnero (grupo de especies), familia, etc. hasta el reino. En esta rea tambin est
debatido el concepto de taxn a utilizar. Muchos especialistas afirman que slo la "filosofa
taxonmica" para agrupar los organismos en taxones de la escuela cladista logra que la
clasificacin ofrezca el servicio que se espera de ella al resto de las ramas de la biologa, pero
la escuela evolucionista tiene razones para delimitar con otros conceptos los taxones, tambin
congruentes con las hiptesis de rbol filogentico, y las dos escuelas se atribuyen la creacin
de sistemas de clasificacin que cumplen en mayor medida sus funciones de sistemas de
almacenamiento y recuperacin de datos, y de predictores del estado de los caracteres y
las direcciones de la evolucin que no se han medido.
La Taxonoma tambin se ocupa de debatir y actualizar los Cdigos Internacionales de
Nomenclatura, de los que por razones histricas hay uno para cada disciplina (Zoologa,
Botnica y Bacterias), cuyo uso para reglamentar el uso de nombres "formales" est
consensuado desde hace unos 100 aos. En un Cdigo se define el sistema taxonmico a
utilizar los Cdigos en uso definen el recin descripto, conocido como el "sistema lineano",
del que se deriva la definicin de taxn aqu utilizada; se decide la formacin de nombres y
cul es el "tipo" con el que se heredan de taxn en taxn, y se explicitan los Principios de
Nomenclatura por encima de las reglas, cuyo objetivo o "principio bsico"19 es proveer la
mxima estabilidad en la nomenclatura. Los Cdigos en uso no evitan las "diferencias
filosficas" entre taxnomos en los conceptos taxonmicos a utilizar ni en la categora especie
ni en las categoras supraespecficas que son una fuente de inestabilidad frecuente en los
nombres de los taxones.
La Taxonoma Biolgica es aqu tratada como una subdisciplina de la Biologa Sistemtica,
que adems tiene como objetivo la reconstruccin de la filogenia, o historia evolutiva, de la
vida.cita 3 Como aqu comprendida la Taxonoma abarca la decisin de qu sistema taxonmico
utilizar, la de qu conceptos taxonmicos asociar a esos taxones, la delimitacin de esos
taxones dejando explcitos los mtodos que fueron utilizados para alcanzarla, la formalizacin
de sus nombres en la subdisciplina de la Nomenclatura, y tambin las herramientas para
la Determinacin o identificacin de especmenes.cita 3cita 6 Como se calcula que slo un 10%
de las especies est descripto, como esas descripciones tienen diferentes grados de
resolucin,cita 8 y las especies evolucionan (cambian con el tiempo en trminos de sus
caracteres) y cambia su distribucin, la determinacin funciona recursivamente con la
descripcin y distribucin de especies en el rea llamada alfa-Taxonoma o Taxonoma
Descriptiva, o, deslindndola de la definicin minimalista de Taxonoma que se maneja desde
hace dcadas y debido a que se intergradan en esa categora taxonmica, el rea de
la Sistemtica Descriptiva23 o Ciencia de la Biodiversidad,cita 6 la que se ocupa del
descubrimiento, la identificacin, la descripcin, la clasificacin y la catalogacincita 6 de la
biodiversidad del planeta, utilizando el organismo como unidad de trabajo y cuya prioridad24 es
la descripcin de todas las especies dentro de un contexto evolutivo.cita 6
La Historia de la Taxonoma ha sido largamente recorrida por stos y otros interrogantes y a lo
largo de ella fueron formndose el sistema de clasificacin y las reglas que nos han quedado
como legado.
La crisis de biodiversidad que es foco de atencin desde mediados de 1990, la cantidad de
datos acumulados con los anlisis de ADN, y la posibilidad de intercambiar informacin a
travs de internet, han revitalizado a esta ciencia en el ambiente cientfico desde las dcadas
de 1990-2000, y han generado un debate acerca de la necesidad de hacer reformas
sustanciales a los Cdigos, algunas de las cuales an se estn debatiendo y otras ya se han
incorporado. Algunas de estas propuestas son el BioCode, el PhyloCode, el agregado de
atributos al tipo nomenclatural como podran ser los nuevos "marcadores de ADN"
(ADN barcodes), y las relacionadas con la informatizacin de los datos y la utilizacin formal
de Internet.